检索结果-内蒙古大学图书馆

中草药 2023年第11期54卷 3639-3646页

作者：徐瑶任宏伟张馨方王芳朱丹谭玲玲袁涛高婷青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室山东青岛266109 青岛农业大学建筑工程学院山东青岛266109

目的筛选得到珊瑚菜Glehnia littoralis抗盐相关基因GlRTH,并进行开放阅读框(open reading frame,ORF)全长克隆以及生物信息学和表达量分析。方法从珊瑚菜转录组数据中筛选到GlRTH基因,通过反转录聚合酶链反应(reverse transcription-po... 详细信息

目的筛选得到珊瑚菜Glehnia littoralis抗盐相关基因GlRTH,并进行开放阅读框(open reading frame,ORF)全长克隆以及生物信息学和表达量分析。方法从珊瑚菜转录组数据中筛选到GlRTH基因,通过反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)以及c DNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)获得该基因全长ORF序列,利用生物信息学分析方法分析其所编码蛋白质的理化性质,预测该蛋白二、三级结构、保守结构域,建立系统发育进化树;利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法检测该基因组织表达特异性及其在NaCl和1-氨基环丙烷羧酸(1-aminocyclopropanecarboxylic acid,ACC)处理下的表达差异。结果GlRTH基因序列全长ORF为690bp,共编码229个氨基酸。系统进化分析表明,珊瑚菜的RTH蛋白与黄胡萝卜***的RTH蛋白亲缘关系最近,相似度达88.65%;qRT-PCR结果显示,GlRTH基因在珊瑚菜的根、叶、花中均有表达,在花中表达量较高,叶和根中无显著差异;200 mmol/L的NaCl处理3、6、12、24、36 h,GlRTH基因表达量明显上调,且处理36 h后GlRTH基因表达量上调最为显著;100 mmol/L ACC处理,GlRTH基因的表达量呈先上升再下降的趋势,在3 h时GlRTH基因表达量显著上调,在6 h和12 h时GlRTH基因表达量下调。结论GlRTH蛋白是乙烯响应因子,并且与珊瑚菜的耐盐性相关。为探究乙烯信号通路和药用植物抗盐反应的关系及改良珊瑚菜的耐盐能力奠定了基础。

关键词：珊瑚菜 GlRTH基因表达量分析 qRT-PCR 生物信息学分析

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金龙胆草查尔酮合酶基因(CHS)的克隆及其在花期不同组织的表达量分析

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农业生物技术学报 2014年第6期22卷 703-711页

作者：刘姗孙蓉唐自钟郑天润高静雷陈惠李成磊四川农业大学生命科学与理学院攀枝花学院生物与化学工程学院干热河谷特色生物资源研发四川省高校重点实验室

查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是植物类黄酮化合物合成的第一关键酶。为了获得金龙胆草(Conyza blinii Lévl.)CHS基因,本研究采用快速扩增cDNA末端(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆得到了金龙胆草CHS基因的DN... 详细信息

查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是植物类黄酮化合物合成的第一关键酶。为了获得金龙胆草(Conyza blinii Lévl.)CHS基因,本研究采用快速扩增cDNA末端(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆得到了金龙胆草CHS基因的DNA和cDNA全长序列,并进行生物信息学分析,通过RTPCR检测该基因在花期不同组织部位中的表达情况并检测对应部位的相对花青素含量。结果表明,获得的CHS基因DNA全长2 098 bp,包括2个内含子;cDNA全长为1 692 bp,含有完整开放阅读框(1 197 bp),编码399个氨基酸,包含查尔酮合酶的标志性序列,命名为CbCHS(GenBank登录号:KJ155749)。序列比对结果显示,金龙胆草CbCHS基因与已报道的其它植物的CHS氨基酸序列具有很高相似性(最高为95%)。半定量RT-PCR结果显示,在叶和茎的表达量最高,相对表达量分别达到87.03%和98.33%,表达量之间没有显著差异(P>0.05);在根中CbCHS基因表达量最少,相对表达量仅为9.43%,表达量与其余部位具有显著差异(P<0.05)。花青素含量也以茎和叶中最高,根中微量,表明CbCHS基因与花青素的蓄积有一定相关性。本研究首次克隆了金龙胆草CbCHS基因的全长DNA及cDNA序列,研究了其在花期不同组织器官中的表达量差异及与花青素的含量关系,为进一步研究CbCHS基因对金龙胆草黄酮含量的影响及其调控机制提供了基础资料。

