检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：刘瑞雪新疆医科大学

学位级别：博士

目的:（1）分析哈萨克族食管鳞癌（Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）患者的血清脂质组学特征,将癌症脂质代谢的变化与基因表达的变化联系起来,为新疆哈萨克族ESCC患者的诊断、治疗提供新的见解。（2）分析沉默信息调节因子3（... 详细信息

目的: （1）分析哈萨克族食管鳞癌（Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）患者的血清脂质组学特征,将癌症脂质代谢的变化与基因表达的变化联系起来,为新疆哈萨克族ESCC患者的诊断、治疗提供新的见解。（2）分析沉默信息调节因子3（Sirtuin 3,SIRT3）在新疆哈萨克族ESCC患者组织中的表达差异,阐述SIRT3表达水平与患者临床病理特征、预后的关系。（3）探究SIRT3对食管鳞癌细胞恶性表型及上皮间质转化（Epithelial-mesenchymal transition,EMT）的影响,通过脂质组学和蛋白质组学分析SIRT3在食管鳞癌细胞脂质代谢重编程中的功能、可能的下游靶基因及发挥作用的通路。（4）通过体内外功能试验,阐明SIRT3通过诱导AKT依赖的脂肪酸代谢相关基因表达及EMT的机制研究。为新疆地区哈萨克族食管鳞癌患者的个体化治疗研究做铺垫。方法: （1）(1)采用超高效液相色谱-串联质谱联用技术（Ultra-Performance Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,UPLC-MS/MS）对新疆地区30例哈萨克族ESCC患者血清及30例匹配的哈萨克族正常人群血清样本进行靶向定量脂质组学分析。（2）利用Illumina Hiseq2000测序仪对3例哈萨克族ESCC患者癌组织及癌旁正常组织进行转录组学分析。（3）整合脂质组学和转录组学结果,筛选哈萨克族ESCC患者血清差异脂质代谢物相关基因,利用实时定量PCR技术（Real Time Quantitative,RT-q PCR）对ESCC组织和癌旁正常组织进行关键基因验证。（4）通过UPLC-MS/MS检测血清差异代谢物相关的关键基因-腺苷酸环化酶(Adenosine 5’-monophosphate（AMP）-activated protein kinase,AMPK)对ESCC细胞脂质代谢的影响。（2）收集纳入65例哈萨克族患者的临床信息,并按照2009年第七版的食管癌TNM分期标准收集组织标本,采用免疫组织化学方法（Immunohistochemistry,IHC）和RT-q PCR方法检测AMPK,SIRT3在癌和癌旁正常组织中的表达。通过Pearson相关性分析探索AMPK与SIRT3的关系。基于AMPK与SIRT3在哈萨克族食管鳞癌组织中表达相关且SIRT3在癌组织中高表达的情况下,进一步分析SIRT3与哈萨克族食管鳞癌患者临床病理指标的相关性及预后关联性;（3）(1)通过体外实验,检测SIRT3对ESCC细胞恶性表型的影响;（2）UPLC-MS/MS方法检测靶基因SIRT3对ESCC细胞脂质代谢的影响。油红“O”实验检测SIRT3对ESCC细胞内中性脂质含量的影响。（3）定量乙酰化蛋白质组学,筛选靶基因SIRT3在食管鳞癌细胞中敲低后,表达水平差异有统计意义的蛋白质,并对蛋白质做功能和通路注释;（4）通过蛋白质免疫印迹（Western blotting）检测SIRT3敲低和过表达后的食管鳞癌细胞中,AKT、P-Akt、FASN和ACC1及EMT相关蛋白（E-cadherin、Vimentin、Snail）的表达水平。（5）添加AKT抑制剂MK2206,回复验证SIRT3对食管鳞癌细胞增殖、侵袭、迁移及中性脂质含量的影响。Western blotting检测MK2206对FASN、ACC1及EMT相关蛋白（E-cadherin、Vimentin、Snail）的影响。（6）构建SIRT3过表达的TE-1细胞裸鼠皮下成瘤模型,观察各裸鼠的体重及皮下瘤体体积的变化情况,进一步采用IHC检测相关指标在不同分组裸鼠皮下瘤体中的表达,明确SIRT3基因对细胞生长和转移的影响。结果: 第一部分:（1）UPLC-MS/MS对两组人群血清样本进行绝对脂质定量,共检测到13种脂类,其中甘油三酯（TAG）类最多。溶血磷脂酰胆碱（LPC）、磷脂酰乙醇胺（PE）、神经酰胺（Cer）是两组样本间表现出显著差异的脂类（P<0.05）。TAG、LPC、PC的脂质链长和链不饱和度显著下调（P<0.05）。根据VIP≥1,P≤0.05条件,共筛选出249种差异脂质代谢物,Cer（18:0/26:1）是最显著上调的的脂质,TAG（58:9）＿FA22:5是最显著下调的脂质。对哈萨克族ESCC患者癌及癌旁正常组织转录组学分析,提示不饱和脂肪酸生物合成、肉碱生物合成过程等与脂质代谢相关通路涉及的差异基因在肿瘤组织中富集（P<0.05）。RT-q PCR结果显示,与这些通路密切相关的基因在哈萨克族ESCC与癌旁组织间存在差异表达（P<0.05）。脂质组学和转录组学整合分析显示,不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸代谢

