检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：王维西北农林科技大学

学位级别：硕士

肝X受体α（Liver X Receptorα, LXRα）是核受体超家族中非甾体类成员,LXRα特异表达于脂质代谢旺盛的组织,如肝、肠、肾、乳腺、脾和肌肉等。大量研究证明LXRα是机体保持胆固醇相对稳定的关键感受器。可通过调控胆固醇的输出、胆汁... 详细信息

肝X受体α（Liver X Receptorα, LXRα）是核受体超家族中非甾体类成员,LXRα特异表达于脂质代谢旺盛的组织,如肝、肠、肾、乳腺、脾和肌肉等。大量研究证明LXRα是机体保持胆固醇相对稳定的关键感受器。可通过调控胆固醇的输出、胆汁酸的产生、脂肪酸的合成及几种脂质转运蛋白从而保持机体脂质的动态平衡。在山羊上,目前还没有完整的LXRα基因序列。本研究克隆西农萨能奶山羊乳腺LXRα基因的cDNA序列并对其进行生物信息学分析;研究西农萨能奶山羊LXRα基因组织表达差异;研究LXRα激动剂TO901317对乳腺上皮细胞中LXRα基因、脂肪酸合酶（Fatty acid synthase, FASN）基因、脂蛋白脂酶（Lipoprotein Lipase, LPL）基因的表达及对细胞脂肪酸组成的影响。试验结果如下: 本研究采用RT-PCR和RACE技术,分离并克隆了西农萨能奶山羊LXRα基因的cDNA序列,其全长1654bp（GenBank收录号为:GU332719）,包括5’UTR150bp,CDS 1344bp和3’UTR 160bp,共编码447个氨基酸。经序列比对发现山羊LXRα基因与其他物种相似性较高,其CDS与GeneBank中牛（BC103207）、小鼠（NM013839）、大鼠（NM031627）、猪（NM001101814）和人（NM005693）的LXRα基因相比较,CDS核苷酸相似性分别为98%、87%、87%、93%和90%,氨基酸的相似性分别为98%、91%、91%、96%和92%。其UTR核苷酸与牛、小鼠、大鼠、猪和人的相应序列比较,5’UTR相似性为93%、27%、82%、23%和74%,3’UTR相似性为98%、63%、65%、78%和79%。经蛋白质结构分析表明,推测山羊LXRα蛋白质的分子量为50.35kD,等电点为6.30,整个序列中不含信号肽与跨膜结构。该蛋白N端到C端均存在较强的亲水区域,按分值大小划分其疏水最大值为3.233,最小值为-3.089,分别位于第84和361氨基酸序列处。LXRα二级结构主要由49.66%不规则卷曲、49.00%α-螺旋和1.34%延伸链组成。其二级结构主要包括三个功能结构域:配体结合区域（LBD, Ligand-binding Domain）、DNA结合区域（DBD, DNA-binding Domain）和锌指蛋白C4型区域（zf-C4, Zinc finger C4 type）。应用ABI PRISM?7300实时荧光定量PCR仪采用SYBR-Green法对西农萨能奶山羊11个组织LXRα基因表达量检测,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶（glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, GAPDH）基因为内参。试验结果显示LXRα基因在垂体、肺脏、肝脏、瘤胃、卵巢、脾脏、皮下脂肪、乳腺、肾脏、心脏及小肠组织中均有表达。LXRα基因在小肠组织中的表达量最高,肝脏、脾脏、皮脂、乳腺次之,分析表明小肠表达量相对于其他组织差异显著（P<0.05）,肝脏、脾脏、皮脂、乳腺基因表达量间差异不显著（P>0.05）,心脏中表达量最低。以西农萨能奶山羊乳腺上皮细胞为试验材料,应用激动剂TO901317（0、0.1、0.01、1、10）μmol/L浓度的培养基处理细胞（0μmol/L为空白对照）,在相同处理时间下乳腺上皮细胞中LXRα、FASN、LPL基因mRNA表达量均上调,其中10μmol/L的LXRα激动剂表达量上调最大;同种浓度激动剂处理条件下,随着培养时间的延长（12、24、48、72）h,乳腺上皮细胞中LXRα、FASN、LPL基因mRNA表达量呈先升高后降低的趋势,培养48h达到最大值。相关分析表明,不同浓度（0.1、0.01、1、10）μmol/L激动剂对西农萨能奶山羊乳腺上皮细胞LXRα、FASN、LPL基因mRNA表达量呈正相关。对细胞总脂肪酸检测结果显示,细胞内总脂肪酸含量增加,不饱和脂肪酸的比例升高,表明LXRα基因对乳腺上皮细胞不饱和脂肪酸具有重要的调控作用。

