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上海交通大学学报（医学版） 2017年第12期37卷 1699-1701页

作者：李晓倩王睿顾川佳徐梦莎何平胡付品上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025 浙江工业大学药学院杭州310014 复旦大学附属华山医院抗生素研究所上海200040

随着临床上广泛耐药菌株的检出率逐年升高,新型抗菌药物需求日益迫切。越来越多的研究者们将注意力集中到噬菌体治疗上,并在这个领域取得了较大的进展。大量的研究表明,一些噬菌体能够产生降解细菌胞外聚合物基质的多糖解聚酶,继而裂解... 详细信息

随着临床上广泛耐药菌株的检出率逐年升高,新型抗菌药物需求日益迫切。越来越多的研究者们将注意力集中到噬菌体治疗上,并在这个领域取得了较大的进展。大量的研究表明,一些噬菌体能够产生降解细菌胞外聚合物基质的多糖解聚酶,继而裂解并杀死宿主菌。该文综述了噬菌体多糖解聚酶的分类和作用方式,判断噬菌体是否产生解聚酶的方法,以及该酶在治疗细菌性感染、降解生物膜和细菌荚膜分型上的应用。

关键词：噬菌体多糖解聚酶生物膜细菌性感染

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结核分枝杆菌最低抑菌浓度测定方法及临界值设置研究进展

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第5期32卷 661-666页

作者：张朝宝王洪海张舒林上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025 武汉工业学院生物与制药工程学院武汉430023 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室上海200433

结核病迄今仍是全球单一病原体引起死亡人数最多的传染性疾病。耐药及耐多药的产生是结核病流行和广泛传播的重要原因之一。建立规范、有效的结核分枝杆菌药敏最低抑菌浓度(MIC)的检测方法及设置有效的临界值对于结核病个体化治疗、快... 详细信息

结核病迄今仍是全球单一病原体引起死亡人数最多的传染性疾病。耐药及耐多药的产生是结核病流行和广泛传播的重要原因之一。建立规范、有效的结核分枝杆菌药敏最低抑菌浓度(MIC)的检测方法及设置有效的临界值对于结核病个体化治疗、快速耐药检测方法的研究以及新型抗结核药物筛选等领域具有重要意义,也是控制耐药结核病产生和传播的关键。该文就结核分枝杆菌MIC测定方法及临界值设置等方面的研究进展进行综述。

关键词：结核分枝杆菌最低抑菌浓度临界值

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上海市某医院产妇乳汁中多溴联苯醚暴露水平

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中华预防医学杂志 2011年第6期45卷 494-497页

作者：崔昌田英张琳王沛丁问微高宇王筱金施蓉王英金军上海交通大学医学院公共卫生学院环境卫生教研室上海市环境与儿童健康教育部重点实验室 200025 上海市浦东新区疾病预防控制中心高桥分中心中央民族大学生命与环境科学学院上海交通大学医学院公共卫生学院生物统计学教研室 200025 上海交通大学医学院公共卫生学院环境卫生教研室 200025

目的通过对上海市某医院产妇乳汁中多溴联苯醚（PBDEs）含量的测定和分析,了解该地区人群中PBDEs的暴露水平及其相关影响因素.方法于2006年9月至2007年4月在上海市某医院对48名产妇进行问卷调查,并采集其乳汁样本,产妇均为单胎妊娠,... 详细信息

