检索结果-内蒙古大学图书馆

果树学报 2024年第11期41卷 2195-2213页

作者：杨彩宁张雨培杨聪聪陈金印甘增宇果蔬贮藏与保鲜江西省重点实验室·江西农业大学南昌330045

[目的]分离并鉴定猕猴桃fad基因家族成员,探究fad基因在猕猴桃采后成熟过程中的表达模式及其与香气物质合成前体不饱和脂肪酸变化的关系。[方法]利用生物信息学方法鉴定并分析猕猴桃fad基因家族成员,采用质构仪和气相色谱仪测定硬度和... 详细信息

[目的]分离并鉴定猕猴桃fad基因家族成员,探究fad基因在猕猴桃采后成熟过程中的表达模式及其与香气物质合成前体不饱和脂肪酸变化的关系。[方法]利用生物信息学方法鉴定并分析猕猴桃fad基因家族成员,采用质构仪和气相色谱仪测定硬度和脂肪酸含量,借助实时荧光定量PCR验证fad在采后成熟过程中的表达特性。[结果]在红阳猕猴桃基因组中共鉴定出了26个fad基因,分为6个亚族;该家族大多为碱性蛋白,大部分定位于内质网中;这些成员不均匀地分布在19条染色体上,种内共有9对串联重复基因和22对片段重复基因;在其启动子区域上发现大量的光响应元件、植物激素响应元件、逆境胁迫响应元件和生长发育相关元件;表达模式分析和qPCR验证实验表明,Acfad2.2表达量均随着成熟而不断显著上调;采后成熟过程中单不饱和脂肪酸(油酸)含量不断显著下降,双不饱和脂肪酸(亚油酸)含量则不断显著提高,多不饱和脂肪酸(亚麻酸)含量在成熟早期和中期无显著差别,而在后期显著降低;猕猴桃硬度采后出现快速下降,存在明显的后熟过程,此过程会形成特征香气酯类物质,而亚油酸又是酯类香气物质合成的主要前体物质。[结论]共鉴定了26个猕猴桃fad基因成员,并筛选出了1个诱导猕猴桃采后成熟过程中亚油酸合成和积累的关键酶基因Acfad2.2,亚油酸含量的增加伴随着猕猴桃后熟散发特征性香气,为进一步探究fad基因参与猕猴桃采后成熟过程不饱和脂肪酸转化和香气合成的生物学功能提供了参考依据。

关键词：猕猴桃 fad基因家族不饱和脂肪酸香气合成基因表达

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番茄fad基因家族的鉴定与表达分析

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生物技术通报 2024年第7期40卷 150-162页

作者：张明亚庞胜群刘玉东苏永峰牛博文韩琼琼石河子大学农学院石河子832003

【目的】脂肪酸脱氢酶(fatty acid desaturase,fad)是一类催化植物不饱和脂肪酸合成的关键酶,在植物生长发育及逆境胁迫响应中起重要作用。鉴定番茄Slfad基因家族,为番茄Slfad基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】采用生... 详细信息

【目的】脂肪酸脱氢酶(fatty acid desaturase,fad)是一类催化植物不饱和脂肪酸合成的关键酶,在植物生长发育及逆境胁迫响应中起重要作用。鉴定番茄Slfad基因家族,为番茄Slfad基因家族功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法,对其基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、基因结构、系统发育树和表达模式等方面进行研究。【结果】在番茄基因组中共鉴定出26个Slfad基因,可分为4个亚族;理化性质分析显示Slfad蛋白的氨基酸个数在119-912个之间,分子量介于13288.27-102522.25 Da,Slfad蛋白在番茄中主要以碱性蛋白的性质存在,大部分Slfad家族成员为稳定蛋白和亲水性蛋白;亚细胞定位预测Slfad基因家族成员主要存在于内质网;基因特征分析显示同一亚族间的成员具有较为相似的基因结构和保守基序;启动子顺式作用元件分析显示数量最多的是光响应与激素响应相关的元件;染色体定位显示26个Slfad家族成员共分布在10条染色体上,6号和12号染色体上成员最多;二级结构预测显示26个Slfads家族成员均以α-螺旋和β-转角为主;转录组数据及RT-qPCR分析表明Slfad1、Slfad4和Slfad18基因在成熟花药中高度表达,Slfad23在根尖中高度表达,说明Slfad1、Slfad4和Slfad18可能参与花药发育,Slfad23可能参与根尖发育;低温胁迫下,Slfad6和Slfad21表达量被抑制,说明Slfad6和Slfad21可能与低温响应有关系,Slfad1和Slfad14在低温胁迫初期显著上调,随后又被抑制,说明该基因在低温胁迫初期发挥重要作用。【结论】Slfad基因家族在番茄根尖、叶片、花药的生长发育过程及低温胁迫中发挥重要作用。

