检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：王杨北京协和医学院

学位级别：博士

背景:在全球范围内,乳腺癌是威胁女性健康的最主要恶性肿瘤,其高发病率对公共健康构成了严峻挑战。目前研究者们逐步揭露了线粒体在细胞代谢、能量转换及调控细胞命运中的核心作用。尤其在肿瘤学领域,线粒体功能的紊乱与癌症细胞的代谢... 详细信息

背景:在全球范围内,乳腺癌是威胁女性健康的最主要恶性肿瘤,其高发病率对公共健康构成了严峻挑战。目前研究者们逐步揭露了线粒体在细胞代谢、能量转换及调控细胞命运中的核心作用。尤其在肿瘤学领域,线粒体功能的紊乱与癌症细胞的代谢重编程之间的密切联系逐渐成为研究焦点。线粒体不仅是细胞能量的主要来源,其在调控细胞存活、促进或抑制肿瘤进展中也扮演着关键角色。因此,针对线粒体功能相关基因在乳腺癌中的作用进行深入研究,不仅能够为理解乳腺癌的发病机制提供新的视角,同时也为预后评估和风险分层提供新的策略。基于此,本研究旨在通过构建一个基于线粒体相关基因的风险预测模型,探索其在改善乳腺癌患者预后预测及风险分层中的应用潜力,以期为乳腺癌的治疗和管理提供更为精确的分子标靶。方法:本研究利用了两个权威数据库中的乳腺癌样本数据:癌症基因组图谱计划(TCGA)和国际乳腺癌分子分类联盟(METABRIC),分别充当训练集与验证集。通过深度分析这些样本的转录组数据,筛选出8个与乳腺癌预后紧密相关的线粒体功能相关基因,进而应用Lasso-Cox回归分析方法构建出一个新颖的风险评分模型。该模型的预后预测效能通过受试者操作特征(ROC)曲线进行了验证。为了增强预后预测的准确性,我们将风险评分模型与患者的临床特征结合,进一步开发了一个列线图(Nomogram)模型,并通过决策曲线分析和临床校准曲线验证了其预测准确性。随后我们进行功能富集和免疫浸润分析,深入探讨了不同风险组之间存在预后差异的可能原因,同时包括突变状态和药物敏感性的比较。最后我们补充了分子生物学实验,分析特定基因在乳腺癌细胞系中的作用。结果:我们成功构建了一个包括ACSL1、ALDH2、MTHFD2、MRPL13、TP53AIP1、SLC1A1、ME3和BCL2A1这8个线粒体相关基因的风险评分模型。分析结果显示,该模型能够作为乳腺癌患者生存预后的独立风险预测因子(风险比HR=3.028,95%置信区间2.038-4.499,P<0.001)。通过进一步的分组分析,我们发现低风险组患者相比于高风险组,不仅展现了更优的生存预后,而且在免疫浸润水平、突变景观以及对抗肿瘤药物的敏感性等方面均表现出较为积极的趋势。而且高低风险组在肿瘤微环境和治疗反应性等方面也存在显著差异,为乳腺癌患者的个体化治疗提供了重要依据。最后我们通过分子生物学实验对模型中的部分基因进行了进一步验证,增加了基础实验水平的验证。结论:综上所述,本研究开发的基于线粒体相关基因的风险模型不仅在乳腺癌患者的生存预后评估中展现出良好的应用潜力,而且对于患者的风险分层及后续治疗策略的制定具有一定的指导意义,同时也为未来乳腺癌的研究和治疗提供了新的线索。背景:乳腺癌是全球女性中最常见的恶性肿瘤之一,其复杂的发病机制至今不完全明了,限制了治疗策略的发展。随着生物信息学技术的进步,全蛋白质组和全转录组关联研究(PWAS/TWAS)为探索乳腺癌的分子机制和发现新的生物标志物提供了可能。结合孟德尔随机化方法,本研究旨在从血浆蛋白的角度,深入分析其与乳腺癌之间的相关性及因果关系,为乳腺癌的预防、诊断和治疗提供新的视角和靶点。本研究旨在通过结合孟德尔随机化的蛋白质组和转录组关联研究,识别与乳腺癌相关且具有因果性的血浆蛋白。方法:我们采用了一种创新的高通量数据分析策略,构建了一个包含两个主要阶段的分析框架,以在分子层面深入探讨乳腺癌的潜在生物标志物和治疗靶点。在第一阶段,我们运用了全蛋白质组和全转录组关联研究(P/TWAS),它能够全面扫描并识别在血浆样本中表达量与乳腺癌风险之间存在显著相关性的血浆蛋白。这一步骤是基于大规模人群的遗传和蛋白质表达数据,通过统计分析揭示哪些蛋白变化与乳腺癌的发生有关。在第二阶段,我们引入了孟德尔随机化方法,来测试特定暴露(如某血浆蛋白的表达水平)和疾病结果(如乳腺癌)之间因果关系。通过这种方法,我们能够区分那些仅与乳腺癌相关的蛋白质与那些可能直接导致乳腺癌发生的蛋白质。为了确保我们发现的因果关系的准确性和稳健性,我们采用外部队列验证以及多种敏感性分析:包括贝叶斯共定位分析,用于评估遗传变异对蛋白质表达和乳腺癌风险的影响是否共享相同的遗传位点;Steiger检测,以确认遗传工具的方向性是否与假设一致;异质性和多效性检测。这些分析方法加强了我们结果的可信度和应用价值。最后,我们对与乳腺癌风险显著相关的血浆蛋白进行了功能富集分析,更深入地理解这些蛋白在乳腺癌发生发展中的作用机制,并评估它们是否具备成为未来药物开发靶标的潜力。结果:在我们的研究中,我们成功地鉴定了五种与乳腺癌有着强关联及因果联系的血浆蛋白。其中,PEX14(OR=1.201,P=0.016)和 CTSF(OR=1.114,P<0.001)均显示出与乳腺癌的正