关键词： LXRα基因生物信息学组织表达分析 TO901317

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毛白杨中生长素转运蛋白PtoPIN2a和PtoPIN5a功能的初步研究

毛白杨中生长素转运蛋白PtoPIN2a和PtoPIN5a功能的初步研究

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作者：李建波华中农业大学

学位级别：硕士

生长素在调控细胞分裂与分化、营养器官的伸长以及植物顶端优势维持中起重要作用。在生长素的极性运输中,转运蛋白PIN-FORMED (PIN)起着主导作用。研究发现杨树PIN基因家族(PtoPIN)含有15个成员,但它门的功能未知。本实验选取其中的PtoP... 详细信息

生长素在调控细胞分裂与分化、营养器官的伸长以及植物顶端优势维持中起重要作用。在生长素的极性运输中,转运蛋白PIN-FORMED (PIN)起着主导作用。研究发现杨树PIN基因家族(PtoPIN)含有15个成员,但它门的功能未知。本实验选取其中的PtoPIN2a和PtoPIN5a两个基因为研究对象,通过RT-PCR、亚细胞定位与转基因等方法对基因的表达模式和功能进行了初步研究,为揭示PIN蛋白在杨树发育过程中的分子作用机理奠定了基础。本实验得到如下主要结果：(1)在蛋白结构预测中发现：PtoPIN2a含有633个氨基酸,分子量为68KD,等电点9.34;PtoPIN5a含有346个氨基酸,分子量为37KD,等电点为8.84。PtoPIN2a和PtoPIN5a都含有2个具有5次跨膜折叠的疏水区和1个中间亲水区。将PtoPIN2a和PtoPIN5a与拟南芥PIN家族进行蛋白聚类分析,发现PtoPIN2a与AtPIN2氨基酸序列相似性达到82%,PtoPIN5a与AtPIN5氨基酸序列相似性达到71%。(2)通过对杨树不同组织中PIN基因的半定量分析,发现PtoPIN2a和PtoPIN5a在根中特异表达。克隆PtoPIN2a和PtoPIN5a启动子,并构建植物表达载体pPtoPIN2a::GUS和pPtoPIN5a::GUS,转化84K杨,获得转基因杨树植株。经GUS活性检测,发现PtoPIN2a启动子主要在根冠和根中柱的小部分区域表达,PtoPINSa启动子主要在根冠和根中柱中的大部分区域表达,进一步验证了PtoPIN2a和PtoPIN5a的表达具有根特异性。(3)通过构建PtoPIN2a和PtoPINSa与YFP的融合表达载体,并转化拟南芥和注射烟草,分析PtoPIN2a和PtoPIN5a的亚细胞定位。结果表明,PtoPIN2a亚细胞定位在质膜上,可能参与生长素在细胞内外的转运;PtoPIN5a亚细胞定位在内质网上,可能参与调控细胞内生长素的平衡。(4)通过构建过表达载体3SS::PtoPIN2a和35S::PtoPIN5a,转化84K杨,经PCR检测分别得到阳性苗48株和50株。PtoPIN2a过表达植株侧根数明显增多,不定根的数目和长度没有明显变化;PtoPIN5a过表达植株侧根数明显减少,不定根的长度却明显增加。通过构建抑制表达载体RNAi-PtoPIN2a和RNAi-PtoPIN5a,转化84K杨,经PCR检测分别得到阳性苗80株和27株。PtoPIN2a抑制表达植株根系发育受到严重影响,侧根数、不定根数明显减少,部分根的生长失去向地性,植株生长变缓慢;PtoPIN5α抑制表达植株没有明显变化,这可能是由于在杨树中存在与PtoPIN5α功能相近的基因能行使PtoPIN5α部分功能。

