检索结果-内蒙古大学图书馆

生物技术通报 2025年第4期41卷 176-187页

作者：王天禧杨炳松潘荣君盖文贤梁美霞鲁东大学园艺学院烟台264025

【目的】从苹果全基因组中鉴定MdPLATZs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究MdPLATZs转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法从苹果全基因组鉴定出17个PLATZ基因家族成员,并依据其序列特征将其划分为4个亚家... 详细信息

【目的】从苹果全基因组中鉴定MdPLATZs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究MdPLATZs转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法从苹果全基因组鉴定出17个PLATZ基因家族成员,并依据其序列特征将其划分为4个亚家族,并对其理化特征、系统进化关系、基因结构、染色体定位和启动子顺式作用元件等进行分析。本研究测定了苹果不同组织中PLATZ家族成员的表达水平,并通过异源表达及干旱胁迫处理来鉴定MdPLATZ9的基因功能。【结果】生物信息学分析结果表明,MdPLATZs分子量范围为17.23-29.39 kD,等电点介于8.24-9.51之间,且多数成员定位在细胞核内。这些基因分布于苹果的13条染色体上,同一亚家族的成员具有相似的基因结构并具有较高的序列同源性,且各组之间存在明显的共线性关系。PLATZ结构域在MdPLATZs家族中高度保守。基因表达模式分析显示,MdPLATZs家族成员存在组织表达特异性,MdPLATZs在花中均有表达,MdPLATZ7在花和茎中表达量最高。进一步分析显示,过表达MdPLATZ9的拟南芥植株过氧化物酶和过氧化氢酶活性显著增强,同时丙二醛和过氧化氢含量降低,抗坏血酸水平升高,并且超氧阴离子的生成速率减缓,这些结果表明,过表达MdPLATZ9提高了拟南芥的抗旱性。【结论】从苹果全基因组中鉴定出17个MdPLATZs转录因子家族成员,该家族成员在基因结构、蛋白基序表现出高度的相似性和同源性,并且存在显著的片段重复。过表达MdPLATZ9的拟南芥植株表现出明显的抗旱性。

关键词：苹果 MdPLATZ9 转录因子生物信息学表达模式分析

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番茄YABBY家族转录因子的克隆、表达模式分析及其功能研究

番茄YABBY家族转录因子的克隆、表达模式分析及其功能研究

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作者：王苏苏重庆大学

学位级别：硕士

YABBY蛋白家族是一种植物中所特有的转录因子，具有典型的N端C2C2型锌指结构域和C端螺旋环螺旋YABBY保守结构域，在大多数的高等植物的生长发育以及形态建成方面发挥着重要的生物学功能。目前，该家族基因在模式生物拟南芥中的功能研究... 详细信息