关键词：乳腺癌线粒体风险标志物预后代谢重编程乳腺癌全蛋白组关联研究全转录组关联研究血浆蛋白孟德尔随机化

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稻曲病菌菌株GZ-14-07中携带的全病毒基因组特征研究

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生物技术通报 2020年第10期36卷 80-87页

作者：张婷婷滕丽蔡小姚龙慧李升愉刘红美贵州医科大学生物与医学工程重点实验室贵阳550000 贵州医科大学基础医学院贵阳550000 贵州医科大学环境污染与疾病监控省部共建教育部重点实验室贵阳550000

稻曲病菌是引起真菌类病害水稻稻曲病的病原。从稻曲病菌菌株GZ-14-07中分离到一株真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens RNA virus 6(UvRV6),对其进行了序列分析。通过CF-11纤维素粉法提取菌株GZ-14-07中的真菌病毒UvRV6,采用随机引... 详细信息

稻曲病菌是引起真菌类病害水稻稻曲病的病原。从稻曲病菌菌株GZ-14-07中分离到一株真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens RNA virus 6(UvRV6),对其进行了序列分析。通过CF-11纤维素粉法提取菌株GZ-14-07中的真菌病毒UvRV6,采用随机引物扩增法获得UvRV6的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对UvRV6的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析。研究发现UvRV6全基因组长度为5043个碱基,GC为48.8%,UvRV6基因组序列中存在两个开放阅读框(ORF1和ORF2),ORF1长2280个碱基,编码760个氨基酸(79.6 kD),ORF2长2385个碱基,编码830个氨基酸(91.5 kD)。ORF1和ORF2编码的蛋白,分别与全病毒科维多利亚属真菌病毒成员的衣壳蛋白和依赖于RNA的RNA聚合酶显著出较高的相似性。另外,UvRV6的ORF1和ORF2之间有一个AUGA序列,在AUGA序列上游存在一段能形成一个H型的假节序列,这两个序列元件的存在使UvRV6两个开放阅读框(ORF1和ORF2)能通过翻译终止后又重新启动翻译的机制,融合成一个大的开放阅读框。最后,通过UvRV6和其他全病毒科成员的依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白序列构建的系统进化树分析得出,UvRV6与属于全病毒科维多利亚属的成员聚集成一簇。明确了UvRV6属于全病毒科维多利亚属的新成员。

