检索结果-内蒙古大学图书馆

上海交通大学学报（医学版） 2019年第8期39卷 827-833页

作者：李建辉苏杨姚玉峰倪进婧上海交通大学基础医学院病原生物学教研室

目的·探究鼠伤寒沙门菌转录调控因子PhoP的甲基化修饰与其活性的相关性,筛选PhoP的甲基转移酶。方法·Westernblotting检测不同培养条件下鼠伤寒沙门菌中PhoP的甲基化水平变化。通过生物信息学预测候选的甲基转移酶,体内过表... 详细信息

目的·探究鼠伤寒沙门菌转录调控因子PhoP的甲基化修饰与其活性的相关性,筛选PhoP的甲基转移酶。方法·Westernblotting检测不同培养条件下鼠伤寒沙门菌中PhoP的甲基化水平变化。通过生物信息学预测候选的甲基转移酶,体内过表达预测的甲基转移酶后检测phoP及其下游基因的转录水平变化,找到可能的PhoP甲基转移酶,并体外验证该甲基转移酶能否甲基化PhoP。使用real-time PCR检测高浓度Mg^2+、弱酸性等培养条件下,phoP与其甲基转移酶在转录水平的相对表达变化。结果·随着培养基中Mg^2+浓度升高,PhoP甲基化水平上升;而经过弱酸刺激后,PhoP甲基化水平下降。生物信息学预测并筛选到9个甲基转移酶,其中体内过表达STM14_0023后,phoP及其下游基因的转录水平下降且PhoP蛋白水平也下降,但敲除STM14_0023对上述分子的表达无影响。体外甲基化酶促反应显示STM14_0023能够甲基化PhoP,体内过表达STM14_0023后也可提高PhoP的甲基化水平,且在抑制phoP表达的高浓度Mg2+培养条件下STM14_0023的转录水平升高。结论·STM14_0023是PhoP的甲基转移酶,甲基化修饰抑制PhoP活性。

关键词：鼠伤寒沙门菌 PhoP 甲基化修饰 STM14_0023 毒力

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钩端螺旋体基因组学及蛋白组学研究进展

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第9期32卷 1135-1140页

作者：郭晓奎秦金红何平朱泳璋上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

钩端螺旋体(简称钩体)可以引起严重的人兽共患病,是威胁人类健康的传染病之一。课题组率先开展了对中国主要致病流行株56601的全基因组测序工作,测序结果显示钩体有两条染色体,共编码4 727个基因,后经重新注释为3 718个基因。基于56601... 详细信息

钩端螺旋体(简称钩体)可以引起严重的人兽共患病,是威胁人类健康的传染病之一。课题组率先开展了对中国主要致病流行株56601的全基因组测序工作,测序结果显示钩体有两条染色体,共编码4 727个基因,后经重新注释为3 718个基因。基于56601株的参考序列,对其减毒株IPAV的测序结果表明,除了有101个基因出现突变之外,IPAV株基因组的大小及基因结构组成与56601株相同。基于基因组序列,课题组设计并合成了钩体的基因组芯片,开展了比较基因组学及转录组学的研究。比较基因组学研究结果显示,钩体的核心基因有2 917个,变异基因有275个,并首次发现钩体基因组中存在2个基因岛。模拟体内外钩体生长的温度条件进行转录组学分析,共发现106个基因差异表达,分属9类不同的功能;对有毒株56601及减毒株IPAV进行转录组学分析,发现了差异上调表达的22 kb的类噬菌体片段。对体外培养的56601株进行蛋白组学分析,鉴定出2 540个蛋白,进一步对这些蛋白进行磷酸化、乙酰化及甲基化的修饰进行分析,发现了32个磷酸化位点、46个乙酰化位点和155个甲基化位点。通过分析发现,钩体蛋白的很多修饰方式类似于真核生物,提示钩体在进化上比较特殊。比较毒力株56601与减毒株IPAV的蛋白组异同,一致表达的蛋白1 627个,差异表达的蛋白402个。基于以上基因组学及蛋白组学研究,课题组进一步开展了对钩体相关功能基因的研究,这些研究均为揭示钩体的致病机制、开发钩体的疫苗及诊断试剂、最终防控钩体病奠定了基础。

