检索结果-内蒙古大学图书馆

计算机学报 2013年第12期36卷 2537-2544页

作者：陈梅陈向群张路许进北京大学信息科学技术学院高可信软件技术教育部重点实验室北京100871

细胞内丰富的信息处理机制和细胞计算的巨并行性一直吸引着科学家构建细胞计算机.科学家利用细胞内的信息处理机制开发了不少模仿简单电子器件功能的细胞计算部件,如细胞布尔逻辑门、细胞记忆单元等,但这些部件没有充分利用细胞计算的... 详细信息

细胞内丰富的信息处理机制和细胞计算的巨并行性一直吸引着科学家构建细胞计算机.科学家利用细胞内的信息处理机制开发了不少模仿简单电子器件功能的细胞计算部件,如细胞布尔逻辑门、细胞记忆单元等,但这些部件没有充分利用细胞计算的巨并行性特点.DNA重组酶Hin能催化DNA片段的翻转反应,通过切换DNA片段的方向来调控基因的表达.该文利用DNA重组酶Hin的这一性质,以合成生物学中广泛使用的生物砖为材料,以大肠杆菌Escherichia coli为宿主细胞,以DNA重组酶Hin为计算工具,构建了一个解决可满足性问题的细胞计算模型.该模型中,每个细胞可独立地生成并判定可满足性问题的一个解,数以亿计的细胞可检查数以亿计的可能解.该模型充分利用细胞计算的巨并行性,显示了细胞计算的巨大潜力.

关键词：生物砖 DNA重组酶Hin 基因调控可满足性问题细胞计算

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指示信号在不同伴随信号下优先级的细菌细胞计算部件

指示信号在不同伴随信号下优先级的细菌细胞计算部件

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作者：陈梅北京市海淀区中关村南大街27号

本公开提供了一种指示信号在不同伴随信号下优先级的细菌细胞计算部件。该细胞计算部件由第一细胞和第二细胞两种细胞构成，其中，第一细胞用于检测待检测信号和第一伴随信号，第二细胞用于检测待检测信号和第二伴随信号；第一细胞内的... 详细信息

标准号: CN110288076B

本公开提供了一种指示信号在不同伴随信号下优先级的细菌细胞计算部件。该细胞计算部件由第一细胞和第二细胞两种细胞构成，其中，第一细胞用于检测待检测信号和第一伴随信号，第二细胞用于检测待检测信号和第二伴随信号；第一细胞内的基因线路包括第一线路和第二线路，第二细胞内的基因线路包括第三线路和第四线路。本发明提供的细胞计算部件，通过设计基因线路，利用启动子的激活和指示信号的抑制对无待测信号、只有待测信号、待测信号和相应伴随信号同时存在做出不同指示，通过多细胞的输出组合指示最终结果。该部件可用于生物计算机、生物传感器等需要判断某一特定信号在不同状态下优先级的相关应用中，具有计算的精准性、高效性与易用性。

关键词：细胞伴随信号待测信号待检测信号细胞计算指示信号生物传感器生物计算机计算部件设计基因输出组合细菌细胞最终结果高效性启动子易用性基因检测可用激活应用

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细菌细胞3-8译码器及细胞计算机

细菌细胞3-8译码器及细胞计算机

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作者：陈梅赵洪帅北京市海淀区中关村南大街27号

本公开提出了一种细菌细胞3‑8译码器，基于第一细胞至第八细胞八种细胞，由第一特征信号启动子、第二特征信号启动子、第三特征信号启动子、组成型启动子、启动子抑制元件、启动子解抑制元件、指示信号元件、指示信号抑制元件以及指示... 详细信息

标准号: CN110309903B

本公开提出了一种细菌细胞3‑8译码器，基于第一细胞至第八细胞八种细胞，由第一特征信号启动子、第二特征信号启动子、第三特征信号启动子、组成型启动子、启动子抑制元件、启动子解抑制元件、指示信号元件、指示信号抑制元件以及指示信号解抑制元件组成。该译码器是一种多细胞计算部件，通过对启动子和指示信号的激活抑制操作，完成译码计算，具有计算的精准性、灵活性与易用性。且可以理解的是，本公开的细菌细胞3‑8译码器可以用于生物计算机、生物传感器等需要译码器的相关应用中，具有应用的广泛性。

关键词：启动子译码器抑制元件指示信号特征信号细菌细胞细胞组成型启动子生物传感器生物计算机细胞计算易用性译码应用激活

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细菌细胞3-8译码器及细胞计算机

细菌细胞3-8译码器及细胞计算机

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作者：陈梅赵洪帅北京市海淀区中关村南大街27号

本公开提出了一种细菌细胞3‑8译码器，基于第一细胞至第八细胞八种细胞，由第一特征信号启动子、第二特征信号启动子、第三特征信号启动子、组成型启动子、启动子抑制元件、启动子解抑制元件、指示信号抑制元件以及指示信号解抑制元件... 详细信息