关键词：番茄脂肪酸脱氢酶 fad基因家族生物信息学表达分析

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毛白杨fad基因家族鉴定与表达模式分析

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分子植物育种 2022年

作者：金兄莲安进宝祁得胜乔枫姜迪杜少波戢爽谢惠春青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室青海省玉树藏族自治州江西林场

脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase， fad)基因家族在植物生物膜的抗逆过程中起着重要的调控作用。为了解fads在毛白杨生长发育过程中的作用，本研究基于生物信息学的分析方法鉴定并分析了毛白杨fad基因家族。结果表明32个Ptfads不... 详细信息

脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase， fad)基因家族在植物生物膜的抗逆过程中起着重要的调控作用。为了解fads在毛白杨生长发育过程中的作用，本研究基于生物信息学的分析方法鉴定并分析了毛白杨fad基因家族。结果表明32个Ptfads不均匀分布于10条染色体上。系统发育分析显示，Ptfad基因家族分为6个亚家族，且基因结构与功能结构域高度保守。启动子上游区域的顺式作用元件分析发现，Ptfad主要参与了毛白杨生长发育过程中的应激反应过程。此外，组织特异性表达模式显示，32个Ptfad基因广泛表达于木质部、根部、嫩叶及成熟叶中，而Ptfad基因家族在愈伤组织诱导及不定芽诱导中呈现低表达的趋势，且Ptfad16的表达模式一直表现为高表达，表明了其在毛白杨生长发育过程中的重要作用。综上所述，本研究为系统了解Ptfad基因家族提供了依据，也为毛白杨fad基因功能特性的深入研究提供了理论基础。

关键词：毛白杨 fad基因家族系统进化基因表达模式生物信息学分析

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毛竹fad基因家族鉴定与综合分析

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分子植物育种 2023年

作者：章妮王欢李绍峰朱丽君孙健深圳职业技术学院城市生态与环境技术研究院深圳职业技术学院材料与环境工程学院

脂肪酸去饱和酶在植物生长发育过程中起着至关重要的调控作用，也与植物对逆境的耐受性密切相关。为了解毛竹fads的结构及表达特征，本研究通过生物信息学的方法在毛竹基因组中鉴定出了42个Pefad基因家族成员。进一步分析结果表明，PeF... 详细信息

脂肪酸去饱和酶在植物生长发育过程中起着至关重要的调控作用，也与植物对逆境的耐受性密切相关。为了解毛竹fads的结构及表达特征，本研究通过生物信息学的方法在毛竹基因组中鉴定出了42个Pefad基因家族成员。进一步分析结果表明，Pefads氨基酸序列长度范围为351～1 386之间，外显子数为1～9个，且80%的成员外显子数在1～3个。毛竹fad基因家族成员与拟南芥、水稻、小麦及大豆的fads聚为五个亚家族，同一亚家族的成员保守基序高度相似。亚细胞定位结果显示Pefads主要定位于叶绿体上，部分定位于内质网或质膜，这也与聚类结果一致。顺式作用元件预测结果表明Pefads主要参与了毛竹生长发育过程中的激素调节及应激反应过程。茎秆发育过程中的转录组测序结果表明Pefad基因家族成员的表达模式不同，Pefad4、Pefad7、Pefad29、Pefad30、Pefad34、Pefad36、Pefad43这7个成员在毛竹茎秆正常的发育过程中起着主要作用。研究结果可为进一步揭示毛竹fad基因家族的功能及其对非生物胁迫的响应机制提供一定的理论依据。

