检索结果-内蒙古大学图书馆

中草药 2023年第21期54卷 7120-7129页

作者：卓桂锋陈炜朱健敏匡龙娇廖乃彬张金枝苏明阳吴林广西中医药大学科学实验中心广西南宁530022 广西中医药大学第一临床医学院广西南宁530022 广西中医药大学广西中医基础研究重点实验室广西南宁530022

目的通过机器学习等生物信息学方法筛选参与血管性痴呆(vascular dementia,Va D)发病机制的铜死亡关键差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并预测和分析具有防治作用的中药。方法基于GSE33000数据集筛选铜死亡DEGs并分... 详细信息

目的通过机器学习等生物信息学方法筛选参与血管性痴呆(vascular dementia,Va D)发病机制的铜死亡关键差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并预测和分析具有防治作用的中药。方法基于GSE33000数据集筛选铜死亡DEGs并分析其相关性;对数据集样本进行聚类分型,应用基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)分型后通路富集情况;应用加权基因共表达网络分析与Va D关系密切的基因并取交集获得重要基因;构建风险预测列线图模型筛选重要基因的风险因子;基于风险因子构建多种机器学习方法的预测模型并将其与铜死亡DEGs进行相关性分析得到关键基因,并进行防治中药的筛选。结果共获得铜转运ATP酶β(ATPase copper transporting beta,ATP7B)、硫辛酸合成酶(lipoic acid synthetase,LIAS)等9个铜死亡DEGs,其相互之间表现出较强的协同或拮抗效应。根据铜死亡DEGs可将Va D患者分为2种亚型且DEGs在亚型间表达有所差异。分型后GSVA通路富集结果涉及刺猬信号通路等;绿松石模块(37个差异基因)与Va D分型高度相关,其与数据集DEGs交集得到5个重要基因,其中XLOC_005471可能是Va D的风险因子。广义线性模型(generalized linear models,GLM)机器学习模型的预测性能最高。脂酰基转移酶2(lipoyltransferase 2,LIPT2)、二氢脂酰胺S-乙酰基转移酶(dihydrolipoamide S-acetyltransferase,DLAT)、二氢硫辛酰胺脱氢酶(dihydrolipoamide dehydrogenase,DLD)、丙酮酸脱氢酶E1亚基β(pyruvate dehydrogenase E1 subunit beta,PDHB)与金属调节转录因子1(metal regulatory transcription factor 1,MTF1)与风险因子相关性较强,可作为铜死亡关键DEGs,其中MTF1、PDHB的表达与Va D患者年龄负相关(P<0.01)。根据铜死亡DEGs筛选出海蛤壳、鱼鳔胶等29味中药,其四气五味多属寒、温、平,苦、甘,归胃、肾、心、肝经,多为清热补虚药。结论ATP7B、LIAS等9个铜死亡DEGs相互调控作用及其相关的刺猬信号通路可能是Va D铜死亡相关发病机制的重要环节,其中TLIPT2、DLAT、DLD、PDHB与MTF1是铜死亡关键基因。GLM机器学习模型可以较准确诊断Va D。ATP7B、LIAS等铜死亡DEGs可能有助于阐释Va D火热内盛伴有气虚或肾精亏虚证型的实质机制,海蛤壳、鱼鳔胶等中药可能为防治Va D潜在分子药物的来源。

关键词：血管性痴呆铜死亡清热补虚药证候实质机器学习广义线性模型海蛤壳鱼鳔胶

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血瘀证与活血化瘀研究热点与展望

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中国中西医结合杂志 2022年第6期42卷 660-663页

作者：徐浩中国中医科学院西苑医院心血管病中心国家中医心血管病临床医学研究中心北京100091

血瘀证与活血化瘀在传统中医学中具有古老的渊源和极为丰富的内容,历经数千年而不衰。20世纪60年代以来,随着中西医结合学术研究的不断发展,在陈可冀院士等中医、中西医结合专家带领下,血瘀证及活血化瘀研究逐步深入,重大成果不断涌现,... 详细信息

血瘀证与活血化瘀在传统中医学中具有古老的渊源和极为丰富的内容,历经数千年而不衰。20世纪60年代以来,随着中西医结合学术研究的不断发展,在陈可冀院士等中医、中西医结合专家带领下,血瘀证及活血化瘀研究逐步深入,重大成果不断涌现,涉及活血化瘀与重大疾病防治、血瘀证证候实质研究、证治体系建立、活血化瘀中药鉴定与研发等方面.

