检索结果-内蒙古大学图书馆

上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1440-1443页

作者：庄绪冉朱泳璋上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化,这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异。为了更全面地在基因组水平上揭示细菌... 详细信息

细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化,这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异。为了更全面地在基因组水平上揭示细菌种内个体间的遗传多样性,进一步探寻个体间的系统发生关系和个体间表型差异的遗传基础,科学家提出了细菌泛基因组学的概念,该文对细菌菌种遗传多样性的形成机制、泛基因组的研究策略及其在细菌研究中的应用和进展等作一综述。

关键词：泛基因组多菌株测序遗传多样性核心基因组附属基因组

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恶性血液病化疗后粒细胞缺乏期医院感染危险因素的分析

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上海交通大学学报（医学版） 2014年第1期34卷 60-64页

作者：毛原飞游建华张莉娜李啸扬刘钊沈杨李军民上海交通大学医学院附属瑞金医院血液科上海200025 上海交通大学基础医学院生物统计学教研室上海200025

目的探讨恶性血液病化疗后粒细胞缺乏患者的机体状态和医院感染的相关性,并分析引起医院感染的危险因素。方法回顾性分析2012年7月—2013年6月上海瑞金医院血液科因恶性血液病入院化疗并在住院期间发生粒细胞缺乏患者的各项临床和实验... 详细信息

目的探讨恶性血液病化疗后粒细胞缺乏患者的机体状态和医院感染的相关性,并分析引起医院感染的危险因素。方法回顾性分析2012年7月—2013年6月上海瑞金医院血液科因恶性血液病入院化疗并在住院期间发生粒细胞缺乏患者的各项临床和实验室检查指标,根据住院治疗期间是否发生医院感染分为无医院感染组(n=68)、临床诊断医院感染组(n=84)和病原学诊断医院感染组(n=62)。三组资料进行单因素分析后,用无序多分类Logistic逐步回归模型进行多因素分析。结果医院感染的发病率为68.22%。多因素分析结果筛选出急性髓系白血病(AML)、住院季节、白细胞计数<0.8×109/L和感染前未使用抗生素预防是发生医院感染的独立危险因素。结论恶性血液病患者化疗后粒细胞缺乏期间医院感染发病率高,应积极对症支持治疗。尤其对于原发病为AML、夏秋季住院化疗和化疗后白细胞计数最低值<0.8×109/L的患者予以抗生素预防可能减少医院感染的发生。

关键词：恶性血液病化疗粒细胞缺乏医院感染危险因素

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Tet:基于DNA去甲基化的全新抗肿瘤药物靶标

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上海交通大学学报（医学版） 2017年第4期37卷 551-555页

作者：龚蔚孟周文理田娜林冠乔付天然张良上海交通大学基础医学院药理学教研室上海200025

Tet蛋白属于α-酮戊二酸(α-KG)和亚铁离子(Fe2+)依赖的双加氧酶家族。Tet特异识别基因组DNA上5-甲基胞嘧啶(5mC)的甲基并进行催化氧化,是哺乳动物基因组DNA主动去甲基化途径中唯一被发现的关键因子。通过调控基因组5mC的动态平衡分布,... 详细信息

Tet蛋白属于α-酮戊二酸(α-KG)和亚铁离子(Fe2+)依赖的双加氧酶家族。Tet特异识别基因组DNA上5-甲基胞嘧啶(5mC)的甲基并进行催化氧化,是哺乳动物基因组DNA主动去甲基化途径中唯一被发现的关键因子。通过调控基因组5mC的动态平衡分布,Tet在胚胎发育早期基因调控和胚胎干细胞定向分化中至关重要,其表达和功能异常与包括骨髓增生异常综合征、慢性骨髓单核细胞性白血病和急性白血病在内的多种血液恶性肿瘤以及实体肿瘤有密切关系。因此,Tet及其介导的DNA去甲基化是全新的抗肿瘤靶向药物靶标。对于Tet生物功能和催化机制的研究将有助于深入了解与DNA去甲基化途径相关肿瘤的发生和发展机制,同时也为研发全新的抗肿瘤靶向药物提供参考。

