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中国医科大学学报 2023年第9期52卷 843-846页

作者：崔楠张俊哲马群 Muisha B MBIKYO 李昭中国医科大学附属第一医院心血管内科沈阳110001

心血管疾病是影响人类健康、导致死亡的重要原因之一。转运rna衍生片段(tRFs)在心血管疾病的发生、发展中起重要作用,包括参与心肌肥厚的代际遗传,调节血管平滑肌的增殖、迁移和表型转换等。但tRFs的很多作用机制仍不明确,需要大量的研... 详细信息

心血管疾病是影响人类健康、导致死亡的重要原因之一。转运rna衍生片段(tRFs)在心血管疾病的发生、发展中起重要作用,包括参与心肌肥厚的代际遗传,调节血管平滑肌的增殖、迁移和表型转换等。但tRFs的很多作用机制仍不明确,需要大量的研究验证。本文主要概述了tRFs的分类、生物学功能,并对tRFs在心肌肥厚、主动脉夹层、血管平滑肌细胞表型转换中的研究进展进行总结、分析。

关键词：转运rna衍生片段生物学功能心血管疾病

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转运rna衍生片段在消化系统恶性肿瘤中的研究进展

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医学综述 2022年第24期28卷 4846-4852页

作者：张飞葛春林中国医科大学附属第一医院浑南院区肝胆胰外科沈阳110001

核酸内切酶可切割转运rna(trna),产生一类异质性的小非编码rna,即trna衍生片段(tRF)。在生物界中,tRF广泛存在,具有独特而多样的生物学功能,其在人类多种消化系统恶性肿瘤中异常表达,并在外周血循环中丰富且稳定表达,具有组织特异性。... 详细信息

核酸内切酶可切割转运rna(trna),产生一类异质性的小非编码rna,即trna衍生片段(tRF)。在生物界中,tRF广泛存在,具有独特而多样的生物学功能,其在人类多种消化系统恶性肿瘤中异常表达,并在外周血循环中丰富且稳定表达,具有组织特异性。通过类似微rna和蛋白海绵的作用机制,调控基因表达与翻译,参与肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。因此,tRF有望成为新的肿瘤标志物和潜在的治疗靶点,但目前其生物学机制尚未完全阐明,有待未来进一步探索。

关键词：消化系统恶性肿瘤转运rna衍生片段转运rna片段化转运rna半分子

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转运rna衍生片段15:31对TGF-β_(1)诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖和炎症反应的影响

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山东医药 2024年第20期64卷 30-34页

作者：夏梓桓单智杰乔云阳张爱青南京医科大学儿科学院南京医科大学第四附属医院儿科

目的观察转运rna衍生片段15:31-Arg-CCT-3-1(tRF-15:31)对转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖和炎症反应的影响。方法体外培养小鼠肾小球系膜细胞,将细胞分为tRF组、NC组、模型组和对照组。对照组使用正常... 详细信息

目的观察转运rna衍生片段15:31-Arg-CCT-3-1(tRF-15:31)对转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖和炎症反应的影响。方法体外培养小鼠肾小球系膜细胞,将细胞分为tRF组、NC组、模型组和对照组。对照组使用正常糖培养基培养细胞。tRF组、NC组、模型组以含10 ng/mL TGF-β_(1)的培养基培养24 h诱导CKD细胞模型;tRF组、NC组分别转染tRF-15:31 mimic和阴性对照。各组干预24 h后,采用CCK-8试剂盒检测细胞增殖能力,采用Western blotting法检测各组细胞中的纤维化指标[纤维连接蛋白(FN)、Ⅰ型胶原蛋白(ColⅠ)、α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)]和炎症指标[白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)]蛋白,采用逆转录定量PCR法检测FN、ColⅠ、α-SMA、IL-6、TNF-α mrna,采用ELISA法检测各组细胞培养液上清中的IL-6、TNF-α。结果模型组增殖活力高于对照组,模型组FN、ColⅠ、α-SMA、IL-6、TNF-α蛋白及mrna表达和培养液上清中IL-6、TNF-α水平高于对照组(P均<0.05);tRF组增殖活力低于NC组,tRF组FN、ColⅠ、α-SMA、IL-6、TNF-α蛋白及mrna表达和培养液上清中IL-6、TNF-α水平低于NC组(P均<0.05)。结论 tRF-15:31可抑制TGF-β_(1)诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖,并减少炎症因子分泌。

