检索结果-内蒙古大学图书馆

Dectin-1在curdlan诱导的慢性肉芽肿病高炎症反应中的作用机制

生物化学与生物物理进展 2016年第6期43卷 592-598页

作者：原慧萍车福刚杨泽北京医院卫生部北京老年医学研究所卫生部老年医学重点实验室北京100730

慢性肉芽肿病(CGD)是一种罕见的遗传免疫缺陷综合症.CGD病人最常见为NADPH氧化酶2(NADPH oxidase 2,NOX2)功能缺失造成吞噬细胞内活性氧生成障碍,不能清除外源的细菌与真菌的感染.凝胶多糖curdlan属于1,3-β-葡聚糖,是白色念珠菌细胞壁... 详细信息

慢性肉芽肿病(CGD)是一种罕见的遗传免疫缺陷综合症.CGD病人最常见为NADPH氧化酶2(NADPH oxidase 2,NOX2)功能缺失造成吞噬细胞内活性氧生成障碍,不能清除外源的细菌与真菌的感染.凝胶多糖curdlan属于1,3-β-葡聚糖,是白色念珠菌细胞壁的主要成分.目前,作为吞噬细胞中主要的模式识别受体,凝集素dectin-1是否参与curdlan诱导巨噬细胞参与免疫炎症反应以及其分子机制不十分清楚.为了研究这一机制,我们采用luminol和Amplex Red法检测活性氧生成水平,ELISA检测炎症因子IL-1β水平以及免疫荧光法检测NF-κB信号通路的激活情况.结果表明,curdlan浓度依赖性上调巨噬细胞活性氧生成,NOX2缺失显著降低活性氧产生,dectin-1缺失部分降低活性氧的生成和部分阻断NF-κB信号通路的激活.NOX2 KO小鼠炎症因子IL-1β水平显著升高,Dectin-1缺失后NOX2 KO小鼠IL-1β水平降低;Dectin-1 KO小鼠的IL-1β水平与WT小鼠比无显著差异,与Dectin-1/NOX2 KO小鼠比差异显著.上述结果提示,curdlan刺激下机体通过巨噬细胞内的dectin-1受体诱导免疫应答,激活NF-KB信号通路释放炎症因子IL-1β,同时通过dectin-1受体激活NOX2释放活性氧清除病原,促进机体修复.在这一过程中dectin-1不是唯一参与的受体.

关键词：慢性肉芽肿性疾病 curdlan 活性氧 dectin-1 IL-1β

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隐球菌脑膜炎患者脑脊液宏基因组二代测序结果分析

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协和医学杂志 2019年第6期10卷 605-611页

作者：葛瑛范思远陈健华申奥窦洪涛肖盟徐英春宫燕萍任海涛吴红龙关鸿志中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院感染内科北京100730 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院神经科北京100730 天津华大医学检验所天津300308 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院检验科北京100730

目的评价脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在隐球菌脑膜炎诊断中的潜在应用价值。方法回顾性收集北京协和医院2014年1月至2016年12月采用脑脊液mNGS技术辅助确诊的6例隐球菌脑膜炎患者临床资料... 详细信息

目的评价脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在隐球菌脑膜炎诊断中的潜在应用价值。方法回顾性收集北京协和医院2014年1月至2016年12月采用脑脊液mNGS技术辅助确诊的6例隐球菌脑膜炎患者临床资料,包括脑脊液常规、生化、细胞学、培养、墨汁染色等实验室检测结果,应用BGISEQ-100测序平台进行脑脊液病原测序,综合分析患者的临床、实验室和辅助检查结果。结果6例患者中,男性4例,女性2例,年龄26~53岁,中位年龄51岁。6例患者均无免疫缺陷性疾病,有头痛、脑膜刺激症状及颅内压增高表现,5例患者出现发热,2例患者出现复视。脑脊液常规检查示白细胞和蛋白轻度升高,糖正常或轻度降低;5例患者脑脊液墨汁染色阳性,4例患者脑脊液隐球菌抗原检测阳性,2例患者脑脊液真菌培养阳性。脑脊液mNGS检测隐球菌核酸序数为108~25361,基因覆盖率0.19%~29.00%;5例提示新型隐球菌感染,其中3例经PCR检测证实为新型隐球菌感染;1例提示格特隐球菌感染,经生物质谱仪检测证实为格特隐球菌感染。结论脑脊液mNGS技术可准确判断隐球菌感染,并对鉴别格特隐球菌具有一定优势,有助于降低免疫功能正常人群隐球菌脑膜炎的漏诊率。

