检索结果-内蒙古大学图书馆

通过网络药理学与转录组学探讨扶正化瘀方影响巨噬细胞的抗肝纤维化机制及效应成分

中国中药杂志 2022年第11期47卷 3029-3037页

作者：幸鹭胡旭东陶艳艳彭渊刘成海上海中医药大学附属曙光医院上海201203 上海中医药大学基础医学院生物教研室上海201203 上海市中医临床重点实验室上海201203

前期已证实扶正化瘀方(FZHY)可通过调控肝内巨噬细胞极化发挥抗肝纤维化作用,但FZHY基于巨噬细胞的抗肝纤维化关键靶点及效应成分目前尚不清楚。作者通过网络药理学分析获取FZHY基于巨噬细胞的抗肝纤维化潜在靶点集合及RNA-Seq测序获取F... 详细信息

前期已证实扶正化瘀方(FZHY)可通过调控肝内巨噬细胞极化发挥抗肝纤维化作用,但FZHY基于巨噬细胞的抗肝纤维化关键靶点及效应成分目前尚不清楚。作者通过网络药理学分析获取FZHY基于巨噬细胞的抗肝纤维化潜在靶点集合及RNA-Seq测序获取FZHY防治小鼠肝纤维化的肝组织差异表达基因集合,将2个集合的交集靶点蛋白进行degree分析,得到FZHY基于巨噬细胞的抗肝纤维化潜在核心靶点,经由PubMed医学文献数据库的检索分析,确定FZHY基于巨噬细胞的抗肝纤维化潜在关键靶点;接着通过反向药理学分析获得FZHY中与关键靶点相对应的效应成分信息;最后将这些效应成分在脂多糖(LPS)诱导M1型THP-1人单核巨噬细胞上进行调控关键靶点基因表达的实验验证。网络药理学联合RNA-seq转录组测序结果分析表明,FZHY可能通过调控巨噬细胞中CCL2和TIMP1、MMP2基因表达发挥抗肝纤维化作用。体内实验结果验证,FZHY在肝纤维化小鼠肝组织中可显著抑制CCL2、TIMP1基因表达,促进MMP2基因表达。体外实验结果验证,FZHY全方及其4种有效单体成分木犀草素、熊果酸、槲皮素、丹参素均可显著抑制M1型THP-1细胞中CCL2、TIMP1基因表达;此外,木犀草素、熊果酸、槲皮素可促进MMP2基因表达,但FZHY全方对MMP2基因表达无明显作用,丹参素对MMP2基因表达有抑制作用。该研究证实FZHY主要通过4种单体活性成分木犀草素、熊果酸、槲皮素、丹参素抑制M1型巨噬细胞中的CCL2、TIMP1基因表达从而实现抗炎、抗肝纤维化作用。

关键词：网络药理学 RNA-seq 扶正化瘀方(FZHY) 巨噬细胞肝纤维化 CCL2 TIMP1

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基于网络药理学及实验验证探讨甘草苷治疗帕金森病的作用机制

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世界科学技术-中医药现代化 2023年第5期25卷 1689-1701页

作者：曲欣妮李文标王利沈隽吉殷宇晴徐缘博何建成许言午上海中医药大学基础医学院生物化学教研室上海中医药大学基础医学院中医诊断教研室上海市健康辨识与评估重点实验室上海201203

