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南方农业学报 2017年第10期48卷 1884-1890页

作者：申玉建方程邱庆庆司景磊吴延军杨祝良杨秀荣郭亚芬蒋和生广西大学动物科学技术学院南宁530004

【目的】克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因(PPARγ),并确定其在不同组织中的表达情况,为后续研究该基因在猪支原体肺炎(MPS)中的作用机制打下基础。【方法】利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪PPARγ基因,并进行BLAST比对... 详细信息

【目的】克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因(PPARγ),并确定其在不同组织中的表达情况,为后续研究该基因在猪支原体肺炎(MPS)中的作用机制打下基础。【方法】利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪PPARγ基因,并进行BLAST比对分析及其推导蛋白的生物信息学分析;以实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪心脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、肌肉和脂肪中的表达情况。【结果】广西巴马小型猪PPARγ基因开放阅读框序列1515 bp,编码504个氨基酸。广西巴马小型猪PPARγ基因推导氨基酸序列与Gen Bank已发表的猪PPARγ基因(FJ436399.1)推导氨基酸序列同源性最高,达100.0%;而与牛(NM_181024.2)、人类(NM_005037.5)、猕猴(NM_001032860.1)、鼠(NM_001308354.1)和鸿雁(KJ019822.1)的同源性分别为92.9%、91.8%、91.5%、90.5%和83.5%,表明PPARγ基因高度保守。PPARγ蛋白分子量为57380.91 Da,理论等电点(p I)为6.88,不稳定系数49.26,脂肪指数为88.21,亲水性平均水平为-0.293,为亲水性蛋白,其二级结构主要是α-螺旋,占总数的39.09%。PPARγ基因在广西巴马小型猪大肠组织中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),而在肾脏、心脏和肌肉组织中的表达量极低。【结论】PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪的各组织中均有表达,但不同组织中的表达水平存在明显差异,可能与其在不同组织中的功能差异有关。

关键词：广西巴马小型猪 PPARγ基因猪肺炎支原体克隆组织表达差异炎症调控

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MYH10基因在不同鸡种中的组织表达差异研究

MYH10基因在不同鸡种中的组织表达差异研究

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四川省畜牧兽医学会2017学术年会

作者：张增荣蒋小松杜华锐李晴云杨朝武邱莫寒刘岚夏波胡陈明余春林宋小燕熊霞杨礼彭涵四川省畜牧科学研究院四川成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川省畜牧科学研究院四川成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川省畜牧科学研究院四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川省畜牧科学研究院四川成都610066

本研究利用定量PCR方法对MYH10基因在不同鸡种中组织表达差异进行了比较研究.研究结果显示:在2周龄,白羽肉鸡公鸡胸肌组织中MYH10基因的表达量显著高于大恒鸡(P＜0.05),白羽肉鸡母鸡胸肌中MYH10基因的表达极显著低于其余的鸡种(P＜0.01)... 详细信息

本研究利用定量PCR方法对MYH10基因在不同鸡种中组织表达差异进行了比较研究.研究结果显示:在2周龄,白羽肉鸡公鸡胸肌组织中MYH10基因的表达量显著高于大恒鸡(P＜0.05),白羽肉鸡母鸡胸肌中MYH10基因的表达极显著低于其余的鸡种(P＜0.01),藏鸡腿肌组织中的表达量极显著高于其余的鸡种(P＜0.01);在6周龄,白羽肉鸡公鸡胸肌组织中MYH10基因的表达量显著高于大恒鸡(P＜0.05),藏鸡母鸡胸肌组织和腿肌组织中MYH10基因的表达分别显著高于大恒鸡和白羽肉鸡(P＜0.05);在10周龄,胸肌组织中MYH10基因各个鸡种间均达到显著水平(P＜0.05),并且藏鸡极显著高于其它的鸡种(P＜0.01).由此推测该基因在肌肉组织的生长和发育过程中有调节作用.

关键词：鸡遗传育种 MYH10基因组织表达差异定量PCR

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MYH10基因在不同鸡种中的组织表达差异研究

MYH10基因在不同鸡种中的组织表达差异研究

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中国畜牧兽医学会家禽学分会第十八次全国家禽学术讨论会

作者：张增荣杜华锐李晴云杨朝武邱莫寒蒋小松刘岚夏波胡陈明余春林宋小燕熊霞杨礼彭涵四川省畜牧科学研究院四川成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川省畜牧科学研究院四川成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室四川成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川省畜牧科学研究院四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司四川成都610066 四川省畜牧科学研究院四川成都610066

