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西南民族大学学报（自然科学版） 2021年第2期47卷 139-148页

作者：赵丹熊燕华永琳岳永起郭玉熊显荣字向东殷实李键西南民族大学畜牧兽医学院四川成都610041 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川成都610041 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室四川成都610041

旨在克隆牦牛解偶联蛋白1(UCP1)基因序列,并对其进行生物信息学分析,进一步研究该基因在牦牛各组织的表达规律.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛UCP1基因全长序列,生物信息学分析牦牛CDS区,qPCR检测UCP1基因在牦牛不同组织中的... 详细信息

旨在克隆牦牛解偶联蛋白1(UCP1)基因序列,并对其进行生物信息学分析,进一步研究该基因在牦牛各组织的表达规律.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛UCP1基因全长序列,生物信息学分析牦牛CDS区,qPCR检测UCP1基因在牦牛不同组织中的表达模式.结果表明,UCP1基因全长为954 bp(GenBank ***345537),其中开放阅读框(Open reading frame,ORF)全长为942 bp,编码313个氨基酸.蛋白分子特性预测UCP1蛋白为不稳定疏水性蛋白,存在跨膜结构域以及多个磷酸化位点.二级结构和三级结构预测显示,UCP1蛋白由无规则卷曲、α螺旋和延伸链三者交替出现.牦牛UCP1基因的核苷酸和氨基酸序列与普通牛的相应序列相似度最高,同源性分别为97.63%和96.76%;与斑马鱼的核苷酸序列和氨基酸序列相似度最低,分别为62.58%和64.29%.组织表达分析发现UCP1在牦牛心、肝、脾、肺、肾、脂肪、背肌、半腱肌中均有表达,但在肾中的表达量最高,肾与其他组织之间差异显著(P<0.05).不同品种牦牛UCP1基因的差异表达分析发现,其在麦洼牦牛背最长肌、肝中的表达量均显著高于金川牦牛(P<0.05和P<0.0001).这些结果为丰富牦牛UCP1基因的功能研究提供了参考依据.

关键词：牦牛 UCP1基因组织表达分析生物信息学分析

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藏山羊KLF6基因克隆及组织表达分析

藏山羊KLF6基因克隆及组织表达分析

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2017年全国养羊生产与学术研讨会暨养羊学分会第七次全国会员代表大会

作者：池永东王永朱江江林森赵越林亚秋青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室

引言KLFs(Krüppel-like factors)家族是一类羧基端具有三个锌指结构的转录因子,广泛存在于真核生物中。KLF6是KLFs家族中的重要一员,与靶基因的启动子结合来调控下游靶基因的表达,有研究表明KLF6可能通过抑制DLK1(delta drosophila... 详细信息

引言KLFs(Krüppel-like factors)家族是一类羧基端具有三个锌指结构的转录因子,广泛存在于真核生物中。KLF6是KLFs家族中的重要一员,与靶基因的启动子结合来调控下游靶基因的表达,有研究表明KLF6可能通过抑制DLK1(delta drosophila homolog-like 1)来促进3T3-L1前体脂肪细胞分化。因此本研究以藏山羊为研究对象,利用RT-PCR方法克隆藏山羊KLF6基因序列,并利用相关的生物学软件进行生物信息学分析,利用实时荧光定量

关键词：组织表达分析基因序列基因克隆前体脂肪细胞

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军曹鱼MHC-Ⅱa基因全长cDNA的克隆及其组织表达分析

军曹鱼MHC-Ⅱa基因全长cDNA的克隆及其组织表达分析

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中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第五次会员代表大会暨第十六次学术研讨会

作者：茅莉娜冯娟郭志勋许海东李玉谷华南农业大学兽医学院中国水产科学研究院南海水产研究所

采用同源克隆和末端快速扩增方法,得到998 bp的军曹鱼(Rachycentron canadum)MHC-Ⅱa全长cDNA片段。该序列包括53 bp的5'末端非编码区(5'UTR),234 bp的3'末端非编码区(3'UTR)及711 bp的开放阅读框(ORF),编码236个氮基酸... 详细信息

