检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：孟祥丰吉林大学

学位级别：硕士

在现代生物学中生物组成鉴定的阶段即将完成,在能够获得细胞内清晰的组成物时如何能够在更高的抽象层面上理解生理调控方式和信息传导网络的全面功能而不是单一基因水平便变得越来越重要。医药学因为需要了解疾病和开发治疗方法的需求... 详细信息

在现代生物学中生物组成鉴定的阶段即将完成,在能够获得细胞内清晰的组成物时如何能够在更高的抽象层面上理解生理调控方式和信息传导网络的全面功能而不是单一基因水平便变得越来越重要。医药学因为需要了解疾病和开发治疗方法的需求也增加了对特定生理过程理解的实际需求。这促使系统生物学领域需要创建一套可计算模型和方法来从系统上分析和了解细胞信号调节的机制和原理,其中包括细胞信号系统的行为是如何从其组成生物分子的物理相互作用中产生的,这些功能的基本设计原则和表示方法是什么以及这些交互作用是如何执行信息处理和决策选择功能的问题等。而通过计算机编程可计算的模型来模拟反应网络的信号传导过程是研究的主要方向。为了学习和理解细胞中决策与交互系统的进行过程,单靠纯人力的计量生物实验是不切实际的,需要抽象出计算模型去模拟这种复杂系统的行为,并通过结合各种各样真实生物学实验的观察数据,能够提供一些重要的模拟数据进而产生新颖和有用的假设。但是当尝试对细胞信号传导网络进行计算模型的构造时,都要面临系统组合复杂性问题。这主要是由蛋白质信号分子之间复杂的多种组合和多重修饰引起的,并且这种分子组合衍生出的多种分子物种过程又会增加参与到信号传导网络中的化学反应数量,最终导致了系统的组合复杂性。基于规则建模是解决上述组成复杂性难题的一种建模方法。基于规则的模型通过仅定义大分子复合物内的反应基序以及涉及到的那些基序的相互作用和修饰来代替手动列举可能存在于系统内的所有可能的物种和反应。规则具有与化学反应基本相同的形式,通过形成特定的反应类别提供了定义不同反应模板的功能。现如今有多种不同的研究方法和软件使用基于规则的建模方式完成了对一些被研究透彻的生物反应网络建模过程,并且成立了不同语言构造的基于规则模型的。BioNetGen是一个用于构建和模拟基于规则的模型的开源软件包。它已被用于模拟多种生物过程,包括细胞信号传导,基因调节和代谢。模型是用人类可读的,基于文本的建模语言BNGL编写的。模型也可以导出为不同的格式,例如SBML和MATLAB语言。本文采用基于规则的方法对大肠杆菌内乳糖操纵子的基因表达调控过程进行可计算模型的建模。在对其生理过程充分理解的基础上,使用更精确的规则设计完成反应物质的定义与模拟正负反馈调控机制的进行,提供了在BioNetGen下计算模型表示程序的代码设计,相应参数的使用以及反应物质浓度变化的曲线图像。通过设计不用调控机制的单独与混合模拟过程以及对大量对比实验数据结果的分析,详细阐述了如何采用以调控模块为划分的思想,逐步扩展对复杂反应网络的规则表示。对比其他方法的建模结果,在使用更少的规则模式的同时得到了更明显的实验效果,展现了基于规则的建模方法在降低反应网络系统复杂度上的有效性,同时也说明了扩展建模的可行性。

关键词：细胞信号系统基于规则建模乳糖操纵子 BioNetGen

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细胞钙浓度的变化对周期信号的响应及胞间同步

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中山大学学报（自然科学版） 2009年第5期48卷 108-113页

作者：周永军牛中奇张辉西安电子科技大学电子工程学院陕西西安710071 西北工业大学电子信息学院陕西陕西西安710072

钙离子是细胞中一种很重要的第二信使,通常它以钙离子浓度振荡的方式转导多种生理学信息,影响细胞分化、成熟和凋亡等各种生理过程,最终导致生物效应。通过实验研究了细胞钙浓度的变化对周期信号的响应和建立在多细胞模型的基础上,从肝... 详细信息

