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色谱 2025年第5期43卷 446-454页

作者：徐坤黄嫣嫣赵睿北京分子科学国家研究中心中国科学院活体分析化学重点实验室中国科学院分子科学科教融合卓越创新中心中国科学院化学研究所中国科学院大学

外泌体是由细胞分泌的双层膜囊泡，携带有丰富的生物分子，是细胞间信息交流的重要媒介，与多种疾病的发生发展密切相关。在复杂体系中开展外泌体分离富集研究，对于疾病诊断、预后检测和分子机制研究具有重要意义。但外泌体广泛存在于... 详细信息

外泌体是由细胞分泌的双层膜囊泡，携带有丰富的生物分子，是细胞间信息交流的重要媒介，与多种疾病的发生发展密切相关。在复杂体系中开展外泌体分离富集研究，对于疾病诊断、预后检测和分子机制研究具有重要意义。但外泌体广泛存在于复杂生命体系中，尺寸小且分布范围宽，为其分离富集带来了困难与挑战。目前已经发展了基于物理性质的超速离心、体积排阻色谱、超滤和聚合物沉淀等方法。以亲和配体为识别单元，基于分子识别的亲和分离策略能够实现外泌体高选择性分离富集。在众多分子识别工具中，多肽凭借着可设计性强、构象自由灵活等优势，被应用于外泌体亲和分离之中。本文首先对目前外泌体分离富集方法进行了总结，之后重点介绍了以外泌体蛋白质和生物膜特性为靶标的亲和多肽设计与筛选原理及其在外泌体亲和分离富集中的应用。

关键词：外泌体分子识别多肽分离富集

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瘢痕疙瘩旁真皮成纤维细胞转录组特征初探

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中华皮肤科杂志 2025年第2期58卷 145-153页

作者：张道宁林萍萍田杰张国红李航北京大学第一医院皮肤性病科皮肤病分子诊断北京市重点实验室国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心国家药品监督管理局化妆品质量控制与评价重点实验室北京100034 汕头大学医学院病理学系汕头515041

目的从转录组水平描述瘢痕疙瘩的潜在皮损范围,为解析瘢痕疙瘩切除后复发提供分子证据。方法收集2022年7-12月在北京大学第一医院皮肤性病科临床确诊并经手术切除治疗的瘢痕疙瘩患者3例,分别取其瘢痕疙瘩及瘢痕疙瘩旁真皮组织,同时收集... 详细信息

目的从转录组水平描述瘢痕疙瘩的潜在皮损范围,为解析瘢痕疙瘩切除后复发提供分子证据。方法收集2022年7-12月在北京大学第一医院皮肤性病科临床确诊并经手术切除治疗的瘢痕疙瘩患者3例,分别取其瘢痕疙瘩及瘢痕疙瘩旁真皮组织,同时收集4例良性皮肤肿瘤旁真皮组织作为对照。通过原代细胞培养纯化获得真皮成纤维细胞,传至第2代后进行转录组测序并进行差异基因筛选、基因本体论(GO)功能以及京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析。在分析差异表达基因时,定义差异表达倍数(FC)>2且P<0.05的基因为表达上调基因,FC<0.5且P<0.05的基因为表达下调基因。通过分析已发表文献中瘢痕疙瘩与瘢痕疙瘩旁组织的单细胞转录组测序数据(GSA数据库中HRA000425)及正常真皮单细胞转录组测序数据(GEO数据库中GSE130973),侧面验证本研究中转录组结果的准确性。在本研究及文献中的组织样本中验证瘢痕疙瘩旁关键基因的表达。结果与瘢痕疙瘩成纤维细胞相比,瘢痕疙瘩旁及对照真皮成纤维细胞共同的表达上调基因63个,富集在脂质运输(P=0.038)、离子运输(P=0.040)等生物学过程;与对照真皮成纤维细胞相比,瘢痕疙瘩旁及瘢痕疙瘩成纤维细胞共同的表达上调基因56个,富集在转化生长因子β信号通路(P<0.001)等。瘢痕疙瘩、瘢痕疙瘩旁真皮成纤维细胞分别与对照真皮成纤维细胞相比,仅在瘢痕疙瘩旁表达上调的差异基因有79个;经基因表达基值过滤与一致性分析,最终获得与瘢痕疙瘩旁转录组特征密切相关的候选基因13个(平均表达量>1000且组内表达量方差<30000的基因),包括抑制瘢痕疙瘩形成相关基因SMAD6、SMAD7及促进瘢痕疙瘩形成相关基因MSX1、SNAI1、EDN1,同样参与细胞生长、骨化、软骨形成等生物学过程(均P<0.01)。通过ChEA3网站进行转录因子的富集分析发现,上述13个基因富集到的转录因子包括成肌分化蛋白1(MYOD1)、成肌素(MYOG)等(均P<0.05)。结论与瘢痕疙瘩和对照真皮成纤维细胞相比,瘢痕疙瘩旁真皮成纤维细胞的转录特征是同时高表达抑制和促进瘢痕疙瘩形成的相关基因,可能从分子水平解释瘢痕疙瘩旁组织与正常皮肤形态学的相似性及瘢痕疙瘩高复发倾向的潜在机制。

