检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：曹学仁车海彦罗大全韩乔慧何永祥 571101 海南省海口市龙华区学院路4号

本发明公开了一种用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组及其应用。所述用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组包括16对引物，引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17～48所示。本发明还提供了所述引物组在橡胶树白粉菌群体遗传... 详细信息

标准号: CN113755632B

本发明公开了一种用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组及其应用。所述用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组包括16对引物，引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17～48所示。本发明还提供了所述引物组在橡胶树白粉菌群体遗传结构分析中的应用。所述引物组具有特异性好、扩增稳定、多态性丰富、重复性好、便于统计等特点，为橡胶树白粉菌群体遗传结构的研究提供了新的技术和手段。

关键词：橡胶树白粉菌群体遗传结构分析引物组群体遗传结构核苷酸序列对引物多态性扩增引物应用统计研究

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用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组及其应用

用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组及其应用

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作者：曹学仁车海彦罗大全韩乔慧何永祥 571101 海南省海口市龙华区学院路4号

标准号: CN113755632A

关键词：橡胶树白粉菌群体遗传结构分析引物组群体遗传结构核苷酸序列对引物多态性扩增引物应用统计研究

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多位点序列分型及其在寄生虫群体遗传结构分析中的应用

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中国血吸虫病防治杂志 2014年第4期26卷 449-452页

作者：梁伟涛刘华邓瑶广东省东莞市公安局东莞523000 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织疟疾血吸虫病和丝虫病合作中心江苏省血吸虫病防治研究所

多位点序列分型技术(Multilocus sequence typing,MLST)具有分辨率、敏感性及特异性高等优点。在寄生虫学研究中,MLST通过扩增多个管家基因进行测序分析和对病原体进行群体遗传结构分析,可为研究虫种进化等提供更多的理论依据。本文就M... 详细信息

多位点序列分型技术(Multilocus sequence typing,MLST)具有分辨率、敏感性及特异性高等优点。在寄生虫学研究中,MLST通过扩增多个管家基因进行测序分析和对病原体进行群体遗传结构分析,可为研究虫种进化等提供更多的理论依据。本文就MLST技术的原理、方法和结果分析及其在几种寄生虫遗传结构分析方面的应用进行综述。

关键词：医学寄生虫学多位点序列分型管家基因群体遗传结构分析隐孢子虫微孢子虫

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猪结肠小袋纤毛虫多位点序列分型方法的建立及遗传多态性研究

猪结肠小袋纤毛虫多位点序列分型方法的建立及遗传多态性研究

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作者：赵立卓河南科技大学

学位级别：硕士

结肠小袋纤毛虫(Balantioides coli)是寄生于人和猪等多种动物结肠和盲肠的一种世界性流行的人兽共患寄生虫。猪是该病原主要的自然宿主。目前用于该病原的分子鉴定方法主要是扩增18S r RNA和ITS1-5.8S r RNA-ITS2基因。其中18S r RNA、... 详细信息

