检索结果-内蒙古大学图书馆

“磨玻璃影”特征的早期肺腺癌中MPP成分的突变特征分析及ZNF469基因的探索

中国肺癌杂志 2023年第12期26卷 889-900页

作者：许有涛孙钦泓王思炜朱鸿宇董国璋孟凡尘夏志军游静孔祥茹吴金涛陈鹏袁方慰余新宇季金芾李知桐朱鹏程孙宇翔刘桐言尹荣许林南京医科大学附属肿瘤医院江苏省肿瘤医院胸外科江苏省肿瘤防治研究所江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室南京210009

背景与目的目前,肺癌依然是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。而在早期肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中,微乳头(micropapillary,MPP)成分尤其常见,且通常表现出高侵袭性,其与早期转移、淋巴浸润的风险以及患者的5年生存率显著相... 详细信息

背景与目的目前,肺癌依然是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。而在早期肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中,微乳头(micropapillary,MPP)成分尤其常见,且通常表现出高侵袭性,其与早期转移、淋巴浸润的风险以及患者的5年生存率显著相关。本研究旨在探究以磨玻璃影(ground-glass opacities,GGOs)为特征的早期LUAD中MPP成分和非MPP成分的异同,寻找MPP成分所特有的突变特征,并分析锌指蛋白家族的ZNF469基因与早期LUAD预后以及免疫浸润的关系。方法收集31例LUAD恶性肺结节,采用显微解剖法将其分为成对的MPP和非MPP成分。对早期恶性肺结节组分进行全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES),利用maftools、非负矩阵分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)法、Sigminer等方法进行突变特征分析,以揭示侵袭性LUAD中MPP组分相比于其他肿瘤组织所特有的基因组突变特征。利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)的LUAD数据库中ZNF469的表达情况,探讨其与肺癌预后的关系;利用GeneMANIA数据库以及基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析探索LUAD中与ZNF469相关基因的互作网络及信号通路;利用TIMER和TISIDB数据库分析ZNF469表达与LUAD中免疫细胞浸润水平的相关性。结果MPP成分具有较多的基因组变异,相比于非MPP成分的肿瘤组织,癌症体细胞突变目录(Catalogue of Somatic Mutations in Cancer,COSMIC)的13号突变特征(胞苷脱氨酶家族,APOBEC)是MPP成分所特有的,这提示其参与了MPP成分对LUAD早期侵袭过程的促进作用;并且APOBEC特征高的MPP样本具有更高的肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB),提示这些患者更能从免疫治疗中获益。LUAD中突变ZNF469的表达高于正常组织,与LUAD患者的不良预后有关。基因互作网络分析以及GO和KEGG富集分析发现,COL6A1、COL1A1、COL1A2、TGFB2、MMP2、COL8A2、C2CD4C等与ZNF469具有相互作用,且主要与编码胶原蛋白、参与细胞外基质构成有关。ZNF469表达与肿瘤的免疫浸润呈正相关。结论本研究揭示了中国人群侵袭性LUAD中MPP成分的特有突变特征,并发现突变ZNF469的高表达影响LUAD预后与免疫浸润,推测ZNF469可作为LUAD潜在的诊断及预后生物标志物。

关键词：肺肿瘤磨玻璃影微乳头成分突变特征分析 ZNF469基因

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肺腺癌中免疫微环境特征与EGFR突变状态的相关性研究

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中国肺癌杂志 2023年第3期26卷 204-216页

作者：朱鸿宇陈鹏董国璋孟凡尘夏志军游静孔祥茹吴金涛袁方慰余新宇孙钦泓季金芾王思炜刘桐言许林南京医科大学附属肿瘤医院江苏省肿瘤医院胸外科江苏省肿瘤防治研究所江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室南京210009

背景与目的在全球范围内肺癌发病率和死亡率一直居高不下,而肺腺癌是其中最主要的一个组织亚型,表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变是肺腺癌的一个重要驱动基因突变。近年来以程序性死亡受体1(programmed cel... 详细信息