关键词：瘢痕疙瘩转录组成纤维细胞差异表达基因瘢痕疙瘩旁真皮组织

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深度学习算法在脑年龄预测中的应用进展

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中国医学物理学杂志 2025年第1期42卷 122-127页

作者：廖建灏吴凯黄家源韩睿彭润霖周静华南理工大学生物医学科学与工程学院广东广州511442 华南理工大学材料科学与工程学院广东广州510006 华南理工大学国家人体组织功能重建工程技术研究中心广东广州510006 广东省精神疾病转化医学工程技术研究中心广东广州510370 广东省老年痴呆诊断与康复工程技术研究中心广东广州510500 华南理工大学广东省生物医学工程重点实验室广东广州510006

脑年龄预测的研究对于深入理解个体神经发育、神经精神性疾病的早期诊断以及制定个性化治疗方案具有重要意义,随着深度学习的不断发展,越来越多的研究专注于利用此类算法来预测脑年龄。相较于传统回归算法,深度学习具备复杂模式学习、... 详细信息

脑年龄预测的研究对于深入理解个体神经发育、神经精神性疾病的早期诊断以及制定个性化治疗方案具有重要意义,随着深度学习的不断发展,越来越多的研究专注于利用此类算法来预测脑年龄。相较于传统回归算法,深度学习具备复杂模式学习、端到端学习和高度自适应性等优势,能更准确地揭示神经精神疾病的神经病理机制,为临床评估、辅助诊断以及预后预测提供更为精准的工具。本综述提供了近年来深度学习算法在脑年龄预测研究方面的应用进展,介绍了在脑年龄预测中深度学习模型的改进、多模态数据输入和可解释性研究上的进展,最后讨论了集成深度学习架构的建立方法和制定统一的基准测试的未来挑战,并展望了深度学习在脑年龄预测中的应用前景。

关键词：脑年龄机器学习深度学习回归预测综述

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猫哮喘诊断与治疗的临床研究进展

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中国畜牧兽医 2025年第2期52卷 959-965页

作者：路心怡杨洛江蓝王炜俞峰刘波中国农业大学动物医学院北京100193

猫哮喘是一种由过敏原引起的下呼吸道嗜酸性粒细胞炎性疾病,临床表现为反复发作的咳嗽、呼吸急促甚至呼吸困难。猫哮喘的病理机制与人类高Th2型哮喘类似,患猫出现气道高反应性变化、黏蛋白基因高度表达和嗜酸性粒细胞浸润。目前猫哮喘... 详细信息

猫哮喘是一种由过敏原引起的下呼吸道嗜酸性粒细胞炎性疾病,临床表现为反复发作的咳嗽、呼吸急促甚至呼吸困难。猫哮喘的病理机制与人类高Th2型哮喘类似,患猫出现气道高反应性变化、黏蛋白基因高度表达和嗜酸性粒细胞浸润。目前猫哮喘尚无公认的诊断指南,慢性支气管炎与其有极为相似的临床症状和影像学表现,是临床诊断中应重点排查的方向。哮喘患猫胸部X线片最常见的异常表现为支气管型或支气管间质型,支气管灌洗液可见嗜酸性粒细胞炎症。新型诊断方法中,呼出气冷凝液分析和气压全身体积描记术属于无创性诊断,并且可用于清醒状态下的患猫,在标准化呼出气冷凝液生物标志物和气压全身体积描记术的参数参考范围后,两种新型诊断方案有望应用于宠物猫临床。临床常用的治疗药物为皮质类固醇,在患猫支气管痉挛时使用支气管扩张剂。新型治疗方案中,冲击免疫疗法针对过敏原建立免疫耐受机制,从过敏性炎症级联初始阶段进行治疗,是有望彻底治愈哮喘的新型治疗技术。新型的诊断与治疗技术目前在宠物猫中的研究较少,多用于实验室建立的猫哮喘模型,在应用于宠物猫临床之前,仍需更多的临床数据。

