检索结果-内蒙古大学图书馆

西南大学学报（自然科学版） 2012年第10期34卷 17-24页

作者：周作勇曹立亭彭开政王芝英胡世君西南大学(荣昌校区)动物医学系重庆荣昌402460

该试验对重庆忠县感染山羊的无浆体主要表面蛋白4(MSP4)基因进行克隆测序,并对其系统进化、基因型以及推导蛋白的b细胞抗原表位进行分析.结果表明:所克隆的MSP4基因片段大小为870bp,CDS序列全长852bp,编码283个氨基酸,Genbank登录号为HQ... 详细信息

该试验对重庆忠县感染山羊的无浆体主要表面蛋白4(MSP4)基因进行克隆测序,并对其系统进化、基因型以及推导蛋白的b细胞抗原表位进行分析.结果表明:所克隆的MSP4基因片段大小为870bp,CDS序列全长852bp,编码283个氨基酸,Genbank登录号为HQ840746.该序列与已公布的羊无浆体MSP4(AY702923,HQ456347,HQ661165)同源性最高,均达99.8%.系统发育分析发现,该序列被聚类到羊无浆体群.抗原表位预测表明忠县山羊无浆体MSP4蛋白的优势b细胞抗原表位在N端第77-82(AGTALS),93-98(APSLSG),216-220(TAGLV)和244-249(GSTLAI)4个区段.本研究从分子水平证实重庆存在羊无浆体感染,我国羊无浆体至少有5个基因型,重庆山羊无浆体MSP4蛋白具有4个优势b细胞抗原表位,为羊无浆体病亚单位疫苗的研发提供了参考.

关键词：山羊羊无浆体 MSP4 序列分析 b细胞抗原表位

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停乳链球菌GapC的免疫特性分析及b细胞抗原表位的筛选与鉴定

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中国兽医科学 2023年第4期53卷 506-513页

作者：杨启昱陈晓萌王汉青马那提·哈山张宝江苏艳新疆农业大学动物医学学院病原微生物诊断与预防实验室新疆乌鲁木齐830052 新疆燕犇褐牛繁育发展有限公司新疆昌吉831100

旨在表达牛乳源停乳链球菌3-磷酸甘油醛脱氢酶(GapC),预测并鉴定其b细胞抗原表位。本研究采用PCR扩增停乳链球菌GapC基因,构建重组质粒p ET-28a-TR-X16087-2。经IPTG诱导表达后纯化GapC蛋白,并以纯化的GapC蛋白免疫小鼠,采用ELISA方法检... 详细信息

旨在表达牛乳源停乳链球菌3-磷酸甘油醛脱氢酶(GapC),预测并鉴定其b细胞抗原表位。本研究采用PCR扩增停乳链球菌GapC基因,构建重组质粒p ET-28a-TR-X16087-2。经IPTG诱导表达后纯化GapC蛋白,并以纯化的GapC蛋白免疫小鼠,采用ELISA方法检测Ig G抗体效价及抗体分型,分析对小鼠的免疫保护效力。结果显示,成功表达了大小为44 ku的GapC蛋白,对小鼠的免疫保护率为76%。预测并筛选出3个b细胞抗原表位,鉴定了1个优势抗原表位bP3:^(196)PHRGGDLRRARAGAAN^(206)。上述结果表明,本研究成功表达了停乳链球菌GapC蛋白,对其免疫效果进行了评估,预测与鉴定了其b细胞表位,为GapC蛋白功能和表位疫苗的研究奠定了基础。

关键词：停乳链球菌 GapC蛋白原核表达 b细胞抗原表位免疫原性

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非洲猪瘟病毒p30蛋白单克隆抗体的制备及其b细胞抗原表位的鉴定

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中国兽医科学 2023年第8期53卷 947-955页

作者：王俊荣张路捷胡永新吴晓东白娟高雁怩姜平南京农业大学农业农村部动物细菌学重点实验室江苏南京210095 中国动物卫生与流行病学中心山东青岛266032

为了解析非洲猪瘟病毒(ASFV)p30蛋白的抗原表位,以原核表达的重组p30蛋白为免疫原免疫6周龄雌性bALb/c小鼠,以杆状病毒系统表达纯化的p30蛋白间接ELISA为单抗筛选方法,研制出12株单抗,细胞培养上清抗体效价均大于1∶6400。1G2单克隆抗... 详细信息

