检索结果-内蒙古大学图书馆

仲恺农业工程学院学报 2025年第03期 37-43+61页

作者：郜梓涵胡泽华蔡林豪刘木金肖晗梁日深仲恺农业工程学院动物科技学院仲恺农业工程学院健康养殖创新研究院英德市盈信农业有限公司

棘胸蛙（Quasipaa spinosa）是分布于中国南部的特色蛙种．本研究测定了采自于广东清远的棘胸蛙线粒体全基因组，针对其线粒体基因组结构特征进行分析，并基于线粒体基因组序列研究了叉舌蛙科分子系统进化关系．结果表明，棘胸蛙线粒体... 详细信息

棘胸蛙（Quasipaa spinosa）是分布于中国南部的特色蛙种．本研究测定了采自于广东清远的棘胸蛙线粒体全基因组，针对其线粒体基因组结构特征进行分析，并基于线粒体基因组序列研究了叉舌蛙科分子系统进化关系．结果表明，棘胸蛙线粒体基因组全长为17 996 bp，包含13个蛋白质编码基因、23个tRNAs、2个rRNAs和1个非编码控制区，其基因组中存在2个连续重复的tRNA-Met基因．碱基组成为：A(29.2%)、G(14.2%)、T(30.2%)和C(26.4%)，存在明显AT偏倚．基于12种蛋白编码基因构建的分子系统进化树显示，棘胸蛙位于棘胸蛙属内部，并与小棘蛙（Quasipaa exilispinosa）亲缘关系较近．对于棘胸蛙属在叉舌蛙科中的地位，该属与倭蛙属（Nanorana）聚为姐妹群，大头蛙属（Limnonectes）位于其后．该结果为棘胸蛙分子鉴定与系统进化研究提供分子水平信息.

关键词：棘胸蛙(Quasipaa spinosa) 线粒体基因组系统进化分析

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广东省国兰病毒病害调查及CymMV和ORSV基于cp基因的系统进化分析

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植物保护学报 2020年第2期47卷 372-383页

作者：任锐魏永路朱根发杨凤玺广东省农业科学院环境园艺研究所广东省园林花卉种质创新与利用重点实验室广州510640

为调查广东省国兰病毒病发生情况,采用双抗体夹心-酶联免疫吸附测定(double sandwich enzyme-linked immunosorbent assay,DAS-ELISA)法对采集自广州市、汕头市和韶关市兰花主产区的53份具有典型病毒病症状的国兰叶片进行检测,选取35份... 详细信息

为调查广东省国兰病毒病发生情况,采用双抗体夹心-酶联免疫吸附测定(double sandwich enzyme-linked immunosorbent assay,DAS-ELISA)法对采集自广州市、汕头市和韶关市兰花主产区的53份具有典型病毒病症状的国兰叶片进行检测,选取35份病叶应用RT-PCR技术对检测结果进行验证,并基于cp基因序列对检测到的病毒进行系统进化分析。DAS-ELISA检测结果显示,53份病叶中有44份检出病毒,总检出率为83.02%;其中,有14份仅检出建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV),有19份仅检出齿兰环斑病毒(Odontolossum ring spot virus,ORSV),有11份检出CymMV和ORSV复合侵染,检出率分别为26.42%、35.85%和20.75%。RT-PCR检测结果显示,35份病叶中有30份检出病毒,总检出率为85.71%;其中,有21份仅检出CymMV,有6份仅检出ORSV,有4份检出CymMV和ORSV复合侵染,检出率分别为60.00%、17.14%和11.43%,但未检测到其它病毒。表明广东省国兰病毒病害主要由CymMV和ORSV侵染引起。序列和系统进化分析显示,来源于不同地区和寄主的CymMV和ORSV分离物的cp基因序列极为保守,CP氨基酸序列相似性分别大于97.31%和93.67%,且CymMV和ORSV多样性种群的分化与寄主种属和地理隔离关系不大。