背景与目的在全球范围内肺癌发病率和死亡率一直居高不下,而肺腺癌是其中最主要的一个组织亚型,表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变是肺腺癌的一个重要驱动基因突变。近年来以程序性死亡受体1(programmed cell death 1,PD-1)及程序性死亡配体1(programmed cell death ligand 1,PD-L1)抑制剂为代表的免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)治疗在部分肺癌患者中疗效显著。有研究表明EGFR突变的患者对免疫治疗的获益程度有限,本研究旨在讨论肺腺癌患者中EGFR突变状态与各类免疫细胞浸润数量、空间分布的关系。方法本研究纳入62例接受手术的肺腺癌患者。通过对手术切除的肿瘤组织进行不同区域多点采样,最终获取了223份肿瘤组织样本。通过基因检测获取了每份肿瘤组织的EGFR突变情况,包括突变丰度(variant allele frequency,VAF)以及突变亚型等信息。对肿瘤组织进行苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色、免疫组化染色、多重荧光免疫组化染色,并通过计算免疫组化评分获取各类免疫细胞在肿瘤组织中的浸润情况以及三级淋巴结构(tertiary lymphoid structure,TLS)的分布情况。结果与野生型患者相比,EGFR突变肺腺癌患者肿瘤组织中CD68^(+)巨噬细胞以及组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC)II类抗原呈递细胞浸润更多,且MHC II类抗原呈递细胞空间分布的异质性较大,而CD56^(+)自然杀伤细胞以及CD8^(+)T细胞等浸润更低。EGFR VAF高的肿瘤组织与更低的CD3^(+)T细胞、CD20^(+)B细胞、CD56^(+)自然杀伤细胞、CD68^(+)巨噬细胞、CD8^(+)T细胞等细胞浸润相关,其中只有CD3^(+)T细胞分布的空间异质性较小。对于中国人群常见的两种EGFR突变亚型,EGFR外显子19缺失突变相较于EGFR外显子21 L858R突变肿瘤组织中有更低的免疫细胞浸润,但CD3^(+)T细胞、CD56^(+)自然杀伤细胞、CD68^(+)巨噬细胞以及CD8^(+)T细胞等免疫细胞分布的空间异质性更高。预后分析发现,CD3^(+)T细胞、CD20^(+)B细胞浸润程度高、TLS形成数量多以及CD8^(+)T细胞高分布异质性的EGFR突变患者拥有更长的无病生存期。结论EGFR突变肺腺癌具有独特的低免疫细胞浸润的“非炎性”肿瘤微环境,不同突变亚型以及VAF的肿瘤微环境之间也表现出异质性,这些差异不仅体现在免疫细胞的浸润数量上,也体现在免疫细胞的空间分布情况。因此对EGFR突变肺腺癌的免疫微环境进行进一步更深入的研究对未来提高EGFR突变肺腺癌患者的免疫治疗疗效具有重大意义。

关键词：肺肿瘤 EGFR突变免疫微环境肿瘤异质性免疫治疗

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细胞转录组学和代谢组学整合策略表征突变影响谷氨酰胺合成酶酶活的关键代谢通路

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色谱 2025年第3期43卷 207-219页

作者：凌婷石京冯婷泽裴劭君李思怿朴海龙中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析重点实验室辽宁大连116023 中国医科大学附属肿瘤医院胸外科肿瘤研究所辽宁省肿瘤医院暨研究所辽宁沈阳110042 中国医科大学生命科学学院生物化学和分子生物学教研室辽宁沈阳110122 中国科学院大学北京100049

谷氨酰胺合成酶(GS)是细胞中唯一可以从头合成谷氨酰胺的酶,在癌症代谢中扮演着重要角色。GS酶活缺陷突变往往导致严重的代谢疾病甚至是死亡。理解GS酶活降低对生理功能的影响可能为靶向治疗提供新的方向,同时对其内在机制的探索可以为... 详细信息

谷氨酰胺合成酶(GS)是细胞中唯一可以从头合成谷氨酰胺的酶,在癌症代谢中扮演着重要角色。GS酶活缺陷突变往往导致严重的代谢疾病甚至是死亡。理解GS酶活降低对生理功能的影响可能为靶向治疗提供新的方向,同时对其内在机制的探索可以为治疗干预开辟新的途径。已报道的GS酶活缺陷突变包括R324C(第324位精氨酸突变为半胱氨酸)和R341C(第341位精氨酸突变为半胱氨酸)等,本研究新发现了GS的另一个酶活缺陷突变位点K241(第241位赖氨酸)。为了探究GS酶活缺陷突变带来的影响,本研究利用双组学技术对GS的酶活缺陷突变R324C和K241R(第241位赖氨酸突变为精氨酸)在肺癌细胞中的功能进行研究,通过对转录组和代谢组数据的整合揭示了GS酶活缺陷突变对一些重要生物过程的显著影响。GS的缺陷突变阻碍了细胞周期和多种氨基酸代谢途径。除了谷氨酰胺合成受到抑制,精氨酸-脯氨酸代谢、甘氨酸-丝氨酸-酪氨酸代谢以及天冬氨酸-谷氨酸-丙氨酸代谢在GS突变的细胞中表现出更强的活力,同时,氨酰-tRNA的生物合成途径也显著被激活。进一步的研究发现,GS酶活缺陷带来氨基酸代谢的改变源自谷氨酸的重新定向和相关代谢酶的表达变化,同时,氨酰-tRNA生物合成的激活源自谷氨酰胺在GS酶活缺陷细胞中带来的能量应激激活了特定蛋白的表达,如转录因子4(ATF4)。此外,细胞表型实验表明,GS酶活缺陷细胞的迁移能力低于野生型细胞。以上结果揭示了GS酶活缺陷突变体细胞中的代谢重编程现象,突出了癌细胞代谢的复杂性和适应性。

