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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1415-1420页

作者：周爱萍徐志弘孙青姚玉峰吴兴福上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025 西藏民族学院医学院咸阳712082 苏州市第五人民医院检验科苏州215007

目的分析结核分枝杆菌(MTB)北京型菌株及非北京型菌株5个有明显差异的MTB散在分布重复单位(MIRU)位点,研究其多态性与下游基因表达的关系。方法利用生物信息学方法预测5个MIRU位点(ETR-C、Mtub-30、Mtub-39、MIRU-27、MIRU-40)下游相邻... 详细信息

目的分析结核分枝杆菌(MTB)北京型菌株及非北京型菌株5个有明显差异的MTB散在分布重复单位(MIRU)位点,研究其多态性与下游基因表达的关系。方法利用生物信息学方法预测5个MIRU位点(ETR-C、Mtub-30、Mtub-39、MIRU-27、MIRU-40)下游相邻基因启动子区域。通过PCR方法扩增该区域并与分枝杆菌启动子探针载体pMC210连接,重组质粒测序正确后,用电穿孔方法转化耻垢分枝杆菌mc2155。采用Real-Time PCR技术检测报告基因lacZ的转录水平,验证MIRU位点多态性对其下游基因表达的影响。结果 Mtub-39位点核心区域内含有其下游基因的启动子。成功构建了分别带有1、3、5个拷贝重复序列的Mtub-39位点的重组质粒。Real-Time PCR结果显示,有多态性的Mtub-39位点(pMC210-Mtub-39-N158、pMC210-Mtub-39-N139及pMC210-Mtub-39-N146)对报告基因lacZ的转录调控差异有统计学意义(P=0.006 5)。结论 Mtub-39位点的多态性能明显影响下游基因启动子的活性进而调节其表达。

关键词：结核分枝杆菌 MTB散在分布重复单位位点 pMC210 启动子

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结核分枝杆菌特异性抗原ESXO的重组制备及其免疫原性评估

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1426-1429,1447页

作者：封莉叶娟王凤平赵俊伟吴兴福张舒林江苏省苏州市第五人民医院检验科苏州215007 河南中医学院分子生物学教研室郑州450008 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的评估结核分枝杆菌(MTB)重组特异性抗原ESXO在大肠埃希菌中的高效表达,并评价其免疫原性。方法采用常规分子克隆方法获得MTB重组蛋白ESXO。酶联免疫吸附试验(ELISA)方法检测84份确诊结核病(TB)患者血清和48份健康人血清中相应的抗结... 详细信息

目的评估结核分枝杆菌(MTB)重组特异性抗原ESXO在大肠埃希菌中的高效表达,并评价其免疫原性。方法采用常规分子克隆方法获得MTB重组蛋白ESXO。酶联免疫吸附试验(ELISA)方法检测84份确诊结核病(TB)患者血清和48份健康人血清中相应的抗结核ESXO抗体水平,评价血清学抗原活性,并与结核早期分泌蛋白ESAT-6和CFP-10的检测结果进行比较。结果重组特异性抗原ESXO在大肠杆菌中获得成功表达,其在*** BL 21 plysS(DE3)中以可溶性和包涵体两种形式存在,相对分子质量(27 300)与预期相符,血清学抗原活性评估结果显示其特异度和敏感度分别为94.0%(45/48)和32.1%(27/84),特异度与ESAT-6和CFP-10相当,敏感度高于ESAT-6。结论结核特异性抗原ESXO有望成为新的TB诊断与疫苗设计的候选抗原。

关键词：分枝杆菌,结核克隆 ESXO 基因表达血清学诊断

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结核分枝杆菌特异性抗原Rv3117的克隆表达和诱导小鼠免疫应答的实验研究

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1444-1447页

作者：汤俊明陈翠翠王学才赵俊伟张舒林江苏宜兴市人民医院宜兴214200 郑州大学第一附属医院郑州450001 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的克隆表达结核分枝杆菌Rv3117蛋白,并进行诱导小鼠免疫应答的初步研究。方法通过聚合酶链反应(PCR)扩增结核分枝杆菌Rv3117基因,克隆入pET32a载体,构建重组质粒pET32a-Rv3117,转化入大肠埃希菌BL21(***)plysS(DE3),异丙基硫代-β-D-... 详细信息

