检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：唐如玉中国科学院大学

学位级别：硕士

遗传多样性是基因挖掘、品种改良及选育的基础，轮回选择群体构建及其遗传多样性评价可为群体进一步改良及优良个体的筛选提供参考和指导。本研究基于4个陆稻群体及172个水稻品种或杂交组合，经过4次轮回重组，构建了研究群体，并从表... 详细信息

遗传多样性是基因挖掘、品种改良及选育的基础，轮回选择群体构建及其遗传多样性评价可为群体进一步改良及优良个体的筛选提供参考和指导。本研究基于4个陆稻群体及172个水稻品种或杂交组合，经过4次轮回重组，构建了研究群体，并从表型性状及SSR分子标记2方面对研究群体遗传多样性进行评价，主要结果如下:　　(1)采用16个表型性状对1395个研究群体单株进行遗传多样性评价的结果表明:群体表型性状变异系数范围为0.08～0.41，均值为0.20，群体具有丰富的遗传变异。Shannon-Wiener多样性指数范围为0.72～1.92，均值为1.50，群体具有丰富的遗传多样性。有效穗、剑叶长、二次枝梗、每穗粒总数4个表型性状具有较高的遗传变异及较好的遗传多样性。　　(2)群体在株型与产量性状内或相互间具有显著相关性。剑叶长、每穗粒总数、千粒重、穗长、粒长、一次枝梗、有效穗、剑叶宽、二次枝梗、抽穗期10个性状可作为群体综合评价的指标。基于以上10个指标表型性状的UPGMA聚类分析，在欧式距离为13时，将1395份供试材料分为4个亚群，进一步表明研究群体具有丰富的遗传多样性。　　(3)12对SSR引物对随机选取研究群体的260份材料的分析结果表明，群体共检测到153个等位基因(Na)，范围为7～26，均值为12.75±5.17、有效基因数(Ne)为47.76，范围为1.72～4.72，均值为3.97±1.42，群体多态性信息含量(PIC)范围为0.31～0.86，均值0.68±0.14，群体期望杂合度范围为0.3～0.86，均值为0.70±0.15，Shannon-Wiener多样性指数范围为0.79～2.43，均值为1.60±0.42，表明供试材料具有较高的遗传多样性。　　(4)基于SSR分子标记的群体结构分析将供试材料分为4大亚群，群体间的Fst及遗传距离(D)具有较好的一致性。　　本研究明确了研究群体具有丰富的遗传多样性。综合实验分析结果，剑叶长、二次枝梗、每穗粒总数3个表型性状具有较高的遗传变异、较好的遗传多样性及与综合得分F值相关系数较高，后期群体的改良可以侧重以上3个性状。剑叶长、每穗粒总数、千粒重、穗长、粒长、一次枝梗、有效穗、剑叶宽、二次枝梗、抽穗期10个性状可作为群体综合评价的指标。群体在株型与产量构成因子性状方面内及相互之间存在显著的相关性，对株型的选择可以实现产量性状的改良，后期群体的改良可以对这些表型的相关性加以利用。群体中极端性状个体及综合得分F值较高的个体，可进一步用于品种培育。

关键词：水稻遗传多样性表型性状简单重复序列标记

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甘蔗栽培品的主要农艺性状与AFLP和SSR分子标记的关联分析

甘蔗栽培品的主要农艺性状与AFLP和SSR分子标记的关联分析

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作者：朱专为福建农林大学

学位级别：硕士

本实验分为两部分进行，第一部分是SSR分子标记的开发与筛选，从NCBI上通过MISA软件扫描目标基因组序列，在43Mb的甘蔗基因组序列中共找到7231个SSR位点，平均每5947bp含有1个SSR位点。基因组其中二、三碱基的占比类型最多，这与研究其... 详细信息