关键词：毛白杨 PIN 组织表达分析亚细定位基因功能

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异育银鲫中科3号MSTN基因的克隆与序列分析

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江苏农业科学 2014年第11期42卷 40-44页

作者：张颖李冰朱健蒋高中南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081

采用同源克隆和末端快速扩增（rapid amplication of cDNA ends，RACE）方法分离克隆了异育银鲫（Allogyoge-netics crucian carp）中科3号肌肉生长抑制素（myostatin，MSTN）基因全长DNA，得到3394 bp全长的DNA，包含3段外显子和2段内... 详细信息

采用同源克隆和末端快速扩增（rapid amplication of cDNA ends，RACE）方法分离克隆了异育银鲫（Allogyoge-netics crucian carp）中科3号肌肉生长抑制素（myostatin，MSTN）基因全长DNA，得到3394 bp全长的DNA，包含3段外显子和2段内含子，其中2098 bp的全长cDNA在NCBI数据库中进行序列比对后，确定为异育银鲫中科3号MSTN基因。对推测的MSTN基因氨基酸序列进行同源性比对和系统分析显示：MSTN基因在异育银鲫与斑马鱼及其他鱼类间的氨基酸序列相似度为73．5％～98．0％，与鲤鱼MSTN基因相似度最高（98．0％），不同物种间MSTN的氨基酸序列较为保守。用半定量RT－PCR检测MSTN基因在异育银鲫心、肠、肌、脑、鳃和肝的相对表达量结果表明，MSTN基因在脑中含量最高，其次是肌、鳃、心、肠，在肝脏中含量最低。

关键词：异育银鲫肌肉生长抑制素同源法克隆末端快速扩增法序列分析组织表达分析

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黄鳝MIF和Cathepsin B基因的克隆与嗜水气单胞菌感染下的表达模式分析

黄鳝MIF和Cathepsin B基因的克隆与嗜水气单胞菌感染下的表达模式...

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作者：林荣楠四川农业大学

学位级别：硕士

嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染诱发的疾病给黄鳝(Monopterus albus)养殖业带来了巨大风险。巨噬细胞移动抑制因子(Macrophage migration inhibitory factor,MIF)是一种重要的先天免疫调节因子,在细胞增殖和免疫应答的激活等... 详细信息

嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染诱发的疾病给黄鳝(Monopterus albus)养殖业带来了巨大风险。巨噬细胞移动抑制因子(Macrophage migration inhibitory factor,MIF)是一种重要的先天免疫调节因子,在细胞增殖和免疫应答的激活等多种信号转导通路中起重要作用。CathepsinB属于木瓜蛋白酶家族中的溶酶体半胱氨酸蛋白酶,在参与细胞内蛋白质降解、维持细胞稳态的正常代谢、间接参与免疫反应等方面起重要作用。迄今未有人对黄鳝MIF和CathepsinB基因进行研究。在本实验中我们用同源克隆的方法获得,并分析了黄鳝MIF和Cathepsin B基因的开放阅读框(openreadingframe,ORF)。并用荧光定量PCR技术分析了 MIF和Cathepsin B基因在正常健康黄鳝肠、肝脏、肌肉、皮肤、脾脏、肾脏和心脏等组织中的组织表达模式。检测了嗜水气单胞菌攻毒(***),检测了黄鳝在攻毒后Oh、4h、8h、12h、24h和48h后MIF和CathepsinB基因在黄鳝皮肤、肝脏、肾脏、脾脏中的表达情况。MIF基因的开放阅读框长348bp,编码115个氨基酸,序列已呈递NCBI数据库(序列号为KY318074)。CathepsinB的开放阅读框长993bp,编码330个氨基酸,序列已呈递NCBI数据库(序列号为KY318075)。基因相似性分析表明,MIF与其他鱼类、两栖类、哺乳类相似性达到72%-90%,CathepsinB与其他鱼类、两栖类、鸟类、哺乳类的相似相达到80%-94%。MIF和Cathepsin B的系统发育分析表明,其进化树都主要分为两支,一支包含鱼类的蛋白质序列,另一支包含两栖类、爬行类、哺乳类和鸟类的蛋白质序列,证实了不同群体间的进化关系。MIF在所有检测的组织中都表达,在肝脏和肾脏表达量最高,在心脏、脾、肠和肌肉的表达水平次之,在皮肤中表达水平最低。CathepsinB在肝、脾、肾的表达量高于在肠道、肌肉、心脏和皮肤中的表达量。经嗜水气单胞菌攻毒后Oh到48 h,MIF和Cathepsin B基因的表达量在皮肤、肝脏、头肾、脾脏表达量都升高,12h达峰值,并且这种诱导是时间依赖性的。说明MIF和Cathepsin B参与了黄鳝对抗嗜水气单胞菌感染的免疫应答。结果表明MIF和Cathepsin B在组织表达量的增加,可能是由于其参与了黄鳝对抗败血症的免疫应答。

关键词：黄鳝 MIF Cathepsin B 基因克隆组织表达分析嗜水气单胞菌

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番茄芯片杂交差异表达耐旱相关基因的克隆与分析

番茄芯片杂交差异表达耐旱相关基因的克隆与分析

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作者：肖亮华中农业大学

学位级别：硕士

干旱作为一种非生物逆境最主要的形式,严重影响了作物的产量和品质,在很多地区是农业发展的瓶颈,因而抗逆育种特别是抗旱育种一直受到重视。番茄(Solanum lycopersicum)是一种世界性的蔬菜作物,也是科学研究的模式植物。本研究以本实验... 详细信息

干旱作为一种非生物逆境最主要的形式,严重影响了作物的产量和品质,在很多地区是农业发展的瓶颈,因而抗逆育种特别是抗旱育种一直受到重视。番茄(Solanum lycopersicum)是一种世界性的蔬菜作物,也是科学研究的模式植物。本研究以本实验室通过基因芯片杂交筛选出的一些干旱响应基因信息为基础,选取其中三个基因即晚期胚胎富集蛋白基因(LEA),发育相关的一个转录因子基因(Hox)和蛋白酶抑制剂基因(TR)(三个候选基因的超量表达载体已由本实验室构建,其中LEA是从番茄干旱敏感品种M82中克隆,Hox和TR是从野生种潘那利中克隆。)拟通过遗传转化和其他分子生物学的方法对其进行克隆与分析,为下一步系统分析关键基因的生物学功能及其作用的分子机理奠定基础。本研究获得的主要结果如下: 1.根据SGN(***)中公布的基因信息(SGN-U213276),克隆到番茄晚期胚胎富集蛋白基因SlLEA3 cDNA,经生物信息学分析发现该基因与番茄第3号染色体上的一个BAC 100%同源(BAC号为C03HBa0323D22),其gDNA序列长839bp,cDNA长756bp,含有一个内含子,CDS长516bp,编码171个氨基酸。氨基酸比对结果显示与番茄LEA同源性最高的植物是长春花(Catharanthusroseus),为56%。生物信息学预测了其蛋白质的一级结构和二级结构,预测结果表明该蛋白具有良好的亲水性,说明植物在遭遇干旱胁迫时该基因是通过其蛋白产物的高级结构使细胞免受损伤来行使功能的。通过PlantCARE软件预测了该基因的启动子序列和一些与干旱响应相关的元件。 2.以农杆菌介导的方法将正义SpHox和SpTR8导入到普通番茄品种A57中,分别获得转化植株6株和2株,PCR检测结果表明,外源基因已整合到番茄基因组中。 3.半定量RT-PCR分析了各候选基因在亲本材料M82和潘那利中的表达模式。其中SlLEA3在M82和潘那利中表达差异较大,在M82的叶片,花和果实中均有表达,但在潘那利中仅能在果实中检测到较弱的表达;SpHox在潘那利各组织中呈组成型表达,且从幼叶到茎,其表达丰度逐渐升高,在M82的根中该基因几乎不表达,从幼叶到老叶表达量也呈逐渐上升,但不如在潘那利中明显,且在茎中表达很弱;SpTR8在潘那利各组织中均有表达,但在M82的叶片和果实中的表达量很弱,在根无法检测到表达。 4.半定量RT-PCR调查了SlLEA3基因在不同干旱程度胁迫和ABA,NaCl,SA,Cold等诱导下在M82叶片中的表达量,结果表明SlLEA3基因的表达量随ABA和NaCl胁迫程度的增加而升高,同时也受SA诱导,而对冷诱导无响应。 5.构建了原核表达载体pET-SlLEA3,使重组蛋白在原核细胞中大量表达。在高盐胁迫条件下,该基因表达产物在大肠杆菌表达体系中显示出较好的保护作用。

