检索结果-内蒙古大学图书馆

基于线粒体COⅢ基因分析厚壳贻贝(Mytilus coruscus)养殖群体遗传多样性

海洋与湖沼 2012年第2期43卷 249-253页

作者：周超郭宝英吴常文叶莹莹李继姬冯广朋浙江海洋学院海洋科学学院国家海洋设施养殖工程技术研究中心舟山316004 中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室上海200090

基于线粒体DNA的COⅢ基因序列对我国沿海重要经济贝类厚壳贻贝3个养殖群体(温州、宁德、福州)的遗传多样性和遗传结构进行了分析。由PCR扩增获得23个体的COⅢ基因787bp的部分序列,其多态性遗传参数统计显示,23个个体共检出21个单倍型,... 详细信息

基于线粒体DNA的COⅢ基因序列对我国沿海重要经济贝类厚壳贻贝3个养殖群体(温州、宁德、福州)的遗传多样性和遗传结构进行了分析。由PCR扩增获得23个体的COⅢ基因787bp的部分序列,其多态性遗传参数统计显示,23个个体共检出21个单倍型,总群体单倍型多样性指数(Hd)为0.978,核苷酸多样性指数(Pi)为0.01045,平均核苷酸差异数(K)为8.534,三个群体均显示出较丰富的遗传多样性。遗传分化系数(Fst)表明,福州群体与宁德群体和温州群体间有一定程度的遗传分化,而宁德群体和温州群体间无遗传分化。

关键词：厚壳贻贝 COⅢ 遗传多样性遗传结构

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厚壳贻贝(Mytilus coruscus)4个群体遗传多样性的ISSR分析

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海洋与湖沼 2012年第1期43卷 113-119页

作者：叶莹莹徐梅英郭宝英吴常文浙江海洋学院海洋科学学院国家海洋设施养殖工程技术研究中心舟山316004 浙江大海洋科技有限公司舟山316004 中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室上海200090

采用ISSR分子标记对中国沿海4个厚壳贻贝群体进行遗传多样性和遗传结构分析,筛选出13条引物对4个群体120个样品共扩增出192个清晰的扩增位点,其中多态位点188个,多态位点百分率为97.92%,在物种水平上遗传多样性较为丰富。群体遗传多样... 详细信息

采用ISSR分子标记对中国沿海4个厚壳贻贝群体进行遗传多样性和遗传结构分析,筛选出13条引物对4个群体120个样品共扩增出192个清晰的扩增位点,其中多态位点188个,多态位点百分率为97.92%,在物种水平上遗传多样性较为丰富。群体遗传多样性结果表明,PPL在81.77%—89.58%之间,H在0.2950—0.2818之间,I在0.4213—0.4447之间,其中福州群体多样性指数最低,温州群体最高。4个群体间GST为0.1519,Nm值范围介于3.0576—5.9714之间,AMOVA分析显示遗传变异主要来自群体内个体间。群体间遗传距离和聚类分析显示,温州群体和宁德群体首先聚为一支,再与舟山群体聚类,最后与福州群体聚在一起。表明地理位置较远的群体,遗传距离也较大,地理距离和遗传距离一致。

关键词：厚壳贻贝群体遗传遗传多样性 ISSR

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我国东南沿海厚壳贻贝(Mytilus coruscus)4个群体线粒体16S rRNA序列及遗传结构分析

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海洋与湖沼 2012年第2期43卷 376-381页

采用16S rRNA基因测序技术,对我国东南沿海4个地理群体的厚壳贻贝遗传结构及遗传变异进行研究。通过对4个厚壳贻贝群体共83个个体的线粒体16S rRNA基因进行测序,获得1个长度为305bp的同源序列,共检测到150个多态位点,多态位点比例达49.... 详细信息

采用16S rRNA基因测序技术,对我国东南沿海4个地理群体的厚壳贻贝遗传结构及遗传变异进行研究。通过对4个厚壳贻贝群体共83个个体的线粒体16S rRNA基因进行测序,获得1个长度为305bp的同源序列,共检测到150个多态位点,多态位点比例达49.18%。83个个体中共检测到28个单倍型,单倍型多样性指数(Hd)为0.810,核苷酸多样性指数(Pi)为0.09602,平均核苷酸差异数(K)达27.846。结果表明,我国东南沿海厚壳贻贝群体具有较高的遗传多样性水平。遗传结构检测结果表明,舟山群体、温州群体、宁德群体间的遗传距离小,遗传分化系数(Fst)为-0.0141—0.0059之间,群体内部无显著分化(P>0.05),而福州群体与其它群体间遗传距离较大,为0.215—0.217之间,遗传分化系数(Fst)也较大,为0.6217—0.6319之间,存在极显著的遗传分化(P<0.001)。