关键词：谷氨酰胺合成酶突变转录组学代谢组学肺癌谷氨酰胺

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BMAL1基因抑制耐放射鼻咽癌细胞株增殖、迁移和侵袭能力机制研究

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中华放射肿瘤学杂志 2022年第11期31卷 1039-1045页

作者：黎钰欣赵朝芬刘丽娜贺前勇徐歆宇周定安周建奖金风贵州医科大学附属医院肿瘤科贵阳550004 贵州医科大学附属肿瘤医院肿瘤科贵阳550008 贵州医科大学临床医学院肿瘤学教研室贵阳550004 贵州医科大学临床医学研究中心贵阳550004 贵州医科大学分子生物学重点实验室贵阳550004

目的探究BMAL1基因对耐放射鼻咽癌细胞株(5‐8FR)增殖、迁移和侵袭能力的影响及分子机制。方法小剂量分次照射构建鼻咽癌耐放射细胞5‐8FR,运用克隆形成实验结果拟合多靶单击模型并计算放疗增敏比。通过蛋白质印迹实验检测5‐8FR和对照... 详细信息

目的探究BMAL1基因对耐放射鼻咽癌细胞株(5‐8FR)增殖、迁移和侵袭能力的影响及分子机制。方法小剂量分次照射构建鼻咽癌耐放射细胞5‐8FR,运用克隆形成实验结果拟合多靶单击模型并计算放疗增敏比。通过蛋白质印迹实验检测5‐8FR和对照组5‐8F细胞株中PI3K/Akt/MMP‐2/9信号通路相关蛋白的表达。构建BMAL1基因的高表达及敲除载体,分别转染鼻咽癌细胞株5‐8F和耐放射细胞株5‐8FR,获得BMAL1基因过表达(pcDNA‐BMAL1)及其对照组(pcDNA)和干扰(BMAL1‐shRNA)及对照组(con‐shRNA)的稳转细胞株。蛋白质印迹法验证感染效率,检测两组细胞过表达或干扰BMAL1基因后PI3K/Akt/MMP‐2/9信号通路相关蛋白的改变情况。采用CCK‐8法、划痕实验、Transwell法检测过表达及干扰BMAL1基因后耐放疗细胞株5‐8FR增殖、迁移和侵袭能力的变化。结果鼻咽癌耐放射细胞株中BMAL1基因表达下调,PI3K/Akt通路蛋白及下游相关分子MMP‐2、MMP‐9表达增加,TIMP‐2、TIMP‐1表达降低。过表达BMAL1基因可抑制PI3K/Akt通路蛋白及下游相关分子MMP‐2、MMP‐9表达,促进TIMP‐2、TIMP‐1表达,抑制耐放射鼻咽癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,干扰BMAL1基因则结果相反。结论BMAL1基因可以逆转耐放射鼻咽癌细胞株PI3K/Akt/MMP‐2/9信号通路相关蛋白的表达,并抑制耐放射鼻咽癌细胞株的增殖、迁移和侵袭能力。

关键词：生物钟基因鼻咽肿瘤耐放射细胞株增殖迁移侵袭

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DNA损伤修复蛋白PARP1聚ADP-核糖基化有丝分裂蛋白BUB3调控HeLa细胞的有丝分裂

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陆军军医大学学报 2023年第16期45卷 1682-1692页

作者：杨雪徐波天津医科大学肿瘤医院肿瘤研究所生物化学与分子生物学研究室国家肿瘤临床医学研究中心乳腺癌防治教育部重点实验室天津300060 重庆大学附属肿瘤医院智能肿瘤学研究中心乳腺癌智能诊疗重庆市重点实验室重庆400030 重庆大学医学院重庆400040