钙离子是细胞中一种很重要的第二信使,通常它以钙离子浓度振荡的方式转导多种生理学信息,影响细胞分化、成熟和凋亡等各种生理过程,最终导致生物效应。通过实验研究了细胞钙浓度的变化对周期信号的响应和建立在多细胞模型的基础上,从肝细胞内钙离子振荡的动力学模型出发,以胞间耦合因子作为影响因子,数值分析单细胞、耦合的多细胞下的胞内钙振荡形式。实验结果表明:细胞钙振荡对不同频率和强度的周期信号的响应是不同的:对有的参数周期信号能产生强烈响应,有的不能。数值分析结果表明:细胞间的差异性导致钙振荡不同,胞间耦合影响多细胞钙振荡的同步性。

关键词：细胞信号系统电磁场钙振荡同步性

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细胞信号系统在铜绿假单胞菌中的应用

细胞信号系统在铜绿假单胞菌中的应用

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中国药学会学术年会

作者：裴斐胡文斌王睿解放军总医院临床药理研究室北京100853 北京大学医学部北京100083

铜绿假单胞菌为一种机会感染性致病菌,铜绿假单胞菌产生的各种严重感染与其毒力因子的释放密切相关.它分泌的多种胞外毒力因子被一个复杂的与细胞间信号传递系统有关的调节回路所控制,该细胞间信号传递系统使细菌以一种协同的、依赖细... 详细信息

铜绿假单胞菌为一种机会感染性致病菌,铜绿假单胞菌产生的各种严重感染与其毒力因子的释放密切相关.它分泌的多种胞外毒力因子被一个复杂的与细胞间信号传递系统有关的调节回路所控制,该细胞间信号传递系统使细菌以一种协同的、依赖细胞密度的方式产生这些细胞外毒力因子.本文着重介绍铜绿假单胞菌主要毒力因子及细胞间信号传递在铜绿假单胞菌生物被膜及急性感染致病机制中的作用,同时也概述了这些调节系统用于治疗方案的可能性.

关键词：铜绿假单胞菌群体感受系统生物被膜毒力因子细胞信号系统

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细胞信号系统在铜绿假单胞菌耐药中的作用

细胞信号系统在铜绿假单胞菌耐药中的作用

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首届全国细菌耐药监测与临床专题学术会议

作者：裴斐胡文斌王睿 1000853 北京解放军总医院临床药理研究室 1000853 北京大学医学部

生物细胞中进行着各种复杂的代谢过程,除物质代谢和能量代谢外,还包括信息代谢过程,它主要传递着环境变化的信息,调节和控制着物质与能量代谢以及生理反应与生长发育,故称之为细胞信号系统.铜绿假单胞菌为一种机会感染性致病菌,铜绿假... 详细信息

生物细胞中进行着各种复杂的代谢过程,除物质代谢和能量代谢外,还包括信息代谢过程,它主要传递着环境变化的信息,调节和控制着物质与能量代谢以及生理反应与生长发育,故称之为细胞信号系统.铜绿假单胞菌为一种机会感染性致病菌,铜绿假单胞菌产生的各种严重感染与其毒力因子的释放密切相关.它分泌的多种胞外毒力因子被一个复杂的与细胞间信号传递系统有关的调节回路所控制,该细胞间信号传递系统使细菌以一种协同的、依赖细胞密度的方式产生这些细胞外毒力因子.信号传递至细胞内的方式有两种,一种是信号分子通过细胞膜信号转导蛋白引起细胞内反应,另一种是信号分子通过被动扩散或某种转运系统进入细胞.前一种方式称之为两组分调节系统(two-component regulatory systems),后一种方式称之为群体感受系统(quorum sensing systems).在铜绿假单胞菌中,研究者发现了至少两套完整的群体感受系统(quorum sensing system),即las和rhl系统.目前这两套群体感受系统对铜绿假单胞菌的作用巳基本阐明:这两套系统主要根据细菌细胞的密度来控制一系列毒力因子基因的表达,并通过细胞间信号传递进行细菌间的交流.它们是以一个整体而不是个体细胞行动.群体感受系统是目前比较关注的细菌信号转导过程。本文研究细胞信号系统在铜绿假单胞菌耐药中的作用。

