检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：汤计瑞泸州医学院

学位级别：硕士

目的：原发免疫性血小板减少症(primary immune thrombocytopenia, ITP)是常见的出血性疾病，发病机制不明，以排除性诊断为主。实验诊断主要依据骨髓巨核细胞计数、成熟障碍及血清抗血小板抗体检测。由于骨髓巨核细胞成熟障碍特异性差... 详细信息

目的：原发免疫性血小板减少症(primary immune thrombocytopenia, ITP)是常见的出血性疾病，发病机制不明，以排除性诊断为主。实验诊断主要依据骨髓巨核细胞计数、成熟障碍及血清抗血小板抗体检测。由于骨髓巨核细胞成熟障碍特异性差，抗血小板抗体为多克隆抗体，其免疫表型有多种形式，因此现有的检测方法不仅阳性率低，而且不能鉴别其他免疫性疾病导致的血小板减少。临床上诊断存在很大困难，我们采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-massspectrometry, SELDI-TOF-MS)结合蛋白质芯片技术检测ITP患者、继发免疫性、继发非免疫性血小板减少症患者和健康人血小板裂解液，筛选出差异蛋白质，结合人工神经网络（Artificial Neural Networks，ANN），建立ITP诊断模型。方法：应用SELDI-TOF-MS技术检测64例ITP、47例急性白血病(acute leukemia,AL)、26例再生障碍性贫血(aplastic anemia, AA)、26例系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus, SLE)患者及42例健康人血小板裂解液,获得血小板蛋白质谱图。Biomarker Wizard3.1软件对Proteinchipsoftware得到的数据进行统计学分析，采用t检验方法计算均值、标准差S、P值，P<0.05认为有统计学意义。筛选出差异蛋白，结合BP神经网络，建立ITP人工神经网络诊断模型。结果：在质荷比（mass electron ratio,M/Z)为2000-20000范围内：1. ITP组与正常对照组比较，筛选出4个差异蛋白质峰(P<0.05)，在ITP组中高表达的是3549.17、7678.09，低表达的是5328.29、7894.32。2. ITP组与继发免疫性血小板减少症组（包括SLE患者）比较，筛选出4个差异蛋白(P<0.05)，质荷比分别为2276.15、3130.62、4521.60、5795.56。与继发免疫性血小板减少症组比较，这4个蛋白质在ITP组中低表达。3. ITP组与继发非免疫性血小板减少症组(包括AL和AA患者）比较，质荷比为7955.22、9409.65表达差异有统计学意义(P<0.05)。4.继发免疫性血小板减少症组与继发非免疫性血小板减少症组比较，质荷比为2842.32和9409.65表达差异有统计学意义(P<0.05)，且在继发免疫性血小板减少症组高表达。5. ITP组、继发免疫性血小板减少症组与继发非免疫性血小板减少症组相互比较，筛选出4个差异蛋白质峰(P<0.05)，质荷比分别为2276.15、3130.62、7955.22、9409.65。6.采用ITP组与正常对照组筛选的4个差异蛋白质峰，建立ITP诊断模型1。用验证组1(包括ITP患者32例和正常对照组21例）对该模型进行盲法验证，灵敏度93.3%，特异度82.6%，阳性预测值87.5%，阴性预测值82.6%，Youden指数75.2%。7.采用ITP组与继发免疫性血小板减少症组、继发非免疫性血小板减少症组筛选的4个差异蛋白质峰，建立ITP诊断模型2。用验证组2（包括ITP患者32例、SLE患者13例、AL患者23例和AA患者13例）对该模型进行验证，灵敏度78.4%，特异度93.3%，阳性预测值90.6%，阴性预测值84.0%，Youden指数74.4%。结论：1. ITP组与正常组、继发性血小板减少症组（包括继发免疫性血小板减少症组、继发非免疫性血小板减少症组）血小板裂解液差异蛋白表达有统计学意义。***-TOF-MS技术可能是寻找ITP生物标志物的有效工具，建立的人工神经网络模型可能对ITP的诊断具有一定的临床价值。