关键词： DNA去甲基化 Tet蛋白 5-羟甲基胞嘧啶胚胎干细胞抗肿瘤

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HRX-EEN融合基因转基因小鼠行为能力的异常

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上海交通大学学报（医学版） 2009年第1期29卷 31-33页

作者：蔡军傅爱芬郑林傅国辉上海交通大学基础医学院病理学教研室上海200025

目的观察HRX-EEN融合基因转基因小鼠行为能力的异常。方法应用Morris水迷宫实验测试并比较HRX-EEN融合基因转基因小鼠(转基因组,n=12)和C57/BL小鼠(对照组,n=12)的学习和记忆能力,包括前4天的隐蔽平台实验和第5天的空间探索实验。结果... 详细信息

目的观察HRX-EEN融合基因转基因小鼠行为能力的异常。方法应用Morris水迷宫实验测试并比较HRX-EEN融合基因转基因小鼠(转基因组,n=12)和C57/BL小鼠(对照组,n=12)的学习和记忆能力,包括前4天的隐蔽平台实验和第5天的空间探索实验。结果隐蔽平台实验中,转基因组小鼠的逃避潜伏期长于对照组,除第1天外,其余各天差异均具有统计学意义(P<0.05);空间探索实验中,转基因组小鼠目标象限内搜索时间、经过目标平台位置次数和在中心区域时间显著少于对照组(P<0.01)。结论HRX-EEN融合基因转基因小鼠的学习和记忆能力显著下降。

关键词： HRX-EEN融合基因转基因小鼠 Morris水迷宫

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羟基红花黄色素A的血管作用及其机制研究

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上海交通大学学报（医学版） 2009年第4期29卷 431-434页

作者：张琳沈国舜张镜年聂培鹤支建明上海交通大学基础医学院生理学教研室上海200025

目的探讨羟基红花黄色素A（HSYA）对离体大鼠胸主动脉环收缩功能的影响及其机制。方法采用生物信号采集系统记录灌流大鼠胸主动脉环张力变化，观察HSYA（1×10^-6～1×10^-4mol／L）对苯肾上腺素（PE）（1×10^-6～1×1... 详细信息

目的探讨羟基红花黄色素A（HSYA）对离体大鼠胸主动脉环收缩功能的影响及其机制。方法采用生物信号采集系统记录灌流大鼠胸主动脉环张力变化，观察HSYA（1×10^-6～1×10^-4mol／L）对苯肾上腺素（PE）（1×10^-6～1×10^-4mol／L）、KCl（6×10^-2mol／L）和CaCl2（1×10^-5～3×10^-3mol／L）收缩血管功能的影响，并观察钌红（RR）或肝素（HP）预处理对HSYA作用的影响。结果HSYA抑制KCl、PE对完整内皮和去内皮血管环的收缩作用，且呈浓度依赖性。HSYA可使CaCl2量-效曲线下移，呈浓度依赖性。HSYA＋HP抑制血管收缩的作用比单用HSYA明显（P〈0．05），与HP相比差异无统计学意义（P〉0．05）；HSYA＋RR抑制血管收缩的作用与单用RR或HSYA比较，差异均有统计学意义（P〈0．05）。结论HSYA的血管作用可能是通过抑制Ca^2＋内流和减小Ca^2＋浓度实现的。

关键词：羟基红花黄色素A 血管收缩 ryanodine受体 1,4,5-三磷酸肌醇受体

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羟基红花黄色素对离体心脏功能的影响

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上海交通大学学报（医学版） 2010年第5期30卷 540-543页

作者：聂培鹤张文慧金珠张琳沈国舜张镜年支建明上海交通大学基础医学院生理学教研室上海200025

目的研究羟基红花黄色素A(HSYA)对离体大鼠左心室收缩功能的影响。方法 42只大鼠根据实验需要随机分为正常对照组、HSYA组(1～100μmol/L)、HSYA(30μmol/L)对照组和HSYA(30μmol/L)+K+通道阻断剂组(分别为KATP阻断剂Gli、BKCa阻断剂Tea... 详细信息