关键词：鸡 MYH10基因组织表达差异定量PCR

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胭脂鱼ASIP基因的克隆及组织表达差异研究

胭脂鱼ASIP基因的克隆及组织表达差异研究

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：黄坤曾丽雯杨鑫温安祥武佳韵四川农业大学生命科学学院

胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus),属于硬骨鱼纲、鲤形目、亚口鱼科、胭脂鱼属,是亚口鱼科鱼类分布在亚洲大陆的唯一现存种。胭脂鱼从幼鱼到成鱼阶段,体色会发生巨大变化:幼年的胭脂鱼体色呈深褐色,体两侧各有三条黑褐色横条纹,背鳍、臀... 详细信息

胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus),属于硬骨鱼纲、鲤形目、亚口鱼科、胭脂鱼属,是亚口鱼科鱼类分布在亚洲大陆的唯一现存种。胭脂鱼从幼鱼到成鱼阶段,体色会发生巨大变化:幼年的胭脂鱼体色呈深褐色,体两侧各有三条黑褐色横条纹,背鳍、臀鳍上叶灰白色,下叶下缘灰黑色;到成鱼阶段时体侧变为胭脂红色或黄褐色,皮肤上的黑斑逐渐消失,产生了一条贯穿头尾的胭脂红色的宽纵带,背鳍、尾鳍均呈淡红色。在不同的发育阶段,胭脂鱼的体色有明显的从黑到红的转变,这可能与黑色素合成的变化有重要关联。ASIP(Agouti signal protein,Agouti信号蛋白)基因是协调哺乳动物黑色素生成的关键基因,作为重要的转录因子参与黑色素合成和分泌过程中。鱼类的黑色素合成相关基因与哺乳动物高度同源,在鱼类中具有一定的保守,本研究通过同源克隆和RACE技术的方法克隆了胭脂鱼ASIP基因,并分析该基因在胭脂鱼幼鱼和成鱼的血液、肌肉、皮肤、肝和脑组织中的表达情况,以初步探究该基因对胭脂鱼体色变化的影响。最终得到长448bp的基因片段,用SMART在线预测软件分析,发现ASIP基因的结构域位于6-123位,其结构域在各个物种间的相似性不高。荧光定量PCR检测了ASIP基因在幼年与成年胭脂鱼肝胰脏、肌肉、脑、血液、肾脏、皮肤和眼球组织中的表达情况,结果显示ASIP基因在胭脂鱼皮肤、肾、肌肉和眼球组织中均有表达,且在胭脂鱼成鱼肌肉中的表达量非常高与幼鱼相比,差异显著;在脑、血液和肝胰脏中表达量极低或不表达。ASIP基因的组织差异表达可能与物种及其表型相关,在成鱼肌肉中高表达的ASIP可能与胭脂鱼独特的体色变化有关。通过对其表达量差异的研究,有助于更好地了解胭脂鱼体色变化的分子调控机制。

关键词：胭脂鱼体色 ASIP基因基因克隆组织表达差异

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罗氏沼虾谷氨酸脱氢酶基因克隆及其在MrTV感染下的组织表达分析

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2017年第5期43卷 639-648页

作者：郑群艳潘晓艺沈锦玉陈少波徐洋许婷温州医科大学检验医学院-生命科学学院浙江温州325035 浙江省淡水水产研究所浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江湖州313001 浙江省海洋水产养殖研究所浙江温州325005

本研究利用c DNA末端快速扩增技术克隆获得罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,GDH)基因(Mr GDH)的c DNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并检测该基因在罗氏沼虾不同组织中的表达差异;同时,利... 详细信息

本研究利用c DNA末端快速扩增技术克隆获得罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,GDH)基因(Mr GDH)的c DNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并检测该基因在罗氏沼虾不同组织中的表达差异;同时,利用罗氏沼虾太湖病毒(Macrobrachium rosenbergii Taihu virus,Mr TV)感染沼虾,研究感染前后沼虾鳃和肝胰腺Mr GDH的转录特征。结果显示,Mr GDH基因c DNA序列全长2 257 bp,拥有一个1 662 bp长的开放阅读框,合计编码氨基酸553个,合成的蛋白质分子质量约为61.37 k Da。Mr GDH氨基酸序列与中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)、凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的同源性较高,达到92%,其二级结构和三维结构与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)以及家蚕(Bombyx mori)高度相似,说明Mr GDH氨基酸序列比较保守。实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR)结果显示,Mr GDH基因在与机体运动和代谢有关的组织中表达量较高,其中在肌肉中表达量最高,而在血淋巴中最低。罗氏沼虾受Mr TV病毒感染48 h,肝胰腺和鳃中Mr GDH基因的表达在统计学上均极显著高于对照组(P<0.01);感染72 h,鳃中Mr GDH基因表达显著高于对照组(P<0.05),肝胰腺中Mr GDH基因表达极显著高于对照组(P<0.01):说明Mr TV感染胁迫可以刺激罗氏沼虾Mr GDH的表达上调。

