检索结果-内蒙古大学图书馆

中草药 2022年第1期53卷 214-221页

作者：张国宁李元玉马雪祺李姝诺陈万生肖莹上海中医药大学中药研究所中药资源与生物技术中心上海201203 第二军医大学附属长征医院药学部上海200003 上海中医药大学中药炮制教研室上海201203

目的克隆菘蓝Isatis indigotica中咖啡酸氧甲基转移酶(I. indigotica fortune caffeic acid O-methyltransferase,IiCOMT)编码基因,并进行生物信息学及表达分析。方法采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝IiCOMT的全长cDNA,进而通过PCR获得其基因组DNA序列。通过qRT-PCR检测IiCOMT在四倍体菘蓝和二倍体菘蓝各器官以及不同胁迫条件下的表达情况。结果 IiCOMT全长cDNA为1376 bp(GenBank登录号DQ115905),包含1个1092 bp的开放阅读框(open readingframe,ORF),编码363个氨基酸残基,其对应的DNA序列含有3个内含子,4个外显子。IiCOMT基因在2种倍性菘蓝的根茎叶均有表达,且四倍体菘蓝中的表达均高于二倍体。胁迫因素盐处理(NaCl)、冷处理(4℃)、水杨酸(salicylicacid,SA)、茉莉酸甲脂(methyl jasmonate,MeJA)、赤霉素(gibberellic acid,GA3)和脱落酸(abscisic acid,ABA)均能诱导IiCOMT表达水平上调。结论 IiCOMT的克隆及表达分析,为进一步阐明与咖啡酸氧甲基转移酶相关的四倍体菘蓝优良性状形成的分子机制奠定了基础。

关键词：菘蓝咖啡酸氧甲基转移酶基因克隆生物信息学表达分析

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细胞色素P450酶在植物次生代谢产物生物合成中的研究进展

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分子植物育种 2024年第7期22卷 2176-2183页

作者：李永康马雪祺冯婧娴陈万生孙连娜肖莹上海中医药大学中药研究所中药资源与生物技术中心中药炮制教研室上海201203 海军军医大学附属长征医院医疗保障中心上海200003

细胞色素P450 (cytochrome P450, CYP450)是一类广泛存在于自然界的超基因家族单加氧酶,参与多种植物次生代谢产物的生物合成,被誉为“万能的生物催化剂”。近年来,随着高通量测序技术和分子生物学的发展,越来越多植物CYP450酶的功能被... 详细信息

细胞色素P450 (cytochrome P450, CYP450)是一类广泛存在于自然界的超基因家族单加氧酶,参与多种植物次生代谢产物的生物合成,被誉为“万能的生物催化剂”。近年来,随着高通量测序技术和分子生物学的发展,越来越多植物CYP450酶的功能被揭示,相关生物合成研究取得了令人瞩目的成果。本研究结合CYP450的结构特点、作用机制,重点介绍植物CYP450在次生代谢产物生物合成中的研究进展,为植物CYP450酶的挖掘及功能研究提供参考,也为基于此的植物次生代谢产物生物合成与代谢调控提供依据。

关键词：细胞色素P450酶植物次生代谢产物生物合成蛋白结构

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基于衰老视角的3种常见慢病共有机制与中药发现

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西安交通大学学报(医学版) 2025年第1期46卷 101-111页

作者：崔春利闫浩晨王敏王川孙继佳陕西中医药大学药学院陕西咸阳712046 西北大学数学学院陕西西安710127 陕西中医药大学第二附属医院心内一科陕西咸阳712000 上海中医药大学中药学院数理教研室上海201203

目的通过生物信息学分析、机器学习算法和分子对接等方法和技术探讨非酒精性脂肪肝(NAFLD)、2型糖尿病(T2DM)和动脉粥样硬化(AS)3种常见慢病和衰老基因相关的共有机制和潜在治疗药物。方法从AgingAtlas、CellAge、GenAge和MSigDB等数... 详细信息