关键词：钩端螺旋体基因组蛋白组

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鼠伤寒沙门菌中假定转录调控因子的筛选

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上海交通大学学报（医学版） 2018年第10期38卷 1174-1180页

作者：刘舒婷姚玉峰倪进婧上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的·基因组信息学分析结合分子生物学实验对鼠伤寒沙门菌中假定转录调控因子进行筛选,以期发现新的转录调控因子和调控机制。方法·通过沙门菌基因组信息分析筛选得到30个假定转录调控因子,利用λ-Red同源重组系统敲除各目的... 详细信息

目的·基因组信息学分析结合分子生物学实验对鼠伤寒沙门菌中假定转录调控因子进行筛选,以期发现新的转录调控因子和调控机制。方法·通过沙门菌基因组信息分析筛选得到30个假定转录调控因子,利用λ-Red同源重组系统敲除各目的基因。酸耐受实验检测各敲除株在对数期酸耐受应答中的差异;细胞感染模型检测各敲除株上皮细胞入侵能力和巨噬细胞内复制能力;利用realtimePCR检测突变株中pho P及其下游基因的转录水平。结果·成功构建30个敲除株。ΔSTM14_0739、ΔSTM14_2717和ΔSTM14_1646对数期酸耐受能力较WT增强,ΔSTM14_1878、ΔSTM14_4338和ΔSTM14_1965则较WT减弱。ΔSTM14_0739和ΔSTM14_2717对He La细胞的入侵率降低,ΔSTM14_1878和ΔSTM14_2717在RAW264.7细胞内的24 h复制率提高。Realtime-PCR结果显示STM14_2717敲除并不影响pho P转录。结论·研究发现了新的转录调控因子,为深入研究沙门菌致病机制提供新的方向。

关键词：鼠伤寒沙门菌转录调控因子酸耐受细胞入侵及胞内复制

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钩端螺旋体在不同宿主巨噬细胞内存活能力的比较

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上海交通大学学报（医学版） 2011年第7期31卷 869-874页

作者：罗云蔓黄莉莉刘伯玉张彦胡宝瑜朱平郭晓奎何平姜叙诚上海交通大学基础医学院病理学教研室上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海交通大学基础医学院细胞生物学教研室上海 200025

目的通过比较钩端螺旋体(钩体)在人和小鼠单核-巨噬细胞内的存活情况,探讨固有免疫在钩端螺旋体病致病机制中的作用。方法将钩体秋季血清群强毒株56606v株及其经体外多次传代的弱毒株56606 a株在体外分别感染经佛波酯(PMA)诱导分化的人... 详细信息

目的通过比较钩端螺旋体(钩体)在人和小鼠单核-巨噬细胞内的存活情况,探讨固有免疫在钩端螺旋体病致病机制中的作用。方法将钩体秋季血清群强毒株56606v株及其经体外多次传代的弱毒株56606 a株在体外分别感染经佛波酯(PMA)诱导分化的人单核细胞系THP-1和小鼠单核-巨噬细胞系RAW 264.7。感染后2、24、72 h,采用免疫荧光染色激光共聚焦显微镜观察并计算两种细胞的含菌细胞百分数;感染后2、12、24、48和72 h,采用Real-Tim e PCR技术定量检测可间接反映细胞内钩体存活数量的钩体16S rRNA的表达。结果随着感染时间的延长,两种细胞的含菌细胞百分数逐渐降低;Real-Tim e PCR检测结果显示:随着感染时间的延长,两种细胞内钩体16S rRNA的表达逐渐下调,细胞内钩体的存活数量逐渐减少。结论钩体在人和小鼠单核-巨噬细胞内均不能存活和繁殖,提示致病性钩体通过抗巨噬细胞的杀灭降解而在胞内的存活和繁殖可能不是钩体感染人类宿主的主要致病途径,其发病机制有待进一步阐明。

