检索结果-内蒙古大学图书馆

中国肺癌杂志 2014年第3期17卷 238-242页

作者：夏金晶白浩熊丽纹李蓉颜波邵敏华韩宝惠上海交通大学医学院附属上海市胸科医院呼吸内科上海200030

背景与目的 BIM基因编码的蛋白属于BCL2蛋白家族的成员,作为凋亡调控因子参与多种细胞活动。BIM基因上2,903bp的插入缺失片段与非小细胞肺癌EGFR-TKI靶向用药的获得性耐药相关。建立并优化HRM方法有助于快速、准确地检测BIM基因2,903 b... 详细信息

背景与目的 BIM基因编码的蛋白属于BCL2蛋白家族的成员,作为凋亡调控因子参与多种细胞活动。BIM基因上2,903bp的插入缺失片段与非小细胞肺癌EGFR-TKI靶向用药的获得性耐药相关。建立并优化HRM方法有助于快速、准确地检测BIM基因2,903 bp片段的缺失,为临床工作提供指导性的意见。本研究建立与稳定了HRM的检测方法,并在30例肺癌样本以及30例正常对照样本中检测BIM基因缺失情况。方法设计、合成针对BIM基因片段缺失的引物,优化高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析方法。并选取部分样本通过普通PCR方法和直接测序法检测BIM基因缺失情况。野生型模板扩增产物其解链温度要高于缺失型产物的解链温度。野生型和缺失型产物的熔解曲线可见明显差异,相应的Tm值相差约2.5 oC。结果经过HRM基因突变分析方法,在30例肺癌样本中检测到1例为BIM基因纯合缺失型,7例为杂合缺失型,22例为野生型。在30例正常对照样本中检测,2例为杂合缺失型,28例为野生型。结论本研究建立的对BIM基因片段缺失的高分辨率熔解曲线法是一种,灵敏、准确、快速、高通量的方法。

关键词：高分辨率熔解曲线法 BIM基因肺肿瘤

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高分辨率熔解曲线法检测JAK2基因V617F突变及其应用

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临床检验杂志 2011年第8期29卷 602-604页

作者：郑卫东方伟刘艳辉罗盈杜欣陈志红广东省人民医院广东省医学科学院检验科广州510080 广东省人民医院广东省医学科学院病理科广州510080 广东省人民医院广东省医学科学院血液科广州510080 广东省人民医院广东省医学科学院医学研究中心广州510080

目的探讨实时定量PCR方法和高分辨率熔解曲线法(HRM)在检测JAK2基因V617F突变中的应用。方法以JAK2基因V617F发生纯合突变的人红白血病细胞株(HEL)及不含JAK2基因V617F突变的人白血病细胞株(HL60)为阳性对照和阴性对照,优化HRM法检测条... 详细信息

目的探讨实时定量PCR方法和高分辨率熔解曲线法(HRM)在检测JAK2基因V617F突变中的应用。方法以JAK2基因V617F发生纯合突变的人红白血病细胞株(HEL)及不含JAK2基因V617F突变的人白血病细胞株(HL60)为阳性对照和阴性对照,优化HRM法检测条件,分别以优化的HRM法和直接测序法对63例临床疑似骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者DNA标本进行JAK2基因V617F突变检测,评价2种检测方法结果的一致性。结果 HRM法可检出系列混合样本中5%的突变型等位基因突变,且重复性较高。以测序法为金标准,HRM法的敏感性和特异性均为100%,两种方法结果一致。结论 HRM法能够在单一闭管体系中实现对JAK2基因V617F突变的检测,具有较高的敏感性和特异性,可用于JAK2基因V617F突变的临床检测。

关键词：高分辨率熔解曲线法 JAK2基因 V617F突变骨髓增殖性肿瘤

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建立高分辨率熔解曲线法筛选含VEB-3型基因菌株

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中华微生物学和免疫学杂志 2010年第10期30卷 956-958页