关键词：宏基因组二代测序隐球菌脑膜炎脑脊液诊断

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Label free方法研究大鼠脑脊液中锰毒性相关的差异蛋白质组

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毒理学杂志 2012年第4期26卷 247-253页

作者：敬海明张拓杨帆刘君丽董一文赵超英马玲刘建中张鹏郑珊李红张思玉魏开华李国君北京市疾病预防控制中心/北京市预防医学研究中心卫生毒理所北京市食物中毒诊断溯源技术重点实验室首都医科大学公共卫生与家庭医学学院北京100013 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京中研同仁堂医药研发有限公司

目的本研究旨在探查临床可介入性生物样本脑脊液中锰毒性相关的差异表达蛋白谱,为今后深入的毒性机制研究和病程相关生物标志研究提供科学数据。方法运用非标记(label free)定量蛋白质组学技术分析比较成年大鼠经腹腔注射暴露于氯化锰(... 详细信息

目的本研究旨在探查临床可介入性生物样本脑脊液中锰毒性相关的差异表达蛋白谱,为今后深入的毒性机制研究和病程相关生物标志研究提供科学数据。方法运用非标记(label free)定量蛋白质组学技术分析比较成年大鼠经腹腔注射暴露于氯化锰(以锰计,6 mg Mn/kg BW)1个月(亚急性)、3个月(亚慢性)及3个月加30 d恢复期后与其相应对照组(腹腔注射生理盐水)大鼠的脑脊液中蛋白质的差异表达情况,并根据蛋白质的基因本体(gene ontology,GO)注释对所鉴定蛋白进行了分类分析。结果本研究共鉴定到173个蛋白质,经差异性比较与重复蛋白剔除后获得123个锰毒性相关的差异表达蛋白,其中,染锰后55个蛋白质表达量上调,68个蛋白质表达量下调。根据差异性,123个差异表达蛋白可分为4个层次,分别为表达升高(4个),表达下降(2个),仅在对照组鉴定到(66个),仅在染毒组鉴定到(51个)。对123个差异蛋白按其GO注释分别进行细胞组件、分子功能及生物学过程分类后发现,差异表达蛋白主要来自于细胞核、细胞外基质及细胞质,以结合功能为主,少数参与代谢、应对刺激等生物学过程,半数以上的生物学过程未知。结论由于脑脊液中的蛋白质多数都是由脉络丛组织合成分泌的,因此上述脑脊液中差异表达的蛋白质组不仅可以作为锰神经毒性作用引起的神经退行性疾病的潜在的生物学标志,而且还为锰致脉络丛(血-脑脊液屏障的组织基础)上皮细胞毒性损伤作用分子机制的深入研究提供线索和实验基础。

关键词：锰脑脊液脉络丛非标记(label free)定量蛋白质组学技术 GO分析

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宏基因组高通量测序协助诊断异基因造血干细胞移植术后患者感染病原体的价值分析

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中华内科杂志 2022年第8期61卷 928-932页

作者：孙佳慧张晓辉莫晓冬付海霞张圆圆陈育红陈瑶王昱黄晓军许兰平北京大学人民医院血液科北京大学血液病研究所国家血液系统疾病临床医学研究中心造血干细胞移植治疗血液病北京市重点实验室北京100044

目的探讨宏基因组高通量测序技术(mNGS)在异基因造血干细胞移植术后感染患者中的应用价值。方法回顾性分析2019年4月至2020年11月于北京大学血液病研究所进行异基因造血干细胞移植术后出现局部或全身感染症状的83例患者, 并进行mNGS检... 详细信息