关键词：钩端螺旋体巨噬细胞活性实时荧光定量PCR

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结核分枝杆菌微进化研究与临床应用

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1404-1405,1414页

作者：姚玉峰上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

近十年来,在国内众多科研机构的努力下,对结核病的研究取得了较大的进展,并获得了国际认可。但有关结核病的诊断、治疗、预防以及日益严重的耐药问题仍然是我国结核病防控的瓶颈。因此必须加强结核病基础研究的临床转化,并注重以临床应... 详细信息

近十年来,在国内众多科研机构的努力下,对结核病的研究取得了较大的进展,并获得了国际认可。但有关结核病的诊断、治疗、预防以及日益严重的耐药问题仍然是我国结核病防控的瓶颈。因此必须加强结核病基础研究的临床转化,并注重以临床应用为靶向的结核病研究。结核分枝杆菌的基因组微进化研究已取得了较大进展,如利用比较基因组学找到结核分枝杆菌有毒株和无毒株的差异,发现MazG突变可能与结核分枝杆菌的毒力丧失有关。如何利用这些资源为结核病的诊断、预防和治疗提供新型的有效手段是结核病研究人员的当务之急。

关键词：结核分枝杆菌基因组微进化预防诊断

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上海地区大米样品黄曲霉素B_1含量检测

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上海交通大学学报（医学版） 2011年第10期31卷 1492-1495页

作者：叶露韦艳霞刘畅上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的对上海市区内出售的大米样本进行黄曲霉素B1含量的测定和分析。方法以在上海市区内的散装粮食店、中型超市、大型超市和淘宝网店采购的苏北产大米和东北产大米作为受试样本,采用酶联免疫吸附法测定样本大米中黄曲霉素B1的含量。采... 详细信息

目的对上海市区内出售的大米样本进行黄曲霉素B1含量的测定和分析。方法以在上海市区内的散装粮食店、中型超市、大型超市和淘宝网店采购的苏北产大米和东北产大米作为受试样本,采用酶联免疫吸附法测定样本大米中黄曲霉素B1的含量。采用独立样本T检验分析不同产地样本大米中黄曲霉素B1含量的差异;单因素方差分析比较不同购物来源样本大米中黄曲霉素B1的含量差异。结果 60个受试样本中黄曲霉素B1含量的总体均值为1.926 ppb,其中超过国家标准样本数为2个,分别为购自散装店和中型超市的东北产大米;苏北和东北样本大米中黄曲霉素B1的含量分别为(1.221±1.055)ppb和(2.631±2.903)ppb,两者差异具有统计学意义(P<0.05)。散装店、网店、中型超市和大型超市样本大米中黄曲霉素B1的含量分别为(2.900±2.457)ppb、(1.570±1.416)ppb、(1.743±2.683)ppb和(0.569±0.608)ppb,四者比较差异有统计学意义(P<0.05),进一步的多重检验表明散装店与大型超市来源样本大米中黄曲霉素B1的含量存在统计学差异(P<0.05)。结论上海市区出售的大米样本中黄曲霉素B1含量总体较低。受试样本中的黄曲霉素B1的含量,东北产大米高于苏北产大米,散装粮食店来源大米高于大型超市来源大米。在散装店和中型超市的受试样本中发现黄曲霉素B1含量超标样本。

关键词：黄曲霉素B1 大米酶联免疫吸附法

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细菌泛基因组学的研究

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1440-1443页

作者：庄绪冉朱泳璋上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化,这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异。为了更全面地在基因组水平上揭示细菌... 详细信息

细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化,这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异。为了更全面地在基因组水平上揭示细菌种内个体间的遗传多样性,进一步探寻个体间的系统发生关系和个体间表型差异的遗传基础,科学家提出了细菌泛基因组学的概念,该文对细菌菌种遗传多样性的形成机制、泛基因组的研究策略及其在细菌研究中的应用和进展等作一综述。

关键词：泛基因组多菌株测序遗传多样性核心基因组附属基因组

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后抗生素时代我们如何征服细菌?