关键词：蛋白质组学表面增强激光解析电离飞行时间质谱生物标志物原发免疫性血小板减少症

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非小细胞肺癌化疗耐药/敏感的血清蛋白质标志物筛选、鉴定

非小细胞肺癌化疗耐药/敏感的血清蛋白质标志物筛选、鉴定

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作者：傅文凡广州医学院

学位级别：硕士

肺癌是目前全球发病率、死亡率最高的恶性肿瘤之一，占全部恶性肿瘤的16％，全部癌症死亡的28％。其发病率有明显上升趋势，在我国肺癌的发病率也逐年上升，并且已经成为我国城市人口癌症死亡的首要原因。据统计，我国2004-2005肺癌的... 详细信息

肺癌是目前全球发病率、死亡率最高的恶性肿瘤之一，占全部恶性肿瘤的16％，全部癌症死亡的28％。其发病率有明显上升趋势，在我国肺癌的发病率也逐年上升，并且已经成为我国城市人口癌症死亡的首要原因。据统计，我国2004-2005肺癌的死亡率为30．83／10万，居第一位。非小细胞肺癌(N。n small cell 1ung cancer，NscLc)是肺癌的主要病理类型，占80％，其中肺腺癌约占总病例的35％40％。尽管过去20年中第三代化疗药物及靶向治疗药物不断涌现，其生存期却无明显改善。非小细胞肺癌的5年生存率仅为14％，其主要原因是不能早期诊断和化疗耐药。70％的NscLc在发现时已属晚期，失去手术治疗的机会，所以大部分病例是以化疗为主的综合治疗，但目前晚期非小细胞肺癌肺癌的标准一线治疗含铂两药方案有效率仅40％左右。本实验入组病例40例回顾性分忻，有效率为35％也证实了这一点。因此寻找能够预测非小细胞肺癌化疗敏感／耐药性的生物标志物，指导临床个体化用药具有重要意义。常见能够预测肿瘤化疗的敏感性的方法有：1．体内药敏实验；2．体外药敏实验；3．肿瘤标志物的检测；4．耐药基因的检测。但目前预测化疗敏感性的方法都有不少缺点，仍然不够理想，主要存在与临床相关性较差，费时较长等问题。理想的方法直该：1．与临床相关性好，敏感性、特异性较好；2．简单、快速、费时短；3．标本易获取，可多样化；4．可筛选多种药物；5．可操作性强，能标准化；6．费用低廉，易于临床推广。无论是耐药基因的突变、表达水平的改变，或者是药物泵改变还是抗凋亡途径调整出现的耐药，最终的执行者都是蛋白质。从蛋白质水平来寻找能够预测肿瘤化疗耐药的的生物标志物有着重要的意义。蛋白质组(pr。te。me)指的是一个基因组(gen。me)或一种细胞／组织所表达的全部蛋白质(pr。tein)。蛋白质组学(pr。te。mics)就是从整体的角度，分忻动态变化的蛋白质组成、表达水平和修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用。可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑，也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之表面增强激光解忻电离飞行时间质谱(surface enhanced 1aser des。rpti。ni。nizati。n time。f flight mass stectr。metry，sELDI TOF Ms)将结合了能量吸收分子后的蛋白质在激光的激发下电离，带有电荷的蛋白质在加速电场的作用下，不同质荷比的蛋白质在长度一定的真空管中飞行所需的时间不同，带有正电荷的蛋白质离子束在到达检测器的一瞬间，电子倍增器将产生瞬时电流，转换成蛋白质的相对含量。它将蛋白质芯片和表面增强激光解忻电离飞行时间质谱有机地结合在一起，具有样品用量小、操作简便、灵敏度高、高通量等优点。通过配套生物信息学软件，可以寻找到差异蛋白，建立诊断模型。是寻找血清等蛋白生物标志物的理想手段。 SELDI TOF Ms技术目前已广泛用于多种疾病的早期诊断及指导治疗，在筛选肿瘤特异性蛋白质中的直用最为广泛，也显得最为重要。但由于技术的局限性，发现的蛋白峰，无法知道其序列，下游的研究工作困难。c¨np。rt技术的磁珠可以分离纯化血清的中低丰度小分子量蛋白。MALDI TOF Ms是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱，用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜，基质从激光中吸收能量传递给生物分子，而电离过程中将质子转移到生物分子或从生物分子得到质子，而使生物分子电离的过程。TOF的原理是离子在电场作用下加速飞过飞行管道，根据到达检测器的飞行时间不同而被检测即测定离子的质荷比(M／z)与离子的飞行时间成正比，检测离子。TOF／TOF对于Ms／Ms模式可通过第一级TOF选择母离子进入高能碰撞池中碰碎，然后进入第二级TOF重新被加速并被分忻，不仅能够检测蛋白质的肽谱，同时可以检测肽序列。研究目的：本实验拟通过联合利用sELDI TOF Ms技术、c¨np。rt磁珠、MALDI TOT／TOF Ms技术，寻找非小细胞肺癌患者血清中能够预化疗敏感／耐药的蛋白质，建立预测非小细胞肺癌化疗敏感／耐药性的模型；并分离纯化蛋白，进行质谱鉴定。材料和方法： 1．病例选择2009年2月至2009年9月，40例就诊于广州医学院附属肿瘤医院的非小细胞肺癌患者，行标准含铂类两药方案化疗2周期后按REcIsT评价方法，分为化疗有效组(cP+PR)和化疗无效组(sD+PD)。 2．血清样品处理和保存入组患者用干燥试管抽取清晨空腹静咏血3～5m1，4℃15)00转／分，离心10分钟，提取血清，置于80℃冰箱保存。 *** TOF Ms检测将样本加到芯片上以后