关键词：厚壳贻贝 16S rRNA 遗传多样性

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维生素D_3对三角帆蚌外套膜细胞内Ca^(2+)浓度的影响

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动物学杂志 2011年第3期46卷 98-103页

作者：郝莹莹施志仪李文娟靳雨丽上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海201306

采用胰酶消化法获得三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)外套膜细胞,用Fluo-3/AM荧光标记技术和激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)检测外套膜内外表皮细胞在静息状态下细胞的游离Ca2+浓度及不同浓度维生素D3(VD3... 详细信息

采用胰酶消化法获得三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)外套膜细胞,用Fluo-3/AM荧光标记技术和激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)检测外套膜内外表皮细胞在静息状态下细胞的游离Ca2+浓度及不同浓度维生素D3(VD3)孵育后的外套膜细胞的Ca2+的动态情况。结果表明,未添加VD3(1.25 mmol/L Ca2+)时,外套膜外表皮细胞的Ca2+荧光强度显著高于内表皮细胞内的Ca2+(P<0.05)。在添加不同浓度VD3后,内表皮细胞与外表皮细胞内Ca2+浓度变化趋势一致,表现为细胞内Ca2+沉积量的变化是随着VD3浓度的增大而增大,其中,对照组与添加50 IU/L组差异不显著(P>0.05);当添加浓度为100 IU/L时,与对照组和50 IU/L组差异显著(P<0.05);当添加组浓度达到500IU/L时,与前3组有显著差异(P<0.05);当添加的浓度增大到1 000 IU/L后与500 IU/L组差异不显著(P>0.05),但与其他组均存在显著差异(P<0.05)。本实验为外套膜细胞的钙代谢机制研究提供了实验依据。

关键词：三角帆蚌外套膜细胞Ca2+浓度维生素D3(VD3) 激光共聚焦扫描显微镜

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江苏阳澄湖螺类群落的空间分布格局

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长江流域资源与环境 2011年第6期20卷 711-716页

作者：孙月娟王武刘其根彭自然陈立婧胡忠军薛俊增曲宪成上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海201306

2008年1月～2009年10月对江苏阳澄湖螺类群落结构进行了季节调查研究。共采集到螺类4科5属6种,优势种为铜锈环棱螺,次优种为长角涵螺。阳澄湖螺类平均密度为22.0±4.7ind./m2,平均生物量为23.31±4.69g/m2,螺类密度和生物量在... 详细信息

2008年1月～2009年10月对江苏阳澄湖螺类群落结构进行了季节调查研究。共采集到螺类4科5属6种,优势种为铜锈环棱螺,次优种为长角涵螺。阳澄湖螺类平均密度为22.0±4.7ind./m2,平均生物量为23.31±4.69g/m2,螺类密度和生物量在年际和季节间均无明显差异,但群落结构存在显著的空间变化,密度在东湖区和中华绒螯蟹围网养殖区较大、西湖区最小,生物量围网养殖区最高、西湖区最低;铜锈环棱螺密度围网养殖区最高、西湖区最低,长角涵螺密度东湖区最高、围网养殖区次之、入湖河流及其它湖区极低。中华绒螯蟹养殖未导致围网养殖区螺类数量下降,螺类(主要是铜锈环棱螺)的投放可能是该区螺类密度、生物量及铜锈环棱螺所占比例较高的主要原因之一。逐步回归分析表明,水深是影响螺类群落整体密度和生物量空间分布差异的主要因子;典型对应分析(CCA)表明,铜锈环棱螺主要分布在叶绿素a较高的水域,而长角涵螺和纹沼螺则主要分布在透明度较大的地方。

关键词：阳澄湖中国绒螯蟹围网养殖螺类群落结构密度生物量空间变化

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上海崇明岛明珠湖浮游植物群落结构

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应用生态学报 2011年第6期22卷 1599-1605页

