检索结果-内蒙古大学图书馆

黑龙江农业科学 2006年第3期 90-94页

作者：毕影东郭东林杨冬鹤徐香玲李集临王晓萍柏永军哈尔滨师范大学生物系哈尔滨150080 黑龙江省克山县北联镇农业综合服务中心克山161633

表达序列标签(expressed sequence tags,EST)是一种快捷、高效地揭示基因组信息的方法。本文对EST概念、技术原理及其在基因组研究中的应用和进展等方面内容进行了综述,并对EST在大豆基因组研究和抗孢囊线虫大豆研究中的应用进展作一介绍。

关键词：表达序列标签大豆抗孢囊线虫

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

表达序列标签分析在血吸虫基因组研究中的应用

引用

中国热带医学 2003年第2期3卷 224-226页

作者：杨胜湖南省南华大学病原生物研究所衡阳市421001

表达序列标签分析是借助于 10 0～ 40 0个核苷酸长度的标记引物 ,在随机选取cDNA克隆 ,进行 5’端或(和 ) 3’端进行大规模一次性测序。

关键词：血吸虫基因组计划表达序列标签

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

表达序列标签及其应用

引用

生物技术通讯 2003年第1期14卷 82-84页

作者：陈红歌贾新成河南农业大学生物工程学院

表达序列标签(EST)在基因组作图、克隆基因、新基因的识别、蛋白质组研究等许多方面具有重要的用途。本文介绍了EST的制备方法,以及构建均一化cDNA文库的方法,并介绍了EST在以上各方面的应用。

关键词：表达序列标签应用均一化cDNA文库 EST技术

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

表达序列标签技术及其应用

引用

经济林研究 2008年第2期26卷 127-130页

作者：房学爽徐刚标中南林业科技大学湖南长沙410004

表达序列标签（Express Sequence Tags,以下简称为EST）是指表达基因一端或两端的部分DNA序列,能代表着某个表达基因的一段序列信息,平均长度为300~500 bp。EST是大规模获取基因功能的一种最为快捷、有效的研究手段,为寻找新基因、绘制... 详细信息

表达序列标签（Express Sequence Tags,以下简称为EST）是指表达基因一端或两端的部分DNA序列,能代表着某个表达基因的一段序列信息,平均长度为300~500 bp。EST是大规模获取基因功能的一种最为快捷、有效的研究手段,为寻找新基因、绘制遗传图谱、研究基因差异表达和比较基因组学及DNA芯片的制备等提供了大量的序列信息。综述了EST技术的原理、方法及其应用等方面的研究进展。

关键词：基因工程表达序列标签 cDNA 技术应用综述

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

表达序列标签技术及其应用

表达序列标签技术及其应用

引用

中国林学会经济林分会2007年学术年会

作者：房学爽徐刚标中南林业科技大学湖南长沙410004

表达序列标签(Express Sequence Tags,以下简称为EST)是指表达基因一端或两端的部分DNA序列,能代表着某个表达基因的一段序列信息,平均长度为300～***是大规模获取基因功能的一种最为快捷、有效的研究手段,为寻找新基因、绘制遗传图谱... 详细信息

表达序列标签(Express Sequence Tags,以下简称为EST)是指表达基因一端或两端的部分DNA序列,能代表着某个表达基因的一段序列信息,平均长度为300～***是大规模获取基因功能的一种最为快捷、有效的研究手段,为寻找新基因、绘制遗传图谱、研究基因差异表达和比较基因组学及DNA芯片的制备等提供了大量的序列信息.综述了EST技术的原理、方法及其应用等方面的研究进展.

关键词：基因工程表达序列标签基因功能遗传图谱比较基因组学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

石蒜属植物cDNA文库构建与表达序列标签（EST）分析

石蒜属植物cDNA文库构建与表达序列标签（EST）分析

引用

作者：崔永兰南京林业大学

学位级别：博士

表达序列标签(Expressed sequence ***)是一种快速地进行基因功能分析及发现新基因的有效方法。为了全面了解石蒜属植物的花苞和叶片的基因表达情况，本研究利用cDNA文库，对忽地笑野生型叶片与突变型叶片及长筒石蒜花苞EST序列进行了... 详细信息