目的通过对上海市某医院产妇乳汁中多溴联苯醚（PBDEs）含量的测定和分析,了解该地区人群中PBDEs的暴露水平及其相关影响因素.方法于2006年9月至2007年4月在上海市某医院对48名产妇进行问卷调查,并采集其乳汁样本,产妇均为单胎妊娠,排除高血压、糖尿病、HIV感染和不良用药史.采用气相色谱-负化学电离源-质谱法测定乳汁中7种PBDE同族体[溴代联苯醚（BDE）-28,BDE-47,BDE-100,BDE-99,BDE-154,BDE-153和BDE-183]的含量,并分析其影响因素.结果产妇乳汁中7种PBDEs（∑,PBDEs）浓度中位数为8.81 ng/g脂重（lipid weight,1w）,浓度范围为1.92-41.55 ng/g ***-28、BDE-47、BDE-100、BDE-99、BDE-154、BDE-153、BDE-183检出率分别为98%（47/48）、96%（46/48）、86%（41/48）、90%（43/48）、83%（40/48）、98%（47/48）、90%（43/48）;浓度中位数分别为0.88、0.99、0.97、1.39、1.14、2.17、1.41 ng/g 1w.不同学历产妇乳汁中PBDEs水平（logΣ7PBDEs）分别为：初中及以下为（0.89±0.24）、高中为（1.02±0.17）、大专及以上为（1.08±0.28）;不同月收入水平产妇乳汁中PBDEs水平（log∑7PBDEs）分别为：＜1000元为（0.89±0.12）、1000-3000元为（1.01±0.24）、＞3000元为（1.13±0.21）.相关分析发现母亲受教育水平（r=0.322,P＜0.05）和收入水平（r=0.388,P＜0.05）与母乳PBDEs暴露水平呈正相关.结论产妇乳汁中普遍含有PBDEs,母亲受教育水平和收入水平可能影响母乳中PBDEs水平.

关键词：乳,人多溴联苯类母亲暴露

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多反应变量重复测量资料的协方差类型模型应用及SAS实现

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中国医院统计 2011年第3期18卷 208-212页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室 200025

目的探讨协方差类型模型在多反应变量的重复测量资料分析中的应用方法为了评价盐酸吡格列酮片治疗2型糖尿病的有效性,以安慰剂为对照,对240例2型糖尿病患者的空腹血糖和餐后2 h血糖重复观测数据进行多反应变量的协方差类型模型分析,... 详细信息

目的探讨协方差类型模型在多反应变量的重复测量资料分析中的应用方法为了评价盐酸吡格列酮片治疗2型糖尿病的有效性,以安慰剂为对照,对240例2型糖尿病患者的空腹血糖和餐后2 h血糖重复观测数据进行多反应变量的协方差类型模型分析,对模型的固定效应参数矩阵作最小二乘估计并进行组间比较,同时给出误差效应的方差协方差矩阵,利用SAS中的MIXED过程得以实现结果 2组空腹血糖和餐后2 h血糖的总体差别有统计学意义（P〈0.01）;各时间点的差异有统计学意义（P〈0.01）;反应变量类别和时间的交互作用有统计学意义（P〈0.05）,说明空腹血糖和餐后2 h血糖随时间的变化趋势有所不同;分组和时间的交互作用有统计学意义（P〈0.01）,说明2组血糖随时间的变化趋势有所不同.得到固定效应的有关参数的估计值,并给出了曲线图.用药后患者的空腹血糖和餐后2 h血糖随时间变化而变化,且2组曲线的变化趋势是不相同的.试验组曲线随时间迅速下降,而安慰剂组曲线随时间变化非常平缓结论多反应变量的协方差类型模型可以处理有随机缺失数据的资料,并允许每个观察对象观察次数和观察时间不同,通过指定非独立数据的方差协方差矩阵结构,直接对相关性结构建模.模型不仅考虑了每个反应变量多次重复测量结果之间的相关性,也考虑了各个反应变量之间的相关性,可有效地进行重复测量资料的动态变化趋势分析,统计结论更为可信.