关键词：非小细胞肺癌表面增强激光解析电离飞行时间质谱 Clinport 基质辅助激光解吸附电离串联飞行时间质谱蛋白质组学耐药化疗敏感性生物标志物

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原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究

原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究

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作者：胡琼英泸州医学院

学位级别：硕士

目的：原发性肝癌是由肝细胞或肝内胆管细胞发生的癌肿,是我国常见的恶性肿瘤之一,其死亡率在消化系统肿瘤中列第三位,仅次于胃癌和食道癌,临床上以肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)最为多见。肝细胞癌是世界上最常见恶性肿瘤之... 详细信息

目的：原发性肝癌是由肝细胞或肝内胆管细胞发生的癌肿,是我国常见的恶性肿瘤之一,其死亡率在消化系统肿瘤中列第三位,仅次于胃癌和食道癌,临床上以肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)最为多见。肝细胞癌是世界上最常见恶性肿瘤之一,总的5年生存率低于5%。目前HCC发病率在我国呈日渐上升趋势,造成其高病死率的主要原因是目前尚缺乏特异性高的早期诊断方法,由于HCC病人早期常无症状,发现时已属中、晚期,丧失了治疗的最佳时机。因此,迫切需要探索一种快速、简单、灵敏度高、特异性好的早期诊断方法。在众多的检测手段中,表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(Surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry, SELDI-TOF-MS)无疑是当今报道最前沿、最热门、检测敏感度和特异度最高的技术。任何疾病在出现病理变化之前,细胞内的蛋白质在成分和数量上都会有相应改变,并通过血清中的蛋白质模式反映出来。因此,通过比较不同疾病人群血清中差异蛋白质的表达,可能筛选出肿瘤相关的标志分子。本研究采用差异蛋白组学的方法,利用SELDI-TOF-MS技术检测乙肝、肝硬化、原发性肝癌患者、其他消化系统肿瘤与健康人血清蛋白指纹图谱,并筛选原发性肝癌患者特异表达的血清蛋白标志物,结合人工神经网络技术(artificial neural network,ANN)建立预测模型,探索其用于原发性肝癌实验诊断的临床价值,以建立早期有效检测原发性肝癌的客观实验指标。方法：利用SELDI-TOF-MS技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清标本得到相应的蛋白指纹图谱,经Biomarker Wizard分析软件找出差异蛋白,采用人工神经网络,建立诊断原发性肝癌实验诊断模型。将其中75例乙肝和68例肝硬化、100例原发性肝癌、91例其他消化系统肿瘤和101例健康人血清随机分为训练集(乙肝35例,肝硬化33例,原发性肝癌50例,其他消化系统肿瘤41例,健康人51例)结合到金芯片上,检测血清蛋白质谱数据,将获得的蛋白质谱图用Ciphergen ProteinChip 3.0软件进行数据的校正和分析,采用Ciphergen Biomaker Wizard 3.1软件筛选肝炎、肝硬化、原发性肝癌和其他消化系统肿瘤的差异蛋白。此数据将用于筛选肝癌的差异蛋白标志物并建立人工神经网络诊断模型。验证集(乙肝40例,肝硬化35例,原发性肝癌50例,其他消化系统肿瘤50例,健康人50例)进行相同的处理后数据用于模型诊断效度的盲法验证。结果：原发性肝癌患者与对照组血清蛋白指纹图谱筛选出75个差异表达的蛋白质荷比峰(P<0.05),利用其中7个有明显表达差异的标志蛋白(P<0.01)建立人工神经网络诊断模型,.其质荷比(m／z)分别为4207、6604、7734、8106、8545、8599、8894。经Swiss-Prot蛋白数据库检索,初步鉴定为Peptide YY-like,50S ribosomal protein L30,50S ribosomal protein L35, Neutrophil-activating peptide 2 (74), Acyl carrier protein,30S ribosomal protein S21, UPF0330 protein TK1752。利用该模型对原发性肝癌进行盲法预测,对原发性肝癌的诊断灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论：原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,建立的人工神经网络模型为原发性肝癌的诊断提供了的新方法,,对原发性肝癌的鉴别诊断、治疗和基因研究具有重要意义。