关键词：金龙胆草查尔酮合酶(CHS) 克隆生物信息学分析表达量分析

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BMP2和BMP4基因在草原红牛睾丸组织中的表达量分析

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中国兽医学报 2016年第4期36卷 661-664页

作者：秦立红张国梁吴健李旭刘基伟王蕾赵玉民赵志辉吉林省农业科学院畜牧分院吉林公主岭136100 吉林大学畜牧兽医学院吉林长春130062

采用实时荧光定量PCR技术检测BMP2和BMP4基因在草原红牛1,12,18,30月龄4个发育阶段睾丸组织中的mRNA表达水平。旨在探讨该基因在草原红牛睾丸不同发育阶段的表达情况。结果表明:BMP2和BMP4基因在所检测的肉牛4个发育阶段睾丸组织中均有... 详细信息

采用实时荧光定量PCR技术检测BMP2和BMP4基因在草原红牛1,12,18,30月龄4个发育阶段睾丸组织中的mRNA表达水平。旨在探讨该基因在草原红牛睾丸不同发育阶段的表达情况。结果表明:BMP2和BMP4基因在所检测的肉牛4个发育阶段睾丸组织中均有表达。BMP4基因1月龄表达量显著低于12,18,30月龄(P<0.05),12月龄表达量最高,随着月龄增加,表达量减少。而BMP2基因在出生阶段表达量最低,但是与其他3个阶段差异不显著(P>0.05),基因表达趋势也是12月龄表达量最高,然后随着月龄增加,表达量减少。

关键词： BMP2基因 BMP4基因草原红牛睾丸组织表达量分析

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蜀宣花牛与荷斯坦牛、娟荷杂交牛HSP70基因多态性及表达量分析

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黑龙江畜牧兽医 2018年第24期 50-53,260页

作者：甘佳付茂忠王巍唐慧冯华方东辉王淮易军四川省畜牧科学研究院成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室成都610066 宣汉县动物疫病预防控制中心四川宣汉636150

为了探索地方牛品种的抗热应激遗传调控分子机制,试验在高湿热环境下测定了蜀宣花牛与荷斯坦牛、娟荷杂交牛的HSP70基因的SNP及表达量。结果表明:在热应激情况下,蜀宣花牛与荷斯坦牛、娟荷杂交牛的体温、血液生化指标出现了显著或极显... 详细信息

为了探索地方牛品种的抗热应激遗传调控分子机制,试验在高湿热环境下测定了蜀宣花牛与荷斯坦牛、娟荷杂交牛的HSP70基因的SNP及表达量。结果表明:在热应激情况下,蜀宣花牛与荷斯坦牛、娟荷杂交牛的体温、血液生化指标出现了显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01);HSP70基因共检测到3个SNP位点,均为无义突变;在高温高湿条件下,蜀宣花牛HSP70基因的表达量极显著高于荷斯坦牛和娟荷杂交牛(P<0.01)。说明地方品种牛在遗传背景上较荷斯坦牛具有更好的适应高湿热环境的能力。

关键词：蜀宣花牛热应激 HSP70基因 SNP 表达量分析

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灰飞虱（Laodelphax striatellus）谷胱甘肽-S-转移酶基因的分子克隆及表达量分析

灰飞虱（Laodelphax striatellus）谷胱甘肽-S-转移酶基因的分子...