目的探讨宏基因组高通量测序技术(mNGS)在异基因造血干细胞移植术后感染患者中的应用价值。方法回顾性分析2019年4月至2020年11月于北京大学血液病研究所进行异基因造血干细胞移植术后出现局部或全身感染症状的83例患者, 并进行mNGS检测。标本包括外周血、脑脊液、肺泡灌洗液、脓腔穿刺液等, 同时分析同期细菌/真菌培养、病毒PCR检测结果, 将mNGS结果和常规检测结果进行比对。结果 83例患者112份样本进行了mNGS检测, 共确定病原微生物34种。其中细菌11种, 共17例次, 最常见为大肠埃希菌(4/17)。真菌7种, 共10例次, 白色念珠菌(2/10)。病毒16种, 共129例次, 细环病毒30.2%(39/129)、CMV 25.6%(33/129)、EBV 14.0%(18/129)。以常规检测手段为金标准, mNGS敏感性为86.5%, 特异性为45.0%。单一病原体感染的样本, mNGS与常规检测手段结果一致的共82.9%(29/35);共感染样本中, mNGS与常规检测结果一致的占16/17。结论 mNGS有助于确定感染病原体, 可作为常见手段的补充诊断方式。

关键词：高通量核苷酸测序造血干细胞移植感染

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尿液蛋白质组作为下一代生物标志物的潜力

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中国生物化学与分子生物学报 2022年第12期38卷 1571-1585页

作者：沈梓芸高友鹤北京师范大学基因工程药物及生物技术北京市重点实验室北京100875

生物标志物是与机体生理及病理生理状态相关的可监测到变化的生化指标,尿液不属于内环境,没有稳态机制,能够积累并反映机体生理状态的早期变化,有潜力辅助疾病的早期诊断和预后监测。得益于非侵入性的收集方式,尿液可以被连续、大量、... 详细信息

生物标志物是与机体生理及病理生理状态相关的可监测到变化的生化指标,尿液不属于内环境,没有稳态机制,能够积累并反映机体生理状态的早期变化,有潜力辅助疾病的早期诊断和预后监测。得益于非侵入性的收集方式,尿液可以被连续、大量、重复收集并便捷、稳定地保存,且组分相对简单,易于分析,是理想的标志物研究样本。但临床尿液样本蛋白质组可能会受到生活习惯、用药情况等多种混杂因素的影响,而动物模型方便控制变量,可以最大程度减少混杂因素的干扰,并使得在疾病发生、发展极早期采集样本成为可能;此外,患者的疾病分期、分型、用药情况等信息不能被忽视,现有样本策略和分析方式有待优化,例如,对同一个人不同时期、不同状态(例如患病前后)的尿液样本进行前后对照是一种理想的分析方式,这种方式能够消除个体间差异性的影响,符合个性化、精准化医疗的趋势;在无自身对照样本的情况下,一对多的分析方法能够更好地体现个体与健康群体的差别,辅助未知疾病的诊断和鉴别。尿液大分子的膜保存方式使得临床样本的保存更加简单经济。尿液生物标志物领域研究的进步需要政策和伦理的支持、资金和人力长期持续的投入以及大样本、大数据的辅助。本文综述了尿液生物标志物的重要概念、理论思想、发展历程、研究现状、主要方法和技术以及未来展望等内容,期望能较为全面地展示尿液蛋白质组在生物标志物领域广阔的应用前景。

关键词：尿液蛋白质组学早期生物标志物

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单细胞测序技术在肠道相关基础研究中的应用

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中华实验外科杂志 2020年第8期37卷 1575-1580页

作者：王权王铸张振张萌萌李晨叶颖江姜可伟王杉北京大学人民医院胃肠外科 100044 北京大学人民医院外科肿瘤研究室/结直肠癌诊疗研究北京市重点实验室 100044 山东大学附属省立医院胃肠外科济南250021

近年来,随着单细胞技术的不断更新和发展,以单细胞转录组测序为代表的测序技术在世界范围内快速普及,该技术极大促进了我们对生物体内细胞异质性的理解。单细胞测序则是指在单个细胞水平上对其携带的遗传信息进行测序,旨在深层次了解同... 详细信息

