检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：韩轶星中国科学院研究生院

学位级别：博士

衰老是所有生物都面临着的一个复杂而且不可逆转的生物学过程。衰老的过程中大多数的生理机能都逐渐减退,机体失去体内生理平衡,最终导致了疾病和死亡的发生。尽管衰老广泛存并且对生命有着重要的影响,但是长期以来对于单个基因或者单... 详细信息

衰老是所有生物都面临着的一个复杂而且不可逆转的生物学过程。衰老的过程中大多数的生理机能都逐渐减退,机体失去体内生理平衡,最终导致了疾病和死亡的发生。尽管衰老广泛存并且对生命有着重要的影响,但是长期以来对于单个基因或者单个信号通路的研究并没有从根本上揭示衰老的分子机制。生物体发育过程中,表观遗传修饰在确定基因的转录状态和决定细胞的命运上发挥着重要的作用。并且,表观遗传因子还是接收和记录环境信息的媒介。在一定条件下表观遗传修饰还可以将环境因素对于基因组的影响遗传给后代,或者影响基因表达的过程,因此,在衰老的过程中,表观遗传修饰很可能介导了环境对于基因组的影响,并影响了衰老的速率。在这种情况下,利用分子系统生物学方法,从表观遗传学角度进行衰老过程中基因转录调控的研究将有助于我们解开衰老的机制之谜。\n 在本文的研究中,我们对不同年龄阶段的恒河猴大脑前额叶区域组织进行了组蛋白甲基化修饰H3K4me3,H3K4me2和H3K27me3的ChIP-seq实验。1)通过整合分析恒河猴大脑组织中H3K4me3的ChIP-seq数据和RNA-seq数据以及基因组的结构信息,精确定位了17,933个TSSs,预测了大约10,000个新的TSSs,同时确定了这些基因的转录方向。2)对于基因启动子区域的H3K4me2和H3K27me3的ChIP-seq数据的分析发现,它们在恒河猴大脑中随着衰老的发生逐渐增加。结合基因表达芯片数据进行的功能性分析结果表明,启动子区H3K4me2和H3K27me3的修饰水平发生显著变化的基因,其功能富集在衰老相关的神经系统的发育、细胞的形态建成、转录调控、离子转运和信号传导、物质合成和能量代谢、刺激应答和免疫功能等生物学过程中。这可能预示着H3K4me2和H3K27me3的修饰调控了基因的转录过程,进而影响了衰老相关的生物学过程。3)H3K4me2还标识了增强子区域。我们通过机器学习(machine learning)算法,利用恒河猴大脑组织中的H3K4me2和H3K27me3的ChIP-seq数据预测得到了30,000多个恒河猴大脑中潜在的增强子序列,对其功能分析结果表明,恒河猴大脑中的潜在的增强子在神经突触传递、细胞形态、离子结合、刺激应答等衰老过程中变化显著的生物学过程中显示出明显的富集。和启动子区组蛋白修饰水平变化影响的生物学过程一致性表明,预测得到的一些增强子和启动子一起调控了Axon guidance和Circadian Rhythm等大脑衰老特异性的生物学过程。4)在基因转录调控的研究中,对绝缘子的作用了解的还较少。因此在进行组蛋白甲基化修饰对于TSSs,启动子和增强子进行研究的同时,我们在细胞系中对反式调控因子绝缘子结合蛋白CTCF所受到的表观遗传学调控进行了初步探索。通过生物信息学的模型预测和全基因组的ChIP-seq的实验分析,证明了H2AZ和H3K9me2对于一些位点上CTCF的结合有调控作用。\n 综合以上结果,表观遗传学修饰在启动子、增强子以及绝缘子区域的修饰状态会对基因转录调控过程产生影响。我们所关注的组蛋白甲基化修饰H3K4me2和H3K27me3在恒河猴大脑衰老过程中影响了基因表达调控的关键元件进而调控了基因转录,并且通过这些关键区域上的修饰水平的变化影响了衰老相关基因的表达,进而影响了衰老的发生。

关键词：大脑衰老生物学过程表现遗传学

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飞蝗两型的表现遗传学——DNA甲基化与飞蝗型变

飞蝗两型的表现遗传学——DNA甲基化与飞蝗型变

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作者：林哲中国科学院大学

学位级别：博士

飞蝗(Locustamigratotia)是一种在世界广泛分布的农业害虫，具有群居型和散居型两种型态。当种群密度发生改变时，飞蝗两型之间可以相互转化，并且这种型变的特点可以从亲代遗传给子代。飞蝗是一种研究环境条件影响下表型可塑性表观遗... 详细信息