关键词：稻曲病菌真菌病毒 dsRNA 全病毒科维多利亚属

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1型发作性睡病相关生物学标志物的研究进展

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中风与神经疾病杂志 2023年第3期40卷 241-243页

作者：高明康史亚茹刘震王艺博(综述) 褚旭(审校) 济宁医学院临床医学院山东济宁272002 兖州惠民医院山东济宁272100 济宁医学院附属医院山东济宁272000

1型发作性睡病(NT1)是一种以下丘脑神经递质丢失为显著特征的严重神经系统疾病 [1] ,脑脊液(CSF)中食欲素-A(又称下丘脑外侧区分泌素-1,Hct1)缺乏是NT1患者典型的生物学标志物 [2] ,但是在目前的临床实践中,受限于脑脊液标本的采集及储... 详细信息

1型发作性睡病(NT1)是一种以下丘脑神经递质丢失为显著特征的严重神经系统疾病 [1] ,脑脊液(CSF)中食欲素-A(又称下丘脑外侧区分泌素-1,Hct1)缺乏是NT1患者典型的生物学标志物 [2] ,但是在目前的临床实践中,受限于脑脊液标本的采集及储存等因素,无形中增加了对Hct1的检测难度和操作复杂性。近年来的流行病学研究显示NT1患病率为25~50/10万人 [3] ,已成为一个日渐严重的健康问题,并且由于NT1患者的日间过度睡眠(EDS),表现为白天不可克制的睡眠发作,以及本病的特征性症状即猝倒发作 [4] ,均严重影响到NT1患者的人身安全及生活质量。目前对于NT1的诊断主要依赖于典型症状和包括多次小睡潜伏期实验(MSLT)、多导睡眠图(PSG)等在内的神经电生理检查 [5] ,但由于发作性睡病从出现症状到确诊的时间跨度可长达5~15年,并且许多临床医生对该疾病的认知度较低,有研究表明可能高达一半的发作性睡病患者不能得到及时的诊断和治疗 [6] ,近年来,随着人们对发作性睡病认识的逐步提高,研究人员也在NT1发病机制上取得很大进展,但是到目前为止,仍缺乏与NT1早期诊断及病程监测等明确相关的生物学标志物,现就1型发作性睡病相关生物学标志物的研究进展予以综述。

关键词： 1型发作性睡病生物学标志物进展

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2016～2017年河北地区侵袭性真菌感染的病原菌分布特征

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中国真菌学杂志 2019年第5期14卷 257-263页

作者：栗方李志荣赵建宏赵颖张延海董爱英刘金禄郭彦言孙艳赵文申谢守军魏宏莲张金艳任宏涛王建升吴相锟光晓刘冬青杜红丽郭映辉徐英春肖盟杨文航徐晓琳河北燕达医院感染与疾病控制部廊坊065201 首都医科大学附属北京朝阳医院感染与微生物科北京100020 河北医科大学第二医院河北省临床检验中心石家庄050000 中国医学科学院北京协和医院检验科侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730 河北燕达医院廊坊065201 华北理工大学附属医院唐山063000 河北北方学院附属第一医院张家口075000 河北省唐山市工人医院唐山063000 沧州市中心医院沧州061001 邯郸市中心医院邯郸056001 承德医学院附属医院承德067000 河北医科大学第二医院石家庄050000 河北医科大学第四医院石家庄050019 邢台市人民医院邢台054001 河北省人民医院石家庄050057 河北省武安市第一人民医院武安056300 邯郸市第一医院邯郸056002 衡水市人民医院衡水053000 河北省儿童医院石家庄050030

目的了解2016~2017年河北地区16家三级教学医院侵袭性真菌感染现状,为临床诊治和感染防控提供数据资料。方法各参与单位收集引起侵袭性真菌感染的酵母菌和丝状真菌菌株,中心实验室应用Vitek MS质谱分析进行菌株复核鉴定,对Vitek MS不能... 详细信息

