检索结果-内蒙古大学图书馆

生物化学与生物物理进展 2006年第12期33卷 1165-1176页

作者：范树国林纳生楚雄师范学院化学与生命科学系 “中央研究院”植物暨微生物学研究所

竹花叶病毒卫星RNA(satBaMV)是一个长度为836个核苷酸(不包括polyA)的单链正义RNA分子,可编码一20ku的卫星蛋白(P20).satBaMV的复制和包被需依赖竹花叶病毒(BaMV).P20是核酸结合蛋白,能促进satBaMV在寄主植物的长距离移动.利用细菌双杂... 详细信息

竹花叶病毒卫星RNA(satBaMV)是一个长度为836个核苷酸(不包括polyA)的单链正义RNA分子,可编码一20ku的卫星蛋白(P20).satBaMV的复制和包被需依赖竹花叶病毒(BaMV).P20是核酸结合蛋白,能促进satBaMV在寄主植物的长距离移动.利用细菌双杂交系统(BTH)和pull-downassays研究了P20自身、P20与BaMV蛋白以及BaMV蛋白之间的相互作用.研究表明:P20自身的相互作用是最强的;P20与甲基转移酶(MET)和衣壳蛋白(CP)之间有明显的相互作用;三基因连锁蛋白之间亦存在强的相互作用;CP与三基因连锁蛋白之间有明显的相互作用.删减分析表明,位于P20N端包括RNA结合位点在内的15个氨基酸是P20自身相互作用所必需的.N端缺失可导致P20间相互作用消失.P20的β折叠结构也是P20间相互作用所必需.此外,P20与烟草细胞色素C还原酶和β微管蛋白之间有较强的相互作用.BaMV蛋白与P20之间的同型和异型相互作用对BaMV及其卫星RNA在寄主植物中的移动起重要作用.

关键词：竹花叶病毒竹花叶病毒卫星RNA 蛋白质间相互作用

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竹花叶病毒卫星RNA分子特性、基因组变异及其在生物防治上的应用

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病毒学报 2005年第4期21卷 318-323页

作者：范树国林纳生中国科学院华南植物园广东广州510650 中央研究院植物暨微生物学研究所台湾台北11529

病毒虽然需要依赖寄主细胞才能存活,但却有许多亚病毒分子为其寄生物,这些亚病毒分子需要辅助病毒来帮助其复制与包被.卫星病毒(satellite virus)、卫星RNA(satellite RNA)和类病毒(viroid)是目前所知分子最小的生物实体(biological ent... 详细信息

病毒虽然需要依赖寄主细胞才能存活,但却有许多亚病毒分子为其寄生物,这些亚病毒分子需要辅助病毒来帮助其复制与包被.卫星病毒(satellite virus)、卫星RNA(satellite RNA)和类病毒(viroid)是目前所知分子最小的生物实体(biological entity).多数卫星病毒与植物病毒相关,少数与噬菌体或动物病毒相关,如腺病毒的卫星病毒.卫星病毒可分为两大类,一类可编码自身的衣壳蛋白(capsid protein),另一类为卫星病毒RNA分子(曾被称为virusoid),需利用辅助病毒的衣壳蛋白.卫星病毒基因组为长度约0.5～2kb的单链RNA,与辅助病毒基因组无同源性,复制时常干扰辅助病毒的增殖.

关键词：卫星RNA 基因组变异分子特性花叶病毒生物防治应用病毒分子衣壳蛋白寄主细胞植物病毒动物病毒寄生物类病毒噬菌体腺病毒相关包被

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白蟻巢中的炭角菌

白蟻巢中的炭角菌

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第十二届海峡两岸真菌学学术研讨会

作者：朱宇敏中央研究院植物暨微生物學研究所

炭角菌屬真菌為一類常見的子囊菌,具有直立的子座、核果形的子囊殼、單壁層子囊具有一個於碘溶液中呈藍色反應的頂端構造、及單細胞的暗色子囊孢子具有一條發芽縫。超過350種的炭角菌屬真菌棲息於木頭、落果、種子、及落葉中,僅有25種...

