检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：徐健沈阳农业大学

学位级别：硕士

西伯利亚杏(Armeniaca sibirica)是我国北方地区重要的生态经济树种,其种仁富含油脂,可用于高级食用油和生物柴油,有重要的经济价值,提高山杏种仁油脂含量是重要的研究课题之一。本研究以西伯利亚杏种仁五个不同发育时期转录组和西伯利... 详细信息

西伯利亚杏(Armeniaca sibirica)是我国北方地区重要的生态经济树种,其种仁富含油脂,可用于高级食用油和生物柴油,有重要的经济价值,提高山杏种仁油脂含量是重要的研究课题之一。本研究以西伯利亚杏种仁五个不同发育时期转录组和西伯利亚杏基因组为依据,克隆了转录因子AsWRI1和AsLEC2的基因,构建了AsWRI1基因植物表达载体并进行遗传转化。通过对拟南芥转基因株系的表型鉴定和油脂含量测定,验证该转录因子对种仁油脂积累的调控作用。研究结论如下: (1)成功克隆出西伯利亚杏种仁脂肪酸合成相关转录因子基因AsWRI1和AsLEC2,AsWRI1的CDS序列全长1200 bp,编码399个氨基酸,AsLEC2的CDS序列全长1497bp,编码498个氨基酸。通过和拟南芥基因组数据库的比对,发现AsWRI1基因含有2个AP2/EREBP结构域,分别位于AsWRI1基因序列的67-139 bp和168-229 bp,AsWRI1基因编码的转录因子可能属于AP2/EREBP家族。AsLEC2基因含有1个B3结构域,位于AsLEC2基因序列的574-795 bp,与拟南芥LEC2的B3结构域高度吻合。AsLEC2基因编码的转录因子可能属于B3家族。利用DNAMAN软件与拟南芥同源基因进行比对发现AsWRI1和At WRI1二者所编码氨基酸的同源性为51.69%,AsLEC2和At LEC2二者所编码氨基酸的同源性为42.9%。 (2)在西伯利亚杏种仁脂肪酸合成过程中,AsWRI1基因表达量先升高后降低,与脂肪酸合成关键酶基因BCCP1、BCCP2、CT、MAT、KASⅠ-1、KASⅠ-2、KASⅢ、KAR-1、HAD、EAR、FATA的表达趋势相对一致,表明AsWRI1可能参与了西伯利杏种仁脂肪酸合成关键酶的调控。 (3)构建了酵母单杂交表达载体p GBKT7-AsWRI1并转入到Y2H酵母菌株中。通过在缺陷性培养基中添加3-AT以及X-α-gal产生的酵母显色反应,表明AsWRI1具有转录激活活性。 (4)通过蘸花法将AsWRI1基因转入拟南芥中,筛选阳性植株至T3代。转基因株系的根长、株高和种子大小与野生型相比均有增加,AsWRI1在拟南芥果荚开花后20 d表达量高,在叶、花、茎中表达量低;受外源基因AsWRI1的影响,与拟南芥油脂合成相关的14个基因的表达量和表达模式发生了改变,其中FAD2、FAD3、SAD6和TAG1等与油脂相关的关键酶基因表达量较野生型相比均明显上调;转基因拟南芥种子油脂含量比野生型植株显著提高24.31%。

关键词：西伯利亚杏 AsWRI1 AsLEC2 油脂含量表达量分析

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MsFAR1、MsPYL8、MsGATA12基因与紫花苜蓿秋眠相关性研究

MsFAR1、MsPYL8、MsGATA12基因与紫花苜蓿秋眠相关性研究

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作者：罗宽河南农业大学

学位级别：硕士

紫花苜蓿(Medicago sativa L.)的秋眠性是其独有的一种特性,为了研究苜蓿的秋眠性,我们从1级的秋眠型苜蓿和9级的非秋眠型苜蓿的转录组测序中选出了三个可能与紫花苜蓿秋眠性相关的差异基因MsFAR1(FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1)、MsPYL8... 详细信息

