检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2022年第1期41卷 20-27页

作者：宋晓越吴仪凡艾需李增辉赵森李新春陈生会屈雷陕西省陕北绒山羊工程技术研究中心榆林学院榆林719000 陕西省“四主体一联合”肉羊工程技术校企联合研究中心神木719300

本研究通过对30只子午岭黑山羊(Capra hircus)主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,mhc)Ⅱ类基因第二外显子的遗传变异分析,旨在探究子午岭黑山羊mhcⅱ类基因的多态性,从而评估其种群发展趋势,为mhcⅱ类基因与生长... 详细信息

本研究通过对30只子午岭黑山羊(Capra hircus)主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,mhc)Ⅱ类基因第二外显子的遗传变异分析,旨在探究子午岭黑山羊mhcⅱ类基因的多态性,从而评估其种群发展趋势,为mhcⅱ类基因与生长性能和疾病抗性的相关性研究奠定基础,促进子午岭黑山羊的保护和开发利用。结果共获得4种mhcⅱ类基因的第二外显子序列,包括DQA2、DRB1、DQB2和DRA。多态性分析发现除DRA外,其他基因多态性均较丰富。在长期的进化过程中,DRB1和DQB2基因受到了明显的选择压力作用,这种选择作用有助于子午岭黑山羊对当地气候的适应。子午岭黑山羊各项体尺指标均比陕北白绒山羊低,结合等位基因、基因型频率差异发现:DQA2基因型在两个群体中的分布差异显著(P<0.05);DRB1的等位基因和基因型在两个群体中的分布差异极显著(P<0.01)。本次对子午岭黑山羊mhcⅱ类基因多态性的研究有助于筛选生长或疾病抗性相关的mhc候选基因,进而可促进子午岭黑山羊的保护和品系改良的进程。

关键词：子午岭黑山羊 mhcⅱ类基因遗传变异种质资源保护

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大绿臭蛙复合体mhcⅱ类基因多样性及进化机制研究

大绿臭蛙复合体MHCⅡ类基因多样性及进化机制研究

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作者：谷子文河南师范大学

学位级别：硕士

两栖类从水生到陆生的转变，是脊椎动物演化史上具有重要意义的事件，而免疫适应是两栖类起源和适应辐射过程中应对环境病原微生物剧烈变化所需要解决的关键问题。近二十年来，由于气候变化、栖息地破坏、外来物种入侵和疾病等因素，全... 详细信息

两栖类从水生到陆生的转变，是脊椎动物演化史上具有重要意义的事件，而免疫适应是两栖类起源和适应辐射过程中应对环境病原微生物剧烈变化所需要解决的关键问题。近二十年来，由于气候变化、栖息地破坏、外来物种入侵和疾病等因素，全世界两栖类多样性及种群数量急剧减少，病毒和细菌感染是两栖类物种锐减甚至灭亡的直接原因之一。主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex，mhc)是参与脊椎动物机体免疫重要的基因家族之一，通过呈递抗原启动免疫反应，其多态性与动物对环境的适应性、病原微生物的抵抗能力密切相关。因此，揭示两栖类不同物种种群mhc的遗传多样性研究有助于评估种群适应环境变化的能力，为生物多样性保护提供依据，大绿臭蛙复合体(Odorrana graminea species complex)隶属于蛙科(Ranidae)、臭蛙属(Odorrana)，广泛分布于东南亚和中国秦岭以南地区，大绿臭蛙复合体mhc遗传分化程度、mhc多态性与其大尺度的空间分布格局和复杂多变的环境微生物的相关性尚不清楚。　　本研究以大绿臭蛙复合体13个地里种群201号样本为研究对象，克隆测定了mhcⅡ类B基因外显子2序列，通过序列比对和同源性分析揭示了大绿臭蛙mhcⅡ类B基因外显子2的多态性、遗传分化程度及基因是否发生重组，基于贝叶斯法(Bayesian Inference, BI)和最大似然法(Maximum Likelihood, ML)重建了mhc等位基因的系统发育关系树，并通过中性检验和选择压力分析揭示了mhcⅡ类B基因外显子2的进化模式。　　结果显示：　　(1)大绿臭蛙复合体mhcⅡ类B基因外显子2的序列与其他两栖类的已知序列同源性很高，系统发育关系结果表明大绿臭蛙复合体mhcⅡ类B基因与天目臭蛙和凹耳臭蛙mhcⅱ类基因亲缘关系最近。　　(2)成功测定大绿臭蛙复合体201号样本1608条序列，共检测到46个等位基因，不同地理种群的等位基因数存在差异，数目从1到12个不等，个体间等位基因数也存在明显差异，单个个体最多检测到3个等位基因，表明大绿臭蛙mhcⅡ类B基因最少有2个基因座位。　　(3)中性检验结果表明大绿臭蛙复合体mhcⅡ类B基因显著偏离中性进化，经历了种群扩张。中性检验和Z-test分析表明该基因受到净化选择作用。　　(4)重组分析后未发现该基因有基因重组现象。