YABBY蛋白家族是一种植物中所特有的转录因子，具有典型的N端C2C2型锌指结构域和C端螺旋环螺旋YABBY保守结构域，在大多数的高等植物的生长发育以及形态建成方面发挥着重要的生物学功能。目前，该家族基因在模式生物拟南芥中的功能研究比较清楚，但在番茄中分子机制仍不是很清楚，研究YABBY家族基因在番茄生长发育进程中的生物学功能具有重要意义。本研究筛选了番茄YABBY家族中的几个紧密相关的转录因子分别命名为SlYABBY5、SlYABBY1b和SlYABBY2a，利用qRT-PCR技术研究了此三个基因在番茄各组织中的表达模式分析；在ABA、ASA、IAA、GA3等外源激素处理以及低温、高盐和叶伤害等逆境胁迫下的表达分析。此外，分别构建了SlYABBY1b和SlYABBY2a基因的沉默表达载体，以及SlYABBY2a超表达载体，通过农杆菌转化的方法分别将SlYABBY1b和SlYABBY2a所构建的沉默载体和超表达载体转入番茄基因组中，经抗生素筛选以及PCR鉴定，获得相应的番茄转基因株系，并对转基因番茄的生长发育进行了表型观察，进行了相关基因的表达研究，对其功能进行初步分析。主要研究内容和结果如下： 1从NCBI数据库中分别获得SlYABBY5（GenBank登录号：AK246138）、SlYABBY1b（GenBank登录号：AK326840）和SlYABBY2a(GenBank登录号：AK328263)基因序列及其所编码的氨基酸残基，并利用RT-PCR的方法克隆了包含完整ORF的SlYABBY5基因，克隆了用于构建沉默载体的SlYABBY1b和SlYABBY2a基因的特异片段和用于构建超表达载体的包含完整ORF的SlYABBY2a的基因。所获得的基因片段分别连入pGEM-T-easy-vector克隆载体，经PCR验证和测序验证，所克隆的基因片段序列正确。 2提取野生型番茄AC++各组织材料以及rin和Nr突变体的果实材料的总RNA，采用反转录酶和寡聚dT合成cDNA第一链。利用qRT-PCR的方法进行AC++野生型番茄各组织表达模式分析，利用Nr和rin的果实成熟突变体进行果实成熟各时期表达模式分析。结果表明，SlYABBY5、SlYABBY1b和SlYABBY2a均在番茄根和茎中表达量极低，但在番茄叶组织、果实组织、萼片和花组织中均呈现组成型表达，在不同组织中的表达有明显的差异；在Nr和rin果实成熟突变体中与野生型番茄相比无明显差异，且具有类似的表达趋势。 3选取四周大小的野生型番茄叶组织为材料，利用IAA、ABA、GA3和ASA等激素处理番茄幼苗，qRT-PCR方法分析表明，SlYABBY5、SlYABBY1b和SlYABBY2a三个基因的表达均受到抑制；利用低温、高盐和机械损伤等处理幼苗，SlYABBY1b基因的表达也受到了明显的抑制；而SlYABBY5和SlYABBY2a基因受低温胁迫的抑制，而其表达水平受高盐和叶伤害胁迫的诱导。 4利用所克隆的SlYABBY1b基因的特异序列构建了RNAi介导的番茄pBIN19::SlYABBY1b沉默载体，经PCR和酶切验证正确后，利用农杆菌介导的方法将沉默载体重组入番茄基因组中，经过Kan抗性筛选以及PCR验证的方法来筛选阳性转基因株系，经过验证获得了5个阳性的转基因株系；利用qRT-PCR技术，检测SlYABBY1b基因在所筛选出的所有的转基因株系中的表达情况，检测到该基因的表达水平均被明显的下调。 5利用所克隆的SlYABBY2a的特异基因片段构建RNAi介导的番茄pBIN19::SlYABBY2a沉默载体，利用所克隆的包含完整ORF的SlYABBY2a的特异片段构建pBI121：：SlYABBY2a超表达载体，经酶切和PCR验证正确后，利用农杆菌介导的方法侵染番茄子叶，分别将沉默和超表达载体重组入番茄基因组，采用Kan抗性筛选和PCR验证的方法筛选出阳性转基因株系，验证分别获得了2个超表达和5个沉默的转基因株系；利用qRT-PCR技术检测SlYABBY2a基因分别在超表达和沉默转基因株系中的表达量，结果显示，在2个超表达转基因株系中SlYABBY2a基因的表达水平均被明显上调，而该基因在沉默转基因株系中其表达量明显下降。 6利用SlYABBY1b部分转基因材料分别进行生长素途径和赤霉素合成途径相关基因的检测，研究表明，IAA3、IAA9、ARF7、ARF8和PIN4在RNAi介导的沉默转基因番茄中表达水平与野生型番茄相比均被下调。其中，IAA3、IAA9和ARF8的表达在转基因株系RNAi2#中被下调的水平比RNAi4#株系明显。氧化酶基因GA20ox1的表达水平在RNAi2#和RNAi4#株系中被上调，而GA20ox2的表达水平无明