关键词：番茄(Solanum lycopersicum) 生物信息学 cDNA克隆大肠杆菌组织表达分析

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转拟南芥氨基酸通透酶基因（AtAAP1）玉米的功能研究

转拟南芥氨基酸通透酶基因（AtAAP1）玉米的功能研究

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作者：李慧杰吉林农业大学

学位级别：硕士

氨基酸通透酶(amino acid permease,AAP),是位于细胞膜上与氨基酸转运有关的载体蛋白。目前研究表明,模式植物拟南芥中已经筛选出许多植物氨基酸转运蛋白。本研究以转胚乳特异性启动子玉米、转组成型启动子玉米为实验材料,探究AtAAP1基... 详细信息

氨基酸通透酶(amino acid permease,AAP),是位于细胞膜上与氨基酸转运有关的载体蛋白。目前研究表明,模式植物拟南芥中已经筛选出许多植物氨基酸转运蛋白。本研究以转胚乳特异性启动子玉米、转组成型启动子玉米为实验材料,探究AtAAP1基因在玉米中的功能。本研究利用荧光定量PCR的方法分析了AtAAP1基因在转胚乳特异性启动子玉米种子中的组织表达情况,同时测定了含有两种不同类型启动子(胚乳特异性启动子和组成型启动子)的转AtAAP1基因玉米根、叶、种子的生理生化指标:游离氨基酸含量、可溶性蛋白质含量、总氮含量、20种氨基酸及其组成、α和β醇溶蛋白含量、脯氨酸含量和赖氨酸含量。为深入了解AtAAP1基因的功能、进而明确玉米氮素的利用机理提供理论依据,使其应用于产业化。主要结果如下:1、对不同生育期,转胚乳特异性启动子玉米与转组成型启动子玉米根、叶、种子,游离氨基酸含量、可溶性蛋白质含量、脯氨酸、赖氨酸含量进行测定,发现游离氨基酸与可溶性蛋白质的含量在转胚乳特异性启动子玉米根和种子中较高;脯氨酸与赖氨酸的含量在转胚乳特异性启动子玉米种子中较高;吐丝期时,两种类型转基因玉米根和叶中游离氨基酸与可溶性蛋白质的含量均最高。2、测定转胚乳特异性启动子玉米阳性植株与阴性植株种子中AtAAP1基因的表达,发现AtAAP1基因在阳性玉米种子中的表达远远高于阴性对照,乳熟期AtAAP1基因的表达最低,蜡熟期至完熟期逐渐升高。3、测定转胚乳特异性启动子玉米阳性植株与阴性植株不同生育期根、叶、种子游离氨基酸与可溶性蛋白质含量发现,根和叶片在吐丝期时,两者含量最高;种子在完熟期时两者含量最高。阳性植株根与种子中游离氨基酸与可溶性蛋白质的含量均高于阴性植株,而叶中游离氨基酸与可溶性蛋白质含量与根中相反。阳性植株根中游离氨基酸含量最高可达到阴性植株的1.44倍;可溶性蛋白质的含量可达到阴性植株的1.69倍。阳性玉米种子中游离氨基酸含量最高可达到阴性玉米种子的1.36倍;可溶性蛋白质的含量可达到阴性玉米种子的1.69倍。4、分析转胚乳特异性启动子玉米阳性植株和阴性植株根、叶、种子中总氮含量与20种氨基酸及其组成,发现阳性植株生殖器官种子中总氨基酸含量、总氮含量均高于阴性植株;阳性玉米种子中的中性氨基酸、谷氨酸含量增高明显。5、利用BandScan凝胶分析软件对转胚乳特异性启动子玉米阳性种子与阴性种子醇溶蛋白含量分析,表明阳性玉米种子中α醇溶蛋白和β醇溶蛋白的含量较高。