本实验分为两部分进行，第一部分是SSR分子标记的开发与筛选，从NCBI上通过MISA软件扫描目标基因组序列，在43Mb的甘蔗基因组序列中共找到7231个SSR位点，平均每5947bp含有1个SSR位点。基因组其中二、三碱基的占比类型最多，这与研究其它作物发表的有关SSR结果相一致。\n 本研究设计、合成了232对SSR引物。使用12个甘蔗品种对232对引物进行PCR筛选验证，共筛选出48对多态性效果好的引物，分离出212个多态位点，平均每对引物扩增出4.41个多态位点。本研究第二部分关联分析所使用的9对SSR引物，选自48对引物之中。\n 实验第二部分用从国家甘蔗种质资源库选取80份源自世界各地的甘蔗品种，并对试验材料的10个重要农艺性状(出苗数、总苗数、分蘖数、分蘖率%、有效茎/4m、亩有效茎、锤度、株高、茎径、单茎重）进行田间调查统计。用64对AFLP引物和9对SSR引物产生的分子标记对试验群体进行全基因组扫描。通过表型变异，基因多态性以及群体结构的鉴定分析后，用广义线性模型（GLM)进行对表型性状和基因型数据进行关联分析，鉴定出与目标性状呈显者关联的703个标记位点，极显著关联的111个AFLP标记位点以及与性状呈显著关联27个SSR标记位点,极显著关联的10个SSR标记位点。\n 1．试验材料的表型性状的统计描述和方差分析结果显示,80个试验材料的十个表型性状间的P值均小于0.001，差异极其显著,表明试验所构建的关联作图群体的表型多态性十分丰富。\n 2.在表型性状的相关分析中，株高、茎径、单茎重三个表型性状之间也是呈现极显著的的正相关，锤度在该相关分析中除了与茎径表现为显著的负相关，与其他性状均未发现相关关系。\n 3.64对AFLP引物在80个甘蔗品种上共检测到15159个变异位点，选取其中4141个质量优等的标记位点（平均每对引物64.7个标记），9对SSR引物扩增出的151个多态位点。\n 4、将AFLP分子数据使用群体结构分析软件STRUCTURE2.3.4将试验群体划为6个亚群，该结果与利用NTSYS2.1e基于UPGMA做出聚类分析图结果基本相同，说明群体结构分析结果可靠。\n 5、基因型性状与表型性状的关联分析显示从结果中可以看出与锤度呈极显著关联标记个数明显要远远高于其他性状的，在AFLP标记的关联分析中，标记对性状的变异解释率分布在13.09%到25.86%之间，其中变异解释率高于20%的标记为点多达8个，最高变异解释率高达25.86%与其关联的标记为E-ACT/M-CAT_293bps。在SSR标记的关联分析中，27个标记与性状呈显著关联(P＜0.01),其中FZW89_100bp,FZW202_201bp均与总苗数和分蘖数显著关联。FZW97_270bp位点与锤度和茎重均显著关联。10个标记与表型性状呈极显著关联(P<0.001)，其中FZW107_106bp，FZW202_101bp，FZW202_195bp三个位点对锤度变异的解释率分别高达35.59%，37.62%，30.17%。

关键词：甘蔗基因组学简单重复序列标记农艺性状扩增片段长度多态性

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水稻光氧化基因LPO1(t)的初步定位

水稻光氧化基因LPO1(t)的初步定位

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作者：赖东南京农业大学

学位级别：硕士

水稻是我国重要的粮食作物，也是单子叶植物研究的模式作物。叶片是绿色植物光合作用的主要器官，而叶绿素是进行光合作用的主要场所。绿色植物叶片吸收的光强超过光合作用的饱和光强时，就会发生光合作用的光抑制。光抑制现象在C3植物... 详细信息

水稻是我国重要的粮食作物，也是单子叶植物研究的模式作物。叶片是绿色植物光合作用的主要器官，而叶绿素是进行光合作用的主要场所。绿色植物叶片吸收的光强超过光合作用的饱和光强时，就会发生光合作用的光抑制。光抑制现象在C3植物中普遍存在，高光强下伴以其它理化逆境(低温、高温、干旱、盐渍、大气污染等)时，加剧光抑制，使叶绿素降解，出现叶片“黄化”的光氧化现象。\n 在选育的籼型两用不育系812S中分化出1个农艺性状基本一致的光氧化变异株系812HS，秧苗期叶片正常绿色，但在分蘖盛期-拔节期，在强烈阳光照射下，叶色发生非常明显的光氧化现象。本研究对812HS的生理特性和遗传行为进行了研究，并对光氧化基因进行了初步定位，主要结果如下:\n 1.生理分析表明，812HS叶片的PSⅡ反应中心活力和PSⅡ电子传递活力低于野生型，而剩余光能高于野生型，光能利用效率低于野生型。说明812HS的性状为已合成的叶绿素受低温强光引起的光氧化伤害。\n 2.将812HS与090028杂交，繁衍获得F2群体，在分蘖盛期-拔节期低温强光下，叶色出现光氧化与非光氧化植株的明显分化。卡方检验表明，光氧化株数:非光氧化株数的比值符合3∶1的孟德尔分离比例，表明812HS的光氧化性状受一个显性主基因控制。\n 3.采用BSA法，用经典的495对RM#系列微卫星SSR标记，对水稻双亲、光氧化基因池、非光氧化基因池进行筛选。F2群体分离的隐性单株连锁分析表明，第4染色体上的标记RM307和RM401与光氧化基因连锁遗传，2个标记之间遗传距离为8.8cM，光氧化基因与2个标记之间的遗传距离分别为4.3cM和4.5cM。经检索，该显性光氧化基因属首次发现的新基因，暂命名为LPO1(t)(leaf photo-oxidation1)。本研究为LPO(1)(t)基因的分子标记辅助选择育种和基因克隆奠定了基础。