飞蝗(Locustamigratotia)是一种在世界广泛分布的农业害虫，具有群居型和散居型两种型态。当种群密度发生改变时，飞蝗两型之间可以相互转化，并且这种型变的特点可以从亲代遗传给子代。飞蝗是一种研究环境条件影响下表型可塑性表观遗传的理想模型。　　近年来，人们对昆虫中的DNA甲基化机制有了新的看法。越来越多的证据表明，DNA甲基化在调控动物和昆虫表型可塑性方面起作用。然而，现在关于飞蝗中是否存在DNA甲基化现象，群散两型之间的DNA甲基化程度是否存在差异，以及DNA甲基化是否参与调控型变等问题，几乎无人报导。　　本研究首次利用飞蝗转录组的数据，运用生物信息学的手段，对飞蝗的甲基化现象进行预测，结果表明飞蝗与蜜蜂等膜翅目昆虫相似，在基因组中存在高DNA甲基化修饰。　　进而又利用碱基兼并和RACE等手段，寻找到飞蝗基因组中Dnmt1、Dnmt2和Dnmt3的同源基因，首次鉴定出飞蝗具有完整的DNA甲基化酶系统。通过定量PCR从飞蝗整个发育阶段与成虫各个组织展开了两型DNA甲基化酶表达活性的分析，发现了Dnmt1、Dnmt2和Dnmt3在胚胎期全部高表达、而Dnmt1和Dnmt2在成虫中高表达的规律;并发现了在成虫的脑和胸部肌肉中，群居型和散居型之间的Dnmt1和Dnmt2在表达量上存在显著性差异。因此我们推测在脑与胸部肌肉中可能存在DNA甲基化程度差异较大的基因。　　为了验证这种假说，我们利用MS-AFLP技术，分析了在这两个组织中群散两型飞蝗之间的甲基化位点的多态性。结果表明成虫的脑和胸部肌肉中DNA甲基化程度在两型飞蝗之间确实存在显著差异。我们选择了62条片段进行测序，并利用重亚硫酸氢盐PCR的方法，最终鉴定出在脑和胸部肌肉中存在差异的DNA甲基化位点。