目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、... 详细信息

目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、CTD等数据库获取帕金森病相关基因。将甘草苷的预测靶点和帕金森病相关基因取交集,通过Cytoscape软件利用交集靶点构建“药物-靶点-疾病”网络并进行可视化;运用Cytoscape软件的BisoGenet插件对交集靶点构建PPI网络,通过CytoNCA插件进行拓扑学计算并经度中心性(Degree centrality,DC)和中介中心性(Between centrality,BC)两步筛选获得核心PPI网络;采用R软件运行Bioconductor程序包进行GO和KEGG富集分析;运用Cytoscape软件构建“基因-通路”网络,筛选出网络的关键靶点,并将其与甘草苷进行分子对接;采用Western blot方法验证甘草苷对6-羟基多巴胺(6-hydroxydopamine,6-OHDA)诱导的SH-SY5Y细胞Caspase-3、Bax、Bcl-2、p-PI3K和p-AKT等凋亡通路关键蛋白表达与活化的调控作用。结果共获得甘草苷靶点343个,帕金森病相关基因1328个,二者交集靶点为46个;经拓扑学分析获得核心PPI网络,包含108个节点和2298条边;GO功能分析得到的1543个条目主要与凋亡调控、细胞周期与节律、DNA合成及分解代谢有关;凋亡、PI3K-AKT、NF-κB、TGF-β、HIF-1、FoxO等97条KEGG信号通路被显著富集;“基因-通路”中筛选的关键蛋白及分子对接结果显示TP53、AKT1及RELA可能是甘草苷治疗帕金森病的关键靶点;Western blot结果显示,与6-OHDA组相比,给与甘草苷处理后Bax和Cleaved-Caspase-3的表达水平明显减少(P<0.05),Bcl-2的表达水平显著增加(P<0.01);p-PI3K和p-AKT磷酸化水平明显增多(P<0.01)。结论网络药理学分析提示甘草苷可通过调控多种生物学过程和相关信号途径治疗帕金森病;细胞水平实验证明了甘草苷对6-OHDA损伤神经细胞的保护作用,并初步证实了其对凋亡信号通路的调控作用,为进一步阐明甘草苷治疗帕金森病的分子机制奠定了基础。

关键词：网络药理学甘草苷帕金森病机制凋亡

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基于脉搏波频域梅尔频率倒谱系数特征的高血压危险分层预测模型

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海军军医大学学报 2024年第10期45卷 1226-1240页

作者：齐晨浩杨晶东邱泽浩尧明慧燕海霞上海理工大学光电信息与计算机工程学院自主机器人实验室上海200093 上海中医药大学中医学院中医诊断学教研室上海201203

目的为改进基于人工智能技术高血压时域脉搏波分类模型精度低、泛化性能差的问题,提出一种基于融合注意力机制的频域脉搏波预测模型。方法首先将时域脉搏波转换为频域梅尔频率倒谱系数特征,增强脉搏波区分度,采用时间卷积网络与Transf... 详细信息

目的为改进基于人工智能技术高血压时域脉搏波分类模型精度低、泛化性能差的问题,提出一种基于融合注意力机制的频域脉搏波预测模型。方法首先将时域脉搏波转换为频域梅尔频率倒谱系数特征,增强脉搏波区分度,采用时间卷积网络与Transformer 结构提取脉搏波深层特征,并将自注意力机制与选择性内核注意力进行决策融合,提取脉搏波关联特征,并采用Floodings正则化方法间接控制训练损失,防止过拟合发生。针对上海中医药大学附属龙华医院及上海市中西医结合医院提供的527例临床脉诊数据,进行5折交叉验证实验。此外,采用梯度提升决策树算法统计脉搏波频域特征的贡献率排名,分析影响模型分类精度的关键因素,为中医临床辅助诊断提供参考价值。结果本研究提出的模型分类评估指标准确度、F1值、精确率、召回率和AUC值分别为0.939 6、0.924 9、0.940 9、0.929 5和0.993 4。脉搏波的静态特征、一阶差分和二阶差分系数的贡献率相对均衡,说明高血压危险程度不仅与脉搏波的静态特征相关,也应当考虑脉搏波的动态特征。结论与典型脉搏波分类模型相比,本研究提出的模型具有较高的分类精度和泛化性能。

关键词：高血压危险分层梅尔频率倒谱系数时间卷积网络 Transformer

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过氧化氢诱导人自然杀伤细胞损伤的特点和主要机制

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中国免疫学杂志 2023年第2期39卷 235-240页

作者：齐婧姝平大冰孙鑫胡旭东彭渊刘成海上海中医药大学附属曙光医院肝病研究所上海201203 上海中医药大学基础医学院生物教研室上海201203 上海市中医临床重点实验室与教育部肝肾疾病重点实验室上海201203 上海中医健康服务协同创新中心上海201203

目的:观察过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导人自然杀伤细胞株(NK92MI)损伤的特点及其主要机制。方法:采用不同浓度H_(2)O_(2)(0、1、5、25 mmol/L)诱导NK92MI细胞损伤,显微镜下观察NK92MI细胞的生长状态;试剂盒检测细胞上清中乳酸脱氢酶(LDH)... 详细信息