结肠小袋纤毛虫(Balantioides coli)是寄生于人和猪等多种动物结肠和盲肠的一种世界性流行的人兽共患寄生虫。猪是该病原主要的自然宿主。目前用于该病原的分子鉴定方法主要是扩增18S r RNA和ITS1-5.8S r RNA-ITS2基因。其中18S r RNA、5.8S r RNA基因高度保守,不同分离株之间分辨率低,仅适用于种间鉴定;ITS1/2序列虽可用于种内分型,但其变异极强,准确性受到质疑。微卫星分子标记因其在基因组中分布广泛、重复性和保真性好、变异频率高等特点而广泛应用于多种病原分型和群体遗传学研究中。目前结肠小袋纤毛虫的种内遗传多样性还不清晰,所以亟需构建高效的亚型分型方法,为该病原的分子流行病学研究提供有效工具。本研究在我国6个省的14个养殖场共采集了190份断奶仔猪的粪便样本。基于粪便直接涂片法和18S r RNA基因的分子标记技术调查了我国部分地区猪群结肠小袋纤毛虫病的感染情况。形态学检查发现,含有小袋虫滋养体或包囊的样本共有69份,检出率为36.32%。此外,洛阳地区新鲜粪样的镜检结果和虫体密度检测表明,虫体感染强度越大的粪便样品越稀软。对190份粪便样本分别提取DNA后,基于结肠小袋纤毛虫18S r RNA基因位点的分子检测发现,共有98份结肠小袋纤毛虫阳性样品,总阳性率为51.58%。其中黑龙江的阳性率(44.44%)最低,其余各地区阳性率均在50%以上。虽然本研究中不同地理区域的结肠小袋纤毛虫在断奶仔猪中的感染率存有差异,但其差异无统计学意义(P>0.05)。基于在线软件Tandem Repeats Finder从结肠小袋纤毛虫分离株P011全基因组数据的scafold 23中检索出12个微卫星序列,并以其为中心序列设计套式PCR引物,使用28份猪结肠小袋纤毛虫阳性DNA样品检测并优化引物和试验条件,选取PCR扩增效率较高的6个微卫星(BC-MS1、BC-MS5、BC-MS7、BC-MS10、BC-MS11和BC-MS12)作为备选位点。将在各位点成功扩增的样品切胶纯化后测序,通过序列拼接、校正和比对后发现,位点BC-MS7的微卫星区域及其侧翼序列均十分保守,无法将各样品分离株进行有效区分。所以本研究最终基于各位点微卫星区域的长度多态性及单核苷酸替换等信息筛选出了5个多态性遗传标记位点(BC-MS1、BC-MS5、BC-MS10、BC-MS11和BC-MS12),并以此构建适用于猪结肠小袋纤毛虫的多位点序列分型工具。本研究通过构建的MLST方法,解析了我国部分地区猪源结肠小袋纤毛虫的遗传特性。共选取58个不同地区的猪结肠小袋纤毛虫分离株在上述5个多态性位点上扩增,结果显示分别有42、40、44、48和43个分离株在这5位点成功获得核苷酸序列,形成了18、24、23、22、24个亚型。***亚型在各位点的系统发育分析显示江苏的2个分离株(JS-J12和JS-J20)在每个位点都处于一个单独的分支上;河南的3个分离株(He N-P5、He N-P6和He N-B12)在4个位点(He N-B12在位点BC-MS12与其它两个样品分离)也都处于一个分支上。此外,在每个微卫星位点都会有河南的***分离株与P011参考序列处于同一分支,且河南的***分离株在进化树上分散于大多数分支,没有形成明显聚类。本研究共有25个分离株在上述5个位点全部扩增成功并形成了23个多位点序列亚型。将25个分离株在5个位点的核苷酸序列串联后分析发现,本研究中猪结肠小袋纤毛虫种内具有高度遗传多样性,群体遗传结构为克隆性遗传结构,并存在连锁不平衡现象。系统进化分析结果显示,这些分离株大致分为两个亚群,各主要类群之间序列相似性在96%以上,各地区样品分散于系统进化树的各个分支,没有形成明显聚类,不存在明显的地理隔离差异。综上所述,本研究筛选出了5个多态性遗传位点,构建了适用于猪结肠小袋纤毛虫的多位点序列分型工具,并研究了我国部分地区猪源结肠小袋纤毛虫的群体遗传结构研究,解析了该病原的遗传多样性。本研究获得了猪结肠小袋纤毛虫更丰富的遗传学信息,为评估该病原的遗传多样性和阐明其传播机制等科学问题提供了有力依据。

关键词：猪结肠小袋纤毛虫多位点序列分型微卫星遗传多态性群体遗传结构分析

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用于白鹇个体识别的遗传标记及应用

用于白鹇个体识别的遗传标记及应用

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作者：王晨彭仕明吴亚江陈武单芬谢伟骏吕梦娜曾玉慧 510075 广东省广州市先烈中路120号