关键词：水稻光氧化基因简单重复序列标记生理特性遗传行为选择育种

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东北春大豆根系相关性状SSR标记关联分析

东北春大豆根系相关性状SSR标记关联分析

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作者：赵慧艳黑龙江大学

学位级别：硕士

根系是土壤与地上部之间进行物质传递的重要桥梁，在植物吸收水分、养分以及植物激素的合成、分泌、转运等方面发挥着重要作用，根系的形态影响地上部发育和抗逆能力。因此，研究大豆根系性状的遗传机理，发掘与其紧密连锁的标记位点，... 详细信息

根系是土壤与地上部之间进行物质传递的重要桥梁，在植物吸收水分、养分以及植物激素的合成、分泌、转运等方面发挥着重要作用，根系的形态影响地上部发育和抗逆能力。因此，研究大豆根系性状的遗传机理，发掘与其紧密连锁的标记位点，对选育高产优质大豆品种有着重要的指导意义。　　本研究拟开展:1）选取了392份大豆品种作为试验材料，从大豆基因组中筛选出179对SSR标记对392份大豆品种进行全基因组扫描，用以研究大豆品种的群体遗传结构、遗传多样性以及标记间连锁不平衡。可将这392份大豆品种划分为2个亚群，即为亚群Ⅰ（主要是黑龙江育成品种）和亚群Ⅱ（主要是吉林育成和地方品种），对其分别进行了2年室内根系性状的鉴定。2）利用2018和2019年鉴定的总根长、总根表面积、总根体积、总根平均直径和侧根数5个性状，以及SSR标记信息，应用TASSEL V3.0软件的GLM模型对亚群Ⅰ和亚群Ⅱ两年数据进行关联分析得到一个P值，再利用Fisher法合并多个假设检验得出P-值进行关联定位分析，最后用FDR方法比较P-值，当P-值小于0.005时，定义为标记与性状显著关联，并发掘出优异等位变异和对应的载体材料。其结果如下:　　1、遗传多样性分析结果:运用Powermarker软件对392份大豆品种进行多样性分析，结果在179个SSR位点中，共检测出1116个等位变异，等位变异的变幅为2～12个，平均每个位点等位变异数是6.41个，多态性信息含量(PIC)变幅为0.005～0.819，位点平均多态性信息含量是0.570，平均基因多样性指数为0.61。只检测到2个等位变异的标记有5个（Satt211、Satt441、Sct-064、Satt270和Satt575）;检测到12个等位变异的标记是Satt631。　　2、连锁不平衡分析结果:运用TASSEL3.0软件分析标记间的连锁不平衡，179个SSR标记位点一共检测出14701种组合，在这些组合中，无论是共线性组合，还是非共线组合，均存在一定程度的LD衰减。在统计概率P＜0.01水平下，共筛选出535种共线性组合。以位点间的LD和遗传距离进行回归分析，发现位点D'值随着遗传距离的增加衰减速度加快，连锁不平衡程度呈现出降低的趋势。LD衰减所延伸的最小距离为:2.56cM。　　3、群体结构划分结果:基于两两品种间的遗传相似性系数的主成分分析、品种间的遗传距离的聚类分析以及STRUCTURE软件获得K值的分析将329份供试材料划分为2个类群（亚群Ⅰ和亚群Ⅱ）。　　4、根系性状分析:对亚群Ⅰ202份品种进行根系性状分析，结果表明，2018年5个性状的变异系数介于20.58％～57.70％，总根体积的变异系数最大，其值为57.70％;2019年5个性状的变异系数介于8.16％～69.78％，总根体积的变异系数最大，其值为69.78％;对亚群Ⅱ190份品种进行根系性状鉴定显示，2018年5个性状的变异系数介于28.92％～76.23％，总根体积的变异系数最大，其值为76.23％;2019年5个性状的变异系数介于9.95％～43.32％，总根长的变异系数最大，其值为43.32％。这说明根系性状具有广泛的遗传变异。　　5、与根系5个性状显著关联的位点:与总根长显著关联的标记有19个;与总根表面积显著关联的标记有18个;与总根体积显著关联的标记有13个;与总根平均直径显著关联的标记有19个;与侧根数显著关联的标记有14个。　　6、表型效应值及载体材料:对检测到的位点进行优异等位变异及载体材料的分析，5个性状共发现107个优异等位变异，其中Satt683-225(52.00)、Satt234-138(17.53)、Sat-299-305(0.13)、Sat-270-184(0.13)和Sat-351-318(14.51)分别是总根长、总根表面积、总根体积、总根平均直径和侧根数中增效效应最大的等位变异类型，携带各个性状的代表性载体材料分别为合丰51、合丰55、合农60、合农76和黑农83（通农5号）。