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作者：尤福洋南京农业大学

学位级别：硕士

灰飞虱Laodelphax striatellus(Fallen)是我国重要的水稻害虫,在刺吸水稻等禾本科植物的同时,还能传播多种植物病毒病,严重影响我国水稻的产量。谷胱甘肽-S-转移酶(Glutathione S-transferases,GSTs)是一种多功能的超家族酶系。GSTs被... 详细信息

灰飞虱Laodelphax striatellus(Fallen)是我国重要的水稻害虫,在刺吸水稻等禾本科植物的同时,还能传播多种植物病毒病,严重影响我国水稻的产量。谷胱甘肽-S-转移酶(Glutathione S-transferases,GSTs)是一种多功能的超家族酶系。GSTs被认为在昆虫体内行使杀虫剂解毒代谢的功能,与昆虫的抗药性形成紧密相关。因此,本文利用灰飞虱转录组数据,搜索并克隆了灰飞虱谷胱甘肽-S-转移酶基因序列,通过荧光定量PCR技术对三种灰飞虱抗性品系中的谷胱甘肽-S-转移酶基因进行了表达分析,筛选出可能参与杀虫剂解毒代谢的灰飞虱谷胱甘肽-S--转移酶。研究结果总结如下:1、灰飞虱谷胱甘肽-S-转移酶基因的分子克隆和序列分析通过本地Blast的方法搜索灰飞虱转录组数据,获得了19条谷胱甘肽-S-转移酶基因序列,去除2条冗余序列,剩余的17条序列中9条是已发表的灰飞虱GST基因,另外8条是新发现的灰飞虱GSTs。上述新发现的8条序列通过PCR克隆和验证后,分别命名为 LsGSTd2、LsGSTo2、LsGSTo3、LsGSTz2、LsGSTm1、LsGSTm2、LsGSTm3和 LsGSTm4。其中,LsGSTd2、LsGSTz2、LsGSTm1、LsGSTm2、LsGSTm3 和 LsGSTm4基因序列完整,而LsGSTo2和LsGSTo3基因的3'端缺失。利用3'RACE技术克隆了LsGSTo 和LsGSTo3基因的3'端序列,并验证了它们的全长。LsGSTo2全长为1158 bp,开放阅读框1119 bp,编码372个氨基酸;LsGSTo3全长为648bp,开放阅读框636bp,编码211个氨基酸。综合已知的9条灰飞虱GST基因和本次新发现的8条GSTs,通过系统发育分析,发现这17条灰飞虱GST基因中:Delta亚家族有2个,Epsilon亚家族有1个,Omega亚家族有3个,Sigma亚家族有3个,Theta亚家族有1个,Zeta亚家族有2个,Microsomal亚家族有5个。2、谷耽甘肽-S-转移酶在三个灰飞虱抗性品系中的表达量分析为了筛选出灰飞虱体内参与杀虫剂解毒代谢的谷胱甘肽-S-转移酶,利用定量PCR技术检测了在三个灰飞虱抗性品系(吡虫淋抗性品系、毒死蜱抗性品系和溴氰菊酯抗性品系)中,新克隆的8个GSTs基因和文献中已报道的9条GSTs基因的表达情况。结果表明:在抗吡虫啉的灰飞虱品系中LsGSTd2、LsGSTm1、LsGSTo2、LsGSTe1和LsGSTz1基因的表达量显著高于敏感品系,而LsGSTm4基因表达量显著下调为敏感品系的0.3倍;在抗毒死蜱的灰飞虱品系中LsGSTo2的表达量显著高于敏感品系,而LsGSTm4基因表达量下调为敏感品系的0.5倍;在抗溴氰菊酯的灰飞虱品系中LsGSTd2、LsGSTo2、LsGSTs1、LsGSTe1和LsGSTz1基因表达量明显上调。从以上研究结果可以发现:在灰飞虱抗性品系中上调表达的基因除了有Delta亚家族中的LsGSTd2和 Epsilon 亚家族中的 LsGSTe1外,还有 Omega、Sigma、Zeta 和 Microsomal亚家族的GSTs基因。综上所述,本研究通过对GST基因的克隆和表达量的分析,筛选出了可能参与杀虫剂解毒代谢的GSTs,为进一步研究GST在杀虫剂解毒代谢中的功能奠定了坚实的基础。

