检索结果-内蒙古大学图书馆

生物化学与生物物理进展 2012年第7期39卷 595-604页

作者：宛宝山张秋芬周爱萍赵国屏姚玉峰上海交通大学医学院基础医学院病原生物学教研室上海200025 中国科学院上海植物生理与生态研究所合成生物学实验室上海200032

在后基因组时代,特别是在新的测序理论和设备大发展的背景下,一些重大传染性致病微生物基因组序列正在被逐一测定,并且随后的基因功能注释,蛋白质三维结构重建等工作也正在开展,以期对致病微生物的生物学特性、诊断策略和治疗方法等有... 详细信息

在后基因组时代,特别是在新的测序理论和设备大发展的背景下,一些重大传染性致病微生物基因组序列正在被逐一测定,并且随后的基因功能注释,蛋白质三维结构重建等工作也正在开展,以期对致病微生物的生物学特性、诊断策略和治疗方法等有突破性的认识.作为对人类健康一直存在严重威胁的结核分枝杆菌,其基因组在进化中所发生的各种遗传事件对其生物学性质、致病能力和抗药性等各方面有重要作用.本文旨在阐述结核分枝杆菌的起源及其基因组特征,论述其基因组进化的研究进展.

关键词：结核分枝杆菌基因组比较基因组学分子进化

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孕妇全血、脐血中微量元素和重金属元素检测及相关性探讨

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上海交通大学学报（医学版） 2010年第8期30卷 897-901页

作者：施蓉王沛高宇王筱金王敏敏龚燕岚田英上海交通大学公共卫生学院上海200025 上海交通大学基础医学院生物统计学教研室上海200025 上海交通大学医学院瑞金医院妇产科上海200025 上海市第七人民医院妇产科上海200092

目的检测孕妇全血(简称母血)及脐血中微量元素和重金属元素水平,并分析两者之间的相关性。方法采集上海市和辽宁省大连市249例健康孕妇母血及259例胎儿脐血(其中母血和脐血配对241对);采用电感耦合等离子质谱系统检测全血中的铜(Cu)、铁... 详细信息

目的检测孕妇全血(简称母血)及脐血中微量元素和重金属元素水平,并分析两者之间的相关性。方法采集上海市和辽宁省大连市249例健康孕妇母血及259例胎儿脐血(其中母血和脐血配对241对);采用电感耦合等离子质谱系统检测全血中的铜(Cu)、铁(Fe)、硒(Se)、锰(Mn)、锌(Zn)、铅(Pb)、镉(Cd)的质量浓度;采用自动测汞仪测定全血中汞(Hg)的质量浓度。采用Spearm an相关分析对母血与脐血中各元素水平的相关性进行分析。结果母血中Cu、Se、Zn、Pb和Cd的质量浓度分别为1 493.0、126.2、6 260.0、57.2和1.1μg/L,明显高于脐血中的614.6、107.6、2 150.0、35.0和0.6μg/L(P<0.01);脐血中的Fe、Mn和Hg的质量浓度分别为512.2、77.1和2.4μg/L,明显高于母血中的432.6、52.9和1.5μg/L(P<0.01)。其中,1.2%(3/249)的母血Hg和3.4%(9/259)的脐血Hg超过美国环境保护局推荐的参考标准(5.8μg/L);12.0%(30/249)的母血Pb和5.8%(15/259)的脐血Pb超过联邦职业环境卫生委员会推荐的参考标准(100μg/L);5.6%(14/249)的母血Cd和3.5%(9/259)的脐血Cd超过美国职业安全与卫生管理局推荐的参考标准(5μg/L)。除Fe元素外,其他元素在母血和脐血中的质量浓度均呈正相关(P<0.01)。结论一定比例的母血和脐血中Pb、Cd、Hg水平超过有关机构推荐的参考标准;微量元素及重金属元素在母血中的水平与在胎儿脐血中的水平有一定相关性,孕期应合理补充微量元素并监测重金属元素水平。

关键词：微量元素重金属元素脐血孕妇

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能谱CT深度学习图像重建与迭代重建算法图像质量对比的体模和动物模型研究

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中华放射学杂志 2023年第12期57卷 1361-1367页

作者：姜江陈勇石骁萌陆伟王柏松石博文王雯芳朱兰潘自来张欢上海交通大学医学院附属瑞金医院放射科上海200025 GE医疗(中国)CT影像研究中心上海201203 上海交通大学医学院生物统计学教研室上海200025