关键词：飞蝗 DNA甲基化 DNA甲基转移酶型变分析表现遗传学

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EB病毒相关胃癌肿瘤相关基因表现遗传学调节机制的研究

EB病毒相关胃癌肿瘤相关基因表现遗传学调节机制的研究

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作者：刘霞青岛大学

学位级别：博士

目的：明确EB病毒相关胃癌(EBV-associatedgastriccarcinoma,EBVaGC)WNT5A表观遗传学异常及其生物学意义。探讨EBVaGC和EBV阴性胃癌(EBV-negativegastriccarcinoma,EBVnGC)组织中视网膜母细胞瘤(retinoblastoma,Rb)和转化生长因子β1(transforminggrowthfactorβ1,TGF-β1)基因启动子甲基化状态及蛋白表达,探讨EBV感染与Rb,TGF-β1基因甲基化及蛋白表达的关系。　　方法：①选取5种EBV阳性和15种EBV阴性胃癌细胞系作为研究对象,RT-PCR检测上述细胞系WNT5AmRNA的转录表达。②甲基化特异性PCR(Methylation-specificPCR,MSP)及亚硫酸氢盐基因组测序法(Bisufitegenomicsequencing,BGS)检测胃癌细胞系以及EBVaGC,EBV阴性胃癌(EBV-negativegastriccarcinoma,EBVnGC)和相应癌旁组织中WNT5A编码基因启动子区甲基化状态。③实时荧光定量PCR(RealtimequantitativePCR,realtimeqPCR)检测去甲基化药物作用前后EBV阳性细胞系和部分EBV阴性胃癌细胞系WNT5A表达。④构建重组表达质粒pcDNA3.1-WNT5A转染EBV阳性细胞系SUN719,WesternBlotting或RT-PCR检测转染后外源性WNT5A表达对β-Catentin,c-Jun和JunB蛋白以及ATF2,c-myc和EGFRmRNA转录表达的影响。⑤采用甲基化特异性PCR(methylmion-specificPCR,MSP)对各种临床病理指标匹配的30例EBVaGC和38例EBVnGC组织中Rb和TGF-β1基因启动子区域的甲基化状态进行检测。⑥免疫组化技术检测两种胃癌组织中Rb和TGF-β1蛋白的表达。⑦采用靶向LMP1的小干涉RNA和/或TGF-β1作用EBV阳性和阴性胃癌细胞系,RT-PCR方法检测LMP1相关因子MMP9,Survivin,CDK4,EGFR和ICAM-1转录表达。　　结果：①RT-PCR结果显示,EBV阴性细胞系WNT5A表达较为普遍,而EBV阳性细胞系中则表达缺失或下调。②MSP检测结果发现5种EBV阳性细胞系中WNT5A编码基因启动子均表现为不同程度的甲基化,只有部分EBV阴性细胞系发生不同程度的甲基化。BGS检测结果显示,EBV阳性胃癌细胞系WNT5A编码基因启动子区49个CpG位点甲基化率显著高于EBV阴性胃癌细胞系,两者间具有显著性差异(F=305.414,P＜0.05)。③两对特异性MSP引物(WNT5Am1/m2和WNT5Au1/u2;WNT5Am3/m4和WNT5Au3/u4)检测23例EBVaGC和25例EBVnGCWNT5A启动子甲基化状态,结果显示,两组间比较差别均有统计学意义(WNT5Aml/m2∶X2=7.561,P=0.006:WNT5Am3/m4∶X2=5.298,P=0.0214)。两对特异性MSP引物检测EBVaGC和EBVnGC及其匹配的癌旁组织中甲基化状态,EBVaGC和癌旁组织比较有显著性差异(WNT5Am1/m2∶X2=18.050,P=0.000;WNT5Am3/m4∶X2=10.083,P=0.0015),而EBVnGC和癌旁组织比较差别无统计学意义(WNT5Am1/m2∶X2=3.500,P=0.061;WNT5Am3/m4:X2=2.286,P=0.131)。④qPCR检测结果显示,去甲基化药物Aza作用EBV阳性胃癌细胞系SUN719可以重新激活WNT5A,恢复其表达。⑤重组质粒pcDNA3.1-WNT5A转染EBV阳性胃癌细胞系SNU719,WesternBlotting结果显示,外源性WNT5A表达可以显著抑制WNT/β-Catenin信号通路中β-Catenin表达。⑥与质粒对照组及变异型WNT5A重组质粒组比较,转染野生型WNT5A重组质粒的SUN719细胞c-Jun和c-myc表达水平没有发生显著变化;而JunB表达明显升高,ATF2和EGFR转录表达显著降低,差别具有统计学意义(P＜0.05)。⑦EBVaGC和EBVnGC组织中Rb基因启动子甲基化检出率分别为80.0%(24/30)和50.0%(19/38),差异有显著性(X2=6.490,P=0.011);EBVaGC和EBVnGC组织中TGF-β1启动子基因甲基化检出率分别为(50.0%,15/30)和(36.8%,14/38),差异无显著性(X2=1.187,P=0.276)。⑧EBVaGC和EBVnGC组织中Rb蛋白表达率分别为43.3%(13/

关键词： EB病毒相关胃癌视网膜母细胞瘤转化生长因子β1 表现遗传学调节机制

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非小细胞肺癌的表现遗传学治疗对DNMT1表达的影响

非小细胞肺癌的表现遗传学治疗对DNMT1表达的影响

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作者：栾加强桂林医学院

学位级别：硕士

目的:探讨表观治疗对非小细胞肺癌(NSCLC)DNMT1表达的影响特点及生物学作用。 　　方法:本研究分为两部分。第一部分:表观治疗对NSCLC中DNMT1的影响及作用机制的研究:1.表观治疗对NSCLC中DNMT1表达的影响。非小细胞肺... 详细信息