表达序列标签(Expressed sequence ***)是一种快速地进行基因功能分析及发现新基因的有效方法。为了全面了解石蒜属植物的花苞和叶片的基因表达情况，本研究利用cDNA文库，对忽地笑野生型叶片与突变型叶片及长筒石蒜花苞EST序列进行了测定，并对获得的EST进行生物信息学分析，为全面了解忽地笑叶片突变的机理及长筒石蒜花型、花色变异的原因奠定了基因组学和分子生物学方面的研究基础。利用ZAP表达载体，构建了忽地笑野生型和突变型叶片的cDNA文库。忽地笑野生型叶片cDNA文库的初库滴度为1.2×10～6pfu／mL,重组率为93.7％；忽地笑突变型叶片cDNA文库的初库滴度为5.6×10～5pfu／mL,重组率为96％。经双酶切鉴定，两个文库的插入片段大小均在500-3000bp之间。利用大规模DNA序列测定方法，获得了忽地笑野生型叶片EST 1606条、突变型叶片EST 2132条及长筒石蒜花苞EST 4992条。利用Phred软件对长筒石蒜花苞EST 4992条、忽地笑野生型叶片EST 1606条及忽地笑突变型叶片EST 2132条进行编辑后，分别获得4687条、1312条、1810条有效EST序列，其序列的平均长度分别为545bp、403bp、437bp，序列平均质量数分别为39.28、39.54、40.13；另外通过GC含量分析获得长筒石蒜花苞、忽地笑野生型及突变型叶片EST的GC含量分别39.46、48.33、47.51。将全部7809条有效EST序列全部提交GenBank，长筒石蒜花苞、忽地笑野生型及突变型叶片分别有4624、1304、1800条EST序列已被GenBank收录。利用Phrap软件进行片段重叠群分析，长筒石蒜花苞4687条有效EST序列经拼接后获得967个片段重叠群(contig)与1343个单一EST(singlet)序列；忽地笑野生型叶片1312条有效序列经拼接后得到200个片段重叠群(contig)与535个单一EST(singlet)序列；忽地笑突变型叶片1810条有效序列经拼接后获得305个片段重叠群(contig)与574个单一EST(singlet)序列。随机测序所获得的同一基因的EST的数目可以在一定程度上代表该基因在该组织中的表达丰度。长筒石蒜花苞、忽地笑野生型叶片及忽地笑突变型叶片低丰度表达基因分别为1343(58.1％)、535(72.8％)、574(65.3％)；中丰度表达基因分别为788(34.1％)、152(20.7％)、234(26.6％)；高丰度表达基因分别为179(7.8％)、48(6.5％)、71(8.1％)。因而石蒜属植物花与叶中基因表达比较均衡，高丰度表达基因比较少，绝大多数为中、低丰度表达的基因。 BLAST搜索发现，据同源物类型分类长筒石蒜花苞有31％(1458／4687)的EST可在蛋白质或核酸水平找到同源类似物。其中有3.3％(156／4687)为转座因子(TEs)，这可能与长筒石蒜丰富的花型、花色变异有关。同时还识别了一个控制花器官发育的MADS-box基因AGAMOUS。结合拟南芥基因功能分类方法，长筒石蒜花苞中参与蛋白质合成的基因最多，其次为能量代谢、信号转导等。高丰度表达的基因有聚蛋白、逆转座子相关蛋白等。忽地笑野生型叶片和突变型叶片分别有74.9％(983／1312)与78.1％(1413／1810)的EST在蛋白质或核酸水平找到了同源类似物。根据拟南芥基因功能分类的方法进行功能分类表明，参与蛋白质合成的基因最多，其次为能量代谢、细胞防卫与细胞结构、组织与生物形成、信号转导等。忽地笑野生型与突变型叶片在蛋白质合成、细胞防卫及功能不明确的其它三大类基因表达中存在着差异。在忽地笑野生型叶片中蛋白质合成及细胞防卫与细胞结构基因的表达明显高于突变型叶片，而突变型叶片中功能不明确的基因明显高于野生型叶片，说明在突变型叶片中突变事件发生后，导致了细胞防卫能力的降低及蛋白质合成能力的下降，从而影响了忽地笑突变型叶片的生长势。高丰度表达的基因有叶绿素确结合蛋白、伸长因子、脱落酸与逆境诱导蛋白等。在丰富表达基因中忽地笑野生型与突变型叶片之间没有显著差别。关键词:长筒石蒜，花苞，忽地笑，野生型叶片，突变型叶片，cDNA文库，表达序列标签，片段重叠群