目的了解2016~2017年河北地区16家三级教学医院侵袭性真菌感染现状,为临床诊治和感染防控提供数据资料。方法各参与单位收集引起侵袭性真菌感染的酵母菌和丝状真菌菌株,中心实验室应用Vitek MS质谱分析进行菌株复核鉴定,对Vitek MS不能有效鉴定的疑难和罕见菌株采用ITS和/或钙调蛋白CaM测序分析。结果16家医院共检出侵袭性真菌493株,其中酵母菌268株(54.36%),丝状真菌225株(45.64%)。酵母菌主要是白念珠菌41.79%,其次是热带念珠菌、近平滑念珠菌和光滑念珠菌。丝状真菌主要是烟曲霉58.22%,其次是黄曲霉/米曲霉和黑曲霉。侵袭性真菌复核正确率(373/493)75.66%。结论引起的侵袭性真菌感染中最常见的是念珠菌为主的酵母菌和曲霉菌为主的丝状真菌。采用微生物质谱鉴定结合ITS/CaM区测序方法可以有效提高真菌的鉴定正确率,为临床侵袭性真菌的治疗提供参考依据。

关键词：侵袭性真菌酵母菌丝状真菌分布特征

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基于基因测序和GEO数据挖掘探讨结核性溃疡的发病机制

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中国感染控制杂志 2023年第1期22卷 23-30页

作者：高贝贝黄子慧陈思琪曹丽敏翁嘉晨郭丹丹陈悦南京中医药大学附属南京市中西医结合医院江苏南京210014

目的通过生物信息学途径,挖掘结核性溃疡发生发展过程中的关键基因,为结核性溃疡的研究提供新思路。方法选择课题组前期基因测序的数据集及基因表达综合数据库(GEO)下载的数据集GSE83456,利用R软件筛选出共同的差异表达基因,再对共同的... 详细信息

目的通过生物信息学途径,挖掘结核性溃疡发生发展过程中的关键基因,为结核性溃疡的研究提供新思路。方法选择课题组前期基因测序的数据集及基因表达综合数据库(GEO)下载的数据集GSE83456,利用R软件筛选出共同的差异表达基因,再对共同的差异基因进行基因本体论(GO)以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用STRING及Cytoscape软件构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络并进行可视性,使用cytoHubba插件进一步筛选出关键基因,用基因组富集分析(GSEA)进行验证。选取2021年7月—2022年3月某院住院的60例结核性溃疡患者及同期60例健康体检人员,利用逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)对血清中的关键基因进行验证。结果筛选出共同的差异表达基因19个,主要富集在抗病毒免疫反应、单核细胞趋化性调节、干扰素-β等功能以及NOD样受体信号通路、感染性疾病等方面。分析PPI后筛选出GBP1作为关键基因,GSEA证实GBP1与结核性溃疡高度相关。qRT-PCR证实GBP1在结核性溃疡患者的血清中高表达,并在治疗2周后明显下降(均P<0.001)。结论GBP1可能成为结核性溃疡诊断的生物学标志物以及治疗的潜在靶点。

关键词：结核性溃疡生物信息学基因发病机制 GBP1

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基于生物信息学方法分析FAM20A在甲状腺癌中的诊断价值

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实用肿瘤学杂志 2023年第3期37卷 230-235页

作者：吴南楠尹瑞梨孙荣欣赵冬首都医科大学附属北京潞河医院内分泌代谢与免疫性疾病中心北京101149 糖尿病防治研究北京市重点实验室

目的采用多种生物信息学分析工具和免疫组织化学染色,明确序列相似性20家族成员A(Family with sequence similarity 20 member A,FAM20A)在甲状腺癌(Thyroid carcinoma,TC)中的表达及临床诊断意义。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库... 详细信息