炭角菌屬真菌為一類常見的子囊菌,具有直立的子座、核果形的子囊殼、單壁層子囊具有一個於碘溶液中呈藍色反應的頂端構造、及單細胞的暗色子囊孢子具有一條發芽縫。超過350種的炭角菌屬真菌棲息於木頭、落果、種子、及落葉中,僅有25種左右生活在白蟻巢中。白蟻巢炭角菌之子囊孢子長度大多小於7微米,而子座外層非常薄或是不存在。大多已知的種類分布在亞洲、並生長於大白蟻亞科白蟻的巢中。我們對非洲的種類所知不多。然而大白蟻亞科白蟻在非洲的多樣性,高出亞洲的多樣性甚多;因此可以預見,非洲白蟻巢炭角菌還有相當多的種類等著被發現。由我們的研究可以看出,即使在亞洲,白蟻巢炭角菌的多樣性仍是被嚴重的低估。

关键词：

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探索雞肉絲菇基因體的DNA甲基化與轉錄體變化

探索雞肉絲菇基因體的DNA甲基化與轉錄體變化

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第十三届海峡两岸菌物学学术研讨会

作者：黃彥鈞謝惠美徐翡曼嚴明仁林仲彥朱宇敏陳柏仰中央研究院植物暨微生物學研究所台灣中央研究院資訊科學研究所台灣

雞肉絲菇(Termitomyces eurhizus)屬於真菌界擔子菌門，具有豐富的營養價為高階的食用菇生長過程中必須和黑翅土白蟻(Odontotermes formosanus)共生。至今雞肉絲菇的子實體仍只能自野外採集，無法人工栽培。雖然對於相近墨水菇(Coprinop... 详细信息

雞肉絲菇(Termitomyces eurhizus)屬於真菌界擔子菌門，具有豐富的營養價為高階的食用菇生長過程中必須和黑翅土白蟻(Odontotermes formosanus)共生。至今雞肉絲菇的子實體仍只能自野外採集，無法人工栽培。雖然對於相近墨水菇(Coprinopsis cinerea)的出菇分子機制已有相當的研究，但由於雞肉絲菇複雜的共生條件與環境因素伴隨著表觀遺傳層次的調控，其出菇分子機制尚未被建立。

关键词：雞肉絲菇基因體學表觀基因體學 DNA甲基化轉錄體

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基因轉錄體分析及次世代定序技術之挑戰

基因轉錄體分析及次世代定序技術之挑戰

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第七届(2009)两岸三院信息技术与应用交流研讨会

作者：何建明張育榮林文鐽陳彥臣陳建智中央研究院資訊科學研究所植物暨微生物學研究所

基因转录体分析系针对生物体全部基因进行表现内容研究，旨在探究与比较细胞在特定组织、阶段与条件下的基因表现序列、表现程度与功能等，是基因体科学研究的重要课题。对於快速增加的转录体表现序标帜列(Expressed Sequence Tags,EST... 详细信息

基因转录体分析系针对生物体全部基因进行表现内容研究，旨在探究与比较细胞在特定组织、阶段与条件下的基因表现序列、表现程度与功能等，是基因体科学研究的重要课题。对於快速增加的转录体表现序标帜列(Expressed Sequence Tags,EST)资料等，需要整合式的自动化生物资讯平台来协助生物学家进行快速与有效的转录体分析。因此，我们开发出Bio301-EST序列注解分析系统()，提供序列清理、组合(assembly)、相似序列资料库搜寻、Gene Ontology(GO)功能注解、统计分析报表、GO图形化操作介面、Microarray探针序列自动筛选以及比较不同EST序列库(library)之间的功能差异。实验测试结果显示，Bio301提供可靠的功能性比较分析结果;同时，Bio301已经累积服务来自台湾、大陆与澳洲(Australia)共计～140专案，～60万EST序列。近来，随者次世代高通量定序技术的进步与落实，愈来愈大量的转录体序列不断增加，且一次实验产量从先前的百万硷基对(base pair)提升到百亿硷基对，造成转录体资料处理分析极大的挑战。我们已经建构了雏形系统，开始协助生物学家进行数个台湾特有物种的高通量定序转录体分析研究。

关键词：基因转录体分析序组合基因功能注解高通量定序生物资讯

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竹花叶病毒卫星RNA编码卫星蛋白P20在P20转基因烟草(Nicotiana benthamiana)中的作用

竹花叶病毒卫星RNA编码卫星蛋白P20在P20转基因烟草(Nicotiana be...

