检索结果-内蒙古大学图书馆

浙江农业学报 2022年第8期34卷 1582-1590页

作者：姜昊梁黄允梁绍芳谢梦晨徐天成宋芷婷向文文陈青春万小荣孙伟仲恺农业工程学院农业与生物学院广东广州510225 广州市特色作物种质资源研究与利用重点实验室广东广州510225

为探究不同甜玉米自交系幼苗期对镉的响应差异,发掘与甜玉米苗期耐镉性状相关的分子标记位点,选取13份甜玉米自交系进行镉胁迫处理(Cd浓度为0.01 mol·L^(-1)),综合评价甜玉米幼苗生理指标差异,并寻找与甜玉米苗期耐镉性相关的简单... 详细信息

为探究不同甜玉米自交系幼苗期对镉的响应差异,发掘与甜玉米苗期耐镉性状相关的分子标记位点,选取13份甜玉米自交系进行镉胁迫处理(Cd浓度为0.01 mol·L^(-1)),综合评价甜玉米幼苗生理指标差异,并寻找与甜玉米苗期耐镉性相关的简单重复序列(SSR)分子标记。结果显示,从耐镉性判断,KY188、M114A为敏感型自交系,T96-4、M3、T35和T8-1为耐受型自交系。与对照处理相比:KY188(敏感型)经过镉胁迫处理后,叶绿素含量随时间推进显著(P<0.05)降低,苗高、总根数、根长、地上部鲜重和干重、地下部鲜重和干重、总鲜重、总干重分别显著(P<0.05)降低了18.87%、24.32%、21.13%、58.86%、2.04%、33.77%、26.11%、47.11%、14.29%;T96-4(耐受型)经过镉胁迫处理后,上述指标无显著变化。通过相关性分析,共检测到9个与甜玉米苗期耐镉性状相关的SSR标记,分别位于第2、3、4、5、6、8、9、10号染色体上。

关键词：镉胁迫主成分分析耐镉性简单重复序列分子标记甜玉米

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基于SSR分子标记的地被菊遗传多样性分析和指纹图谱构建

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生物工程学报 2023年第7期39卷 2839-2860页

作者：李子航何立飞王秀军郭林繁罗春燕李庆卫北京林业大学园林学院北京100083 北京市花木有限公司北京100032

为了从分子水平上研究地被菊(Chrysanthemum×morifolium)种质资源的遗传多样性并建立地被菊品种的指纹图谱库,筛选出多态性高的引物用于地被菊品种间鉴定、亲缘关系分析和分子标记辅助选种体系的建立,本研究利用多态性好、条带清... 详细信息

为了从分子水平上研究地被菊(Chrysanthemum×morifolium)种质资源的遗传多样性并建立地被菊品种的指纹图谱库,筛选出多态性高的引物用于地被菊品种间鉴定、亲缘关系分析和分子标记辅助选种体系的建立,本研究利用多态性好、条带清晰、重复性好的12对引物对91份地被菊材料和14份菊属近缘种材料进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记和遗传多样性分析,从12对引物中筛选出9对核心引物对受试材料进行指纹图谱构建。结果显示,在105个样品中,12对引物检测出104个等位位点,范围为2−26,平均每个点位检测出9.25个等位基因数,平均每个点位检测得到的有效等位基因数(number of effective alleles,Ne)为2.7456,范围为1.2760−4.7425;Shannon信息指数(Shannon genetic diversity index,I)变化范围是0.5133−2.2399,均值是1.2090;Nei’s基因多样性指数(Nei’s gene diversity index,H)范围是0.2163−0.7891,均值是0.5780;观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)的范围是0.2233−0.8952,均值是0.5575;期望杂合度(expected heterozygosity,He)的范围是0.2174−0.7933,均值是0.5808;多态信息含量(polymorphism information content,PIC)值变化范围是0.2115−0.7740,均值是0.5329;遗传相似性系数(genetic similarity,GS)范围为0.2285−1.0000,均值是0.6083。聚类分析表明,在遗传距离(genetic distance,GD)=0.30时,受试材料可以分为两个类群。Structure群体结构分析将受试材料分为3个种群和1个混合种群。从12对引物中筛选出可完全区分105份受试材料的9对核心引物,构建了91份地被菊材料和14份菊属近缘种材料的指纹图谱。地被菊材料之间具有显著的遗传差异和丰富的遗传多样性,对于地被菊的园林应用和品种选育具有重要意义。地被菊品种和菊属近缘种的指纹图谱库的构建,一定程度上揭示了105份实验材料的亲缘关系,为今后地被菊品种鉴定与筛选体系的研究提供了技术支撑。