关键词：慢性肾脏病肾小球系膜细胞转运rna衍生片段细胞增殖炎症反应

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转运rna的表观遗传修饰及其异常对神经退行性变性疾病的影响

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浙江大学学报(医学版) 2025年第1期54卷 58-69页

作者：唐明敏毕洪运董子敬曾玲晖浙大城市学院医学院浙江杭州310015 浙江大学医学院附属第二医院神经内科浙江杭州310009 浙江大学良渚实验室浙江杭州311121 浙江大学医学院脑科学与脑医学学院浙江杭州310058

神经退行性变性疾病是一组以中枢或周围神经系统神经元的功能和结构完整性逐渐丧失为特征的神经系统疾病。这类疾病的病因复杂,致病机制及药物靶点的研究仍面临诸多难题。转运rna(trna)修饰在调节密码子识别、维持分子结构稳定性以及影... 详细信息

神经退行性变性疾病是一组以中枢或周围神经系统神经元的功能和结构完整性逐渐丧失为特征的神经系统疾病。这类疾病的病因复杂,致病机制及药物靶点的研究仍面临诸多难题。转运rna(trna)修饰在调节密码子识别、维持分子结构稳定性以及影响trna衍生片段(tRF)产生等方面发挥着关键作用,对神经发育和神经系统的生理功能具有重要作用。异常的trna修饰与多种神经退行性变性疾病的发病机制密切相关,特别是延伸因子复合物依赖的trna修饰和甲基化修饰异常能导致翻译过程和tRF水平变化,进而干扰蛋白质稳态和细胞应激反应,影响神经元存活。此外,神经退行性变性疾病患者体内tRF水平也显示出显著变化,特定tRF对神经退行性变性疾病有着不同的影响。本文从trna表观遗传修饰的生物学功能出发,深入探讨其异常在神经退行性变性疾病中的作用,包括经典的密码子识别功能和非经典的tRF生成机制,最后讨论了trna修饰可以作为治疗神经退行性变性疾病的潜在靶点。

关键词：神经退行性变性疾病转运rna 表观遗传修饰转运rna衍生片段综述

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胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tirna的差异表达及功能分析

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中国免疫学杂志 2025年第05期 1041-1047页

作者：陈代奕文宇琪何彩林胡恩杨曌宇熊新贵杨波中南大学湘雅医院中西医结合科

目的：探究胶原诱导性关节炎（CIA）大鼠血浆转运rna衍生片段（tRF）和转运rna半分子（tirna）的差异表达，并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析，为类风湿关节炎（RA）的诊断和治疗寻找新的靶点。方法：皮下注射Ⅱ型胶原建立R... 详细信息

目的：探究胶原诱导性关节炎（CIA）大鼠血浆转运rna衍生片段（tRF）和转运rna半分子（tirna）的差异表达，并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析，为类风湿关节炎（RA）的诊断和治疗寻找新的靶点。方法：皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型，通过关节炎指数（AI）积分、HE染色评价疾病模型；利用Illumina平台测序获取tRF和tirna表达谱，RT-qPCR用于tRF和tirna表达量的验证；结合miRanda和TargetScan数据库预测差异表达tRF和tirna的靶基因；GO和KEGG富集分析对靶基因功能进行注释。结果：CIA模型大鼠血浆共有25个差异表达的tRFs和tirnas，其中23个上调，2个下调；筛选出6个CIA大鼠特异性表达tRFs和tirnas，分别为Other-36:73-trna-Arg-CCT-4、Other-57:70-trna-Glu-CTC-1-M3、tRF-1:32-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:31-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:32-Pro-AGG-1-M4和tRF-1:32-Glu-TTC-2-M2，其靶基因GO分析主要涉及细胞器相关条目，KEGG分析富集到多条与RA相关的经典信号通路。结论：差异表达tRFs和tirnas的靶基因可能参与调控RA的重要病理生理过程及药物治疗的作用靶点。

关键词：类风湿关节炎胶原诱导性关节炎转运rna衍生片段转运rna半分子

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胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tirna的差异表达及功能分析