作者：陈立婧吴竹臣胡忠军彭自然刘其根上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海201306

2007年1月至12月对崇明岛明珠湖的浮游植物群落结构和物种多样性的周年动态进行了初步研究.共发现浮游植物120种,隶属于8门63属.优势种包括小席藻、微小平裂藻、旋折平裂藻、不定微囊藻和肘状针杆藻.浮游植物的年平均丰度和年平均生物... 详细信息

2007年1月至12月对崇明岛明珠湖的浮游植物群落结构和物种多样性的周年动态进行了初步研究.共发现浮游植物120种,隶属于8门63属.优势种包括小席藻、微小平裂藻、旋折平裂藻、不定微囊藻和肘状针杆藻.浮游植物的年平均丰度和年平均生物量分别为5361.57×104cell.L-1和7.68 mg.L-1.浮游植物现存量各月间差异极显著(P<0.01),在7月达到最高峰值,但各站点间差异不显著.浮游植物的Shannon多样性指数和Margalef指数夏秋季低,冬春季高.生物学评价显示,明珠湖冬春两季的水质要优于夏秋两季,且目前正处于中富营养阶段,水体为α-中污型.典范相关分析结果表明,影响明珠湖浮游植物群落结构的主要因子依次为温度、总磷和总氮.

关键词：明珠湖浮游植物多样性指数典范相关分析环境因子

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牙鲆变态中IGF-I基因表达及甲状腺激素对其的调节作用

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水生生物学报 2011年第2期35卷 355-359页

作者：张俊玲施志仪付元帅程琦上海海洋大学农业部水产种质资源和养殖生态重点开放实验室上海201306

胰岛素样生长因子（Insulin-like growth factors,IGFs）是一类具有胰岛素样代谢和促有丝分裂功能的蛋白质,参与脊椎动物的胚胎发育、生长和生殖。IGF系统包括两个配体（IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ）、IGF受体（IGF-I receptor,IGF-I R;IGF-II rece... 详细信息

胰岛素样生长因子（Insulin-like growth factors,IGFs）是一类具有胰岛素样代谢和促有丝分裂功能的蛋白质,参与脊椎动物的胚胎发育、生长和生殖。IGF系统包括两个配体（IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ）、IGF受体（IGF-I receptor,IGF-I R;IGF-II receptor,IGF-ⅡR）以及IGF结合蛋白（IGF binding proteins，IGFBPs）。

关键词：牙鲆变态发育 IGF-I 基因表达甲状腺激素

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基因组步移技术克隆稀有鲫角蛋白18基因序列及序列分析

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上海海洋大学学报 2011年第5期20卷 661-668页

作者：叶莹蔡生力刘红上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海201306

角蛋白18是角蛋白的一种,属于S型角蛋白,是在哺乳动物和两栖类动物胚胎发育中第一个表达的中间纤维蛋白。根据已发表的人、爪蟾及斑马鱼角蛋白18 DNA序列,通过DNAman同源性比较获得保守序列,并从中设计二对引物。从稀有鲫基因组中PCR... 详细信息

角蛋白18是角蛋白的一种,属于S型角蛋白,是在哺乳动物和两栖类动物胚胎发育中第一个表达的中间纤维蛋白。根据已发表的人、爪蟾及斑马鱼角蛋白18 DNA序列,通过DNAman同源性比较获得保守序列,并从中设计二对引物。从稀有鲫基因组中PCR扩增得到2 779 bp的角蛋白18的DNA序列片段;通过基因组步移,分别获得该基因的上游和下游序列片段;最后将获得的全基因片段克隆至质粒载体pMD19-T进行序列测定检验。结果显示所克隆的稀有鲫角蛋白18基因全长3 765 bp。对该基因进行NCBI的Blastn同源性比较分析,表明稀有鲫同斑马鱼比较角蛋白18 DNA序列存在73.6%同源相似性;同时对该基因进行生物学分析,开放阅读框(Open ReadingFrame,ORF)预测表明稀有鲫角蛋白18是含有7个外显子和6个内含子,共编码367个氨基酸的蛋白质。研究亮点:首次成功克隆了稀有鲫角蛋白18基因全长序列3 765 bp,并且通过软件预测分析得出氨基酸序列,把氨基酸序列在DNA序列中进行标记,显示稀有鲫角蛋白18基因全长序列含有7个外显子和6个内含子,共编码367个氨基酸。另外,没有采用常用的从RNA反转录为cDNA为模板获得基因全长,而是直接以DNA为模板出发,利用基因组步移的方法获得基因全长。

