检索结果-内蒙古大学图书馆

中华耳科学杂志 2022年第6期20卷 873-878页

作者：黄卫彤刘锦嵩王宗杰廖旺张峰朱茂灵鄢盛恺南宁市妇幼保健院南宁530011 遵义医科大学附属医院检验科遵义563003 遵义医科大学检验医学院遵义563006 中国科学院北京基因组学研究所北京100101

目的研究南宁市新生儿耳聋基因突变情况,评估新生儿听力筛查准确性,探讨突变位点与听力损失的关系。方法采用耳声发射和自动听性脑干诱发电位反应对出生于2016年1月-2018年12月的17000例新生儿进行听力初筛、复筛及确诊检查,针对GJB2、G... 详细信息

目的研究南宁市新生儿耳聋基因突变情况,评估新生儿听力筛查准确性,探讨突变位点与听力损失的关系。方法采用耳声发射和自动听性脑干诱发电位反应对出生于2016年1月-2018年12月的17000例新生儿进行听力初筛、复筛及确诊检查,针对GJB2、GJB3、SLC26A4基因对1007例听力初筛未通过的新生儿进行靶向捕获高通量测序,结合生物信息学分析,明确突变位点致病性。结果1007例初筛未过的新生儿中,确诊听力损失78例,355例(35.25%,355/1007)检出突变耳聋基因,其中237例检出12种“致病的”或“可能致病的”突变位点,78例检出新错义突变位点(GJB2:c.217C>A、c.316T>G、c.676G>T;SLC26A4:c.739T>C),13例听力确诊正常者检出11种非编码区突变。GJB2、GJB3、SLC26A4基因的突变携带率分别为1.75%、0.66%、0.36%。GJB2:c.79G>A和GJB3:c.357C>T、c.341A>G、c.608T>C的等位基因频率符合哈迪-温伯格遗传平衡定律,GJB2:c.79G>A(Z=3.082;P<0.01)、c.109G>A(Z=10.670;PT(Z=2.902;P<0.01)、c.341A>G(Z=2.798;P<0.001)与听力损失的关联具有统计学意义。结论本研究证实GJB2 c.109G>A是南宁市新生儿携带率最高的耳聋基因突变位点。结合听力和基因检测是临床早期干预非综合征型听力损失更有效的策略。

关键词：遗传性听力损失新生儿耳聋基因听力筛查靶向捕获高通量测序

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基于多重PCR靶向捕获测序技术对241个非倒位型血友病A家系进行F8基因突变谱分析

基于多重PCR靶向捕获测序技术对241个非倒位型血友病A家系进行F8...

引用

作者：黄丽敏南方医科大学

学位级别：硕士

研究背景及目的血友病A(Hemophilia A,HA)是一种X连锁隐性遗传出血性疾病,是最常见的严重遗传性凝血功能障碍,该病是由于编码凝血因子Ⅷ(Coagulation factorⅧ,FⅧ)的基因(F8基因)缺陷导致FⅧ合成减少或不足引起的,具有出血倾向是该病... 详细信息

研究背景及目的血友病A(Hemophilia A,HA)是一种X连锁隐性遗传出血性疾病,是最常见的严重遗传性凝血功能障碍,该病是由于编码凝血因子Ⅷ(Coagulation factorⅧ,FⅧ)的基因(F8基因)缺陷导致FⅧ合成减少或不足引起的,具有出血倾向是该病主要的临床表现,常见的受累组织包括粘膜,肌肉,皮下,关节和重要脏器等。目前HA最有效的治疗手段仍然是替代治疗,患者需长期输注外源性FⅧ,然而抑制物的发展是与替代治疗相关的最严重并发症之一,大大降低了治疗效果,给患者及其家庭带来沉重负担。研究表明,F8基因突变类型与疾病的严重程度、出血表型、抑制物的发展等密切相关,因此,对血友病患者及其家系、携带者进行基因诊断,对于早期诊断、早期预防、预后管理具有重要的理论意义和现实意义。此外,基因治疗有望能够根治该病,对F8基因突变类型的了解将允许临床医生根据基因型和潜在的抑制物发展风险对治疗结果进行分析。研究方法我们收集了 241个经过南方医院确诊的非倒位型HA家系,采用多重PCR靶向捕获测序技术对HA家系的血友病相关基因的全部外显子及外显子内含子邻接10bp进行测序,使用自主开发的整合生物信息学分析系统对测序结果进行注释、解读,并且根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)序列突变注释标准对其进行致病等级的划分,筛选出致病位点。使用Ion Reporter软件对大片段缺失/重复进行分析。随后将高通量测序结果与Sanger测序结果进行比较。研究结果在241个HA家系中,一共在222个HA家系中检测到了 186个F8基因突变位点,检出率为92.12%(222/241)。有19个家系的F8基因的目标测序区域没有检测到可能的致病突变。Sanger测序结果与高通量结果一致。在检出的186个F8基因突变中,139个为点突变(139/186,74.73%),44个为(44/186,23.66%)小片段插入/缺失,3个为大片段缺失。我们鉴定了 69新突变,并对其中的错义突变和无义突变采用蛋白功能预测软件进行了分析。我们发现了 3 个共同突变:c.3780C>G(***1260Glu)、c.6724G>A(***2242Met)和c.3169G>A(***1057Lys),在我们的研究队伍中这3个突变的频率为分别6.22%(15/241)、3.32%(8/241)、2.90%(7/241)。此外,我们发现了 3 个特殊家系,先证者的外公无出血表型,错义突变可能是导致临床表型异质性的原因之一。研究结论本研究采用多重PCR靶向捕获测序技术对241个非倒位型HA家系进行F8基因突变研究,我们的研究结果证明多重PCR靶向捕获测序可以对除了内含子22倒位、1倒位以外的所有F8基因突变类型进行检测。首次发现并鉴定了 69个F8基因新突变,并对这些位点进行了生物信息学分析,丰富了F8基因突变谱,此外,我们发现了3个临床表型异质性的特殊家系,提出错义突变可能是导致临床表型异质性的原因之一,以上研究对进一步了解基因型-表型研究具有重要意义。

