检索结果-内蒙古大学图书馆

海洋学报 2011年第1期33卷 111-120页

作者：曲朦施晓峰张之文丁少雄厦门大学海洋与环境学院福建厦门361005

HSP60(heat shock protein 60,热休克蛋白60)作为高度保守的热休克蛋白家族的一员,不仅可以在应激状态下帮助其他蛋白正确折叠并恢复天然构象,还可作为危险信号作用于天然免疫系统。基于HSP60的EST序列设计特异引物,采用RACE技术成功克... 详细信息

HSP60(heat shock protein 60,热休克蛋白60)作为高度保守的热休克蛋白家族的一员,不仅可以在应激状态下帮助其他蛋白正确折叠并恢复天然构象,还可作为危险信号作用于天然免疫系统。基于HSP60的EST序列设计特异引物,采用RACE技术成功克隆获得赤点石斑鱼HSP60 cDNA全序列及基因组全序列。其cDNA序列全长2 351 bp,包括75 bp的5′UTR,539 bp的3′UTR和1 737 bp的开放阅读框,共编码578个氨基酸。核苷酸及氨基酸序列比对结果显示该基因与其他脊椎动物的相似性很高。基于氨基酸序列构建的系统进化树与传统物种树基本吻合,说明HSP60可能是1个潜在的可用于物种系统进化研究的良好标记。所获得的赤点石斑鱼HSP60基因组全序列含有8个内含子和9个外显子,也与已知其他硬骨鱼类基本一致。这种在序列特征、蛋白空间结构及基因组结构上的高度保守性意味着HSP60在动物生命活动中可能发挥着至关重要的作用。通过实时PCR检测结果发现HSP60在赤点石斑鱼各组织中均有表达,而攻毒后鱼体肝的表达量显著增高(P<0.05),鳃、脾、胃和脑等重要组织器官的表达量也有不同程度的提高,该结果证实了HSP60基因在鱼类非特异性免疫应答中发挥了作用。

关键词：赤点石斑鱼 HSP60 克隆组织表达特性

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抚仙金线鲃kisspeptin基因的克隆及组织表达特性

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四川动物 2016年第4期35卷 496-502页

作者：廖宗甄孙彩云王晓爱杨国坤潘晓赋杨君兴李文笙有害生物控制与资源利用国家重点实验室广东省水生经济动物良种繁育重点实验室中山大学深圳研究院中山大学生命科学学院广州510275 遗传资源与进化国家重点实验室中国科学院昆明动物研究所昆明650223

抚仙金线鲃Sinocyclocheilus tingi是云南抚仙湖的特有种,虽已突破其人工繁殖技术,但在塘养环境下不能自然繁衍。kiss1基因编码的神经多肽kisspeptin被认为是下丘脑-垂体-性腺轴的重要调节因子,通过调控促性腺激素释放激素、促性腺激素... 详细信息

抚仙金线鲃Sinocyclocheilus tingi是云南抚仙湖的特有种,虽已突破其人工繁殖技术,但在塘养环境下不能自然繁衍。kiss1基因编码的神经多肽kisspeptin被认为是下丘脑-垂体-性腺轴的重要调节因子,通过调控促性腺激素释放激素、促性腺激素等激素的分泌参与到生殖调控中。本研究采用反转录PCR和c DNA末端快速扩增(RACE)技术在抚仙金线鲃中克隆出编码kisspeptin的2个基因kiss1和kiss2的c DNA,其中kiss1的开放阅读框长度为351 bp,编码116个氨基酸;kiss2的开放阅读框长度为369 bp,编码122个氨基酸。反转录PCR结果显示,kiss1在抚仙金线鲃雌雄个体中均是肠道的表达量最高;kiss2表达量最高的组织在雄性和雌性中不同,雄性为肠道,雌性则是下丘脑和全脑。为进一步探究kiss1和kiss2在中枢神经系统及垂体中的分布,本研究中将抚仙金线鲃的脑部分为8个部分进行反转录PCR,结果显示,雄性脊髓和垂体中的kiss1表达量较高,雌性垂体中的kiss1表达量最高,其次是视顶盖;kiss2在雌性和雄性中均在下丘脑的表达量最高。本研究的结果为抚仙金线鲃人工繁殖提供了更多探索的方向。