作者：李刚魏取好倪瑛乔王艳艳杜昕蒋晓飞复旦大学附属金山医院检验科 200540 复旦大学附属华山医院检验科 200040

目的建立高分辨率熔解曲线法筛选含VEB-3型基因菌株.方法不重复收集2003年1-12月革兰阴性杆菌产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）菌株292株,用酚-氯仿法抽提基因组DNA;首先以基因组DNA为模板,PCR扩增VEB基因;挑选阳性菌株34株再PCR扩增包含... 详细信息

目的建立高分辨率熔解曲线法筛选含VEB-3型基因菌株.方法不重复收集2003年1-12月革兰阴性杆菌产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）菌株292株,用酚-氯仿法抽提基因组DNA;首先以基因组DNA为模板,PCR扩增VEB基因;挑选阳性菌株34株再PCR扩增包含168位点的一段约110 bp的基因片段,高分辨率熔解曲线（high resolution melt,HRM）分析后测序验证.结果 VEB-3亚型与其他亚型基因通过HRM分析具有显著的差别;测序结果与HRM分型结果一致.结论应用HRM技术可以准确快速筛选含VEB-3型基因菌株.

关键词： VEB-3亚型高分辨率熔解曲线法超广谱β-内酰胺酶

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高分辨率熔解曲线法检测中国北方汉族人群KIF6基因的单核苷酸多态性

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中国临床研究 2012年第12期25卷 1161-1163,I0001页

作者：吴歌李贵斌戴彬张冬青吉林大学第四医院国家药物临床试验机构长春市130011 吉林大学第四医院骨科长春市130011 吉林大学第四医院心内科长春市130011

目的探讨用新型基因分析法-高分辨率熔解曲线法(high resolution melting,HRM)分析中国北方汉族人群驱动蛋白分子6(KIF6)基因Trp719Arg(rs20455)的单核苷酸多态性。方法样本来自2010至2011年心内科门诊及住院的234例非致死性心肌梗死患... 详细信息

目的探讨用新型基因分析法-高分辨率熔解曲线法(high resolution melting,HRM)分析中国北方汉族人群驱动蛋白分子6(KIF6)基因Trp719Arg(rs20455)的单核苷酸多态性。方法样本来自2010至2011年心内科门诊及住院的234例非致死性心肌梗死患者(病例组)和228例非冠心病人群(对照组)。取受检者静脉血样1ml,留存于-80℃超低温冰箱。采用HRM法对rs20455位点进行基因多态性分型检测。结果对照组中rs20455位点TT、TC、CC基因型频率分别为29.5%、47.4%、23.1%;T、C等位基因频率分别为47.0%和53.0%;病例组的基因型频率是TT14.0%、TC59.7%、CC26.3%,T、C等位基因频率分别为56.0%和44.0%;病例组与对照组基因型和等位基因频率在2组间分布差异有统计学意义(P均<0.05)。结论成功利用HRM对中国北方非致死性心肌梗死患者和非冠心病人群的KIF6Trp719Arg位点进行了基因分型,并发现其在心肌梗死患者和非冠心病人群中分布差异有统计学意义,提示rs20455可能是中国北方汉族人群中非致死性心肌梗死筛查的生物学标记物之一。

关键词：心肌梗死,非致死性高分辨率熔解曲线法驱动蛋白分子6 单核苷酸多态性

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检测AKT1基因E17K突变的高分辨率熔解曲线法(HRM)

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科学技术与工程 2010年第26期10卷 6405-6408页

作者：任浩洋中国人民解放军总医院药品中心南楼药房北京100853

建立并优化HRM方法检测AKT1基因的E17K(49G>A)突变,并在85例非小细胞肺癌中应用该法检测AKT1基因的E17K突变。设计、合成针对AKT1基因的E17K突变的引物、探针,优化不对称PCR条件及高分辨率熔解曲线(HRM)基因突变分析方法。对85例非... 详细信息