为了解析非洲猪瘟病毒(ASFV)p30蛋白的抗原表位,以原核表达的重组p30蛋白为免疫原免疫6周龄雌性bALb/c小鼠,以杆状病毒系统表达纯化的p30蛋白间接ELISA为单抗筛选方法,研制出12株单抗,细胞培养上清抗体效价均大于1∶6400。1G2单克隆抗体的重链属于IgG2b,其余11株单抗的重链均属于IgG1,轻链均为κ型。Western-blot和间接免疫荧光试验结果显示,这些单克隆抗体均能与ASFV感染的猪肺泡巨噬细胞发生特异性反应。通过p30蛋白基因截短表达和Western-blot发现,这12株单抗分别识别4个抗原表位,包括11MEVIFKTDLRSS22,82EWNMILHVLFEEETES97,107KNDNETNECTSSFETL122,122LFEQEPSSEVPKDSKL137。本研究结果为非洲猪瘟病毒诊断和生物学研究提供了有用的生物学材料。

关键词：非洲猪瘟病毒 p30蛋白单克隆抗体 b细胞抗原表位

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Ⅰ型与Ⅱ型IbDV前体多聚蛋白b细胞抗原表位的预测与比较

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中国家禽 2009年第21期31卷 22-24,28页

作者：肖治军张改平乔松林赵东李学伍邓瑞广杨艳艳邢广旭郅玉宝杨继飞柴书军河南省农业科学院河南省动物免疫学重点实验室河南郑州450002

用生物信息学方法比较了Genbank中9株Ⅰ型IbDV与2株Ⅱ型IbDV基因片段A前体多聚蛋白的推导氨基酸(aa)序列,预测并分析了上述两型IbDV毒株前体多聚蛋白的线性b细胞抗原表位。结果表明,两型IbDV毒株的前体多聚蛋白有75个aa残基的差异,其上... 详细信息

用生物信息学方法比较了Genbank中9株Ⅰ型IbDV与2株Ⅱ型IbDV基因片段A前体多聚蛋白的推导氨基酸(aa)序列,预测并分析了上述两型IbDV毒株前体多聚蛋白的线性b细胞抗原表位。结果表明,两型IbDV毒株的前体多聚蛋白有75个aa残基的差异,其上大多数预测b细胞抗原表位的位置及其指数值均无明显差异;但两型IbDV在第3～10位中的aa残基差异影响了该序列肽的预测指数和结构,以及与Ⅰ型IbDV多抗的反应性。

关键词： IbDV 氨基酸序列 b细胞抗原表位比较分析

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鸭肝炎病毒VP1蛋白b细胞抗原表位预测及变异分析

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中国家禽 2011年第20期33卷 27-30页

作者：黄良宗刘鳗仪王淑敏司兴奎马春全顾万军佛山科学技术学院广东佛山528231 佛山市三水区南山动物防疫站广东佛山528000

以鸭肝炎病毒(DHV)SN株VP1基因序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测VP1蛋白的二级结构,并分别运用Kyte-Doolittle方法、Jameson-Wolf方法和Emini方法预测蛋白的亲水性、抗原指数和表面可及性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测其b细胞抗原表位。结果显示,VP1蛋白C端第132～137、177～186、209～219区段有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的无规则卷曲和β-转角,可能是VP1蛋白的b细胞抗原优势表位;DHV SN株与弱毒疫苗株在推测的VP1b细胞抗原表位177～186和209～219两个区域氨基酸序列变异较大。

关键词：鸭肝炎病毒 VP1蛋白二级结构 b细胞抗原表位

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人巨细胞病毒包膜糖蛋白b的b细胞抗原表位预测

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湖南师范大学自然科学学报 2013年第5期36卷 65-69页