紫花苜蓿(Medicago sativa L.)的秋眠性是其独有的一种特性,为了研究苜蓿的秋眠性,我们从1级的秋眠型苜蓿和9级的非秋眠型苜蓿的转录组测序中选出了三个可能与紫花苜蓿秋眠性相关的差异基因MsFAR1(FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1)、MsPYL8(Pyrabactin Resistance Like8)、MsGATA12来进行研究,试图找到各基因在紫花苜蓿中的作用和是否参与调控紫花苜蓿的秋眠。这三个基因目前在紫花苜蓿上尚未有相关的研究报道,而且MsFAR1和MsGATA12两个基因在其他物种上的研究也很少。由于苜蓿的秋眠性是对季节的反映,而且可能在特定组织中起作用,故本试验首先通过荧光定量PCR对紫花苜蓿的生长阶段5月到9月根、茎、叶、顶芽四个不同组织间三个基因的表达量进行分析,然后挑选MsGATA12基因对其可能参与的生物途径探究其功能。结果表明,MsFAR1在紫花苜蓿叶片中表达量最高,而且在5、6、7月时叶片中1级苜蓿MsFAR1表达量都极显著高于9级苜蓿,而8、9月份时9级苜蓿品种表达量极显著高于1级;在5月和6月时1级苜蓿顶芽中表达量高于9级,但差异不显著,然而7、8、9月时9级表达量显著高于1级表达量,而且这种差异随着月份的增加而增加;从MsFAR1在茎中的表达量可以看出,在5、6、7月份时,1级和9级苜蓿茎中MsFAR1的表达量均差异不显著,但是在八月时MsFAR1在1级和9级茎中表达量都极显著提高,随后在9月时下降,其中9级苜蓿MsFAR1表达量恢复到同前几个月一样的水平,差异不显著。推测MsFAR1能在苜蓿感光部位大量合成而且能对外界光周期的变化做出反应。MsPYL8是ABA受体的一种,用外源ABA处理紫花苜蓿幼苗能使MsPYL8表达量上调。对MsPYL8的时空表达分析表明,它能积极的相应外界的干旱环境,极大提高自身的表达量,且在根中表达量>茎中表达量>叶片中表达量,推测在紫花苜蓿中MsPYL8能通过ABA途径对干旱胁迫做出响应,且响应部位是从根中大量表达后经茎运输,然后到叶片中。对MsGATA12的处理结果表明,在一定范围内MsGATA12能被外源GA3上调,且相当敏感;干旱也能使MsGATA12表达量上调,但是相对GA3的响应强度稍弱。冷环境能使MsGATA12表达量下降,继而产生适应性反应而逐渐上升到正常水平;MsGATA12对盐胁迫和外源IAA不敏感,可能MsGATA12不参与盐胁迫和IAA途径。在根中MsGATA12最活跃,表达量最高,但随着根的生长周期延长表达量逐渐下降;MsGATA12在茎表达量只有在8、9月植株秋眠时才发生较明显变化;根和茎中MsGATA12表达量在各个月份1级和9级苜蓿中差异均不显著,而在叶片和顶芽中变化较大,在5月和6月时1级苜蓿品种叶片中MsGATA12表达量极显著高于9级叶片中表达量,随后在7、8、9月时1级和9级MsGATA12表达量差异不显著;1级和9级苜蓿在顶芽中MsGATA12表达量在5、6、7三个月无显著差异,但是到8月和9月时,1级表达量极显著高于9级表达量。说明MsGATA12可能在叶片和顶芽中发挥了重要作用,叶和顶芽是其主要调控部位。本试验还构建了MsGATA12过表达载体,然后通过农杆菌介导法转入紫花苜蓿,成功地获得了转基因苜蓿。

关键词：紫花苜蓿 MsFAR1基因 MsPYL8基因 MsGATA12基因表达量分析光周期胁迫

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甘蓝型油菜高亚麻酸性状的数量遗传和相关基因分析

甘蓝型油菜高亚麻酸性状的数量遗传和相关基因分析

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作者：练景龙西北农林科技大学

学位级别：硕士

增强脂肪酸营养价值是油菜品质改良的主要目标,双低油菜富含的三种主要脂肪酸(油酸、亚油酸、亚麻酸)还可以进一步优化调整。过去认为亚麻酸不饱和键多容易氧化,不利于食用油的储存和烹炸,因此提倡降低亚麻酸的比例;但是近年来发现了亚... 详细信息

