检索结果-内蒙古大学图书馆

中国比较医学杂志 2022年第9期32卷 122-127页

作者：庞硕罗卓慧张连峰中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心国家卫生健康委员会人类疾病比较医学重点实验室北京100021

TSPAN7是一种由位于X染色体上的tspan7基因所编码的四次跨膜糖蛋白,在脑组织和胰腺中高度表达。目前研究发现TSPAN7能够在细胞膜形成TSPAN富集微域(Tspan-enriched microdomains,TEM)或TSPAN网,参与调控细胞内外信息传递与物质交流、细... 详细信息

TSPAN7是一种由位于X染色体上的tspan7基因所编码的四次跨膜糖蛋白,在脑组织和胰腺中高度表达。目前研究发现TSPAN7能够在细胞膜形成TSPAN富集微域(Tspan-enriched microdomains,TEM)或TSPAN网,参与调控细胞内外信息传递与物质交流、细胞骨架、细胞运动以及细胞形态等生物过程。同时,TSPAN7在多种细胞中发挥至关重要的作用,在肿瘤细胞中,TSPAN7作为一把双刃剑,通过在肿瘤细胞中的表达改变发挥促进或抑制肿瘤的能力;在免疫细胞中,TSPAN7可以作为肌动蛋白成核和稳定的正调控因子,参与DCs形态发生;在神经细胞中,TSPAN7参与突触传递和神经元形态发生;在胰岛细胞中,TSPAN7通过调节β细胞的电压依赖性Ca^(2+)通道进而控制钙(Ca^(2+))进入胰腺β细胞,影响胰岛素分泌。TSPAN7在不同组织细胞中发挥相应作用,在生理和病理条件下发生改变,参与肿瘤、精神疾病、Ⅰ型糖尿病等多种疾病的发生发展。本文旨在综述TSPAN7在多种疾病中的作用机制,以期为动物模型研制、疾病诊断、药物干预治疗提供新思路。

关键词： TSPAN7 癌症 Ⅰ型糖尿病 HIV-1蛋白 X连锁的智力障碍孤独症谱系障碍

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基于人工智能辅助分析的感染性疾病精准诊断

基于人工智能辅助分析的感染性疾病精准诊断

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作者：夏涵官远林李长诚马自立胡龙佟斯垚西咸新区予果微码生物科技有限公司

西咸新区予果微码生物科技有限公司（以下简称“予果生物”或“公司”）成立于2017年，立足于中国感染精准医学行业，基于人工智能辅助分析的感染性疾病精准诊断，致力打造病原微生物分析的全产品方案。予果生物坚持以技术创新驱动，作... 详细信息