作者：彭波谢伟岸黄超洋刘腊兰吴舒婷张风华常海艳刘如石李小曼湖南师范大学生命科学学院中国长沙410081

目的:通过生物信息学方法分析人巨细胞病毒包膜糖蛋白b(gb)的三级结构并预测其线性b细胞抗原表位.方法:根据人巨细胞病毒gb蛋白的胞外域序列,利用DNAStar软件分析其二级结构和表面特性,联合在线b细胞表位预测程序bcePred,通过其理化特... 详细信息

目的:通过生物信息学方法分析人巨细胞病毒包膜糖蛋白b(gb)的三级结构并预测其线性b细胞抗原表位.方法:根据人巨细胞病毒gb蛋白的胞外域序列,利用DNAStar软件分析其二级结构和表面特性,联合在线b细胞表位预测程序bcePred,通过其理化特性来综合预测该蛋白可能的线性b细胞抗原表位;利用SWISSMODEL服务器的同源建模方法构建gb蛋白的三级结构模型,对在生理三聚体条件下该蛋白各预测表位进行验证.结果:成功预测出人巨细胞病毒gb蛋白的多个线性b细胞抗原表位区段,其中预测出的5个表位区段不属于任何已发现的抗原区域,为后续验证其优势中和表位,研制安全、高效的表位疫苗奠定了理论基础.

关键词：生物信息学人巨细胞病毒包膜糖蛋白b b细胞抗原表位

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猪附红细胞体ORF2蛋白的二级结构及其b细胞抗原表位的预测

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中国生物制品学杂志 2013年第2期26卷 218-221页

作者：单思巴彩凤辽宁医学院实验动物中心辽宁锦州121001

目的预测猪附红细胞体[亦称猪嗜血支原体（Mycoplasma suis,***）]ORF2基因编码蛋白的二级结构及其b细胞抗原表位。方法应用生物信息学软件DNAstar的Editseq将***中ORF2的基因核苷酸序列翻译成氨基酸序列,与Genbank中登录的氨基酸序列... 详细信息

目的预测猪附红细胞体[亦称猪嗜血支原体（Mycoplasma suis,***）]ORF2基因编码蛋白的二级结构及其b细胞抗原表位。方法应用生物信息学软件DNAstar的Editseq将***中ORF2的基因核苷酸序列翻译成氨基酸序列,与Genbank中登录的氨基酸序列进行比对,通过Protean模块预测ORF2蛋白的二级结构及其亲水性区域、柔韧性区域、抗原指数、表面可及性等特性,并预测b细胞优势抗原表位。结果 ORF2蛋白具有规则的二级结构,多处于亲水性区域、柔韧性区域、表面可及性较大和抗原指数较高的区段,潜在的优势b细胞抗原表位为17~23、121~127、138~144、192~200氨基酸区段。结论预测了ORF2蛋白二级结构和b细胞抗原表位,为***表位疫苗的设计以及血清诊断试剂盒的研发奠定了理论基础。

关键词：猪附红细胞体生物信息学二级结构 b细胞抗原表位

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SARS冠状病毒M蛋白二级结构和b细胞抗原表位的稳定性分析

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广东医学 2005年第5期26卷 601-603页

作者：胡族琼赵卫龙北国江丽芳郭新雄南方医科大学微生物学教研室广州510515 中山大学中山医学院微生物学教研室广州510089

目的预测具有代表性的3株SARS冠状病毒M蛋白二级结构和b细胞抗原表位,探讨基因变异对M蛋白二级结构和b细胞抗原表位的影响。方法采用Chou-Fasman方法、Garnier-Robson方法和Karplus-Schulz方法预测SARS冠状病毒M蛋白二级结构;按Kyte-Doo... 详细信息

目的预测具有代表性的3株SARS冠状病毒M蛋白二级结构和b细胞抗原表位,探讨基因变异对M蛋白二级结构和b细胞抗原表位的影响。方法采用Chou-Fasman方法、Garnier-Robson方法和Karplus-Schulz方法预测SARS冠状病毒M蛋白二级结构;按Kyte-Doolittle方案、Emini方案和Jameson-Wolf方案预测b细胞抗原表位。结果3株SARS冠状病毒M蛋白的二级结构和b细胞抗原表位完全一致。结论SARS冠状病毒M蛋白的二级结构和抗原表位比较稳定,提示利用某一毒株的M蛋白制备单克隆抗体和疫苗可应用于SARS的诊断和防治。