目的采用多种生物信息学分析工具和免疫组织化学染色,明确序列相似性20家族成员A(Family with sequence similarity 20 member A,FAM20A)在甲状腺癌(Thyroid carcinoma,TC)中的表达及临床诊断意义。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取甲状腺癌相关数据,分析FAM20A在甲状腺癌组织和正常组织之间的表达差异,绘制ROC曲线计算AUC值,评估FAM20A对甲状腺癌的诊断效能。利用GEO数据库下载GSE205733甲状腺癌数据集,分析FAM20A基因在甲状腺癌组织中的表达水平,并进行基因富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA);利用在线数据库STRING分析FAM20A的蛋白相互作用网络。同时收集2022年3月—2023年2月期间于首都医科大学附属北京潞河医院甲状腺外科行甲状腺结节手术的29例患者病理组织样本,进行病理组织石蜡切片和免疫组织化学染色,验证比较甲状腺癌及良性甲状腺结节样本中FAM20A的表达水平。结果TCGA数据库结果表明,与正常甲状腺组织相比,FAM20A在甲状腺癌组织中的表达显著升高(P<0.001)。FAM20A表达水平与甲状腺癌临床TNM分期和病理分型相关(P<0.05)。FAM20A对于甲状腺癌的诊断效能显著(AUC=0.828)。GSE205733数据分析显示与正常组织相比,FAM20A在甲状腺癌组织中表达显著增加(P<0.001)。GSEA富集分析结果显示FAM20A主要与P53和白介素等信号传导通路相关。STRING数据库分析显示与FAM20A相互作用的蛋白主要有PEAK,FAM20C和ENAM等。免疫组织化学染色结果显示FAM20A在甲状腺癌组织中表达显著增加(P<0.05)。结论FAM20A基因在甲状腺癌组织中高表达,与患者临床TNM分期和病理分型相关,可作为诊断甲状腺癌的潜在分子标记物,且与P53和白介素等信号传导通路相关,为研究甲状腺癌进展分子机制及靶向药物的开发提供理论依据。

关键词：生物信息学 FAM20A 甲状腺癌

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α-突触核蛋白纤维介导脑微血管损伤在帕金森病认知障碍中的作用及机制研究

α-突触核蛋白纤维介导脑微血管损伤在帕金森病认知障碍中的作用...

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作者：黄睿华南理工大学

学位级别：博士

【研究背景】帕金森病是继阿尔茨海默病之后第二常见的神经退行性疾病,其特征包括黑质致密部多巴胺能神经元的进行性丢失和α-突触核蛋白（alpha synuclein,αSyn）病理性聚集形成路易小体沉积。除了静止性震颤、肌强直与运动迟缓等运... 详细信息