目的:探讨表观治疗对非小细胞肺癌(NSCLC)DNMT1表达的影响特点及生物学作用。 　　方法:本研究分为两部分。第一部分:表观治疗对NSCLC中DNMT1的影响及作用机制的研究:1.表观治疗对NSCLC中DNMT1表达的影响。非小细胞肺癌细胞分为对照组（未用药）、5-AZA-CDR治疗组（1～3天）、MS-275治疗组（第4天）及混合治疗组(第1～3天，5-AZA-CDR;第4天，MS-275)，治疗后收集细胞，提取蛋白通过Westernblotting技术对DNMT1表达进行分析;2.表观治疗抑制DNMT1表达的作用机制，按照第一部分治疗方案收集细胞样本，提取总RNA，进行逆转录合成cDNA，然后进行qRT-PCR分析。 　　第二部分:表观治疗的用药浓度及治疗后非小细胞肺癌细胞中DNMT1变化的研究。1.表观治疗药物治疗NSCLC的最佳用药浓度的探究:对非小细胞肺癌细胞分为对照组（未用药）、5-AZA-CDR治疗组（1～3天）、MS-275治疗组（第4天）及混合治疗组(第1～3天，5-AZA-CDR;第4天，MS-275)，加入不同浓度的药物，通过MTT及Westernblotting技术探索治疗非小细胞肺癌细胞的最佳用药浓度;2.表观治疗结束后非小细胞肺癌细胞中DNMT1表达的变化。表观治疗后，收集停药后不同时间段的非小细胞肺癌细胞，进行Westernblotting分析，来检测停药后DNMT1在非小细胞肺癌细胞中表达的变化。 　　结果:第一部分:1.表观治疗后，治疗组DNMT1表达水平均低于未治疗组，联合治疗组较5-AZA-CDR治疗组有效，而5-AZA-CDR治疗组比MS-275治疗组效果明显;2.通过qRT-PCR研究证明了DNMT1生成减少是其在细胞中表达降低的主要原因。 　　第二部分研究发现，表观治疗药物如果药物浓度过小对DNMT1抑制效果不明显，若用量过大则会产生细胞毒性;表观治疗结束时对非小细胞肺癌细胞中DNMT1的抑制作用最强，但随着停药时间的延长，DNMT1表达水平有所恢复;而且不同细胞株对表观治疗的敏感性不同。 　　结论 　　1.表观治疗能有效抑制NSCLC中DNMT1基因的表达，而且对NSCLC生长有抑制作用，并能诱导其死亡。DNA甲基化转移酶抑制剂5-AZA-CDR对DNMT1的抑制作用较去乙酰化酶抑制剂MS-275直接有效，联合用药效果更佳。表观药物对DNMT1的抑制作用主要体现在阻碍其生成。 　　2.表观治疗药物如果药物浓度过小对抑制DNMT1效果不明显，若用量过大则会产生细胞毒性，而且不同细胞株对表观药物的敏感性不同。 　　3.表观治疗后，随着停药时间的延长，DNMT1的表达水平逐步恢复，进一步说明表观遗传可以逆转的性质。

关键词：非小细胞肺癌表现遗传学 DNA甲基转移酶1 治疗效果

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遗传学及表观遗传学改变在骨髓增生异常综合征中的临床意义

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中国实用内科杂志 2010年第5期30卷 407-410页

作者：康慧媛于力解放军总医院血液科北京100853

骨髓增生异常综合征(MDS)是起源于造血干细胞异常改变的克隆性疾病。细胞遗传学异常如5q-、-7和7q-、20q-等分子遗传学异常如各种融合基因、抑癌基因缺失等及表观遗传学改变如抑癌基因异常甲基化等对MDS的明确诊断、预后分析及靶向治疗... 详细信息

骨髓增生异常综合征(MDS)是起源于造血干细胞异常改变的克隆性疾病。细胞遗传学异常如5q-、-7和7q-、20q-等分子遗传学异常如各种融合基因、抑癌基因缺失等及表观遗传学改变如抑癌基因异常甲基化等对MDS的明确诊断、预后分析及靶向治疗有着极其重要的价值。明确MDS发生发展及转归的分子机制对于寻求新的诊断及治疗靶点有重要意义。

关键词：遗传学表现遗传学骨髓增生异常综合征

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表观遗传学的分子机制及其研究进展

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安徽农业科学 2008年第33期36卷 14450-14452,14510页

作者：孙永健陈小强孙宁张磊天津农学院农学系天津300384

表观遗传学(epigenetics)是指不涉及DNA序列改变、可以通过有丝分裂和减数分裂进行遗传的基因表达变化的遗传学分支领域。目前研究主要集中在DNA甲基化、组蛋白密码、染色质重塑和非编码RNA调控等方面。副突变、亲代基因印记、性别相关... 详细信息

表观遗传学(epigenetics)是指不涉及DNA序列改变、可以通过有丝分裂和减数分裂进行遗传的基因表达变化的遗传学分支领域。目前研究主要集中在DNA甲基化、组蛋白密码、染色质重塑和非编码RNA调控等方面。副突变、亲代基因印记、性别相关性基因剂量补偿效应和转基因沉默等都是典型的表观遗传现象。相关研究有利于揭示生物生长发育、多倍体植物基因组进化、杂种优势以及人类疾病等许多生命现象的本质。

关键词：表现遗传学 DNA甲基化组蛋白密码非编码RNA调控蛋白质侵染因子

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组蛋白去乙酰化酶8在肿瘤发展中作用的研究进展

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吉林大学学报（医学版） 2021年第2期47卷 528-536页