关键词：灰飞虱谷胱甘肽-S-转移酶基因克隆表达量分析

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亚致死浓度甲维盐胁迫对甜菜夜蛾幼虫解毒酶系活力及其相关基因表达量的影响

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棉花学报 2015年第2期27卷 149-158页

作者：戴瀚洋孙洋柏立新赵静肖留斌谭永安江苏省农业科学院植物保护研究所南京210014 南京农业大学植物保护学院南京210095

为明晰几种重要解毒酶在甜菜夜蛾针对甲维盐抗性形成过程中的可能作用,本文研究分析了甲维盐处理后甜菜夜蛾幼虫体内主要解毒酶活力及其对应基因表达量的变化趋势。结果表明,在甲维盐(剂量为:LC5、LC20、LC50)胁迫72 h后,甜菜夜蛾体内... 详细信息

为明晰几种重要解毒酶在甜菜夜蛾针对甲维盐抗性形成过程中的可能作用,本文研究分析了甲维盐处理后甜菜夜蛾幼虫体内主要解毒酶活力及其对应基因表达量的变化趋势。结果表明,在甲维盐(剂量为:LC5、LC20、LC50)胁迫72 h后,甜菜夜蛾体内多功能氧化酶(MFO)比活力及Se CYP450表达量均较对照极显著上升(P<0.01),且二者均随着处理浓度的增大而先上升后下降。同时,谷胱甘肽S-转移酶(GST)的比活力也呈现出相同的变化趋势。而Se GSTs与Se GSTs1在胁迫后的表达趋势与GST比活力的并不一致,Se GSTs表达量随着处理浓度的上升而极显著升高(P<0.01),而Se GSTs1则随着处理浓度的上升而下降。在3个亚致死浓度甲维盐处理下,酯酶(EST)比活力均被显著抑制(P<0.05),同样的趋势也反映在Se Car E表达量的显著变化上(P<0.05)。此外,MFO、EST的比活力变化趋势与其对应基因Se CYP450、Se Car E表达谱之间存在极显著相关性(P<0.01);而GST活力只与Se GSTs表达量具有极显著相关性(P<0.01),与Se GSTs1表达量之间则不存在显著相关性。因此,MFO、GST及其相关基因Se CYP450、Se GSTs、Se GSTs1有可能参与到甜菜夜蛾对甲维盐抗药性的演化过程中。

关键词：甜菜夜蛾甲维盐酶活表达量分析杀虫剂胁迫

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金柑果皮油胞特性和相关调控基因表达量的研究

金柑果皮油胞特性和相关调控基因表达量的研究

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作者：高兴广西大学

学位级别：硕士

金柑果实是柑橘类水果中可以带皮食用的果实,其果皮油胞的大小、数量、内含物等直接影响食用品质。因此,本试验以金柑油胞为出发点,以油胞较多的普通品种融安金柑、油胞较少的芽变品种滑皮金柑、油胞最少的芽变品种脆蜜金柑为试材,研究... 详细信息

