检索结果-内蒙古大学图书馆

上海交通大学学报（医学版） 2012年第9期32卷 1135-1140页

作者：郭晓奎秦金红何平朱泳璋上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

钩端螺旋体(简称钩体)可以引起严重的人兽共患病,是威胁人类健康的传染病之一。课题组率先开展了对中国主要致病流行株56601的全基因组测序工作,测序结果显示钩体有两条染色体,共编码4 727个基因,后经重新注释为3 718个基因。基于56601... 详细信息

钩端螺旋体(简称钩体)可以引起严重的人兽共患病,是威胁人类健康的传染病之一。课题组率先开展了对中国主要致病流行株56601的全基因组测序工作,测序结果显示钩体有两条染色体,共编码4 727个基因,后经重新注释为3 718个基因。基于56601株的参考序列,对其减毒株IPAV的测序结果表明,除了有101个基因出现突变之外,IPAV株基因组的大小及基因结构组成与56601株相同。基于基因组序列,课题组设计并合成了钩体的基因组芯片,开展了比较基因组学及转录组学的研究。比较基因组学研究结果显示,钩体的核心基因有2 917个,变异基因有275个,并首次发现钩体基因组中存在2个基因岛。模拟体内外钩体生长的温度条件进行转录组学分析,共发现106个基因差异表达,分属9类不同的功能;对有毒株56601及减毒株IPAV进行转录组学分析,发现了差异上调表达的22 kb的类噬菌体片段。对体外培养的56601株进行蛋白组学分析,鉴定出2 540个蛋白,进一步对这些蛋白进行磷酸化、乙酰化及甲基化的修饰进行分析,发现了32个磷酸化位点、46个乙酰化位点和155个甲基化位点。通过分析发现,钩体蛋白的很多修饰方式类似于真核生物,提示钩体在进化上比较特殊。比较毒力株56601与减毒株IPAV的蛋白组异同,一致表达的蛋白1 627个,差异表达的蛋白402个。基于以上基因组学及蛋白组学研究,课题组进一步开展了对钩体相关功能基因的研究,这些研究均为揭示钩体的致病机制、开发钩体的疫苗及诊断试剂、最终防控钩体病奠定了基础。

关键词：钩端螺旋体基因组蛋白组

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结核分枝杆菌微进化研究与临床应用

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1404-1405,1414页

作者：姚玉峰上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

近十年来,在国内众多科研机构的努力下,对结核病的研究取得了较大的进展,并获得了国际认可。但有关结核病的诊断、治疗、预防以及日益严重的耐药问题仍然是我国结核病防控的瓶颈。因此必须加强结核病基础研究的临床转化,并注重以临床应... 详细信息

近十年来,在国内众多科研机构的努力下,对结核病的研究取得了较大的进展,并获得了国际认可。但有关结核病的诊断、治疗、预防以及日益严重的耐药问题仍然是我国结核病防控的瓶颈。因此必须加强结核病基础研究的临床转化,并注重以临床应用为靶向的结核病研究。结核分枝杆菌的基因组微进化研究已取得了较大进展,如利用比较基因组学找到结核分枝杆菌有毒株和无毒株的差异,发现MazG突变可能与结核分枝杆菌的毒力丧失有关。如何利用这些资源为结核病的诊断、预防和治疗提供新型的有效手段是结核病研究人员的当务之急。

关键词：结核分枝杆菌基因组微进化预防诊断

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后抗生素时代我们如何征服细菌?

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1401-1403页

作者：郭晓奎上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

耐药性"超级细菌"的出现,将使我们重新步入无抗生素可用的时代,即"后抗生素时代"。面对日益严重的细菌耐药性,寻找新的抗菌药物及治疗方案已成为目前急需解决的难题。文章阐述新型抗生素、抗菌肽、噬菌体和中药制... 详细信息

耐药性"超级细菌"的出现,将使我们重新步入无抗生素可用的时代,即"后抗生素时代"。面对日益严重的细菌耐药性,寻找新的抗菌药物及治疗方案已成为目前急需解决的难题。文章阐述新型抗生素、抗菌肽、噬菌体和中药制剂的研究开发及应用前景,为后抗生素时代针对耐药细菌,特别是超级细菌的抗感染药物的研究提供思路。