关键词：多反应变量重复测量资料协方差类型模型协方差结构

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结核分枝杆菌Rv0315重组蛋白ELISPOT辅助诊断活动性肺结核的应用价值

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上海交通大学学报（医学版） 2013年第7期33卷 970-974页

作者：周业成陈翠翠叶娟赵俊伟玄松花杨志荣张舒林四川大学生命科学学院成都610065 郑州大学第一附属医院郑州450001 河南中医学院分子生物学教研室郑州450008 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的用酶联免疫斑点试验(ELISPOT)评价结核分枝杆菌重组蛋白Rv0315在活动性肺结核病诊断中的应用价值。方法选取初治肺结核病患者25例和健康体检者28名分别作为结核组和对照组,应用Rv0315蛋白作为抗原对受试者外周血单核细胞进行ELISPO... 详细信息

目的用酶联免疫斑点试验(ELISPOT)评价结核分枝杆菌重组蛋白Rv0315在活动性肺结核病诊断中的应用价值。方法选取初治肺结核病患者25例和健康体检者28名分别作为结核组和对照组,应用Rv0315蛋白作为抗原对受试者外周血单核细胞进行ELISPOT检测斑点形成细胞(SFCs)的数量,判断结核分枝杆菌感染情况,并与结核早期分泌靶向抗原(ESAT6)和培养滤液蛋白10(CFP10)抗原的检测结果进行比较。结果以Rv0315、EAST6和CFP10作为抗原,用ELISPOT方法检测结核分枝杆菌感染的敏感度分别为84.0%(21/25)、80.0%(20/25)和92.0%(23/25),特异度分别为89.2%(25/28)、89.2%(25/28)和92.8%(26/28),其中Rv0315的敏感度高于EAST6但低于CFP10。结论应用重组蛋白Rv0315作为抗原建立的ELISPOT方法具有应用于活动性肺结核病辅助诊断的潜在价值。

关键词：结核分枝杆菌 Rv0315 酶联免疫斑点技术细胞免疫

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武汉地区结核分枝杆菌氨基糖苷类抗生素耐药分离株rpsL和rrs基因特征分析

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上海交通大学学报（医学版） 2011年第11期31卷 1583-1587页

作者：温子禄沈建国张朝宝余晓丽陈平唐神结郭晓奎张舒林武汉工业学院生物与制药工程学院武汉430023 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025 南阳理工学院南阳473004 同济大学附属上海市肺科医院结核科上海200433

目的阐明武汉地区结核分枝杆菌分离株氨基糖苷类药物耐药相关基因rpsL和rrs的分子突变特征。方法从武汉医疗救治中心共收集69株结核分枝杆菌的临床菌株,包括耐链霉素(SM)菌株35株(其中4株同时对卡那霉素耐药)和SM敏感菌株34株(其中全敏... 详细信息

目的阐明武汉地区结核分枝杆菌分离株氨基糖苷类药物耐药相关基因rpsL和rrs的分子突变特征。方法从武汉医疗救治中心共收集69株结核分枝杆菌的临床菌株,包括耐链霉素(SM)菌株35株(其中4株同时对卡那霉素耐药)和SM敏感菌株34株(其中全敏感20株)。采用PCR直接测序法分析rpsL和rrs基因的分子突变特征。结果 35株SM耐药株中有26株(74.3%)检测到rpsL突变,突变位点集中在第43位和第88位密码子,并发现了1个新的突变类型Lys88Glu;13株耐药株(37.1%)检测到四种不同类型的rrs基因突变,分别为A1401G(17.1%,6/35)、A514C(14.3%,5/35)、G1487A(2.9%,1/35)和C517T(2.9%,1/35),1株全敏感菌株的rrs基因发生了C1029T突变。卡那霉素耐药株中只有3株检测到了rrs突变,并发现了一种rrs基因尚未见报道的G1487A突变类型。结论结核分枝杆菌对氨基糖苷类药物的耐药与rpsL和rrs突变相关,耐药基因突变类型存在地域差异。

关键词：结核分枝杆菌氨基糖苷类耐药 rpsL基因 rrs基因

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噬菌体治疗泛耐药肺炎克雷伯菌肺部感染的临床应用及效果初探

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上海交通大学学报（医学版） 2021年第9期41卷 1272-1276页

作者：李莉莎李建辉何斌吴楠楠朱同玉郭晓奎陈峥宏贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵阳550025 上海市公共卫生临床中心上海噬菌体研究所上海201508 上海交通大学医学院国家热带病研究中心全球健康学院上海200025