关键词：地被菊遗传多样性简单重复序列分子标记指纹图谱

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基于SSR分子标记的沙枣遗传多样性分析和指纹图谱构建

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生物工程学报 2024年第10期40卷 3530-3547页

作者：王梓煦曾郅涵秦孝天李子航童宇航刘克林李庆卫北京林业大学园林学院林木资源高效生产全国重点实验室北京100083 北京市绿地养护管理事务中心北京102211

为了促进沙枣新品种选育、种质资源鉴定保护和生态经济型沙枣产业综合发展,对沙枣(Elaeagnus angustifolia)种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,挖掘沙枣种质来源和遗传背景。本研究采用多态性好、条带清晰、重复性好的11对引... 详细信息

为了促进沙枣新品种选育、种质资源鉴定保护和生态经济型沙枣产业综合发展,对沙枣(Elaeagnus angustifolia)种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,挖掘沙枣种质来源和遗传背景。本研究采用多态性好、条带清晰、重复性好的11对引物,利用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)分子标记技术,对甘肃省和北京市来源的150份沙枣材料的遗传多样性进行了研究,基于遗传距离进行非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚类分析,基于贝叶斯模型的Structure v2.3.3软件解析150份种质的遗传结构。在遗传多样性分析中,平均等位基因数为(number of alleles,Na)7.6364,平均有效等位基因数(number of effective alleles,Ne)为2.8326,平均Shannon信息指数(Shannon genetic diversity index,I)为1.1781,Nei's平均基因多样性指数(Nei's gene diversity index,H)为0.5821,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.4899,平均期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.5840,平均多态信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.5354,平均遗传相似性系数(genetic similarity,GS)为0.8315,表明所研究的沙枣之间具有显著的遗传差异和丰富的遗传多样性。聚类分析将150份材料划分为3个类群,平均遗传距离(genetic distance,GD)为0.4229,聚类结果和地理来源并不完全一致。Structure群体结构分析将供试材料分为2个种群。利用8对多态信息含量最高的引物,构建了150份沙枣材料的指纹图谱。本研究成功构建了甘肃和北京沙枣种质资源的DNA指纹图谱,阐明了其亲缘关系,为沙枣种质资源鉴定、优异种质筛选、园林应用和分子辅助育种工作提供了理论依据。

关键词：沙枣遗传多样性简单重复序列分子标记指纹图谱

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云南草果种质资源的遗传多样性及亲缘关系的SSR分析

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中草药 2018年第22期49卷 5388-5395页

作者：胡一凡张雪梅徐绍忠杨生超杨志清云南农业大学农学与生物技术学院云南昆明650201 云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心云南昆明650201 云南农业大学云南省药用植物生物学重点实验室云南昆明650201 云南省芳香生物工程技术研究中心云南昆明650201

目的评价云南草果居群的遗传多样性及亲缘关系。方法运用7对微卫星引物对24个草果居群进行分析;首先应用GenALEx计算遗传多样性参数,并进行PCoA和AMOVA分析;采用NTsys软件绘制居群聚类图;最后利用Structure软件计算出最佳的K值。结果 2... 详细信息

目的评价云南草果居群的遗传多样性及亲缘关系。方法运用7对微卫星引物对24个草果居群进行分析;首先应用GenALEx计算遗传多样性参数,并进行PCoA和AMOVA分析;采用NTsys软件绘制居群聚类图;最后利用Structure软件计算出最佳的K值。结果 24个草果居群的Shannon多样性指数(H)的平均值为0.49,期望杂合度(He)的平均值为0.32;遗传分化系数(Fst)为0.090,基因流(Nm)为2.930。24个草果居群的遗传分化有81%存在于居群内,仅有19%存在于居群间;黄花草果23个居群的遗传一致度(I)为0.631 8～0.982 4,遗传距离(D)的范围为0.017 7～0.459 2,而白花草果居群(MG5)与其他23个黄花草果居群一致度均较小,为0.3697～0.6090;而居群聚类分析,在遗传距离0.49处,明显地把白花草果与黄花草果分开;Structure聚类得出K=4时,209份黄花草果资源可被分为4个类群。结论云南黄花草果居群的遗传多样性水平平均偏高;遗传变异主要存在于居群内,而非居群间。根据基因型,黄花草果和白花草果被明显地划分成2类,遗传距离很远;而黄花草果大致被分为4个类群。