金柑果实是柑橘类水果中可以带皮食用的果实,其果皮油胞的大小、数量、内含物等直接影响食用品质。因此,本试验以金柑油胞为出发点,以油胞较多的普通品种融安金柑、油胞较少的芽变品种滑皮金柑、油胞最少的芽变品种脆蜜金柑为试材,研究三个品种间果实品质,油胞大小、数量差异；并对三个品种果实果皮转录组测序,通过差异基因分析油胞形成的相关调控基因；再用测定参选基因在各个时期的表达量,分析这些基因在果实发育过程中的不同表达,预测这些基因与油胞发育过程的关系；旨在为应用基因工程培育油胞精油含量较少的优质金柑提供理论依据。1.脆蜜金柑、融安金柑、滑皮金柑三个品种之间,果皮油胞数量从果实生长初期则已表现出来。随着果实的成熟,果皮油胞密度则略有下降。单位果皮面积内油胞含量最多的是融安金柑、滑皮金柑次之、脆蜜金柑最少。融安金柑和滑皮金柑果实赤道部密度最小,果实顶部密度最大。2.脆蜜金柑呈现出果大、果重、油胞含量少、可食率高、果汁率高、可溶性固形物含量高、蔗糖含量高、总糖含量高、含酸量低的优点,在口感上呈现出辛辣味小、皮脆、汁多、肉厚、甜蜜少酸的特点。3.对三个金柑品种进行转录组测序,共获得36093条基因。将获得的基因与蛋白质数据库进行比对,对其功能进行注释和分类。比对到NR数据库的基因有20973条,占总基因数的58.11%；在GO得到功能注释和预测的基因有20973条,占组装转录本的58.11%。4.36093条基因在融安金柑(对照组)、滑皮金柑、脆蜜金柑三个转录组文库中进行表达量差异比较分析,获得8113个差异表达基因DEGs。6融安金柑和滑皮金柑比较,有DEGs1417个上调表达,277个下调表达。融安金柑和脆蜜金柑比较,有DEGs3134个,1514个下调。滑皮金柑和脆蜜金柑比较,有DEGs757个上调表达,1014个下调表达。5.8113个DEGs进行GO显著富集分析,融安金柑和滑皮金柑比较、融安金柑和脆蜜金柑比较、滑皮金柑和脆蜜金柑比较分别有12个、28个、22个显著性富集的GO term。6.通过与NR库比对,200条基因编码了超过46种不同类别的转录因子,参与烯类等物质调控有关的AP2/ERF和WRKY转录因子,在融安金柑和滑皮金柑比较中有AP2/ERF转录因子4个；在融安金柑和脆蜜金柑比较中,WRKY转录因子26个,在滑皮金柑和脆蜜金柑比较中,有WRKY转录因子18个。7.筛选获得135条DEGs可能编码油胞精油成分烯萜类、酮类物质的5条调控酶基因和5条转录因子。预测金柑油胞相关物质的控制基因可能是在类黄酮生物合成途径中,控制柚皮素-3-双加氧酶促进柚皮素、二氢槲皮素等物质合成的酶基因Unigene0008513和调控新薄荷醇脱氢酶促进薄荷醇合成的Unigene0000766酶基因。

关键词：脆蜜金柑油胞高通量测序表达量分析

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拟南芥钙依赖蛋白激酶参与植物激素信号转导(英文)

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植物生理与分子生物学学报 2007年第3期33卷 227-234页

作者：袁昕邓克勤赵小英伍贤进秦玉芝唐冬英刘选明湖南大学生命科学与技术研究院生物能源与材料研究中心长沙410082 怀化学院生物工程系怀化418000

在植物信号通路中,涉及到钙应答的蛋白激酶大多是钙依赖蛋白激酶。钙依赖蛋白激酶作为钙信号转导因子,参与了包括激素信号转导途径在内的很多传递过程。本工作在前人研究的基础上,对拟南芥AtCPK30基因的功能进行了深入的研究。RT-PCR分... 详细信息

在植物信号通路中,涉及到钙应答的蛋白激酶大多是钙依赖蛋白激酶。钙依赖蛋白激酶作为钙信号转导因子,参与了包括激素信号转导途径在内的很多传递过程。本工作在前人研究的基础上,对拟南芥AtCPK30基因的功能进行了深入的研究。RT-PCR分析结果表明:AtCPK30在植物根中的表达量很高,其在幼苗中的转录水平分别受ABA、IAA、2,4-D、GA_3和6-BA等激素的诱导调节。AtCPK30基因过表达的转基因株系幼苗的主根比野生型的长,同时发现转基因植株幼苗的根在缺钙的MS培养基上生长较野生型植株长,表明缺钙对转基因幼苗影响较小。用ABA、IAA、GA_3和BA处理时,转基因植株幼苗的根对激素更敏感。当野生型和转基因植株生长在含有生长素抑制剂NPA的MS培养基上时,NPA对转基因植株侧根的抑制比对野生型弱。GFP-CPK30融合蛋白的亚细胞定位研究结果表明:CPK30蛋白定位在细胞壁和细胞膜上。这些研究结果说明了AtCPK30作为钙信号转导因子,参与了多种激素调节植物根生长的过程。