目的研究羟基红花黄色素A(HSYA)对离体大鼠左心室收缩功能的影响。方法 42只大鼠根据实验需要随机分为正常对照组、HSYA组(1～100μmol/L)、HSYA(30μmol/L)对照组和HSYA(30μmol/L)+K+通道阻断剂组(分别为KATP阻断剂Gli、BKCa阻断剂Tea、KV阻断剂4-AP和KAch阻断剂Art),每组6只。经Langendorff离体心脏恒压灌流,依次梯度给予含有HSYA的灌流液。通过左心室内的乳胶水囊经换能器连于PowerLab生物信号采集分析系统,观察给药前后以及不同浓度HSYA对左心室收缩功能的影响,并观察不同的K+通道阻断剂对HSYA作用的影响。结果 HSYA能浓度依赖性抑制左心室收缩压、舒张末压、收缩最大速率和心率(P<0.05或P<0.01);对舒张最大速率影响不大(P>0.05)。Gli及Tea能剂量依赖性阻断HSYA的效应(P<0.05或P<0.01),4-AP及Art对HSYA的效应没有影响(P>0.05)。结论 HSYA可呈剂量依赖性抑制心脏的收缩功能和心率,其作用机制与开放KATP和BKCa通道有关。

关键词：羟基红花黄色素A 离体心脏心功能 K+通道

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转录组测序数据中cSNP和表达差异基因的分析方法

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上海交通大学学报（医学版） 2014年第2期34卷 129-133页

作者：李少波傅国辉上海交通大学基础医学院病理学教研室上海200025

目的确立本次转录组测序数据中编码区单核苷酸多态性(cSNP)和表达差异基因的分析方法,筛选出可能导致蛋白质功能改变的单核苷酸多态性(SNP)位点和不同表型细胞中存在的表达差异基因。方法对正常培养的胃癌细胞系MKN28和SGC7901进行RNA测... 详细信息

目的确立本次转录组测序数据中编码区单核苷酸多态性(cSNP)和表达差异基因的分析方法,筛选出可能导致蛋白质功能改变的单核苷酸多态性(SNP)位点和不同表型细胞中存在的表达差异基因。方法对正常培养的胃癌细胞系MKN28和SGC7901进行RNA测序(RNA-Seq),将测序数据与参考基因组进行比对,对测序的reads数、测得的基因数、MKN28和SGC7901中各自表达上调的基因数、SNP数及可变剪接形式进行统计学分析。运用在线的软件和数据库并结合计算机编程,对2株胃癌细胞系转录组测序数据中的SNP进行筛选和功能预测;对2株细胞中表达差异基因GO聚类结果进行分析比较。结果筛选并预测了8种类别709种基因的SNP,分析出了6个经预测能够导致蛋白功能改变的SNP位点。对表达差异基因的分析得到了丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶在2株细胞中的表达情况;经Western blotting和PCR验证了部分分析结果。结论确立了1种转录组测序后cSNP数据的分析方法,该方法能够对大量SNP数据进行高效筛选和分析;通过聚类分析后再比较得到了一组在MKN28中高表达而在SGC7901中低表达的蛋白激酶基因;这些结果为后续实验提供了依据。

关键词：编码区单核苷酸多态性转录组 RNA测序表达差异基因胃癌

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骨髓活检在血液肿瘤疾病中的诊断价值

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肿瘤 2008年第9期28卷 743-745,750页

作者：张梅杜心垿上海交通大学基础医学院病理学教研室上海200025

在诊断肿瘤性疾病时,病理学诊断是必不可少的“金标准”,但是骨髓活检并不等同于血液病理学检查,需结合骨髓涂片以及其他生化和免疫学等方法。尤其是近20年来,随着细胞与分子生物学技术被应用于诊断之中,对于骨髓活检在血液学肿瘤诊断... 详细信息

在诊断肿瘤性疾病时,病理学诊断是必不可少的“金标准”,但是骨髓活检并不等同于血液病理学检查,需结合骨髓涂片以及其他生化和免疫学等方法。尤其是近20年来,随着细胞与分子生物学技术被应用于诊断之中,对于骨髓活检在血液学肿瘤诊断中的价值更需综合考虑。尽管如此,骨髓活检在诊断血液系统疾病、动态观察疾病进展变化以及判断预后等方面,还是具有其他实验室检查所无法取代的价值。[第一段]