关键词：原发性肝癌表面增强激光解析电离飞行时间质谱人工神经网络蛋白标志物受试者工作特征曲线

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基于SELDI-TOF-MS技术的壶腹周围癌血清蛋白质谱的初步研究

基于SELDI-TOF-MS技术的壶腹周围癌血清蛋白质谱的初步研究

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作者：向鑫泸州医学院

学位级别：硕士

目的：壶腹周围癌包括壶腹癌，胆总管下端癌和十二指肠癌，各种壶腹周围癌之间生物学特性不同，具有不同的预后。同时临床上壶腹周围癌又常与胰头癌混淆，而两者生物学特性和预后差异明显。我们运用SELDI-TOF-MS技术对各壶腹周围癌及胰... 详细信息

目的：壶腹周围癌包括壶腹癌，胆总管下端癌和十二指肠癌，各种壶腹周围癌之间生物学特性不同，具有不同的预后。同时临床上壶腹周围癌又常与胰头癌混淆，而两者生物学特性和预后差异明显。我们运用SELDI-TOF-MS技术对各壶腹周围癌及胰头癌血清蛋白质谱图进行比较，探索各肿瘤间血清蛋白质的差异，且通过差异蛋白组学筛选壶腹癌特异的肿瘤标志物，并建立决策树诊断模型，期望找到早期诊断壶腹癌的方法。方法：运用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)技术对经病理诊断的27例壶腹癌，12例胆总管下端癌，34例胰头癌和30例正常对照组血清进行检测。检测结果采用BiomakerWizard3.1版分析软件筛选有统计学意义的差异蛋白，对壶腹癌，胰头癌，胆总管下端癌进行两两比较，探索相互之间是否存在差异。运用SPSS17.0软件建立壶腹癌的决策树诊断模型，并运用ROC曲线比较诊断价值，最后通过蛋白质数据库检索差异蛋白质，初步鉴定差异蛋白。结果：1.壶腹癌，胰头癌，胆总管下端癌相互之间血清蛋白质的表达存在差异。2.壶腹癌组和正常对照组有32个显著差异的蛋白质峰（P值<0.05），其中壶腹癌组有10个蛋白质谱峰的表达相对增高，有22血清蛋白质谱峰降低。壶腹癌组和胰头癌组之间有14个差异表达蛋白，其中壶腹癌组与胰头癌组相比有13个蛋白质谱峰降低，有一个增高。壶腹癌和胆总管下端癌血清蛋白质谱结果相比较，有6个增高，2个降低。胆总管下端癌和胰头癌血清蛋白质谱结果相比较，有18个差异表达蛋白，全部都降低。3.运用ROC曲线作图分析CA19-9对壶腹癌和正常对照组鉴别诊断的价值，在CA19-9以47.9u/ml为分界点时具有最大诊断价值，特异性和敏感性分别为66.7%和70.4%。4.决策树诊断模型，CA19-9，M/Z8612,M/Z6583对壶腹癌的诊断效果相互比较，ROC曲线下面积分别为0.861，0.685，0.787，0.708。决策树诊断模型具有最好的诊断价值，M/Z6583,M/Z8612两种蛋白也比传统的肿瘤标志物CA19-9具有更好的诊断效果。5.利用TagIdent搜索工具在Swiss-Prot蛋白质数据库中检索M/Z6583，M/Z8612，分别获得2种和4种候选蛋白。结论：1.研究结果表明壶腹癌组、胆管下端癌组、胰头癌组之间血清蛋白质的表达具有差异性。筛选其中差异表达的蛋白有利于进一步探索各肿瘤之间预后差异的分子基础。2.壶腹癌和正常对照组血清蛋白指纹图谱之间存在差异，M/Z6583,M/Z8612两种蛋白比传统的肿瘤标志物CA19-9具有更好的诊断效果，对两种蛋白的进一步研究将有利于壶腹癌的鉴别诊断及深入了解壶腹癌的具体发生发展过程。3.决策树诊断模型具有很高的诊断价值，和CA19-9, M/Z6583,M/Z8612相比，ROC曲线下面积分别为0.861，0.685，0.787，0.708。决策树诊断模型具有很好的临床价值，有可能成为筛选壶腹癌的一种新方法。