关键词：建兰花叶病毒齿兰环斑病毒 RT-PCR DAS-ELISA 系统进化分析广东省

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四川地区一株锦鲤疱疹病毒的分离鉴定及系统进化分析

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水产学报 2018年第1期42卷 141-148页

作者：陈俊杰李媛瑗阳瑞雪汪开毓耿毅黄小丽陈德芳欧阳萍四川农业大学动物医学院四川农业大学动物科技学院

2015年5月,四川某鲤养殖场暴发一种传染性疾病,导致鲤大面积死亡,死亡率高达80%。为研究此次疾病病因和流行规律,将病料进行解剖、细菌学检查、病理组织观察、PCR鉴定、病毒分离和系统进化分析。结果显示,发病鱼眼球凹陷,胸鳍及腹鳍出... 详细信息

2015年5月,四川某鲤养殖场暴发一种传染性疾病,导致鲤大面积死亡,死亡率高达80%。为研究此次疾病病因和流行规律,将病料进行解剖、细菌学检查、病理组织观察、PCR鉴定、病毒分离和系统进化分析。结果显示,发病鱼眼球凹陷,胸鳍及腹鳍出现出血斑,病鱼鳃严重坏死,肾脏肿大。细菌检查为阴性。组织病理学观察,病变最明显的是鳃和肾脏。病鱼鳃丝血管扩张充血,鳃小片呼吸上皮细胞肿胀、脱落。鳃丝基部的上皮细胞大量增生,层次增多。肾小管上皮细胞组织结构紊乱,细胞肿胀,管腔变狭小,有崩裂和坏死现象。提取病鱼的肾脏和鳃组织DNA为模板,针对世界动物卫生组织（OIE）推荐的检测锦鲤疱疹病毒（KHV）的Sph基因进行PCR检测,出现特异性扩增产物。将病鱼的肾脏和肝脏组织研磨过滤灭菌后,腹腔注射20尾健康鲤,实验组表现为急性死亡（累积死亡率为90%）,出现与自然发病鱼相同的症状。将组织匀浆接种到普通鲤脑细胞系（CCB）,盲传3代后可稳定地观察到典型的细胞病变。细胞培养物染色超薄切片电镜观察结果显示,病毒为有囊膜的球状,病毒粒子直径为180;00 nm。对分离株的TK基因全长序列进行系统发育分析,证实该毒株属于KHV亚洲1型毒株。本研究首次报道我国西南地区养殖鲤中KHV感染引起大面积死亡,为KHV起源进化、分类以及疾病诊断和防控提供重要依据。

关键词：鲤锦鲤疱疹病毒鲤疱疹病毒Ⅲ型(CyHV-3) 病毒分离鉴定系统进化分析

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侵染地黄的瓜类褪绿黄化病毒基因组序列克隆及系统进化分析

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植物保护学报 2023年第2期50卷 359-369页

作者：秦艳红文艺刘玉霞高素霞王飞鲁传涛河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业农村部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室郑州450002

为地黄脱毒及防控瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV),从河南省温县、武陟县和禹州市3个主产区采集60份具有花叶、黄化和褪绿等典型症状的地黄病叶样品,利用高通量测序技术对混合病样进行测定,利用CCYV-CPF/CPR和... 详细信息

为地黄脱毒及防控瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV),从河南省温县、武陟县和禹州市3个主产区采集60份具有花叶、黄化和褪绿等典型症状的地黄病叶样品,利用高通量测序技术对混合病样进行测定,利用CCYV-CPF/CPR和CCYV-P22F/P22R引物对60份样品进行反转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测,并利用9对引物对侵染地黄的CCYV全基因组序列进行扩增和克隆,用DNAMAN 6.0软件对CCYV的分子变异进行分析,利用MEGA X 10.0软件构建系统发育树。结果显示,60份地黄病叶样品中检测出了蚕豆萎蔫病毒2(broad bean wilt virus 2,BBWV2)、地黄花叶病毒(Rehmannia mosaic virus,ReMV)、油菜花叶病毒(youcai mosaic virus,YoMV)和CCYV等病毒;在60份样品中,有22份样品中检测到CCYV,检出率为36.7%;21个地黄分离物之间的CP基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为99.3%~100.0%和98.4%~100.0%,与其他分离物之间的CP基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为94.6%~100.0%和96.8%~100.0%,17个地黄分离物之间的P22基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为98.4%~100.0%和96.3%~100.0%,与其他分离物之间的P22基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为96.1%~100.0%和94.1%~100.0%;基于CP和P22基因核苷酸序列的系统发育树结果显示,CCYV不同分离物形成2个分支。CCYV地黄分离物的基因组包含RNA1和RNA2两个组分,全长分别为8607 nt和8041 nt,共编码12个蛋白;CCYV地黄分离物基因组高度保守,与其他分离物基因组RNA1和RNA2的核苷酸一致率均为99.7%~100.0%,基于基因组的系统发育树结果显示,CCYV地黄分离物的核苷酸序列与其他寄主上CCYV分离物的核苷酸序列聚为一个分支,而与毛形病毒属Crinivirus的其他病毒分开。