本发明涉及一种用于白鹇个体识别的遗传标记及应用，涉及生物技术领域。该遗传标记包括SNP位点1‑86中的至少20个。利用该遗传标记对白鹇进行个体识别，个体识别结果准确可靠，且在个体识别结果的基础上还能够进行亲缘关系、种群遗传多... 详细信息

标准号: CN118147319A

本发明涉及一种用于白鹇个体识别的遗传标记及应用，涉及生物技术领域。该遗传标记包括SNP位点1‑86中的至少20个。利用该遗传标记对白鹇进行个体识别，个体识别结果准确可靠，且在个体识别结果的基础上还能够进行亲缘关系、种群遗传多样性、群体遗传结构分析等工作，满足白鹇物种的保护研究需求。

关键词：个体识别遗传标记群体遗传结构分析种群遗传多样性生物技术领域亲缘关系物种应用研究

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鳞砗磲四碱基重复微卫星DNA分子标记

鳞砗磲四碱基重复微卫星DNA分子标记

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作者：马海涛喻子牛张跃环李军秦艳平高红梅 511458 广东省广州市南沙区海滨路1119号

本发明公开了鳞砗磲四碱基重复微卫星DNA分子标记。所述微卫星分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明首次提供了1个鳞砗磲的四碱基重复微卫星位点及扩增这个微卫星位点的引物序列和扩增方法，可应用于鳞砗磲的群体遗传结构分... 详细信息

标准号: CN117106927A

本发明公开了鳞砗磲四碱基重复微卫星DNA分子标记。所述微卫星分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明首次提供了1个鳞砗磲的四碱基重复微卫星位点及扩增这个微卫星位点的引物序列和扩增方法，可应用于鳞砗磲的群体遗传结构分析、亲权鉴定及分子标记辅助育种等领域的研究，重复性好，是一种可靠有效的分子标记。

关键词：微卫星位点分子标记碱基重复扩增分子标记辅助育种群体遗传结构分析微卫星分子标记核苷酸序列微卫星DNA 亲权鉴定引物序列应用研究

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基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法

基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法

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作者：蔡珊珊徐胜勇高天翔 316100 浙江省舟山市普陀区海洋科技产业园普陀展茅晓辉工业区c2—10地块

本发明提供一种基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法，属于基因工程技术领域，包括如下步骤：提取褐菖鲉基因组DNA；将基因组DNA酶切，酶切液中加入Adapter接头进行接头连接；将接头连接获得的不同样品DNA片段混合，进行PCR扩增，然后将... 详细信息

标准号: CN110551806B

本发明提供一种基于高通量测序的褐菖鲉SNP检测方法，属于基因工程技术领域，包括如下步骤：提取褐菖鲉基因组DNA；将基因组DNA酶切，酶切液中加入Adapter接头进行接头连接；将接头连接获得的不同样品DNA片段混合，进行PCR扩增，然后将产物进行测序；将测序得到的原始数据分选聚类，按样品个体进行数据质控并删除Adapter接头序列，将序列比对到参考基因组上，提取SNP位点，筛选用于群体遗传结构分析的SNP位点。本发明SNP检测方法能够减少DNA降解且提高DNA纯度，技术稳定、重复性高、能够在降低成本的情况下大量开发基因组分子标记，该检测方法。

关键词：基因组DNA 接头连接褐菖鲉基因组测序酶切群体遗传结构分析基因工程技术高通量测序分子标记接头序列序列比对样品个体原始数据样品DNA 分选聚类质控删除筛选参考检测开发

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鳞砗磲微卫星DNA分子标记

鳞砗磲微卫星DNA分子标记

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作者：马海涛喻子牛于冬梅张跃环李军秦艳平高红梅 511458 广东省广州市南沙区海滨路1119号

本发明公开了鳞砗磲微卫星DNA分子标记。所述微卫星分子标记包括TS101、TS102、TS103，所述微卫星分子标记TS101、TS102、TS103的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1～3所示。本发明首次提供了3个鳞砗磲的微卫星位点及扩增这3个微卫星位点的... 详细信息