近年来,随着单细胞技术的不断更新和发展,以单细胞转录组测序为代表的测序技术在世界范围内快速普及,该技术极大促进了我们对生物体内细胞异质性的理解。单细胞测序则是指在单个细胞水平上对其携带的遗传信息进行测序,旨在深层次了解同类细胞的不同亚群的分布及状态、相互作用等。单细胞测序技术的研究成果涉及肿瘤分型、靶向用药、免疫治疗,动植物胚胎发育,心血管疾病的发生发展机制等众多研究领域。同时,单细胞测序在微量检测技术方面的优势,包括新物种鉴定、病原筛查、病原进化、耐药监测和临床诊断等;还包括宿主层面的免疫应答,靶点评估及抗体筛查等。本文从单细胞测序技术在肠道研究中的应用现状进行详细综述,以期为后续研究提供参考。

关键词：单细胞测序技术炎症性肠病结直肠癌肿瘤干细胞免疫细胞巨噬细胞

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SARS-CoV-2的宿主组织分布和体液中排放研究进展

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中国人兽共患病学报 2021年第12期37卷 1118-1122页

作者：张拥军凌华陈爱平重庆医药高等专科学校重庆401331 重庆市疾病预防控制中心重庆400042 高致病性病原微生物重庆市重点实验室重庆400042

由SARS-CoV-2引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)大流行已经持续超过1年,目前对于疾病发病机制尚不完全清晰。本文从病原学角度,总结病毒受体在人体不同组织分布以及不同器官的临床表现,基于尸检报告得出病毒的人体组织细胞嗜性,根据连... 详细信息

由SARS-CoV-2引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)大流行已经持续超过1年,目前对于疾病发病机制尚不完全清晰。本文从病原学角度,总结病毒受体在人体不同组织分布以及不同器官的临床表现,基于尸检报告得出病毒的人体组织细胞嗜性,根据连续体液样品的检测报告推测病毒排放到不同体液中持续时间及特点,以便深入理解SARS-CoV-2的致病机制,选择合理的临床诊断检材,正确解读检测结果,促进感染者管理和治疗、科学防控COVID-19全球大流行疫情。

关键词： SARS-CoV-2 2019年冠状病毒病血管紧张素转化酶2 体液病毒排放

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糖尿病并发症的靶向代谢组学研究进展

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药物评价研究 2022年第6期45卷 1166-1172页

作者：刘宁刘传鑫黄建梅北京中医药大学中药学院北京102488 河南科技大学临床医学院河南科技大学第一附属医院内分泌代谢科国家代谢病临床医学研究中心分中心河南省遗传罕见病医学重点实验室河南洛阳471003

靶向代谢组学是代谢组学的重要组成部分,对目标明确的代谢产物在样本中的含量进行检测,具有特异性强、检测灵敏度高和定量准确等特点。应用靶向代谢组学研究疾病发生发展过程中的差异代谢物并阐明其代谢异常的机制,对疾病诊断及治疗具... 详细信息

靶向代谢组学是代谢组学的重要组成部分,对目标明确的代谢产物在样本中的含量进行检测,具有特异性强、检测灵敏度高和定量准确等特点。应用靶向代谢组学研究疾病发生发展过程中的差异代谢物并阐明其代谢异常的机制,对疾病诊断及治疗具有重要意义。将靶向代谢组学在糖尿病周围神经病变、糖尿病视网膜病变、糖尿病肾病、糖尿病性认知功能障碍、糖尿病性心肌病及糖尿病性黄斑水肿中的应用进行归纳,整合不同疾病发生发展涉及的氨基酸代谢、脂代谢、三羧酸循环及糖酵解等多种代谢途径及相关的差异代谢物,整理了不同并发症的部分生物标志物,以期为后续深入研究、寻找疾病治疗新途径提供思路和方法。

关键词：糖尿病靶向代谢组学糖尿病并发症氨基酸代谢鞘脂代谢

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慢性精神分裂症患者前脉冲抑制知觉空间分离范式的探索性研究

慢性精神分裂症患者前脉冲抑制知觉空间分离范式的探索性研究

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中国神经科学学会精神病学基础与临床分会第十一届学术年会

作者：田晴雷铭李量王传跃首都医科大学附属北京安定医院精神疾病诊断与治疗北京市重点实验室北京大学心理学系言语听觉研究中心机器感知与智能教育部重点实验室

目的:精神分裂症的早期识别问题亟待解决.前脉冲抑制(Prepulse Inhibition,PPI)缺陷及注意缺陷均是该病的内表型指标,可用于病因机制研究.然而,早期研究显示,PPI缺乏灵敏性及特异性,因此,优化PPI范式,提高其效应尺度成为PPI研究的关键.... 详细信息