关键词：大绿臭蛙复合体 mhcⅱ类基因遗传多样性进化机制

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内蒙古地区布氏田鼠种群mhcⅱ类基因第二外显子的遗传分析

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淮北师范大学学报（自然科学版） 2017年第3期38卷 30-36页

作者：赵素华魏磊宿州职业技术学院安徽宿州234101 毫州学院生物与化学工程系安徽亳州236800 中国科学院动物研究所动物生态和保护生物学院重点实验室国家野生动物疫病研究中心北京100101

以mhcⅱ类基因第二外显子(mhc classⅡexon 2)为分子标记,用限制性酶切多态性和直接测序的方法对分布于内蒙古地区的8个布氏田鼠种群共460个个体进行种群遗传结构的分析.结果显示,酶切共检测到6个等位基因,13个酶切多态性位点,卡方检验... 详细信息

以mhcⅱ类基因第二外显子(mhc classⅡexon 2)为分子标记,用限制性酶切多态性和直接测序的方法对分布于内蒙古地区的8个布氏田鼠种群共460个个体进行种群遗传结构的分析.结果显示,酶切共检测到6个等位基因,13个酶切多态性位点,卡方检验显示,各种群在6个酶切多态性位点上基因型频率不符合Hardy-Weinberg平衡.序列分析显示,在长度261 bp的核苷酸序列中,有57个变异位点,定义21种单倍型,其中有1个单倍型为不同区域种群所共享,其余20个单倍型均为各区域种群所特有.7个地理种群的单倍型多样性和核苷酸多样性较高,1个地理种群较低.谱系分析显示,8个布氏田鼠地理种群分为3个进化分支,分别与采集的地理种群相吻合:同一地理种群内单倍型之间遗传差异小,而不同地理来源的单倍型之间存在较大区别.Mentel检测表明,布氏田鼠的遗传分化与地理距离呈现正相关.AMOVA分析结果同样表明地理种群之间存在差异:各区域类群间变异组分占总变异比率的60.48%,区域内种群间变异组分占总变异比率的7.78%,种群内个体间变异组分占总变异比率的28.14%;遗传分化系数和基因流分析显示,布氏田鼠种群出现一定程度的分化,但正镶白旗种群与其他种群之间遗传分化显著.布氏田鼠的这种遗传结构特点可能是该物种稳定的地下生活环境和有限的迁移造成的,且浑善达克沙漠形成布氏田鼠分化最强烈的隔离因素.

关键词：布氏田鼠 mhcⅱ类基因遗传分化

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绵羊mhcⅱ类基因遗传多态性研究进展

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中国草食动物科学 2015年第1期35卷 47-50页

作者：惠文巧侯宏艳汤继顺朱德建班谦陈胜安徽省农业科学院畜牧兽医研究所合肥230031 安徽大学生命科学学院干细胞及转化医学研究中心

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,mhc)是广泛存在于脊椎动物体内的一类高度紧密连锁的基因群,绵羊mhc又称为绵羊淋巴细胞表面抗原(ovine lymphocyte antigen,OLA),位于绵羊20号染色体上,分为Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类区... 详细信息