【研究背景】帕金森病是继阿尔茨海默病之后第二常见的神经退行性疾病,其特征包括黑质致密部多巴胺能神经元的进行性丢失和α-突触核蛋白（alpha synuclein,αSyn）病理性聚集形成路易小体沉积。除了静止性震颤、肌强直与运动迟缓等运动症状外,认知障碍是帕金森病最显著的非运动症状之一,具有高致残性与病死率。帕金森病认知障碍的发病机制复杂,临床诊断相对滞后,治疗效果不佳。既往研究表明,皮层αSyn病理性沉积导致的认知功能下降与血管危险因素和血管变性密切相关。然而,尚不明确脑微血管系统在调控αSyn病理变化与神经元变性中的作用,其内在机制也鲜有研究。【研究目的】本研究旨在探讨脑微血管在帕金森病认知障碍中的作用,并阐明脑微血管内皮细胞在调节认知相关的αSyn病理和神经元变性中的作用和机制。【研究方法】本研究通过将αSyn预合成纤维（αSyn preformed fibrils,αSyn PFF）注射到大脑皮层和纹状体,构建一种帕金森病模型。通过爬杆实验、悬挂实验和/或转棒实验检测αSyn PFF注射六个月后小鼠的运动功能改变,通过Morris水迷宫和/或Y迷宫检测认知功能改变。（1）病理学方面,通过伊文思蓝灌注与免疫荧光染色观察存在认知障碍的帕金森病小鼠神经元改变、脑微血管损伤及其与αSyn病理性沉积的相关性。（2）通过低密度脂蛋白受体相关蛋白-1（low-density lipoprotein receptor-related protein 1,LRP1）C端抗体识别LRP1细胞内结构域（intracellular domain,ICD）在帕金森病小鼠的皮层微血管与分离的小鼠脑微血管内皮细胞中的表达。利用生物素偶联的αSyn PFF(αSyn PFFGFP)处理人源性脑微血管内皮细胞系HBEC-5i探究LRP1-ICD对αSyn纤维化和累积的作用。LRP1-ICD具有与聚（腺苷5'-二磷酸核糖）聚合酶-1[poly（adenosine 5'-diphosphate ribose）polymerase-1,PARP1]相互作用的结合位点,通过在脑微血管内皮细胞中过表达LRP1-ICD并给与PARP1抑制剂（ABT-888）,观察LRP1-ICD靶向αSyn PFF诱导的PARP1通路激活的作用。LRP1-ICD/PARP1对脑微血管内皮细胞结构与功能的作用通过以下体外实验得到验证:免疫印迹用于检测内皮细胞的紧密连接蛋白表达,免疫细胞化学用于检测内皮细胞的磷酸化αSyn沉积,单层细胞跨膜电阻与渗透性实验用于检测内皮细胞的屏障功能,血管形成实验用于观察内皮细胞的血管形成能力,迁移实验用于检测内皮细胞的迁移运动能力,以及线粒体膜电位和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸与其还原型辅酶I的比值用于测定内皮细胞的代谢变化。为了明确脑微血管内皮细胞LRP1-ICD对神经元存活的影响,将过表达LRP1-ICD的脑微血管内皮细胞与神经元共培养,通过免疫印迹检测神经元的酪氨酸羟化酶（Tyrosine hydroxylase,TH）和切割的Caspase3的表达情况。通过定量实时聚合酶链反应和酶联免疫吸附剂测定检测内皮细胞释放脑源性神经营养因子前体（pro-brain-derived neurotrophic factor,pro BDNF）的水平。（3）在αSyn PFF诱导帕金森病模型之前,本研究通过使用携带内皮特异性启动子的腺相关病毒在小鼠脑微血管内皮细胞中过表达LRP1-ICD,同时给与小鼠连续间断喂养PARP1抑制剂ABT-888,以观察血管内皮LRP1-ICD/PARP1对αSyn PFF诱导的运动和认知障碍以及大脑皮层与海马区的血管损伤、αSyn聚集与传播以及神经元死亡的影响。（4）为了阐明PARP1在αSyn PFF诱导的血管内皮损伤中的作用,本研究构建了血管内皮细胞特异性敲除PARP1（PARP1 conditional knockout,PARP1 CKO）小鼠。将αSyn PFF注射到野生型（wild type,WT）和PARP1 CKO小鼠脑内,通过行为学、病理学与生化实验观察血管内皮敲除PARP1对αSyn PFF诱导的运动与认知功能下降以及磷酸化αSyn沉积与PAR合成的作用。通过RNA测序分析WT和PARP1 CKO小鼠脑微血管内皮细胞的差异表达基因与功能富集,阐明血管内皮敲除PARP1的保护机制。【研究结果】（1）αSyn PFF注射六个月后,小鼠表现出明显的运动损伤与以空间学习记忆损害为主的认知障碍。αSyn PFF导致注射侧黑质致密部TH+神经元丢失以及大脑皮层与纹状体脑微血管损伤。受损的脑微血管呈现长度较短、分支较少等异常形态,并且血管密度与磷酸化αSyn沉积呈负相关。（2）免疫荧光染色显示,αSyn PFF增加了皮层微血管L

关键词：帕金森病认知障碍 αSyn PFF 血管变性 LRP1/PARP1

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红细胞比容水平与冠心病发展的相关性研究

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北京生物医学工程 2022年第6期41卷 576-582页

作者：曹洪帅李佳松谢佳宏舒丽霞蔺嫦燕首都医科大学附属北京安贞医院-北京市心肺血管疾病研究所北京100029 首都医科大学临床生物力学应用基础研究北京市重点实验室北京100069

目的探讨红细胞比容(hematocrit,HCT)与冠心病发展的相关性及可能存在的作用机制。方法纳入首都医科大学附属北京安贞医院体检中心体检人员共2126名进行统计分析,根据HCT分组进行倾向评分匹配后总共匹配126对,通过二元logistic回归法分... 详细信息