关键词：壶腹周围癌表面增强激光解析电离飞行时间质谱决策树

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干燥综合征蛋白组学的研究

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昆明医科大学学报 2016年第4期37卷 65-70页

作者：刘娟付萍昆明医科大学第二附属医院风湿免疫科云南昆明650101

目的应用SELDI研究干燥综合征疾病的特异性差异蛋白.方法选用CM10芯片,应用表面增强激光解析离子飞行时间质谱技术,比较SS疾病组与正常组血清的蛋白及SS疾病组中关节肿痛组与无关节肿痛组血清的蛋白质表达差异.结果 (1)SS组与正常组的... 详细信息

目的应用SELDI研究干燥综合征疾病的特异性差异蛋白.方法选用CM10芯片,应用表面增强激光解析离子飞行时间质谱技术,比较SS疾病组与正常组血清的蛋白及SS疾病组中关节肿痛组与无关节肿痛组血清的蛋白质表达差异.结果 (1)SS组与正常组的血清中有68个差异质谱峰(P<0.05),并鉴定出11个蛋白在SS组中10个上调表达,1个下调表达;(2)未发现与关节肿痛相关的特异性差异蛋白;(3)将11个差异蛋白分别与临床资料进行分析对比,未发现明显相关性.结论 (1)SS患者与正常人血清中蛋白质的表达有差异;(2)伴关节肿痛症状SS患者无特异性差异蛋白;(3)检测出的α-1抗糜蛋白酶、纤维蛋白原α链、β淀粉样蛋白前体、转甲状腺素蛋白、β2-微球蛋白都可能参与SS的发病,上述物质均可引起淀粉样变,损伤机制可能与淀粉样变相关.

关键词：干燥综合征表面增强激光解析电离飞行时间质谱骨桥蛋白铁调素

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应用SELDI—TOF—MS技术筛选肺鳞癌和肺腺癌患者差异蛋白的研究

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国际呼吸杂志 2012年第15期32卷 1139-1144页

作者：李文涛柳广南周继红黄斯明肖阳宝苏红广西医科大学第一附属医院呼吸内科南宁530021

目的应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（sELDI-TOF-MS）技术筛选出不同病理类型肺癌患者血清、支气管肺泡灌洗液（BALF）和肺癌组织中的差异蛋白，并探讨其临床意义。方法选用WCX-2芯片、SELDI—TOF-MS技术检测20例肺鳞癌、20例肺... 详细信息