关键词：地黄瓜类褪绿黄化病毒全基因组序列系统进化分析外壳蛋白

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植物八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因保守结构域模式与系统进化分析

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植物生理学报 2013年第12期49卷 1407-1412页

作者：席海秀李洪艳佟少明辽宁师范大学生命科学学院辽宁省植物生物工程重点实验室辽宁大连116081

八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素生物合成过程中催化无色的八氢番茄红素形成有色的ζ-类胡萝卜素的关键酶。本文选取公开发表的PDS及通过在NCBI数据库中搜索得到的43条来自于不同物种的PDS的氨基酸序列进行分... 详细信息

八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素生物合成过程中催化无色的八氢番茄红素形成有色的ζ-类胡萝卜素的关键酶。本文选取公开发表的PDS及通过在NCBI数据库中搜索得到的43条来自于不同物种的PDS的氨基酸序列进行分析。通过CDD在线软件预测每条氨基酸序列保守结构域,结果表明,所选取序列均包含一个NAD(P)-binding domain保守结构域,其长度为51个氨基酸,不同物种保守结构域中氨基酸的突变集中在8个不同的位置上;利用MEGA等软件进行多序列比对后构建系统进化树,可以看到不同物种的PDS蛋白清晰地分类到各自的类群内,和传统的分类学结果一致,表明所有不同分支的PDS蛋白都是单系同源,并不存在物种间的水平基因转移。

关键词：八氢番茄红素脱氢酶保守结构域系统进化分析

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福建省柑橘褐斑病菌的分离、鉴定和系统进化分析

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植物保护学报 2019年第6期46卷 1243-1251页

作者：李亚吕佳芮朱玲鲁国东王宗华刘国坤福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室

为明确在福建省南平市的橘柚和三明市的温州蜜橘上发现的疑似柑橘褐斑病的病原菌种类,采用组织分离法获得纯化菌株,通过回接法验证菌株的致病性,利用形态学特征对病原菌进行初步鉴定,并采用最大似然法以多聚半乳糖醛酸酶基因endoPG为靶... 详细信息

为明确在福建省南平市的橘柚和三明市的温州蜜橘上发现的疑似柑橘褐斑病的病原菌种类,采用组织分离法获得纯化菌株,通过回接法验证菌株的致病性,利用形态学特征对病原菌进行初步鉴定,并采用最大似然法以多聚半乳糖醛酸酶基因endoPG为靶标对本研究以及国内外已报道的链格孢菌株构建系统发育树,分析其遗传多样性。结果表明,从病组织中共分离获得26株纯培养菌株,经形态学鉴定均为链格孢菌Alternaria spp.。利用分生孢子液接种橘柚离体嫩叶发现,有22株菌株能侵染橘柚叶片并产生与田间相似的褐斑病症状,确认该病害为链格孢引起的柑橘褐斑病。系统发育树分析结果显示,分离所得的26株菌株均聚在已报道的4个柑橘链格孢进化分支Clade1~Clade4中,其中21株菌株聚在国内特有的分支Clade4中,有3株菌株和1株菌株分别聚在国内外兼有的分支Clade3和Clade1中,1株菌株聚在国外特有的分支Clade2中,表明在福建省采集的这些柑橘褐斑病菌均为链格孢菌,且遗传多样性较丰富。

关键词：柑橘褐斑病链格孢菌病原菌分离鉴定系统进化分析

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河南省常见蚊种中沃尔巴克氏体感染分子检测及系统进化分析

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中国血吸虫病防治杂志 2023年第4期35卷 389-393页