目的:精神分裂症的早期识别问题亟待解决.前脉冲抑制(Prepulse Inhibition,PPI)缺陷及注意缺陷均是该病的内表型指标,可用于病因机制研究.然而,早期研究显示,PPI缺乏灵敏性及特异性,因此,优化PPI范式,提高其效应尺度成为PPI研究的关键.动物实验证实,正常小鼠可利用知觉空间线索提高PPI水平,而模型组则存在缺陷.所以,PPI知觉空间分离范式可作为潜在生物学指标展开研究.

关键词：精神分裂症前脉冲抑制注意调节缺陷知觉空间分离

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基于CRISPR/Cas9技术构建STING基因敲除猪肺泡巨噬细胞系及其对Ⅰ型干扰素转录的影响

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南方农业学报 2022年第4期53卷 891-898页

作者：黄秋艳杨烨城张昆丽孟繁明李剑豪朱向星王塑天唐冬生佛山科学技术学院生命科学与工程学院/广东省动物分子设计与精准育种重点实验室/广东省基因编辑工程技术研究中心广东佛山528225 广东省农业科学院动物科学研究所/畜禽育种国家重点实验室/广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广东广州510610 广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站广东广州510640

【目的】阐明干扰素基因刺激因子(STING)在猪抗病原微生物感染中的作用机制,为猪传染性胃肠炎、流行性腹泻和猪伪狂犬病等病毒性疾病的科学防控提供参考依据。【方法】基于CRISPR/Cas9技术,在STING基因第4、第8外显子中寻找高分靶点并设... 详细信息

【目的】阐明干扰素基因刺激因子(STING)在猪抗病原微生物感染中的作用机制,为猪传染性胃肠炎、流行性腹泻和猪伪狂犬病等病毒性疾病的科学防控提供参考依据。【方法】基于CRISPR/Cas9技术,在STING基因第4、第8外显子中寻找高分靶点并设计sgRNA序列,将退火的sgRNA与酶切的LentiCRISPRv2载体用T4 DNA连接酶连接以获得LentiCRISPRv2-STING-sgRNA慢病毒载体(STING-sgRNA);以不同的STING-sgRNA慢病毒载体组合及包装质粒psPAX2和包膜质粒pMD2.G共同转染293T细胞,得到含sgRNA的慢病毒再转染3D4/21细胞;经嘌呤霉素筛选和有限稀释法获得单克隆细胞株,通过PCR、测序及Western blotting鉴定STING基因的敲除效果;并采用实时荧光定量PCR验证STING基因敲除对I型干扰素表达的影响。【结果】以不同的STING-sgRNA慢病毒载体组合与HA-STING过表达载体共同转染293T细胞,均能在细胞内对STING真核表达载体产生编辑效果,且以STING-sgRNA(1+5)慢病毒载体组合的编辑效率最高。以编辑效率最高的STING-sgRNA(1+5)慢病毒载体组合及包装质粒psPAX2和包膜质粒pMD2.G共同转染293T细胞包装出慢病毒,再用慢病毒感染3D4/21细胞,结果获得1株STING基因大片段(4989 bp)缺失的3D4/21细胞株,Western blotting检测未发现STING蛋白,说明STING基因敲除3D4/21细胞(3D4/21-STING-/-)构建成功。与野生型3D4/21细胞相比,在转染副猪嗜血杆菌DNA刺激下,3D4/21-STING-/-细胞中的IFN-β基因转录水平显著降低(P<0.05)。【结论】采用CRISPR/Cas9技术能成功大片段敲除3D4/21细胞中的STING基因,而导致STING基因功能丧失;STING基因敲除会导致细胞在病原微生物DNA刺激时Ⅰ型干扰素转录障碍,也提示STING基因可能是猪抗病原微生物感染的关键因子。

关键词： CRISPR/Cas9 STING基因猪肺泡巨噬细胞基因敲除 Ⅰ型干扰素

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