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,mhc)是广泛存在于脊椎动物体内的一类高度紧密连锁的基因群,绵羊mhc又称为绵羊淋巴细胞表面抗原(ovine lymphocyte antigen,OLA),位于绵羊20号染色体上,分为Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类区域,其中mhcⅱ类基因具有高度的基因多态性。文章综述了绵羊mhcⅱ类基因的分子结构及遗传多态性,重点总结了近十年来国内外不同绵羊品种mhcⅱ类基因遗传多态性的研究进展,并对绵羊mhcⅱ类基因未来的研究重点进行了展望。

关键词：绵羊 mhcⅱ类基因遗传多态性

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内蒙古地区不同地理种群布氏田鼠遗传分化研究

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现代农业科技 2017年第16期 220-223,225页

作者：魏文天王玉民何宏轩魏磊内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古呼和浩特010018 亳州学院生物与化学工程系中国科学院动物研究所动物生态和保护生物学院重点实验室/国家野生动物疫病研究中心

[目的]探讨布氏田鼠地理种群的遗传分化。[方法]以mhcⅱ类基因第二外显子为分子标记进行序列分析和基因分型。结果:获得了内蒙古8个布氏田鼠地理种群460个样品的mhcⅱ类基因第二外显子基因的261 bp核苷酸序列,经单倍型分选后,共定义了2... 详细信息

[目的]探讨布氏田鼠地理种群的遗传分化。[方法]以mhcⅱ类基因第二外显子为分子标记进行序列分析和基因分型。结果:获得了内蒙古8个布氏田鼠地理种群460个样品的mhcⅱ类基因第二外显子基因的261 bp核苷酸序列,经单倍型分选后,共定义了21个单倍型,其中有3个单倍型为不同区域种群所共享,其余19个单倍型均为各区域种群所特有。单倍型网络进化关系分析显示,8个布氏田鼠地理种群形成3个稳定的进化支,分别与采集的地理种群相吻合:同一地理种群内单倍型之间遗传差异小,而不同地理来源的单倍型之间存在较大区别。AMOVA分析显示,遗传变异主要发生在区域类群间。对基因流和遗传分化系数、种群遗传距离和遗传相似度分析表明,布氏田鼠种群出现了一定的遗传分化,正镶白旗种群因浑善达克沙漠的阻碍而分化最明显。Mentel检测揭示布氏田鼠的遗传分化与地理距离无显著相关性。[结论]栖息地的复杂地形和气候变化可能是影响布氏田鼠群体间遗传分化的主要因素,而种群间距离隔离对于布氏田鼠的遗传分化作用不明显。

关键词：布氏田鼠地理种群 mhcⅱ类基因遗传分化内蒙古

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内蒙古布氏田鼠地理种群遗传多样性

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四川动物 2016年第6期35卷 818-824页

作者：魏磊赵素华胡奕王承民何宏轩亳州学院生物与化学工程系安徽亳州236800 宿州职业技术学院安徽宿州234101 中国科学院动物研究所动物生态和保护生物学院重点实验室国家野生动物疫病研究中心北京100101

以mhcⅱ类基因第二外显子为分子标记，利用限制性内切酶分析法和序列分析法对8个布氏田鼠Lasiopodomys brandtii地理种群进行遗传多样性分析。结果显示，8个布氏田鼠地理种群的mhcⅱ类基因第二外显子酶切共检测到6个等位基因，定义21种... 详细信息