关键词：稀有鲫角蛋白18 克隆基因组步移

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鳙中国土著群体与移居群体遗传变异的AFLP分析

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中国水产科学 2011年第2期18卷 283-289页

作者：严骏骢赵金良李思发郑德锋曹阳上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海201306

为全面了解鳙(Aristichthys nobilis)在世界范围的群体遗传状况,本研究采用AFLP技术分析了鳙中国土著群体(长江、珠江)与国内、外移居群体(中国黑龙江、欧洲多瑙河、北美密西西比河)的遗传变异特征,结果表明,鳙长江、珠江土著群体的Nei... 详细信息

为全面了解鳙(Aristichthys nobilis)在世界范围的群体遗传状况,本研究采用AFLP技术分析了鳙中国土著群体(长江、珠江)与国内、外移居群体(中国黑龙江、欧洲多瑙河、北美密西西比河)的遗传变异特征,结果表明,鳙长江、珠江土著群体的Nei’s基因多样性(H)分别为0.0394±0.1221和0.0529±0.1236,黑龙江、多瑙河、密西西比河移居群体分别为0.0233±0.0883、0.0122±0.0619和0.0134±0.0614,说明国内、外移居群体的遗传多样性显著低于国内土著群体,这与移居群体的来源以及在异地适应、定居、建群过程中发生了明显的遗传瓶颈效应有关。AMOVA分析表明,群体间差异对群体总遗传变异的贡献率为31.48%,而群体内的贡献率为68.52%。鳙长江、珠江群体间的遗传分化指数Fst值为0.3501(P<0.01),土著群体与国内、外移居群体间的总Fst值为0.1550(P<0.01),鳙土著群体与国内、外移居群体间表现为显著分化,反映了移居新形成的自然群体在遗传背景、遗传漂变、经历的生态环境压力与自然选择等方面与土著群体间存在明显差异。本研究通过了解鳙自然群体的遗传现状,海内、外移居群体与中国土著群体的遗传差异,旨为进一步监测该物种海内、外移居群体的遗传变化趋势积累资料,为鳙遗传资源保护、引种移植管理提供依据。

关键词：鳙土著群体移居群体遗传变异 AFLP

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团头鲂野生、驯养、选育3类遗传生态群体遗传变异的线粒体DNA分析

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中国水产科学 2011年第3期18卷 483-492页

作者：唐首杰李思发蔡完其上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海201306

通过对线粒体DNA控制区和CO I基因序列的联合分析,研究了团头鲂(Megalobrama amblycephala)3类遗传生态群体(包含4个野生群体、2个驯养群体、1个选育良种"浦江1号"群体)的遗传多样性和遗传分化情况。结果表明:(1)在所分析的7... 详细信息

通过对线粒体DNA控制区和CO I基因序列的联合分析,研究了团头鲂(Megalobrama amblycephala)3类遗传生态群体(包含4个野生群体、2个驯养群体、1个选育良种"浦江1号"群体)的遗传多样性和遗传分化情况。结果表明:(1)在所分析的7个群体中,共确定了64种单倍型,群体间无共享单倍型。(2)4个野生群体内线粒体DNA的单倍型多样度(Hd)在0.857～0.943之间,核苷酸变异位点数在31～40之间,核苷酸多样性指数(π)在0.275%～0.461%之间,平均核苷酸差异数(K)的范围为4.043～6.800;2个驯养群体的相应参数变化范围分别为0.714～0.800、18～21、0.122%～0.175%、1.800～2.586,均低于野生群体;选育群体的相应参数分别为0.843、23、0.193%、2.843,低于4个野生群体,但高于2个驯养群体。以上4种多样性参数在7个群体中的变化趋势一致。(3)7个群体之间的平均遗传距离在0.000 6～0.003 5之间,遗传分化指数(FST)在0.010 9～0.133 1之间。4个野生群体间FST值差异不显著(P>0.05),而2个驯养群体间FST值差异显著(P<0.05),它们与选育群体间的FST值差异也显著(P<0.05)。以上结果表明,生存环境的殊异(敞开的天然水体,封闭的驯养池塘)和人工选择(严格有序的科学选育)对种群遗传结构影响巨大,导致鱼类不同遗传生态类型群体间产生遗传变异和遗传分化。

关键词：团头鲂野生群体驯养群体选育群体遗传生态线粒体DNA 遗传变异

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