标准号: CN110309903A

本公开提出了一种细菌细胞3‑8译码器，基于第一细胞至第八细胞八种细胞，由第一特征信号启动子、第二特征信号启动子、第三特征信号启动子、组成型启动子、启动子抑制元件、启动子解抑制元件、指示信号抑制元件以及指示信号解抑制元件组成。该译码器是一种多细胞计算部件，通过对启动子和指示信号的激活抑制操作，完成译码计算，具有计算的精准性、灵活性与易用性。且可以理解的是，本公开的细菌细胞3‑8译码器可以用于生物计算机、生物传感器等需要译码器的相关应用中，具有应用的广泛性。

关键词：启动子译码器抑制元件特征信号指示信号细菌细胞细胞组成型启动子生物传感器生物计算机细胞计算易用性译码应用激活

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指示信号在不同伴随信号下优先级的细菌细胞计算部件

指示信号在不同伴随信号下优先级的细菌细胞计算部件

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作者：陈梅北京市海淀区中关村南大街27号

标准号: CN110288076A

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脂质-DNA复合结构的细胞应用

脂质-DNA复合结构的细胞应用

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作者：张露灏中国科学院大学(中国科学院上海应用物理研究所)

学位级别：博士

受体-配体相互作用在细胞的信号转导,新陈代谢和生长方面发挥着重要的作用。对于不同的细胞或细胞的不同状态,受体的种类和数量存在巨大的差异。虽然一些具有靶向性的分子探针能够可视化细胞膜上受体的分布,甚至实现肿瘤的诊断和靶向治... 详细信息

受体-配体相互作用在细胞的信号转导,新陈代谢和生长方面发挥着重要的作用。对于不同的细胞或细胞的不同状态,受体的种类和数量存在巨大的差异。虽然一些具有靶向性的分子探针能够可视化细胞膜上受体的分布,甚至实现肿瘤的诊断和靶向治疗,但针对内源性受体,筛选和设计具有正交性的受体-配体相互作用仍然面临着巨大的挑战。DNA链能通过Watson-Crick碱基互补配对原则杂交,并能通过改变碱基的种类和数目设计不同的DNA链。因此该过程具有高度的特异性和可编程性,理论上可以设计无限组正交相互作用对。本工作是通过DNA框架核酸编码并模拟具有正交性的受体-配体相互作用体系,并将该体系应用于细胞的模式识别,多价配体-受体相互作用研究,基于活细胞的细胞计算网络的构建。具体内容如下:第一,通过细胞膜表面DNA编码生物模拟的受体-配体相互作用体系,实现不同细胞的模式识别。胆固醇修饰的单链DNA能够插入细胞膜上,我们将锚定在细胞膜上的DNA链称为人工受体(ADR)。细胞质膜上分布着大量胆固醇,通常集中在与细胞内化作用相关的小窝蛋白结构域和脂筏。我们将带有手臂链的四面体DNA框架核酸(TDF)作为配体,其能通过碱基互补配对与互补的ADR结合。我们对ADR-TDF配体相互作用的正交性进行验证,发现ADR-TDF配体的相互作用具有正交性。受体在细胞膜上的分布通常受内化作用的影响,我们研究了哪个内化途径会对ADR-TDF配体的分布产生影响。发现ADR-TDF配体在细胞上的分布主要受温度和小窝蛋白依赖的内化途径的影响。由于不同细胞膜受体分布的动力学存在差异,从而导致不同ADR-TDF配体相互作用模式。因此,可以通过模式识别的方法,区分不同的细胞系。第二,基于第一部分内容建立的ADR-TDF配体相互作用体系,我们研究了多价的TDF配体与ADR相互作用的关系。带负电的DNA结构通常能与细胞膜表面的清道夫受体(SR)产生相互作用。我们用SR的抑制剂聚肌苷处理细胞后,发现ADR阴性细胞对TDF的内化受到明显的抑制,但ADR阳性细胞对TDF的内化几乎不受影响,表明ADR介导TDF配体的内化独立于天然的SR受体介导TDF配体的内化。通过全内反射显微镜,我们在单分子水平记录下了ADR或SR与TDF配体的相互作用过程。我们发现ADR与TDF配体相互作用的时间明显比SR与TDF配体相互作用的时间长,表明ADR与TDF配体的亲和力更高。TDF配体是三维结构,通过改变手臂链的位置和数量,可以构建价态和取向不同的TDF配体。我们发现价态和取向都会影响TDF配体的内化,价态越高,TDF配体的内化效率更高,并且对位的取向能提高配体的内化效率。利用价态对内化的影响,我们构建了加权运算体系,根据TDF配体的价态和浓度,控制不同价态TDF配体的内化效率。第三,根据ADR-TDF配体系统,构建了细胞计算逻辑线路。我们以活细胞为基质,实现了“与”门和“或”门的逻辑运算。我们根据设计加入作为输入信号的DNA链,当细胞内出现荧光信号时,输出为“1”,否则输出为“0”。我们进一步通过载有阿霉素(Dox)的TDF结构Dox@TDF,实现了根据逻辑线路调控的药物递送。该线路使用“非”门逻辑运算,当没有输入信号时,细胞正常生长,输出为“1”,当有输入信号时,细胞生长受到抑制,输出为“1”。总的来说,利用DNA编码的受体-配体相互作用系统,能够实现细胞的分类,多价相互作用模型和细胞计算线路的构建。相较于基于蛋白质的受体-配体相互作用系统,DNA编码的配体-受体相互作用系统更易设计。该系统有潜力应用于智能的药物递送,细胞计算系统的构建等方面。