关键词：罗氏沼虾罗氏沼虾太湖病毒谷氨酸脱氢酶基因克隆组织表达差异

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线纹海马Hippocampus erectus的tlr21基因结构及其对CpG-ODN的应答特征

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热带海洋学报 2019年第1期38卷 67-75页

作者：张媛秦耿张博林强中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 中国科学院大学北京100049

作为先天性免疫反应中重要的模式识别受体之一,TLR(toll-likereceptor)基因家族介导的先天性免疫是脊椎动物抵御病原微生物的重要防线。研究分析了线纹海马Hippocampus erectus tlr21基因的序列特征,并基于抗原注射实验探讨了海马tlr21... 详细信息

作为先天性免疫反应中重要的模式识别受体之一,TLR(toll-likereceptor)基因家族介导的先天性免疫是脊椎动物抵御病原微生物的重要防线。研究分析了线纹海马Hippocampus erectus tlr21基因的序列特征,并基于抗原注射实验探讨了海马tlr21的免疫功能。线纹海马tlr21基因的开放阅读框长度为2946bp,编码981个氨基酸,预测其编码蛋白相对分子量为246.98kDa,理论等电点为4.78。tlr21编码蛋白主要包含1个信号肽和3个功能结构域:胞外区具有14个富含亮氨酸重复序列的结构域(LRR),跨膜区具有富含半胱氨酸的结构域,胞内区则具有TIR结构域。同源性比较和系统进化分析表明,线纹海马tlr21基因与虎尾海马Hippocampuscomestlr21基因的同源性最高,其次与斜带石斑鱼Epinephelus coioides、牙鲆Paralichthys olivaceus、大菱鲆Scophthalmus maximus和红鳍东方鲀Takifugu rubripes的tlr21基因聚为一枝。tlr21基因在线纹海马的脑、鳃、肝、肠、肾、性腺、肌肉和育儿袋各组织均有分布,肾脏中表达量最高。抗原注射实验结果发现,线纹海马Tlr21对不同类型CpG寡脱氧核苷酸(CpG-ODNs)的识别能力存在差异,其中,CpG-2007和CpG-HC4040对海马肾脏tlr21的mRNA表达量具有显著的促进作用(P<0.05)。研究表明,线纹海马Tlr21能够通过识别含CpG序列的DNA发挥免疫识别作用,研究结果将有助于系统认识海马免疫系统中TLR家族基因的功能特征,为建立海马病害防治策略提供理论依据。

关键词： tlr21 基因结构 CpG-ODN 免疫线纹海马组织表达差异

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长牡蛎(Crassostrea gigas)两个Dmrt家族基因的时空表达

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海洋与湖沼 2015年第3期46卷 717-724页

作者：张娜黄雯许飞李莉张国范郭希明海洋生态养殖技术国家地方联合工程实验室中国科学院海洋研究所青岛266071 中国科学院大学北京100049 Haskin Shellfish Research Laboratory Institute of Marine and Coastal Sciences Rutgers University

本文以长牡蛎27个幼虫发育阶段个体以及成体的5个组织织作为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术对其Dmrt家族中的2个基因(CgDsx和CgDmrtA2)的表达模式以及在性别决定中的作用进行了研究。结果表明,长牡蛎CgDsx基因在胚胎发育初期有大量表... 详细信息

本文以长牡蛎27个幼虫发育阶段个体以及成体的5个组织织作为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术对其Dmrt家族中的2个基因(CgDsx和CgDmrtA2)的表达模式以及在性别决定中的作用进行了研究。结果表明,长牡蛎CgDsx基因在胚胎发育初期有大量表达,从囊胚期到担轮幼虫初期表达量最高,之后表达量开始降低,在D形幼虫后一直维持在极低的表达水平,此后仅在成体的雄性性腺中具有高度表达。由此可见,CgDsx可能也对早期胚胎发育起一定调控作用,同时参与了性别决定。CgDmrtA2在长牡蛎所有组织中均有表达,各组织间表达差异不显著,在D形幼虫至壳顶后期表达量较高,说明它参与了胚胎中后期的发育过程,可能与神经的形成相关,但是其具体功能还需要进一步研究。