关键词：毛竹 fad基因家族表达模式生物信息学分析

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澳洲坚果fad基因家族的全基因组鉴定与表达分析

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分子植物育种 2024年

作者：王润轩薛彬娥侯晨何波祥张谦汪迎利连辉明梁东成仲恺农业工程学院园艺园林学院广东省林业科学研究院

脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase， fad)是一种调控不饱和脂肪酸合成的重要酶，但fad酶在果仁富含不饱和脂肪酸的澳洲坚果(Macadamia integrifolia Maiden & Betche)中鲜有报道。本文基于澳洲坚果全基因组鉴定其fad基因家族... 详细信息

脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase， fad)是一种调控不饱和脂肪酸合成的重要酶，但fad酶在果仁富含不饱和脂肪酸的澳洲坚果(Macadamia integrifolia Maiden & Betche)中鲜有报道。本文基于澳洲坚果全基因组鉴定其fad基因家族成员，对其理化性质、进化关系及基因结构等进行分析；通过对不同组织器官和果仁不同发育阶段转录组的数据分析，研究澳洲坚果fad基因的表达特征。结果表明：澳洲坚果基因组共有23个fad基因家族成员，氨基酸数目为245～677个，分子量为27.81～78.68 kD，等电点为6.05 ～ 9.49。除第4、11及14号染色体外，其余染色体上均有澳洲坚果fad基因家族成员分布。根据系统进化分析的结果，将澳洲坚果fad基因家族划分为6个亚家族。不同亚家族在澳洲坚果果仁5个不同发育阶段及不同组织器官(花、叶、茎、根和果)的表达模式不一。其中MiFAB2.3、MiFAB2.4、MiFAB2.5、MiADS1及MiDSD1在果仁中表达上调，蛋白互作预测结果显示这5个基因的同源基因与不饱和脂肪酸代谢相关。本研究结果为后续深入研究澳洲坚果fad基因家族的功能提供了理论参考。

关键词：澳洲坚果 fad基因家族系统进化表达模式分析

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花生fad基因家族分子进化及遗传变异研究

花生FAD基因家族分子进化及遗传变异研究

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作者：宋爱霞福建农林大学

学位级别：硕士

栽培种花生是全球重要的经济作物，种子含有丰富的脂肪酸和蛋白质，有“长寿果”的美称，其异源四倍体由两个二倍体祖先Arachis duranensis（AA genome）和Arachis ipaensis（BB genome）杂交而来。中国是花生生产和消费大国，但花生食... 详细信息