关键词：食管鳞癌脂质代谢重编程 SIRT3 脂肪酸合成 EMT

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应用计算病理学和FTIR显微光谱技术对PFE的诊断研究

应用计算病理学和FTIR显微光谱技术对PFE的诊断研究

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作者：黎德婵贵州医科大学

学位级别：硕士

目的:基于三种不同处理的肺组织切片进行全切片数字图像扫描,用卷积神经网络（Convolutional Neural Network,CNN）Inception-V3模型建立肺脂肪栓塞（Pulmonary Fat Embolism,PFE）诊断的AI模型。同时,通过进一步傅里叶变换红外（Fourie... 详细信息

目的: 基于三种不同处理的肺组织切片进行全切片数字图像扫描,用卷积神经网络（Convolutional Neural Network,CNN）Inception-V3模型建立肺脂肪栓塞（Pulmonary Fat Embolism,PFE）诊断的AI模型。同时,通过进一步傅里叶变换红外（Fourier Transform Infrared,FTIR）显微光谱检测结合化学计量学方法分析PFE死亡与非PFE死亡组间的生化差异,为PFE的死因鉴定提供可靠的证据。方法: 1.本研究收集了55例PFE（1-3级）,45例非PFE的肺组织样本,每个案例的样本采用三种不同的处理,包括常规苏木精和伊红（hematoxylin and eosin,HE）染色、油红O染色以及未染色的切片。将所有切片扫描成数字化切片,利用图像分割技术建立三种不同处理方法的肺数字切片图像数据库。 2.利用深度学习算法对Inception V3模型进行训练,将建立的图像数据库按7:3比例分为训练集、验证集,经过迁移学习、数据扩增等方法得到针对不同处理切片的PFE识别模型。 3.针对三种处理切片训练得到的最优模型进行验证。通过绘制受试者工作特征（Receiver operating characteristic,ROC）曲线,计算其曲线下面积（Area under curve,AUC）值,绘制混淆矩阵,计算真阳性率（True positive rate,TPR）,真阴性率（TNR:True negative rate,TNR）等评估模型的识别能力与泛化能力。并在不同分级的PFE组间的模型预测脂滴含量采取单因素方差分析（one-way analysis of variance,ANOVA）来评估各模型定量的效能。在定量的基础上绘制PFE死亡与非PFE死亡（存在1-2级PFE）组的ROC曲线确定最佳的诊断阈值,通过最大约登指数来确定。 4.采用FTIR显微光谱技术结合化学计量学对PFE的光谱进行分类诊断。首先收集9例PFE死亡组,9例非PFE死亡（1-2级PFE）作为对照组。使用FTIR显微光谱采集PFE中脂肪栓子对应的光谱,并在FTIR显微光谱配套软件OPUS 8.2对采集的原始光谱依次进行以下预处理:将光谱区间截取为1800-900 cm-1、进行基线校正、矢量归一化、最后进行平滑加二阶导数转换。选择1700-1745 cm-1光谱范围进行积分成像提取两组对应脂滴光谱,比较两组样本二阶导处理前后平均光谱,然后进行主成分分析（principal component analysis,PCA）识别具有差异性的波段、并构建偏最小二乘-判别分析（partial least squares-discriminant analysis,PLS-DA）模型,对PFE光谱进行分类诊断。结果: 1.结果表明,基于三种处理的切片建立的PFE数据库,可用于Inception V3模型的训练来建立PFE脂滴的识别模型,其建立的深度学习模型有能力识别肺部微血管中的脂肪滴形态,基于HE染色切片的模型识别脂肪栓子时其AUC值达到了0.98,TNR为100%,TPR为87.2%。基于未染色的数字切片图像训练的模型识别脂滴的AUC值达到0.98,其预测值的TNR为99.2%,TPR为87.5%。采用油红O染色的数字切片图像训练的模型在识别脂滴时的AUC值达到了1.00,其分类的混淆矩阵显示预测的TNR为100%,TPR为91%。 2.人工智能（Artificial Intelligence,AI）对PFE的量化结果与油红O染色后人工基于Falzi评分系统的诊断结果基本吻合。并在HE染色切片,根据模型对PFE的量化诊断确定了PFE死亡的诊断阈值为8.28%,根据该阈值诊断PFE死亡时获得的AUC值为0.984。与法医病理学专家的诊断结果相比,该模型的自动化定量诊断与使用特殊染色进行人工识别的结果相似,且优于人工识别HE染色切片的结果。未染色的切片模型在PFE死亡组与非PFE死亡组的诊断中AUC值达到0.966,最佳阈值为5.05%。油红O染色切片的模型诊断PFE死亡的AUC值为1.00,最佳阈值为16.70%。 3.基于建立的阈值,我们验证了模型在实际案例中的应用,经训练后的模型能正确分类PFE死亡与非PFE死亡。 4.在FTIR显微光谱中,比较两组样本的平均光谱,PFE组的脂滴光谱在1745cm-1处的吸收峰明显高于对照组,经二阶导处理的平均光谱在1745cm-1处脂肪酸酯的C=O的吸收波段强度差异最突出。通过PCA及其载荷图分析,两组间主要差异来自对照组相关的1734cm-1吸收峰,对应游离脂肪酸的羧基（COOH）和PFE死亡组相关的1745cm-1处的峰对应于C=O伸缩振动

关键词：计算病理学肺脂肪栓塞傅里叶变换红外显微光谱深度学习死因鉴定

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中性鞘磷脂酶2经外泌体调控细胞间神经酰胺转移在再生肝组织抑制结直肠癌肝转移的作用及机制研究

中性鞘磷脂酶2经外泌体调控细胞间神经酰胺转移在再生肝组织抑制...