建立并优化HRM方法检测AKT1基因的E17K(49G>A)突变,并在85例非小细胞肺癌中应用该法检测AKT1基因的E17K突变。设计、合成针对AKT1基因的E17K突变的引物、探针,优化不对称PCR条件及高分辨率熔解曲线(HRM)基因突变分析方法。对85例非小细胞肺癌标本提取的基因组DNA,应用HRM基因突变分析方法和直接测序的方法检测了AKT1基因的E17K突变情况。经优化后,设计的引物在不对称PCR反应条件下可扩增出良好的条带。检测探针与野生型模板的扩增产物杂交后,其解链温度要高于与突变型产物杂交的解链温度。野生型和突变型的质粒模板所产生的熔解曲线可见显著差异,相应的Tm值相差约3.5℃。经HRM基因突变分析方法和直接测序法检测,在85例非小细胞肺癌标本检测到1例AKT1基因的E17K位点为杂合突变型,其余均为野生型。本研究建立的对AKT1E47K突变检测的HRM方法是一种灵敏、准确、快速的方法。另外,本研究仅在非小细胞肺癌患者中发现频率极低的AKT1E47K突变。

关键词：高分辨率熔解曲线法 AKT1基因非小细胞肺癌

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原发性高血压SCNN1G基因多态性特征分析

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临床心血管病杂志 2020年第4期36卷 371-374页

作者：翟英南邵博宇杨畅徐岩陈思秀刘玟妍王玉格李明成高丽君张亚丽赵云冬潘晓明北华大学医学技术学院吉林132013 吉林省中药DNA指纹检测技术科技创新中心吉林市中心医院

目的:本实验通过分析SCNN1G基因rs5729的基因型及等位基因分布特点,探究此基因单核苷酸多态性与原发性高血压(EH)的关系。方法:采用高分辨率熔解曲线法(high resolution melting,HRM)对rs5729位点进行基因多态性分型检测。样本来自2018-... 详细信息

目的:本实验通过分析SCNN1G基因rs5729的基因型及等位基因分布特点,探究此基因单核苷酸多态性与原发性高血压(EH)的关系。方法:采用高分辨率熔解曲线法(high resolution melting,HRM)对rs5729位点进行基因多态性分型检测。样本来自2018-06-2019-07吉林市中心医院高血压患者115例(病例组)和非高血压人群88例(对照组)。同时,在上述样本中随机选取81例采用测序法进行验证。结果:病例组的基因型频率是TT 67.82%、AT 25.22%、AA 6.96%,T、A等位基因频率分别为80.43%和19.57%;对照组中rs5729位点TT、AT、AA基因型频率分别为89.77%、9.10%、1.13%;T、A等位基因频率分别为94.32%和5.68%;病例组和对照组的基因型与等位基因频率在2组间分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论:利用HRM法对SCNN1Grs5729位点进行基因分型,发现其在高血压人群中分布存在差异。

关键词：高分辨率熔解曲线法基因型高血压

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微卫星不稳定性(MSI)检测技术专家共识

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临床与实验病理学杂志 2024年第3期40卷 228-235页

作者：中国医师协会医学技师委员会病理技术专家组中国医学装备协会病理装备分会标准化部中国研究型医院学会病理学专业委员会病理技术学组中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会病理技术学组杨军徐志杰朱卫东张静师艺丁伟不详南京大学医学院附属鼓楼医院中南大学湘雅医院苏州大学附属第一医院复旦大学附属肿瘤医院新疆医科大学第一附属医院

微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)是DNA复制过程中形成大量移码突变、引起的核苷酸重复单元数量改变的现象,多种肿瘤中均可见MSI,常见于结直肠癌、子宫内膜癌和胃癌。MSI检测对多种实体瘤患者有重要意义,包括林奇综合征... 详细信息

微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)是DNA复制过程中形成大量移码突变、引起的核苷酸重复单元数量改变的现象,多种肿瘤中均可见MSI,常见于结直肠癌、子宫内膜癌和胃癌。MSI检测对多种实体瘤患者有重要意义,包括林奇综合征筛查、指导5-FU类化疗药物的选择、预后分层和筛选免疫检查点抑制剂获益人群等。目前,MSI检测主要包括PCR+毛细管电泳法、PCR+高分辨率熔解曲线法和N GS法,其中以PCR+毛细管电泳法为金标准。