作者：胡婷婷朴光宇金艳花延边大学医学院细胞生物学与医学遗传学教研室吉林延吉133002

在肿瘤的表观遗传学中,组蛋白乙酰化和(或)去乙酰化是其调控基因表达的主要驱动力。目前,组蛋白去乙酰化酶(HDACs)参与癌细胞形成与发展的具体机制仍有待进一步研究。组蛋白去乙酰化酶8 (HDAC8)属于Ⅰ类HDAC家族成员,是重要的表观遗传... 详细信息

在肿瘤的表观遗传学中,组蛋白乙酰化和(或)去乙酰化是其调控基因表达的主要驱动力。目前,组蛋白去乙酰化酶(HDACs)参与癌细胞形成与发展的具体机制仍有待进一步研究。组蛋白去乙酰化酶8 (HDAC8)属于Ⅰ类HDAC家族成员,是重要的表观遗传因子之一,其通过催化组蛋白去乙酰化导致局部染色质结构呈压缩和(或)关闭状态而抑制基因转录,还可催化去乙酰化组蛋白之外的蛋白,从而起到对生物大分子的调节作用。HDAC8参与基因转录调控、肿瘤发生发展、细胞增殖、细胞分化和凋亡等重要过程。现就近几年有关HDAC8的结构以及其在胃癌、结肠癌、肺癌、乳腺癌和神经母细胞瘤等多种肿瘤发展中的作用作一综述,旨在更深入了解其功能,并为肿瘤治疗提供新思路。

关键词：组蛋白去乙酰化酶8 乙酰化肿瘤表现遗传学

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儿童早期发育的表观遗传运动调控机制的认识进展

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中国儿童保健杂志 2024年第8期32卷 821-825页

作者：张霆首都儿科研究所北京100020

儿童早期发育的健康质量与儿童日常生活中的膳食均衡和积极的身体活动密切相连,而随着生命科学研究的进展,人们对这一行动的科学认识越来越深刻。为此,在儿童膳食均衡的前提下,本文阐述了身体运动通过对机体表观遗传修饰的影响,有序进... 详细信息

儿童早期发育的健康质量与儿童日常生活中的膳食均衡和积极的身体活动密切相连,而随着生命科学研究的进展,人们对这一行动的科学认识越来越深刻。为此,在儿童膳食均衡的前提下,本文阐述了身体运动通过对机体表观遗传修饰的影响,有序进行下游功能基因的调控,发挥机体内细胞通讯和组织通讯稳态的支撑作用,从而保障儿童机体的良好发育。其中,通过对运动表观遗传学机制(包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非组蛋白修饰、表观遗传修饰阅读器、运动的乳酸代谢和乳酸化修饰等)研究进展的介绍,系统地明确了儿童进行科学身体活动的分子基础。

关键词：表现遗传学运动儿童早期发展

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中医证候实质与表观遗传学相关性初探

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浙江中西医结合杂志 2013年第6期23卷 443-446页

作者：牟新杭州市红十字会医院杭州310003

辨证论治是中医学的特色之一，是构成中医理论体系的重要组成部分，是临床医疗实践准则，在临床诊疗过程中，方从法出，法随证立，可见“证候”是诊疗过程的核心内容，是立法遣药组方的依据，所以正确的辨证在临床工作中有着十分重要的... 详细信息

辨证论治是中医学的特色之一，是构成中医理论体系的重要组成部分，是临床医疗实践准则，在临床诊疗过程中，方从法出，法随证立，可见“证候”是诊疗过程的核心内容，是立法遣药组方的依据，所以正确的辨证在临床工作中有着十分重要的意义。

关键词：表现遗传学中医证候理论探讨

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表观遗传学中DNA甲基化与结直肠癌关系的研究进展

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中国卫生产业 2013年第21期10卷 139-140页

作者：陈红兵吕忠船青岛大学医学院附属烟台毓璜顶医院胃肠外一科山东烟台264000

DNA甲基化是恶性肿瘤中常见的一种表观遗传学改变,其可直接导致抑癌基因的转录发生失活,参与恶性肿瘤的发生和发病过程。所以近几年来,DNA甲基化成为表观遗传学研究的关注点,通过对DNA甲基化深入研究,发现有些特异性的异常甲基化的检测... 详细信息

DNA甲基化是恶性肿瘤中常见的一种表观遗传学改变,其可直接导致抑癌基因的转录发生失活,参与恶性肿瘤的发生和发病过程。所以近几年来,DNA甲基化成为表观遗传学研究的关注点,通过对DNA甲基化深入研究,发现有些特异性的异常甲基化的检测,可成为早期诊断肿瘤的特异分子指标。因此,我们现在进一步研究表观遗传学中DNA甲基化与结直肠癌的关系,现分析如下。

关键词：表现遗传学 DNA甲基化结直肠癌

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