作者：刘玉婷王丹贺志权钱丹刘颖杨成运鲁德领张红卫郑州大学公共卫生学院河南郑州450001 河南省疾病预防控制中心

目的了解河南省常见蚊种沃尔巴克氏体(Wolbachia)感染率及基因型别,为蚊媒病防控提供参考。方法2022年7-9月,在河南省濮阳市、南阳市和许昌市牛棚、羊圈和民房等生境中采集伊蚊、库蚊和按蚊样本,检测沃尔巴克氏体感染。分别扩增沃尔巴... 详细信息

目的了解河南省常见蚊种沃尔巴克氏体(Wolbachia)感染率及基因型别,为蚊媒病防控提供参考。方法2022年7-9月,在河南省濮阳市、南阳市和许昌市牛棚、羊圈和民房等生境中采集伊蚊、库蚊和按蚊样本,检测沃尔巴克氏体感染。分别扩增沃尔巴克氏体16S rDNA和wsp基因并测序,在NCBI数据中使用BLAST软件进行同源性比对。将所获16SrDNA基因序列与GenBank数据库中16S rDNA基因序列进行比较,采用MEGA 11.0软件构建16S rDNA和wsp基因进化树。结果2022年7—9月,在南阳市、许昌市和濮阳市3个采样点累计采集506只雌性成蚊,沃尔巴克氏体总检出率为45.1%,其中白纹伊蚊感染率为97.9%(143/146),高于淡色库蚊(50.6%,85/168),差异有统计学意义(χ^(2)=88.064,P<0.01)。许昌市淡色库蚊沃尔巴克氏体感染率为96.8%(62/64),高于南阳市(15.6%,7/45)和濮阳市(27.1%,16/59),差异有统计学意义(χ^(2)=89.950,P<0.01)。蚊虫沃尔巴克氏体16S rDNA基因所得序列同源性为95.3%~100.0%,wsp基因所得序列同源性为81.7%~99.8%。经wsp基因系统进化分析发现,3个采样点蚊虫体内沃尔巴克氏体存在A组和B组,其中A组分为wAlbA型和wMors型、B组分为wPip型和wAlbB型。濮阳市和南阳市白纹伊蚊感染wAlbB型沃尔巴克氏体、许昌市白纹伊蚊感染wAlbA型;3个采样点淡色库蚊均感染wPip型,南阳市发现1只淡色库蚊感染wMors型。结论河南省白纹伊蚊、淡色库蚊普遍携带沃尔巴克氏体,其中白纹伊蚊主要感染wAlbB型和wAlbA型,淡色库蚊主要感染wPip型。河南省首次发现淡色库蚊体内感染沃尔巴克氏体wMors型。

关键词：沃尔巴克氏体 16S rDNA wsp基因系统进化分析白纹伊蚊淡色库蚊中华按蚊河南省

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2014～2017年环鄱阳湖地区H3亚型禽流感病毒流行情况和系统进化分析

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病毒学报 2018年第1期34卷 1-8页

作者：焦铭刘晓青陈涛张恒傅伟杰谢昀李希妍曾晓旭祝菲舒跃龙王大燕中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织全球流感参比和研究合作中心卫生和计划生育委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 江西省疾病预防控制中心南昌330029

为研究环鄱阳湖地区禽流感病毒（AIVs）的流行情况,本研究于2014~2017年在环鄱阳湖地区家禽相关环境中开展AIVs监测,通过病毒分离和二代测序共获得211株H3亚型AIVs,占所有流感毒株的11.9%。其中包括97株H3N2（46.0%）,22株H3N8（10.4%）... 详细信息

为研究环鄱阳湖地区禽流感病毒（AIVs）的流行情况,本研究于2014~2017年在环鄱阳湖地区家禽相关环境中开展AIVs监测,通过病毒分离和二代测序共获得211株H3亚型AIVs,占所有流感毒株的11.9%。其中包括97株H3N2（46.0%）,22株H3N8（10.4%）,11株H3N6（5.2%）,5株H3N3（2.4%）,2株H3N1（0.9%）以及74株H3与其他亚型的混合毒株（35.1%）。病毒来源以活禽市场为主（94.3%）。2017年5月,在环鄱阳湖地区首次分离到H3N1亚型禽流感病毒,也是2003年以后再次在中国分离到该亚型AIVs。对病毒HA和NA基因进化分析显示环鄱阳湖地区有多个分支的H3亚型AIVs共同流行,除16株H3N8的NA基因聚集在北美谱系,其他的病毒均属于欧亚谱系。HA裂解位点氨基酸序列提示病毒属于低致病性禽流感病毒（LPAIVs）,但是PB1片段编码全长的PB1-F2蛋白,并且有10株病毒发生N66S突变,提示病毒对哺乳动物宿主致病性增加。另外,两株病毒M2蛋白S31N突变,提示病毒对金刚烷胺类药物产生耐药性。本研究为H3亚型禽流感病毒的风险评估提供了科学依据,需要持续加强监测,为各亚型禽流感病毒的预测预警和风险评估提供依据。