关键词：传统中医学重大疾病防治活血化瘀中药陈可冀院士中西医结合血瘀证证候实质学术研究

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血管性痴呆代谢相关基因及防治中药筛选的生物信息学及实验验证研究

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中国医药导报 2024年第29期21卷 36-42页

作者：张金枝陈炜卓桂锋黄德庆符钰岚杨富才欧阳超吴林广西中医药大学第一附属医院脑病一区广西南宁530023 广西中医药大学研究生院广西南宁530022

目的基于代谢差异表达基因(MDEG)探讨血管性痴呆(VD)代谢相关的发病机制及可能的中药防治策略。方法GEO数据集GSE122063的差异表达基因与代谢相关基因取交集后得到MDEGs。随后,基于MDEGs将GEO数据集中VD患者数据进行聚类分型。利用P值... 详细信息

目的基于代谢差异表达基因(MDEG)探讨血管性痴呆(VD)代谢相关的发病机制及可能的中药防治策略。方法GEO数据集GSE122063的差异表达基因与代谢相关基因取交集后得到MDEGs。随后,基于MDEGs将GEO数据集中VD患者数据进行聚类分型。利用P值排名前10的MDEGs进行机器学习模型构建并筛选排名前5位的MDEGs;根据前5位的MDEGs进行中药预测、四气、五味、归经分析并选取重要中药进行实验验证。抽取18只雄性SD大鼠按照随机数字表法分成分成假手术组、模型组、鹿茸组,每组各6只。假手术组仅分离颈动脉不接扎;模型组与鹿茸组大鼠予双侧颈总动脉结扎;鹿茸组大鼠予中药鹿茸[0.572 g/(kg·d)]灌胃。大鼠造模后进行水迷宫实验、RT-q PCR检测以验证生物信息学结果。结果本研究得到CYP17A1等24个MDEGs。基于MDEGs将VD基因分为2个亚型;极限梯度上升(XGB)模型为最佳学习模型并得到排名前10的MDEGs(CYP17A1、CYP26A1、KCNE4、ADCY7、FMO1、SLC13A5、GBA3、PCK1、ELOVL1、ALOX5AP);通过前5位的MDEGs获得鹿茸等27味具有生物学效应的中药,多归于肝、肾、脾经;五味多属甘、苦味;四气多属温、寒。药物功效多与补虚相关。与假手术组比较,模型组水迷宫实验逃逸潜伏期延长,目标象限停留时间减少,跨越平台次数下降(P<0.01);与模型组比较,鹿茸组逃逸潜伏期缩短,目标象限停留时间延长,跨越平台次数增多(P<0.01)。与假手术组比较,模型组大脑皮质CYP17A1、CYP26A1的m RNA相对表达量降低(P<0.05);与模型组比较,鹿茸组大脑皮质CYP17A1、CYP26A1的m RNA相对表达量上升(P<0.05)。结论CYP17A1等24个MDEGs可能是VD代谢相关发病机制的重要环节。XGB学习模型可以较准确诊断VD。MDEGs可能为揭示VD脾肾亏虚证型的内在机制提供线索。同时,鹿茸等中药有望成为防治VD的潜在药物来源,其中鹿茸可能通过代谢相关基因CYP17A1、CYP26A1发挥抗VD作用。

关键词：血管性痴呆代谢相关基因中药筛选证候实质机器学习

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宏基因组学技术在中医证候研究中的应用与思考

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江西中医药大学学报 2024年第4期36卷 128-132页

作者：宋楠楠杜菁西旺江西中医药大学南昌330004

宏基因组学是一种以微生物群落为研究对象的测序研究技术,通过提取特定环境中所有微生物的基因信息,集合分析微生物群落结构、系统进化、代谢路径、基因功能等方面的特征。目前已广泛地用于多种医学相关的微生物研究领域。将宏基因组学... 详细信息

宏基因组学是一种以微生物群落为研究对象的测序研究技术,通过提取特定环境中所有微生物的基因信息,集合分析微生物群落结构、系统进化、代谢路径、基因功能等方面的特征。目前已广泛地用于多种医学相关的微生物研究领域。将宏基因组学引入中医学的研究中,使中医学与同样强调整体性的现代微观技术有机结合,可以弥补中医学研究过程中缺少微观化指标的不足,具有独特的应用前景。中医证候是中医基础理论与中医临床的桥梁,从宏基因组学的研究方法着手,尝试对其进行现代化的定性定量分析,可以部分揭示中医证候的实质,使中医证候更加规范化、科学化。宏基因组学有整体性、动态性、环境统一性的特点,十分符合中医学中“证候”的一般特征。因此,基于宏基因组学技术的中医证候实质研究不仅有较高的可行性,同时可以为中医辨证论治和方剂配伍等理论研究带来新的方向,为推动中医现代化带来新的契机。