关键词： SARS冠状病毒 b细胞抗原表位蛋白二级结构稳定性分析 olf方案单克隆抗体 M蛋白基因变异代表性预测

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鸡传染性法式囊病毒VP2蛋白b细胞抗原表位的研究

鸡传染性法式囊病毒VP2蛋白B细胞抗原表位的研究

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作者：乔宏兴河南农业大学

学位级别：硕士

鸡传染性法氏囊病(Infectious bursal Disease, IbD)是由传染性法氏囊病病毒(IbDV)引起的鸡的一种高度接触性传染病。病毒在法氏囊的b淋巴细胞中迅速繁殖,损伤法氏囊的b淋巴细胞,引起严重的免疫抑制,从而导致疫苗免疫失败和继发感染的发... 详细信息

鸡传染性法氏囊病(Infectious bursal Disease, IbD)是由传染性法氏囊病病毒(IbDV)引起的鸡的一种高度接触性传染病。病毒在法氏囊的b淋巴细胞中迅速繁殖,损伤法氏囊的b淋巴细胞,引起严重的免疫抑制,从而导致疫苗免疫失败和继发感染的发生,对养鸡业造成严重的经济损失。IbDV属于双RNA病毒科的成员,病毒基因组由A,b两个片段的双股RNA组成。其中,基因组b片段编码病毒蛋白VP1,它是一种RNA依赖性的RNA聚合酶;基因组A片段包含2个部分重叠的开放阅读框架(ORF),小ORF编码分子量为17kDa的非结构蛋白VP5;大ORF编码一种分子量约110kDa的前体多聚蛋白,该蛋白在翻译后进一步加工形成VP2、VP3利VP4,形成IbDV的结构蛋白,参与病毒核衣壳的形成,携带病毒主要中和性b细胞抗原表位,诱导中和性抗体的产生。 b细胞抗原表位又称抗原决定簇,是抗原分子上能够被抗体分子识别的部位,在蛋白质抗原中一股由几个直接相邻或构象上相邻的氨基酸组成,决定着机体产生抗体的特异性,是诱导体液免疫的基本单位。对以体液免疫反应为主的IbDV来说,鉴定其b细胞抗原表位便是揭示IbD体液免疫的本质。本项研究应用基因工程技术构建了VP2基因原核表达载体pETVP2,并在大肠杆菌中诱导表达了鸡IbDV主要结构蛋白VP2。表达蛋白能够与鸡IbDV抗血清和单抗发生特异性反应,应用该表达蛋白鉴定出11株单克隆抗体识别VP2蛋白。在应用生物信息学原理分析鸡IbDV VP2蛋白结构特性的基础上,合成了VP2 16-mer重叠多肽51条,VP2 12-mer重叠多肽64条,合成多肽与载体蛋白bSA偶联后,经peptide-ELISA利Dot-ELISA检测其与鸡IbDV单克隆抗体和多抗的反应性。结果显示,VP2中含有5个中和性单克隆抗体识别的线性表位:EP1:37TLRSETSTYNLTV49;EP2:76SNGNYKF82;EP3:201DRPRVYTITAADDYQFS217;EP4:326SWSARGSLAVTI337;EP5:403SERDRLGIKTVW414和6个多抗反应位点:ES1:91NLPASYNYCRLVSRSLTV108;ES2:331GSLAVTIHGGNYPGALRPVTLV352;ES3:371FELIPNPELAKNLVTEYG388;ES4:433NSPLKIAGAFGFK445;ES5:449RAIRRIAVPVVS460;ES6:495ASGKARAASGRIRQLTLA512。VP2单克隆抗体识别的抗原表位多肽同时也能够与鸡IbDV多抗反应。通过重叠多肽合成技术和单克隆抗体抑制实验证明单克隆抗体YNW17识别VP2表位的氨基酸序列为:197CDSSDRPRVYTIT209;单克隆抗体YNW29识别表位的序列为:329ARGSLAVTI337。进一步精确定位了表位EP3和EP4的序列范围。通过本项研究,详细地绘制了鸡IbDV VP2蛋白的抗原表位图谱,对揭示IbDV体液免疫产生的本质具有重要意义,同时为设计IbD新型表位疫苗奠定了基础。