关键词：铜绿假单胞菌细菌耐药监测细胞信号系统生物细胞代谢致病菌细菌信号转导

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细胞信号系统与铜绿假单胞菌毒力因子的表达

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中国药物应用与监测 2003年第5期18卷 164-167,160页

作者：裴斐胡文斌王睿解放军总医院药材处临床药理药学研究室北京100853 北京大学医学部北京100083 解放军总医院药材处临床药理药学研究室北京100853

　　生物细胞中进行着各种复杂的代谢过程,除物质代谢和能量代谢外,还包括信息代谢过程,它主要传递着环境变化的信息,调节和控制着物质与能量代谢以及生理反应与生长发育,故称之为细胞信号系统.铜绿假单胞菌为一种机会感染性致病菌,铜... 详细信息

　　生物细胞中进行着各种复杂的代谢过程,除物质代谢和能量代谢外,还包括信息代谢过程,它主要传递着环境变化的信息,调节和控制着物质与能量代谢以及生理反应与生长发育,故称之为细胞信号系统.铜绿假单胞菌为一种机会感染性致病菌,铜绿假单胞菌产生的各种严重感染与其毒力因子的释放密切相关.……

关键词：细胞信号系统铜绿假单胞菌能量代谢代谢过程严重感染信息物质代谢生物细胞生理反应生长发育环境变化毒力因子致病菌感染性控制调节

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铕对小麦根细胞钙调素及NAD激酶的影响研究

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中国稀土学报 2005年第6期23卷 757-761页

作者：安宜北京理工大学生命科学与技术学院北京100081

研究了Eu对小麦根细胞内钙调素的含量和活性以及对受钙调素调控的专一性酶NAD激酶的影响。结果表明,Eu3+有类似Ca2+的作用,影响受Ca2+浓度调控的信号系统关键蛋白———钙调素的活性和含量变化,从而引起钙调素调控酶NAD激酶的活性改变,... 详细信息

研究了Eu对小麦根细胞内钙调素的含量和活性以及对受钙调素调控的专一性酶NAD激酶的影响。结果表明,Eu3+有类似Ca2+的作用,影响受Ca2+浓度调控的信号系统关键蛋白———钙调素的活性和含量变化,从而引起钙调素调控酶NAD激酶的活性改变,最终影响细胞内生理生化过程。认为稀土离子对生物体的Hormesis效应可能与稀土离子对细胞信号传递系统的影响有关,稀土离子可能通过影响细胞信号系统来调节细胞内的各种生理生化变化,形成稀土元素生物效应的多样性特征。

关键词：植物生理学铕小麦钙调素细胞信号系统 NADKase 稀土

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低频电磁场与细胞信号系统

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基础医学与临床 2000年第1期20卷 16-19页

作者：陈树德陈家森王丽英华东师范大学物理系生物物理研究室上海200062

１引言在２０世纪，环境中的低频电磁场的强度已经大大增强。环境中的低频电磁场主要起源于电的传送，电的分配及电的使用。近年来的研究表明低频电磁场的生物效应是明显的。ＬｉｂｏｆｆＡ在１９８４年报道了交变电磁场对ＤＮＡ合成的... 详细信息

１引言在２０世纪，环境中的低频电磁场的强度已经大大增强。环境中的低频电磁场主要起源于电的传送，电的分配及电的使用。近年来的研究表明低频电磁场的生物效应是明显的。ＬｉｂｏｆｆＡ在１９８４年报道了交变电磁场对ＤＮＡ合成的影响［１］。ＳｍｉｔｈＳ．等在１９...