以mhcⅱ类基因第二外显子为分子标记，利用限制性内切酶分析法和序列分析法对8个布氏田鼠Lasiopodomys brandtii地理种群进行遗传多样性分析。结果显示，8个布氏田鼠地理种群的mhcⅱ类基因第二外显子酶切共检测到6个等位基因，定义21种单倍型，其中有3个单倍型为不同区域种群共享，经卡方检验，6个酶切多态性位点上基因型频率不符合Hardy—Weinberg平衡；序列分析显示，在261bp的核苷酸序列中，有57个变异位点，单倍型多样性为0．7465～0．8733、核苷酸多样性为0．00606～0．01655。谱系分析得到3个稳定的分支：锡林浩特、二连浩特、东乌珠穆沁旗和西乌珠穆沁旗4个种群形成一个单元分歧的进化分支（A区域），新巴尔虎左旗、陈巴尔虎旗和新巴尔虎右旗3个种群成一个单元分歧的进化分支（B区域），而位于浑善达克沙漠南部的正镶白旗种群形成一个独立单元分歧的进化分支（C区域），分别与采集的地理种群相吻合。AMOVA分析结果表明，区域类群间的遗传变异占总变异比率的64．08％，区域内种群间占7．78％，种群内占28．14％。除正镶白旗种群外，布氏田鼠种群具有较丰富的遗传多样性，遗传变异主要发生在区域类群之间和种群内。

关键词：布氏田鼠 mhcⅱ类基因遗传多样性

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反式转录因子在多器官功能障碍综合征中对mhcⅱ类基因的调控

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中国普外基础与临床杂志 2010年第11期17卷 1190-1192页

作者：柴琛薛左良曹农王斌生李强兰州大学第一医院普外科兰州730000

目的探讨主要组织相容性复合体(mhc)Ⅱ类基因的反式转录因子(CⅡTA)在多器官功能障碍综合征(MODS)中对mhcⅱ类基因的调控机理。方法 18只雄性家猪随机分为实验组(n=9)和对照组(n=9)。实验组给予失血性休克、再灌注损伤、内毒素血症等复... 详细信息

目的探讨主要组织相容性复合体(mhc)Ⅱ类基因的反式转录因子(CⅡTA)在多器官功能障碍综合征(MODS)中对mhcⅱ类基因的调控机理。方法 18只雄性家猪随机分为实验组(n=9)和对照组(n=9)。实验组给予失血性休克、再灌注损伤、内毒素血症等复合干扰因素,建立二次打击猪MODS模型;对照组仅进行麻醉和动静脉插管。7d后处死存活动物。切取实验组造模成功动物和对照组动物的脾脏组织,用Trizol法提取总RNA。设计CⅡTA和猪mhcⅱ类基因(SLA-DQA)引物序列,逆转录构建cDNA,行实时荧光定量PCR检测。UVP计算机图像分析系统绘出标准曲线并得出2组CⅡTA mRNA和SLA-DQA mRNA的拷贝数。以Pearson法分析MODS动物CⅡTA mRNA和SLA-DQA mRNA表达的相关性。结果实验组动物死亡7例,有8例发生MODS。对照组动物CⅡTA mRNA的拷贝数为(3.516±1.237)×103,实验组MODS动物为(0.367±0.088)×103,差异有统计学意义(P=0.000);对照组SLA-DQA mRNA拷贝数为(5.330±3.053)×103,实验组为(1.376±1.006)×103,差异亦有统计学意义(P=0.002)。MODS动物中CⅡTA mRNA和SLA-DQA mRNA的表达呈正相关(Pearson值为0.499,P=0.017)。结论 MODS模型复制满意。mhcⅱ类基因在MODS中表达下降与CⅡTA的调控有关。

关键词：反式转录因子多器官功能障碍综合征动物模型 mhcⅱ类基因

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应用RNA干扰阻抑小鼠L929细胞mhcⅱ类基因表达及功能的研究

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现代免疫学 2009年第6期29卷 464-469页

作者：路丽明丁庆杨能周晓荣周芸周光炎上海交通大学医学院上海市免疫学研究所上海200025

为了探讨RNA干扰技术对小鼠CⅡTA(II类反式激活因子)以及mhc Ⅱ类基因表达和功能的影响。我们首先设计并合成4条小干扰RNA(small-interfering RNA,siRNA)(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3和siRNA-4)序列,在阳离子脂质体的介导下转染小鼠L929... 详细信息