关键词：抚仙金线鲃 kisspeptin kiss1 kiss2 克隆组织表达特性

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版纳微型猪近交系TDRP1基因克隆、鉴定及mRNA的组织表达特性

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中国实验动物学报 2014年第6期22卷 9-16页

作者：王配霍金龙王淑燕潘伟荣查星琴施晨曾养志云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院昆明650201

目的克隆版纳微型猪近交系（BMI）不育和可育公猪TDRP1基因,分析其序列及mRNA表达水平上的差异,预测其蛋白质功能,并检测该基因在可育公猪中的组织表达分布情况。方法以猪NM_001198925序列为模板,设计特异引物,采用RT-PCR方法结合测序获... 详细信息

目的克隆版纳微型猪近交系（BMI）不育和可育公猪TDRP1基因,分析其序列及mRNA表达水平上的差异,预测其蛋白质功能,并检测该基因在可育公猪中的组织表达分布情况。方法以猪NM_001198925序列为模板,设计特异引物,采用RT-PCR方法结合测序获得TDRP1的c DNA序列并进行生物信息学分析;采用半定量PCR方法检测TDRP1在不育和可育公猪睾丸中的表达规律,分析该基因在可育公猪17种组织中的表达特征。结果获得了BMI TDRP1基因的编码区序列（Gen Bank登录号：KJ186786）,生物信息学分析表明其编码186个氨基酸,蛋白质相对分子质量（Mw）为20.49×10^3,等电点（p I）为5.86,无信号肽,有94.1%的概率位于细胞核,含有1个亮氨酸富集的核输出信号。不同物种的氨基酸序列比对表明猪TDRP1与人、恒河猴、小鼠和大鼠等哺乳动物的TDRP1相似性在73%-83.2%之间,其中与人、恒河猴的相似性较高。mRNA表达分析表明,TDRP1在BMI不育和可育公猪睾丸间表达水平差异无显著,在精囊腺和前列腺中高表达,在睾丸和小脑中中度表达,在大脑和肾脏中低表达,在其余组织中不表达。结论成功克隆了BMI TDRP1基因的全长编码区序列并发现了BMI特有的2个SNP位点;TDRP1基因在BMI不育和可育公猪间序列完全一致,睾丸mRNA表达水平差异无显著性,多组织转录谱分析表明该基因存在明显的组织差异表达现象,在精囊腺和前列腺中有较高表达量,为深入研究TDRP1基因在精子发生方面的作用奠定了基础。

关键词：精子发生相关蛋白1 精子发生版纳微型猪近交系生物信息学组织表达特性

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鹌鹑HSP25基因克隆结构与功能预测及组织表达特性分析

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黑龙江畜牧兽医 2017年第6期 243-246,299页

作者：余卓然李鹏承李雪楠刘鑫博张津铭靳晨虹李金龙东北农业大学生命科学学院哈尔滨150030 东北农业大学动物医学学院哈尔滨150030

为了克隆HSP25编码序列,探明其蛋白结构、功能及组织表达特性,试验以鹌鹑为材料,采用RT-PCR方法获得HSP25的开放阅读框(ORF)序列信息,采用生物信息学的方法预测蛋白结构与功能,采用qRT-PCR方法检测组织表达特性。结果表明:鹌鹑HSP25基因... 详细信息

为了克隆HSP25编码序列,探明其蛋白结构、功能及组织表达特性,试验以鹌鹑为材料,采用RT-PCR方法获得HSP25的开放阅读框(ORF)序列信息,采用生物信息学的方法预测蛋白结构与功能,采用qRT-PCR方法检测组织表达特性。结果表明:鹌鹑HSP25基因的ORF为579 bp,编码193个氨基酸,该蛋白为膜外非分泌蛋白,能够结合α晶状体蛋白B分子,其在心脏、肝脏组织中高度表达,推测具有抑制心脏与肝脏的肿瘤发生作用。

关键词：鹌鹑 HSP25基因基因扩增蛋白质结构与功能组织表达特性

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大黄鱼（Pseudosciaena crocea）细胞色素P450 CYP4F7基因的克隆鉴定及其在病原疫苗和LPS刺激下组织表达特性研究

大黄鱼（Pseudosciaena crocea）细胞色素P450 CYP4F7基因的克隆...