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作者：李清平南方医科大学

学位级别：博士

目的和背景:肝部分切除术(partial hepatectomy,PH)是当前治疗结直肠癌肝转移(colorectal cancer liver metastasis,CRLM)的首选方法。目前关于PH后诱发的肝再生(liver regeneration,LR)对CRLM的作用尚不明确。大部分研究表明LR会促进CRLM的进展,少部分研究表明LR会抑制CRLM的进展。但在LR的背景下,预防CRLM复发的具体机制仍不明确。神经酰胺(ceramide,CER)是一种参与细胞间相互作用的有效抗癌脂质。在本论文中,我们研究了在LR的背景下,CER代谢在介导肝细胞和转移的结直肠癌(colorectal cancer cells,CRC)细胞之间相互作用以调节CRLM的作用。方法:通过行70%PH诱导小鼠LR,再通过脾脏内注射MC38细胞,模拟在小鼠LR背景下构建CRLM模型。qPCR、免疫组化和免疫印迹等方法检测CRLM癌组织和CRLM癌旁肝组织内CER代谢酶的变化,靶向脂质组学检测CRLM癌组织和CRLM癌旁肝组织内CER变化。再通过进行一系列功能实验,研究了体内外CER代谢的生物学作用。结果:我们发现LR既可以增加CRLM癌组织中转移的CRC细胞的凋亡,又可以促进基质金属蛋白酶2(matrix metalloproteinase 2,MMP2)表达和上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),增加转移的 CRC 细胞的侵袭性,从而促进CRLM的进展。LR诱导后中性鞘磷脂酶2(neutral sphingomyelinase 2,nSMase2,SMPD3)在再生肝细胞中上调,并在CRLM形成后的癌旁肝细胞中持续上调,而CER代谢酶在CRLM癌组织中却没有明显的变化。肝脏Smpd3的敲低可通过减少转移的CRC细胞的线粒体凋亡,引起β-catenin(CANTB)向核内聚集,上调MMP2的表达和EMT,增强转移性CRC细胞的侵袭性,进一步促进了LR背景下CRLM的进展。我们还发现小鼠70%肝切除术后第3天提取的血清外泌体可以增强CRC细胞的迁移和侵袭能力。Smpd3敲低的小鼠70%肝切除术后第3天提取的血清外泌体可以进一步减少CRC细胞的线粒体凋亡和增强CRC细胞的侵袭,从而促进了 CRLM的进展。使用SMPD3抑制剂GW4869药物处理可以显著减少外泌体的释放,减少CRC细胞的线粒体凋亡和增强CRC细胞的侵袭,促进了 LR背景下小鼠CRLM的进展。在机制上,我们发现肝脏SMPD3在LR后控制了再生肝细胞和CRLM癌旁肝细胞外泌体CER的生成,SMPD3产生的外泌体CER关键地引导了 CER从癌旁肝细胞向转移的CRC细胞进行细胞间转移,增加CRLM癌组织中CER的水平,并通过促进转移的CRC细胞的线粒体凋亡和减少转移的CRC细胞的侵袭来抑制CRLM的进展。此外,我们进一步研究还发现,在LR的情况下,纳米脂质体CER可以通过诱导转移的CRC细胞的线粒体凋亡和减弱转移的CRC细胞的侵袭性,从而抑制CRLM的进展。结论:SMPD3产生的外泌体CER在LR中抑制CRLM的进展,构成了关键的抗CRLM机制,CER作为治疗药物可能会减少部分肝切除术后CRLM的复发。

关键词：肝再生结直肠癌肝转移中性鞘磷脂酶2 神经酰胺外泌体

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卵泡抑素相关蛋白在消化系统肿瘤的研究进展

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中华预防医学杂志 2024年第9期58卷 1444-1449页

作者：仵泇锘姜玉章南京医科大学附属淮安第一医院检验科淮安223300

消化系统肿瘤是影响人们生活质量的重要因素之一,已经成为全球严重的公共卫生问题,对肿瘤高危人群进行肿瘤标志物的早期筛查并干预是肿瘤预防的关键。卵泡抑素相关蛋白(FRP)是卵泡抑素家族的重要成员,此类蛋白参与了生殖系统、呼吸系统... 详细信息

消化系统肿瘤是影响人们生活质量的重要因素之一,已经成为全球严重的公共卫生问题,对肿瘤高危人群进行肿瘤标志物的早期筛查并干预是肿瘤预防的关键。卵泡抑素相关蛋白(FRP)是卵泡抑素家族的重要成员,此类蛋白参与了生殖系统、呼吸系统等肿瘤的病理过程,近年来其在消化系统肿瘤的研究中引起了广泛关注,提示FRP可能在消化系统肿瘤的发生发展中发挥重要作用,是临床诊治的潜在标志物。文章综述了与消化系统肿瘤相关的FRP的生物学功能、表达情况及潜在作用机制,以期为消化系统肿瘤的诊断和预防、预后评估和药物研发提供参考。

关键词：卵泡抑素卵泡抑素相关蛋白肿瘤消化系统生物标志物

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经典名方枳实薤白桂枝汤的现代研究及展望

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世界中医药 2024年第19期19卷 3032-3038页

作者：魏娇霞付敏李媛牛征张轩宇姚丽哈尔滨医科大学药学院哈尔滨150081

枳实薤白桂枝汤为治疗胸痹之经典名方,收录于国家中医药管理局公布的第一批《古代经典名方目录》,临床用于治疗心血管疾病、呼吸系统疾病、消化系统疾病等,对冠心病疗效尤为显著,是开发治疗心血管疾病创新药物的重要来源。但其有效成分... 详细信息