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上海交通大学学报（医学版） 2012年第11期32卷 1401-1403页

作者：郭晓奎上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

耐药性"超级细菌"的出现,将使我们重新步入无抗生素可用的时代,即"后抗生素时代"。面对日益严重的细菌耐药性,寻找新的抗菌药物及治疗方案已成为目前急需解决的难题。文章阐述新型抗生素、抗菌肽、噬菌体和中药制... 详细信息

耐药性"超级细菌"的出现,将使我们重新步入无抗生素可用的时代,即"后抗生素时代"。面对日益严重的细菌耐药性,寻找新的抗菌药物及治疗方案已成为目前急需解决的难题。文章阐述新型抗生素、抗菌肽、噬菌体和中药制剂的研究开发及应用前景,为后抗生素时代针对耐药细菌,特别是超级细菌的抗感染药物的研究提供思路。

关键词：耐药细菌控制

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结核分枝杆菌ABC转运蛋白与物质的跨膜转运

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微生物学报 2014年第6期54卷 608-615页

作者：徐志弘周爱萍姚玉峰上海交通大学医学院基础医学院病原生物学教研室上海200025

结核分枝杆菌作为一种胞内寄生菌,主要存在于巨噬细胞吞噬体内,并且通过与宿主细胞竞争摄取营养物质、主动排出有毒物质来维持生存。因此,参与上述过程的ABC转运蛋白在结核分枝杆菌的致病中发挥着举足轻重的作用。已有报道结核分枝杆菌... 详细信息

结核分枝杆菌作为一种胞内寄生菌,主要存在于巨噬细胞吞噬体内,并且通过与宿主细胞竞争摄取营养物质、主动排出有毒物质来维持生存。因此,参与上述过程的ABC转运蛋白在结核分枝杆菌的致病中发挥着举足轻重的作用。已有报道结核分枝杆菌基因组编码了38个ABC转运蛋白。这类蛋白质有着广泛的底物结合谱,参与了无机离子、糖类、氨基酸、寡肽、药物等多种物质的跨膜转运。本文将对结核分枝杆菌编码的ABC转运蛋白超家族中的不同成员及其底物特异性、转运机制以及与毒力的关系的研究进展进行综述。

关键词：结核分枝杆菌 ABC转运蛋白底物特异性转运机制致病力

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细菌分裂Z环定位的调控方式

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微生物学报 2013年第4期53卷 321-327页

作者：桑昱陶晶姚玉峰上海交通大学医学院基础医学院病原生物学教研室上海200025

细菌细胞的分裂调控机制一直是人们研究的热点。在细胞中部形成一个隔膜,这一看似简单的过程是一个多因子参与调控的过程。Z环(FtsZ ring)是分裂体的支架,Z环形成的位置不仅是隔膜形成的位置还决定着细胞分裂位点,Z环在不正确的位置形... 详细信息

细菌细胞的分裂调控机制一直是人们研究的热点。在细胞中部形成一个隔膜,这一看似简单的过程是一个多因子参与调控的过程。Z环(FtsZ ring)是分裂体的支架,Z环形成的位置不仅是隔膜形成的位置还决定着细胞分裂位点,Z环在不正确的位置形成会导致细胞不均等分裂。目前研究已经发现了细胞分裂的多种调控包括Min系统、类核闭塞、MipZ蛋白,通过不同机制可以有效避免Z环的组装,从而阻止了分裂体在不正确的位置形成。就目前研究的Z环形成的过程以及影响Z环定位的调控机制作一综述。

关键词：细菌细胞分裂 Min系统类核闭塞

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