目的应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（sELDI-TOF-MS）技术筛选出不同病理类型肺癌患者血清、支气管肺泡灌洗液（BALF）和肺癌组织中的差异蛋白，并探讨其临床意义。方法选用WCX-2芯片、SELDI—TOF-MS技术检测20例肺鳞癌、20例肺腺癌和20例肺良性病变患者血清、BALF和肺组织匀浆的蛋白质谱，用Biomarker Patiern软件分析肺鳞猫和肺腺癌的差异蛋白并初步建立诊断模型。结果①肺鳞癌组与肺良性病变组：在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在2、9、8个差异蛋白峰（P〈0．05），分别选用其中质荷比为5124．24、7967．29联合10843．45、7914．59联合8709．66的差异蛋白波峰建立分类树模型，其诊断肺鳞癌的灵敏度分别为85％、80％、75％，特异度分别为65％、80％、90％，正确率分别为75％、80％、83％，阳性预测值分别为71％、80％、88％，阴性预测值分别为81％、80％、78％，其相对应ROC曲线下面积分别为0．750、0．916、0．930。②肺腺癌组与肺良性病变组：在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在8、9、7个差异蛋白峰（P〈0．05），分别选用其中质荷比为9295．79、7923．01、2452．49的差异蛋白波峰建立分类树模型，其诊断肺腺癌的灵敏度分别为75％、80％、70％，特异度分别为65％、90％、85％，正确率分别为70％、85％、78％，阳性预测值分别为68％、89％，82％，阴性预测值分别为72％、82％、71％，其相对应ROC曲线下面积分别为0．844、0．933、0．825。结论肺鳞癌和肺腺癌BALF及肺组织匀浆中的差异蛋白较血清多，诊断效率比血清高，肺鳞癌BALF中质荷比为7967．29和10843．45的差异蛋白峰联合、肺组织匀浆中质荷比为7914．59和8709．66的差异蛋白峰联合建模及肺腺癌BALF中质荷比为7923．01的差异蛋白峰建立分类树诊断模型，其诊断的灵敏度、特异度和正确率可达到75％～90％，有可能作为诊断肺鳞癌和肺腺癌的标志蛋白。

关键词：表面增强激光解析电离飞行时间质谱差异蛋白肺癌支气管肺泡灌洗液肺组织匀浆血清

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系统性红斑狼疮患者血清差异蛋白的研究

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皮肤病与性病 2015年第5期37卷 251-256页

作者：陈超超邓丹琪昆明医科大学第二附属医院皮肤科云南昆明650101 大理学院附属医院皮肤科 671300

目的筛选出系统性红斑狼疮活动组、稳定组与正常对照组血清中的差异蛋白,从整体水平寻找SLE患者血清的异常蛋白,寻找SLE的分子标记物。方法选用弱阳离子交换蛋白芯片(CM10芯片),用Protein Chip Biomarker System II-C型蛋白质芯片阅读... 详细信息

目的筛选出系统性红斑狼疮活动组、稳定组与正常对照组血清中的差异蛋白,从整体水平寻找SLE患者血清的异常蛋白,寻找SLE的分子标记物。方法选用弱阳离子交换蛋白芯片(CM10芯片),用Protein Chip Biomarker System II-C型蛋白质芯片阅读仪读取芯片信息,应用表面增强激光解析离子飞行时间质谱(SELDI-TOF—MS)技术,分别检测SLE活动组40例、稳定组40例及正常人群40例血清的蛋白质质谱图,对不同分组数据进行差异表达统计分析、层次聚类分析和主成分分析,筛选出差异蛋白,并用生物信息学鉴定。结果 1 SLE活动组与稳定组的血清中有53个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),活动组血清中的差异蛋白有21个上调表达,32个下调表达;2 SLE稳定组与正常对照组的血清中共存在22个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),稳定组血清中的差异蛋白有15个上调表达,7个下调表达;3 SEL活动组与正常对照组的血清中共存在44个有统计学差异的蛋白峰(P<0.05),活动组血清中的差异蛋白有17个上调表达,27个下调表达;4应用生物学信息鉴定出铁调素、神经分泌蛋白生长因子片段、β淀粉样肽前体,活动组较正常组/稳定组表达升高;中性粒细胞防御素3和中性粒细胞防御素1、血浆蛋白酶c1抑制剂片段、补体C3片段、α-1抗胰糜蛋白酶,活动组较正常组/稳定组表达都下降;交联-α-胰蛋白酶抑制物H4重链片段,稳定组较正常组表达升高。结论 1 SLE患者血清中蛋白质表达和正常人血清有差异;2铁调素与狼疮肾炎活动有关,有望成为SLE活动的生物学标签;3中性粒细胞防御素3和中性粒细胞防御素1具有趋化作用、调理吞噬作用、细胞毒性、参与补体激活;4血清C3的下降可以成为诊断SLE的辅助性指标。