枳实薤白桂枝汤为治疗胸痹之经典名方,收录于国家中医药管理局公布的第一批《古代经典名方目录》,临床用于治疗心血管疾病、呼吸系统疾病、消化系统疾病等,对冠心病疗效尤为显著,是开发治疗心血管疾病创新药物的重要来源。但其有效成分不明、作用机制不清成为其现代研发的瓶颈。通过整合梳理近30年枳实薤白桂枝汤研究进展,全面分析其活性成分,系统总结其药理作用机制,以期为经典名方枳实薤白桂枝汤的临床应用和药物研发提供有益参考。

关键词：枳实薤白桂枝汤胸痹经典名方活性成分药理作用临床应用研究进展药物研发

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社区中老年人骨骼肌质量与代谢综合征的关联研究

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上海预防医学 2024年第1期36卷 40-46页

作者：陈思敏努尔比亚木·艾合提沈静晏师康开地日艳·库日班江彭星阿卜杜乃比·吾普尔戴江红杨蕾新疆医科大学公共卫生学院新疆乌鲁木齐830054

【目的】探讨新疆乌鲁木齐市社区中老年人骨骼肌质量与代谢综合征(MS)患病风险的相关性,为了解社区中老年居民骨骼肌质量与MS的关系提供理论依据。【方法】以2018年7月—2019年1月新疆多民族自然人群队列乌鲁木齐市1438名≥50岁社区居... 详细信息

【目的】探讨新疆乌鲁木齐市社区中老年人骨骼肌质量与代谢综合征(MS)患病风险的相关性,为了解社区中老年居民骨骼肌质量与MS的关系提供理论依据。【方法】以2018年7月—2019年1月新疆多民族自然人群队列乌鲁木齐市1438名≥50岁社区居民为研究对象,使用问卷调查、体格检查、生物电阻抗分析(BIA)、实验室检测等方式收集数据。骨骼肌质量使用经体重校正的四肢骨骼肌质量指数(SMI)评估;MS的定义为至少存在以下之中的3项:腹部肥胖、高血压、高血糖、高三酰甘油和高低高密度脂蛋白胆固醇。将SMI分为Q_(1)~Q_(4)等4个四分位数组。应用趋势χ^(2)检验探讨SMI分级水平与MS之间的相关性;应用多因素logistic回归模型,分析较高SMI组(Q_(2)、Q_(3)、Q_(4))与参照组Q_(1)的MS患病风险的差异。【结果】共检出MS患者560人、患病率38.94%,其中男性代谢综合征患病率39.16%、女性患病率38.80%。男性SMI分级水平增加与MS患病率不相关(趋势性P>0.05);调整混杂因素后(模型4),SMI增加与MS患病率仍不相关(P_(趋势)=0.995),MS发生风险在SMI最低四分位数Q_(1)组和最高四分位数组Q_(4)(OR=1.01,95%CI:0.69~1.78)间不存在统计学差异。女性MS患病率随着SMI分级水平的增加逐渐下降(P_(趋势)<0.001);调整混杂因素后(模型4),SMI增加与MS患病率仍存在相关关系(P_(趋势)=0.005),且以SMI最低四分位数Q_(1)为参照组,Q_(2)(OR=0.63,95%CI:0.40~1.00)、Q_(3)(OR=0.56,95%CI:0.34~0.94)、Q_(4)(OR=0.42,95%CI:0.23~0.76)发生MS的风险均下降。【结论】骨骼肌质量增加可能有益于预防MS,尤其是女性中老年居民。考虑到我国老龄化加剧及MS与相关合并症的密切关系,管理骨骼肌质量可能有助于预防MS及潜在合并症。