关键词：证候实质宏基因组学微生物中医现代化

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温病气分证证候实质的研究进展

温病气分证证候实质的研究进展

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中国畜牧兽医学会中兽医学分会第八次全国代表大会暨2014年学术年会

作者：张世栋中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

温病是畜禽疾病中一类重要的中医证候,其中气分证是温病过程中正邪相争的关键时期,是典型的温病证候之一.依据中兽医临床判断,畜禽的许多现代传染病与感染性疾病过程均有气分证的症候表现.多年来,气分证动物模型的建立与证候实质研究一... 详细信息

温病是畜禽疾病中一类重要的中医证候,其中气分证是温病过程中正邪相争的关键时期,是典型的温病证候之一.依据中兽医临床判断,畜禽的许多现代传染病与感染性疾病过程均有气分证的症候表现.多年来,气分证动物模型的建立与证候实质研究一直是领域内的研究热点.本文从气分证的模型研究和白虎汤与气分证的方证相关性研究两方面对气分证证候实质研究进展进行了综述,并展望了蛋白组学技术在证候实质研究中的美好前景.

关键词：中兽医学温病气分证模型证候实质

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心肌梗死恢复期气虚血瘀证的代谢组学研究

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时珍国医国药 2016年第6期27卷 1527-1530页

作者：朱明丹杜武勋姜民魏聪聪张少强袁宏伟刘长玉张建平冯利民张红霞刘岩朱林平曹旭焱天津中医药大学第二附属医院天津300150 天津中医药大学 300193 南开大学天津300072

目的对心肌梗死恢复期气虚血瘀证进行代谢组学研究。方法通过心肌梗死恢复期气虚血瘀证代谢组学特征谱的研究,从系统生物学角度探讨心肌梗死恢复期气虚血瘀证的微观基础。结果心肌梗死恢复期气虚血瘀证较健康对照组溶血磷脂酰胆碱,亚油... 详细信息

目的对心肌梗死恢复期气虚血瘀证进行代谢组学研究。方法通过心肌梗死恢复期气虚血瘀证代谢组学特征谱的研究,从系统生物学角度探讨心肌梗死恢复期气虚血瘀证的微观基础。结果心肌梗死恢复期气虚血瘀证较健康对照组溶血磷脂酰胆碱,亚油酸、花生四烯酸、鞘氨醇类物质的代谢水平均下调。结论心肌梗死恢复期气虚血瘀证患者可能存在能量代谢、磷脂代谢、脂肪酸代谢紊乱。

关键词：心肌梗死恢复期气虚血瘀证证候实质代谢组学

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生物系统论指导下的中医证候实质研究及其问题

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中国中西医结合杂志 2011年第3期31卷 419-423页

作者：杜武勋朱明丹姜民马朋周莹天津中医药大学第二附属医院天津300150 天津南开大学药学院博士后天津300071

本文就采用生物系统论的方法进行中医证候研究的思路进行了总结,通过目前中医证侯学与基因组学、蛋白质组学、代谢组学研究的情况,提出了中医证候学研究需要重视证候的功能性和证候的整体性特征。

关键词：中医证候研究证候实质系统论生物中医证侯学蛋白质组学中医证候学基因组学

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心肾综合征阳虚水泛证与气虚血瘀证患者血清蛋白质组学研究

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海峡药学 2016年第11期28卷 121-123页

作者：欧阳秋芳郭进建游涛严锦贤魏仲南赵红佳福建中医药大学附属第二人民医院福州350003

目的建立心肾综合征(CRS)阳虚水泛证、CRS气虚血瘀证及健康对照的血清蛋白质组表达图谱,初步鉴定其差异表达的蛋白质。方法选择CRS患者35例,其中阳虚水泛证组20例;气虚血瘀证组15例。另选健康者12例作为对照。各组血清去除白蛋白,测定... 详细信息