关键词：大豆根系性状遗传机理简单重复序列标记

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水稻光氧化基因LPOl（t）的初步定位

水稻光氧化基因LPOl（t）的初步定位

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作者：赖东南京农业大学

学位级别：硕士

水稻是我国重要的粮食作物,也是单子叶植物研究的模式作物。叶片是绿色植物光合作用的主要器官,而叶绿素是进行光合作用的主要场所。绿色植物叶片吸收的光强超过光合作用的饱和光强时,就会发生光合作用的光抑制。光抑制现象在C3植物中... 详细信息

水稻是我国重要的粮食作物,也是单子叶植物研究的模式作物。叶片是绿色植物光合作用的主要器官,而叶绿素是进行光合作用的主要场所。绿色植物叶片吸收的光强超过光合作用的饱和光强时,就会发生光合作用的光抑制。光抑制现象在C3植物中普遍存在,高光强下伴以其它理化逆境(低温、高温、干旱、盐渍、大气污染等)时,加剧光抑制,使叶绿素降解,出现叶片“黄化”的光氧化现象。在选育的籼型两用不育系812S中分化出1个农艺性状基本一致的光氧化变异株系812HS,秧苗期叶片正常绿色,但在分蘖盛期-拔节期,在强烈阳光照射下,叶色发生非常明显的光氧化现象。本研究对812HS的生理特性和遗传行为进行了研究,并对光氧化基因进行了初步定位,主要结果如下： 1.生理分析表明,812HS叶片的PSⅡ反应中心活力和PS Ⅱ电子传递活力低于野生型,而剩余光能高于野生型,光能利用效率低于野生型。说明812HS的性状为已合成的叶绿素受低温强光引起的光氧化伤害。 2.将812HS与090028杂交,繁衍获得F2群体,在分蘖盛期-拔节期低温强光下,叶色出现光氧化与非光氧化植株的明显分化。卡方检验表明,光氧化株数：非光氧化株数的比值符合3：1的孟德尔分离比例,表明812HS的光氧化性状受一个显性主基因控制。 3.采用BSA法,用经典的495对RM#系列微卫星SSR标记,对水稻双亲、光氧化基因池、非光氧化基因池进行筛选。F2群体分离的隐性单株连锁分析表明,第4染色体上的标记RM307和RM401与光氧化基因连锁遗传,2个标记之间遗传距离为8.8cM,光氧化基因与2个标记之间的遗传距离分别为4.3cM和4.5cM。经检索,该显性光氧化基因属首次发现的新基因,暂命名为LPO1(t)(leaf photo-oxidation1).本研究为LPO1(t)基因的分子标记辅助选择育种和基因克隆奠定了基础。

关键词：水稻光氧化简单重复序列标记基因定位

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莴苣品种SSR分子标记鉴定体系的建立及应用

莴苣品种SSR分子标记鉴定体系的建立及应用

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作者：凌晨华南农业大学

学位级别：硕士

莴苣是我国重要的绿叶菜之一，我国的莴苣种质资源较为丰富。由于早期育种家对莴苣命名不规范，加上从国内外各地区频繁重复引种，存在“一品多名”和“同名异种”情况，给莴苣种质资源收集鉴定、品种测试等带来困难，有必要建立莴苣品... 详细信息