关键词： YABBY家族 qRT-PCR 表达模式分析 RNAi 番茄

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‘红阳’猕猴桃TCP基因家族鉴定及其在果实中的表达分析

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生物技术通报 2025年第3期41卷 190-201页

作者：宋姝熠蒋开秀刘欢艳黄亚成刘林娅大连大学生命健康学院大连116622 六盘水师范学院生物科学与技术学院六盘水553004

【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’... 详细信息

【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’猕猴桃TCP转录因子的理化性质、基因结构、保守基序、顺式作用元件及物种间共线性关系等。利用转录组数据和RT-qPCR分析‘红阳’猕猴桃中AcTCPs在果实不同发育时期、不同组织中和激素处理下的表达模式。【结果】在‘红阳’猕猴桃中鉴定出分布于19条染色体上的40个含有完整TCP结构域的AcTCPs基因,分别命名为AcTCP1-AcTCP40。系统发育分析、保守基序和基因结构分析将它们分为PCF(21)、CIN(12)和CYC/TB1(7),且全基因复制或片段复制在‘红阳’猕猴桃TCP基因家族的扩展中发挥了重要作用。组织特异性分析表明,6个候选基因在雄花和果实中高表达,果实不同发育时期RT-qRCR结果显示,AcTCP1在果实发育后期高表达,AcTCP11、AcTCP1、AcTCP35、AcTCP10和AcTCP32在果实发育前期高表达,且表达模式与转录组结果一致。对果实进行外源激素处理结果表明,脱落酸(ABA)和乙烯(ET)处理下调了6个候选AcTCPs的表达;赤霉素(GA_(3))处理初期上调了AcTCP1、AcTCP35和AcTCP32的表达,氯吡苯脲(CPPU)处理初期上调了Ac TCP35和AcTCP32的表达,其余AcTCPs的表达均被GA_(3)和CPPU下调。【结论】从‘红阳’猕猴桃全基因组中系统鉴定出40个TCP基因,6个候选基因在果实和雄花中高表达。在果实中AcTCP35、AcTCP32、AcTCP1、AcTCP10、AcTCP11和AcTCP20的表达与果实发育密切相关且受到外源激素(ABA、ET、GA_(3)和CPPU)的调控。

关键词： ‘红阳’猕猴桃 TCP转录因子全基因组鉴定生物信息学组织差异表达模式分析激素处理

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高粱CPP基因家族鉴定及表达分析

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生物技术通报 2025年第1期41卷 132-142页

作者：杜品廷吴国江王振国李岩周伟周亚星内蒙古民族大学科尔沁沙地生态农业国家民委重点实验室通辽028000 通辽市农牧科学研究所通辽028042

【目的】CPP基因家族在真核生物中广泛存在,对植物的生长发育起到重要的作用。从高粱基因组中鉴定CPP基因家族成员并分析其表达特征,为高粱CPP基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】通过生物信息学技术的方法对高粱CPP基因... 详细信息

【目的】CPP基因家族在真核生物中广泛存在,对植物的生长发育起到重要的作用。从高粱基因组中鉴定CPP基因家族成员并分析其表达特征,为高粱CPP基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】通过生物信息学技术的方法对高粱CPP基因家族进行序列分析,并联合转录组和RT-qPCR技术分析SbCPP在高粱不同组织及盐碱胁迫下的表达情况。【结果】高粱中共鉴定到8个SbCPP基因,不均匀地分布在7条染色体上,家族各成员间具有相似的基因结构及蛋白理化性质;结合进化树分析与共线性分析结果表明,SbCPP基因与水稻存在密切亲缘关系,且共存在6对同源基因;启动子分析发现,SbCPP基因启动子含有光响应、激素响应、应激响应等元件。转录组数据分析结果表明,SbCPP基因可能参与高粱响应盐碱胁迫的调控过程。通过实时荧光定量PCR发现,SbCPP基因在高粱盐碱胁迫中广泛表达,但家族成员在不同时期中的表达模式存在差异,SbCPP01、SbCPP04在12 h表达较高,SbCPP02在6 h表达较高,SbCPP03在1 h表达量较高,上述基因表达显著。【结论】在高粱中获得了8个CPP基因,其中SbCPP01、SbCPP02、SbCPP04基因在盐碱胁迫处理下呈现高表达,表明这些基因在高粱抵御盐碱胁迫中发挥重要作用。

关键词：高粱 CPP基因生物信息学 RT-qPCR 表达模式分析

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彩色马铃薯花青素合成相关ERF基因筛选及表达分析

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生物技术通报 2024年第9期40卷 82-91页

作者：吴娟武小娟王沛捷谢锐聂虎帅李楠马艳红内蒙古农业大学农学院呼和浩特010019 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010010

【目的】乙烯响应因子(ethylene responsive factor,ERF)是一类重要的转录因子,参与调控植物花青素的生物合成。筛选可能参与调控马铃薯块茎花青素合成的StERFs基因,为开展彩色马铃薯花青素相关StERFs基因功能研究奠定基础。【方法】利... 详细信息