关键词：转基因玉米氨基酸通透酶1(AAP1) 生理生化指标组织表达分析

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牦牛DIO2基因克隆及其在骨骼肌的表达分析

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西南民族大学学报（自然科学版） 2019年第6期45卷 551-558页

作者：熊燕赵丹刘静怡石超宋紫文华永林张静柏雪李键熊显荣西南民族大学生命科学与技术学院四川成都610041 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川成都610041 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室四川成都610041

为探索DIO2基因调控牦牛骨骼肌发育及肌纤维类型组成的潜在功能,克隆DIO2基因CDS序列并进行相关的生物信息学分析,以及比较分析其在牦牛骨骼肌的差异表达.结果显示,DIO2基因的CDS全长为789 bp,编码132个氨基酸.序列同源性比对及系统进... 详细信息

为探索DIO2基因调控牦牛骨骼肌发育及肌纤维类型组成的潜在功能,克隆DIO2基因CDS序列并进行相关的生物信息学分析,以及比较分析其在牦牛骨骼肌的差异表达.结果显示,DIO2基因的CDS全长为789 bp,编码132个氨基酸.序列同源性比对及系统进化树分析发现,牦牛DIO2基因与普通牛的亲缘关系最近,核酸及蛋白序列与普通牛一致;与小鼠的亲缘关系较远,序列同源性仅为86.75%和87.12%,与原鸡的亲缘关系最远,二者的同源性分别为79.17%和76.30%.理化性质预测表明DIO2蛋白为不稳定疏水性蛋白,有跨膜结构域,具有24个磷酸化位点,蛋白结构为无规则卷曲、α-螺旋和延伸链三者交替出现.采用实时荧光定量PCR分析显示,DIO2基因在牦牛的脾、肺等内脏组织表达无显著差异;在背最长肌和半腱肌的表达量显著高于脂肪和肝脏组织(P<0.01).此外,DIO2在金川牦牛半腱肌的表达量显著高于麦洼牦牛(P<0.05).以上结果为研究DIO2在牦牛骨骼肌的功能提供参考资料.

