检索结果-内蒙古大学图书馆

草地学报 2023年第2期31卷 321-329页

作者：杨卓雄董笛韩烈保晁跃辉北京林业大学北京100083

TCP是高等植物所特有的一类转录因子,参与调控植物的生长发育、衰老及逆境应答等多个生物学过程。本研究从日本结缕草(Zoysia japonica)中克隆出ZjTCP20基因,并对该基因进行生物信息学分析、自激活检测、表达模式分析等来探究该基因特性... 详细信息

TCP是高等植物所特有的一类转录因子,参与调控植物的生长发育、衰老及逆境应答等多个生物学过程。本研究从日本结缕草(Zoysia japonica)中克隆出ZjTCP20基因,并对该基因进行生物信息学分析、自激活检测、表达模式分析等来探究该基因特性。ZjTCP20基因完整编码区为624 bp,编码208个氨基酸。ZjTCP20蛋白无信号肽,具有疏水性,系统发育进化树结果显示其与玉米(Zea mays)ZmTCP20亲缘关系最近。亚细胞定位显示该蛋白定位于叶绿体、细胞质和细胞核上。ZjTCP20基因表达模式结果显示,该基因在幼嫩叶片中大量表达,随植物发育表达量逐渐减少,但茉莉酸甲酯(MeJA)等3个激素对基因的表达量没有显著影响。酵母自激活试验显示ZjTCP20具备自激活活性。本研究为进一步研究ZjTCP20基因提供了科学依据。

关键词：日本结缕草 TCP20基因生物信息学表达模式分析

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丹参普遍胁迫蛋白基因(SmUSP)的克隆及表达模式分析

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植物生理学报 2013年第4期49卷 362-368页

作者：邝静生华武玉翠葛茜张媛王喆之药用资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室陕西师范大学生命科学学院西安710062

通过BLAST比对分析丹参EST数据库,发现一个与普遍胁迫蛋白(USP)基因家族同源性较高的基因序列,命名为SmUSP,GenBank登录号为JX416284。依据该序列,从DNA和cDNA水平克隆得到该基因全长,经分析发现该基因无内含子序列,包含一个长711bp的... 详细信息

通过BLAST比对分析丹参EST数据库,发现一个与普遍胁迫蛋白(USP)基因家族同源性较高的基因序列,命名为SmUSP,GenBank登录号为JX416284。依据该序列,从DNA和cDNA水平克隆得到该基因全长,经分析发现该基因无内含子序列,包含一个长711bp的完整开放读码框(ORF),编码236个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmUSP编码蛋白的相对分子量25.5kDa,为无信号肽和跨膜结构域的疏水酸性蛋白;SmUSP具有UspA结构域和ATP结合位点,属于USP蛋白UspFG亚家族。实时荧光定量PCR分析表明,SmUSP在丹参的根、茎、叶、花中均有表达,在根中的表达量较高。同时,SmUSP表达受茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、脱落酸(ABA)以及脱水胁迫的上调诱导,推测该基因可能在丹参防御反应中发挥作用。

关键词： SmUSP 生物信息学分析表达模式分析

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水曲柳BZR1基因克隆及其表达模式分析

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植物研究 2021年第5期41卷 744-752页

作者：纪欣童于磊詹亚光东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室哈尔滨150040

研究水曲柳BZR1基因应答非生物胁迫及激素信号的表达模式,对探究BR在水曲柳生长发育及响应环境胁迫方面的作用有重要意义。本研究以水曲柳为材料,PCR克隆得到目的基因,通过生物信息学软件分析分子结构特征,利用荧光定量PCR探究FmBZR1在... 详细信息

研究水曲柳BZR1基因应答非生物胁迫及激素信号的表达模式,对探究BR在水曲柳生长发育及响应环境胁迫方面的作用有重要意义。本研究以水曲柳为材料,PCR克隆得到目的基因,通过生物信息学软件分析分子结构特征,利用荧光定量PCR探究FmBZR1在低温、盐胁迫及ABA、IAA、GA3诱导下的表达模式。生物信息学分析表明,FmBZR1基因全长984 bp,编码327个氨基酸,FmBZR1蛋白为亲水性蛋白,与樟子松BZR1蛋白的同源性较高。在非生物胁迫与激素诱导下,结果表明,与对照组相比,FmBZR1基因表达量有显著差异。低温处理6 h、盐处理24 h后表达量最高,分别为对照组的1.98、10.13倍。ABA、IAA、GA3处理3 h后基因表达量最低,分别为对照组的0.52、0.41、0.50倍;GA3处理24h后基因表达量最高,为对照组的6.23倍。FmBZR1基因在水曲柳生长发育及各种胁迫应答的过程起到了十分关键的作用。