增强脂肪酸营养价值是油菜品质改良的主要目标,双低油菜富含的三种主要脂肪酸(油酸、亚油酸、亚麻酸)还可以进一步优化调整。过去认为亚麻酸不饱和键多容易氧化,不利于食用油的储存和烹炸,因此提倡降低亚麻酸的比例;但是近年来发现了亚麻酸对人体的各种重要营养保健作用,提高亚麻酸作为新的育种方向受到重视。本研究对课题组选育的15%-20%的高亚麻酸自然变异品系R8Q10和YH25005等,利用数量遗传分析、亚麻酸合成途径FAD2与FAD3基因克隆、荧光定量表达分析、以及转录组测序等方法,以期明确高亚麻酸油菜种质资源形成的遗传和分子机理,为指导高亚麻酸育种奠定基础。取得主要的结果如下:1.通过高、低亚麻酸材料杂交各世代联合的主基因+多基因遗传分离模型分析,R8Q10×SW、YH25005×SW杂交各世代的亚麻酸的最优遗传模型均为两对加性主基因+加性显性多基因,但多基因的遗传效应大于主基因,说明微效多基因对甘蓝型油菜亚麻酸含量贡献较大,选育高亚麻酸的品种需要聚合微效多基因。2.对于相关基因FAD2、FAD3的分析中,荧光定量表达结果显示高亚麻酸品系的FAD2、FAD3部分拷贝表达量比亚麻酸较低的材料显著上调。克隆测序的部分结果显示,高亚麻酸R8Q10和YH25005的FAD2相比普通油菜JA177没有明显的氨基酸差异。鉴定到部分拷贝的FAD3的内含子和外显子碱基突变和产生的单个氨基酸差异,例如***3.c-R8Q10与***3.c-JA177的CDS对应的第478位由A突变为T,相应的第160位氨基酸由N(天冬酰胺)突变为I(异亮氨酸)。对于***3.b的c DNA测序R8Q10和YH25005分别有2和3个重复都在第814位核苷酸由T突变为C,对应氨基酸第272位由C(半胱氨酸)突变为R(精氨酸)。3.完成高亚麻酸R8Q10、YH25005、低亚麻酸A28、低亚麻酸且高油酸SW授粉后24天种子的转录组测序,共获得84.19Gb Clean Data。转录组结果显示编码FUS3、NF-YC、ABI3等转录因子的基因在R8Q10、YH25005种子中上调,可能是FAD3上调的原因之一。

关键词：高亚麻酸遗传分析基因克隆 FAD2 FAD3 表达量分析转录组分析

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22个香石竹品种干旱胁迫下生理生化特性分析及抗旱性评价

22个香石竹品种干旱胁迫下生理生化特性分析及抗旱性评价

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作者：闫艳丽华中农业大学

学位级别：硕士

干旱是植物优良遗传性状表达的主要限制因素,发掘抗旱种质资源,通过传统及现代分子育种手段培育抗旱品种具有重要意义。本试验以22个香石竹品种为研究对象,根据预实验选用20%PEG6000模拟干旱胁迫进行处理,分析比较叶片RWC、SOD、POD、CA... 详细信息