关键词：肿瘤血液学骨髓诊断

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超高效合相色谱法测定l-OTS的含量及光学纯度

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上海交通大学学报（医学版） 2016年第3期36卷 459-462页

作者：谢一凡杨若林刘慧中陆阳上海交通大学基础医学院化学教研室上海200025 上海交通大学基础医学院实验教学中心上海200025

目的建立l-OTS的含量测定及光学纯度检查的超高效合相色谱法(UPC^2)。方法使用ACQUITY UPC^(2TM)Trefoil^(TM)AMY1手性色谱柱(3.0 mm×50 mm,2.5μm),柱温30℃,以超临界CO_2和0.2%二乙胺的异丙醇(95∶5,体积比)为流动相,流速为1.0 m... 详细信息

目的建立l-OTS的含量测定及光学纯度检查的超高效合相色谱法(UPC^2)。方法使用ACQUITY UPC^(2TM)Trefoil^(TM)AMY1手性色谱柱(3.0 mm×50 mm,2.5μm),柱温30℃,以超临界CO_2和0.2%二乙胺的异丙醇(95∶5,体积比)为流动相,流速为1.0 m L/min,检测波长227 nm(补偿参比为310~360 nm),采用对照品法进行定量测定。结果 l-OTS与其对映异构体(d-OTS)有效分离,分离度为2.30,在40~1 000 mg/L范围内峰面积对应质量浓度呈良好的线性关系(r=0.999 9,n=7),平均加样回收率为99.8%(n=9),样品在24 h内稳定(RSD=0.81%),最低检测限5 ng(S/N=4)。结论此方法简便、迅速,经方法学验证可用于l-OTS的含量测定及光学纯度分析。

关键词：超高效合相色谱法莨菪烷衍生物手性分析光学纯度

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原因不明复发性流产患者母-胎界面T淋巴细胞受体β链可变区基因的表达水平和频率

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中华妇产科杂志 2008年第10期43卷 751-756页

作者：汪希鹏林其德马政文洪艳陆佩华上海交通大学医学院附属仁济医院妇产科 200001 上海交通大学医学院基础医学院神经生物教研室 200001

目的通过分析母一胎界面T淋巴细胞受体（TCR）β链可变区（BV）基因的表达水平和频率，探索T淋巴细胞参与原因不明复发性流产（RSA）发生的作用机制。方法采集18例原因不明RSA患者（研究组）和41例正常早孕人工流产妇女（对照组）的蜕... 详细信息

目的通过分析母一胎界面T淋巴细胞受体（TCR）β链可变区（BV）基因的表达水平和频率，探索T淋巴细胞参与原因不明复发性流产（RSA）发生的作用机制。方法采集18例原因不明RSA患者（研究组）和41例正常早孕人工流产妇女（对照组）的蜕膜组织，基因组扫描方法检测两组患者蜕膜内TCRBV基因的表达，分析TCRBV基因表达水平和频率的分布与原因不明RSA的关系。结果（1）研究组患者蜕膜组织中TCRBV基因的表达水平，BV19为0．029±0．031，高于对照组（0．013±0．010），而BV5．2的表达水平（0．040±0．035）低于对照组（0．067±0．052），两组间分别比较，差异均有统计学意义（P〈0．05）。其余各家族的表达水平两组问比较，差异均无统计学意义（P〉0．05）。（2）研究组TCRBV家族中表达频率最高的前4位为BV2、BV6、BV7和BV3，其表达频率分别为66．7％、66．7％、66．7％和61．1％，均超过了50％。研究组中，BV15、BV19和BV20的表达频率分别为33．3％、38．9％和33．3％，均高于对照组（分别为7．3％、14．6％和7．3％）；BV4和BV7的表达频率分别为33．3％和66．7％，均低于对照组（分别为65．9％和92．7％），两组间分别比较，差异均有统计学意义（P〈0．05）。其余各家族的表达频率两组间比较，差异均无统计学意义（P〉0．05）。结论原因不明RSA患者蜕膜组织内的TCRBV家族表达存在差异，表达频率变化显著的TCRBV家族可能导致免疫有关的流产发生的易感性。

关键词：流产自然基因 T细胞受体β 互补决定区疾病易感性

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