目的:观察过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导人自然杀伤细胞株(NK92MI)损伤的特点及其主要机制。方法:采用不同浓度H_(2)O_(2)(0、1、5、25 mmol/L)诱导NK92MI细胞损伤,显微镜下观察NK92MI细胞的生长状态;试剂盒检测细胞上清中乳酸脱氢酶(LDH)释放率及谷胱甘肽(GSH)、超氧化物歧化酶(SOD)含量;流式细胞术检测细胞凋亡;试剂盒检测NK92MI细胞对人慢性髓原白血病细胞株K562细胞的杀伤能力;RT-PCR法检测细胞JNK1、Bcl2、PD-1、PD-L1等凋亡相关基因的表达;蛋白免疫印迹法检测细胞JNK1、p-JNK1蛋白的表达。结果:与未经刺激组(H2O20 mmol/L)相比,经H2O2(1、5、25 mmol/L)刺激5 h后,NK92MI细胞细胞存活率显著下降(P<0.05);凋亡细胞数量明显增多,以Annexin V+PI+晚期凋亡细胞居多(P<0.01);对K562细胞的杀伤能力明显下降(P<0.05);JNK1、PD-1、PD-L1基因表达水平明显升高(P<0.05),Bcl2基因表达水平明显下降(P<0.05)。p-JNK蛋白表达水平明显增多(P<0.01)。结论:H2O2体外诱导NK细胞氧化损伤的特点以细胞晚期凋亡为主,其作用机制与激活JNK1信号通路进而引发细胞程序性死亡相关。

关键词：过氧化氢人自然杀伤细胞细胞损伤

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NAFLD疾病进程关键风险基因发现与验证

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医学研究杂志 2024年第12期53卷 78-87页

作者：崔永康苟小军曹姗王淑斐孙继佳上海中医药大学附属宝山医院消化科 201999 上海中医药大学附属宝山医院中心实验室 201999 上海中医药大学中药学院数理教研室 201203

目的探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证。方法基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基因分析、京都基因与基因组百科全书(Kyo... 详细信息

目的探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证。方法基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基因分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析、蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析以及机器学习特征筛选方法,发现NAFLD疾病进程中的关键基因;同时,构建从单纯性脂肪肝(simple steatosis,SS)到非酒精性脂肪肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)的NAFLD疾病进程风险预测模型;最后,通过体外分子生物学实验对关键基因进行验证。结果GEO数据库中差异表达基因分析结果显示,正常对照(normal control,NC)组与NASH组比较有1247个差异表达基因,NC组与SS组之间有1088个差异表达基因,SS组与NASH组比较只有75个差异表达基因。结合前期研究和文献查阅以及KEGG通路富集分析结果显示,有4条与NAFLD疾病相关的共同信号通路,即胆固醇代谢(hsa04979)、半乳糖代谢(hsa00052)、PI3K/Akt信号通路(hsa04151)和PPAR信号通路(hsa03320)等。通过3种不同的机器学习特征筛选方法,最终得到4个共有基因,即AKR1B10、COL1A2、HKDC1、LAMC3。体外分子生物学实验结果显示,AKR1B10、COL1A2在NAFLD中均显著上调,与生物信息学分析结果一致。结论本研究发现了SS发展到NASH的关键基因,同时,构建了NAFLD疾病进程的风险预测模型,为NAFLD疾病的有效控制、干预与临床诊断和治疗提供了有价值的方法与技术。

关键词：非酒精性脂肪性肝病差异表达基因分析 KEGG通路富集分析 PPI网络分析疾病进程风险预测模型

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短视频作为新型临床教学富媒体工具的应用

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中医药管理杂志 2024年第10期32卷 188-190页

作者：孙羿帼顾超李屹上海中医药大学附属龙华医院综合内科上海200032 上海中医药大学龙华临床医学院中医经典与临床教研室上海200032 上海中医药大学附属龙华医院上海200032

短视频具有充分的便利性、可得性和传播性,其作为新型媒介形式的在多媒体平台上的爆炸性扩张是科技革新进程中的必然产物。目前,中国在全球短视频产业中具有绝对优势。短视频便利、易得、传播力强,适合作为新的知识传播载体,成为新型教... 详细信息