干旱是植物优良遗传性状表达的主要限制因素,发掘抗旱种质资源,通过传统及现代分子育种手段培育抗旱品种具有重要意义。本试验以22个香石竹品种为研究对象,根据预实验选用20%PEG6000模拟干旱胁迫进行处理,分析比较叶片RWC、SOD、POD、CAT、可溶性蛋白、MDA、Pro等7个理化指标的变化,探讨干旱胁迫下香石竹内在生理响应机制,为22个香石竹品种的抗旱筛选提供理论依据;以这7个理化指标的抗旱指数为基础,对各香石竹品种进行主成分分析及综合评价,并根据D值对香石竹品种进行聚类分析,对香石竹品种进行抗旱鉴定;同时对这22个香石竹品种进行盆栽断水处理,以直接缺水处理的方式进行抗旱鉴定;最后根据综合评价和断水抗旱鉴定的结果筛选出抗旱材料和敏感材料,同时选出4个干旱相关基因,通过半定量RT-PCR的方法,比较分析这4个基因在不同抗旱性香石竹品种中表达量的差异。本研究主要结论如下:1、理化特性分析。随着20%PEG处理时间的延长,22个香石竹品种的相对含水量(RWC)不断降低,其余SOD、POD、CAT、MDA、Pro、可溶性蛋白等6个理化指标均呈现上升趋势,部分材料呈现先上升后下降的趋势;除RWC外,SOD、POD、CAT、MDA、Pro、可溶性蛋白等6个理化指标在第一组BT、DL、CS、SW、CB、SG、PH、DA、TC、SB、DO、FC、RF等13个香石竹品种干旱处理96h时的含量均稍高于第二组FM、MT、VL、PS、MS、TS、FD、RY、PL等9个香石竹品种在处理4d时的含量;对超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)等抗氧化酶研究中发现,第一组(同上)处理96h时SOD、POD发挥了主要作用,而CAT在清除活性氧中的作用相对次要,而第二组(同上)在处理7d时CAT发挥了主要作用,其次为SOD,最弱的为POD;方差分析的结果显示,22个香石竹品种应对胁迫处理的响应存在显著差异。2、主成分分、综合评价及聚类分析。将已完成的生理生化指标测定值作为本阶段数据分析的基础,经分析发现第一组13个香石竹品种的7个理化指标被转换为4个综合指标,第二组9个香石竹品种的7个理化指标被转换为3个综合指标,经计算得出综合评价值D值,对D值进行聚类分析。两组香石竹品种均划分成了三类:第一组分析结果表明:CB、DL、BT为抗旱性较强的品种,DA为抗旱性较弱的品种,其余9个为抗旱性中等的品种,分别为CS、SG、SB、TC、FC、RF、SW、PH、DO等;第二组分析结果表明:MS为抗旱性较强的品种,TS、RY、VL为抗旱性中等的品种,其余5个为抗旱性较弱的品种,分别为MT、PL、FM、PS、FD等。3、断水筛选。根据干旱处理后植物叶片持绿性对两组香石竹进行抗旱鉴定:第一组品种中PS,SW,MS,FC等四个品种的叶片持绿性较高,具有较高的抗旱性,而FM,BT,DL,DA,PH等的叶片持绿性较低,抗旱性较差,PL、DO、TS、FD、MT等5个品种的抗旱性属于中等水平;第二组品种中RY,CB,CS,VL等四个品种的叶片持绿性较高,属于抗旱能力较强的品种,SB、RF、TC、SG等4个品种属于抗旱能力相对较弱的品种。4、DREB2A、P5CS2、CSD1、ERD16等4个基因在干旱处理下抗旱不同的香石竹品种的表达量分析。(1)DREB2A在抗旱性不同的4个品种中均呈现先上升后下降的趋势,4个品种均在干旱处理24h时表达量达到第一个高峰,在48h时表达量略有下降,之后各品种表达量又不断上升;(2)P5CS2在抗旱性强的品种MS和CB中呈现一直上升的趋势,分别在处理72h和96h时表达量达到最大值,在抗旱性弱的品种中呈现先上升后下降的趋势,品种SG和MT分别在处理24h和72h时达到峰值;(3)CSD1在抗旱性强的品种MS和CB中呈现先上升后下降的趋势,分别在处理24h和48h时达到峰值,在抗旱性弱的品种SG和MT中呈现先上升后下降再上升的趋势,分别在干旱处理12h和24h达到第一个峰值,都在72h达到了第二个峰值;(4)ERD16在抗旱性强的品种MS和CB中呈现先上升后下降的趋势,品种MS在处理24h时达到峰值,品种CB先后在干旱处理24h和96h时达到峰值,抗旱性弱的品种MT和SG分别在处理12h和24h时达到第一个峰值,均在处理72h时达到第二个峰值。