关键词：鸡传染性法氏囊病病毒中和性抗体 b细胞抗原表位多肽合成

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巴西诺卡菌P61蛋白单克隆抗体的制备以及b细胞抗原表位的筛选和鉴定

巴西诺卡菌P61蛋白单克隆抗体的制备以及B细胞抗原表位的筛选和鉴...

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作者：吉兴照中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

诺卡氏菌(Nocardia,N.)革兰染色阳性、需氧、广泛存在于自然界中,如水、土壤等,是.种呈全球分布的机会致病菌,通常感染免疫力缺陷、器官移植、糖尿病、肿瘤以及长期服用类固醇激素的病人,主要引起肺部感染,也可通过血行播散等方式感染... 详细信息

诺卡氏菌(Nocardia,N.)革兰染色阳性、需氧、广泛存在于自然界中,如水、土壤等,是.种呈全球分布的机会致病菌,通常感染免疫力缺陷、器官移植、糖尿病、肿瘤以及长期服用类固醇激素的病人,主要引起肺部感染,也可通过血行播散等方式感染其他部位,如皮肤、中枢神经系统等。近儿年诺卡菌感染率不断升高,目前已知对人致病的诺卡菌约有25种,其中主要有巴西诺卡菌、星形诺卡菌、鼻疽诺卡菌、新星诺卡菌等。巴西诺卡菌一般通过外伤进入皮肤引起慢性炎症而形成脓肿等疾病,在西方国家主要引起足菌肿,也可通过吸入而引起感染。巴西诺卡菌过氧化氢酶(P61)由03I01640基因编码,是一种重要的毒力因子,在巴西诺卡菌感染中起着重要作用,是主要的免疫显性蛋白,能够刺激机体产生特异性的抗体,在临床诊断中具有潜在的价值。本研究通过制备巴西诺卡菌P61蛋白的单克隆抗体,并通过单克隆抗体筛选的方法筛选并鉴定P61蛋白的b细胞抗原表位,为巴西诺卡菌临床诊断与检测提供实验基础,为巴西诺卡菌致病机制提供实验依据。本文首先用处于对数生长期的巴西诺卡菌感染bALb/c小鼠足垫,构建足菌肿感染模型,以获取多克隆抗血清。在NCbI数据库中查找P61蛋白的编码基因(03I01640),应用生物信息学方法进行密码子优化,然后通过基因合成的方法合成P61全长基因。将P61基因异入pET30a(+)质粒中,应用大肠杆菌bL21(DE3)进行IPTG诱导表达,His标签纯化试剂盒进行纯化后,应用PAGE和Western blot对蛋白进行验证分析,将验证后的蛋白P61做为抗原免疫bALb/c小鼠制备单克隆抗体。通过截短表达的方法将P61全长基因进行截短表达,应用肽扫描方法,用制备的单克隆抗体对截短表达的蛋白通过Western blot方法进行筛选鉴定。最后通过生物信息分析软件对P61蛋白的结构进行预测分析,并将筛选出的抗原表位在P61蛋白上进行定位分析。本文首次通过原核系统表达方法重组表达了具有生物学活性的P61蛋白,且纯化后纯度较高。纯化后的蛋白能被抗巴西诺卡菌小鼠血清特异性的识别。应用纯化的蛋白免疫小鼠获得了10株杂交瘤细胞株,10株杂交瘤细胞产生的单克隆抗体均能识别P61蛋白,而并不能识别his标签。通过肽扫描方法成功筛选到1个抗原表位和两个抗原表位区域。通过生物信息学软件对筛选到的抗原表位在预测的蛋白三维结构上进行定位,发现三个抗原表位均在蛋白表面。

关键词：巴西诺卡菌 P61蛋白 b细胞抗原表位单克隆抗体重组表达

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