关键词： DNA框架核酸模式识别多价相互作用细胞计算

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一种标记橡胶树白粉菌的荧光载体及其表达方法和应用

一种标记橡胶树白粉菌的荧光载体及其表达方法和应用

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作者：李潇殷金瑶董林朋刘玉涵刘文波缪卫国 570100 海南省海口市美兰区人民大道58号

本发明公开了一种标记橡胶树白粉菌的荧光载体，所述荧光载体为基于pJNARG质粒改造的质粒pJNARG‑RP60‑GFP，该质粒在XcmI酶切位点处被插入了一个多菌灵抗性基因，质粒pJNARG‑RP60‑GFP的多克隆位点在启动子RP60和GFP绿色荧光蛋白编码基... 详细信息

标准号: CN114317586A

本发明公开了一种标记橡胶树白粉菌的荧光载体，所述荧光载体为基于pJNARG质粒改造的质粒pJNARG‑RP60‑GFP，该质粒在XcmI酶切位点处被插入了一个多菌灵抗性基因，质粒pJNARG‑RP60‑GFP的多克隆位点在启动子RP60和GFP绿色荧光蛋白编码基因之间。本发明提供了用于评价白粉菌转化效率的有力工具，即用电击转化法转化含有荧光基因的质粒，使其在白粉菌细胞中表达荧光基因，并通过荧光标记所转化的白粉菌细胞计算白粉菌转化效率，从而有利于研究其他同时导入白粉菌细胞的外源或自身基因的作用。

关键词：白粉菌质粒荧光基因荧光载体转化效率橡胶树转化多菌灵抗性基因绿色荧光蛋白多克隆位点细胞编码基因细胞计算荧光标记自身基因启动子外源位点改造研究

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一种基于鼠脑定位细胞的机器人情景认知地图的构建与导航方法

一种基于鼠脑定位细胞的机器人情景认知地图的构建与导航方法

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作者：刘冬邹强丛明崔瑛雪吕志 116024 辽宁省大连市甘井子区凌工路2号

本发明属于机器人技术与应用领域，涉及一种基于鼠脑定位细胞的机器人情景认知地图的构建与导航方法。机器人在探索环境的过程中，获取自身的运动信息以及正前方的图像信息，并将自身的运动信息输送到网格细胞计算模型中，进而生成相应... 详细信息

标准号: CN109668566B

本发明属于机器人技术与应用领域，涉及一种基于鼠脑定位细胞的机器人情景认知地图的构建与导航方法。机器人在探索环境的过程中，获取自身的运动信息以及正前方的图像信息，并将自身的运动信息输送到网格细胞计算模型中，进而生成相应的位置细胞模型。通过定义事件，将机器人在空间中的位置信息、获取到的图像信息进行封装，利用状态神经元对事件进行标记。在探索过程中，状态神经元不断产生，进而覆盖整个环境，构成环境的情景认知地图。利用生成的情景认知地图，采用全局路径规划算法来实现基于目标的机器人导航。通过局部路径规划算法，利用激光测距传感器对机器人的全局路径进一步优化，实现了机器人的实时避障以及路径的局部优化。

关键词：机器人情景认知状态神经元图像信息运动信息全局路径规划算法激光测距传感器局部路径规划机器人导航机器人技术定位细胞定义事件局部优化全局路径位置细胞细胞计算正前方避障构建鼠脑网格算法封装探索覆盖优化

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一种基于鼠脑定位细胞的机器人情景认知地图的构建与导航方法

一种基于鼠脑定位细胞的机器人情景认知地图的构建与导航方法

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作者：刘冬邹强丛明崔瑛雪吕志 116024 辽宁省大连市甘井子区凌工路2号

标准号: CN109668566A

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