标准号: 2300190033

西咸新区予果微码生物科技有限公司（以下简称“予果生物”或“公司”）成立于2017年，立足于中国感染精准医学行业，基于人工智能辅助分析的感染性疾病精准诊断，致力打造病原微生物分析的全产品方案。予果生物坚持以技术创新驱动，作为国内最早推动Cell-free mNGS转化于应用的企业，参与并完成了科技部第一批“十三五”国家重点研发项目，参与省市级科研项目4项;公司病原微生物高通量宏基因检测产品荣获“科创中国”先导技术奖(生物医药方向）;公司获国家高新技术企业、西安市工程研究中心、西安市工程技术研究中心、西安市硬科技企业之星、陕西省潜在瞪羚企业认证，荣评第十届中国创新创业大赛全国优秀企业、中国创新创业大赛陕西省二等奖、西安国际创业大赛二等奖。公司持续围绕感染性疾病病原微生物精准诊断，打造行业最大规模研发及生信团队，公司负责人带领团队持续投资研发并推进前沿应用，实现了技术创新及产品的更新迭代。“基于人工智能辅助分析的感染性疾病精准诊断”技术，融合了测序数据和临床实验室检验数据，并创新性地通过多源数据融合模型对两类数据实现了优势互补。通过人工智能将测序大数据和临床大数据进行深度整合，囊括超高维度特征值分析和过滤模型，可进行多组学、跨物种的基因组大数据研究和应用，可全面、真实和精准检测超3万种病原。结合联邦学习构架实现病原诊断符合率超88%，位居行业领先地位。公司围绕核心技术开展高价值专利布局，累计申请发明专利25项，其中已授权11项，软著40项，团队成员发表SCI文章90余篇，影响因了超400分。领先于国际水平的自研核心技术，有效解决了传统病原诊断方法速度慢、种类少、诊断难的困境，帮助医生和患者快速明确感染病因。立足于公司自研核心技术“基于人工智能辅助分析的感染性疾病精准诊断一Cell-free方法学、结构化微生物数据库及全流程“超高维度特征值分析”病原鉴定模型”，开发了PACEseq病原微生物产品、BloodSeq血液重要病原体产品、mTBPro病原微生物高敏结核与非结核及耐药突变位点产品、DRseq临床重点病原体产品等多款临床刚需产品:相继推出生物安全性高、抗污染能力强的自动化设备VacumnLab、全自动样本处理平台MetaLab 1·68、获授权全球最新测序仪、申报二代与三代测序病原微生物分析软件及自动化分析系统DataLab 3.14等，为病原数据分析提供了全流程本地化解决方案。基于项目核心技术自主研发产品，公司于2022年实现营业收入超亿元。公司已在北京、上海、广州、西安、南京、长沙、成都、合肥、南宁、南昌、重庆等城市建立本地化产品中心，业务范围覆盖全国超150个城市，服务超1200家医院，产品应用超25万例样本。力争以最短的时间为更多患者提供病原精准数据分析，明确感染病因。公司核心技术通过产业化成果转化已在临床刚需产品中得以较好的应用推广。核心产品具体如下： PACEseq病原微生物检测产品，融合Cell free-mNGS、泛基因组及“超高维度特征值分析”技术，全面、真实和精准检测30248种病原。 BloodSeq血液重要病原体检测产品，以低载量核酸湿实验技术，优化靶向扩增及NGS技术，检测271种重要病原体及18种耐药基因，解决血液病原检测难的问题。 mTB Pro病原微生物高敏结核与非结核及耐药突变位点产品，全面覆盖30248种病原体，精准优化10种结核与39种非结核的种水平鉴定及25种药物耐药基因SNP变异检测，适用于BALF、痰液、脑脊液、血液及组织等多种临床样本。 Drseq临床重点病原体产品，是一种针对临床重点病原体的更快速、更高敏的病原体检测方法，可覆盖57种细菌、21种真菌、17种DNA病毒、52种RNA病毒、7种寄生虫和7种特殊病原体，采用高通量测序平台，以全因素权重体系病原体鉴定人工智能算法，精准鉴定病原体及重要耐药基因，辅助临床进行快速、精准、抗感染治疗。 HUGO VacuumLab全自动核酸提取仪是一种基于膜吸附原理的自动化核酸提取设备，能够自动完成样本的核酸提取和纯化，可用于供医疗机构对来源于人体的血清、血浆、脱落细胞、拭子等样本进行核酸提取。HUGO VacuumLab核酸提取时间短，仅需30min就可以完成一轮操作，可有效节约报告时间。 MetaLab 1 • 68是由予果自主研发的全自动样本处理平台，用于mNGS的样本前处理，自动完成核酸提取和文库构建，同时兼容qPCR的体系配制。MetaLab 1 • 68是世界首创的多个独立腔室且带负压控制的全自动核酸提取建库平台，真正实现了无人值守，无需人工干预添加耗材，极大地推动NGS的落地。 DataLab 3 • 14自动化病原分析系统，配合自主研发的病原分析软件，可实现测序数据¥机后的自动分析并出具报告，与其他

关键词：感染性疾病诊断人工智能病原诊断方法

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SARS-CoV-2的宿主组织分布和体液中排放研究进展

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中国人兽共患病学报 2021年第12期37卷 1118-1122页

作者：张拥军凌华陈爱平重庆医药高等专科学校重庆401331 重庆市疾病预防控制中心重庆400042 高致病性病原微生物重庆市重点实验室重庆400042

由SARS-CoV-2引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)大流行已经持续超过1年,目前对于疾病发病机制尚不完全清晰。本文从病原学角度,总结病毒受体在人体不同组织分布以及不同器官的临床表现,基于尸检报告得出病毒的人体组织细胞嗜性,根据连... 详细信息

由SARS-CoV-2引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)大流行已经持续超过1年,目前对于疾病发病机制尚不完全清晰。本文从病原学角度,总结病毒受体在人体不同组织分布以及不同器官的临床表现,基于尸检报告得出病毒的人体组织细胞嗜性,根据连续体液样品的检测报告推测病毒排放到不同体液中持续时间及特点,以便深入理解SARS-CoV-2的致病机制,选择合理的临床诊断检材,正确解读检测结果,促进感染者管理和治疗、科学防控COVID-19全球大流行疫情。

关键词： SARS-CoV-2 2019年冠状病毒病血管紧张素转化酶2 体液病毒排放

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基于神经网络的酿酒酵母细胞检测方法

基于神经网络的酿酒酵母细胞检测方法

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作者：李帅江南大学

学位级别：硕士

微生物感染一般可以分为细菌感染、病毒感染以及真菌感染。微生物感染导致的疾病是人类最常见的疾病,也是人类身上发生最多的感染性疾病。侵入性酿酒酵母感染是一种非常典型的侵入性真菌感染疾病,例如,服用酵母菌制剂后导致原因不明的... 详细信息