采用同源克隆和末端快速扩增方法,得到998 bp的军曹鱼(Rachycentron canadum)MHC-Ⅱa全长cDNA片段。该序列包括53 bp的5'末端非编码区(5'UTR),234 bp的3'末端非编码区(3'UTR)及711 bp的开放阅读框(ORF),编码236个氮基酸,预测其蛋白质分子量约为25.94kD,等电点为4.39。通过构建MHC-Ⅱa氨基酸序列的系统进化树,并进行比对,结果表明,与已知鱼类、老鼠(Mus musculus)及人类(Homo sapiens)MHC-Ⅱa基因的同源性在25.0%-69.5%之间。所推测的蛋白质序列具有一些重要的特征,包括前导肽、a1、a2和CP/TM/CYT区,保守的半胱氨酸等。Real-time PCR检测结果显示,MHC-Ⅱa基因在正常军曹鱼组织中均有表达,但其表达量在各种组织中存在差异,其中较强的表达于头肾、鳃,中等程度表达于脾、肠,在心、脑、肌肉中表达较弱。经LPS刺激后,头肾中MHC-Ⅱa基因表达下调。

关键词：军曹鱼 MHC-Ⅱa 全长cDNA 组织表达分析

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菲律宾蛤仔RP2基因的克隆与组织表达分析

菲律宾蛤仔RP2基因的克隆与组织表达分析

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2014年中国水产学会学术年会

作者：裴爱君赵祥吉秦艳杰闫喜武李霞王福景大连海洋大学辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心

本实验首次采用反转录PCR(RT-PCR)与c DNA末端快速克隆(RACE)法首次从菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)外套膜中克隆出RP2基因(Gene Bank登录号:KF826881)。该基因c DNA序列长度为1158bp,包括62bp的5’端非编码区,41bp的3’端非编码区,开放阅读框1053bp,编码350个氨基酸。推导的氨基酸序具有TBCC(57-175aa)和CARP(65-102aa)保守结构域,并为非跨膜糖蛋白。在NCBI中Blast同源性比较表明,基因氨基酸序列与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)XPR2具有较高相似性(56%),与高等哺乳动物、鸟类、鱼类、两栖类及节肢动物的各模式动物之间相似性在43-53%之间,与非洲眼线虫(Loa loa)的相似性较低为33%。利用实时定量PCR技术检测RP2基因在蛤仔不同组织中的表达,结果显示,PR2基因在菲律宾蛤仔雄性性腺表达量最高,其次为鳃、水管和外套膜,在斧足和闭壳肌中表达量很少,在雌性性腺中没有表达。这说明RP2基因表达较广泛,但不同组织表达量存在明显差异。

关键词：菲律宾蛤仔 RP2 分子克隆组织表达分析

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猪脂肪滴表面结合蛋白perilipin、TIP47和CGI-58的cDNA克隆、基因定位和组织表达分析

猪脂肪滴表面结合蛋白perilipin、TIP47和CGI-58的cDNA克隆、基因...

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全国动物生理生化第九次学术交流会

作者：夏涛甘莉张沛超杨在清华中农业大学生命科学技术学院华中农业大学生命科学技术学院华中农业大学生命科学技术学院华中农业大学生命科学技术学院

动物体内储存的脂肪是维持细胞正常代谢所必须的,但是,中性脂肪的异常积累会引起严重的疾病,例如,脂肪肝、肥胖、Ⅱ型糖尿病和动脉粥样硬化等,同时,在畜牧业中也会影响肉类的品质。脂肪滴结合蛋白是一类结合在脂肪滴表面的蛋白质,它们... 详细信息

动物体内储存的脂肪是维持细胞正常代谢所必须的,但是,中性脂肪的异常积累会引起严重的疾病,例如,脂肪肝、肥胖、Ⅱ型糖尿病和动脉粥样硬化等,同时,在畜牧业中也会影响肉类的品质。脂肪滴结合蛋白是一类结合在脂肪滴表面的蛋白质,它们直接控制着脂肪滴的生成和水解,调节体内脂肪