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中国免疫学杂志 2024年

作者：陈代奕文宇琪何彩林胡恩杨曌宇熊新贵杨波中南大学湘雅医院中西医结合科

目的：探究胶原诱导性关节炎（collagen-induced arthritis，CIA）大鼠血浆转运rna衍生片段（trna-derived rna fragment，tRF）和tirna的差异表达，并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析，为类风湿性关节炎（rheumatoid arthri... 详细信息

目的：探究胶原诱导性关节炎（collagen-induced arthritis，CIA）大鼠血浆转运rna衍生片段（trna-derived rna fragment，tRF）和tirna的差异表达，并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析，为类风湿性关节炎（rheumatoid arthritis，RA）的诊断和治疗寻找新的靶点。方法：皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型，通过关节炎指数（arthritis index，AI）积分、H&E染色评价疾病模型；利用Illumina平台测序获取tRF和tirna表达谱，RT-qPCR用于tRF和tirna表达量的验证；结合miRanda和TargetScan数据库预测差异表达tRF和tirna的靶基因；基因本体（Gene Ontology，GO）和京都基因和基因组数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）富集分析对靶基因功能进行注释。结果：CIA模型大鼠血浆共有25个差异表达的tRF和tirna，其中23个上调，2个下调；筛选出6个CIA大鼠特异性表达tRF和tirna，分别是Other-36:73-trna-Arg-CCT-4、Other-57:70-trna-Glu-CTC-1-M3、tRF-1:32-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:31-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:32-Pro-AGG-1-M4和tRF-1:32-Glu-TTC-2-M2，其靶基因GO分析主要涉及细胞器相关条目，KEGG分析富集到多条与RA相关的经典信号通路。结论：差异表达的tRF和tirna的靶基因可能参与调控RA的重要病理生理过程及药物治疗的作用靶点。

关键词：类风湿关节炎胶原诱导性关节炎转运rna衍生片段转运rna半分子

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转运rna衍生的小rna功能及其研究方法

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遗传 2021年第12期43卷 1107-1120页

作者：马剑峰甘麦邻朱砺沈林園四川农业大学动物科技学院成都611130 四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室成都611130

转运rna衍生的小rna(trna-derived small rnas,tsrna)是近年来发现的一类由成熟trna或trna前体通过特殊的作用机制加工产生的非编码rna。根据其产生方式的不同,主要分为trna半分子(trna halves)和trna衍生片段(trna-derived rna fragments,tRFs)两种类型。tsrna广泛存在于各种生物体中,具有高度保守、结构稳定和组织表达特异性等特点。大量研究表明,多种细胞应激反应中tsrna的表达显著上升,其参与应激反应的调控是一种保守的生物现象。tsrna可通过调控转录本稳定性、调节翻译和作为表观遗传调控因子等方式在多种生物学过程中发挥重要作用,此外,tsrna具有作为疾病生物标志物和治疗靶点的潜力,逐渐成为生物医学领域中的研究热点。本文从tsrna的生物发生、功能和研究方法3个方面,对其研究现状进行了综述,以期为后续研究提供参考。

关键词：非编码rna 转运rna衍生片段 tsrna tRFs

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circ1811及tirna-Val-TAC-004在胃癌恶性进展中作用机制及临床意义