【目的】乙烯响应因子(ethylene responsive factor,ERF)是一类重要的转录因子,参与调控植物花青素的生物合成。筛选可能参与调控马铃薯块茎花青素合成的StERFs基因,为开展彩色马铃薯花青素相关StERFs基因功能研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系、蛋白质二级结构、启动子顺式作用元件及蛋白互作关系进行分析,同时采用RT-qPCR方法对不同颜色马铃薯薯肉中StERFs进行表达模式分析。【结果】基于不同颜色马铃薯块茎的转录组表达谱,获得7个差异表达ERF转录因子。7个StERFs属于亲水性蛋白,均预测定位于细胞核。Motif 1(RWLG)和Motif 2(YRG)是7个StERFs中共同的保守基序,属于AP2的结构域特征序列。StERFs基因启动子序列含有响应激素作用元件,以及响应防御与胁迫、低温和光照等的顺式作用元件。7个StERFs在紫色薯肉中表达量显著高于黄色薯肉,其中StERF72和StERF110与已知的花青素相关ERFs(IbERF71和PyERF3)亲缘关系较近,且7个StERFs与56个转录因子存在蛋白互作关系。【结论】7个StERFs基因可能参与调控马铃薯块茎中花青素的合成,其中StERF72和StERF110可作为候选基因进一步验证其功能。

关键词：彩色马铃薯花青素 ERF转录因子生物信息学分析表达模式分析

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水稻IDD基因家族的全基因组鉴定及综合分析

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中国水稻科学 2024年第6期38卷 638-652页

作者：钟智慧秦璐黎志力杨珍贺晓鹏蔡怡聪江西农业大学农学院/作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室南昌330045

[目的]明确植物特异转录因子Os IDD基因家族成员特征特性,验证其表达模式,为深入研究水稻IDD基因家族生物学功能奠定基础。[方法]通过Pfam鉴定与明确水稻IDD家族成员,对其核酸与蛋白序列特征、蛋白结构、系统发育与共线性、启动子元件... 详细信息

[目的]明确植物特异转录因子Os IDD基因家族成员特征特性,验证其表达模式,为深入研究水稻IDD基因家族生物学功能奠定基础。[方法]通过Pfam鉴定与明确水稻IDD家族成员,对其核酸与蛋白序列特征、蛋白结构、系统发育与共线性、启动子元件进行综合分析;通过RT-PCR技术验证OsIDD基因在各组织、不同激素处理及不同非生物胁迫下的表达模式。[结果]发现Os IDD家族具有15个成员,为3个亚家族,在染色体上呈不均匀分布,N端均具有核定位信号及高度保守的ID结构域。多重序列比对及motif分析表明其在各个类型中相对保守,与玉米IDD基因家族共线性分析表明两个物种间具有高度同源性。芯片及RT-PCR分析发现Os IDD主要在穗及发育胚乳中表达量较高,其启动子序列均包含激素/胁迫响应顺式元件。[结论]本研究对15个OsIDD成员进行了综合分析,Os IDD结构保守,与Zm IDD共线性强,主要在穗及发育胚乳组织中高表达,可能参与不同激素及多种非生物逆境胁迫响应过程。

关键词：水稻 IDD基因家族综合分析表达模式分析

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金钗石斛bHLH转录因子家族全基因组鉴定及表达分析

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生物技术通报 2024年第6期40卷 203-218页

作者：王健杨莎孙庆文陈宏宇杨涛黄园贵州中医药大学药学院贵阳550025 贵州省中药民族药材种质资源保存及评价工程研究中心贵阳550025

【目的】bHLH转录因子广泛存在于植物中,是调控植物生长发育和响应逆境胁迫的重要转录因子家族之一。从金钗石斛全基因组中鉴定DnbHLHs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究DnbHLHs转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】利用... 详细信息