关键词：骨骼肌质量代谢综合征中老年社区

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脑脊液生物标志物在阿尔茨海默病诊断中的价值

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中华检验医学杂志 2022年第1期45卷 8-13页

作者：张晓敏崔雨婷张晶晶王怡斐王培昌首都医科大学宣武医院检验科北京100053 首都医科大学临床检验诊断学系北京100069

阿尔茨海默病(AD)是一种老年期的神经退行性疾病,早期干预是目前延缓该病进展的唯一可靠手段。该文汇总并分析近年来各类AD生物标志物研究的代表性文献,分类评述了各类脑脊液(GSF)标志物对AD诊断及鉴别诊断的效能。其中CSF Aβ42、Aβ4... 详细信息

阿尔茨海默病(AD)是一种老年期的神经退行性疾病,早期干预是目前延缓该病进展的唯一可靠手段。该文汇总并分析近年来各类AD生物标志物研究的代表性文献,分类评述了各类脑脊液(GSF)标志物对AD诊断及鉴别诊断的效能。其中CSF Aβ42、Aβ42/Aβ40、tau蛋白、Aβ42/p-tau、生长相关蛋白43、突触相关蛋白25、神经颗粒素、人视锥样蛋白1等对AD诊断、鉴别诊断均具有较大价值。CSF标志物可用于AD诊断及鉴别诊断。实验室应根据自身条件,针对AD选择适宜的CSF标志物。

关键词：脑脊液生物标志物阿尔茨海默病

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核心时钟基因对白纹伊蚊C6/36细胞代谢节律及两种成蚊交配节律的作用和调控机制研究

核心时钟基因对白纹伊蚊C6/36细胞代谢节律及两种成蚊交配节律的...

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作者：刘爽南方医科大学

学位级别：博士

背景:生物钟是生物体对地球自转和公转引起的光照、温度等环境因子的周期性变化的长期适应,从而产生内在的自发的计时机制。生物钟系统由输入通路、中央起搏器或振荡器和输出通路组成。输入通路用于接受外界光和温度等环境信号并传入核... 详细信息