莴苣是我国重要的绿叶菜之一，我国的莴苣种质资源较为丰富。由于早期育种家对莴苣命名不规范，加上从国内外各地区频繁重复引种，存在“一品多名”和“同名异种”情况，给莴苣种质资源收集鉴定、品种测试等带来困难，有必要建立莴苣品种快速精准的鉴定技术体系。本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳，筛选出莴苣核心引物，建立了莴苣品种DNA分子鉴定技术体系，构建了莴苣品种的DNA指纹数据库，并结合表型数据进行遗传多样性分析。　　主要研究结果如下：　　1.从245对引物中经过聚丙烯酰胺凝胶电泳初筛、毛细管电泳复筛，筛选出在9条染色体上均有分布的22对核心引物。22对核心引物在233个莴苣品种中共检测到466个等位变异，等位变异范围为5-42，平均为21.18。22对核心引物PIC值范围为0.37-0.89，平均为0.73。依据扩增片段大小为各核心引物选择相应的参照样品。基于核心引物建立莴苣品种鉴定体系，并构建233个莴苣品种的指纹数据库。　　2.233个莴苣品种间遗传相似系数在0-1之间，平均为0.746。聚类分析将233个品种分为茎用和叶用两大类群。叶用莴苣类群中，结球莴苣聚成一类，半结球莴苣趋于聚成一类，散叶莴苣难以聚成一类。主成分分析结果和遗传结构分析结果与聚类分析结果基本一致。8组共24个同名莴苣品种聚类结果与地理来源有一定相关性，来源于同一省份或地区的品种大多被划分到同一类群。　　3.核心引物未能区分的6组15个品种经田间种植对比鉴定，3对品种表型性状无明显差异被判定为相同品种，表型性状有明显差异的品种大部分性状表达状态相同或相近，为近似品种，表明基于分子的聚类结果与基于表型的分类结果基本一致。利用核心引物可以辅助DUS测试筛选近似品种，也可以从分子上区分同名品种。　　4.78个品种的21个表型性状中叶形状、叶片边缘波状程度、叶片泡状程度、外叶的颜色深浅和植株株幅的遗传多样性指数较大，这些性状在不同品种之间表现出丰富的变异。主成分分析显示，5个主成分累计贡献率为88.18%，反映叶片形态、肉质茎和颜色相关性状具有较高差异性。性状间相关分析显示，外叶色调、叶片花青甙显色和幼苗花青甙显色3个性状间的相关系数最大。　　5.78个品种的表型和分子聚类结果基本一致。经mantel检验，品种间的表型性状和SSR标记的相似系数矩阵的相关性不高，分子标记无法完全取代形态学标记，综合两种标记使用对鉴定更有利。

关键词：莴苣品种鉴定简单重复序列标记 DNA指纹图谱遗传多样性

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川芎SSR标记开发及遗传多样性分析

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中国现代中药 2024年第11期26卷 1854-1866页

作者：毛常清沙秀芬陶珊吴宇彭芳廖海浪袁灿张超四川省农业科学院经济作物研究所四川成都610300

目的:基于川芎基因组调研结果开发简单重复序列(SSR)标记,对109份川芎种质资源进行遗传多样性分析,为川芎种质资源评价、保存和新品种选育等提供理论依据。方法:基于Survey测序已组装序列挖掘川芎基因组中的SSR位点并设计引物,筛选多态... 详细信息

目的:基于川芎基因组调研结果开发简单重复序列(SSR)标记,对109份川芎种质资源进行遗传多样性分析,为川芎种质资源评价、保存和新品种选育等提供理论依据。方法:基于Survey测序已组装序列挖掘川芎基因组中的SSR位点并设计引物,筛选多态性高的引物,对109份川芎种质资源进行遗传多样性和遗传分化分析,并在川芎及其近缘物种中进行通用性验证。结果:36对引物在109份川芎种质资源中共检测到102个等位基因位点,观测等位基因数为2.8333,期望杂合度为0.4885,Shannon's指数为0.8071,Nei基因多样性为0.4860,多态信息含量为0.4194,采集的109份川芎种质资源具有丰富的遗传多样性。基于遗传距离的聚类分析显示,在遗传相似系数为0.76处,109份川芎聚为两大类,但其与地理分布关系不大。通用性验证显示,36对SSR引物在川芎及其近缘物种中通用性较好。结论:开发的36对SSR标记能很好地揭示川芎的遗传多样性,供试109份川芎种质遗传分化小、基因流较大。