关键词：水曲柳 BZR1基因基因克隆胁迫处理表达模式分析

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烟草硝酸盐转运蛋白NtNRT1.7基因的克隆、亚细胞定位及表达模式分析

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烟草科技 2022年第5期55卷 1-8页

作者：尹卓然王驰轩栋栋罗勇连文力贾宏昉河南农业大学烟草学院郑州市450002 厦门大学生命科学学院福建省厦门市361000

为研究硝酸转运蛋白(Nitrate transporter,NRT)在烟草吸收和转运硝酸盐中的作用,以烟草K326的cDNA为模板,克隆了一个全长1839 bp、编码612个氨基酸的硝酸盐转运蛋白基因,命名为NtNRT1.7。生物信息学分析表明烟草NtNRT1.7具有典型跨膜结... 详细信息

为研究硝酸转运蛋白(Nitrate transporter,NRT)在烟草吸收和转运硝酸盐中的作用,以烟草K326的cDNA为模板,克隆了一个全长1839 bp、编码612个氨基酸的硝酸盐转运蛋白基因,命名为NtNRT1.7。生物信息学分析表明烟草NtNRT1.7具有典型跨膜结构域。同源性分析结果显示,NtNRT1.7与拟南芥AtNRT1.7的同源性达57.23%。亚细胞定位结果表明该蛋白定位在细胞膜上,是一个典型的膜蛋白。启动子分析和不同胁迫处理的qRT-PCR结果显示,NtNRT1.7主要在成熟叶中高表达,并受低氮诱导抑制表达,受干旱、低温、高盐等胁迫诱导增强表达,表明NtNRT1.7基因可能参与非生物胁迫条件下硝酸盐的再利用。

关键词： NRT1.7 基因克隆表达模式分析烟草

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山新杨LTP家族基因生物信息学及表达模式分析

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植物研究 2022年第2期42卷 211-223页

作者：孙乾吴宇航张雅譞曹竞丹石晶静王超东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学林学院哈尔滨150040

以山新杨(Populus davidiana×*** ***)LTP家族基因为研究对象,初步分析该家族基因的序列特征和表达模式,筛选材性和抗性相关PdbLTP基因,为LTP基因的分子调控机制研究及林木遗传改良提供候选基因。通过蛋白性质分析、多序列比对分... 详细信息

以山新杨(Populus davidiana×*** ***)LTP家族基因为研究对象,初步分析该家族基因的序列特征和表达模式,筛选材性和抗性相关PdbLTP基因,为LTP基因的分子调控机制研究及林木遗传改良提供候选基因。通过蛋白性质分析、多序列比对分析、进化树分析初步分析LTP家族基因的序列特征。利用荧光定量PCR(qRT-PCR)分析重力、NaCl及PEG胁迫处理下山新杨LTP家族基因的表达模式。查找获得8条PdbLTP基因序列,2条亚家族PdbGLTP基因序列。CDS序列长度在294~396 bp。LTP家族蛋白为疏水性蛋白且具有8个半胱氨酸的保守结构。qRT-PCR结果显示,PdbLTP1、PdbLTP3、PdbLTP5、PdbLTP7基因在应拉木中表达上调;PdbLTP1、PdbLTP2、PdbLTP3、PdbLTP5基因在茎中表达量最高;除PdbLTP5外,其它基因均受盐胁迫诱导;PdbLTP1、PdbLTP2、PdbLTP3、和PdbLTP5受干旱胁迫诱导。PdbLTP基因家族成员在调控山新杨木质部发育和抵抗非生物胁迫中发挥作用。

关键词：山新杨 LTP家族生物信息学表达模式分析

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内蒙古白绒山羊erk2基因的克隆及表达模式分析

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生物工程学报 2013年第12期29卷 1743-1752页

作者：王彦凤吴曼琳王晓晶王婧李洋连梦瑶王志钢内蒙古大学生命科学学院内蒙古呼和浩特010021 赤峰市医院内蒙古赤峰024000

旨在克隆内蒙古白绒山羊erk2基因cDNA并分析其基本表达模式。采用RT-PCR方法克隆白绒山羊erk2基因cDNA。通过在线软件Blast进行核酸序列分析,用SMART与Psite进行氨基酸序列分析。定量RT-PCR检测erk2基因在绒山羊组织中的表达特异性。免... 详细信息