关键词：香石竹生理生化抗旱表达量分析

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紫花苜蓿热激蛋白基因MsHSP70的克隆及功能分析

紫花苜蓿热激蛋白基因MsHSP70的克隆及功能分析

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作者：栗振义中国农业科学院

学位级别：硕士

热激蛋白(HSP)是一种具有广泛抗逆作用的保护性蛋白,主要作为分子伴侣在细胞保护、光合作用、遗传繁育和胁迫应激等过程中发挥重要作用。本文分析了紫花苜蓿热激蛋白基因MsHSP70的特性及功能,旨在为苜蓿遗传改良与抗逆品种选育提供理论... 详细信息

热激蛋白(HSP)是一种具有广泛抗逆作用的保护性蛋白,主要作为分子伴侣在细胞保护、光合作用、遗传繁育和胁迫应激等过程中发挥重要作用。本文分析了紫花苜蓿热激蛋白基因MsHSP70的特性及功能,旨在为苜蓿遗传改良与抗逆品种选育提供理论依据。主要实验结果如下:1、利用同源克隆法,从紫花苜蓿克隆了一个全长为2146 bp热激蛋白基因序列,命名为MsHSP70(GenBank accession No:KJ621409)。经生物信息学分析,该基因包含一个2028 bp开放阅读框,可编码675个氨基酸,MsHSP70蛋白分子量为72.33 KDa,蛋白二级结构主要由α螺旋、β折叠组成。多序列比对结果显示MsHSP70与截形苜蓿、豌豆、拟南芥HSP70的相似度分别为:94.47%、89.93%、78.72%。2、通过亚细胞定位分析及在线预测,MsHSP70基因可定位于线粒体,经过进化树分析可将MsHSP70归类到线粒体HSP70家族。成功构建了MsHSP70基因原核表达载体并转入大肠杆菌,在IPTG诱导下在大肠杆菌中大量表达,聚丙烯酰胺凝胶电泳结果表明MsHSP70原核表达蛋白分子量与预测结果一致。3、利用实时荧光定量PCR对MsHSP70基因在苜蓿不同组织和非生物胁迫下的表达模式进行了分析,结果表明,MsHSP70在紫花苜蓿的花中表达量最大,茎和叶次之,根中最少;MsHSP70基因的表达受高温、ABA、H2O2诱导,干旱和盐胁迫下基因表达量没有显著变化。4、构建了植物表达重组载体pCAMBIA1302-MsHSP70,并采用农杆菌介导法转化了拟南芥和紫花苜蓿,经过抗性筛选和分子检测,初步鉴定已获得转MsHSP70基因拟南芥和紫花苜蓿。5、通过对转MsHSP70基因拟南芥中MsHSP70基因表达分析,结果显示MsHSP70基因受ABA、干旱和盐胁迫诱导表达;对T3代转基因拟南芥植株的抗逆性分析显示,与野生型相比,转基因拟南芥在ABA和干旱胁迫下均表现为:丙二醛(MDA)含量较低,脯氨酸含量较高,超氧化物歧化酶(SOD)活性较高,并且在干旱胁迫下转基因拟南芥相对含水量(RWC)高于野生型;在盐胁迫下转基因拟南芥与野生型各项生理指标没有明显差异;对转基因拟南芥苗期生长情况观测发现,在ABA与干旱胁迫下,转基因拟南芥幼苗鲜重与根长均大于野生型,在盐胁迫下差异不显著;综上所述,在转基因拟南芥中,MsHSP70基因在ABA和干旱胁迫调节机制中起重要调控作用。

关键词：紫花苜蓿热激蛋白亚细胞定位表达量分析遗传转化

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水稻DFR基因家族生物信息学分析及转化研究

水稻DFR基因家族生物信息学分析及转化研究

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作者：都晓龙吉林农业大学

学位级别：硕士

植物二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol 4-reductase,DFR)是花青素生物合成途径中的关键酶,研究表明其对花色和果色的修饰具有重要作用。本实验室研究发现,该酶基因的表达能够影响玉米的产量,而关于该酶对于产量的影响至今未见报道。... 详细信息