为了探讨RNA干扰技术对小鼠CⅡTA(II类反式激活因子)以及mhc Ⅱ类基因表达和功能的影响。我们首先设计并合成4条小干扰RNA(small-interfering RNA,siRNA)(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3和siRNA-4)序列,在阳离子脂质体的介导下转染小鼠L929细胞。48h后,用半定量RT-PCR和定量PCR方法检测CⅡTA mRNA的变化;流式细胞仪检测I-Ab分子表达的变化。接着构建了CIITA特异的短发夹状干扰RNA(short hairpin RNA,shRNA)表达载体,通过在靶细胞内转录形成具有特异干扰作用的shRNA,高效、特异的阻断CⅡTA基因的表达,形成Ⅱ类基因功能缺陷或使其表达降低。进一步混合淋巴细胞反应观察同种异基因CD4+T细胞对稳定转入RAN干扰载体的L929细胞的免疫应答强度,结果证实该L929细胞对不同受者CD4+T细胞的刺激能力分别下降73.90%和76.34%。以上结果为减低同种异体/异种器官细胞性排斥提供了新的思路和手段。

关键词： mhcⅡ类转录激活因子 siRNA Ⅰ-A mhcⅱ类基因

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尼罗罗非鱼mhcII类基因的克隆与表达特征及多态性研究

尼罗罗非鱼MHCII类基因的克隆与表达特征及多态性研究

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作者：庞纪彩上海海洋大学

学位级别：硕士

近年来由于罗非鱼链球菌病的大规模爆发，罗非鱼养殖业已经受到严重威胁。目前还没发现有效的防治措施。罗非鱼抗病品种(系)培育是值得期待的防病策略。而鱼类抗病力的分子遗传基础是抗病品种培育的前提。主要组织相容性复合体(Majorhis... 详细信息

近年来由于罗非鱼链球菌病的大规模爆发，罗非鱼养殖业已经受到严重威胁。目前还没发现有效的防治措施。罗非鱼抗病品种(系)培育是值得期待的防病策略。而鱼类抗病力的分子遗传基础是抗病品种培育的前提。主要组织相容性复合体(Majorhistocompatibilitycomplex，mhc)是已知存在于所有脊椎动物体内与机体免疫机能密切相关的基家族，在引发和维持机体防御免疫的过程中起重要作用。本实验克隆得到尼罗罗非鱼mhcⅱ类基因的基因组及cDNA序列，实时定量PCR检测其在各组织和器官的表达量；用克隆测序的方法分析mhcⅡB基因多态性以及该基因多态性与罗非鱼链球菌病抗性的关系，旨在为罗非鱼抗病品系选育提供理论基础。主要结果和结论如下： 1.尼罗罗非鱼mhcⅱ类基因cDNA及基因组序列的克隆与序列多态性分析采用同源克隆和cDNA末端快速扩增技术得到mhcⅡA和mhcⅡB的cDNA序列，并用特异引物直接扩增法获得基因组序列，GenBank登录号分别为JN967619和JN967618。mhcⅡA基因组序列长1614bp，包括4个外显子和3个内含子；其cDNA序列长度为1076bp，其中开放阅读框（ORF）为723bp，编码240个氨基酸。与其他物种相比，其氨基酸序列的相似性约为25.4-64.5%。mhcⅡB基因组序列长3143bp，包括6个外显子和5个内含子；其cDNA序列长1119bp，其中ORF为750bp，共编码249个氨基酸。与其他硬骨鱼及哺乳动物和鸟类相比，其氨基酸序列的相似性约为26.9-74.7%。尼罗罗非鱼mhcⅡA和ⅡB基因中存在多个等位基因，本研究分离得到了12种不同的mhcⅡAcDNA序列和10种不同的mhcⅡBcDNA序列（GenBank登录号：JN983472-JN983493），该研究结果可为尼罗罗非鱼抗病分子标记辅助选育奠定理论基础。 2.尼罗罗非鱼mhcⅱ类基因的组织表达分析利用所得尼罗罗非鱼mhcⅡA和ⅡB基因cDNA序列，设计特异性引物，运用实时定量PCR的方法检测mhcⅡA和ⅡB基因mRNA在各组织或器官的表达量，以及用罗非鱼无乳链球菌（Streptococcusagalatiae）感染后，分析这两个基因在各组织或器官中表达量的变化。定量PCR分析结果显示，mhcⅡA和ⅡB基因mRNA在健康个体的脑、肾、脾脏、心脏、肝脏、鳃、肌肉、胃、肠和皮肤中均有表达，但表达量有所差异，其中在胃和鳃的表达量最高，脑和肌肉表达量最低。罗非鱼无乳链球菌感染后，mhcⅱ类基因mRNA在肠、鳃、脾脏和肾脏中的表达量均明显升高。 ***ⅡB基因多态性与罗非鱼链球菌抗性的关系为了解mhcⅡB基因多态性与尼罗罗非鱼链球菌抗性的相关关系，本研究用引物2b-snp-sf和2b-snp-sr分别从尼罗罗非鱼40尾感病个体和40尾抗病个体的基因组DNA中扩增mhcⅡB基因片段，扩增产物长度为775-797bp。在775-797bp核苷酸序列中，抗病群体的多态核苷酸位点有265个(33.2%)，感病群体中有255(31.9%)。在该扩增片段编码的101个氨基酸位点中，抗病群体与感病群体分别有32个和33多态位点。对80个个体的441个阳性克隆测序，发现有7种不同的mhcⅡB等位基因主型，编码7个不同的氨基酸序列。大部分等位基因是两个群体共有的。等位基因Orni-DAB*0201和Orni-DAB*0401在抗病群体中出现的频率（15.5%,5.6%）显著高于在感病群体中出现的频率（7.4%,1.8%）；而等位基因Orni-DAB*0501只出现在抗病群体中。抗病群体中70%的个体出现2-4个等位基因，30%的个体出现1个等位基因；感病群体中42.5%的个体出现2-4个等位基因，57.5%的个体只出现1个等位基因。这提示个体中mhcⅡB等位基因数量的多少，与其对链球菌病的抵抗力有着明显的关系。个体中具有的mhcⅡB等位基因数越多，抗病力越强。本研究结果为抗病尼罗罗非鱼选育提供了依据。