关键词：长牡蛎 Dmrt家族幼虫发育组织表达差异性别决定

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猪ifitm基因克隆及其序列和组织表达分析

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河南农业大学学报 2016年第3期50卷 359-363,388页

作者：张玉娟赵婷徐朝于琨马倩李超燕郑文明许君河南农业大学生命科学学院河南郑州450002

为了研究ifitm基因的功能,本研究从猪肾PK15细胞中克隆了猪的3个ifitm c DNA序列,分析了猪ifitm1、ifitm2和ifitm3基因的染色体定位及其与其他物种基因序列的同源关系,并对不同ifitm在不同组织的表达进行分析和检测。结果显示,猪ifitm... 详细信息

为了研究ifitm基因的功能,本研究从猪肾PK15细胞中克隆了猪的3个ifitm c DNA序列,分析了猪ifitm1、ifitm2和ifitm3基因的染色体定位及其与其他物种基因序列的同源关系,并对不同ifitm在不同组织的表达进行分析和检测。结果显示,猪ifitm和人、鼠ifitm具有相同的基因和蛋白结构,进化上与牛ifitm高度同源,ifitm1和ifitm3在脾、肾、心、肝等组织中大量表达,而ifitm2只在脾和肾中检测到表达,在其他组织中的表达量相对较小。猪ifitm基因的克隆、生物信息学及组织表达分析为进一步研究其在猪细胞中的功能奠定了基础。

关键词：干扰素刺激基因猪干扰素诱导的跨膜蛋白基因克隆基因序列组织表达差异

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杏花鸡白细胞介素10(IL--10)基因的克隆及其表达分析

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中国家禽 2019年第4期41卷 5-11页

作者：郭利金陈小兰曹森梁少东聂庆华华南农业大学动物科学学院广东广州510642 农业部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东广州510642

为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IE... 详细信息

为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IEC、鸡巨噬细胞HD11和鸡成纤维细胞DF-1中IL-10基因的表达差异以及在不同肠道组织中IL-10的表达量差异。结果表明,完整地扩增了IL-10基因的完整CDS序列,发现了3个同义突变(162A>G、180T>C和303C>T)。构建的发育树表明杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与红色原鸡、鹌鹑、火鸡和珍珠鸡的同源性最高。IL-10在鸡肠上皮细胞的表达量最高,在盲肠扁桃体中表达量最高。球虫子孢子的入侵导致DF-1细胞和HD11细胞中的IL-10表达量升高。研究结果为IL-10基因在肠道免疫和抵抗球虫病的研究提供理论基础。

关键词：鸡 IL-10 CDS全长同源性细胞表达差异组织表达差异

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布氏轮藻肌动蛋白基因家族的全基因组鉴定及表达分析

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四川大学学报（自然科学版） 2022年第4期59卷 173-180页

作者：胡莎莎张冬群张苡芃韩鹏举兰利琼卿人韦四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都610065

为了解肌动蛋白actin在轮藻植物生长发育中的潜在功能,本研究利用生物信息学方法对布氏轮藻肌动蛋白基因家族进行了鉴定及表达分析.在布氏轮藻中共鉴定出16个肌动蛋白基因,将其重命名为CbACT1~CbACT16,其氨基酸长度为361~1182 AA,相对... 详细信息

为了解肌动蛋白actin在轮藻植物生长发育中的潜在功能,本研究利用生物信息学方法对布氏轮藻肌动蛋白基因家族进行了鉴定及表达分析.在布氏轮藻中共鉴定出16个肌动蛋白基因,将其重命名为CbACT1~CbACT16,其氨基酸长度为361~1182 AA,相对分子质量为39 886.71~117 256.72 Da,等电点介于4.68~8.93;亚细胞定位预测显示15个肌动蛋白基因位于细胞质中,1个位于叶绿体中;二级结构结果表明肌动蛋白基因主要以无规则卷曲和α螺旋为主;共线性分析中仅发现一对源自片段重复的旁系同源基因;系统发育结果表明轮藻肌动蛋白基因可以分为两个亚家族,结合基因结构及保守基序分析,同一亚家族倾向于具有相似的外显子分布,较多的共有基序;基于启动子顺势作用元件分析表明,16个肌动蛋白基因参与了许多与生物和非生物胁迫、激素调节和光反应有关的生命活动.组织表达分析显示,16个基因在四种不同组织中存在差异性表达,表明它们在不同组织的生长发育过程中具有不同的功能.因此,轮藻肌动蛋白基因家族可能参与了轮藻植物不同组织的发育过程及响应生物和非生物胁迫等的过程.

关键词：布氏轮藻肌动蛋白基因家族系统进化分析组织表达差异

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