关键词：川芎简单重复序列标记遗传多样性遗传分化

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芸薹种SSR和UGMS标记遗传连锁图谱的构建

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中国科技论文在线精品论文 2013年第19期6卷 1814-1819页

作者：王哲韩新丽朴钟云沈阳农业大学园艺学院沈阳 110866

以芸薹种大白菜亚种多国芸薹属A基因组测序计划(multinational Brassica genome project,MBGP)模式植物"Chiifu"为父本,以小白菜亚种高代自交系"四九菜心"为母本,利用国际公用简单重复序列(simple sequence repeats... 详细信息

以芸薹种大白菜亚种多国芸薹属A基因组测序计划(multinational Brassica genome project,MBGP)模式植物"Chiifu"为父本,以小白菜亚种高代自交系"四九菜心"为母本,利用国际公用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记和本实验室设计开发的单基因微卫星标记(unigene microsatelite sequence,UGMS),以回交一代(first backcross,BC1)为作图群体,构建了一张总长度为1159.9 cM、包含10条连锁群的分子遗传图谱.该图谱共计251个分子标记,其中包含120个UGMS标记和131个SSR标记.标记的平均图距为4.62 cM.每条连锁群有15～37个标记,连锁群长度介于79.3～150.9 cM之间.该图谱为构建一张完整的大白菜染色体片段替换系奠定了基础.

关键词：蔬菜学芸薹种简单重复序列标记单基因微卫星标记遗传图谱

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不同产地野生金荞麦SSR标记鉴定

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中国现代中药 2021年第12期23卷 2067-2071页

作者：赵莎郑司浩李进瞳刘美娟林晖才熊啟相曾燕王继永中国中药有限公司北京100195 国药种业有限公司北京100035

目的:开发简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记用于鉴定不同产地野生金荞麦种质资源。方法:基于金荞麦全基因组数据设计SSR标记引物,对来自云南、贵州、四川的野生金荞麦样本进行遗传多样性分析及聚类分析。结果:引物组合JQ... 详细信息

目的:开发简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记用于鉴定不同产地野生金荞麦种质资源。方法:基于金荞麦全基因组数据设计SSR标记引物,对来自云南、贵州、四川的野生金荞麦样本进行遗传多样性分析及聚类分析。结果:引物组合JQM03、JQM04、JQM07、JQM19、JQM21可以对产地为四川的野生金荞麦进行鉴定;引物组合JQM04、JQM07、JQM19、JQM21可以对产地为贵州的野生金荞麦进行鉴定区分。结论:开发的金荞麦SSR分子标记可成功鉴定四川、贵州产地的野生金荞麦种质资源。

关键词：金荞麦简单重复序列标记遗传多样性鉴定

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印度南瓜转录组SSR信息分析及其多态性研究

印度南瓜转录组SSR信息分析及其多态性研究

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中国园艺学会南瓜研究分会2016年年会暨西葫芦、南瓜新品种新技术观摩会

作者：王洋洋单文琪徐文龙崔崇士屈淑平东北农业大学园艺学院哈尔滨150030

对印度南瓜(Cucurbita maxima)开展转录组测序分析,共获得131960条unigenes(90.80Mb),筛选得到12557个SSR位点(占总unigenes的9.51％),其发生频率为1/7.4kb;其中SSRs位点中主导类型为二核苷酸重复,占总SSRs的49.82％;其次是三核苷酸重复,其出现频率为45.31％.通过Primer5设计得到7290对SSR引物,随机选择20对SSR引物对30种不同来源的南瓜进行多态性验证分析,结果显示在14对可扩增产物的SSR引物中,11对引物表现稳定可重复的多态性,UPGMA多态性分析显示11对引物可将30份南瓜材料分为5类.研究表明通过对南瓜转录组分析可获得较高频率的SSR位点且类型丰富,为印度南瓜遗传多样性分析和遗传图谱构建提供了候选标记.

关键词：印度南瓜转录组简单重复序列标记多态性遗传图谱

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