栽培种花生是全球重要的经济作物，种子含有丰富的脂肪酸和蛋白质，有“长寿果”的美称，其异源四倍体由两个二倍体祖先Arachis duranensis（AA genome）和Arachis ipaensis（BB genome）杂交而来。中国是花生生产和消费大国，但花生食用油供给仍严重不足，油脂改良是解决问题的有效途径。不饱和脂肪酸（主要是油酸（Oleic acid）和亚油酸（Linoleic acid））是花生油的主要成分，不仅对花生生长发育至关重要，而且有利于人类身体健康。fad（Fatty Acid Desaturase）基因家族催化不饱和脂肪酸的形成，影响花生中油脂的成分和含量。研究表明，花生的O/L比值（Oleic/Linoleic acid ratio）由fad2基因调控。随着现代生物技术的发展，人类破译了栽培种花生的基因组，为深入研究fad基因家族进化、花生种子油脂代谢及驯化提供了基础。栽培种花生经过长期的自然及人工选择，不饱和脂肪酸的含量显著高于野生种花生和其他产油作物，但其背后控制油脂成分的关键基因fad的进化及驯化过程仍不清楚。本研究系统分析了fad基因家族在花生中的进化和驯化过程，探究了fad基因家族进化及驯化过程中发生的遗传变异，为花生等农作物的遗传改良做出重要参考。　　本研究以27个植物基因组为研究对象，通过构建进化树分析了fad基因家族在植物中的进化;鉴定了两个野生祖先花生和栽培种花生（普通型、珍珠豆性、多粒型）的fad基因，并从共线性、基因结构和基因表达等方面研究基因功能;同时，分析了fad2基因的分化;最后，利用225个花生种质资源通过群体遗传学手段分析了fad基因在驯化中受到的人工选择。研究结果如下：　　***基因家族在植物中系统演化：fad基因家族在植物中分化为四个亚家族，基因分化发生在苔藓植物形成之前。第一类脱氢酶亚家族基因在不同植物中的进化历史不同，在单子叶中发生了丢失。与其他物种相比，部分亚家族在栽培种花生发生了扩增。　　2.花生fad基因家族的进化和功能分析：fad基因家族在花生中相对保守，栽培种花生的fad基因来自于两个野生种花生，其中多粒型花生（***，PI240568）多出5条Front-end亚家族基因。共线性分析显示两个亚基因组上的fad基因由于染色体重组发生交换。基因结构分析显示，编码fad蛋白结构域的基因序列缺失将导致基因表达量降低，甚至形成假基因。基因表达分析显示fad重复基因在花生中存在功能分化。　　3.花生fad2基因的功能分化：fad2基因在花生中扩增，多粒型花生中共发现7条fad2蛋白序列，分化为3类基因，分别在种子、雌蕊中特异表达和多个组织中组成型表达。聚类结果与表达分类结果一致，上游顺式作用元件分析发现3类fad2基因都有特异的表达调控元件，参与植物抗逆反应。　　***基因在花生驯化中受到人工选择：群体进化树及群体结构分析显示，野生花生和栽培种花生分为两类，栽培种花生又根据品种不同进一步分为四类。选择清除（Selective sweep）研究发现，fad基因家族中共有6个基因受到人工选择，其中包括两个参与种子油脂合成的重要基因：fad2（fad2_011592）和fad3（fad3_022084）。　　综上所述，本研究利用多种生物信息学手段阐明了fad基因家族在花生中的分类，研究了多拷贝fad2基因在花生中的功能分化，并探究了fad基因家族在不同花生种群中的遗传变异。此研究为进一步研究油脂相关基因提供了参考，有助于花生作物遗传改良和转基因品种研发。

关键词：栽培种花生 fad基因家族分子进化遗传变异

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亚麻fad基因家族的生物信息学鉴定分析

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寒旱农业科学 2023年第3期2卷 246-253页

作者：侯静静赵利王斌甘肃省农业科学院作物研究所甘肃兰州730070

不饱和脂肪酸为人体提供基本代谢所必需的能量,须从膳食中补充。脂肪酸去饱和酶fad(fatty acid desaturase)是植物不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶,植物体内脂肪酸的各组分比例和不饱和度与fad的去饱和作用息息相关。为探究亚麻fad基因... 详细信息

不饱和脂肪酸为人体提供基本代谢所必需的能量,须从膳食中补充。脂肪酸去饱和酶fad(fatty acid desaturase)是植物不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶,植物体内脂肪酸的各组分比例和不饱和度与fad的去饱和作用息息相关。为探究亚麻fad基因家族的表达与进化,为其在亚麻高品质育种中的应用提供理论依据。运用生物信息学方法对亚麻全基因组fad基因家族的43个Lufads基因进行分析。结果显示,该家族成员编码的蛋白质大小为152~453个氨基酸,大部分为碱性不稳定亲水蛋白。与拟南芥fads蛋白序列构建系统发育树,可分为4个主要亚家族:Δ12/ω-3去饱和酶、“前端”去饱和酶、Δ7/Δ9去饱和酶和SAD去饱和酶。保守结构域和外显子-内含子结构分析得出,同一亚组中的家族成员具有较为相似的基因结构。染色体定位分析呈随机性分布。亚细胞定位预测得出,叶绿体上的家族成员最多。启动子顺式作用元件分析发现,该家族成员中抗氧化反应元件(ARE)数量最多。