关键词：低频电磁场细胞信号系统

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描述肝细胞中两类不同特性钙离子浓度振荡的动力学模型

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生物物理学报 2002年第2期18卷 186-192页

作者：应阳君黄祖洽北京师范大学低能核物理研究所

细胞内第二信使钙离子通常以浓度振荡的方式转导多种生理学信息 ,影响细胞分化、成熟和凋亡等各种生理过程。肝细胞实验中看到在一定浓度范围的激动剂刺激下 ,细胞质钙离子浓度的变化可呈现出很不相同的图像。例如在脱羟肾上腺素刺激下 ... 详细信息

细胞内第二信使钙离子通常以浓度振荡的方式转导多种生理学信息 ,影响细胞分化、成熟和凋亡等各种生理过程。肝细胞实验中看到在一定浓度范围的激动剂刺激下 ,细胞质钙离子浓度的变化可呈现出很不相同的图像。例如在脱羟肾上腺素刺激下 ,可出现简单的周期振荡 ,振荡频率随激动剂浓度的不同有变化 ;在腺苷三磷酸刺激下 ,随激动剂浓度从低到高 ,胞质钙离子浓度的变化可以从开始出现简单振荡 ,到形成复杂的多峰间歇振荡。肝细胞中钙离子浓度振荡的峰值多在500nmol/L到800nmol/L范围。给出一个四变量数学模型的改进形式 ,可以模拟肝细胞中钙离子浓度从简单振荡向复杂振荡的变化。

关键词：肝细胞钙离子浓度振荡动力学模型细胞信号系统数学模型

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细胞非线性钙振荡模型一种同步机制分析

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非线性动力学学报 2001年第1期8卷 9-14页

作者：应阳君李卫华北京应用物理与计算数学研究所，北京100088 北京教育学院西城分院，北京100035

细胞中的第二信使钙离了以浓度振荡的方式转导生理学信息，在生物组织中，单个的细胞由于个体差异可以具有不同的本征钙振荡频率，但钙振荡却往往以扫过局部组织的周期波的形式出现，表明多个细胞的钙振荡存在同步作用机制。本文从一个... 详细信息

细胞中的第二信使钙离了以浓度振荡的方式转导生理学信息，在生物组织中，单个的细胞由于个体差异可以具有不同的本征钙振荡频率，但钙振荡却往往以扫过局部组织的周期波的形式出现，表明多个细胞的钙振荡存在同步作用机制。本文从一个典型的非线性细胞钙振荡数学模型出发，研究振荡对周期性刺激信号和无规涨落噪声的响应，给出信号强度和信号周期对细胞钙振荡的影响。结果表明，周期性刺激信号可以使具有不同本征频率的细胞形成同步振荡。说明周期性的控制或刺激信号是生物组织中异质细胞的同步机制之一。

关键词：细胞信号系统钙离子振荡同步非线性

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细胞非线性钙振荡模型一种同步机制分析

细胞非线性钙振荡模型一种同步机制分析

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全国非线性振动学术会议

作者：应阳君北京师范大学低能核物理研究所(北京) 李卫华北京应用物理与计算数学研究所(北京) 北京教育学院西城分院(北京)

细胞中的第二信使钙离子以浓度振荡的方式转导生理学信息,在生物组织中,单个的细胞由于个体差异可以具有不同的本征钙振荡频率,但钙振荡却往往以扫过局部组织的周期波的形式出现,表明多个细胞的钙振荡存在同步作用机制.本文从一个典型... 详细信息

细胞中的第二信使钙离子以浓度振荡的方式转导生理学信息,在生物组织中,单个的细胞由于个体差异可以具有不同的本征钙振荡频率,但钙振荡却往往以扫过局部组织的周期波的形式出现,表明多个细胞的钙振荡存在同步作用机制.本文从一个典型的非线性细胞钙振荡数学模型出发,研究振荡对周期性刺激信号和无规涨落噪声的响应,给出信号强度和信号周期对细胞钙振荡的影响.结果表明,周期性刺激信号可以使具有不同本征频率的细胞形成同步振荡.说明周期性的控制或刺激信号是生物组织中异质细胞的同步机制之一.

关键词：细胞信号系统钙离子振荡同步机制

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