关键词：猪脂肪 perilipin 基因定位 TIP47 组织表达分析结合蛋白 CGI-58

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藏山羊AQP7基因克隆及组织表达分析

藏山羊AQP7基因克隆及组织表达分析

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2018年全国养羊生产与学术研讨会

作者：张亚楠王永朱江江林亚秋西南民族大学生命科学与技术学院青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室

引言/目的水通道蛋白7(aquaporin 7,AQP7)能控制脂肪细胞中脂肪源甘油的转运,其缺乏可降低质膜甘油通透性,减少血浆甘油,同时可提高脂肪细胞甘油激酶活性和促进甘油三酯的合成,进而导致脂肪细胞内甘油和甘油三酯的蓄积,从而增加脂肪细... 详细信息

引言/目的水通道蛋白7(aquaporin 7,AQP7)能控制脂肪细胞中脂肪源甘油的转运,其缺乏可降低质膜甘油通透性,减少血浆甘油,同时可提高脂肪细胞甘油激酶活性和促进甘油三酯的合成,进而导致脂肪细胞内甘油和甘油三酯的蓄积,从而增加脂肪细胞体积和脂肪组织质量。因此本试验拟通过RT-PCR方法克隆藏山羊AQP7基因序列,进行生物学信息分析,并利用

关键词：组织表达分析糖基化位点基因克隆

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猪OX2R的分子克隆及其组织表达分析

猪OX2R的分子克隆及其组织表达分析

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全国动物生理生化第九次学术交流会

作者：宾艳芳束刚宋予震王修启朱晓彤江青艳张永亮冯定远华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院华南农业大学动物科学学院

本试验采用5'-RACE和3'-RACE及RT-PCR的方法获取猪orexin receptor-2(OX2R)的全长cDNA, 克隆入pMD18-T载体中,转化至受体菌DH5α后,经Amp／IPTG／X-Gal选择培养,提取质粒,进行PCR 鉴定,筛选阳性重组克隆测序,利用DNAstar软件拼... 详细信息

本试验采用5'-RACE和3'-RACE及RT-PCR的方法获取猪orexin receptor-2(OX2R)的全长cDNA, 克隆入pMD18-T载体中,转化至受体菌DH5α后,经Amp／IPTG／X-Gal选择培养,提取质粒,进行PCR 鉴定,筛选阳性重组克隆测序,利用DNAstar软件拼接所得的序列,并采用RT-PCR的方法分析猪 OX2R在各组织器官中的表达差异。结果表明:用5'-RACE和3'-RACE及RT-PCR扩增得到的猪OX2R

关键词：组织表达分析

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鹅Mx cDNA全长克隆与组织表达分析研究

鹅Mx cDNA全长克隆与组织表达分析研究

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第四届全国禽病分子生物技术青年工作者会议

作者：曾妙陈舜汪铭书程安春四川农业大学动物医学院预防兽医研究所四川农业大学动物医学院禽病防治与研究中心四川农业大学动物疾病与人类健康四川省重点实验室

Mx蛋白是一种先天免疫抗病毒蛋白效应因子,具有提高机体免疫力以及抗病毒作用。由于水禽特殊的免疫系统以及生活环境,病毒与机体互作过程必然有特殊规律。本研究用RACE扩增Mx cDNA全长并用RTQPCR相对定量的方法,通过对四川白鹅Mx基因序... 详细信息

Mx蛋白是一种先天免疫抗病毒蛋白效应因子,具有提高机体免疫力以及抗病毒作用。由于水禽特殊的免疫系统以及生活环境,病毒与机体互作过程必然有特殊规律。本研究用RACE扩增Mx cDNA全长并用RTQPCR相对定量的方法,通过对四川白鹅Mx基因序列研究及组织表达分布的基础研究,旨在获得Mx cDNA全长,并明确Mx蛋白的组织分布。另外,通过构建的病毒和化学诱导剂刺激细胞模型,预测了鹅Mx蛋白重要的抗病毒活性。综上,对构建鹅Mx蛋白的原核和真核表达系统以及为进一步研究体内外生物活性奠定基础。