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2005植物分子育种国际学术研讨会

作者：范树国林纳生中国科学院华南植物园中央研究院植物暨微生物学研究所

The satellite RNA of Bamboo mosaic virus （BaMV） contains an open reading flame for a 20kDa non-structural protein,which facilitates the long distance movement of satBaMV in *** determine whether theflame shift mutant of satBaMV （F） could move systemically or could be complemented or promoted by P20,su-crose-synthase-promoter-driven P20 （SSP20） transgenic Nicotiana benthamiana plants have been developed viaAgrobacterium-mediated *** transgenic plants have been obtained through two genera-tions of selection on MS medium supplemented with 20 mg/L of *** integrated transgene in trans-genic plants was confirmed by PCR,but not by Southern blot,which maybe due to too low level of integration oftransgene in host ***-PCR results have showed that the transgene could be successfully expressed attranscriptional *** results have been obtained in tissue printing of stem section,also in immunoblot ofphloem sap of F transgenic *** signal was detected from RNA blot of tissue printing and phloem *** agronomical characters,there are more branches in F transgenic plants than in *** significant differencewas found in plant height between transgenic and WT *** dot blot and Northern blot showed that F and itsframe shift mutant F6 could move systemically in both WT and SSP20 transgenic *** line SP3-4 andSP4-4,which indicates that P20 is not essential for BaMV and satBaMV replication and movement,but P20 ishelpful for satBaMV replication and movement because the stronger signal of F was detected in systemic leavesthan that in F6 and BSGFP both in WT and transgenic plants by dot blot and Northern blot *** much differ-ence between WT and transgenic plants in the expression of F and F both in inoculated and systemic *** that the expression level of BSGFP in transgenic plants was slightly higher than that in ***-PCR andsubsequent sequencing data revealed the correct sequence of inocul

关键词： BaMV satBaMV Sucrose-synthase-promoter-driven P20 transgenic Nicotiana benthamiana Homozygous transgenic tobacco plants Systemic movement

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马铃薯晚疫病及其病原菌的遗传多样性

马铃薯晚疫病及其病原菌的遗传多样性

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2005植物分子育种国际学术研讨会

作者：范树国林纳生中国科学院华南植物园中央研究院植物暨微生物学研究所

Potato is one of the most important crops in the *** blight is the most threat to potato pro-duction,and the pathogen of late blight is Phytophthora infestans *** *** has been addressed the origin,distribution,biosystematics of potato,and major potato production *** origin,distribution,economicimportance,symptoms,epidemiology,and disease management measures of late blight have been *** evolution,migration,biosystematics,and life cycle of the pathogen have been *** is demonstratedthat the sources of variation in the pathogen,which include mutation,mitotic recombination,parasexual recombi-nation,inter-specific hybridization,sexual reproduction,migration,genetic drift,and *** markersfor variation studies in the pathogen have been used,which include virulence,mating type,metalaxyl sensitivity,isozymes,RFLPs,RAPD,and *** is discussed the future research to be conducted for the better understand-ing and control of the pathogen of late blight.

关键词： Potato Late blight Phytophthora infestans Mont.de Bary Diversity Variation Markers

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植物蛋白酶抑制剂的特性及其在抗植食性昆虫中的应用

植物蛋白酶抑制剂的特性及其在抗植食性昆虫中的应用

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2005植物分子育种国际学术研讨会

作者：范树国吴国江中国科学院华南植物园中央研究院植物暨微生物学研究所

Plant proteinase inhibitors (PIs),which play a potent defensive role against predators and pathogens,are natural,defense-related proteins often present in seeds and induced in certain plant tissues by herbivory *** review describes the main classes of proteinase inhibitors,the distribution and localization,gen-eral properties,the main functions,and commercial applications of plant *** paper also presents the pro- teinase inhibitor IIs (PIN 2) and their molecular biology,including transgenic plains expressing proteinase in-hibitors against insect,pests,and pathogens,*** lettuce (Lactuca sativa L.) and Chinese flowering cabbage(Brossica campestris ***) which are widely cultivated or distributed in Southeast Asia,especiallyin South China including Hong *** morphorlogical and molecular characteristics of PIN 2-rich Americanblack nightshade (Solarium americanum Mill.) was described,In addition,some future perspectives for plant PIsare also discussed.