【目的】bHLH转录因子广泛存在于植物中,是调控植物生长发育和响应逆境胁迫的重要转录因子家族之一。从金钗石斛全基因组中鉴定DnbHLHs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究DnbHLHs转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法从金钗石斛全基因组中鉴定出bHLH转录因子家族成员,并对其理化特征、系统进化关系、基因结构、染色体定位和启动子顺式作用元件等进行分析,利用转录组数据和RT-qPCR分析DnbHLHs转录因子的组织表达模式和不同非生物胁迫下的表达规律。【结果】在金钗石斛中共鉴定出137个bHLH转录因子,DnbHLHs蛋白的氨基酸数量为85-1260,分子量为9855.23-140024.19 Da,等电点为4.52-10.66,不稳定系数为31.94-87.42,脂溶指数为56.66-106.06,亲水指数为-0.815-0.185。DnbHLHs分布于金钗石斛的19条染色体上,都存在bHLH结构域,与拟南芥的bHLH同源,且组内、种间存在着共线性关系。基因表达模式分析显示,DnbHLHs家族成员存在组织表达特异性,且DnbHLH26和DnbHLH33对多种逆境胁迫有响应。【结论】从金钗石斛全基因组中鉴定出137个DnbHLHs转录因子家族成员,该家族成员的理化性质和保守基序存在特异性和多样性的特征,不同DnbHLHs转录因子之间具有组织表达差异性,且DnbHLH26主要受高盐和高温胁迫的诱导,DnbHLH33主要受高盐、高温和低温胁迫的诱导。

关键词：金钗石斛转录因子 bHLH 生物信息学表达模式分析

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大豆抗花叶病毒病基因GmRHF1的克隆及功能分析

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中国农业科学 2024年第23期57卷 4632-4645页

作者：冯雯蜜周芳雪于哲牟可欣井妍李海燕海南大学热带农林学院/南繁学院(三亚南繁研究院)

【目的】大豆花叶病毒（soybean mosaic virus,SMV）引起的大豆花叶病毒病严重制约着大豆的产量和品质，通过序列变异分析、病毒诱导的基因沉默（virus induced gene silencing,VIGS）等技术验证了大豆RING-H2型锌指蛋白基因GmRHF1的抗... 详细信息

【目的】大豆花叶病毒（soybean mosaic virus,SMV）引起的大豆花叶病毒病严重制约着大豆的产量和品质，通过序列变异分析、病毒诱导的基因沉默（virus induced gene silencing,VIGS）等技术验证了大豆RING-H2型锌指蛋白基因GmRHF1的抗病功能，利用酵母双杂交试验和荧光素酶互补试验筛选并验证其互作蛋白，为深入探究GmRHF1的抗SMV作用机制奠定基础。【方法】首先，从大豆品种徐豆14（高抗SMV）和石山黑豆（高感SMV）中分别克隆GmRHF1，并在代表性抗、感种质资源中分析序列变异的一致性，挖掘基因抗病优异变异。其次，利用荧光定量PCR分析基因在不同组织的表达量差异及SMV处理下基因的表达量变化趋势；同时，采用病毒诱导的基因瞬时沉默技术验证GmRHF1的抗SMV功能。通过酵母cDNA文库筛选、酵母对点验证和荧光素酶互补试验筛选并验证GmRHF1的互作蛋白。最后，利用病毒诱导的基因瞬时沉默技术验证GmClpP6的抗SMV功能，明确GmRHF1与GmClpP6互作对大豆抗SMV的生物学意义。【结果】GmRHF1具有E3泛素蛋白连接酶家族RING-H2型保守结构域，属于典型的RING-H2 finger家族成员。序列变异分析发现GmRHF1具有一个自然存在的非同义突变，可能与SMV抗感性相关。荧光定量PCR显示，病毒诱导后，GmRHF1在抗病材料中的表达量水平显著高于感病大豆。病毒诱导的基因沉默试验显示，有效沉默GmRHF1大豆的叶片降低了大豆对SMV的抗病性，说明GmRHF1具有抗SMV功能。通过酵母cDNA文库，筛选到30个GmRHF1的潜在互作蛋白，利用酵母对点验证和荧光素酶互补试验，证实GmRHF1与GmClpP6间的互作关系。同时，病毒诱导的基因瞬时沉默试验表明，在有效沉默GmClpP6的植株叶片中，大豆对SMV的抗病性减弱。【结论】大豆GmRHF1在编码区序列中存在的非同义突变可能与SMV抗感性相关；GmRHF1可与GmClpP6发生相互作用。GmRHF1在SMV抗性反应中具有重要作用。