背景:生物钟是生物体对地球自转和公转引起的光照、温度等环境因子的周期性变化的长期适应,从而产生内在的自发的计时机制。生物钟系统由输入通路、中央起搏器或振荡器和输出通路组成。输入通路用于接受外界光和温度等环境信号并传入核心振荡器,使得生物钟与环境同步,中央起搏器通过转录翻译以及修饰产生分子振荡,而输出通路则通过分子振荡调控生物下游生理和行为的节律变化。生物钟普遍存在于生物界从人类到蓝藻的各种物种以及从生物体到组织、细胞的各种生物层次,体外培养细胞和组织虽然脱离了生物体中枢神经的调控,也具备三大生物钟原件。果蝇生物钟的分子调控机制一直是研究热点,但人们对其他非果蝇昆虫的时钟机制鲜有研究。蚊是一类重要的医学媒介昆虫,可以传播疟疾、登革热、寨卡病毒病、丝虫病、黄热病、流行性乙型脑炎等多种疾病,对人类的生命健康造成极大的危害,不同蚊种根据它们自身的生态位,进化出了不同的昼夜节律行为,许多蚊虫的行为随着一天中的时间而改变,包括飞行活动、交配、产卵和叮咬等行为,而交配活动作为蚊虫羽化后生殖繁衍的重要生理行为,阐明蚊虫生物钟对交配节律的调控机制对于蚊媒防控具有非常重要指导意义。目的:1.探索白纹伊蚊C6/36细胞中是否存在昼夜节律,对细胞中节律振荡的核心时钟基因和非时钟基因进行特征分析和功能研究,阐明白纹伊蚊细胞水平的生物钟调控机制。2.观察白天活动的白纹伊蚊和夜晚活动为主的致倦库蚊在昼夜条件下的交配行为规律,探究核心时钟基因对两种蚊虫交配行为的作用和调控机制,为蚊虫的精准监测和防制提供理论基础。方法:1.建立白纹伊蚊C6/36细胞昼夜节律模型,在白昼和黑夜(12h Light:12h Dark,LD)条件下同步一周后,于光照开始时收集并每隔6h收集一次,一共收取24小时内5个时间点的细胞样本进行转录组测序,分析并验证转录组测序数据,对振荡基因进行特征分析。2.在白纹伊蚊C6/36细胞中用RNAi的技术手段敲低振荡表达的per基因,在敲低效率最高的第二天收集不同时间点的细胞样本,用RT-qPCR方法分析时钟基因per对细胞代谢基因节律表达的影响。3.分别将白纹伊蚊和致倦库蚊置于LD(8:00开灯,12h Light:12h Dark)、LDDD(12h Dark:121h Dark)、DL(20:00 开灯,12h Dark:12h Light)和 DLDD 等不同光照条件下,解剖各个时间段雌蚊的受精囊,计算雌蚊的授精率,比较两种蚊虫24h内的交配行为节律。4.