目的·探讨使用噬菌体雾化吸入治疗泛耐药肺炎克雷伯菌肺部感染的用药频率及效果。方法·在治疗开始前1 h和使用噬菌体雾化吸入治疗肺部感染过程中每小时,取患者痰液样本进行细菌分离纯化及质谱鉴定,比较细菌裂解谱的异同;同时... 详细信息

目的·探讨使用噬菌体雾化吸入治疗泛耐药肺炎克雷伯菌肺部感染的用药频率及效果。方法·在治疗开始前1 h和使用噬菌体雾化吸入治疗肺部感染过程中每小时,取患者痰液样本进行细菌分离纯化及质谱鉴定,比较细菌裂解谱的异同;同时,于治疗开始前1 h,第一次治疗开始后2、4 h取血液样本进行细菌培养及噬菌体量的测定。结果·噬菌体经雾化吸入后2 h在体内持续增殖,3 h后噬菌体量下降,4 h后进行第二次治疗,噬菌体在体内的增殖规律与第一次相同;第三次使用噬菌体治疗时,噬菌体仅有少量增殖。噬菌体治疗后患者痰液中仍分离到肺炎克雷伯菌,但分离株的噬菌体裂解谱发生了变化,患者临床症状改善。结论·噬菌体能够有效针对靶细菌进行杀灭并改善患者的临床症状。泛耐药肺炎克雷伯菌肺部感染患者经2次雾化吸入治疗即可达到噬菌体使用的最佳效果。噬菌体治疗后病原菌菌株发生了变化。

关键词：噬菌体泛耐药肺炎克雷伯菌治疗应用

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有序多分类重复测量资料的广义线性混合效应模型分析

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中国医院统计 2012年第1期19卷 14-17页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室上海市200025

目的探讨广义线性混合效应模型在有序多分类重复测量资料分析中的应用及SAS9.1的GLIMMIX和NLMIXED过程实现.方法为了评价某新药治疗糖尿病神经病变的临床疗效,采用以安慰剂为对照的随机双盲临床试验.在各个随访时间记录各受试者的神... 详细信息

目的探讨广义线性混合效应模型在有序多分类重复测量资料分析中的应用及SAS9.1的GLIMMIX和NLMIXED过程实现.方法为了评价某新药治疗糖尿病神经病变的临床疗效,采用以安慰剂为对照的随机双盲临床试验.在各个随访时间记录各受试者的神经病变主觉症状总分,并根据减分率评定疗效.建立广义线性混合效应模型,并分别用线性化法和数值法积分近似法进行参数估计,利用SAS中的GLIMMIX和NLMIXED过程得以实现.结果 2种参数估计方法结果很接近.疗效的组间差别有统计学意义（P〈0.000 1）,试验组疗效优于安慰剂组;各个疗程间的疗效差别有统计学意义（P〈0.000 1）,且疗程越大疗效越好; 治疗前神经病变主觉症状总分对疗效有影响（P=0.061 3,接近显著性水平）,其值越高,越容易治愈,提示病情严重的患者相比病情轻微的患者治愈效果更好.另外用数值法积分近似法还给出了随机截距和随机斜率的统计显著性检验.结论采用广义线性混合效应模型对有序多分类重复测量临床资料进行统计分析,可以更客观的进行药物疗效评价.

关键词：广义线性混合效应模型重复测量有序多分类 GLIMMIX NLMIXED

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上海市某医院新生儿脐带血中多溴联苯醚水平及其对出生结局的影响

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中华预防医学杂志 2011年第6期45卷 490-493页

作者：张琳田英杨先丰崔昌高宇王筱金王沛丁问微施蓉王英金军金萍上海交通大学医学院公共卫生学院环境卫生学教研室上海市环境与儿童健康教育部重点实验室 200025 潍坊人民医院滨海分院上海交通大学医学院公共卫生学院环境卫生学教研室 200025 上海交通大学医学院公共卫生学院生物统计学教研室 200025 上海市浦东新区疾病预防控制中心高桥分中心中央民族大学生命与环境科学学院