关键词：猫哮喘嗜酸性粒细胞气道炎下呼吸道疾病

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代谢重编程在主动脉夹层中的研究进展

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中国动脉硬化杂志 2025年

作者：樊杨开张凯璇王媛首都医科大学附属北京安贞医院心血管基础与转化医学研究中心教育部重塑相关心血管疾病重点实验室心血管重大疾病防治协同创新中心北京心肺血管疾病研究所

主动脉夹层（Aortic Dissection， AD）是一种危及生命的急性血管疾病，其发病机制复杂且尚未完全明了。近年来，代谢重编程在AD的发生和发展中逐渐显现出重要作用。本文综述了氨基酸代谢、糖代谢和脂质代谢等主要代谢途径在AD中的异常... 详细信息

主动脉夹层（Aortic Dissection， AD）是一种危及生命的急性血管疾病，其发病机制复杂且尚未完全明了。近年来，代谢重编程在AD的发生和发展中逐渐显现出重要作用。本文综述了氨基酸代谢、糖代谢和脂质代谢等主要代谢途径在AD中的异常变化及其对血管细胞功能的影响。代谢重编程通过调控内皮细胞和血管平滑肌细胞（VSMCs）的功能，促进血管壁结构的破坏和炎症反应的加剧，进而推动AD的进展。此外，本文还探讨了代谢相关分子在AD早期诊断和治疗中的潜在应用，强调了代谢调控作为AD防治新策略的重要性。最后，提出了代谢重编程在AD研究中的未来方向，包括深入机制研究、开发新型生物标志物以及优化临床干预策略，以期为AD的预防和治疗提供新的思路和方法。

关键词：主动脉夹层代谢重编程代谢分子生物标志物

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新生隐球菌的病原学特性及耐药机制研究进展

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微生物学报 2025年第5期 1918-1938页

作者：苏妍谕孙天舒李颖星李懿奕巧莲徐英春中国医学科学院北京协和医院检验科中国医学科学院北京协和医院疑难重症及罕见病全国重点实验室中国医学科学院北京协和医学院研究生院中国医学科学院北京协和医院临床医学研究所转化医学国家重大科技基础设施临床生物样本中心中国医学科学院北京协和医院临床医学研究所转化医学国家重大科技基础设施细胞、组织与生物医学工程平台

新生隐球菌(Cryptococcus neoformans)是一种常见机会致病菌，因其嗜中枢性，常引发隐球菌性脑膜炎。新生隐球菌的侵袭能力与多种因素密切相关，包括荚膜多糖、黑色素、水解酶等毒力因子，以及对宿主体内环境的适应性。在诊断方面，尽... 详细信息

新生隐球菌(Cryptococcus neoformans)是一种常见机会致病菌，因其嗜中枢性，常引发隐球菌性脑膜炎。新生隐球菌的侵袭能力与多种因素密切相关，包括荚膜多糖、黑色素、水解酶等毒力因子，以及对宿主体内环境的适应性。在诊断方面，尽管传统方法如真菌培养和印度墨汁染色仍在使用，但其局限性显而易见。相较之下，分子检测、影像技术和生物芯片等新兴手段显著提升了隐球菌感染的诊断准确性和灵敏度。在临床治疗方面，两性霉素B和氟康唑作为一线药物被广泛应用，但唑类药物的耐药问题日益严峻，导致临床治疗失败率升高。这种耐药性主要归因于靶点基因突变、外排泵表达上调及基因组倍性改变。针对其毒力因子和耐药机制的深入研究，促进了新型抗真菌疗法的探索，包括旧药新用、新药研发以及创新给药策略。本文结合最新研究，综述了新生隐球菌的毒力因子、诊断技术进展、耐药机制及新疗法的研究动态，旨在为隐球菌病的临床诊疗提供借鉴与启示。