标准号: CN117070640A

本发明公开了鳞砗磲微卫星DNA分子标记。所述微卫星分子标记包括TS101、TS102、TS103，所述微卫星分子标记TS101、TS102、TS103的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1～3所示。本发明首次提供了3个鳞砗磲的微卫星位点及扩增这3个微卫星位点的引物序列和扩增方法，可应用于鳞砗磲的群体遗传结构分析、亲权鉴定及分子标记辅助育种等领域的研究，重复性好，是一种可靠有效的分子标记。

关键词：微卫星分子标记微卫星位点分子标记扩增分子标记辅助育种群体遗传结构分析核苷酸序列微卫星DNA 亲权鉴定引物序列应用研究

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指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点及其引物组和应用

指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点及其引物组和应用

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作者：贾舒雯吴钟解陈石泉李元超蔡泽富沈捷王义 570000 海南省海口市美兰区白驹大道12号

本发明属于分子生物学DNA标记技术领域，具体公开了一种指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点，包括ZH3008、ZH7380、ZH13016、ZH17408、ZH18659、ZH18997、ZH19490、ZH19729和ZH21570中的至少一个位点。本发明提供了用于扩增指状蔷薇珊瑚微卫星... 详细信息

标准号: CN116064893A

本发明属于分子生物学DNA标记技术领域，具体公开了一种指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点，包括ZH3008、ZH7380、ZH13016、ZH17408、ZH18659、ZH18997、ZH19490、ZH19729和ZH21570中的至少一个位点。本发明提供了用于扩增指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点的引物组，以及指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点在群体遗传结构分析、亲权鉴定和/或分子标记辅助育种中的应用。本发明提供的指状蔷薇珊瑚微卫星标记位点及用于扩增微卫星标记位点的引物组，可应用于指状蔷薇珊瑚的群体遗传结构分析、亲权鉴定及分子标记辅助育种等领域的研究，重复性佳，是可靠有效的分子标记，是研究指状蔷薇珊瑚遗传多样性和连通性提供重要的工具。

关键词：蔷薇位点指状微卫星标记珊瑚分子标记辅助育种群体遗传结构分析亲权鉴定引物组扩增分子生物学遗传多样性分子标记连通性应用研究

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一组影响母猪繁殖性能的基因及其筛选方法

一组影响母猪繁殖性能的基因及其筛选方法

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作者：高鹏飞李咏诗李步高曹果清郭晓红路畅 030801 山西省晋中市太谷区铭贤南路1号

本发明提供了一组影响母猪繁殖性能的基因及其筛选方法，属于母猪繁殖性能影响因素研究技术领域。本发明提供的影响母猪繁殖性能的基因为14个，分别为：PALM2、C9orf152、TXN、SVEP1、LPAR1、NUCB2、RPS13、PLEKHA7、BTG1、USP25、APP、... 详细信息

标准号: CN116694776A

本发明提供了一组影响母猪繁殖性能的基因及其筛选方法，属于母猪繁殖性能影响因素研究技术领域。本发明提供的影响母猪繁殖性能的基因为14个，分别为：PALM2、C9orf152、TXN、SVEP1、LPAR1、NUCB2、RPS13、PLEKHA7、BTG1、USP25、APP、ADAMTS1、CCT8、GRB14。基因的筛选方法为：通过猪繁殖性状全基因组关联分析、群体遗传结构分析、GO、KEGG富集分析得到影响母猪繁殖性能的基因。基因的应用为调控上述基因以促进母种猪的交配行为和哺育行为。本发明创造性地提出了与母猪繁殖性状相关的一批基因位点，为提高猪繁育能力提供了研究基础。

关键词：繁殖性能影响母猪基因群体遗传结构分析筛选母猪繁殖性能影响因素研究猪繁殖性状关联分析基因位点交配行为母猪繁殖能力提供全基因组富集性状种猪哺育繁育调控应用分析研究

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