目的探讨DNA损伤修复蛋白聚ADP-核糖聚合酶1[poly(ADP-ribose)polymerase 1,PARP1]对HeLa细胞有丝分裂的影响及其分子机制。方法使用流式细胞术、细胞免疫荧光、活细胞成像检测PARP1对HeLa细胞有丝分裂进程的影响。采用染色体核型分析... 详细信息

目的探讨DNA损伤修复蛋白聚ADP-核糖聚合酶1[poly(ADP-ribose)polymerase 1,PARP1]对HeLa细胞有丝分裂的影响及其分子机制。方法使用流式细胞术、细胞免疫荧光、活细胞成像检测PARP1对HeLa细胞有丝分裂进程的影响。采用染色体核型分析、细胞免疫荧光检测PARP1对HeLa细胞染色体稳定性的影响。使用蛋白免疫印迹和免疫共沉淀检测HeLa细胞有丝分裂期PARP1的蛋白表达及酶活性变化。使用蛋白质组质谱分析方法鉴定与PARP1在有丝分裂期具有特异性相互作用的蛋白并进行免疫共沉淀及聚ADP-核糖基化实验验证。结果流式细胞术和细胞免疫荧光结果显示,敲低PARP1或使用奥拉帕尼抑制PARP1的酶活性后,HeLa细胞对诺考达唑诱导的有丝分裂阻滞反应显著下降(P<0.05)。活细胞成像结果显示,敲低PARP1后HeLa细胞的平均有丝分裂时间缩短(P<0.01)。染色体核型分析和免疫荧光结果显示,敲低PARP1后非整倍体细胞和多极纺锤体细胞的比例明显增加(P<0.05)。蛋白免疫印迹结果显示有丝分裂期PARP1的蛋白表达量无明显变化,免疫共沉淀实验结果显示其酶活性显著增加。蛋白质组质谱鉴定和免疫共沉淀结果显示,PARP1与有丝分裂检查点复合体(mitotic checkpoint complex,MCC)的主要组成蛋白BUB3在有丝分裂期具有特异性相互作用,并且BUB3可以发生聚ADP-核糖基化修饰。结论DNA损伤修复蛋白PARP1可能通过上调其酶活性并聚ADP-核糖基化MCC蛋白BUB3以调控HeLa细胞有丝分裂的正常进行并维持其染色体稳定性。

关键词： DNA损伤修复有丝分裂聚ADP-核糖聚合酶1 PARP抑制剂

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衰老相关的肿瘤转移机制探究

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实用老年医学 2025年

作者：陈佳宇任斌辉南京医科大学附属肿瘤医院胸外科/江苏省肿瘤防治研究所江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室

随着全球人口老龄化的加剧，老年群体中癌症的发病率和死亡率持续上升。肿瘤转移是影响癌症预后的主要原因之一，与年轻病人相比，老年病人的肿瘤转移过程受到衰老相关生物学变化的显著影响。本文分析了衰老对肿瘤转移机制的多方面影响... 详细信息

随着全球人口老龄化的加剧，老年群体中癌症的发病率和死亡率持续上升。肿瘤转移是影响癌症预后的主要原因之一，与年轻病人相比，老年病人的肿瘤转移过程受到衰老相关生物学变化的显著影响。本文分析了衰老对肿瘤转移机制的多方面影响，包括上皮-间质转化、血管老化、免疫衰老、细胞外基质重塑和代谢衰老等方面。上皮-间质转化在癌细胞转移中起关键作用，衰老相关分泌表型会促进此转化，增强肿瘤细胞的侵袭性；血管老化削弱了血管结构，使癌细胞更易穿透；免疫系统的老化则降低了抗肿瘤免疫监视能力，增加了转移风险；细胞外基质的重塑和代谢衰老为肿瘤细胞的生长和扩散提供了适宜环境。深入理解这些机制有助于优化针对老年癌症病人的个性化治疗策略，并为抗衰老干预在癌症防治中的应用提供理论依据。

关键词：衰老肿瘤转移上皮-间质转化血管老化免疫衰老细胞外基质重塑代谢衰老

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医学研究生学报 2022年第7期35卷 680-686页

作者：陈昊方攀奇刘桐言马志飞韩忱成王思炜尹荣许林南京医科大学附属肿瘤医院江苏省肿瘤医院江苏省肿瘤防治研究所恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室南京210009