关键词：尼罗罗非鱼 mhcⅱ类基因表达特征多态性链球菌抗性

来源：评论

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海南坡鹿Ⅱ类mhc基因cDNA的分离

海南坡鹿Ⅱ类MHC基因cDNA的分离

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作者：楼暨康浙江大学

学位级别：硕士

海南坡鹿(Cervus eldi hainanus)是泽鹿(Cervus eldi)的一个亚种,仅分布于中国海南岛。由于捕猎和生境破坏,海南坡鹿种群数量急剧下降,一度只剩下不到50只。经过30多年的就地与迁地保护,坡鹿种群已经超过2000头。但由于经历了严重的瓶... 详细信息

海南坡鹿(Cervus eldi hainanus)是泽鹿(Cervus eldi)的一个亚种,仅分布于中国海南岛。由于捕猎和生境破坏,海南坡鹿种群数量急剧下降,一度只剩下不到50只。经过30多年的就地与迁地保护,坡鹿种群已经超过2000头。但由于经历了严重的瓶颈效应,坡鹿的遗传多样性有可能很低,抗病能力和生存能力堪忧。 mhc (Major Histocompatibility Complex,主要组织相容性复合体)是脊椎动物的多基因家族,编码多种细胞表面跨膜糖蛋白,呈递抗原多肽至T细胞,从而启动特异性免疫应答反应。哺乳动物Ⅱ类mhc由DQA、DQB、DRA和DRB等多个功能基因组成,编码负责呈递外源性抗原的分子。由于mhc与抗病能力直接相关,所以是反映种群遗传多样性和评估生存潜力的良好指标。本文分离了一只海南坡鹿个体的Ⅱ类mhc功能基因的cDNA全长,为位点分离打下基础。本文分离了2条DRA基因的全长,2条DRB基因的全长,2条DQA基因的全长和2条DQB基因的全长,以及另一条DQB等位基因的一段。经比较与牛、羊等反刍动物的序列高度相似。还通过SSCP带型复原证明DRA和DQA基因的cDNA都已经拿到。另外还获得了DRA和DQA基因的2号和3号内含子。

关键词：海南坡鹿 mhcⅱ类基因 cDNA SSCP

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