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检索条件"主题词=Max Duo-Preservation String Mapping Problem"

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详细简洁

排序：

Further Improvement in Approximating the maximum duo-preservation string mapping problem 1

引用

16th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI)

作者： Brubach, Brian Univ Maryland Dept Comp Sci College Pk MD 20742 USA

ISBN: (数字)9783319436814

ISBN: (纸本)9783319436814;9783319436807

We present an improved approximation for the maximum duo-preservation string mapping problem (MPSM). This problem was introduced in [7] as the complement to the well-studied Minimum Common string Partition problem (MCSP). Prior work also considers the k-MPSM and k-MCSP variants in which each letter occurs at most k times. The authors of [7] showed a k(2)-appoximation for k >= 3 and 2-approximation for k = 2. A 4-approximation independent of k was shown in [4]. In [4], they also showed that k-MPSM is APX-Hard and achieved approximation ratios of 8/5 for k = 2 and 3 for k = 3. In this paper, we show an algorithm which achieves a 13/4-approximation for the general MPSM problem using a new combinatorial triplet matching approach. During publication of this paper, [3] presented a local search algorithm yielding 7/2, which falls in between the previous best and this paper. The remainder of the paper has not been altered to reflect this.

关键词： string algorithms Polynomial-time approximation max duo-preservation string mapping problem Min Common string Partition problem

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