目的通过生物信息学分析、机器学习算法和分子对接等方法和技术探讨非酒精性脂肪肝(NAFLD)、2型糖尿病(T2DM)和动脉粥样硬化(AS)3种常见慢病和衰老基因相关的共有机制和潜在治疗药物。方法从AgingAtlas、CellAge、GenAge和MSigDB等数据库中收集和整理与衰老相关的基因。将从CTD、DisGeNET、GeneCards、OMIM、PharmGKB和TTD等数据库中获得与NAFLD、T2DM、AS相关的基因和基于GEO差异基因分析得到的基因集取交集后,得到这3种常见慢性疾病的相关疾病基因集。利用clusterProfiler包对衰老基因集、3种疾病相关基因集进行KEGG通路富集分析并取交集。将筛选得到的KEGG通路上的富集基因合并后,导入STRING数据库并构建PPI网络,利用MCODE工具分析得到PPI网络中的核心子模块,计算其中每个节点、模块的重要值Nim和Cim。同时,采用Lasso回归模型、Boruta算法以及随机森林模型等3种机器学习模型进行特征基因筛选。利用HIT2.0数据库查找关键特征基因相关的靶向中药小分子。利用SwissADME和ADMETlab 3.0在线系统对小分子进行ADMET评价和分析。利用分子对接方法对关键作用靶点和筛选到的小分子进行对接。结果总共获得1 325、616、78、597个与衰老、NAFLD、T2DM、AS相关的基因。衰老和3种疾病的KEGG通路富集分析结果取交集后得到2条共有交集通路,共包含243个基因。构建PPI网络,3个核心子模块中Cluster 2的Cim值最高。根据特征基因筛选结果,结合PPI网络模块分析结果,找到4个与衰老相关的特征基因:CDK6、CDKN1A、MYC、PTEN。这4个靶点具有94个潜在中药小分子候选药物,其中,白藜芦醇(resveratrol, RSV)是这4个靶点共有的中药小分子。ADMET评价显示,其具有良好的成药性。PTEN靶点具有较高的Nim值,RSV与PTEN进行分子对接,显示有较好的结合稳定性。结论从衰老的角度来看,发现了一种潜在的中药小分子RSV,它可能通过调节关键基因PTEN来预防和治疗NAFLD、T2DM和AS这3种常见的慢性疾病。

关键词：衰老相关基因生物信息学分析老年慢性疾病机器学习算法

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菘蓝转录因子IiMYB的基因克隆及表达特征

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分子植物育种 2023年第8期21卷 2562-2569页

作者：马雪祺李姝诺张国宁李元玉陈万生肖莹孙连娜上海中医药大学中药炮制教研室中药研究所中药资源与生物技术中心上海201203 第二军医大学附属长征医院医疗保障中心上海200003

MYB转录因子在植物生长发育、次生代谢产物生物合成以及抗逆应激等多个方面发挥重要作用。为了研究菘蓝中特异MYB转录因子的表达特征,本研究采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝中目标MYB转录因子编码基因IiMYB的全长c DNA并获得其... 详细信息

MYB转录因子在植物生长发育、次生代谢产物生物合成以及抗逆应激等多个方面发挥重要作用。为了研究菘蓝中特异MYB转录因子的表达特征,本研究采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝中目标MYB转录因子编码基因IiMYB的全长c DNA并获得其基因组DNA序列,通过RT-qPCR检测IiMYB在四倍体菘蓝和二倍体菘蓝各器官以及不同胁迫条件下的表达情况。IiMYB的c DNA序列全长926 bp(GenBank登录号:DQ468346),含600 bp的开放阅读框(ORF),编码199个氨基酸,其对应的基因组DNA序列含有3个外显子和2个内含子。生物信息学分析表明IiMYB与拟南芥的AtMYBL2同源性最高,遗传距离最近,并仅含有一个myb域(R3)。IiMYB在两种倍性菘蓝的根茎叶中均有表达,其中叶中最高,且在四倍体中的表达水平均高于二倍体。胁迫因素高盐(NaCl)、茉莉酸甲酯(MeJA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)和水杨酸(SA)处理均能上调IiMYB的表达水平,而低温(4℃)处理对IiMYB的表达水平无显著影响。本研究首次从菘蓝植物中克隆得到MYB转录因子并进行了表达分析,为进一步阐明与MYB转录因子相关的四倍体菘蓝优良性状形成的分子机制提供一定基础,也为通过分子育种培育优质菘蓝品系提供了条件。

关键词：菘蓝(Isatis indigotica) MYB转录因子分子克隆生物信息学表达分析

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基于国内外数据库的中药学与药学本科教育热点和趋势分析

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中华医学教育杂志 2024年第3期44卷 236-240页

作者：夏瑜桢吴靳荣徐冰洛郑昌武张彤郑敏沈岚上海中医药大学中药学院办公室上海201203 上海中医药大学中药学院生药学教研室上海201203 上海中医药大学中药学院上海201203

目的分析2000至2022年国内外中药学与药学本科教育的研究热点和趋势。方法在中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊数据库、中华医学期刊全文数据库、Web of Science核心合集中,检索2000年1月1日至2022年12月31日发表的国... 详细信息