关键词：草果简单重复序列分子标记遗传多样性亲缘关系聚类分析

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基于SSR标记的雷公藤属植物遗传多样性和遗传结构评价

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药学学报 2017年第1期52卷 153-161页

作者：励娜姚媛媛陈一龙梁旭明郑丁丁张小梅杨大坚重庆市中药研究院重庆400065 西南大学药学院重庆400715

雷公藤属植物是中药免疫抑制剂的首选原料药材。近年来,由于生态环境破坏和人为过度采挖,雷公藤属植物野生资源急剧减少,濒临灭绝,因此亟需保护其野生资源和评价其遗传多样性。本文通过简单重复序列分子标记(simple sequence repeat,SSR... 详细信息

雷公藤属植物是中药免疫抑制剂的首选原料药材。近年来,由于生态环境破坏和人为过度采挖,雷公藤属植物野生资源急剧减少,濒临灭绝,因此亟需保护其野生资源和评价其遗传多样性。本文通过简单重复序列分子标记(simple sequence repeat,SSR)探讨了28个雷公藤属植物野生居群(9个省共计396个样本)的遗传多样性和遗传结构。结果表明,雷公藤属植物具有较高遗传多样性水平,多态百分比(PPL)为77.29%,Shannon’s信息指数(I)为0.639 4,平均基因杂合度(H)为0.359 9。雷公藤属植物居群间存在较高的遗传分化,平均基因流(N_m)为0.228 7。Nei’s遗传距离构建群体聚类树和Structure聚类分析表明28个居群可分为6支系,昆明山海棠主要被分成四川、云南、贵州-重庆3支,东北雷公藤单独聚为1支,雷公藤被分成2支,其中过渡类型LQ和NY被单独聚为1支。本文为雷公藤属植物野生资源保护、遗传多样性研究和分子标记辅助育种等方面的研究提供理论依据。

关键词：雷公藤属植物简单重复序列分子标记遗传多样性居群遗传结构资源保护

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半夏SSR分子标记开发与遗传多样性

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华中农业大学学报 2021年第6期40卷 19-26页

作者：张景李晓东宗庆波何贝贝拉基景纳良王柯月钟淑梅舒少华华中农业大学植物科学技术学院武汉430070 湖北省果茶办公室武汉430070 九州通医药集团九信中药研究院武汉430051

对半夏转录组数据进行分析,设计开发SSR引物,利用筛选出的SSR引物分析不同居群间半夏的遗传多样性,为半夏分子标记辅助育种提供支撑。结果显示:筛选出的19对多态性较高的引物在17个半夏居群中共检测到49个多态性位点,具有较高的多态性;... 详细信息

对半夏转录组数据进行分析,设计开发SSR引物,利用筛选出的SSR引物分析不同居群间半夏的遗传多样性,为半夏分子标记辅助育种提供支撑。结果显示:筛选出的19对多态性较高的引物在17个半夏居群中共检测到49个多态性位点,具有较高的多态性;利用UPGMA作图共将17个半夏居群分为3个类群;通过分子方差分析(AMOVA)发现半夏居群内的变异达到88%,说明群体与群体间的差异相对较小,遗传变异主要来源于个体间;居群间平均分化系数Fst为0.124,居群间基因流Nm值为1.765,表明居群间能正常地进行基因交流,且居群间遗传分化受基因流的影响较大。本研究利用SSR技术开发的19对SSR引物在不同半夏居群间具有一定的通用性、多态性,能将17份半夏材料明确区分。

关键词：半夏转录组简单重复序列分子标记遗传多样性居群

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桑树种质资源SSR标记的遗传多样性分析

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湖北农业科学 2010年第4期49卷 779-784页

作者：彭波胡兴明邓文叶楚华张鸿武汉大学生命科学学院武汉430072 湖北省农业科学院经济作物研究所武汉430070

利用简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记技术分析了172个桑树品种(系)的遗传多样性,结果表明,10对SSR引物在172份材料中共检测出了67个等位变异,平均每对引物检测到6.7个等位变异,其中多态性标记为66个,多态性比率为98.... 详细信息

利用简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记技术分析了172个桑树品种(系)的遗传多样性,结果表明,10对SSR引物在172份材料中共检测出了67个等位变异,平均每对引物检测到6.7个等位变异,其中多态性标记为66个,多态性比率为98.51%。利用种间的遗传相似性系数进行聚类分析,可将5个种分为三类,白桑、鲁桑、广东桑可聚为一类,山桑、瑞穗桑各为一类。其中白桑与鲁桑的亲缘关系最近,相似性系数为0.9935,山桑和瑞穗桑的亲缘关系最远,相似性系数为0.6866,这一结果与桑树形态学的分类结果大体一致。