关键词：耐药细菌控制

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细菌泛基因组学的研究

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1440-1443页

作者：庄绪冉朱泳璋上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化,这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异。为了更全面地在基因组水平上揭示细菌... 详细信息

细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化,这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异。为了更全面地在基因组水平上揭示细菌种内个体间的遗传多样性,进一步探寻个体间的系统发生关系和个体间表型差异的遗传基础,科学家提出了细菌泛基因组学的概念,该文对细菌菌种遗传多样性的形成机制、泛基因组的研究策略及其在细菌研究中的应用和进展等作一综述。

关键词：泛基因组多菌株测序遗传多样性核心基因组附属基因组

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结核分枝杆菌基因组学与基因组进化

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生物化学与生物物理进展 2012年第7期39卷 595-604页

作者：宛宝山张秋芬周爱萍赵国屏姚玉峰上海交通大学医学院基础医学院病原生物学教研室上海200025 中国科学院上海植物生理与生态研究所合成生物学实验室上海200032

在后基因组时代,特别是在新的测序理论和设备大发展的背景下,一些重大传染性致病微生物基因组序列正在被逐一测定,并且随后的基因功能注释,蛋白质三维结构重建等工作也正在开展,以期对致病微生物的生物学特性、诊断策略和治疗方法等有... 详细信息

在后基因组时代,特别是在新的测序理论和设备大发展的背景下,一些重大传染性致病微生物基因组序列正在被逐一测定,并且随后的基因功能注释,蛋白质三维结构重建等工作也正在开展,以期对致病微生物的生物学特性、诊断策略和治疗方法等有突破性的认识.作为对人类健康一直存在严重威胁的结核分枝杆菌,其基因组在进化中所发生的各种遗传事件对其生物学性质、致病能力和抗药性等各方面有重要作用.本文旨在阐述结核分枝杆菌的起源及其基因组特征,论述其基因组进化的研究进展.

关键词：结核分枝杆菌基因组比较基因组学分子进化

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急性炎症状态下2型糖尿病大鼠的反应能力研究

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第1期32卷 9-13页

作者：韩亭亭苏布德格日乐胡耀敏黄融易静上海交通大学医学院附属仁济医院内分泌代谢病科上海200127 上海交通大学基础医学院细胞生物学教研室上海200025

目的研究2型糖尿病大鼠和正常大鼠在急性炎症状态下的反应能力差异和血糖变化情况。方法以2型糖尿病GK大鼠和Wistar大鼠(正常对照)作为实验对象,按5 mg/kg内毒素(LPS)腹腔注射构建大鼠脓毒症的危重病模型。观察LPS注射前后两种大鼠的一... 详细信息

目的研究2型糖尿病大鼠和正常大鼠在急性炎症状态下的反应能力差异和血糖变化情况。方法以2型糖尿病GK大鼠和Wistar大鼠(正常对照)作为实验对象,按5 mg/kg内毒素(LPS)腹腔注射构建大鼠脓毒症的危重病模型。观察LPS注射前后两种大鼠的一般情况,测定血清中促炎因子肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白介素1β(IL-1β)和白介素6(IL-6)和抗炎因子白介素10(IL-10)的质量浓度,监测血糖的波动情况。结果注射LPS后,Wistar大鼠的一般情况差,出现活动减少、嗜睡、竖毛怕冷、严重腹泻等症状;而GK大鼠一般状况良好,未出现上述表现。LPS注射前,GK大鼠血糖浓度显著高于Wistar大鼠;注射LPS后,两种大鼠血糖浓度均显著升高,GK大鼠血糖波动幅度小于Wistar大鼠,两种大鼠的峰值血糖浓度无明显差异。LPS注射前,GK大鼠血清中TNF-α和IL-6的质量浓度显著高于Wistar大鼠(P<0.01);LPS注射后,两种大鼠血清中TNF-α、IL-1β、IL-6和IL-10的质量浓度均较LPS注射前显著升高(P<0.01),且Wistar大鼠血清中TNF-α、IL-1β和IL-10的质量浓度明显高于GK大鼠(P<0.01)。结论与正常大鼠比较,2型糖尿病大鼠对于急性炎症刺激的耐受性更强。