目的建立心肾综合征(CRS)阳虚水泛证、CRS气虚血瘀证及健康对照的血清蛋白质组表达图谱,初步鉴定其差异表达的蛋白质。方法选择CRS患者35例,其中阳虚水泛证组20例;气虚血瘀证组15例。另选健康者12例作为对照。各组血清去除白蛋白,测定血清蛋白浓度。以双向凝胶电泳分离各组血清蛋白质,考马斯亮蓝染色,扫描凝胶成像后,用PDQuest软件对各组血清蛋白质组表达图谱进行差异分析,选定差异点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-assisted Laser Desorption/ionization-Time of Flight-Mass Spectrometry,MALDI-TOF-MS)分析,Mascot软件搜索MSDB和SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果初步建立CRS阳虚水泛证、CRS气虚血瘀证及健康对照组3组血清蛋白质表达图谱,分别获得蛋白质点95、87和79个;13个蛋白质点在3组血清中呈现差异表达;初步鉴定其中的11个蛋白质分别为:生长分化因子15前体、N末端B型钠尿肽、高敏C反应蛋白、半乳凝素3、肾损伤分子-1、白细胞介素-18、促肾上腺髓质素、髓过氧化物酶、胱抑素C、脂联素、骨保护素。结论得到鉴定的11个蛋白质可能与心肾综合征阳虚水泛证、CRS气虚血瘀证发生发展密切相关,但其具体机制有待进一步研究。

关键词：心肾综合征证候实质蛋白质组学

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早期糖尿病肾病不同证候的尿蛋白组学研究

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中华中医药学刊 2015年第10期33卷 2311-2314页

作者：柴可夫马超王宏献浙江中医药大学浙江杭州310053 义乌市中医医院浙江义乌322000

目的:初步探讨尿液中蛋白的差异与早期糖尿病肾病不同中医证型之间的相关性。方法:对符合纳入标准的150例早期糖尿病肾病患者按中医辨证分型分为肝肾阴虚证组、气阴两虚证组和脾肾阳虚证组。用双向凝胶电泳(2-DE)结合质谱分析方法对3组... 详细信息

目的:初步探讨尿液中蛋白的差异与早期糖尿病肾病不同中医证型之间的相关性。方法:对符合纳入标准的150例早期糖尿病肾病患者按中医辨证分型分为肝肾阴虚证组、气阴两虚证组和脾肾阳虚证组。用双向凝胶电泳(2-DE)结合质谱分析方法对3组患者尿蛋白进行比较蛋白质组学分析。结果:在肝肾阴虚证高表达的蛋白质有:Nogo蛋白、单克隆抗体Ig M。在气阴两虚证高表达的有:动力蛋白、转铁蛋白、Ig Kappa链、和两种白蛋白。脾肾阳虚证高表达的蛋白质有:白蛋白(分子量52 047.8)、转甲状腺素蛋白、αl-抗胰蛋白酶。结论:这些差异蛋白与早期糖尿病肾病不同证候的形成有关,也为进一步研究证候实质提供依据。

关键词：早期糖尿病肾病证候实质尿蛋白组学

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冠心病不同证候的蛋白质组学研究

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辽宁中医杂志 2013年第7期40卷 1296-1301页

作者：朱明丹杜武勋姜民刘长玉张建平张红霞刘岩袁宏伟曹旭焱天津中医药大学天津300193 天津中医药大学第二附属医院天津300150 南开大学药学院天津300071

目的:中医的核心是辨证论治,辨证是基础,但中医"证"的内涵和规范化一直困扰着中医理论的发展。本研究运用蛋白组学的方法,旨在揭示冠心病病证结合的生物学基础,探索证候内涵研究的方法学。方法:采用荧光差异凝胶电泳和电喷雾... 详细信息

目的:中医的核心是辨证论治,辨证是基础,但中医"证"的内涵和规范化一直困扰着中医理论的发展。本研究运用蛋白组学的方法,旨在揭示冠心病病证结合的生物学基础,探索证候内涵研究的方法学。方法:采用荧光差异凝胶电泳和电喷雾质谱法(ESI-MS)等蛋白组学技术对冠心病四个主要证型(心气虚弱、心肾阴虚、痰浊内阻、心血瘀阻)各9例患者进行蛋白组学研究,得到的差异蛋白结合生物信息学技术进行深入的体内通路功能分析,探索冠心病不同证型的蛋白质表达差异并分析其相关性。结果:本研究发现的差异蛋白有凝血酶原、α2巨球蛋白、膜联蛋白A5、补体C3、甘露糖结合蛋白C、载脂蛋白A1、载脂蛋白E、载脂蛋白H、活化T细胞核因子5亚型b等,这些差异基因和蛋白涉及凝血系统、激肽释放酶-激肽系统、补体系统、脂代谢系统,Wnt途径、凋亡系统。结论:这些差异蛋白与不同证候的形成有关,有望作为证候实质的标志性蛋白。

关键词：冠心病证候实质蛋白质组学

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