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作者：娄绘芳浙江大学动物科学学院

学位级别：硕士

大黄鱼((Pseudosciaena crocea)是我国海水传统养殖中最重要的经济养殖鱼类之一。细胞色素P450(Cytochrome P450)是细胞色素P450单加氧酶系的最重要组分之一,参与催化生物对内源物质和亲脂性外源化合物的代谢过程。\n 本研究是在本... 详细信息

大黄鱼((Pseudosciaena crocea)是我国海水传统养殖中最重要的经济养殖鱼类之一。细胞色素P450(Cytochrome P450)是细胞色素P450单加氧酶系的最重要组分之一,参与催化生物对内源物质和亲脂性外源化合物的代谢过程。\n 本研究是在本实验室构建的大黄鱼消减杂交cDNA文库中长623 bp的EST序列基础上设计引物,以腹腔注射LPS的大黄鱼肝脏mRNA为模板,采用RACE-PCR.的方法,克隆、鉴定出细胞色素P450 CYP4F7基因cDNA全长序列。结果显示:大黄鱼CYP4F7cDNA全长1934bp,5\'端非编码区59 bp,3\'端非编码区264 bp,开放式阅读框1611 bp,编码含有536个氨基酸残基的蛋白,推测的蛋白质分子量为61.6 Kda。序列分析表明大黄鱼的CYP4F7的氨基酸序列与舌齿鲈的同源性最高,达91%;与人CYP4F2的同源性为68%,与小鼠CYP4F4和家鼠CYP4F6分别为71%和67%。\n 采用RT-PCR方法研究了CYP4F7基因在对照组大黄鱼、注射了溶藻弧菌灭活疫苗组大黄鱼和注射了细菌脂多糖LPS(Lipopolysaccharide)的大黄鱼各组织中的表达情况。结果发现:CYP4F7在各处理组大黄鱼的脾、肝、心、头肾、肾、鳃中均有表达,脾、肝组织中的表达水平高于头肾、心、肾和鳃。在对照组和溶藻弧菌灭活疫苗组大黄鱼的肌肉和肠组织中CYP4F7均有少量表达,而在LPS刺激组中未见表达。CYP4F7在LPS刺激组中的表达量均显著低于对照组,而溶藻弧菌灭活疫苗组刺激组则明显高于对照组。采用RQ-PCR相对定量方法分析该基因在对照组和溶藻弧菌灭活疫苗刺激组织中的表达情况,所得结果同RT-PCR一致。\n 上述结果说明:我们已经首次成功克隆鉴定了大黄鱼细胞色素P450CYP4F7基因。溶藻弧菌灭活疫苗的刺激增强了CYP4F7在大黄鱼各组织中的表达;而CYP4F7在注射了LPS的大黄鱼各组织中的表达量均低于正常的大黄鱼各组织中CYP4F7的表达量。因此,溶藻弧菌福尔马林灭活疫苗可能是CYP4F7表达的诱导剂,而LPS可能是CYP4F7表达的抑制剂。

关键词：大黄鱼细胞色素溶藻弧菌灭活疫苗基因克隆组织表达特性

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鸭L-FABP及Lb-FABP基因的克隆及组织表达特性研究

鸭L-FABP及Lb-FABP基因的克隆及组织表达特性研究

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作者：钟万福华南农业大学

学位级别：硕士

脂肪酸结合蛋白(Fatty Acid Binding Proteins，FABPs)属于脂结合蛋白超家族成员，是一类分子量较小而对脂肪酸有高亲和力的蛋白质，广泛存在于脊推动物和非脊椎动物细胞质中。FABPs在细胞中的主要作用是进行细胞内脂肪酸的运输。它们... 详细信息