植物二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol 4-reductase,DFR)是花青素生物合成途径中的关键酶,研究表明其对花色和果色的修饰具有重要作用。本实验室研究发现,该酶基因的表达能够影响玉米的产量,而关于该酶对于产量的影响至今未见报道。因此,本试验以DFR基因为研究对象,以水稻为试验材料,利用生物信息学相关技术,对水稻中DFR基因家族进行系统的分析,在挖掘其特征、起源与进化、生物学功能以及表达特性等相关信息的基础上,克隆得到吉粳88中的DFR序列,构建超表达载体,利用农杆菌介导的遗传转化技术转化水稻,进一步验证该基因的功能。结果如下:1.水稻DFR基因家族至少包括55个组成成员,属于脱氢还原酶类;该基因家族起源于单子叶植物与双子叶植物物种分离进化之后,参与多条代谢途径,功能分化明显;2.分析了水稻DFR基因家族在不同组织部位、时期以及激素处理下的表达模式,结果发现该家族成员的表达具有组织特异性、时空特异性,根据表达量数据构建各成员间互作网络,确定了该基因家族各成员间的互作模式及相互影响;3.探讨了继代次数对愈伤组织的影响。研究表明,随着继代次数的增加,愈伤组织分化率和再生率显著下降,分化率由85.3%下降到2.6%,再生率由22.3%下降到1.25%;对可溶性蛋白含量无影响;可溶性糖含量持续降低;对过氧化物酶活性的影响较复杂,呈现先增加后降低再增加的趋势;随着继代次数的增加,细胞逐渐由结构紧密,内容物丰富,液泡较小,排列较整齐状态转变为结构疏松,细胞相对巨大,内含一大液泡,几乎无明显细胞器的状态。表明愈伤组织中的细胞逐渐由胚性愈伤组织转化为非胚性愈伤;4.构建了水稻DFR基因的超表达载体并进行了遗传转化,获得了抗性愈伤;5.分别以水稻根、茎、叶、愈伤组织、抗性愈伤组织为材料进行qPCR分析,结果表明,以愈伤组织为参照,抗性愈伤组织中DFR基因表达量为愈伤组织中的9.6倍,说明抗性愈伤组织中DFR基因表达量明显上调。在未转基因的样品中,已分化的组织中表达量远高于未分化组织,DFR基因在叶片中相对表达量最高,为愈伤组织中的217.6倍。其次为根中,表达量为愈伤组织的136.3倍。最后为茎中,为愈伤组织中表达量的124.9倍。说明该基因参与特定生物学过程。本研究对于进一步挖掘已知基因的功能提供了重要工具及方法,为生物信息学应用于作物育种、种质资源创新提供了有益参考。

关键词：二氢黄酮醇 4-还原酶(DFR) 表达量分析生理生化指标检测 qPCR

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IAA和NPA对核桃内果皮发育的影响

IAA和NPA对核桃内果皮发育的影响

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作者：李义霞塔里木大学

学位级别：硕士

木质素对核桃内果皮的形成、核桃品质的改善起至关重要的作用,不同的外源激素处理对木质素积累作用不同,而生长素可促进细胞壁的沉积,能够调控植物生长发育,促进木质素合成。因此,以‘新露’核桃作为试验样本,利用浓度不同的生长素IAA... 详细信息