关键词：新生隐球菌毒力因子诊断方法耐药机制

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G试验诊断侵袭性真菌病的干扰因素

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中国真菌学杂志 2022年第1期17卷 69-73页

作者：张园柏华松杜君洋徐英春王贺侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室丹娜生物分中心天津300467 天津市侵袭性真菌病精准诊断技术企业重点实验室天津300467 中国医学科学院北京协和医院检验科北京100730 侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730 中国医学科学院北京协和医院疑难重症及罕见病国家重点实验室北京100730

(1,3)-β-D-葡聚糖广泛分布在自然界中,是真菌、酵母、藻类、细菌和高等植物细胞壁成分,G试验的主要检测物质即为真菌细胞壁的(1,3)-β-D-葡聚糖。本文总结了引起G试验的假阳性和假阴性因素如药物因素、医疗因素、宿主基础疾病等,旨在... 详细信息

(1,3)-β-D-葡聚糖广泛分布在自然界中,是真菌、酵母、藻类、细菌和高等植物细胞壁成分,G试验的主要检测物质即为真菌细胞壁的(1,3)-β-D-葡聚糖。本文总结了引起G试验的假阳性和假阴性因素如药物因素、医疗因素、宿主基础疾病等,旨在帮助临床医生正确评估G试验的检测结果,指导临床实践。

关键词： (1,3)-β-D-葡聚糖干扰因素

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新型冠状病毒N_sgRNA荧光定量PCR检测方法的建立

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中华实验和临床病毒学杂志 2025年第1期39卷 96-101页

作者：韩桃利张帜赵嘉欣卢盼焦洋赵剑虹高艳张士尧刘宽宽刘玉洁樊茹李文静孙灵利北京市朝阳区疾病预防控制中心微生物检验科北京100021 北京市房山区疾病预防控制中心北京100021 首都医科大学燕京医学院北京101300 北京市朝阳区疾病预防控制中心环境与卫生科北京100021

目的基于SARS-CoV-2的N_sgRNA建立实时荧光定量PCR检测方并进行初步应用。方法基于Wuhan-Hu-1/2019_MN908947和亚基因组RNA(subgenomic RNA,sgRNA)形成机制设计合成N_sgRNA重组质粒及其特异性引物探针。将重组质粒做为模板,根据实验结果... 详细信息

目的基于SARS-CoV-2的N_sgRNA建立实时荧光定量PCR检测方并进行初步应用。方法基于Wuhan-Hu-1/2019_MN908947和亚基因组RNA(subgenomic RNA,sgRNA)形成机制设计合成N_sgRNA重组质粒及其特异性引物探针。将重组质粒做为模板,根据实验结果的Ct值、荧光强度、扩增曲线等筛选最佳反应条件和反应体系,并采用评价指标对优化后的SARS-CoV-2病毒N_sgRNA荧光定量PCR检测方法进行灵敏性、重复性和特异性评估。同时,将该方法初步应用于172份临床样本和256份城市生活污水的检测探索该方法实际应用的可能性。结果初步建立了检测新冠病毒N_sgRNA的qRT-PCR方法,该方法检测下限为20 copies/mL,批内重复(0.002%~0.767%)和批间重复(0.016%~0.752%)实验变异系数均小于1%,特异性实验仅有N_sgRNA重组质粒检出,建立的方法灵敏度较高,特异性较强,重复性好。临床样本HK.3、EG.5.1和JN.1及其亚分支与其流行时期对应的城市污水样本的Ratio_(sgRNA/gRNA)均具有统计学差异(P<0.05);同时期临床样本和污水城市样本中Ratio_(sgRNA/gRNA)中位数具有较强的相关性(相关系数r=1.000,P=0.010),提示污水样本与人群临床样本中Ratio_(sgRNA/gRNA)趋势一致。结论本研究建立了一种检测SARS-CoV-2的N_sgRNA实时荧光定量PCR方法,该方法具有灵敏度较高,特异性较强,重复性好的特点,可用于检测SARS-CoV-2感染性。

关键词：新型冠状病毒亚基因组实时荧光定量PCR

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肾素-血管紧张素系统：急性呼吸窘迫综合征中的生命之舵

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中国生物化学与分子生物学报 2025年第4期41卷 487-493页