关键词：亚麻 fad基因家族生物信息学分析

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三角褐指藻脂肪酸去饱和酶基因家族分析及高产EPA藻株的选育

三角褐指藻脂肪酸去饱和酶基因家族分析及高产EPA藻株的选育

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作者：叶浩盈福建师范大学

学位级别：硕士

三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是一种无异味、易于培养、繁殖快且二十碳五烯酸(EPA)含量丰富的海洋微藻,而EPA在增强人体免疫力、降低血脂、血压等方面有着显著的作用,因此以高产EPA的三角褐指藻作为工业藻株是未来工业发展的... 详细信息

三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是一种无异味、易于培养、繁殖快且二十碳五烯酸(EPA)含量丰富的海洋微藻,而EPA在增强人体免疫力、降低血脂、血压等方面有着显著的作用,因此以高产EPA的三角褐指藻作为工业藻株是未来工业发展的新趋势。本研究希望通过分子生物学的方法及常压室温等离子体诱变(ARTP)的方式筛选出高产EPA的三角褐指藻藻株,为工业化提取EPA提供科学依据和可利用的藻株。通过对藻株(FACHB-863)进行形态学与分子生物学鉴定,最终判断该藻株为三角褐指藻。利用涂布、划线法,毛细吸管分离法,再结合抗生素除菌方法,获得无菌藻株。比较液体保藏、固-液双相保藏、低温甘油保藏几种方法的保藏效果,固-液双相保藏效果最好,低温保藏最差,且低浓度保护剂保藏的细胞未能存活。从TAIR中下载拟南芥fad基因家族,Blast比对筛选出三角褐指藻的fad基因,共鉴定出15个家族基因。参与脂肪酸合成的去饱和酶基因分别有Δ4、Δ5、Δ6和Δ12,其中,Δ5去饱和酶基因位于11号染色体上并且是参与EPA合成途径中的关键酶基因,所以利用生物信息学对其所编码的蛋白(ptd5α)进行理化性质分析研究。对ptd5α进行分析时发现该蛋白较为稳定,属于亲水性蛋白。ptd5α蛋白有4个跨膜结构域,存在较多潜在的磷酸化位点,说明这些蛋白在与其他酶类蛋白互作过程中可能会改变其磷酸化状态,从而对其生物活性及功能进行调节。本论文针对提高三角褐指藻EPA产量展开了研究。首先对多不饱和脂肪酸合成途径中位于EPA上游的关键酶基因Δ5去饱和酶进行克隆;其次,构建重组质粒p Pha-T1-Δ5导入三角褐指藻中进行过表达;最后,通过ble抗性筛选以及PCR测序验证,筛选出了三株突变藻株(5D1、5D2、5D3)。通过一系列生理生化指标的测定,虽然突变藻株与野生藻株(WT)生长周期差异不显著,但脂肪酸的含量却有显著的提高,尤其是5D1、5D2、5D3三株突变藻株的EPA含量比野生藻株分别提高了24.2%、20.4%、30.9%。荧光定量PCR检测表明突变藻株5D1的Δ5去饱和酶基因的相对表达量较WT提高了61.5%,5D2、5D3藻株的Δ5去饱和酶基因的相对表达量较WT都提高了85.3%。将3株突变藻株与野生藻株基因组重测序发现,各组的In Del和SNP变异情况存在1-4个差异基因。对三角褐指藻野生藻株进行ARTP诱变处理,经初筛和复筛,筛选出4株诱变藻株SJA1、SJA3、SJA4、SJA6,EPA含量分别较野生藻株提高了25.6%、17.4%、15.5%、21.6%。

关键词：三角褐指藻 EPA Δ5去饱和酶基因 fad基因家族 ARTP

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水稻去饱和酶家族基因SAD6的功能研究

水稻去饱和酶家族基因SAD6的功能研究

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作者：岑绮雯杭州师范大学

学位级别：硕士

水稻（OryzasativaL.）作为我国最重要的粮食作物，起源于热带地区，属于低温敏感作物。低温严重限制了水稻的种植范围，特别是在高纬度、高海拔地区。提高水稻苗期对冷胁迫的抗性，对于减少水稻苗期冷害损失、推广直播栽培等方面均具... 详细信息