关键词：糖尿病脓毒症急性炎症血糖细胞因子

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人类遗传病致病基因克隆及其生物学功能研究进展

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第9期32卷 1171-1174页

作者：王铸钢顾鸣敏上海交通大学基础医学院医学遗传学教研室上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院实验动物研究中心上海200025

近20年来,遗传病致病基因克隆及其生物学功能研究取得了快速发展。然而,仍有许多突变基因的致病机制仍未明确。该文简要介绍了遗传病的基本特征,综述了遗传病致病基因克隆和机制研究的进展,并介绍了遗传病基因功能研究的2项进展,其中之... 详细信息

近20年来,遗传病致病基因克隆及其生物学功能研究取得了快速发展。然而,仍有许多突变基因的致病机制仍未明确。该文简要介绍了遗传病的基本特征,综述了遗传病致病基因克隆和机制研究的进展,并介绍了遗传病基因功能研究的2项进展,其中之一是成纤维细胞生长因子9(FGF9)的错义突变(S99N)导致多发性骨性连接综合征;另一个例子是Palladin敲除小鼠出现神经管闭合不全,伴有内脏外露、胎肝萎缩及胚胎造血功能障碍,最后导致胚胎死亡。

关键词：遗传病致病基因发病机制 FGF9基因多发性骨性连接综合征 Palladin基因神经管闭合不全

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壳聚糖季铵盐对肺炎克雷伯菌的体外抑菌作用

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1421-1425页

作者：黄洁雯陈志俊沈隽霏董思聪李擎天谭红略郭晓奎董珂上海交通大学医学院附属瑞金医院检验系上海200025 上海交通大学医学院附属第九人民医院骨科上海200011 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的探讨壳聚糖季铵盐对肺炎克雷伯菌的体外抑菌作用。方法以梯度稀释涂布平板法检测壳聚糖和壳聚糖季铵盐对肺炎克雷伯菌的直接抑菌作用;采用Real-Time PCR技术检测肺炎克雷伯菌生物膜形成相关的重要基因lsrR、lsrK和gmd的表达;并以结... 详细信息

目的探讨壳聚糖季铵盐对肺炎克雷伯菌的体外抑菌作用。方法以梯度稀释涂布平板法检测壳聚糖和壳聚糖季铵盐对肺炎克雷伯菌的直接抑菌作用;采用Real-Time PCR技术检测肺炎克雷伯菌生物膜形成相关的重要基因lsrR、lsrK和gmd的表达;并以结晶紫染色法检测肺炎克雷伯菌的生物膜形成情况。结果干预后6 h时点开始,壳聚糖和壳聚糖季铵盐孔的存活菌计数均显著降低(P<0.05);干预后12 h壳聚糖季铵盐孔的存活菌计数显著低于壳聚糖组,壳聚糖季铵盐和壳聚糖对待检肺炎克雷伯菌的12 h抑菌率分别为(72.6±8.0)%和(50.2±9.3)%(P<0.05)。壳聚糖和壳聚糖季铵盐均能上调lsrR基因表达;壳聚糖季铵盐使lsrK基因表达下调,gmd基因表达也有下调趋势。从干预后6 h开始,壳聚糖和壳聚糖季铵盐对肺炎克雷伯菌的生物膜形成都有显著抑制作用,与对照组比较差异均有统计学意义(P<0.05);但壳聚糖组与壳聚糖季铵盐组之间比较差异并无统计学意义(P>0.05)。结论壳聚糖和壳聚糖季铵盐能够有效抑制肺炎克雷伯菌增殖及生物膜形成。壳聚糖季铵盐的抑菌能力强于壳聚糖,同时可影响肺炎克雷伯菌生物膜形成相关的多个基因的表达。