关键词：大豆花叶病毒锌指蛋白表达模式分析酵母文库筛选荧光素酶互补试验

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油茶SWEET基因家族的全基因组鉴定及表达分析

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生物技术通报 2024年第5期40卷 179-190页

作者：杜兵帅邹昕蕙王子豪张馨元曹一博张凌云林木资源高效生产全国重点实验室森林培育与保护教育部重点实验室北京林业大学林学院北京100083

【目的】挖掘参与油茶糖代谢及逆境响应的糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)。【方法】利用生物信息学方法分析油茶SWEETs家族的基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系、启动子区顺式作用元... 详细信息

【目的】挖掘参与油茶糖代谢及逆境响应的糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)。【方法】利用生物信息学方法分析油茶SWEETs家族的基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系、启动子区顺式作用元件及上游调控因子等,并利用RT-qPCR分析CoSWEETs在不同时期、不同组织及不同逆境胁迫下的基因表达情况。【结果】从油茶中鉴定得到14个CoSWEETs基因,不均匀分布于10条染色体上,不同成员间内含子-外显子数目存在差异。根据系统进化关系,14个CoSWEETs可分为 4个分支,均具有1-2个MtN3 保守结构域,同一分支具有相似的基因结构和基序。根据启动子顺式作用元件和上游转录因子预测的分析结果,CoSWEETs启动子中含有多个与生长发育、植物激素和应激相关的调节元件,其表达可能受到ERF、DOF、BBR-BPC、MYB等转录因子的调控。RT-qPCR分析表明大部分CoSWEETs成员在果实和根中高表达,在种子中的表达水平与发育时期相关,并根据低温、高盐和干旱等非生物胁迫下CoSWEETs的表达模式挖掘出CoSWEET1、CoSWEET2、CoSWEET17等响应油茶低温、干旱或高盐胁迫的基因。【结论】CoSWEET基因的表达受到多种激素及转录因子调控,并在油茶种子发育与逆境胁迫响应中发挥重要作用。

关键词：油茶 SWEET 蛋白结构表达模式分析非生物胁迫

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斜带石斑鱼TLR13基因的克隆及其表达模式分析

斜带石斑鱼TLR13基因的克隆及其表达模式分析

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第五届“全国石斑鱼类繁育与养殖产业化”论坛

作者：梁瑶思卢丹琪丁旭王宇林浩然中山大学生命科学大学院水生经济动物研究所广东省广州市510275 海南大学海洋学院海南省海口市570228 中山大学生命科学大学院水生经济动物研究所广东省广州市510275 海南大学海洋学院海南省海口市570228

Toll样受体(TLR)是重要的天然免疫受体,能够参与识别多种病原相关分子模式,并激活免疫下游通路,在机体抵抗病原侵入中,起着重要的作用.TLR13在小鼠中被发现参与细菌应答,并通过髓样分化因子(MyD88)依赖途径激活下游的免疫通路.但是目前... 详细信息

Toll样受体(TLR)是重要的天然免疫受体,能够参与识别多种病原相关分子模式,并激活免疫下游通路,在机体抵抗病原侵入中,起着重要的作用.TLR13在小鼠中被发现参与细菌应答,并通过髓样分化因子(MyD88)依赖途径激活下游的免疫通路.但是目前对于硬骨鱼类的TLR13仍然知之甚少.本文希望通过实验初步了解硬骨鱼类中TLR 13的结构特点,基因表达模式,为完善鱼类免疫系统的抗病应答机制提供新的科学依据.本文的研究内容主要分为以下几个部分：首先,通过同源克隆方法所获得的斜带石斑鱼TLR13基因全长cDNA序列为3559 bp,其中开放阅读框长2844 bp,共编码947个氨基酸残基;其次,对斜带石斑鱼TLR13编码的氨基酸序列进行分析后发现,其包含一段信号肽序列,14个LRR结构域,以及一个典型的TIR结构域和一个跨膜结构域,具有典型的TLR家族蛋白的结构特点.针对TLR13的TIR结构域进行氨基酸同源性分析则发现,其TIR结构域较为保守.而进化树分析显示,斜带石斑鱼的TLR13与鱼类的TLR22,小鼠的TLR13都具有较近的亲缘关系.最后,对TLR13 mRNA在健康斜带石斑鱼内的表达模式研究发现,除了在胸腺、脾脏、后肾等免疫相关器官有较高的表达外,在脑区也有很高的表达量.

关键词：斜带石斑鱼 TLR13 表达模式分析

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