关键词：系统性红斑狼疮表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白组学

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SELDI-TOF-MS筛选慢性阻塞性肺疾病血清标志蛋白的初步研究

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结核病与胸部肿瘤 2015年第2期 88-92页

作者：张霞李琦吴小意陈文妃张宗德张杰首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所 101149 首都医科大学附属北京天坛医院呼吸科 100050 北京德易生物医学技术有限公司 100035

目的利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（SELDI—TOF—MS）筛选慢性阻塞性肺疾病（COPD）血清特异标志物。方法应用SELDI—TOF—MS技术检测30例COPD稳定期患者和30例健康对照者血清蛋白指纹图谱，采用Biomarker pattern软件进... 详细信息

目的利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（SELDI—TOF—MS）筛选慢性阻塞性肺疾病（COPD）血清特异标志物。方法应用SELDI—TOF—MS技术检测30例COPD稳定期患者和30例健康对照者血清蛋白指纹图谱，采用Biomarker pattern软件进行分析，建立COPD的诊断模型。结果COPD患者血清蛋白图谱与对照组相比，在相对分子质量2000-15000范围内共检测到75个蛋白峰，发现19个有统计学差异的蛋白峰（P〈0．05）。通过对COPD组与对照组间的数据作进一步分析，经BPS软件分析，建立质荷比（M／Z）3167、4645的差异蛋白组成的诊断模型，其诊断敏感度为96．67％，特异度为96．67％。结论SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简单易行、用量少和高通量的分析方法。能直接筛选出COPD血清中特异表达标志物，用特异表达标志物建立的诊断模型能有效区分COPD患者与健康对照者，有望成为COPD诊断的辅助指标。

关键词：慢性阻塞性肺疾病表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白质组学

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基于QPSO-SVM算法的SELDI-TOF质谱数据分析

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计算机应用与软件 2011年第1期28卷 57-60页

作者：张蓉冯斌孙俊江苏信息职业技术学院计算机工程系江苏无锡214101 江南大学信息工程学院江苏无锡214122

生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(... 详细信息

生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(QPSO)与SVM结合,并将建立的诊断模型用于生物标记物的选择。实验结果表明,新的基于量子粒子群算法建立的模型不仅具有良好的预测精度,而且在速度上有大幅的提高。

关键词：表面增强激光解析电离飞行时间质谱粒子群优化算法(PSO) 量子粒子群算法(QPSO) 特征选择技术生物标记物

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TritonX-114去污剂法提取大肠杆菌膜蛋白

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医药前沿 2017年第12期7卷 59-61页

作者：王秦许健刘成桂成都市妇女儿童中心医院检验科四川成都 610091

目的:建立一种快速方便提取大肠杆菌膜蛋白的方法.方法:收集临床分离的大肠杆菌,利用TritonX-114去污剂法提取大肠杆菌膜蛋白,Bradford法测定蛋白浓度,运用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)进行质谱分析,采用CiphergenPr... 详细信息

目的:建立一种快速方便提取大肠杆菌膜蛋白的方法.方法:收集临床分离的大肠杆菌,利用TritonX-114去污剂法提取大肠杆菌膜蛋白,Bradford法测定蛋白浓度,运用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)进行质谱分析,采用CiphergenProteinchip软件采集数据.重复测定20次大肠杆菌的混合标本,评价TritonX-114去污剂法提取大肠杆菌膜蛋白的重复性.结果:TritonX-114去污剂法成功提取出了大肠杆菌膜蛋白.重复测定20次大肠杆菌的混合标本,蛋白峰的分子量变异系数均小于0.05%.结论:T r i t o n X-114去污剂法可以快速方便的提取大肠杆菌膜蛋白,并具有很好的重复性,这不仅对大肠杆菌耐药机制和治疗方法的研究起着重要作用,也为膜蛋白的快速提取提供了新的思路.

关键词：大肠杆菌膜蛋白 TritonX-114 表面增强激光解析电离飞行时间质谱

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