目的调查上海市某医院新生儿脐带血中多溴联苯醚（polybrominated diphenyl ethers,PBDEs）浓度水平,并分析胎儿期PBDEs暴露对新生儿出生结局的影响.方法于2006年9月至2007年4月,对上海市某医院50名入院分娩的孕妇进行问卷调查,孕妇... 详细信息

目的调查上海市某医院新生儿脐带血中多溴联苯醚（polybrominated diphenyl ethers,PBDEs）浓度水平,并分析胎儿期PBDEs暴露对新生儿出生结局的影响.方法于2006年9月至2007年4月,对上海市某医院50名入院分娩的孕妇进行问卷调查,孕妇均为单胎妊娠,排除高血压、糖尿病、HIV感染和不良药物史.收集新生儿脐带血样本,使用气相色谱-负化学电离源-质谱法检测脐带血中7种PBDEs[溴代联苯醚（BDE）-28、BDE-47、BDE-99、BDE-100、BDE-153、BDE-154、BDE-183]浓度,计算PBDEs总浓度（∑,PBDEs）,并进一步分析脐带血中PBDEs浓度水平对新生儿出生结局的影响.结果上海市某医院新生儿身长为（50.15±0.75）cm,体重为（3.49±0.42）kg,胸围为（34.76±1.51）cm,头围为（35.03±1.40）cm,体质指数为（13.76±1.36）kg/m2.新生儿脐带血中∑,PBDEs中位数浓度（范围）为14.06（1.03～379.73）ng/g脂重（lipid weight,1w）.BDE-28、BDE-47、BDE-99、BDE-100、BDE-153、BDE-154、BDE-183检出率分别为22%（11/50）、22%（11/50）、98%（49/50）、72%（36/50）、76%（38/50）、90%（45/50）、14%（7/50）.各同族体中位数浓度（范围）分别为：BDE-28为〈检测限（LOD）（＜LOD～137.20 ng/g 1w）,BDE-47为＜LOD（＜LOD-33.17 ng/g 1w）,BDE-99为7.54（＜LOD-94.01）ng/g 1w,BDE-100为1.57（＜LOD-46.95）ng/g 1w,BDE-153为0.63（＜LOD-79.08）ng/g 1w,BDE-154为0.63（＜LOD-22.30）ng/g 1w,BDE-183为＜LOD（＜LOD-21.63 ng/g 1w）.新生儿体质指数与BDE-99（r=-0.347,P＜0.05）和BDE-154（r=-0.292,P＜0.05）浓度呈负相关.将出生结局按照累计频率25%分为低（≤25%）、高（＞25%）两组,BDE-99在低身长组（≤50 cm）和高身长组（＜50 cm）的几何均数分别为10.59 ng/g 1w和3.60 ng/g 1w,二者差异有统计学意义（t=2.32,P=0.03）.结论上海市某医院新生儿脐带血中普遍存在PBDEs,胎儿期PBDEs暴露可影响新生儿出生结局.

关键词：多溴联苯类婴儿,新生胎血胚胎发育

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医学微生物学精品课程建设

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中国病原生物学杂志 2008年第3期3卷 238-239,I0001页

作者：冯艳徐大刚郭晓奎上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

医学微生物学是医学生的专业基础必修课。近几年来,上海交通大学医学院病原生物学教研室以国家精品课程建设为契机,重视师资人才培养,改善教学条件,完善教学管理体制,在教学内容、教学方法、教学手段及教学模式等方面进行改革与创新,于2... 详细信息

医学微生物学是医学生的专业基础必修课。近几年来,上海交通大学医学院病原生物学教研室以国家精品课程建设为契机,重视师资人才培养,改善教学条件,完善教学管理体制,在教学内容、教学方法、教学手段及教学模式等方面进行改革与创新,于2005年《医学微生物学》课程被评为国家级精品课程。本文就这几年实施国家精品课程建设规划中的实践经验以及心得体会进行了总结。

关键词：精品课程课程建设医学微生物学

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