作者：张艳丽蒋澄宇中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院重大疾病共性机制研究全国重点实验室

急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)是一种严重的肺部疾病，其特征为肺部细胞因子风暴、弥漫性肺泡损伤、肺血管通透性增加、急性非心源性肺水肿和难治性低氧血症(PaO2/FIO2≤300 mm),最终导致多器官衰竭。... 详细信息

急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)是一种严重的肺部疾病，其特征为肺部细胞因子风暴、弥漫性肺泡损伤、肺血管通透性增加、急性非心源性肺水肿和难治性低氧血症(PaO2/FIO2≤300 mm),最终导致多器官衰竭。ARDS起病快、病情严重并且缺乏有效治疗手段，导致其高病死率(30%～70%),对公共健康构成重大威胁。ARDS可由多种病因引发，包括严重感染(例如SARS-CoV、SARS-CoV-2、H5N1)以及非感染性因素。目前的治疗方法主要是非特异性的处理，包括类固醇、传统中医药、营养支持和机械通气等。2012年更新的柏林标准主要依据发病时间、低氧血症、肺水肿以及相关的放射学和生理学异常来诊断ARDS。最近的研究表明，生物标志物可以提高诊断的灵敏度和特异性。例如，血管紧张素II(Ang II)水平升高与重症肺炎的严重程度和预后相关，强调了肾素-血管紧张素系统(renin-angiotensin system, RAS)在ARDS病理机制中的重要作用。ARDS进展的一个关键因素是局部肺组织中RAS的破坏。研究表明，Ang II-Ang II 1型受体(angiotensin II type 1 receptor, AT1R)轴的激活会促进肺损伤。ACE2是RAS的关键负调节因子，在缓解Ang II过度生成引起的肺损伤中发挥着重要作用。动物模型中ACE2的下调导致RAS失衡，进而引发急性肺损伤。SARS-CoV、SARS-CoV-2和禽流感等病毒感染，以及暴露于某些纳米材料，都能通过降低ACE2水平、破坏RAS平衡，特别是通过激活Ang II-AT1R轴，导致Ang II的增加，从而诱发ARDS。本文讨论了涉及RAS抑制剂的潜在治疗策略，包括血管紧张素受体拮抗剂(angiotensin receptor blockers, ARB)和补充ACE2。研究表明，ARB(包括洛沙坦),能够显著减少由病毒感染和其他因素引起的ARDS动物模型中的肺损伤，并改善存活率。此外，重组人ACE2通过降低Ang II水平和缓解肺损伤表现出保护作用。本文还讨论了ARB在治疗多器官功能障碍综合征(multiple organ dysfuction syndrom, MODS)中的治疗潜力，因为RAS失调在器官损伤中发挥关键作用。临床试验表明，ARB能够改善COVID-19患者的预后。尽管ARB可能产生低血压和电解质失衡等不良反应，但它们仍然是治疗ARDS和MODS有前景的治疗选择。未来的研究应进一步阐明RAS调节在不同病因背景下的分子机制，并开发个体化治疗策略，以优化临床治疗效果。总而言之，靶向RAS,特别是Ang II-AT1R轴，代表了治疗ARDS和MODS的一种新颖而有前景的方法，为危重病人提供了有价值的治疗途径。

关键词：肾素-血管紧张素系统急性呼吸窘迫综合征新冠病毒禽流感病毒

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基于人工智能的心血管疾病预测模型研究现状

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蚌埠医科大学学报 2025年第1期50卷 6-13页

作者：彭石娟王小满高琴陈厚早蚌埠医科大学卫生管理学院安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学基础医学院生理学教研室安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学心脑血管疾病基础与临床重点实验室安徽蚌埠233030 中国医学科学院基础医学研究所暨北京协和医学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究国家重点实验室北京100005

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,... 详细信息

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,传统的风险模型通常无法捕捉危险因素之间的非线性关系。人工智能(AI)技术,特别是监督式机器学习和深度学习,为CVD预测提供了新视角和工具。近几年,基于电子病历、多模态影像等临床数据和衰老大数据可以准确地预测CVD的发病和死亡风险,因此,本文将从传统评分、基于AI的临床数据和衰老大数据的CVD预测模型研究现状分别进行阐述,为促进AI结合CVD提供思路。

关键词：心血管疾病人工智能预测模型衰老生物学年龄

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