目的探讨基于体模和动物模型的深度学习重建算法(TF-GSI)和自适应统计迭代重建算法(ASiR-V)对于能谱CT图像质量的影响。方法使用GE Revolution Apex能谱CT对ACR 464体模和胃癌淋巴结转移小鼠模型(n=16)进行扫描。分别在体模和小鼠的70 ... 详细信息

目的探讨基于体模和动物模型的深度学习重建算法(TF-GSI)和自适应统计迭代重建算法(ASiR-V)对于能谱CT图像质量的影响。方法使用GE Revolution Apex能谱CT对ACR 464体模和胃癌淋巴结转移小鼠模型(n=16)进行扫描。分别在体模和小鼠的70 keV虚拟单能图像上重建TF-GSI和ASiR-V的中、高两档等级图像(TF-GSI-M、TF-GSI-H、ASiR-V50%和ASiR-V100%)。评价体模各组图像骨和丙烯酸的任务传递函数(TTF)、图像噪声功率谱(NPS)以及可检测能力指数(d′)。使用单因素方差分析对比小鼠图像噪声、脑组织和肝脏的信噪比(SNR)和对比噪声比(CNR)。2名医师(A和B)评价TF-GSI-H和ASiR-V100%2种重建算法图像对微小病灶检出的一致性采用Kappa检验。结果体模方面,TF-GSI-H组图像在TTF、NPS和d′的表现均最佳:相较ASiR-V100%,TF-GSI-H组图像骨和丙烯酸的TTF50%分别升高了2.4%和8.9%,TF-GSI-H组图像的NPS peak下降了54.1%,TF-GSI-H相对ASiR-V100%对骨和丙烯酸的检出能力分别提升了52.7%和59.5%。TF-GSI组相较ASiR-V组图像噪声降低,2种组织的SNR和CNR均升高,但各组图像间差异不具有统计学意义(P>0.05)。2名医师对2种重建算法图像评价的一致性良好(A,Kappa=0.875,P<0.001;B,Kappa=0.625,P=0.012)。2种重建算法图像对小鼠微小转移灶的检出方面,TF-GSI组高于ASiR-V组(准确度分别为83.5%、71.9%;灵敏度分别为77.8%、61.2%;特异度分别为85.7%、85.7%)。结论TF-GSI相对ASiR-V可以提高能谱CT虚拟单能图像的空间分辨率,改善图像噪声并具有提高微小病灶检出的潜在价值。

关键词：体层摄影术 X线计算机深度学习迭代重建图像质量

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组蛋白去乙酰化酶3在急性白血病细胞株中的表达

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肿瘤 2008年第4期28卷 313-316页

作者：钟华王炳顺陈芳源上海交通大学医学院附属仁济医院血液科上海200127 上海交通大学基础医学院生物统计和医用数学教研室上海200025

目的:研究组蛋白去乙酰化酶3(histone deacetylase 3,HDAC3)在不同类型急性白血病细胞株中的表达,观察HDAC3表达和细胞分化增殖的关系。方法:在16株白血病细胞株中采用实时定量PCR法及Western印迹法检测HDAC3的mRNA及蛋白质表达,检测NB... 详细信息

目的:研究组蛋白去乙酰化酶3(histone deacetylase 3,HDAC3)在不同类型急性白血病细胞株中的表达,观察HDAC3表达和细胞分化增殖的关系。方法:在16株白血病细胞株中采用实时定量PCR法及Western印迹法检测HDAC3的mRNA及蛋白质表达,检测NB4细胞株在维甲酸诱导分化过程中HDAC3 mRNA及蛋白质表达变化情况。结果:在NB4、NB4RA和NOMO-1细胞株中HDAC3 mRNA表达量较高,但蛋白质的表达与此不一致。在维甲酸诱导的NB4细胞分化过程中HDAC3 mRNA和蛋白质的表达呈下降趋势。结论:HDAC3的表达是白血病细胞生长所必须,在NB4细胞中HDAC3表达和细胞的分化和增殖状态相关。

关键词：组蛋白脱乙酰化酶类维甲酸白血病非淋巴细胞急性

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噬菌体裂解酶作为抗菌药物的研究进展

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上海交通大学学报（医学版） 2013年第3期33卷 368-373页

作者：王铮沈文彬张浩天么娆崔泽林何平上海交通大学医学院临床医学专业八年制2009级上海200025 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