关键词：桑树种质资源简单重复序列分子标记遗传多样性

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不同产区黄芩SSR分子标记鉴别研究

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中国现代中药 2021年第11期23卷 1876-1882页

作者：刘美娟郑司浩赵莎秦义杰曾燕王继永中国中药有限公司北京100195

目的:采用简单重复序列(SSR)分子标记技术鉴定不同产区黄芩种质资源。方法:基于黄芩基因组数据设计SSR引物,并对来自河北、东北(辽宁、吉林地区)、内蒙古、山东、山陕(山西和陕西)地区共计5个产区的黄芩进行遗传多样性分析及聚类分析。... 详细信息

目的:采用简单重复序列(SSR)分子标记技术鉴定不同产区黄芩种质资源。方法:基于黄芩基因组数据设计SSR引物,并对来自河北、东北(辽宁、吉林地区)、内蒙古、山东、山陕(山西和陕西)地区共计5个产区的黄芩进行遗传多样性分析及聚类分析。结果:引物组合Sb2、Sb16、Sb22、Sb23、Sb26可以对产地为辽宁、吉林的黄芩进行鉴定区分;引物组合Sb21、Sb22、Sb28可以对产地为内蒙古的黄芩进行鉴定区分;引物组合Sb5、Sb13、Sb16、Sb22可以对产地为陕西、山西的黄芩进行鉴定区分。结论:研究结果可为不同产区黄芩种质资源的鉴定提供一种准确、高效的技术方法。

关键词：黄芩简单重复序列分子标记遗传多样性种质鉴定

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利用SSR分子标记初步分析广西莪术种质资源的遗传多样性

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湖北农业科学 2015年第10期54卷 2408-2411,2415页

作者：杨妮王建广西中医药大学药学院南宁530001

利用简单重复序列分子标记技术对广西莪术(Curcuma kwangsiensis *** et ***)种质资源进行了遗传多样性分析。结果表明,筛选出的14对引物在50份广西莪术种质资源中共扩增出78个条带,其中60条呈现多态性,多态性比率为76.92%,反映出广西... 详细信息

利用简单重复序列分子标记技术对广西莪术(Curcuma kwangsiensis *** et ***)种质资源进行了遗传多样性分析。结果表明,筛选出的14对引物在50份广西莪术种质资源中共扩增出78个条带,其中60条呈现多态性,多态性比率为76.92%,反映出广西莪术种质资源在分子水平上存在较大的差异;广西莪术不同种质资源间的差异主要由遗传因素决定,但也与环境因素有关。聚类结果将50份广西莪术种质资源分成2大类,揭示了它们之间的遗传差异,这为今后广西莪术优良品种的选育提供了依据。

关键词：简单重复序列分子标记广西莪术(Curcuma kwangsiensis S.G.Lee et C.F.Liang) 遗传多样性

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基于DNA条形码及SSR技术鉴定风藤和山蒟

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现代中药研究与实践 2023年第2期37卷 23-27页

作者：严卓彦夏瑛瑛崔洁李彬舟山市食品药品检验检测研究院(国家海洋食品质量检验检测中心) 浙江舟山316012

目的研究海风藤原植物风藤和山蒟的分子鉴定方法。方法提取31份来自全国各地药材植物及不同医药企业生产饮片的基因组,对psbA-trnH、matK、petA-psbJ等叶绿体基因片段以及核糖体间隔序列ITS进行PCR扩增测序及进化树构建。从叶绿体基因... 详细信息

目的研究海风藤原植物风藤和山蒟的分子鉴定方法。方法提取31份来自全国各地药材植物及不同医药企业生产饮片的基因组,对psbA-trnH、matK、petA-psbJ等叶绿体基因片段以及核糖体间隔序列ITS进行PCR扩增测序及进化树构建。从叶绿体基因组的简单重复序列中筛选4对特异性引物,对其扩增产物进行毛细管电泳分析。结果所有样品的psbA-trnH序列高度一致,其它DNA条形码的序列均有一定差异。进化树的聚类分析结果matK和petA-psbJ片段相近,且与SSR分子标记结果一致,但与ITS聚类结果有差异。结论matK和petA-psbJ片段对风藤和山蒟的鉴别能力优于ITS和psbA-trnH,DNA条形码和SSR分子标记法均可为中药材海风藤的种质资源鉴定提供分子依据。

关键词：风藤山蒟 DNA条形码简单重复序列分子标记

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