目的当前关于ZEB1-AS1对肺腺癌血管生成的作用机制尚未明确。文中研究肿瘤相关性成纤维细胞中长链非编码RNALncRNA ZEB1-AS1的表达及其对肺腺癌细胞和血管内皮细胞功能的影响。方法采取RT-PCR检测ZEB1-AS1在肺腺癌组织与配对癌旁正常组... 详细信息

目的当前关于ZEB1-AS1对肺腺癌血管生成的作用机制尚未明确。文中研究肿瘤相关性成纤维细胞中长链非编码RNALncRNA ZEB1-AS1的表达及其对肺腺癌细胞和血管内皮细胞功能的影响。方法采取RT-PCR检测ZEB1-AS1在肺腺癌组织与配对癌旁正常组织以及肺腺癌细胞系,肿瘤相关性成纤维细胞(CAFs)以及配对的正常成纤维细胞中的表达情况。利用特异性小干扰RNA(siRNA)构建ZEB1-AS1低表达CAF细胞系。通过血管生成实验和A549细胞侵袭迁移实验研究CAFs中的ZEB1-AS1对HUVEC血管形成的影响和对肺腺癌浸润的影响。通过酶联免疫吸附反应实验(ELISA)测定沉默ZEB1-AS1CAFs中可能的血管相关性细胞因子,并通过双荧光素酶报告基因实验探究ZEB1-AS1在血管生成调节方面的机制。结果LncRNAZEB1-AS1在肿瘤组织和CAFs中高表达(24.89±19.11),在正常组织和肺腺癌细胞系中低表达(7.09±6.95)。在CAFs中沉默ZEB1-AS1能够抑制HUVEC的血管形成,进而抑制肺腺癌细胞A549的侵袭迁移;并且沉默ZEB1-AS1 CAFs上清中血管内皮生长因子A(VEGFA)分泌减少。双荧光素酶报告基因实验以及统计学分析显示,ZEB1-AS1可能通过竞争性结合miR-505-3p从而促进VEGFA的分泌。结论LncRNA ZEB1-AS1是CAFs高表达的肿瘤血管形成相关的lncRNA,抑制ZEB1-AS1能够抑制HUVEC的血管形成和A549的侵袭转移。ZEB1-AS1可能是肺腺癌潜在的预后标志和治疗靶点。

关键词：肺腺癌 LncRNA ZEB1-AS1 血管形成血管内皮生长因子 miR-505-3p

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构建慢病毒介导缺氧诱导因子HIF-1α在宫颈癌细胞中的表达及其对裸鼠移植瘤的作用

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中国病原生物学杂志 2024年第7期19卷 756-760,767页

作者：阿孜尔古丽·阿布都克日木马红白冰阿瓦汗·吐尔迪古丽仙·吐尔逊于涛新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830017 新疆地方病分子生物学重点实验室中亚高发疾病发病机制与防治国家重点实验乌鲁木齐市沙依巴克区妇幼保健服务中心新疆医科大学附属肿瘤医院山东省寄生虫病防治研究所山东第一医科大学(山东省医学科学院)

目的探讨使用慢病毒载体介导的HIF-1α对裸鼠宫颈癌移植瘤生长、增殖和转移的影响,并寻找宫颈癌新的基因治疗靶点。方法采用慢病毒介导技术,分别在SiHa和C33a细胞中提高C33a细胞的HIF-1α表达,同时敲减SiHa细胞的HIF-1α表达。通过qRT... 详细信息

目的探讨使用慢病毒载体介导的HIF-1α对裸鼠宫颈癌移植瘤生长、增殖和转移的影响,并寻找宫颈癌新的基因治疗靶点。方法采用慢病毒介导技术,分别在SiHa和C33a细胞中提高C33a细胞的HIF-1α表达,同时敲减SiHa细胞的HIF-1α表达。通过qRT-PCR和Western blot技术验证慢病毒转染后HIF-1α表达的效率,并构建裸鼠移植瘤模型。从而验证HIF-1α表达改变对裸鼠体内肿瘤形成、增殖速度、肿瘤体积和肿瘤重量的影响及HIF-1α表达改变对肿瘤发展过程的影响。结果敲减和过表达HIF-1α的SiHa和C33a细胞分别注射于裸鼠左侧腋窝皮下,1周后形成肿瘤,4周后测量移植瘤体积。干扰HIF-1α的裸鼠移植瘤体积较对照组较小,两者差异具有统计学意义(P<0.05),即干扰HIF-1α对裸鼠瘤体的生长具有抑制作用;而HIF-1α过表达后,裸鼠移植瘤体积较对照组较大,两者差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 HIF-1α的表达改变与宫颈癌细胞的增殖和恶化存在一定相关性,HIF-1α表达的改变可以调控肿瘤增殖过程。