传统抗菌药物的耐药问题日益突出,促使人们开始寻求更好的新型抗菌物质。噬菌体裂解酶是由双链DNA噬菌体编码、依靠宿主菌合成的酶,其能特异、高效地水解细菌的细胞壁,使细菌裂解死亡。噬菌体裂解酶在体外及动物体内模型实验中显示出良... 详细信息

传统抗菌药物的耐药问题日益突出,促使人们开始寻求更好的新型抗菌物质。噬菌体裂解酶是由双链DNA噬菌体编码、依靠宿主菌合成的酶,其能特异、高效地水解细菌的细胞壁,使细菌裂解死亡。噬菌体裂解酶在体外及动物体内模型实验中显示出良好的杀菌作用,且至今尚无直接对人体产生毒性的报道,噬菌体裂解酶的特性使其在预防、治疗细菌感染方面拥有广阔的应用前景。

关键词：噬菌体裂解酶抗菌药物耐药性

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混合响应类型的多水平模型在重复测量资料中的应用和实现

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中国卫生统计 2013年第4期30卷 510-513页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室 200025

目的将混合响应类型的多水平模型应用到具有两个不同类型结局变量的重复测量资料的分析中。方法对原始资料的格式作适当变换,构造一个水平1虚拟变量,将2个结局变量作为水平1上的观察单位,各时间点的重复测量为水平2单位,受试者为水平3单... 详细信息

目的将混合响应类型的多水平模型应用到具有两个不同类型结局变量的重复测量资料的分析中。方法对原始资料的格式作适当变换,构造一个水平1虚拟变量,将2个结局变量作为水平1上的观察单位,各时间点的重复测量为水平2单位,受试者为水平3单位,用MLwiN2.25软件拟合混合响应类型的三水平模型,对试验组和对照组的疗效,以及受试者的年龄、性别、观察指标的基线值,时间、组别和时间的交互效应进行分析。结果该模型在考虑了两个不同类型的结局变量在各个水平上的相关性后,可以对两个结局变量同时进行影响因素分析,获得解释变量对两个结局变量影响的估计,且只要数据缺失随机则估计是有效且无偏的。结论由于混合响应类型的多水平模型允许结局变量具有不同类型,并且把数据间的相关性分解为重复测量相关性和结局变量间相关性两部分,可有效地进行重复测量资料的动态变化趋势分析,分析结果更为细致。

关键词：混合响应类型重复测量资料多水平模型多反应变量模型

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两组及多组等级资料Ridit分析的SAS实现

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中国卫生统计 2007年第4期24卷 432-433页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室 (200025)

Ridit分析是由Brass提出的一种用于分析有序分类资料或试验结果进行有序尺度测量的资料的一种技术,它给有序分类变量的各等级赋予所谓的Ridit值,在此基础上对两组及两组以上有序分类资料进行分析和比较。目前常用的统计软件包中没有单独... 详细信息

Ridit分析是由Brass提出的一种用于分析有序分类资料或试验结果进行有序尺度测量的资料的一种技术,它给有序分类变量的各等级赋予所谓的Ridit值,在此基础上对两组及两组以上有序分类资料进行分析和比较。目前常用的统计软件包中没有单独的Ridit分析模块,一些研究者编写了相关的SAS程序,但其组别及等级是固定常数,通用性不强,并且也没有给出具体的统计检验方法。[第一段]

关键词： Ridit分析 SAS程序等级资料有序分类资料多组统计检验方法统计软件包分类变量

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人参皂甙Rg3在体外对胃癌细胞生长和凋亡的影响

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上海交通大学学报（医学版） 2009年第11期29卷 1336-1340页

作者：王吉史桂英袁耀宗乔敏敏章永平孙颖胡梅洁上海交通大学医学院瑞金医院卢湾分院消化内科上海200025 上海交通大学基础医学院细胞生物学教研室上海200025 上海交通大学医学院瑞金医院消化内科上海200025

目的研究人参皂甙Rg3在体外对低、中分化胃腺癌细胞株MKN-45和SGC-7901生长及凋亡的影响。方法取处于对数生长期的MKN-45和SGC-7901细胞,加入不同终浓度(20、30、40、50μg/mL)的人参皂甙Rg3分别培养24、48h或24、48和72h,以不加药细胞... 详细信息