脂肪酸结合蛋白(Fatty Acid Binding Proteins，FABPs)属于脂结合蛋白超家族成员，是一类分子量较小而对脂肪酸有高亲和力的蛋白质，广泛存在于脊推动物和非脊椎动物细胞质中。FABPs在细胞中的主要作用是进行细胞内脂肪酸的运输。它们与脂肪酸结合将其运输到脂肪酸氧化的位置、脂肪酸脂化成甘油三酯或磷脂的位置，或者进入细胞核内发挥其可能的调控功能。因此FABPs对脂类代谢具有重要的调控作用。在鸡中L-FABP及Lb-FABP基因已被分离出并进行了相关的研究，而在鸭中却只克隆了Lb-FABP基因部分的cDNA序列及部分相关研究。本研究以鸡肝脏脂肪酸结合蛋白(Liver Fatty Acid Binding Protein，L-FABP)基因及野鸭(Mallard)肝脏基础型脂肪酸结合蛋白(Liver basic type Fatty Acid Binding Protein，Lb-FABP)基因序列为基础，通过比较基因组学和生物信息学等方法克隆了仙湖鸭L-FABP基因及Lb-FABP基因序列；采用半定量RT-PCR方法研究了L-FABP基因及Lb-FABP基因的组织表达特性。主要研究结果如下： \n 1、通过比较基因组学、生物信息学方法及RACE技术，获得了仙湖肉鸭Lb-FABP基因全长547bp的cDNA序列。分析发现，该序列包括97bp长的5’非翻译区(5’UTR)和69bp长的3’非翻译区(3’UTR)，开放阅读框(ORF)长381bp，共编码126个氨基酸；与鸡的氨基酸的同源相似性为97.

关键词：鸭脂肪酸结合蛋白基因克隆组织表达特性

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白梨SOT基因家族成员组织表达特性的分析

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植物学研究 2018年第5期7卷 496-506页

作者：余彩云谷超张绍铃南京农业大学园艺学院江苏南京

本文旨在鉴定出白梨山梨醇转运蛋白(SOT)基因家族成员,利用生物信息学和基因组织表达特性的分析,明确梨各组织中参与山梨醇运输的主要SOT基因。基于全基因组测序结果,采用生物信息学方法鉴定出苹果、白梨、桃、梅、草莓和黑树莓6个蔷薇... 详细信息

本文旨在鉴定出白梨山梨醇转运蛋白(SOT)基因家族成员,利用生物信息学和基因组织表达特性的分析,明确梨各组织中参与山梨醇运输的主要SOT基因。基于全基因组测序结果,采用生物信息学方法鉴定出苹果、白梨、桃、梅、草莓和黑树莓6个蔷薇科果树物种SOT基因家族序列信息,并进行基因结构、理化特性等相关分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术测定PbSOTs基因在白梨各个器官组织中的表达特性。从六个蔷薇科果树物种分离出SOT基因家族成员62个,其中,PbSOT11、PbSOT12、PbSOT14、PbSOT16、PbSOT23和PbSOT24在白梨各组织中几乎都不表达;PbSOT5仅在花中表达;PbSOT4在白梨各组织中基本也都不表达,PbSOT7/8仅在茎、花、果中表达;PbSOT10和PbSOT13在白梨各组织中同样都不表达,PbSOT9仅在果实中表达;PbSOT6和PbSOT20在所有组织中均表达;PbSOT1/2仅在根、茎、花和种子中表达,而PbSOT3和PbSOT19/21和PbSOT22在根、茎、花、叶和果实中都表达,但在种子中基本不表达。PbSOT20是梨山梨醇“源–库”迁移过程各组织的主要调控基因。而PbSOT6和PbSOT19/21是根组织中山梨醇转运主要调控基因。

关键词：梨蔷薇科果树山梨醇转运蛋白组织表达特性

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鸭YAP1基因编码区克隆、生物信息分析及其组织表达特性

鸭YAP1基因编码区克隆、生物信息分析及其组织表达特性

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四川省畜牧兽医学会2014学术年会

作者：邱佳闵刘贺贺王继文四川农业大学“畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室” 四川成都611130