关键词：宫颈癌缺氧诱导因子-1α 裸鼠皮下移植瘤模型稳定转染

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管中窥豹:肺癌液态活检的现状与挑战

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中国肿瘤外科杂志 2024年第2期16卷 110-115页

作者：孙钦泓尹荣南京医科大学附属肿瘤医院/江苏省肿瘤医院/江苏省肿瘤防治研究所/江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室胸外科南京210009

肺癌是中国最常见的恶性肿瘤之一,亟需新的诊断方法来检测肿瘤并监测治疗反应。液态活检作为一种非侵入性的肿瘤检测方法在肺癌的早筛诊断和治疗管理中展现出巨大的潜力。液态活检通过分析血液中的循环肿瘤细胞(CTCs)、细胞游离DNA(cfD... 详细信息

肺癌是中国最常见的恶性肿瘤之一,亟需新的诊断方法来检测肿瘤并监测治疗反应。液态活检作为一种非侵入性的肿瘤检测方法在肺癌的早筛诊断和治疗管理中展现出巨大的潜力。液态活检通过分析血液中的循环肿瘤细胞(CTCs)、细胞游离DNA(cfDNA)和循环肿瘤DNA(ctDNA),能够提供关于肿瘤的遗传信息,有利于肺癌早期诊断、病情监测以及疗效评估。相较于传统的组织活检,液态活检具有操作简便、风险低、可以反复进行以及能更全面反映肿瘤异质性等优点。该文回顾了液态活检在肺癌中的应用现状,探讨当前液态活检技术面临的挑战。旨在为肺癌的精准诊疗提供科学依据,推动液态活检技术在临床实践中的应用和发展。

关键词：肺癌液态活检循环肿瘤细胞细胞游离DNA 循环肿瘤DNA

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乳腺癌阿霉素耐药细胞株中转运RNA及其来源片段表达谱分析

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中华实验外科杂志 2022年第8期39卷 1497-1500页

作者：莫冬萍严枫江苏省肿瘤医院南京医科大学附属肿瘤医院江苏省肿瘤防治研究所江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室210009

目的分析阿霉素诱导的MCF-7耐药细胞(MCF-7/Adriamycin, MCF-7/ADR)中转运RNA及其来源片段(tRNA-Derived small RNAs, tDRs)表达谱变化, 筛选出调控乳腺癌阿霉素耐药的tDRs。方法采用高通量测序检测MCF-7/ADR细胞的tDRs表达谱, 筛选差... 详细信息

目的分析阿霉素诱导的MCF-7耐药细胞(MCF-7/Adriamycin, MCF-7/ADR)中转运RNA及其来源片段(tRNA-Derived small RNAs, tDRs)表达谱变化, 筛选出调控乳腺癌阿霉素耐药的tDRs。方法采用高通量测序检测MCF-7/ADR细胞的tDRs表达谱, 筛选差异表达tDRs。基因本体和京都基因与基因组百科全书对差异tDRs进行生物学通路分析。细胞凋亡实验和实时定量聚合酶链反应检测转染后细胞凋亡能力和凋亡相关基因。两两比较采用成组t检验。结果 MCF-7/ADR细胞中73条tDRs存在差异(差异倍数>2, P<0.05)。生物学分析示tDRs的主要功能及通路和肿瘤相关, 尤其是上调的tDRs(tRF-58-75-Ala-AGC-1, tRF-58-75-Ala-AGC-5, tRF-58-75-Pro-AGG-1-M7和tRF-59-76-Tyr-GTA-4)与细胞凋亡关系密切。转染tRF-58-75-Ala-AGC-1抑制剂后, MCF-7/ADR转染组细胞凋亡率高于阴性对照组[(83.34±1.95)%比(71.12±5.01)%, t=3.937, P<0.05];MCF-7/ADR转染组细胞中B细胞淋巴瘤/白血病-2(bcl-2) mRNA表达水平低于阴性对照组(0.58±0.23比1.00±0.05, t=3.025, P<0.05);半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶(Caspase)-3、7、9 mRNA表达水平高于阴性对照组(1.29±0.11、1.50±0.16、1.22±0.07比1.00±0.05, t=4.226、5.296、4.174, P<0.05)。结论 MCF-7/ADR细胞的tDRs表达存在差异。

关键词：转运RNA 阿霉素耐药乳腺癌

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