circ1811及tiRNA-Val-TAC-004在胃癌恶性进展中作用机制及临床意义

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作者：付敏江苏大学

学位级别：博士

目的: 研究环状rna(circular rna,circrna)及转运rna衍生片段(t rna-derived fragments,t RF)在胃癌组织中的表达谱,筛选验证胃癌中差异表达的circrna及t RF。建立circ1811及tirna-Val-TAC-004的检测方法,考察其表达水平与胃癌患者病理参数的相关性,评价其临床意义。研究circ1811及tirna-Val-TAC-004对于胃癌细胞增殖、迁移、侵袭等生物学功能的影响,探讨它们调控胃癌发展的分子机制,为胃癌诊疗提供新的思路。方法: 1.通过分析GEO数据库circrna芯片表达谱数据筛选胃癌差异表达的circrna,设计反向引物对候选circrna分子进行q RT-PCR验证,筛选出胃癌组织中低表达的hsa＿circ＿0001811(circ1811)。采用正反向引物定量扩增g DNA结合rnase R耐受性实验,验证circ1811的环状结构。采用FISH与核质分离实验分析circrna的亚细胞定位。采用q RT-PCR检测胃癌组织中circ1811的表达情况,结合临床病理资料分析其临床相关性,绘制ROC曲线,并采用Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,Log-rank检验方法分析circ1811表达水平与患者生存期的相关性。 2.通过circ1811过表达质粒/sirna转染胃癌细胞,q RT-PCR检测过表达/敲减效果,建立circ1811过表达/敲减的胃癌细胞模型。采用生长曲线、克隆形成实验检测细胞生长增殖情况,用Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒和流式细胞术检测细胞凋亡,用Transwell体外迁移和侵袭实验检测细胞迁移侵袭能力,采用免疫缺陷BALB/c裸鼠进行体内实验,注射circ1811过表达组、空载体组胃癌细胞构建致瘤模型,考察肿瘤的大小、重量、体积并对瘤体组织切片进行HE染色及免疫组化分析。 3.采用RIP实验验证circ1811是否能够与AGO2蛋白结合,通过生物信息学网站分析预测circ1811可能发生结合的mi rna,采用双荧光素酶报告基因实验和q RT-PCR验证确定目标mi rna mi R-632。使用生长曲线、克隆形成、凋亡检测和Transwell迁移侵袭实验考察过表达mi R-632对胃癌细胞的增殖、凋亡和转移能力的影响,用回补实验观察mi R-632共转染对circ1811抑癌作用的影响。采用mi RDB、Target Scan和Tar Base数据库预测mi R-632可能作用的靶m rna,使用q RT-PCR和荧光素酶报告基因实验进行验证,确定靶基因为DAPK1,采用DAPK1过表达质粒回补考察其对mi R-632促癌作用的影响,同时考察DAPK1敲减对circ1811抑制胃癌作用的影响,验证circ1811通过mi R-632/DAPK1轴调控胃癌进展。 4.采用4对胃癌肿瘤及配对非癌组织进行t RF测序,对t RF测序结果进行主成分分析、相关系数分析,描述t RF在胃癌组织中的亚组分布情况,统计胃癌差异表达的t RF。建立t RF的q RT-PCR检测方法,通过熔解曲线考察方法的特异性,采用胃癌组织样本逐步验证差异表达的t RF,对通过验证的分子tirna-Val-TAC-004进行扩大样本检测,考察其与胃癌患者临床病理参数的相关性。 5.构建tirna-Val-TAC-004过表达胃癌细胞株,考察tirna-Val-TAC-004过表达对胃癌细胞生长曲线、克隆形成、细胞周期、迁移、侵袭能力的影响。对t RF测序结果进行GO和KEGG分析,考察tirna-Val-TAC-004可能参与的生理过程及信号通路,对GO和KEGG富集的差异基因取交集,预测tirna-Val-TAC-004可能的靶基因,用q RT-PCR进行初步验证。结果: 1.通过对人类circrna芯片数据集GSE89143和GSE93541合并分析,筛选、验证确定胃癌组织中显著表达下调的circrna circ1811为后续研究对象。circ1811来源于STAU2基因的4号和5号外显子反向剪接,具有共价闭合环状结构,在细胞核和细胞质中均有分布,且主要定位在细胞质。胃癌组织中circ1811的表达与患者淋巴结转移程度显著相关,且其低表达提示不良预后。 2.所构建的circ1811过表达质粒/sirna转染胃癌细胞HGC-27和AGS具有较高的过表达/敲减效率,功能学实验发现circ1811过表达显著抑制胃癌细胞增殖、迁移、侵袭及促进凋亡,而circ1811敲减会得到相反的结果。裸鼠成瘤实验显示,circ1811能够在体内显著抑制胃癌细胞的增殖。 ***实验显示circ1811可以与AGO2蛋白

关键词：环状rna 胃癌 microrna 转运rna衍生片段

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低氧肿瘤微环境通过下调tRF-21-3OPP6N7KE的表达促进结肠癌转移分子机制研究

低氧肿瘤微环境通过下调tRF-21-3OPP6N7KE的表达促进结肠癌转移分...