旨在克隆内蒙古白绒山羊erk2基因cDNA并分析其基本表达模式。采用RT-PCR方法克隆白绒山羊erk2基因cDNA。通过在线软件Blast进行核酸序列分析,用SMART与Psite进行氨基酸序列分析。定量RT-PCR检测erk2基因在绒山羊组织中的表达特异性。免疫组化法检测绒山羊睾丸中erk2表达。克隆到的内蒙古白绒山羊erk2基因cDNA片段(GenBank Accession ***569765)长1 083 bp,包含了编码360个氨基酸残基的全长ORF,氨基酸序列与牛的ERK2(Bos Taurus BC133588.1)同源性为100%。SMART分析表明,ORF编码的蛋白包含了活化位点"TEY"及具有丝氨酸/苏氨酸激酶催化活性的S-TKc结构域。Psite分析表明,含2个N-糖基化位点、1个依赖于cAMP/cGMP的蛋白激酶磷酸化位点、3个蛋白激酶c磷酸化位点、5个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、2个N-豆蔻酰化位点、2个异戊二烯基结合区(CAAX box)、7个微体羧基端靶向信号、2个蛋白激酶ATP结合区标记及一个丝/苏氨酸蛋白激酶活性区域标记。PSORT(k-NN prediction)程序预测其定位于细胞质中。定量RT-PCR分析显示erk2基因mRNA丰度在心脏、皮肤以及乳腺组织中mRNA丰度较高,脾、肾中的表达相对较低。在睾丸中检测到ERK2蛋白表达。

关键词：内蒙古白绒山羊 erk2 基因克隆表达模式分析

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玉米ZmPP6C基因的克隆及其响应光质和胁迫处理的表达模式分析

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作物学报 2016年第2期42卷 170-179页

作者：原换换孙广华闫蕾郭林樊晓聪肖阳孟凡华宋梅芳詹克慧杨青华杨建平河南农业大学农学院/河南粮食作物协同创新中心河南郑州450002 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 中国农业科学院研究生院北京100081 北京市辐射中心北京100875

丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶6亚基(catalytic subunits of Ser/Thr protein phosphatase 6,PP6C)是PP6全酶的催化亚基。在模式植物拟南芥中的研究表明,PP6C参与生长素极性运输、脱落酸信号转导和光信号转导途径介导的开花调控。为了明确玉... 详细信息

丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶6亚基(catalytic subunits of Ser/Thr protein phosphatase 6,PP6C)是PP6全酶的催化亚基。在模式植物拟南芥中的研究表明,PP6C参与生长素极性运输、脱落酸信号转导和光信号转导途径介导的开花调控。为了明确玉米丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶6亚基(ZmPP6C)的蛋白结构特征与同源蛋白间的进化关系,采用RT-PCR方法克隆了ZmPP6C的全长基因。序列分析表明,ZmPP6C开放阅读框为912个核苷酸,编码303个氨基酸残基,包含PP2A的催化亚基PP2Ac结构域;系统进化树分析表明,PP6C蛋白在进化上较为保守,并且与高粱的PP6C蛋白相似性更高。对玉米自交系B73的ZmPP6C基因进行器官特异性表达分析表明,其表达量在成株期叶片中最高,是根中的7.9倍;ZmPP6C能够响应不同光质处理,且受远红光和红光的影响较大;也能响应长日和短日处理,在长日条件下的光照和黑暗阶段各有一个明显的表达高峰,在短日条件下的光照和黑暗阶段分别有2个和3个表达峰值;同时,ZmPP6C还响应高渗透、盐渍和淹水等胁迫处理,出现明显的上调表达。结果表明,ZmPP6C在玉米光信号转导、开花诱导与胁迫应答中发挥重要作用,其分子与生化机制值得进一步探讨。

关键词：玉米丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶表达模式分析光敏色素光信号途径非生物胁迫

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丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析

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中草药 2014年第23期45卷 3449-3455页

作者：周宏骏武玉翠晋鑫鑫饶丽华王喆之陕西师范大学生命科学学院教育部药用资源与天然药物化学重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室陕西西安710062

目的克隆丹参碱性螺旋-环-螺旋(b HLH)类转录因子SmbHLH93,并初步探究该基因的功能。方法采用PCR和RT-PCR技术分别从DNA和c DNA水平克隆得到了SmbHLH93基因,进一步通过BD Walking获得了该基因的5’启动子区。生物信息学分析SmbHLH93蛋... 详细信息

目的克隆丹参碱性螺旋-环-螺旋(b HLH)类转录因子SmbHLH93,并初步探究该基因的功能。方法采用PCR和RT-PCR技术分别从DNA和c DNA水平克隆得到了SmbHLH93基因,进一步通过BD Walking获得了该基因的5’启动子区。生物信息学分析SmbHLH93蛋白的理化性质、结构特点和系统进化关系。结合启动子区分析软件和q PCR,研究SmbHLH93在丹参不同部位和环境诱导下的表达模式。结果获得SmbHLH93基因序列954 bp和5’启动子区1 583 bp,其中开放阅读框(ORF)657 bp,有3个内含子和4个外显子,编码218个氨基酸,含有b HLH和ACT_UUR-ACR-like结构域,无跨膜区域,可能定位于细胞核。表达模式分析结果显示该基因的表达量在根中最高,茎中最低,且随着花的形成逐渐降低。光和低温诱导SmbHLH93的高表达,而水杨酸(SA)抑制其表达。结论克隆得到丹参b HLH类转录因子新成员SmbHLH93,初步预测其参与了丹参花的发育过程和丹参次生代谢途径的调控。