目的探讨红细胞比容(hematocrit,HCT)与冠心病发展的相关性及可能存在的作用机制。方法纳入首都医科大学附属北京安贞医院体检中心体检人员共2126名进行统计分析,根据HCT分组进行倾向评分匹配后总共匹配126对,通过二元logistic回归法分析体检人员HCT和冠心病的相关性。为探究可能存在的作用机制,本文选取一例临床诊断为冠心病的患者的冠状动脉CTA影像数据进行三维重建,采用计算流体动力学方法对比分析不同HCT水平(10%~60%)的冠状动脉血管壁面剪切力(wall shear stress,WSS)分布。结果临床数据回归分析显示,HCT与冠心病的发生存在显著正向关系。计算流体动力学分析显示HCT水平不同,冠状动脉壁面剪切力存在差异。HCT=10%时具有最低的剪切应力,且HCT大小与壁面剪切力呈正相关。当HCT>50%时狭窄部位WSS为42 Pa,可能导致内皮剥脱,进一步损伤血管,导致斑块破裂。结论HCT与冠心病发展显著相关,可能通过影响冠状动脉血流动力学参与冠心病的发展。提示临床医生关注HCT值和心血管危险因素的结合可能有助于临床诊疗。

关键词：红细胞比容冠状动脉狭窄计算流体动力学冠心病

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功能基因PURA、RUVBL2和CASP8调控消化肿瘤进展的作用机制研究

功能基因PURA、RUVBL2和CASP8调控消化肿瘤进展的作用机制研究

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作者：高佳佳北京协和医学院

学位级别：博士

食管癌(Esophageal cancer,ECA)是我国致死率排名第四位的恶性肿瘤,其中约90%的组织学类型为食管鳞状细胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)。食管癌早期诊断难,患者就诊时多为中晚期,预后差,探讨促进食管癌进展的分子机制... 详细信息