短视频具有充分的便利性、可得性和传播性,其作为新型媒介形式的在多媒体平台上的爆炸性扩张是科技革新进程中的必然产物。目前,中国在全球短视频产业中具有绝对优势。短视频便利、易得、传播力强,适合作为新的知识传播载体,成为新型教学辅助工具。新冠疫情后,“慕课”线上教学得到了大力的发展,而短视频教学尚未得到普及,基于教学短视频的开发符合我国“双循环”的发展战略及其在教学活动中的巨大潜在价值,对其开发应用进行了探讨。

关键词：临床教学富媒体工具短视频

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社会活动参与对我国老年人认知功能的影响——基于中国健康与养老追踪调查数据

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数理医药学杂志 2024年第1期37卷 41-51页

作者：鲍瑞毛慧娟宋花玲谢国群陈学芬上海中医药大学公共健康学院流行病与卫生统计学教研室上海201203 上海中医药大学针灸推拿学院实验针推学教研室上海201203 上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院肿瘤二科上海200437

目的探索社会活动参与对我国老年人认知功能的影响及城乡差异。方法利用中国健康与养老追踪调查(China Health and Retirement Longitudinal Study,CHARLS)2018年调查数据,共纳入4669名60岁及以上老年人,收集其人口社会学特征、健康状... 详细信息

目的探索社会活动参与对我国老年人认知功能的影响及城乡差异。方法利用中国健康与养老追踪调查(China Health and Retirement Longitudinal Study,CHARLS)2018年调查数据,共纳入4669名60岁及以上老年人,收集其人口社会学特征、健康状况、社会活动参与情况及认知功能评分。采用多重线性回归模型分析社会活动参与对老年人认知功能的影响。结果4669人中认知功能障碍者880人,检出率为18.0%。多重线性回归分析结果显示,跟朋友交往、棋牌活动、炒股、上网、参与社会活动数量均为老年人认知功能的影响因素。影响城市老年人认知功能的社会活动包括跟朋友交往[β=-0.30,95%CI(-0.59,-0.01),P=0.045]、炒股[β=-0.65,95%CI(-0.99,-0.31),P<0.001];影响农村老年人认知功能的社会活动包括跟朋友交往[β=-0.46,95%CI(-0.72,-0.20),P<0.001]、棋牌活动[β=-0.43,95%CI(-0.72,-0.14),P=0.003]、炒股[β=-1.10,95%CI(-1.65,-0.55),P<0.001]、上网[β=-1.18,95%CI(-2.26,-0.10),P=0.033]。炒股与定向力[β=-0.13,95%CI(-0.25,-0.01),P<0.05]、注意力与计算能力[β=-0.14,95%CI(-0.26,-0.02),P<0.05]、语言能力[β=-0.37,95%CI(-0.53,-0.22),P<0.01]三个认知维度均有统计学关联。结论简单交往型(跟朋友交往)和智力参与型(棋牌活动、炒股、上网)活动是老年人认知功能的重要影响因素,政府应当从政策层面鼓励我国老年人参与社会活动。与城市老年人相比,同一类社会活动对农村老年人认知功能的影响更大,应给予农村老年人更多关注,并针对老年个体不同认知维度的衰退,制定更为精细化、可操作性的干预策略。

关键词：社会活动老年人认知功能中国健康与养老追踪调查

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基于机器视觉的三部脉象仪智能定位的研究

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世界科学技术-中医药现代化 2023年第2期25卷 806-812页

作者：黄霖颜建军蔡诗雨吴晓娅周炜郭睿燕海霞王忆勤华东理工大学机械与动力工程学院上海200237 华东理工大学上海市智能感知与检测技术重点实验室上海200237 上海中医药大学四诊信息综合实验室上海201203 上海中医药大学上海市健康辨识与评估重点实验室上海201203

目的客观准确的脉象信息是中医脉诊判断病理的重要依据,三部脉诊仪寸关尺精准定位为获得准确的脉象信息提供了保障。方法依据中医“三部九候”理论,本文提出基于机器视觉的寸关尺三部智能定位的方法。为实现寸口三部脉的脉搏信号准确采... 详细信息