木质素对核桃内果皮的形成、核桃品质的改善起至关重要的作用,不同的外源激素处理对木质素积累作用不同,而生长素可促进细胞壁的沉积,能够调控植物生长发育,促进木质素合成。因此,以‘新露’核桃作为试验样本,利用浓度不同的生长素IAA和生长素运输抑制剂NPA对核桃树短结果枝进行包裹处理,观察在不同浓度IAA和NPA处理后,核桃内果皮木质素的沉积情况,测定内果皮相关生理指标;对IAA和NPA处理后第12 d的样本进行高通量测序,筛选差异表达基因、进行基因功能注释、富集分析;对筛选出的关键差异基因进行定量表达分析,探讨IAA和NPA对木质素生物合成的影响。（1）经外源不同浓度IAA和NPA处理后核桃内果皮木质素沉积现象存在显著差异,通过比对发现50 mg/L IAA处理后内果皮染色面积增加,100 mg/L、150 mg/L、200 mg/L IAA处理后期内果皮染色面积均减少,说明短时间内低浓度IAA处理可促进木质素的积累,并在IAA处理后第12d时,50 mg/L IAA处理后木质素增加比率最大,木质素、纤维素、半纤维素含量整体呈上升趋势,最高分别可达30.55%、16.49%和17.23%;与对照相比,前期100 ml/L NPA处理后,内果皮染色面积减少,100 mg/L NPA的处理后内果皮木质素含量显著降低,纤维素、半纤维素含量整体呈上升趋势;不同浓度IAA和NPA处理后,核桃内果皮中内源IAA、GA3含量、木质素合成相关酶活性显著变化,核桃内果皮木质素、纤维素、半纤维素含量与IAA含量呈极显著正相关,IAA含量与GA3含量、PAL、CAD活性显著相关,说明可通过调节内源IAA含量调控与内果皮成分相关指标的含量,从而调控内果皮的发育。（2）RNA-seq分析发现,50 mg/L IAA处理后差异基因数量最多,为3292个,不同浓度间的核心差异基因有591个,NPA处理后,不同浓度间的共同差异基因为219个。通过KEGG富集分析发现植物激素信号转导途径是共同代谢途径,随着浓度的增加,苯丙烷生物合成途径发生了显著改变,推测该途径也是主要代谢途径。对这两条途径的差异基因进行统计发现,差异基因数量存在显著差异,50 mg/L IAA处理后与苯丙烷生物合成相关差异基因数量最多,为60个;100 mg/L NPA处理后富集在苯丙烷生物合成途径的差异基因数量最少,为5个,且随着浓度的升高,部分与苯丙烷生物合成和激素信号转导相关的差异基因表达量逐渐下调或不表达,推测在低浓度处理后上调或下调表达,在高浓度处理后阈值增加或减小的基因可能是影响木质素合成的关键基因。（3）对与木质素合成相关和生长素相关的基因进行实时荧光定量表达,分析可知Jr4CL2、Jr C4H、Jr CCR1和Jr CAD1基因在经IAA处理后第12 d时,与对照相比,表达量均增加,且50mg/L IAA处理表达量最高,差异倍数较大,处理后期表达量与对照差异不显著,与生长素相关的基因经IAA处理后,表达量发生显著变化,处理后第12 d时,50 mg/L IAA处理表达量最高,随着浓度的增加,表达量逐渐降低,说明IAA在核桃内果皮中发挥重要的作用。Jr COMT基因在50mg/L NPA和100 mg/L NPA处理后表达量降低,Jr AUX、Jr IAA16、Jr IAA9、Jr PIN3基因在100 mg/L NPA处理后表达量均降低,Jr SUAR32基因前期表达量升高,后期降低,说明IAA在核桃内果皮发育过程中发挥重要的作用,NPA处理可抑制与生长素相关的基因的表达。

关键词：核桃内果皮 IAA NPA 木质素高通量测序表达量分析

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无毒基因在稻瘟病菌株007中的克隆鉴定及表达分析

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中国农学通报 2020年第18期36卷 124-129页

作者：熊田田韩豪杰卢艳梅张宁王春台刘新琼程钢中南民族大学生命科学学院武陵山特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室国家民委生物技术重点实验室武汉430074

为了能明确稻瘟病国际标准菌株race 007中包含的无毒基因及其可能的主效无毒基因,本研究设计5个常见的无毒基因特异性引物进行克隆鉴定,并分别检测液体培养条件下和侵染水稻过程中race 007菌株中5个无毒基因的表达情况。本研究发现,稻... 详细信息

为了能明确稻瘟病国际标准菌株race 007中包含的无毒基因及其可能的主效无毒基因,本研究设计5个常见的无毒基因特异性引物进行克隆鉴定,并分别检测液体培养条件下和侵染水稻过程中race 007菌株中5个无毒基因的表达情况。本研究发现,稻瘟病菌株race 007中含有PWL2、AvrPiz-t、Avrpik、Avr-pita、ACE15个无毒基因,克隆鉴定的结果表明这5个无毒基因的变异不大。相比较于液体培养条件下,在侵染水稻的过程中,PWL2表达上调,ACE1、AvrPiz-t、Avr-Pik表达基本不变,而Avr-Pita基因表达出现了下调。因此PWL2基因表达变化较为显著,本研究进一步对PWL2启动子区域进行分析,结果表明该PWL2基因启动子区域存在着一些顺式作用元件来影响PWL2基因的表达。本研究表明,稻瘟病菌race 007含有5种常见的无毒基因且序列变异不大,而且PWL2基因的表达是受到调控并可能发挥主要的致病作用。