关键词：禽流感病毒 H3亚型监测系统进化分析

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滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析

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南方水产科学 2015年第2期11卷 101-108页

作者：胡玉婷胡王凌俊江河段国庆潘庭双安徽省农业科学院水产研究所安徽合肥230031

采用PCR产物直接测序法测定了14尾滁州鲫（Carassius auratus gibelio in Chuzhou）的线粒体细胞色素b（Cytochrome b,Cyt b）基因和控制区（D-loop）全序列,长度分别为1 141 bp和924 bp,且均无核苷酸变异位点。Cyt b基因的T、C、A和G... 详细信息

采用PCR产物直接测序法测定了14尾滁州鲫（Carassius auratus gibelio in Chuzhou）的线粒体细胞色素b（Cytochrome b,Cyt b）基因和控制区（D-loop）全序列,长度分别为1 141 bp和924 bp,且均无核苷酸变异位点。Cyt b基因的T、C、A和G含量分别为29.2%、27.8%、28.5%和14.5%;D-loop的T、C、A和G含量分别为33.2%、20.1%、32.6%和14.1%。2种序列中A＋T含量（57.7%,65.8%）均明显大于G＋C含量（42.3%,34.2%）,且G含量偏低,显示了与其他水生动物线粒体核苷酸碱基含量相似的特征。通过对滁州鲫的控制区结构进行分析,识别了其终止序列区（ETAS）、中央保守区（CD）和保守序列区（CSB）的关键序列。滁州鲫与其他鲫属鱼类的Cyt b和D-loop序列均具有高度的相似性,分别为93%-100%和94%-99%。基于2种序列的分子系统进化树分析均表明,滁州鲫与方正鲫（*** gibelio in Fangzheng）亲缘关系最近,而与来自日本的鲫类群亲缘关系最远。

关键词：滁州鲫细胞色素b 控制区系统进化分析

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贵州烟田马铃薯Y病毒优势株系全序列克隆及系统进化分析

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中国农业大学学报 2017年第7期22卷 34-39页

作者：夏范讲郭玉双贾蒙骜中国烟草总公司贵州省公司贵阳550004 贵州省烟草科学研究院烟草行业重点实验室贵阳550081

为了解马铃薯Y病毒在贵州烟田的发生和流行规律,对2013—2015年采集到的贵州省多个烟区呈现典型茎脉坏死症状的疑似受马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)侵染的烟草样品进行单斑分离和病毒鉴定,并以现有PVY序列信息为参考,设计了4对PVY特... 详细信息

为了解马铃薯Y病毒在贵州烟田的发生和流行规律,对2013—2015年采集到的贵州省多个烟区呈现典型茎脉坏死症状的疑似受马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)侵染的烟草样品进行单斑分离和病毒鉴定,并以现有PVY序列信息为参考,设计了4对PVY特异引物,经过RT-PCR扩增、T载体连接、序列测定以及序列拼接,并利用MEGA软件进行系统进化分析。结果发现PVY福泉分离物(PVY Fuquan isolate,PVY-FQ)和PVY大方分离物(PVY Dafang isolate,PVY-DF)为优势株系并获得了PVY-FQ和PVY-DF的全基因组序列。PVY FQ整条基因组由9 699个碱基组成,编码多聚蛋白的开放阅读框位于第188~9 373nt;PVY DF整条基因组由9 706个碱基组成,编码多聚蛋白的开放阅读框位于第190~9 375nt。2条序列的基本特征与已报道PVY基因组一致。对PVY-FQ和PVY-DF全序列与已报道PVY序列进行系统进化分析发现,PVY-FQ与PVY NTN株系具有较高的亲缘关系,而PVY-DF与PVYN具有较高亲缘关系。

关键词：马铃薯Y病毒基因组序列系统进化分析

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