食管癌(Esophageal cancer,ECA)是我国致死率排名第四位的恶性肿瘤,其中约90%的组织学类型为食管鳞状细胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)。食管癌早期诊断难,患者就诊时多为中晚期,预后差,探讨促进食管癌进展的分子机制对食管癌的诊断和治疗具有重要意义。富含嘌呤元件结合蛋白α(Purine-rich element binding protein alpha,PURα)是PUR蛋白家族成员之一,具有保守的核酸结合结构域,参与DNA复制、转录和修复以及RNA转运和翻译等多种生物学功能。PURα蛋白的异常表达除了参与神经系统疾病的发生外,近年发现PURα还参与一些恶性肿瘤的增殖调控,然而,PURα在食管癌中的表达和作用机制尚不清楚。本研究,首先探讨了 DNA结合蛋白PURα调控食管癌进展的分子机制。首先,分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中PURA基因在食管癌组织中mRNA表达水平,免疫组化分析评估PURα蛋白在食管癌中的表达水平,分析食管癌组织中PURα的表达水平与患者临床病理参数和预后的相关性,以及观察PURα对食管癌体外和体内肿瘤生物学表型的影响。通过构建稳定过表达和敲降PURα的食管鳞癌细胞系,利用CCK-8和平板克隆实验、划痕愈合和Transwell实验检测PURα对体外培养细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响;建立裸鼠皮下移植瘤和尾静脉注射肝肺转移瘤模型,检测PURα对体内肿瘤增殖和肝肺等脏器转移能力的影响。进一步,探讨了 PURα影响食管癌进程的分子机理。对过表达和敲降PURA基因的食管鳞癌细胞的RNA-seq分析,发现受PURA调控的信号通路和差异表达基因。利用qPCR、Western blot和免疫荧光分析验证候选通路和基因,双荧光素酶报告基因和ChIP实验探究PURα对候选基因转录调控的影响,利用回复性实验验证候选基因影响PURα介导的食管癌表型改变中的作用。通过以上实验,我们发现,PURA mRNA和蛋白水平在食管癌组织中高表达,PURα高表达与食管癌患者的淋巴结转移和AJCC分期呈正相关(P<0.05),且PURα高表达患者生存期更短(P<0.05),提示PURα促进了食管鳞癌进展和不良预后。体内外功能实验发现,PURα促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和迁移能力,促进食管癌细胞的裸鼠致瘤和肝、肺等远处器官的转移能力。解析其机制,RNA-seq分析结果提示PURα参与细胞粘附分子和细胞外基质-受体相互作用等通路的调控,影响多个上皮和间质相关基因的表达;PURα下调E-钙黏蛋白(E-Cadherin,CDH1)、上调N-钙黏蛋白(N-Cadherin,CDH2)和波形蛋白(Vimentin,VIM)的表达,诱导食管癌细胞发生上皮-间叶转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)。深入的机制分析表明,PURα可以与Snail家族锌指转录因子2(Snail family transcriptional repressor 2,SNAI2)基因启动子区-896至-431 bp的序列结合,促进SNAI2的转录活性,上调Snail2蛋白的表达。敲降SNAI2可抑制PURα诱导的EMT表型,降低食管癌细胞的运动、侵袭和转移的能力。总之,本研究发现PURα通过与SNAI2基因启动子区域结合,促进SNAI2转录活性,上调Snail2的表达,诱导食管鳞癌细胞发生EMT,进而促进食管鳞癌的增殖、侵袭和迁移,促进肿瘤进展。该研究为食管癌的诊断和治疗提供了新的分子靶标。肝癌(Liver cancer)是全世界最常见的恶性肿瘤之一,其死亡率在所有的恶性肿瘤中排名第四位,致死率高,预后差。RuvB-like 2(RUVBL2)蛋白属于与多种细胞活性相关的保守ATPase(AAA+)蛋白亚家族,其保守的WalkerA和B结构域可以参与ATP的结合和水解。有文献报道RUVBL2可能参与肝癌的发生,然而,RUVBL2的表达、调控和临床意义尚未系统性地在大规模肝癌临床样本中分析和验证。本实验室前期研究发现,RUVBL2蛋白在肝细胞肝癌(Hepatocellular ***)中表达上调,本研究探讨了 RUVBL2在肝癌中的生物学功能和表达调控机制。前期用免疫组化分析了 153例肝癌患者组织芯片的RUVBL2表达水平,在此工作基础上,我们对TCGA数据库中收录的371例肝癌患者的转录组测序数据、体细胞拷贝数改变数据和DNA甲基化数据进行整合分析,探究RUVBL2在肝癌中表达上调的原因和临床意义。进而在体外培养的肝癌细胞上探讨了 RUVBL2在肝癌中的生物学功能。在HepG2和Huh7肝癌细

关键词：食管鳞癌 PURα 上皮-间叶转化侵袭和迁移 Snail2 肝细胞肝癌 RUVBL2 预后因素

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非编码RNAs在痛风中的研究进展

引用

中国临床新医学 2021年第9期14卷 937-942页

作者：蒋雅琼杨丽华马福才(综述) 马利锋(审校) 拉萨市城关区扎细街道社区卫生服务中心西藏850000 西藏民族大学医学院环境与疾病相关基因研究高校重点实验室咸阳712000 咸阳职业技术学院医学院陕西712000 西藏自治区第二人民医院拉萨850000

非编码RNAs(ncRNAs)在人体正常生理过程及疾病中都发挥着重要作用,已被证明参与调节各种炎症性疾病,可作为疾病诊断和预后的生物标志物。痛风是一种常见的炎症性关节病。该文综述了目前ncRNAs在痛风中的研究进展,miRNAs和长链非编码RNAs... 详细信息

非编码RNAs(ncRNAs)在人体正常生理过程及疾病中都发挥着重要作用,已被证明参与调节各种炎症性疾病,可作为疾病诊断和预后的生物标志物。痛风是一种常见的炎症性关节病。该文综述了目前ncRNAs在痛风中的研究进展,miRNAs和长链非编码RNAs(lncRNAs)通过多种途径发挥调节痛风发病机制的作用。靶向ncRNAs可能是治疗痛风的一种有效策略。

关键词：痛风非编码RNAs 长链非编码RNAs

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