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限定检索结果

文献类型

  • 4 篇 学位论文
  • 2 篇 期刊文献

馆藏范围

  • 6 篇 电子文献
  • 0 种 纸本馆藏

日期分布

学科分类号

  • 5 篇 工学
    • 5 篇 计算机科学与技术...
    • 3 篇 软件工程
    • 1 篇 生物医学工程(可授...
    • 1 篇 生物工程
  • 2 篇 理学
    • 1 篇 生物学
    • 1 篇 系统科学
  • 1 篇 农学
    • 1 篇 作物学
  • 1 篇 管理学
    • 1 篇 管理科学与工程(可...

主题

  • 6 篇 fm-index算法
  • 2 篇 压缩查询
  • 1 篇 rna-seq
  • 1 篇 uml语言
  • 1 篇 压缩
  • 1 篇 后缀数组
  • 1 篇 生物信息学
  • 1 篇 索引数据
  • 1 篇 空位种子
  • 1 篇 脱靶位点预测
  • 1 篇 spark分布式框架
  • 1 篇 重叠分块
  • 1 篇 并行
  • 1 篇 spark
  • 1 篇 bwt
  • 1 篇 reads mapping
  • 1 篇 序列比对
  • 1 篇 分块
  • 1 篇 后缀树
  • 1 篇 crispr系统

机构

  • 1 篇 华中科技大学
  • 1 篇 内蒙古师范大学
  • 1 篇 中国科学院研究生...
  • 1 篇 北京联合大学
  • 1 篇 内蒙古农业大学
  • 1 篇 中国科学院软件研...
  • 1 篇 中国科学院软件研...
  • 1 篇 北京工业大学

作者

  • 2 篇 张云泉
  • 2 篇 梁军
  • 1 篇 李开士
  • 1 篇 焦雅
  • 1 篇 刘佳毅
  • 1 篇 李玉成
  • 1 篇 张迪
  • 1 篇 刘芳

语言

  • 6 篇 中文
检索条件"主题词=FM-index算法"
6 条 记 录,以下是1-10 订阅
排序:
RNA-Seq Reads mapping中基于Spark的并行fm-index算法研究
RNA-Seq Reads mapping中基于Spark的并行FM-Index算法研究
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作者: 刘芳 内蒙古师范大学
学位级别:硕士
随着现阶段二代高通量测序技术的不断发展,RNA-Seq测序技术所产生的数据量不断增大,庞大的数据量虽然蕴含了大量生物学信息,但是为研究人员带来了生物信息学分析的难题。快速、高效分析这些海量生物数据,挖掘数据信息,是现今生物信息学... 详细信息
来源: 评论
fm-index分块并行算法及其实现
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计算机工程 2008年 第8期34卷 53-54,58页
作者: 李开士 张云泉 李玉成 中国科学院研究生院 北京100080 中国科学院软件研究所并行计算实验室
查询海量数据有压缩和索引两种方法来提高速度,该文结合这两种方法提出了压缩查询的方法。fm-index是一种自索引的全文查询算法,存在内存占用过大的问题,对于复杂的查询效率也不理想。该文提出分块fm-index算法,在分块的基础上采用MPI... 详细信息
来源: 评论
基于重叠分块的fm-index性能研究与分析
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计算机工程 2009年 第6期35卷 85-87,93页
作者: 梁军 张迪 张云泉 北京联合大学电子信息实训基地 北京100101 中国科学院软件研究所 北京100190
fm-index压缩查询方法结合压缩技术和索引技术,其最大优势是能够在不解开压缩文件的情况下对源文件进行查询。该文通过理论分析和详细的测试数据研究重叠分块对fm-index压缩查询性能的改善。对改进后的fm-index和压缩软件Winrar在压缩... 详细信息
来源: 评论
基于Spark的CRISPR系统脱靶位点预测算法研究与实现
基于Spark的CRISPR系统脱靶位点预测算法研究与实现
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作者: 刘佳毅 华中科技大学
学位级别:硕士
基因编辑技术在基因功能研究、物种性状改良和疾病研究中具有非常重要的作用,成为当下的研究热点。CRISPR系统是目前最具发展潜力的基因编辑工具,但由于其存在脱靶效应,可能会导致不确定位置的DNA片段遭到破坏。提前对全基因组范围内存... 详细信息
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基于后缀树与后缀数组混合结构的基因序列比对算法研究
基于后缀树与后缀数组混合结构的基因序列比对算法研究
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作者: 焦雅 内蒙古农业大学
学位级别:硕士
随着基因测序技术的迅猛发展,基因数据库中序列公共数据量呈指数形式增长。对于基因数据最基础但最重要的分析方法为序列比对。本文通过对现今常用的分析算法和分析软件在序列的类型、特点和功能等方面研究和比较,发现序列比对算法的重... 详细信息
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基于fm-index的压缩查询方法研究与应用
基于FM-index的压缩查询方法研究与应用
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作者: 梁军 北京工业大学
学位级别:硕士
随着计算机和互联网技术的发展,信息检索的信息量日益加大,出现了大批量成GB级的数据文件,人们迫切希望可以在不解压的前提下,知道其中的数据是否有下一步处理需要的数据或者数据是否正确。这样可以节省解压缩的步骤,大大地缩短处理周期... 详细信息
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