关键词：拟南芥蛋白激酶激素钙根表达量分析

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鸭茅TCP基因家族成员鉴定及表达分析

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草地学报 2024年第6期32卷 1682-1692页

作者：骆金婵靳雅荣杨煜琛祝鑫贾纪原王小珊黄琳凯四川农业大学草业科技学院四川成都611130

TCP转录因子家族在叶片发育中发挥重要作用,鸭茅是世界著名的多年生禾本科牧草,叶片是其主要的收获部位,且营养价值丰富。本研究鉴定了鸭茅(Dactylis glomerata)TCP基因家族成员,并对所有成员进行了理化性质、基因结构、染色体定位、进... 详细信息

TCP转录因子家族在叶片发育中发挥重要作用,鸭茅是世界著名的多年生禾本科牧草,叶片是其主要的收获部位,且营养价值丰富。本研究鉴定了鸭茅(Dactylis glomerata)TCP基因家族成员,并对所有成员进行了理化性质、基因结构、染色体定位、进化关系、保守基序和结构域、启动子顺式作用元件以及表达量等分析。发现鸭茅TCP基因家族共有22个成员被划分成3个亚家族;它们都含有TCP蛋白典型结构域;成员间蛋白的亲水性较好,等电点和相对分子质量有差异;α螺旋和无规则卷曲是鸭茅TCP蛋白主要的二级结构,亚细胞定位预测主要定位于细胞核;22个成员的启动子顺式作用元件可分为4类,分别是光响应元件、植物激素响应元件、抗病创伤胁迫响应元件以及其他元件;此外,DgTCP8和DgTCP20在叶片中的表达量较高且可响应生长素和赤霉素的表达。本文为深入探究鸭茅TCP基因在叶片发育中的功能提供依据,为叶片优良鸭茅品种的选育奠定基础。

关键词：鸭茅 TCP 基因家族表达量分析叶片发育

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三角梅黄烷酮3-羟化酶基因的克隆及表达分析

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生物技术通报 2022年第11期38卷 122-128页

作者：孙蓉刘姗高静雷攀枝花学院生物与化学工程学院攀枝花617000

为探究三角梅产生飞燕草素的可能性,根据前期获得的三角梅转录组数据,克隆花青素合成途径关键酶黄烷酮3-羟化酶基因(flavanone 3-hydroxylase,F3H),并通过荧光定量PCR技术检测其在不同颜色三角梅叶片及苞片中的表达量差异。结果显示成... 详细信息

为探究三角梅产生飞燕草素的可能性,根据前期获得的三角梅转录组数据,克隆花青素合成途径关键酶黄烷酮3-羟化酶基因(flavanone 3-hydroxylase,F3H),并通过荧光定量PCR技术检测其在不同颜色三角梅叶片及苞片中的表达量差异。结果显示成功克隆获得了一条cDNA全长1 089 bp,编码363个氨基酸的基因序列,将其命名为BsF3H,登陆GeneBank(OL957093)。BsF3H相对分子质量为41.14 kD,理论等电点为5.48,含有2OG-FeⅡ_Oxy加氧酶结构域,不具有信号肽及跨膜结构,细胞定位于细胞质中,最多的二级结构为α螺旋,三级结构预测显示为单体蛋白。RT-qPCR结果显示该基因在不同颜色三角梅中表达量均不高,相对而言在紫色安格斯(Elizabeth Angus)苞片中表达量最高。研究结果表明三角梅具有产生各类花青素的潜力,可利用基因工程手段对其颜色进行改造。

关键词：三角梅黄烷酮3-羟化酶生物信息学表达量分析

来源：评论

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