微生物感染一般可以分为细菌感染、病毒感染以及真菌感染。微生物感染导致的疾病是人类最常见的疾病,也是人类身上发生最多的感染性疾病。侵入性酿酒酵母感染是一种非常典型的侵入性真菌感染疾病,例如,服用酵母菌制剂后导致原因不明的发烧、肺炎、真菌血症、肝脓肿、腹膜炎、阴道炎、尿路感染或感染性休克等。临床上常用病原菌检测方法的操作过程不仅繁琐耗时和需要昂贵的高精度仪器,而且在操作过程中还有可能污染测试样品,因此建立一种新的酿酒酵母快速检测方法对该疾病的及时预防和快速诊断有着重要意义。本文以侵入性酿酒酵母感染疾病检测作为具体研究对象,用深度学习的方法对血液显微图像中的酿酒酵母细胞进行检测,实现对显微图像中酿酒酵母细胞的快速准确检测,具体的内容阐述如下:(1)简要介绍了卷积神经网络的基础结构,包括对卷积层、池化层、激活函数、全连接层以及损失函数的基本介绍,然后对Res Net和Ghost Net这两个卷积神经网络模型的结构进行了描述,并在后续对其进行了使用。(2)为了模拟酿酒酵母细胞侵入血液的真实环境,本研究在实验室完成了酿酒酵母细胞的培养活化,使用志愿者捐献的血液完成了酿酒酵母感染样本的制备,使用显微镜采集样本图像,并使用标注软件对图像中的酿酒酵母细胞进行标注,搭建了酿酒酵母细胞感染数据集。使用SSD算法对血液细胞与酿酒酵母细胞混合溶液的显微图像进行检测,对检测方法进行可行性验证。为了提升网络性能,首先对SSD算法的特征提取网络进行替换,使用Res Net50卷积神经网络作为SSD算法的特征提取网络,然后在五个额外的特征层上各个卷积层的后面添加了批标准化(Batch Normalization,BN)层。通过以上方法构建了一个更高精度的酿酒酵母细胞检测算法,平均精度(Average Precision,AP)为97.70%,在CPU上单张图片的检测速度为0.31s,比原始SSD算法的平均精度高了1.88%,检测速度无明显差异。(3)对YOLOv3算法进行了改进,进一步提升检测精度和检测速度并减少模型参数数量。首先为了减少模型参数数量,提升检测速度,对YOLOv3算法的特征提取网络进行替换,使用轻量级卷积神经网络Ghost Net作为特征提取网络对Dark Net53进行替换,并将YOLOv3网络的部分卷积层修改为深度可分离卷积,模型的参数数量减少为原来的大约五分之一,检测速度得到提升。为了提高小目标的检测效果,利用扩张卷积增加Ghost Net的感受野;并使用性能更好的Hard Swish激活函数替换了Leaky Re LU激活函数。此外,为了更准确地定位酿酒酵母细胞,将CIo U损失函数应用于边界框回归,其可以对两个边界框之间的距离直接进行最小化,获得更快的收敛速度和更好的回归效果。最后通过在网络结构中加入CBAM注意力机制,使得网络能够更好地关注重点特征。对显微图像通过消融实验进行了验证,由实验结果可知,改进后的YOLOv3与原始YOLOv3相比检测精度和检测速度均得到了提升,平均精度AP为97.96%,在GPU上单张图片的检测时间为0.021s。此外,与Faster R-CNN、SSD、Retina Net、Efficient Det这些经典的目标检测方法以及第三章中使用的基于Res Net50的SSD算法相比,改进之后的YOLOv3拥有着更高的检测精度和更快的检测速度,这进一步体现了改进后的YOLOv3性能的优越性。综上所述,本文针对常用病原菌检测方法操作繁琐耗时等缺点,提出了基于神经网络的侵入性酿酒酵母感染疾病的检测方法,实现了对血液显微图像中酿酒酵母细胞的快速准确检测,为检测侵入性酿酒酵母感染以及其他由微生物导致的相关疾病提供了一种新的、有潜力的方法,同时对发展和完善深度学习技术在细胞检测领域的应用有积极的作用。

关键词：酿酒酵母细胞检测卷积神经网络深度学习 YOLOv3 SSD

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结合多尺度特征融合和注意力机制的肺腺癌病理图像分类胶囊网络