目的克隆表达结核分枝杆菌Rv3117蛋白,并进行诱导小鼠免疫应答的初步研究。方法通过聚合酶链反应(PCR)扩增结核分枝杆菌Rv3117基因,克隆入pET32a载体,构建重组质粒pET32a-Rv3117,转化入大肠埃希菌BL21(***)plysS(DE3),异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导表达,镍柱亲和纯化,通过SDS-PAGE鉴定其表达情况;以目的蛋白免疫C57BL/6小鼠血清并行Western blotting分析。结果成功构建原核表达载体pET32a-Rv3117,获得纯化的目的蛋白,其在*** BL21 plysS(DE3)中主要以可溶性形式表达,相对分子质量(48 100)与预期相符。Western blotting分析结果显示在目标位置有阳性条带。结论成功克隆结核分枝杆菌重组蛋白Rv3117,其能够诱导C57BL/6小鼠的免疫应答。

关键词：结核分枝杆菌 Rv3117 克隆 Western blotting

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不同缺失值处理方法对随机缺失数据处理效果的比较

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郑州大学学报（医学版） 2012年第3期47卷 315-318页

作者：花琳琳施念杨永利赵天仪施学忠郑州大学公共卫生学院卫生统计学教研室郑州450001 郑州大学基础医学院郑州450001 上海交通大学医学院上海200025

目的:比较不同的缺失值处理方法处理随机缺失数据的效果。方法:以HIV/AIDS血液样本血红蛋白、白细胞和血尿素氮检测数据为基础,利用SAS9.1,分别模拟完整数据集和不同缺失率的数据集,从精确度、准确度和分布三方面比较不同方法对缺失数... 详细信息

目的:比较不同的缺失值处理方法处理随机缺失数据的效果。方法:以HIV/AIDS血液样本血红蛋白、白细胞和血尿素氮检测数据为基础,利用SAS9.1,分别模拟完整数据集和不同缺失率的数据集,从精确度、准确度和分布三方面比较不同方法对缺失数据集的处理效果。结果:任意缺失比例下血红蛋白和白细胞数据经不同的方法处理后与完整数据集比较差异无统计学意义。不同缺失比例下,多重填补(MI)法的精确度最高。缺失率10%～20%时,MI法填充后的准确度最高。缺失率30%时,成组删除法处理后的准确度最高。缺失40%以上时,准确度填充效果不稳定。不同缺失比例下,回归法、成组删除法和MI填充2次后的数据的分布特征与完整数据集一致。结论:数据缺失10%～20%时,MI法填充效果最好;缺失30%时,成组删除法处理效果最好;缺失40%以上时,所有方法填充效果均不佳。

关键词：连续变量缺失值随机缺失

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结核分枝杆菌最低抑菌浓度测定方法及临界值设置研究进展

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第5期32卷 661-666页

作者：张朝宝王洪海张舒林上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025 武汉工业学院生物与制药工程学院武汉430023 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室上海200433

结核病迄今仍是全球单一病原体引起死亡人数最多的传染性疾病。耐药及耐多药的产生是结核病流行和广泛传播的重要原因之一。建立规范、有效的结核分枝杆菌药敏最低抑菌浓度(MIC)的检测方法及设置有效的临界值对于结核病个体化治疗、快... 详细信息

结核病迄今仍是全球单一病原体引起死亡人数最多的传染性疾病。耐药及耐多药的产生是结核病流行和广泛传播的重要原因之一。建立规范、有效的结核分枝杆菌药敏最低抑菌浓度(MIC)的检测方法及设置有效的临界值对于结核病个体化治疗、快速耐药检测方法的研究以及新型抗结核药物筛选等领域具有重要意义,也是控制耐药结核病产生和传播的关键。该文就结核分枝杆菌MIC测定方法及临界值设置等方面的研究进展进行综述。

关键词：结核分枝杆菌最低抑菌浓度临界值

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临床试验生物统计学

临床试验生物统计学

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2012药物临床试验质量管理及安全性评价研讨会

作者：苏炳华上海交通大学医学院生物统计教研室

＜正＞～～

关键词：临床试验非劣效界值随机化阳性对照药统计学意义非劣效性检验

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结核分枝杆菌RD5区编码蛋白在结核病血清学诊断中的应用

结核分枝杆菌RD5区编码蛋白在结核病血清学诊断中的应用

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中国微生物学会2012感染与免疫学术研讨会

作者：赵俊伟张苗苗玄松花周业成郭晓奎张舒林上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

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有序多分类重复测量资料的广义线性混合效应模型分析

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中国医院统计 2012年第1期19卷 14-17页

作者：张莉娜上海交通大学医学院生物统计学教研室上海市200025

目的探讨广义线性混合效应模型在有序多分类重复测量资料分析中的应用及SAS9.1的GLIMMIX和NLMIXED过程实现.方法为了评价某新药治疗糖尿病神经病变的临床疗效,采用以安慰剂为对照的随机双盲临床试验.在各个随访时间记录各受试者的神... 详细信息