目的客观准确的脉象信息是中医脉诊判断病理的重要依据,三部脉诊仪寸关尺精准定位为获得准确的脉象信息提供了保障。方法依据中医“三部九候”理论,本文提出基于机器视觉的寸关尺三部智能定位的方法。为实现寸口三部脉的脉搏信号准确采集,采用六个步进电机以及丝杠导轨搭建了脉诊仪的三部定位机构,实现脉搏传感器在水平面上的运动;使用摄像头实现腕部图像的获取,基于机器视觉算法实现寸关尺三部位置坐标的计算。结果基于OpenCV机器视觉库对腕部图像进行预处理后,进行皮肤分割、多边形轮廓拟合和角点检测等操作,根据中医脉诊理论和桡动脉解剖知识,识别出寸关尺三部的准确位置。最后基于RS485通信技术驱动控制水平运动的步进电机,将脉搏传感器移动到寸关尺对应的位置,实现寸关尺三部的智能定位。结论本研究可为脉诊三部自动定位研究提供参考,为智能脉诊仪的使用和推广奠定基础。

关键词：中医脉诊脉象采集机器视觉自动定位

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嘌呤能信号和胞外核苷酸酶在疲劳中的作用及机制研究进展

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海军军医大学学报 2022年第8期43卷 929-935页

作者：沈诞余嘉惠汪丽娜沈雪勇王丽娜海军军医大学(第二军医大学)中医系经典著作教研室上海200433 上海中医药大学针灸推拿学院实验针灸教研室上海201203 复旦大学航空航天系上海市针灸机制与穴位功能重点实验室上海200433 上海中医药大学针灸推拿学院经络腧穴教研室上海201203 上海市针灸经络研究中心上海201203

疲劳是一种主观不适感,往往表现为多样的躯体和精神主诉;其不仅可发展为独立的疾病,也可作为多种疾病的症状,严重降低人们的生活质量。疲劳的发病机制复杂,近年来,中枢和外周神经递质水平改变和能量代谢异常被认为是其主要原因。ATP等... 详细信息

疲劳是一种主观不适感,往往表现为多样的躯体和精神主诉;其不仅可发展为独立的疾病,也可作为多种疾病的症状,严重降低人们的生活质量。疲劳的发病机制复杂,近年来,中枢和外周神经递质水平改变和能量代谢异常被认为是其主要原因。ATP等嘌呤物质在细胞内主要参与躯体能量需求过程,而在细胞外则作为重要信号分子参与有效神经传递、神经元-胶质细胞相互作用、免疫反应和控制等,在疲劳研究中受到广泛关注。胞外ATP代谢进一步以浓度依赖的方式激活P1受体和P2受体,而胞外核苷酸酶通过释放受体配体控制嘌呤物质浓度,以终止或促进嘌呤信号通路。本文对嘌呤能信号和胞外核苷酸酶协同影响疲劳感受与发展的研究进展进行总结归纳,为疲劳发病机制的进一步研究及疲劳的有效防治提供依据。

关键词：嘌呤能信号嘌呤受体胞外核苷酸酶疲劳

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基于二分光反射模型与随机森林的中医舌苔润燥识别研究

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中华中医药杂志 2022年第10期37卷 5908-5912页

作者：颜建军曾梦浩郭睿穆伟伟燕海霞周炜王忆勤华东理工大学机械与动力工程学院上海200237 上海中医药大学四诊信息综合实验室上海201203

在以往的中医舌苔润燥识别研究中,只利用单个特征或指标,通过与经验阈值进行比较来进行舌苔润燥的识别。提取的特征不能充分地反映水分亮斑区的特性,同时利用经验阈值作为分类依据,易受人为主观因素的影响。本课题组提出一种基于二分光... 详细信息

在以往的中医舌苔润燥识别研究中,只利用单个特征或指标,通过与经验阈值进行比较来进行舌苔润燥的识别。提取的特征不能充分地反映水分亮斑区的特性,同时利用经验阈值作为分类依据,易受人为主观因素的影响。本课题组提出一种基于二分光反射模型与随机森林的舌苔润燥识别方法。在已有研究的基础上,基于二分光反射模型分析亮斑区与本色区的光学特性差异,提取舌图像的水分亮斑区的RGB协方差矩阵特征值、亮度和等特征,并对这些特征进行统计分析;基于随机森林算法建立舌苔润燥识别模型。实验结果表明,该方法分类准确率可达95.9%,与已有的舌苔润燥识别方法相比有所提升。该研究为舌苔润燥识别提供了一种新的思路和方法,对舌诊客观化具有一定的实用价值。

关键词：特征分析二分光反射模型随机森林舌苔润燥识别

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