关键词：丹参 SmbHLH93 基因克隆生物信息学表达模式分析

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草地早熟禾BBML基因的克隆及表达模式分析

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草地学报 2024年第2期32卷 396-408页

作者：余江弟李玉珠苗佳敏丁菲菲白小明牛奎举甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心甘肃兰州730070

为探究婴儿潮(BABY BOOM,BBM)基因诱导草地早熟禾(Poa pratensis)体胚发生的潜在功能,本研究采用同源克隆方法获得PpBBML(PpBBM-like)基因,并对其进行生信分析、亚细胞定位和表达模式分析。结果表明:PpBBML编码的蛋白具BBM特有的bbm-1... 详细信息

为探究婴儿潮(BABY BOOM,BBM)基因诱导草地早熟禾(Poa pratensis)体胚发生的潜在功能,本研究采用同源克隆方法获得PpBBML(PpBBM-like)基因,并对其进行生信分析、亚细胞定位和表达模式分析。结果表明:PpBBML编码的蛋白具BBM特有的bbm-1基序且定位于细胞核,并与小麦(Triticum aestivum)BBM亲缘关系最近。PpBBML的表达水平存在组织特异性,表达量为花药>茎基>幼叶>根茎>老叶>不定根。6-BA,NAA(除0 h外),MeJA和EBR(除4 h外)处理后的PpBBML表达量均高于CK;GA3处理后的PpBBML表达量均低于CK。在仅添加生长素的愈伤组织诱导培养基上,其表达量在接种第2 d最高。综上所述,PpBBML是AP2亚家族的转录因子基因,其表达量在幼嫩组织中最高且受到不同激素的诱导,并在愈伤组织形成初期表达量急剧上升,因此,该基因可能具有诱导草地早熟禾胚性愈伤组织发生的潜力。

关键词：草地早熟禾 BBM基因基因克隆生物信息学分析表达模式分析

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玉米大斑病菌StRTG2基因结构、原核表达及表达模式分析

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华北农学报 2021年第4期36卷 191-196页

作者：李默晓卞哲周启慧刘玉卫巩校东谷守芹韩建民河北农业大学生命科学学院河北省植物生理与分子病理学重点实验室河北保定071001

为明确玉米大斑病菌StRTG2基因功能以及其在病菌不同发育时期的表达模式。利用酵母ScRTG2基因编码的氨基酸序列进行BlastP,在玉米大斑病菌中得到了其同源基因序列,将其命名为StRTG2;分别以玉米大斑病菌野生型01-23的全基因组DNA及cDNA... 详细信息

为明确玉米大斑病菌StRTG2基因功能以及其在病菌不同发育时期的表达模式。利用酵母ScRTG2基因编码的氨基酸序列进行BlastP,在玉米大斑病菌中得到了其同源基因序列,将其命名为StRTG2;分别以玉米大斑病菌野生型01-23的全基因组DNA及cDNA为模板,对该基因进行克隆;利用生物信息学技术对该基因编码的蛋白StRtg2进行理化性质分析、结构域预测、亚细胞定位预测;利用MEGA 7.0对Rtg2进行进化关系分析;扩增目的片段的ORF序列,构建该基因原核表达载体,通过转化大肠杆菌BL21后,使用IPTG进行诱导表达;最后利用RNA-Seq数据库分析StRTG2基因在玉米大斑病菌关键生长发育时期(菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉)的表达模式。主要研究结果如下:克隆了该基因发现其长度为1695 bp,不含有内含子;该基因编码的蛋白由564个氨基酸组成,理论等电点值(pI)是6.96,具有典型的Ppx-Gppa保守结构域,亚细胞定位预测结果显示,该蛋白在细胞各部位均有分布,分布于细胞质中的可能性最大;对该蛋白进行进化关系分析表明,玉米大斑病菌StRtg2蛋白与番茄匍柄霉菌中同源蛋白的同源性最高,其次是酿酒酵母;原核表达该基因,SDS-PAGE胶显示该蛋白的大小约为62 ku,与预期大小相符;表达模式分析发现,该基因在病菌发育的5个时期均有表达,其中芽管和侵入钉时期表达量显著降低。为进一步解析StRTG2基因的功能研究奠定基础。

关键词：玉米大斑病菌基因克隆 StRTG2基因原核表达表达模式分析

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