目的分析2000至2022年国内外中药学与药学本科教育的研究热点和趋势。方法在中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊数据库、中华医学期刊全文数据库、Web of Science核心合集中,检索2000年1月1日至2022年12月31日发表的国内外中药学与药学本科专业教育改革论文,使用CiteSpace软件进行可视化分析。结果中药学与药学本科教育发文数量总体呈上升趋势。累计频次排在前5位的中英文高频关键词依次是:人才培养、教学改革、实践教学、培养模式、创新能力;pharmacy student,interprofessional education,performance,attitude,medical student。延续至2022年的研究热点分别为课程思政与interprofessional education,medical student,performance。结论国外药学本科教育研究关注服务型人才培养,以及本专业与其他应用基础学科的深度融合。我国中药学本科教育研究集中于人才培养、教学改革、实践教学等方面。中药学专业本科教育可借鉴国外药学教育研究经验,重视临床中药服务型人才培养,增加学生的跨专业体验,及时更新教学内容,为增强学生的专业技能和未来发展潜力提供可能。

关键词：文献计量学中药学药学本科教育热点趋势

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NAFLD疾病进程关键风险基因发现与验证

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医学研究杂志 2024年第12期53卷 78-87页

作者：崔永康苟小军曹姗王淑斐孙继佳上海中医药大学附属宝山医院消化科 201999 上海中医药大学附属宝山医院中心实验室 201999 上海中医药大学中药学院数理教研室 201203

目的探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证。方法基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基因分析、京都基因与基因组百科全书(Kyo... 详细信息

目的探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证。方法基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基因分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析、蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析以及机器学习特征筛选方法,发现NAFLD疾病进程中的关键基因;同时,构建从单纯性脂肪肝(simple steatosis,SS)到非酒精性脂肪肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)的NAFLD疾病进程风险预测模型;最后,通过体外分子生物学实验对关键基因进行验证。结果GEO数据库中差异表达基因分析结果显示,正常对照(normal control,NC)组与NASH组比较有1247个差异表达基因,NC组与SS组之间有1088个差异表达基因,SS组与NASH组比较只有75个差异表达基因。结合前期研究和文献查阅以及KEGG通路富集分析结果显示,有4条与NAFLD疾病相关的共同信号通路,即胆固醇代谢(hsa04979)、半乳糖代谢(hsa00052)、PI3K/Akt信号通路(hsa04151)和PPAR信号通路(hsa03320)等。通过3种不同的机器学习特征筛选方法,最终得到4个共有基因,即AKR1B10、COL1A2、HKDC1、LAMC3。体外分子生物学实验结果显示,AKR1B10、COL1A2在NAFLD中均显著上调,与生物信息学分析结果一致。结论本研究发现了SS发展到NASH的关键基因,同时,构建了NAFLD疾病进程的风险预测模型,为NAFLD疾病的有效控制、干预与临床诊断和治疗提供了有价值的方法与技术。

关键词：非酒精性脂肪性肝病差异表达基因分析 KEGG通路富集分析 PPI网络分析疾病进程风险预测模型

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上海市高质量社区卫生服务中心建设SWOT分析

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中国基层医药 2023年第8期30卷 1257-1261页

作者：汪铭涵张安赵海磊谢国群孙继佳范怿董恩宏上海中医药大学公共健康学院卫生管理学教研室上海201203 上海中医药大学中药学院数学与物理学教研室上海201203 上海健康医学院护理与健康管理学院健康管理系健康服务与管理教研室上海201318

上海作为最早开展社区卫生服务改革和试点的城市之一,自2004年在城乡地区全面完成社区卫生服务布局及第一轮标准化建设以来,上海始终结合自身特点,不断探索社区卫生服务功能、优化社区卫生服务供给,经过二十余年的发展,在缓解“看病难... 详细信息

上海作为最早开展社区卫生服务改革和试点的城市之一,自2004年在城乡地区全面完成社区卫生服务布局及第一轮标准化建设以来,上海始终结合自身特点,不断探索社区卫生服务功能、优化社区卫生服务供给,经过二十余年的发展,在缓解“看病难、看病贵”等问题方面取得了显著成效。2022年2月,为进一步强化“全专结合”“医防融合”“医养结合”,提高社区居民实施全生命周期健康管理的能力水平,上海市卫生健康委员会对建设高质量社区卫生服务中心试点单位的评价标准作出明确规定,标志着上海市社区卫生服务中心正式迈向高质量发展阶段。该研究采用态势分析法(SWOT),对上海市社区卫生服务的功能和优化社区卫生服务供给的工作进行分析,提出上海市高质量社区卫生服务中心的发展策略与建议。