目的探讨广义线性混合效应模型在有序多分类重复测量资料分析中的应用及SAS9.1的GLIMMIX和NLMIXED过程实现.方法为了评价某新药治疗糖尿病神经病变的临床疗效,采用以安慰剂为对照的随机双盲临床试验.在各个随访时间记录各受试者的神经病变主觉症状总分,并根据减分率评定疗效.建立广义线性混合效应模型,并分别用线性化法和数值法积分近似法进行参数估计,利用SAS中的GLIMMIX和NLMIXED过程得以实现.结果 2种参数估计方法结果很接近.疗效的组间差别有统计学意义（P〈0.000 1）,试验组疗效优于安慰剂组;各个疗程间的疗效差别有统计学意义（P〈0.000 1）,且疗程越大疗效越好; 治疗前神经病变主觉症状总分对疗效有影响（P=0.061 3,接近显著性水平）,其值越高,越容易治愈,提示病情严重的患者相比病情轻微的患者治愈效果更好.另外用数值法积分近似法还给出了随机截距和随机斜率的统计显著性检验.结论采用广义线性混合效应模型对有序多分类重复测量临床资料进行统计分析,可以更客观的进行药物疗效评价.

关键词：广义线性混合效应模型重复测量有序多分类 GLIMMIX NLMIXED

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大肠埃希菌TA系统mazEF的研究进展

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中国微生态学杂志 2012年第10期24卷 948-950,954页

作者：叶露韦艳霞上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025 徐州医学院基础学院病原生物学与免疫学教研室江苏徐州221004

大部分细菌的遗传物质中含有毒素-抗毒素系统(TA)的遗传基因。mazEF是大肠埃希菌染色体上的一对毒素抗毒素基因,由毒素基因mazF和抗毒素基因mazE组成。其在细菌的生长调控和细胞程序性死亡中发挥了重要的作用。环境压力激活mazEF后,Maz... 详细信息

大部分细菌的遗传物质中含有毒素-抗毒素系统(TA)的遗传基因。mazEF是大肠埃希菌染色体上的一对毒素抗毒素基因,由毒素基因mazF和抗毒素基因mazE组成。其在细菌的生长调控和细胞程序性死亡中发挥了重要的作用。环境压力激活mazEF后,MazF可以通过对mRNA的剪切作用造成翻译停止。mazEF的存在可以增加细菌对环境压力的耐受性、保持细菌遗传物质的稳定、参与抗生素引起的细胞死亡、也在细菌的耐药性中发挥重要作用。

关键词：大肠埃希菌毒素-抗毒素系统系统 mazEF

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急性感染状态下2型糖尿病大鼠的反应性研究

急性感染状态下2型糖尿病大鼠的反应性研究

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中华医学会第十一次全国内分泌学学术会议

作者：韩亭亭苏布德格日乐黄融胡耀敏易静刘伟上海交通大学医学院附属仁济医院上海交通大学基础医学院细胞生物学教研室

目的:比较LPS注射后GK大鼠(2型糖尿病模型)和Wistar大鼠(正常模型)机体损伤的加重程度,以及LPS注射后两种大鼠血糖波动和炎性指标的变化情况。方法:GK大鼠随机分为LPS未注射组(GK基线组,简称GK组)、LPS注射组(GK+LPS组),Wistar大鼠随机... 详细信息

目的:比较LPS注射后GK大鼠(2型糖尿病模型)和Wistar大鼠(正常模型)机体损伤的加重程度,以及LPS注射后两种大鼠血糖波动和炎性指标的变化情况。方法:GK大鼠随机分为LPS未注射组(GK基线组,简称GK组)、LPS注射组(GK+LPS组),Wistar大鼠随机分为LPS未注射组(Wistar基线组,简称Wistar组)、LPS注射组(Wistar+LPS组)。对于GK+LPS组和Wistar+LPS

关键词：感染状态糖尿病大鼠 Wistar

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