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新疆大学学报（自然科学版中英文） 2024年第3期41卷 319-328页

作者：李思雨高静王云玲帕力旦·吐尔逊马玉花新疆大学软件学院新疆乌鲁木齐830091 新疆临床基因检测与生物医学信息重点实验室新疆克拉玛依834099 新疆克拉玛依市消化系统肿瘤精准医学临床研究中心新疆克拉玛依834099 新疆克拉玛依市中心医院病理科新疆克拉玛依834099 新疆医科大学第一附属医院影像中心新疆乌鲁木齐830011 新疆师范大学计算机科学技术学院新疆乌鲁木齐830054

病理学家通过分析肺腺癌低级别组织和癌旁组织来确定病灶切除范围,然而,两者间的细胞形态差异较小,分析时依赖病理学家的主观经验,耗时且易误诊.故提出一种结合多尺度特征融合和通道自注意力的胶囊网络(Multi-Scale Feature Fusion with... 详细信息

病理学家通过分析肺腺癌低级别组织和癌旁组织来确定病灶切除范围,然而,两者间的细胞形态差异较小,分析时依赖病理学家的主观经验,耗时且易误诊.故提出一种结合多尺度特征融合和通道自注意力的胶囊网络(Multi-Scale Feature Fusion with Self-Channel Attention for Capsule Network, MSCNet),用于帮助医生高效诊断疾病,为患者提供更好的治疗方案.首先,设计了多尺度特征融合模块来提升胶囊网络以捕捉同源图像不同尺度间的语义信息,试图减少模型计算量以提高处理速度及分类准确性.其次,通道自注意力(Self-Channel Attention, SCA)模块作为MSCNet的另一重要组件,可以寻找到更具代表性的特征,辅助识别组织病理学图像中的细微特征,降低误诊风险.实验结果表明,在肺腺癌低级别组织与癌旁组织的二分类任务中,MSCNet实现了99.34%的分类准确率、97.65%的F1-Score值和97.57%的精确度.

关键词：肺腺癌多尺度特征融合注意力机制胶囊网络

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外泌体在慢性阻塞性肺疾病中的作用

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中华临床实验室管理电子杂志 2023年第1期11卷 45-51页

作者：王敏张妍王盈熹赵龙夏书月大连医科大学研究生院辽宁大连116044 沈阳医学院附属中心医院呼吸科辽宁沈阳110024

慢性阻塞性肺疾病(COPD)在全球范围内的发病率和死亡率均很高,其特征是慢性炎症和进行性气流阻塞。目前未有药物治疗被证明可以提高COPD患者的存活率。近年来外泌体因参与炎性反应、免疫调节和损伤修复等成为研究热点,同时有研究发现外... 详细信息

慢性阻塞性肺疾病(COPD)在全球范围内的发病率和死亡率均很高,其特征是慢性炎症和进行性气流阻塞。目前未有药物治疗被证明可以提高COPD患者的存活率。近年来外泌体因参与炎性反应、免疫调节和损伤修复等成为研究热点,同时有研究发现外泌体与COPD的发生发展密切相关。本综述介绍了外泌体的生物学特性、成分和功能,进而列举了外泌体在COPD的生物标志物方面及发病机制中的相关研究,阐明了外泌体在辅助临床诊断和治疗呼吸系统疾病方面的最新进展。希望为呼吸系统疾病的诊疗带来新的思考。

关键词：慢性阻塞性肺疾病外泌体微RNA 发病机制生物标志物

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类风湿性关节炎生物标志物的研究新进展

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中华检验医学杂志 2019年第9期42卷 723-726,727-730页

作者：李昊隆李永哲中国医学科学院北京协和医院检验科侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730

类风湿性关节炎(RA)是一种常见的慢性、全身性自身免疫性疾病,确切发病机制尚不明确,临床表现以侵蚀性、对称性多关节炎为主。早期诊断RA对判断疾病的严重程度,改善预后以及提高RA患者生活质量有重要意义。目前,RA患者血清中已经发现多... 详细信息

类风湿性关节炎(RA)是一种常见的慢性、全身性自身免疫性疾病,确切发病机制尚不明确,临床表现以侵蚀性、对称性多关节炎为主。早期诊断RA对判断疾病的严重程度,改善预后以及提高RA患者生活质量有重要意义。目前,RA患者血清中已经发现多种自身抗体以及蛋白质类生物标志物,文章就以往发现的RA患者血清中存在的几种自身抗体以及近年来新发现的血清标志物在RA中的诊断、预后评价等方面的研究进展进行阐述。

关键词：关节炎,类风湿自身抗体生物标记

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我国巴贝虫病流行现状与研究进展

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热带病与寄生虫学 2022年第3期20卷 149-157页