关键词：微卫星微卫星不稳定性错配修复毛细管电泳法高分辨率熔解曲线法 NGS 专家共识

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绵羊IGF1基因表达、多态性与毛用性能相关分析

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聊城大学学报（自然科学版） 2021年第2期34卷 59-64页

作者：罗新惠张立春刘艳光柳俭强翟博曹阳张明新金海国吉林省农业科学院动物生物技术研究所吉林公主岭136100 延边大学农学院吉林延吉130021

为探讨绵羊胰岛素样生长因子1(Insulin-like growth factor 1,IGF1)基因与毛用性状的关系,本实验首先通过RT-PCR(Reverse Transcript Polymerase Chain Reaction)法从新吉细毛羊皮肤组织中克隆出IGF1基因,并利用ELISA和qRT-PCR(Quantity reverse transcript polymerase chain reaction)法检测比较新吉细毛羊和小尾寒羊外周血和皮肤组织中IGF1表达差异,再利用HRM(High-resolution melting)方法检测IGF1基因在新吉细毛羊、小尾寒羊和陶赛特羊群体中的多态性,最后进行单因素方差分析检验IGF1不同基因型与新吉细毛羊毛用性状的相关性。结果表明绵羊皮肤组织中表达IGF1基因,新吉细毛羊外周血和皮肤组织中的IGF1表达水平略高于小尾寒羊,但差异不显著。PCR测序结果显示存在c.110 C>T和c.153 T>C多态性位点,其中c.110 C>T引起a.37 Ala>Val突变。进一步HRM方法结合测序结果显示新吉细毛羊、小尾寒羊和陶赛特绵羊三个群体中c.153 T>C存在三种基因型(TT、CT、CC),TT纯合型在三个群体中频率最低,且在新吉细毛羊群体内呈现出Hardy-weinberg极度不平衡状态(p<0.0001)。单因素方差分析结果显示TT基因型在拉伸长度和产毛量指标方面高于CC基因型(p<0.05)。绵羊IGF1基因多态性的发现与毛用性状相关分析将为绵羊毛用性状育种实践奠定基础。

关键词： IGF1基因多态性新吉细毛羊绵羊毛用性能高分辨率熔解曲线法

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HRM-非标记探针法检测CCL2-2518T>C突变方法的建立

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中华临床医师杂志（电子版） 2014年第13期8卷 92-94页

作者：雷洪恩高喆珠许永德辛钟成郭应禄关瑞礼北京大学第一医院男科中心 100034

目的建立一种高分辨率熔解曲线(HRM)-非标记探针的方法用于检测CCL2-2518T>C的单核苷酸多态性(SNP)。方法针对CCL2-2518 T>C,分别设计出针对野生型和突变型的两个非标记探针,采用HRM-非标记探针法对71名健康人群CCL2-2518位点的SN... 详细信息

目的建立一种高分辨率熔解曲线(HRM)-非标记探针的方法用于检测CCL2-2518T>C的单核苷酸多态性(SNP)。方法针对CCL2-2518 T>C,分别设计出针对野生型和突变型的两个非标记探针,采用HRM-非标记探针法对71名健康人群CCL2-2518位点的SNP进行检测,并采用TaqMan分型法进行验证。结果 HRM-非标记法的两个探针与TaqMan分型法分型结果一致,准确率100%;针对突变型(C)的探针明显好于针对野生型(T)的探针,其检测野生纯合型和突变纯合型的探针峰的温度之差分别为5.5℃和2.1℃。结论本研究建立的CCL2-2518 T>C位点突变检测的HRM-非标记探针方法是一种简单、廉价、灵敏、准确和快速的技术,适用于临床检测。

关键词：多态性单核苷酸高分辨率熔解曲线法 CCL2 2518 T〉C

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