用RT-qPCR检测LD条件下白纹伊蚊和致倦库蚊雌雄蚊头部和身体desat1基因在24小时内的时间表达谱,用dsRNA敲低desat1基因研究该基因对两种蚊虫交配行为的影响,并用气相色谱/质谱定量分析desat1基因干扰前后表皮碳氢化合物含量的变化。5.利用本实验室构建保种的per和clk白纹伊蚊和致倦库蚊敲除品系进行交配节律的比较,探索核心时钟基因对交配节律的调控作用和机制。结果:1.在白纹伊蚊C6/36细胞昼夜节律模型下,对不同时间点采集样本进行测序并筛选呈节律振荡的基因,结果发现除了核心时钟基因per呈现昼夜振荡表达外,其他核心时钟基因均没有呈现振荡;除核心时钟基因外,另外尚筛选到许多非核心时钟基因呈现振荡表达,这些基因主要参与代谢节律。2.在C6/36细胞中用siRNA干扰的方法敲低per后,per基因在一天内的表达趋于平缓,节律消失,另外发现参与糖酵解途径的三个关键限速酶基因烯醇化酶eno、乳酸脱氢酶imp3L、甘油醛3磷酸脱氢酶2(gapdh2)的振荡节律表现出不同程度的紊乱。3.白纹伊蚊和致倦库蚊在LD、LDDD、DL和DLDD条件下的交配行为均呈现昼夜节律,白纹伊蚊在24h内都可以交配,但在开灯后3h(清晨)和关灯前3h(傍晚)有两个交配高峰,交配率高达90%;致倦库蚊在一天24h内仅在关灯后3h呈现交配高峰,3h内的交配率最高为40%,在光照下几乎没有交配。***1基因的时间表达谱结果显示在两种蚊虫中都呈现节律表达,白纹伊蚊desat1在白天和夜间都出现了表达高峰,而致倦库蚊desat1在光照向黑暗转换时间段有表达高峰;敲低雄蚊desat1基因会导致两种蚊虫的交配率显著下降,相比白纹伊蚊和致倦库蚊对照组90%左右的交配率,将desat1敲低后,白纹伊蚊交配率(65.5%)和致倦库蚊交配率(62.9%)均显著下降;desat1敲低后白纹伊蚊C19、C23、C29和C31表皮碳氢化合物水平下降,而C27升高;在致倦库蚊,C21、C23显著降低,C27、C29的则显著升高。5.白纹伊蚊时钟基因per、clk突变品系和致倦库蚊clk突变品系的交配节律均发生了不同程度的改变,白纹伊蚊perΔ207突变品系各个时间点交配率显著下降,各时间点的交配率范围是(0～40%);白

关键词：白纹伊蚊生物钟时钟基因代谢交配表皮碳氢化合物

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微单倍型联合Y-SNP/STR(MY):系统构建、评估及在两人DNA混合物中的基因型模式识别

微单倍型联合Y-SNP/STR(MY):系统构建、评估及在两人DNA混合物中...