关键词：社区卫生中心高质量 SWOT分析建设上海市

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植物NAC转录因子研究进展

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植物生理学报 2021年第12期57卷 2225-2234页

作者：马雪祺阴艳红冯婧娴陈万生孙连娜肖莹上海中医药大学中药研究所中药资源与生物技术中心上海201203 上海中医药大学中药学院中药炮制教研室上海201203 海军军医大学第二附属医院医学保障中心上海200003

NAC转录因子是一类植物特有的转录因子家族,其共同特点是在N端含有一段高度保守、由约150个氨基酸构成的NAC结构域,而C端为高度变异的转录调控区。NAC转录因子在植物生长发育、胁迫应答以及次生代谢产物生物合成等生理过程中均发挥重要... 详细信息

NAC转录因子是一类植物特有的转录因子家族,其共同特点是在N端含有一段高度保守、由约150个氨基酸构成的NAC结构域,而C端为高度变异的转录调控区。NAC转录因子在植物生长发育、胁迫应答以及次生代谢产物生物合成等生理过程中均发挥重要调控作用。本文就NAC转录因子的结构特征及生物学功能的相关研究进展进行综述。

关键词： NAC转录因子结构特征生物学功能

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菘蓝中富含亮氨酸重复序列型类受体蛋白激酶基因IiLTK的克隆与表达分析

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植物生理学报 2021年第9期57卷 1715-1726页

作者：李姝诺杨颖博马雪祺李元玉张国宁陈万生肖莹上海中医药大学中药研究所中药资源与生物技术中心上海201203 海军军医大学附属长征医院医学保障中心上海200003 上海中医药大学中药炮制教研室上海201203 上海图锋医药科技有限公司上海201203

富含亮氨酸重复序列型类受体蛋白激酶(LRR-RLK)在植物生长发育、病原防御以及环境适应等多个方面发挥重要作用。为了研究菘蓝(Isatis tinctoria)中LRR-RLK的表达特征,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝LRR-RLK编码基因IiLTK的全长... 详细信息

富含亮氨酸重复序列型类受体蛋白激酶(LRR-RLK)在植物生长发育、病原防御以及环境适应等多个方面发挥重要作用。为了研究菘蓝(Isatis tinctoria)中LRR-RLK的表达特征,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝LRR-RLK编码基因IiLTK的全长cDNA,并获得其基因组DNA序列。IiLTK基因全长cDNA为2477 bp(GenBank登录号DQ211577),包含1个2160 bp的开放阅读框(ORF),编码719个氨基酸残基。对应的基因组分析表明,IiLTK基因含15个内含子和16个外显子。通过qRT-PCR检测IiLTK在四倍体和二倍体菘蓝的不同器官中及受到不同胁迫条件下的表达情况:IiLTK基因在2种倍性菘蓝的根、茎和叶中均有表达,且四倍体菘蓝根和叶中的表达水平均显著高于二倍体。赤霉素(GA3)和脱落酸(ABA)处理能显著提高IiLTK的表达水平;高盐(NaCl)和茉莉酸甲酯(MeJA)处理显著降低IiLTK的表达水平;低温(4℃)和水杨酸(SA)处理对IiLTK表达水平影响不大。

关键词：菘蓝类受体蛋白激酶基因克隆生物信息学表达分析

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王庆其治疗情志相关性脾胃病的经验

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中华中医药杂志 2021年第1期36卷 230-232页

作者：王少墨夏梦幻刘文平王庆其上海中医药大学附属龙华医院上海200032 上海中药大学上海201203 上海中医药大学基础医学院内经教研室上海201203

现代医学把社会心理因素在消化系统疾病的发生发展中起重要作用的疾病称为"心身消化病",王庆其将由精神情志因素导致的脾胃病,或由脾胃病引起的情志病症称为"情志相关性脾胃病",文章介绍王庆其教授对情志相关性脾... 详细信息

现代医学把社会心理因素在消化系统疾病的发生发展中起重要作用的疾病称为"心身消化病",王庆其将由精神情志因素导致的脾胃病,或由脾胃病引起的情志病症称为"情志相关性脾胃病",文章介绍王庆其教授对情志相关性脾胃病的分类、临床表现及辨治经验。

关键词：心身消化病脾胃病情志相关性脾胃病辨证论治王庆其

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