目的探讨微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)和二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术在脓毒血症患者病原学诊断中的价值,为脓毒血症早期诊断提供参考依据。方法采用回顾性分析研究,收集2023年2—8月西安交通大学第二附...
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目的探讨微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)和二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术在脓毒血症患者病原学诊断中的价值,为脓毒血症早期诊断提供参考依据。方法采用回顾性分析研究,收集2023年2—8月西安交通大学第二附属医院重症监护室(intensive care unit,ICU)收治的53例疑似脓毒血症患者的临床资料,采集血液同步进行血培养血培养、ddPCR与NGS检测。结果去除病毒后,血培养阳性率为18.87%(10/53),ddPCR阳性率为47.17%(25/53)、NGS阳性率为41.51%(22/53)。以ddPCR检测范围为参考,ddPCR阳性率为98.11%(52/53),NGS阳性率为84.91%(45/53),两组间差异有统计学意义(P<0.05)。以血培养为参考,ddPCR与NGS敏感度(60.00%vs 70.00%)、特异度(65.11%vs 69.77%)一致性较好。在病原体检出方面,NGS比ddPCR检测范围更广(34种vs 21种),差异具有统计学意义(χ^(2)=55.000,P<0.001)。在耗时方面,血培养平均耗时66.93 h,ddPCR比NGS更快(约4 h vs 20 h)。在抗微生物耐药(antimicrobial resistance,AMR)基因检测方面,有5个耐药菌株经ddPCR与NGS共同检出,经ddPCR检出2种AMR基因,包括bla KPC和mecA,经NGS检出5种AMR基因,除bla KPC外,其余4种在ddPCR检测靶标外检出。结论相比血培养,ddPCR与NGS在脓毒血症病原学诊断中具有良好应用价值,其中ddPCR对病原体检出率更高、耗时更短,NGS检测范围更广,可应用于一些少见菌或常规难以培养的病原体。
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