关键词：长筒石蒜花苞忽地笑野生型叶片突变型叶片 cDNA文库表达序列标签片段重叠群

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

条斑紫菜孢子体cDNA文库构建及表达序列标签的初步分析

引用

大连水产学院学报 2006年第1期21卷 7-12页

作者：徐民俊茅云翔庄筠昀张学成中国海洋大学海洋生命学院山东青岛266003

用λ噬菌体载体构建了条斑紫菜Porphyra yezoensis丝状体cDNA表达文库,并对文库进行了随机测序,对随机测序形成的719条表达序列标签(EST)序列进行了初步分析。结果表明:该文库包含1.52×106个独立克隆,重组率为88.2%;EST的冗余率为5... 详细信息

用λ噬菌体载体构建了条斑紫菜Porphyra yezoensis丝状体cDNA表达文库,并对文库进行了随机测序,对随机测序形成的719条表达序列标签(EST)序列进行了初步分析。结果表明:该文库包含1.52×106个独立克隆,重组率为88.2%;EST的冗余率为54.2%,新EST的比率为65.7%。本研究为开展条斑紫菜的功能基因克隆、分析和功能基因组学研究提供了条件。EST序列已递交Gen-Bank,编号为CX873884到CX874602。

关键词：紫菜 cDNA文库表达序列标签

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

梅花鹿表达序列标签资源的微卫星信息分析

引用

黑龙江畜牧兽医 2009年第12期 126-127页

作者：郝丽东北林业大学野生动物资源学院

微卫星标记(simple squenee repeat,SSR)是真核生物基因组中l～6个核苷酸的串联重复,被公认为是各类遗传标记中最有效的分子标记之一.快速增长的表达序列标签(expressed sequence tags,EST)为微卫星标记的开发提供了巨大的来源.

关键词：表达序列标签微卫星标记信息分析梅花鹿资源生物基因组串联重复分子标记

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

藏族外周血淋巴细胞表达序列标签分析

引用

山东医药 2010年第44期50卷 50-52页

作者：陈云天徐树青童晓梅郑晓光于军格日力复旦大学附属上海市第五人民医院上海200240 中国科学院北京基因组研究所青海大学高原医学研究中心

目的对藏族外周血淋巴细胞cDNA文库进行随机大规模表达序列标签(ESTs)测序并进行生物信息学分析,通过序列比对找到与低氧适应相关基因有关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。方法将部分文库经大肠杆菌BM 25.8质粒化,用5′端测序引物进行测序... 详细信息

目的对藏族外周血淋巴细胞cDNA文库进行随机大规模表达序列标签(ESTs)测序并进行生物信息学分析,通过序列比对找到与低氧适应相关基因有关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。方法将部分文库经大肠杆菌BM 25.8质粒化,用5′端测序引物进行测序,利用BLAST程序对获得的ESTs从核苷酸和氨基酸水平进行同源性搜索和比对。结果经序列比对发现突变位点较多发生在UTR区域,同时一些基因的编码区域也发生蛋白序列的变化。对这些基因注释后发现,有些突变发生在与能量代谢、线粒体相关的基因及一氧化氮合酶上,如GTPase、NDUFA6、ATP5L、NOSIP。结论 ESTs技术是一个快速、有效寻找新基因的方法 ,是系统研究不同人群基因表达模式的有力工具。

关键词：藏族淋巴细胞表达序列标签单核苷酸多态性

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

辐射抗性小鼠与其亲代差异基因的表达序列标签

引用

苏州大学学报（医学版） 2009年第1期29卷 1-3页

作者：王芹岳井银李进宋力刘强穆传杰吴红英中国医学科学院放射医学研究所生物室天津市分子核医学重点实验室天津300192

目的寻找IRM-2小鼠体内存在的与辐射抗性相关的基因。方法提取IRM-2小鼠和其亲代小鼠脾细胞总RNA,利用mRNA差异显示技术挑选差异表达片段,对每一条差异带进行特异PCR扩增、克隆和测序。结果获得IRM-2小鼠独有而亲代小鼠均无的cDNA差异... 详细信息

目的寻找IRM-2小鼠体内存在的与辐射抗性相关的基因。方法提取IRM-2小鼠和其亲代小鼠脾细胞总RNA,利用mRNA差异显示技术挑选差异表达片段,对每一条差异带进行特异PCR扩增、克隆和测序。结果获得IRM-2小鼠独有而亲代小鼠均无的cDNA差异带75条,经测序获得52条差异cDNA序列。与GenBank基因库同源性比较,得到21条与小鼠已知基因不同源的表达序列标签(EST)。结论21条EST提示IRM-2小鼠体内可能存在辐射抗性相关基因,为进一步分离和鉴定辐射抗性相关基因奠定了基础。

关键词：辐射抗性 mRNA差异显示表达序列标签

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：