关键词： Mx cDNA 组织表达分析抗病毒蛋白四川白鹅外周血淋巴细胞真核表达系统抗病毒作用抗病毒活性全长克隆细胞模型

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猪GGTA1基因的组织表达分析

猪GGTA1基因的组织表达分析

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第十二次全国畜禽遗传标记研讨会

作者：万琴张育静李加琪华南农业大学动物科学学院

引言目前异种器官移植研究是解决供体器官严重匮乏的新途径,然而免疫排斥反应一直是人体器官移植中的主要障碍。猪因其器官在功能、形态、理化性质上与人类较为匹配而逐渐成为人一种移植的首选供体和研究开发的热点。但猪-人器官移植过... 详细信息

引言目前异种器官移植研究是解决供体器官严重匮乏的新途径,然而免疫排斥反应一直是人体器官移植中的主要障碍。猪因其器官在功能、形态、理化性质上与人类较为匹配而逐渐成为人一种移植的首选供体和研究开发的热点。但猪-人器官移植过程中产生超急性免疫排斥反应(HAR),是由于人体中天然抗体(XNA)与Gal抗原发生特异性结合形成免疫复合物

关键词：大花白猪组织表达分析 GGTA1

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赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)ApoA-I基因的克隆及组织表达分析

赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)ApoA-I基因的克隆及组织表达分析

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中国水产学会鱼病专业委员会2013年学术研讨会

作者：曲朦黄晓红李海张晓洁王亚琴陈彤丁少雄厦门大学海洋与地球学院

ApoA-I(apolipoprotein A-I)是血浆高密度脂蛋白(HDL)的重要组成成分,在脂类代谢,尤其是促进胆固醇从组织到肝脏的逆向转运中起重要作用。另外,ApoA-I还被证实具有抗氧化、抗炎症、广谱抗菌以及抗病毒活性。我们基于赤点石斑鱼ApoA-I的... 详细信息

ApoA-I(apolipoprotein A-I)是血浆高密度脂蛋白(HDL)的重要组成成分,在脂类代谢,尤其是促进胆固醇从组织到肝脏的逆向转运中起重要作用。另外,ApoA-I还被证实具有抗氧化、抗炎症、广谱抗菌以及抗病毒活性。我们基于赤点石斑鱼ApoA-I的EST序列设计特异引物,采用RACE技术成功克隆获得ApoA-I cDNA全序列。其cDNA序列全长1267bp,包括33bp的5’UTR,442bp的3’UTR和792bp的开放阅读框(ORF),共编码263个氨基酸。根据已获得的cDNA序列,成功构建了pET-28a-ApoA-I表达载体,并行了原核表达与蛋白纯化;经过蛋白质印迹杂交证实纯化蛋白为目的蛋白。体外抗菌实验证明纯化后的ApoA-I蛋白具有抑制大肠杆菌及哈维氏弧菌生长的作用。通过实时PCR检测结果发现ApoA-I在赤点石斑鱼各组织中均有表达,其中肝脏和肠的表达量最高,而攻毒后鱼体各组织的表达量则没有明显变化;说明在鱼体内ApoA-I并未被哈维氏弧菌诱导表达。另外,我们还初步探索了饵料脂肪含量差异对赤点石斑鱼ApoA-I表达的影响。结果表明,摄食不同脂肪含量的饵料之后24h内,赤点石斑鱼肝脏及肠组织中ApoA-I基因mRNA及血浆HDL-c含量均无显著变化;因此我们认为ApoA-I在鱼体内可能属于组成型表达。但在连续30d的高脂摄食后,赤点石斑鱼肝脏组织切片中显示出明显的脂肪堆积现象,血浆HDL-c含量也显著降低;推测这可能是鱼体的一种自我保护机制,减缓肝脏脂肪的堆积,减轻肝脏代谢负担。

关键词：石斑鱼 Epinephelus akaara)ApoA-I 组织表达分析

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