作者：陈木新薛靖波艾琳宋鹏蔡玉春陈家旭中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心国家级热带病国际联合研究中心深圳市疾病预防控制中心海南热带病研究中心(国家热带病研究中心海南分中心)

巴贝虫病是由巴贝虫感染引起的一类人兽共患寄生虫病。巴贝虫经蜱叮咬、输血或器官移植等途径传播，主要寄生于人或其他脊椎动物红细胞内。感染人体的巴贝虫主要有田鼠巴贝虫、猎户巴贝虫、邓肯巴贝虫、分歧巴贝虫等。巴贝虫病呈世界性... 详细信息

巴贝虫病是由巴贝虫感染引起的一类人兽共患寄生虫病。巴贝虫经蜱叮咬、输血或器官移植等途径传播，主要寄生于人或其他脊椎动物红细胞内。感染人体的巴贝虫主要有田鼠巴贝虫、猎户巴贝虫、邓肯巴贝虫、分歧巴贝虫等。巴贝虫病呈世界性分布，多发于夏秋季节，在我国属于新发、罕见寄生虫病。过去临床上缺乏敏感有效的诊断方法，导致很多巴贝虫病患者未能得到及时治疗。随着高敏感性的分子生物学检测技术在临床上的应用，巴贝虫病病例报告数量逐渐增多。本文详细回顾了1943年至今我国人巴贝虫病病例报告情况，概述了巴贝虫病诊断、治疗和致病机制等方面的研究进展，分析了我国巴贝虫病防控的挑战和前景。

关键词：巴贝虫病流行临床表现诊断治疗研究进展挑战

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纳米硒制备方法、抗氧化作用机制及临床应用研究进展

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山东医药 2021年第6期61卷 103-108页

作者：黄轶驰田红旗北京协和医学院中国医学科学院放射医学研究所天津30019 天津市放射医学与分子核医学重点实验室

硒是人体必需的微量元素之一,纳米技术制备的红色单质硒生物相容性高,安全性好,同时具有良好的抗氧化活性。制备纳米硒的方法主要包括化学、生物(如细菌、真菌、植物等)及物理制备三类:化学方法可通过硒源与还原剂发生氧化还原反应制备... 详细信息

硒是人体必需的微量元素之一,纳米技术制备的红色单质硒生物相容性高,安全性好,同时具有良好的抗氧化活性。制备纳米硒的方法主要包括化学、生物(如细菌、真菌、植物等)及物理制备三类:化学方法可通过硒源与还原剂发生氧化还原反应制备纳米硒,同时用稳定剂对纳米硒表面进行修饰,可提高其生物活性和稳定性,调控制备纳米硒的释放速率;细菌、真菌及植物提取物均可用于生物制备纳米硒;γ-辐射和微波辐射等物理方法常作为化学或生物制备纳米硒的辅助方法,提升制备效率,提高纳米硒产量和质量。纳米硒主要通过直接清除活性氧簇、增强酶促抗氧化系统抗氧化能力及抑制细胞凋亡等机制发挥抗氧化作用。纳米硒在预防、保护氧化应激所致的组织损伤(例如生殖、消化系统)以及治疗神经系统疾病和糖尿病等相关疾病中可发挥重要作用。

关键词：硒纳米硒抗氧化剂活性氧氧化应激

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microRNAs在自身免疫性疾病中的研究进展

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中国新药杂志 2020年第14期29卷 1596-1601页

作者：任禹珂王超吕建军屈哲霍桂桃张頔杨艳伟王雪李波林志中国食品药品检定研究院国家药物安全评价监测中心药物非临床研究北京市重点实验室

microRNAs(miRNAs)是一类单链内源性非编码小RNAs,长度约为18～25个核苷酸,在调控基因表达、细胞生长、分化及凋亡、生物的生长发育和疾病中发挥重要作用。自身免疫性疾病是以自身免疫反应导致组织器官损伤和相应功能障碍为主要发病机... 详细信息

microRNAs(miRNAs)是一类单链内源性非编码小RNAs,长度约为18～25个核苷酸,在调控基因表达、细胞生长、分化及凋亡、生物的生长发育和疾病中发挥重要作用。自身免疫性疾病是以自身免疫反应导致组织器官损伤和相应功能障碍为主要发病机制的一类疾病。研究发现多种miRNAs的异常表达有可能成为这类疾病早期诊断的生物标志物或临床治疗的靶标。本文对miRNAs的生物学特点以及miRNAs在自身免疫性疾病中的研究进展进行综述。

关键词： microRNAs 自身免疫作用机制生物标志物

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