目的研究人参皂甙Rg3在体外对低、中分化胃腺癌细胞株MKN-45和SGC-7901生长及凋亡的影响。方法取处于对数生长期的MKN-45和SGC-7901细胞,加入不同终浓度(20、30、40、50μg/mL)的人参皂甙Rg3分别培养24、48h或24、48和72h,以不加药细胞作为阴性对照。MTT法检测MKN-45和SGC-7901细胞生长抑制率;流式细胞仪AnnexinV/PI双染法检测SGC-7901细胞凋亡率;流式细胞仪分析SGC-7901细胞周期;透射电子显微镜观察50μg/mL人参皂甙Rg3处理组SGC-7901细胞的形态学改变。结果人参皂甙Rg3各处理组SGC-7901和MKN-45细胞生长抑制率均明显高于对照组(P<0.05),且随药物浓度的增加和作用时间的延长而上升(P<0.05)。与对照组比较,人参皂甙Rg3各处理组SGC-7901细胞凋亡率和G0/G1期细胞百分比均明显上升,且呈浓度和时间依赖性。透射电子显微镜观察50μg/mL人参皂甙Rg3处理组SGC-7901细胞,可见典型的凋亡细胞结构。结论人参皂甙Rg3在体外对胃癌细胞生长具有抑制作用,且呈现一定的时效和量效关系,其机制可能与诱导胃癌细胞凋亡有关。

关键词：人参皂甙Rg3 胃癌细胞株细胞凋亡细胞生长抑制

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复发事件资料的生存分析在临床试验中的应用及SAS实现

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中国卫生统计 2012年第4期29卷 490-492,496页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室 200025

目的探讨复发事件资料的生存分析在临床试验中的应用。方法为了评价某新药治疗成人慢性乙型肝炎的有效性,采用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药物平行对照的Ⅱ期临床试验,对238例受试者的HBVDNA进行重复观测。以HBVDNA阴转作为终点事件... 详细信息

目的探讨复发事件资料的生存分析在临床试验中的应用。方法为了评价某新药治疗成人慢性乙型肝炎的有效性,采用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药物平行对照的Ⅱ期临床试验,对238例受试者的HBVDNA进行重复观测。以HBVDNA阴转作为终点事件,记录各次阴转时间,分别用总时间模型(total time model)和边际模型(marginal model)进行复发事件资料的生存分析,用稳健的夹心方差估计方法对模型的回归系数进行估计,并进行组间比较,用SAS中的PHREG过程实现。结果服用试验药比服用对照药,HBV DNA更容易阴转,且时间更短,尤其是服药后的前期(24周内),随着随访时间的增加,试验药和对照药对于HBV DNA阴转的影响逐渐接近。治疗前的HBVDNA值越大,治疗后越不容易阴转,且时间越长,随着阴转次数的增加,治疗前HBV DNA值的大小对治疗后阴转的影响越来越小。结论对于复发事件资料的生存数据,应根据实际情况采用合适的模型,才能更客观地进行评价。

关键词：复发事件生存分析夹心方差估计总时间模型边际模型

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含截尾数据的时间相依的ROC曲线分析

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中国卫生统计 2014年第5期31卷 867-870页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室 200025

目的将时间相依的ROC曲线应用到临床试验的分析中。方法采用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药物平行对照的治疗成人慢性乙型肝炎的Ⅱ期临床试验,通过三个模型,用时间相依的ROC分析方法考察两个次要疗效指标HBVDNA、ALT对疗效判定的诊... 详细信息

目的将时间相依的ROC曲线应用到临床试验的分析中。方法采用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药物平行对照的治疗成人慢性乙型肝炎的Ⅱ期临床试验,通过三个模型,用时间相依的ROC分析方法考察两个次要疗效指标HBVDNA、ALT对疗效判定的诊断能力、两者的综合诊断能力以及各指标诊断能力的组间比较。结果对乙型肝炎疗效的诊断方面,HBVDNA比ALT诊断能力更强,HBVDNA和ALT两个指标的综合诊断能力最强,但与HBVDNA单指标诊断能力差别无统计学意义。HBVDNA、ALT以及两者对疗效的综合诊断能力上,试验组都要略高于对照组,且组间差别有统计学意义(P<0.05)。结论对于一个历时较长的临床试验来说,由于病例依从性的问题会存在一定的脱落,疗效的判定存在截尾数据,并且也是时间相依的,此时对各诊断指标诊断能力的考察就应该用时间相依的ROC曲线分析更符合实际。

关键词：截尾数据时间相依一致性概率 ROC曲线

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