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作者：陈义全浙江大学

学位级别：硕士

背景和目的tRFs（t rna-related fragments）是衍生于t rna的非编码小分子rna片段,近年来大量研究表明,这种小分子片段在人体发挥各种生物学功能,而且与各种疾病都有着显著关联。在多种恶性肿瘤中,t RFs的异常表达促进了肿瘤的进展。然... 详细信息

背景和目的tRFs（t rna-related fragments）是衍生于t rna的非编码小分子rna片段,近年来大量研究表明,这种小分子片段在人体发挥各种生物学功能,而且与各种疾病都有着显著关联。在多种恶性肿瘤中,t RFs的异常表达促进了肿瘤的进展。然而,t RFs与结肠癌进展之间的调节关系在很大程度上仍然未知。本研究旨在探讨低氧条件下结肠癌细胞中关键t RF的功能,并探讨其潜在的分子机制。实验方法常氧和1%O2环境下培养结肠癌RKO细胞,q PCR和免疫印迹方法检测HIF-1α的表达。采用全转录本测序和生物信息学方法检测常氧和1%O2环境下RKO细胞中t RFs的表达。将t RF-21-3OPP6N7KE模拟物和抑制剂分别转染到RKO和SW480结肠癌细胞中,构建稳定的细胞系。采用Transwell法和MTT法分别检测结肠癌细胞的迁移、侵袭和增殖能力。然后,用q PCR方法检测上皮间充质转化（epithelial-to-mesenchymal transition,EMT）相关生物标志物和基质金属蛋白酶（matrix metalloproteinase,MMPs）的表达。并用免疫印迹的方法检测TGF-β1（Transforming growth factorβ1）的表达。结果qPCR和免疫印迹结果表明低氧环境培养下的RKO细胞株HIF-1α的表达升高。全转录本测序结果显示,低氧条件下RKO细胞中一组t RFs差异表达。其中,经q RT-PCR结果验证,t RF-21-3OPP6N7KE表达显著降低。细胞功能实验结果表明降低t RF-21-3OPP6N7KE表达可促进结肠癌细胞迁移和侵袭,但不影响增殖。此外,t RF-21-3OPP6N7KE表达的下调促进了TGF-β1的表达,并增强了基质金属蛋白酶MMPs、间充质生物标志物N-cadherin以及EMT相关转录因子Snail1、Snail2（slug）、ZEB1的转录。结论和意义通过上述实验结果,我们发现低氧肿瘤微环境通过下调t RF-21-3OPP6N7KE的表达,诱导上皮间充质转化,并激活MMPs以溶解细胞外基质,从而促进结肠癌细胞迁移和侵袭,而TGF-β1可能在这一过程中发挥着重要作用。t RF-21-3OPP6N7KE这种t rna来源的小分子片段在结肠癌细胞中发挥着抑癌作用,可能成为精准治疗的新靶点。

关键词：转运rna衍生片段结肠癌低氧肿瘤微环境转移基质金属蛋白酶上皮间充质转化

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TRF及其在肿瘤中作用的研究进展

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医学综述 2020年第8期26卷 1526-1530页

作者：单世婷朱春富南京医科大学研究生学院南京210029 南京医科大学附属常州第二人民医院肝胆外科江苏常州213000

转运rna衍生片段属于非编码小rna家族成员。TRF具有多种生物学功能,包括作为应激反应中的信号分子和基因表达的调节因子。此外,TRF还参与rna加工、细胞增殖、翻译抑制、基因表型的遗传、细胞凋亡和免疫调节。TRF与癌症的发生、进展和化... 详细信息

转运rna衍生片段属于非编码小rna家族成员。TRF具有多种生物学功能,包括作为应激反应中的信号分子和基因表达的调节因子。此外,TRF还参与rna加工、细胞增殖、翻译抑制、基因表型的遗传、细胞凋亡和免疫调节。TRF与癌症的发生、进展和化疗耐药有密切关系,在乳腺癌及其耐药细胞、前列腺癌、结直肠癌组织中明显高表达。肿瘤细胞中特异性表达TRF,研究其在乳腺癌耐药中的作用机制,可能使其成为一种新的生物学标志物来指导临床诊断和治疗。

关键词：转运rna 转运rna衍生的小rna 转运rna衍生片段肿瘤化疗耐药

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