关键词：壳聚糖壳聚糖季铵盐肺炎克雷伯菌抑菌试验生物膜形成

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武汉地区结核分枝杆菌临床分离株乙胺丁醇耐药分子特征研究

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武汉工业学院学报 2013年第3期32卷 13-17页

作者：丁冰冰马峻陈高瞻刘志国李睿胡申才郭利余晓丽张舒林武汉轻工大学生物与制药工程学院湖北武汉430023 武汉市医疗救治中心检验科湖北武汉430032 武汉轻工大学校医院湖北武汉430023 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

探讨武汉地区结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因embB的分子特征,为深入研究结核分枝杆菌乙胺丁醇(EMB)耐药分子机制、快速检测技术的建立和个体化临床用药奠定基础;同时探索武汉地区"北京基因型"菌株的传播类型,为结核防控提供参... 详细信息

探讨武汉地区结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因embB的分子特征,为深入研究结核分枝杆菌乙胺丁醇(EMB)耐药分子机制、快速检测技术的建立和个体化临床用药奠定基础;同时探索武汉地区"北京基因型"菌株的传播类型,为结核防控提供参考。收集85株临床分离株,采用PCR直接测序法分析embB基因的突变特征;采用RD105基因缺失检测法鉴定85株分离株中"北京基因型"菌株。结果显示22例EMB耐药株中,15(68.2%)例在embB基因检测到突变,其中14例为306位点突变,突变类型为M306V ATG→GTG和M306I ATG→ATA,1例为319位点突变,突变类型为Y319C TAT→TGT;同时,在63例EMB敏感株中也检测到了5株(7.9%)发生了embB基因突变,其中4例在306位点,1例在319位点。85例临床分离株中78株为"北京基因型"菌株,占全部菌株的91.8%,非"北京基因型"菌株有7株,占8.2%。研究表明embB306位点突变不仅在乙胺丁醇耐药菌株中,而且在乙胺丁醇敏感菌株中也能检测到。由于乙胺丁醇耐药菌株同时还耐其他药物,故不能排除其他药物与embB306位点突变的关系,因此embB306位点突变与结核分枝杆菌耐药的相关性有待深入探讨。本研究发现武汉地区结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药株中embB基因突变类型并不存在地域差异,而在敏感株中却存在明显的地域差异性。本研究同时表明,"北京基因型"菌株在武汉地区呈主要流行趋势,应该引起我们的重视。

关键词：结核分枝杆菌乙胺丁醇(EMB) 耐药 embB基因北京基因型

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miRNA在类风湿关节炎中的研究进展

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现代免疫学 2012年第1期32卷 76-79页

作者：叶周熹陈广洁上海交通大学医学院基础医学院上海交通大学医学院免疫学教研室上海200025

微小RNA(miRNA)是一类新发现的、微小的、非编码的RNA分子。据研究,其在调节包括免疫细胞谱系的发生、分化、成熟,以及维持免疫自稳和功能正常等生物学过程中发挥重要的作用。miRNA在转录后水平调节多个靶基因的表达,预计将影响到人类... 详细信息

微小RNA(miRNA)是一类新发现的、微小的、非编码的RNA分子。据研究,其在调节包括免疫细胞谱系的发生、分化、成熟,以及维持免疫自稳和功能正常等生物学过程中发挥重要的作用。miRNA在转录后水平调节多个靶基因的表达,预计将影响到人类三分之一的蛋白质编码基因。类风湿关节炎(RA)是一种系统性的、炎症性的自身免疫性疾病,往往会导致不可逆性关节损伤。迄今为止,尚无有效治疗手段可以治愈这种疾病。近年研究认为,miRNA与RA的产生有一定关系。若能明确其中miRNA的作用机制,将为治疗类风湿关节炎及与其类似的自身免疫性疾病提供新思路。另外,miRNA作为生物标志物在疾病的诊断和预后观察方面具有很高的临床价值。本文对miRNA的发生和合成、其与类风湿关节炎产生的关系以及作为生物标志物的研究进展进行综述。

关键词： miRNA 类风湿关节炎自身免疫生物标志物

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