关键词：稻瘟病菌无毒基因克隆表达量分析

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茶树COBRA基因家族全基因组鉴定及表达分析

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茶叶学报 2021年第3期62卷 95-104页

作者：艾安涛李燕丽章文益吕立堂贵州大学茶学院贵州贵阳550025 湄潭县茶产业发展中心贵州湄潭564100 贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室贵州贵阳550025

COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子,对植物生长、纤维素含量等有重要作用。本研究通过对茶树基因组数据进行分析,成功的从中鉴定到COBRA基因,并对该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、进... 详细信息

COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子,对植物生长、纤维素含量等有重要作用。本研究通过对茶树基因组数据进行分析,成功的从中鉴定到COBRA基因,并对该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、进化关系、保守结构域、染色体定位等进行生物信息学分析,同时分析了茶树COBRA成员在PEG诱导的干旱胁迫、茉莉酸甲酯处理、盐胁迫、冷胁迫处理中的转录组数据,最后对茶树进行茉莉酸甲酯处理,基于荧光定量PCR技术的表达水平验证。结果表明:茶树COBRA基因有16个家族成员,相对分子质量24807.70~74813.12,等电点5.43~9.14,亚细胞定位显示在细胞膜和细胞外;根据系统进化树将茶树COBRA基因家族分为5类;保守结构域和motif分析发现相同亚家族的基因结构,保守结构域都属于COBRA基因家族;基因表达分析显示COBRA基因在不同茶树部位和胁迫的表达量有不同差异,说明茶树COBRA基因广泛参与茶树生长发育和非生物胁迫响应。实时荧光定量PCR显示经茉莉酸甲酯处理后,3个CsCOBRA基因表达量趋势大致与转录组数据一致,本研究将为进一步开展茶树COBRA基因家族的功能验证和抗逆作用机理研究等提供参考。

关键词：茶树 COBRA基因家族生物信息学表达量分析

来源：评论

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6个月季品种抗白粉病特性差异分析

引用

南方园艺 2022年第5期33卷 6-14页

作者：杨淳李晓瑞吴亦丁吴舒瑶 Xu Ping 明凤上海师范大学生命科学学院上海200234 上海师范大学植物种质资源开发中心上海200234 植物种质资源开发协同创新中心上海200234

月季被誉为“花中皇后”,在城市绿化、园林景观等应用中有着重要的作用。白粉病是月季生产中的第一大病害,严重影响月季观赏价值和经济价值。笔者以6个月季品种为研究对象,对其抗白粉病特性进行比较、评价和分析,为月季白粉病抗性品种... 详细信息

月季被誉为“花中皇后”,在城市绿化、园林景观等应用中有着重要的作用。白粉病是月季生产中的第一大病害,严重影响月季观赏价值和经济价值。笔者以6个月季品种为研究对象,对其抗白粉病特性进行比较、评价和分析,为月季白粉病抗性品种的选育提供一定的参考。综合6个月季品种在白粉病菌侵染后的表型,DAB、NBT和台盼蓝染色情况,抗病相关基因表达量以及考马斯亮蓝R-250染色分析,表明:‘男爵’‘艾弗的玫瑰’‘诺瓦利斯’可能是通过NPR1介导的信号途径诱导RcPR1基因的表达来实现对白粉病菌不同程度上的抗性;‘月月粉’对白粉病菌表现出易感性;‘安吉拉’和‘蓝色风暴’对白粉病有较强的抗性,这两个品种的抗病机理又存在一定差异;‘安吉拉’叶片表面白粉病菌很难附着、萌发,说明其可能主要通过叶片表面物理或化学的防御机制抵御白粉病菌的入侵;‘蓝色风暴’可能通过SA抗病防卫基本信号通路上游的调控来保证其抗性。

关键词：月季白粉病表型分析表达量分析抗病特性

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