目的:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术筛选出肺癌患者血清、肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)和肺癌组织中的...
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目的:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术筛选出肺癌患者血清、肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)和肺癌组织中的差异蛋白,了解其不同病理分型和解剖分型表达的特点及影响因素,并探讨其临床意义。
方法:选用弱阳离子交换蛋白芯片(WCX-2芯片),应用SELDI-TOF-MS技术分别检测40例肺癌患者和20例肺良性病变患者血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺组织匀浆的蛋白质质图谱,筛选出肺癌的差异蛋白,用直线相关分析研究他们之间的内在联系。进一步研究分析其中肺鳞癌患者和肺腺癌患者血清、BALF和肺组织匀浆的蛋白质质图谱,筛选出差异蛋白;比较中央型肺癌患者和周围型肺癌患者血清、BALF和肺组织匀浆的蛋白质质图谱;同时研究20例周围型肺癌患者活检前后BALF的蛋白质质图谱变化情况。用Protein Chip Biomarker System II-C型蛋白质芯片阅读仪读取芯片信息,采用Ciphergen Protein Chip 3.2版本的分析软件自动采集数据,读取峰高值,获得蛋白表达图谱,用Biomarker Pattern 5.0软件分析差异蛋白并初步建立诊断模型。
结果:一、肺癌组与肺良性病变组的差异蛋白
1.血清差异蛋白两者血清中共存在9个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),肺癌组血清中的差异蛋白均为上调表达,以质荷比(M/Z)为4097.08Da的差异蛋白建立分类树诊断模型,其诊断肺癌的灵敏度为77.5%(31/40),特异度为70%(14/20),正确率为75%(45/60),阳性预测值为83.78(%31/37),阴性预测值为60.87(%14/23),ROC曲线下面积为0.767。
***中的差异蛋白两者共存在20个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),肺癌组BALF中的差异蛋白14个上调表达, 6个下调表达,以M/Z为8133.51Da和15117.01Da的差异蛋白联合建立分类树诊断模型最好,其诊断肺癌的灵敏度为80%(32/40),特异度为80%(16/20),正确率为80%(48/60),阳性预测值为88.89%(32/36),阴性预测值为66.67%(16/24),ROC曲线下面积为0.919。
3.肺组织匀浆的差异蛋白两者共存在18个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),肺癌组肺组织匀浆中的差异蛋白4个上调表达,14个下调表达,以M/Z为3648.28Da的差异蛋白建立分类树诊断模型最好,其诊断肺癌的灵敏度为72.5%(29/40),特异度为85%(17/20),正确率为76.67%(46/60),阳性预测值为90.63%(29/32),阴性预测值为60.71%(17/28),ROC曲线下面积为0.867。
4.直线相关分析结果(1)肺癌患者血清中M/Z为4097.08Da的建模差异蛋白与肺组织匀浆中M/Z为3648.28Da的建模差异蛋白之间无相关性(P>0.05),但与BALF中M/Z为8133.51Da的建模差异蛋白之间呈正相关(P=0.025、r =0.355),与BALF中M/Z为15117.01Da的建模差异蛋白亦呈正相关(P=0.021、r =0.363);(2)肺癌患者BALF中M/Z为8133.51Da与M/Z为15117.01Da的建模差异蛋白之间呈正相关(P<0.0001、r =0.618);(3)肺癌患者BALF中M/Z为8133.51Da和M/Z为15117.01Da的建模差异蛋白与肺组织匀浆中M/Z为3648.28Da的建模差异蛋白之间均无相关性(P>0.05)。
二、不同病理类型肺癌的差异蛋白
(一)肺鳞癌组与肺良性病变组1.血清:两者共存在2个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),肺鳞癌患者的血清中差异蛋白1个上调表达、1个下调表达,以M/Z为5124.24Da的差异蛋白建立分类树诊断模型,其诊断肺鳞癌的灵敏度为85%(17/20),特异度为65%(13/20),正确率为75%(30/40),阳性预测值为62.96%(17/24),阴性预测值为81.25%(13/16),其ROC曲线下面积为0.750。***:两者共存在9个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),肺鳞癌患者的BALF中差异蛋白4个上调表达、5个下调表达,以M/Z为7967.29Da和10843.45Da的差异蛋白联合建模最好,其诊断肺鳞癌的灵敏度为80%(16/20),特异度为80%(16/20
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