关键词： Proteinase inhibitors(PIs) proteinase inhibitor Ⅱ(PIN2) Lettuce(Lactuea sativa L.) Chinese flowering cabbage(Brassica campestris ssp.parachinensis) American black nightshade(Solarium americanum Mill.)

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竹花叶病毒卫星RNA基因组变异及其在生物防治上的应用

竹花叶病毒卫星RNA基因组变异及其在生物防治上的应用

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2005植物分子育种国际学术研讨会

作者：范树国林纳生中国科学院华南植物园中央研究院植物暨微生物学研究所

Satellite RNA is a subviral agent,which depends on helper virus for its replication,encapsidation,*** RNA of BaMV (satBaMV),a single-stranded positive-sense RNA of 836 nucleotide [excluding 3′poly (A) tail] containing a single open reading frame which encodes a nonstructural protein of 20 kDa (P20),de-pends on BaMV for its replication and *** RNA could be detected from 32 of 77 BaMV iso-lates,which were collected from 81 leaf samples with disease from abroad and different parts of Taiwan Provinceof *** could be found in most of samples from Dendrocalamus latiflorus Munro (19/20),but veryrare in Bambusa oldhamii Munro (2/23).Interestingly,in the circumstances of coinfection with satBaMV,the con-tent of BaMV decreases considerably than that without *** on relationship among collected sat-BaMV isolates,they could be divided into two groups (group A and B),which had no correlation with the geo-graphic *** much difference could be found in nucleotide sequence of 5′UTR among differentisolates,the two groups have similar secondary structure,which had something to do with the evolution of *** satBaMV isolates,BSL6 and BSF4,have different biological characteristics,BSL6 could interferewith BaMV replication and restore the symptoms of Nicotiana benthamiana caused by BaMV infection,but BSF4couldn'*** is concluded that BSL6 could be used in biological control of BaMV infection in the near future.

关键词： BaMV satellite Genomic variation 5'UTR Biological control

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竹花叶病毒卫星RNA编码卫星蛋白P20的磷酸化及蛋白质间的相互作用

竹花叶病毒卫星RNA编码卫星蛋白P20的磷酸化及蛋白质间的相互作用

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2005植物分子育种国际学术研讨会

作者：范树国林纳生中国科学院华南植物园中央研究院植物暨微生物学研究所

Bamboo mosaic virus (BaMV),a member of Potexvirus,contains a 6.4 kb single-stranded,posi-tive-sense RNA with five conserved open reading flames (ORFs).BaMV satellite RNA (satBaMV),the onlysatellite RNA found in Potexvirus,depends on BaMV for its replication and encapsidation,but it shares little se-quence homology with BaMV except for the 5′untranslated region (UTR).SatBaMV RNA is a linear molecule of836 nt and contains an open reading flame (ORF) for a protein of 20 kDa (P20),which shares 46% amino acid i-dentity with capsid protein (CP) of satellite virus associated with panicum mosaic sobemovirus (sPMV).Unlikeother mRNA-type satellite RNAs,mutation in P20 did not significantly affect satBaMV RNA replication,whichhas shown that P20 is not essential for satBaMV RNA ***,besides the RNA-binding propertiesof P20 resemble those of virus-encoded movement proteins,mutations that blocked the synthesis of P20 inhibitedthe systemic movement of satBaMV RNA in Nicotiana benthamiana co-infected with the helper BaMV *** laser scanning microscopy,the chimeric BSGFP satBaMV in which the ORF of P20 was replaced withthe green fluorescent protein (GFP) gene,was able to move into the neighboring cells at time intervals after co-in-oculation with BaMV *** result suggests that P20 is not involved in cell-to-cell movement but in thelong-distance (systemic) movement of satBaMV *** address if P20 can function as BaMV CP,chimericsatBaMV carrying the CP gene of BaMV and chimeric BaMV carrying the P20 gene of satBaMV were *** interchangeable function between P20 and CP was ***,the chimeric satBaMV inwhich the P20 gene was replaced with CP gene of sPMV was competent for systemic movement in ***-ana plants co-inoculated with BaMV RNA.

关键词： Bamboo mosaic virus(BaMV) BaMV satellite RNA(satBaMV) P20

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