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作者

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检索条件"主题词=Web Interface for Continuum Modeling of Molecular Solvation and Ion Transport"

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详细简洁

排序：

web interface for continuum modeling of molecular solvation and ion transport

Web Interface for Continuum Modeling of Molecular Solvation ...

引用

2015欧亚经济论坛-2015第五届国际纳米科技大会

作者： Benzhuo Lu Institute of Computational Mathematics and Scientific/Engineering Computing Academy of Mathematics and Systems Science Chinese Academy of Sciences

continuum models(implicit solvent models) are widely applied to simulating molecular solvation and ionic transport in wide ion channels.A web-based graphical user interface(GUI) is presented for simulations of Poisson-Boltzmann electrostatics and Poisson-Nernst-Planck electrodiffusion of ion transport in channel proteins or *** webserver is designed to help users avoid most of the technical difficulties encountered in setting up and simulating complex ***-based 3D finite element/boundary element simulation platforms are built for these simulations,as well as design of *** the case of nanopore,the volume tetrahedral mesh is automatically generated on a web interface through typing a series of parameters describing the nanopore,such as the upper and lower pore radius,membrane thickness and box *** pore can carry surface charge density described as a given *** solvation energies,and the ionic concentration and electric potential profiles,and ionic current in the channel/pore cases can be *** are given for different types of simulations.

关键词： web interface for continuum modeling of molecular solvation and ion transport

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