目的：旨在克隆鸭YAP1基因,预测其蛋白结构、功能及其组织表达特性.方法：以北京肉鸭为材料,采用RT-PCR技术克隆鸭YAP1基因CDS区,利用多种生物信息学分析软件预测其结构与功能,并应用荧光定量PCR检测其组织表达谱.结果：结果表明:鸭YAP... 详细信息

目的：旨在克隆鸭YAP1基因,预测其蛋白结构、功能及其组织表达特性.方法：以北京肉鸭为材料,采用RT-PCR技术克隆鸭YAP1基因CDS区,利用多种生物信息学分析软件预测其结构与功能,并应用荧光定量PCR检测其组织表达谱.结果：结果表明:鸭YAP1基因CDS全长1248bp,编码415个氨基酸,氨基酸水平上与鸡相似性高达99.7％,与参与比较的哺乳动物相似性均高于90％;氨基酸序列分析发现鸭YAP1蛋白相对分子量为45417.5Da,理论等电点为5.15,主要定位在细胞核,属水溶性蛋白,无信号肽与跨膜结构,不属于分泌蛋白;预测鸭YAP1氨基酸含有磷酸化、糖基化位点各30个;含两个WW结构域,且不同物种间结构域较保守;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构呈弯曲状螺旋结构;荧光定量结果显示,YAP1在胰脏中表达量最高,可能在胰脏中起关键作用.结论：由研究结果与分析推测,鸭等鸟类YAP1基因功能与哺乳动物具较高一致性.以上研究为进一步探讨YAP基因在鸟类中的作用提供了参考.

关键词：鸭 YAP1基因克隆技术生物信息学组织表达特性

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鸡含溴结构域蛋白2的亚细胞定位及组织表达特性分析

鸡含溴结构域蛋白2的亚细胞定位及组织表达特性分析

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第九届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会

作者：韩一帆周磊袁超段志强贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州大学动物科学学院

引言/目的含溴结构域蛋白2 (BRD2)是一种能够特异性识别乙酰化赖氨酸残基的保守蛋白。目前,BRD2基因的研究主要集中在人和小鼠,但是鸡BRD2基因的克隆、亚细胞定位以及在鸡胚发育过程不同组织中的表达情况尚不清楚。本研究通过研究鸡BRD... 详细信息

引言/目的含溴结构域蛋白2 (BRD2)是一种能够特异性识别乙酰化赖氨酸残基的保守蛋白。目前,BRD2基因的研究主要集中在人和小鼠,但是鸡BRD2基因的克隆、亚细胞定位以及在鸡胚发育过程不同组织中的表达情况尚不清楚。本研究通过研究鸡BRD2蛋白的亚细胞定位以及检测BRD2基因在鸡不同发育阶段不同组织中的表达情况,旨在为后续研究BRD2基因调控鸡组织发育的作用机制奠定基础。

关键词：亚细胞定位组织表达特性结构域

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鹅MTP基因组织表达特性及填饲对其表达的影响

鹅MTP基因组织表达特性及填饲对其表达的影响

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四川省畜牧兽医学会2010年学术年会

作者：叶健强王继文四川农业大学畜禽品种资源发掘与利用重点实验室四川，雅安 625014 四川省畜牧科学研究院四川，成都 610066

本研究以朗德鹩和四川白鹅为研究材料，采用RT—PCR方法对鹅MTP基因在不同组织、不同的发育阶段时的肝脏和小肠组织中的表达特性进行了研究，并研究了填饲对肝脏与小肠组织中MTP基因表达的影响。结果显示，在检测的8种组织中MTP在10周... 详细信息

本研究以朗德鹩和四川白鹅为研究材料，采用RT—PCR方法对鹅MTP基因在不同组织、不同的发育阶段时的肝脏和小肠组织中的表达特性进行了研究，并研究了填饲对肝脏与小肠组织中MTP基因表达的影响。结果显示，在检测的8种组织中MTP在10周龄时只在肝脏、小肠和脑组织中有表达;鹩MTP基因在肝脏和小肠中的表达量随着周龄的增加呈现出逐步上升的趋势;填饲引起肝组织MTP基因表达水平降低，而使小肠组织MTP基因表达水平升高。

关键词： MTP基因组织表达特性填饲鹅

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