关键词：牦牛 DIO2基因骨骼肌组织表达分析生物信息学分析

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加州鲈Caspase-3基因克隆及表达分析

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安徽农学通报 2023年第21期29卷 73-79页

作者：梁富宋长江唐怀庆丘金珠赵天珍郑汉生宋海霞中山市农产品质量安全检验所广东中山528400

从加州鲈(Micropterus salmoides)头肾组织中克隆获得Caspase家族中Caspase-3基因的编码区序列,通过生物信息学分析工具分析Caspase-3基因的蛋白结构,预测其功能并检测其在加州鲈各组织中的表达量。结果表明,该基因cDNA全长890 bp,ORF为... 详细信息

从加州鲈(Micropterus salmoides)头肾组织中克隆获得Caspase家族中Caspase-3基因的编码区序列,通过生物信息学分析工具分析Caspase-3基因的蛋白结构,预测其功能并检测其在加州鲈各组织中的表达量。结果表明,该基因cDNA全长890 bp,ORF为852 bp,可编码283个氨基酸,蛋白理论分子质量为73.06 ku,理论等电点(PI)为5.09;Caspase-3基因含有一个保守信号肽序列,不存在跨膜区;多序列比对结果显示加州鲈Caspase-3与红笛鲷(Lutjanus peru)Caspase-3相似度最高,高达88.38%;系统进化分析发现加州鲈Caspase-3与红笛鲷聚为一支;Caspase-3基因在所取组织中均有表达,在脑组织中表达量最高,在鳃组织中表达量最低。

关键词：加州鲈 Caspase-3 生物信息学组织表达分析

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加州鲈p65基因克隆及表达分析

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安徽农业科学 2024年第16期52卷 91-95,100页

作者：丘金珠唐怀庆宋海霞赵天珍梁富邓晓华梁莹宋长江中山市农产品质量安全检验所广东中山528400

从加州鲈(Micropterus salmoides)脑组织中克隆获得NF-κB家族中p65基因的编码区序列,该基因cDNA全长1944 bp,ORF为1899 bp,可编码632个氨基酸。理论分子质量为69.61 ku,理论等电点(PI)为5.66,通过生信学分析工具对p65基因蛋白结构进行... 详细信息

从加州鲈(Micropterus salmoides)脑组织中克隆获得NF-κB家族中p65基因的编码区序列,该基因cDNA全长1944 bp,ORF为1899 bp,可编码632个氨基酸。理论分子质量为69.61 ku,理论等电点(PI)为5.66,通过生信学分析工具对p65基因蛋白结构进行分析,同时对其蛋白功能进行预测,结果显示:该基因不含有信号肽序列,同时不存在跨膜结构域,但存在1个NF-κB家族保守的结构域。多序列比对结果显示,加州鲈(Micropterus salmoides)p65与小口黑鲈(Micropter us dolomieu)的相似度最高,达99.30%;构建系统进化树发现,加州鲈(Micropterus salmoides)p65与小口黑鲈(Micropter us dolomieu)聚为一支。通过qRT-PCR结果表明,加州鲈p65基因在所取组织均有表达,在脑组织中表达量最高,其次是头肾、胸腺和心脏,在脾脏组织中的表达量最低。

关键词：加州鲈 p65 生物信息学组织表达分析

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陆地棉GhACS基因家族鉴定及表达分析

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河南大学学报（自然科学版） 2019年第3期49卷 303-310页

作者：李辰曦刘凌云王松江静棉花生物学国家重点实验室/河南省植物逆境生物学重点实验室/河南大学生命科学学院

1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase,ACS,EC 4.4.1.14)是乙烯生物合成过程的限速酶,对乙烯在高等植物体内的代谢调控具有至关重要的作用.本文通过系统发育分析和序列比对研究,鉴定出陆地棉基因组共编... 详细信息

1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase,ACS,EC 4.4.1.14)是乙烯生物合成过程的限速酶,对乙烯在高等植物体内的代谢调控具有至关重要的作用.本文通过系统发育分析和序列比对研究,鉴定出陆地棉基因组共编码22个GhACS基因,其编码蛋白含有7个与功能密切相关的保守基序,C末端具有多个潜在的Ser磷酸化位点;GhACS基因组织表达分析显示每个GhACS在棉花不同组织不同发育阶段表现出不同的基因表达谱,这些结果为进一步探究陆地棉GhACS基因家族的功能提供了有力的依据和参考.

关键词：陆地棉 ACS基因家族生物信息学分析组织表达分析

来源：评论

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