目的:探讨C型凝集素域家族4,成员M(C-type lectin domain family 4,member M,CLEC4M)在正常肝、肝硬化、肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织及其配对癌旁肝组织中的表达及其临床意义。方法:利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Geno...
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目的:探讨C型凝集素域家族4,成员M(C-type lectin domain family 4,member M,CLEC4M)在正常肝、肝硬化、肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织及其配对癌旁肝组织中的表达及其临床意义。方法:利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)等数据库,筛选各个肝癌数据库中在HCC组织中表达明显下调的基因。利用GEO数据库分析正常肝、肝硬化及HCC组织中CLEC4M mRNA的表达水平。采用实时定量PCR检测83对HCC组织及其配对癌旁肝组织中CLEC4M mRNA的表达水平。利用肝细胞癌癌基因图谱数据库(Integrative Molecular Analysis of Hepatocellular Carcinoma,HCCDB)分析CLEC4M mRNA在多种肿瘤中的表达情况。分别采用免疫组织化学法检测236对HCC及其配对癌旁肝组织、10例正常肝组织和12例肝硬化组织中CLEC4M蛋白的表达水平;蛋白质印迹法检测8对HCC及其配对癌旁肝组织中CLEC4M蛋白的表达水平;再用Kaplan-Meier法分析癌旁肝组织中CLEC4M表达与患者总生存期之间的关系。结果:对GEO和TCGA数据库的检索结果以及对83对临床样品的检测结果显示,HCC组织中CLEC4M mRNA的表达水平明显低于癌旁肝组织(P值均<0.0001)。对GEO数据库的检索结果显示,CLEC4M mRNA在正常肝、肝硬化及HCC组织中的表达呈逐渐下降的趋势(P<0.05)。免疫组织化学法检测结果显示,236例HCC组织中仅6例为CLEC4M蛋白高表达,而配对癌旁肝组织中有157例为CLEC4M高表达。Kaplan–Meier生存期分析显示,癌旁肝组织中CLEC4M高表达患者的总生存期较CLEC4M低表达者明显延长(P<0.0001)。结论:HCC组织中CLEC4M低表达,而癌旁肝组织中CLEC4M高表达提示患者预后较好。
LXRα(Liver Xreceptorα)是一种氧甾醇核受体在免疫和脂类代谢等生物过程中发挥重要作用,为了进一步探究LXRα的生物学功能,本研究对LXRα和RXRA共同过表达的HepG2细胞进行了全基因组转录分析。在HepG2细胞中LXRα和RXRA共同过表达导致451个基因发生差异表达(p<0.05)其中有213个基因表达上调,221个基因表达下调,通过GO(Gene ontology)功能和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomics)通路基因富集分析发现这些基因参与调控化合物代谢、转录和免疫防御等生物过程。此外还发现在HepG2细胞中,LXRα和RXRA过表达也导致细胞死亡和凋亡相关基因的部分沉默或激活,证明LXRα也参与调控细胞死亡和凋亡。本研究首次在HepG2细胞中通过同时过表达LXRα和RXRA分析LXRα的靶基因及其所参与的生物过程和信号通路,为后续LXRα的功能发掘和相关疾病的药物开发和治疗提供了理论依据。
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