关键词：血友病A F8 基因突变靶向捕获高通量测序

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靶向捕获测序鉴定先天性白内障的致病基因

引用

中国实用眼科杂志 2018年第4期36卷 333-336页

作者：马明福崔蓉赵乐天李练兵程志重庆市人口和计划生育科学技术研究院/国家卫生计生委出生缺陷与生殖健康重点实验室重庆400020 重庆医科大学细胞生物学与遗传学教研室重庆400016

目的探讨外显子靶向捕获结合高通量测序技术在先天性白内障基因诊断中的应用价值方法收集1个先天性白内障家系先证者外周血,提取基因组DNA,并制备基因组文库。用GenCap基因序列捕获技术靶向富集文库中28个先天性白内障已知致病基因的外... 详细信息

目的探讨外显子靶向捕获结合高通量测序技术在先天性白内障基因诊断中的应用价值方法收集1个先天性白内障家系先证者外周血,提取基因组DNA,并制备基因组文库。用GenCap基因序列捕获技术靶向富集文库中28个先天性白内障已知致病基因的外显子并进行高通量测序。通过生物信息学分析筛选致病突变。用Sanger测序验证相应致病基因突变位点。结果高通量测序获得了712.29 Mb的原始数据,测序数据经过生物信息学分析,发现CRYAA基因突变位点c.145C>T,突变导致CRYAA 49位精氨酸残基突变为半胱氨酸残基。Sanger测序验证了高通量测序的结果。结论利用靶向捕获结合高通量测序技术可鉴定先天性白内障的致病基因突变,对先天性白内障的临床基因诊断具有潜在的应用价值。

关键词：先天性白内障遗传诊断靶向捕获高通量测序

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先天性白内障致病基因EPHA2的筛查与鉴定

引用

河北医学 2018年第8期24卷 1245-1249页

作者：李乾杨振菲常亮国家卫生计生委科学技术研究所国家人类遗传资源中心北京100081 国家康复辅具研究中心附属康复医院眼科北京100176 北京大学第三医院妇产科生殖医学中心北京100191

目的:应用新一代高通量测序技术研究一个连续三代都有患病的先天性白内障家系的致病基因。方法:采用已知候选基因靶向捕获富集的方法并结合二代测序技术,筛选出候选突变,应用Sanger测序对其进行验证及家系内的共分离检验,之后对其进行... 详细信息

目的:应用新一代高通量测序技术研究一个连续三代都有患病的先天性白内障家系的致病基因。方法:采用已知候选基因靶向捕获富集的方法并结合二代测序技术,筛选出候选突变,应用Sanger测序对其进行验证及家系内的共分离检验,之后对其进行信息学预测。结果:该家系共七名患者,遗传方式符合常染色体显性遗传规律。靶向基因测序发现了EPHA2基因的一个杂合突变c.1532C>T,该变异造成EPHA2基因编码的跨膜蛋白受体氨基酸序列错义改变(p.T511M),信息学预测表明E-PHA2氨基酸511位在物种进化上保守且T511M突变引起蛋白质功能改变,Sanger测序结果表明该突变可信并且在先天性白内障家系内与疾病表型共分离。结论:EPHA2基因c.1532C>T(p.T511M)可能是本研究先天性白内障家系的致病突变。病基因。方法:采用已知候选基因靶向捕获富集的方法并结合二代测序技术,筛选出候选突变,应用Sanger测序对其进行验证及家系内的共分离检验,之后对其进行信息学预测。结果:该家系共七名患者,遗传方式符合常染色体显性遗传规律。靶向基因测序发现了EPHA2基因的一个杂合突变c.1532C>T,该变异造成EPHA2基因编码的跨膜蛋白受体氨基酸序列错义改变(p.T511M),信息学预测表明EPHA2氨基酸511位在物种进化上保守且T511M突变引起蛋白质功能改变,Sanger测序结果表明该突变可信并且在先天性白内障家系内与疾病表型共分离。结论:EPHA2基因c.1532C>T(p.T511M)可能是本研究先天性白内障家系的致病突变。

关键词：先天性白内障靶向捕获高通量测序 EPHA2 突变

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