水稻（OryzasativaL.）作为我国最重要的粮食作物，起源于热带地区，属于低温敏感作物。低温严重限制了水稻的种植范围，特别是在高纬度、高海拔地区。提高水稻苗期对冷胁迫的抗性，对于减少水稻苗期冷害损失、推广直播栽培等方面均具有重要意义。冷害对植物的首要作用部位是细胞膜，而脂肪酸是细胞膜的重要组成部分;近年来，越来越多的研究表明脂肪酸的去饱和对抵御植物冷害有一定的保护作用。催化饱和脂肪酸脱氢成为不饱和脂肪酸这一步的关键酶是脂肪酸去饱和酶（Fattyaciddesaturase，fad），因此，本研究针对水稻的fad家族展开了研究。首先运用生物信息学方法从水稻基因组中鉴定fad家族成员，对其结构、进化特征和表达模式进行研究，在此基础上选取OsSAD6基因对其生物学功能展开研究，发现OsSAD6参与水稻耐冷性调控，结果如下：　　（1）从水稻基因组中鉴定出20个fad家族成员。基于系统发育关系和功能，可将其分为6个亚家族。亚家族成员的基序组成和分布以及结构域特征具有明显的组别差异。fad基因不均匀地分布于水稻的10条染色体上，具有2对串联重复和7对片段重复基因。水稻、小麦、大麦、拟南芥和番茄基因组之间fad家族成员存在不同数量的共线基因对，与物种分类关系远近基本相符。在大部分水稻fad基因的启动子中鉴定到大量光、激素和胁迫响应的顺式作用元件，而与生长发育相关的顺式作用元件较少。基因表达分析表明，选取的9个水稻fad基因中有5个基因（OsSLD1、OsDES1、Osfad2-1、Osfad7和OsSAD6）受高温或者低温诱导，大部分基因在盐、干旱和ABA处理下转录被抑制。　　（2）结合上述水稻fad基因应答逆境胁迫的表达模式，本研究选取低温响应基因OsSAD6展开下一步功能探究。OsSAD6基因编码一个硬脂酰-ACP脱氢酶（Stearoyl-ACPdesaturase，SAD），仅包含一个FA_desaturase_2结构域，N端含有一个叶绿体转运肽，在单子叶植物中高度保守。qRT-PCR结果显示，OsSAD6基因在多个组织中呈组成型表达;其表达也受冷胁迫的强烈诱导，仅1小时就达到峰值。亚细胞定位结果显示OsSAD6定位于叶绿体和质膜。　　（3）通过克隆OsSAD6基因的全长CDS，以组成型启动子Ubiquitin驱动OsSAD6基因在粳稻品种日本晴中过表达，并基于CRISPR/Cas9技术创制OsSAD6基因敲除突变体。表型观察发现OsSAD6基因的过表达和功能缺失对水稻的正常生长发育并无显著影响。　　（4）通过对野生型、OsSAD6基因敲除材料及过表达材料的苗期耐冷性进行评估，发现OsSAD6基因敲除突变体表现出低温敏感表型，而OsSAD6过表达植株表现出增强的耐冷性，表明OsSAD6基因正调控水稻的耐冷性。在OsSAD6过表达植株中，如RBOHs、APXs、GPX1和CATC等ROS代谢相关基因的表达在冷胁迫下相较于野生型显著上调。提示OsSAD6可能通过影响ROS代谢相关基因的表达，维持冷胁迫下细胞内的氧化还原稳态。　　（5）将OsSAD6作为诱饵蛋白，在日本晴苗期叶片酵母双杂交cDNA文库中进行筛选，得到了候选互作蛋白OsANN1，经酵母双杂交实验、免疫共沉淀等方法证明了OsSAD6能够和OsANN1互作。基于OsANN1在调控ROS动态平衡和钙离子信号转导中的作用，揭示OsSAD6可能通过和OsANN1互作共同调控水稻耐冷性。

关键词：水稻 fad基因家族不饱和脂肪酸耐冷性活性氧

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