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作者：范浩亮南方医科大学

学位级别：博士

由 Y 染色体短串联重复序列(Y-chromosomal short tandem repeats,Y-STRs)和Y-DNA单倍群所构成的Y染色体单倍型,可以用来描述未知男性的父系特征。但是,Y染色体遗传标记目前尚不足以进行精确的个体识别。近年来,随着大规模并行测序(mass... 详细信息

由 Y 染色体短串联重复序列(Y-chromosomal short tandem repeats,Y-STRs)和Y-DNA单倍群所构成的Y染色体单倍型,可以用来描述未知男性的父系特征。但是,Y染色体遗传标记目前尚不足以进行精确的个体识别。近年来,随着大规模并行测序(massiveparallel sequencing,MPS)技术的发展,法医遗传学中引入了微单倍型(microhaplotype)的概念,微单倍型作为一种新型遗传标记,有望促进法医个体识别鉴定和DNA混合物的解析。因此,在不同的法医学应用场景中,特别是有男性嫌疑人的犯罪现场(如性侵犯案件),联合使用两者,可为案件提供更多的侦查线索。在本研究中,首次联合微单倍型和Y染色体遗传标记,基于多重PCR和150 bp 双端 MPS 技术,研发了 MY 系统(Microhaplotype and Y-SNP/STR),包含 114个 Y-SNPs(涵盖 12 种主要的 Y-DNA 单倍群),45 个 Y-STRs(N-1 Stutter<0.09;突变率<5 × 10-3)和22个微单倍型遗传标记(等位基因测序深度比>0.91;两两遗传距离>10Mb)。在100名广东汉族中,MY系统22个微单倍型遗传标记的有效等位基因数量(effective number of alleles,Ae)的平均值为7.17(3.62-14.72),其累积个体识别能力为1-5.00 × 10-31,累积二联体和三联体非父排除概率分别为 1-5.00 × 10-8 和 1-4.85 × 10-12。在千人基因组计划(1000 Genomes Project,1KG)群体中,经过全面法医学评估和法医群体遗传学分析,MY系统22个微单倍型遗传标记的系统效能,大致相当于26-28个法医常用STRs的系统效能,MY系统可作为STR的有效补充用于法医学实践(个体识别,亲子鉴定,DNA混合物解析和生物地理祖源推断等)。基于MY系统,针对两人DNA混合物的解析,我们提出了基因型模式识别(genotype pattern recognition,GPR)。根据等位基因测序深度(depth of coverage,DoC)的降序排列特征,将两人DNA混合物的26种不同的基因型组合整合为9种基因型模式,在此基础上,使用10组男性-男性DNA模拟混合物,验证了 GPR的实际应用范围(混合比例:1:10-1:2)。通过回归分析,针对不同的遗传标记和基因型模式,建立了真实混合比例(actualmixingratio,AMR)与DoC 比(RDOC)之间的回归关系。如果观测RDoC值位于RDoC交集内的5个重叠区域(overlapping areas),主要贡献者和次要贡献者的基因型需要似然比的方法判断;如果观测RDoC值位于其他非重叠区域(RDoC交集外的绝大部分区域和RDoC交集内的非重叠区域),在期望真实混合比例E(AMR)的辅助下,通过观测RDoC值与RDoC范围直接比较,观测RDoC值的基因型模式可以被识别。因此,基于MY系统,可以通过GPR策略来实现两人DNA混合物的解析(实际应用范围为1:10-1:2)。

关键词：微单倍型 Y-SNP Y-STR 大规模并行测序两人DNA混合物基因型模式识别

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肺脑交互潜在病理生理机制的研究进展

引用

中华神经医学杂志 2024年第9期23卷 928-932页

作者：刘家豪王颖董瑞孙立新山东第二医科大学麻醉学院潍坊261053 青岛市市立医院麻醉手术科青岛266071

肺脑交互是指肺脏与大脑之间通过多种机制相互影响和调节的复杂病理生理过程,该过程通过神经、免疫、微生物与代谢物以及气体等多个层面,共同作用于肺脏与大脑之间的复杂网络,并影响着疾病的发展。本文围绕神经通路、免疫通路、微生物... 详细信息

肺脑交互是指肺脏与大脑之间通过多种机制相互影响和调节的复杂病理生理过程,该过程通过神经、免疫、微生物与代谢物以及气体等多个层面,共同作用于肺脏与大脑之间的复杂网络,并影响着疾病的发展。本文围绕神经通路、免疫通路、微生物和代谢物通路以及气体通路在肺脑交互中的病理生理机制进行综述,旨在为相关肺部和脑部疾病的预防和治疗提供新思路、新方法,为后续研究和临床实践提供参考。

关键词：肺脑神经免疫微生物代谢物气体

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