检索结果-内蒙古大学图书馆

复旦学报（医学版） 2023年第5期50卷 743-749,760页

作者：何沅宸孙传瑞陈胤孜陈晓葳王锡玲复旦大学公共卫生学院卫生统计学教研室上海200032 复旦大学公共卫生安全教育部重点实验室上海200032

目的基于实时再生数建立COVID-19预测模型并开发新冠疫情可视化平台。方法利用上海市卫生健康委员会报告的COVID-19每日感染者数,将2022年3月1日—4月29日作为模型拟合阶段,通过贝叶斯分层模型估算实时再生数的变化情况并预测疫情发展,... 详细信息

目的基于实时再生数建立COVID-19预测模型并开发新冠疫情可视化平台。方法利用上海市卫生健康委员会报告的COVID-19每日感染者数,将2022年3月1日—4月29日作为模型拟合阶段,通过贝叶斯分层模型估算实时再生数的变化情况并预测疫情发展,将4月30日—5月6日作为预测性能评估阶段,使用随机化概率分布变换和分级概率评分评估模型预测结果。使用Python、R等开源软件开发可视化平台。结果上海市疫情的实时再生数于4月5日首次降至1以下,模型预测本轮疫情将于6月中下旬实现“动态清零”,模型预测结果的概率分布和实际观察值在统计学上具有一致性(P=0.12)且集中度较好(382.53±105.29)。可视化平台可实现上海市疫情变化趋势描述和疫情预测两大功能,已于2022年4月19日开放访问。结论该模型预测性能良好,可视化平台填补了国内对COVID-19疫情数据深层次挖掘的空白,具有较好的扩展价值和应用前景。

关键词： COVID-19 实时再生数预测数据可视化

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重叠加权法在药品不良反应信号检测中的模拟研究

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中国药物警戒 2023年第6期20卷 646-650页

作者：韦连慧张朋朋刘永梅郭晓晶许金芳陈枭陈晨鑫叶小飞海军军医大学卫生统计学教研室上海200433 联勤保障部队天津康复疗养中心天津300074

目的通过模拟研究探索重叠加权法在药品不良反应信号检测中均衡混杂因素的效果。方法采用点估计值、标准误、偏倚、均方差、95%置信区间覆盖率综合评价倾向性评分分层、倾向性评分匹配、逆概率加权法及重叠加权法这4种方法在4种不同组... 详细信息

目的通过模拟研究探索重叠加权法在药品不良反应信号检测中均衡混杂因素的效果。方法采用点估计值、标准误、偏倚、均方差、95%置信区间覆盖率综合评价倾向性评分分层、倾向性评分匹配、逆概率加权法及重叠加权法这4种方法在4种不同组间重叠程度时效应估计的准确性和稳定性。结果在本研究的模拟情景中,重叠加权法效应估计的结果最准确、稳定,其他3种方法的准确性和稳定性随着重叠程度的减小均逐渐变差,逆概率加权法差异最大。结论重叠加权法可以作为在药品不良反应信号检测中均衡混杂因素的一种选择。

关键词：药品不良反应信号检测混杂因素重叠加权倾向性评分分层倾向性评分匹配逆概率加权

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倾向性评分加权方法介绍及R软件实现

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中国循证医学杂志 2022年第3期22卷 365-372页

作者：涂博祥秦婴逸吴骋徐宵赵艳芳海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433 中国人民解放军73056部队江苏镇江232000 同济大学医学院上海200092

本文介绍了倾向性评分加权中的逆概率加权和重叠权重加权,以及如何进行均衡性检验及效应量估计,随后介绍并比较了4种可以实现倾向性评分加权的R软件包。

关键词：倾向性评分逆概率加权重叠权重

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多项膨胀效应模型对美国城市4~9岁儿童哮喘危险因素的分析

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复旦学报（医学版） 2021年第1期48卷 47-54页

作者：顾丹彤林燧恒复旦大学公共卫生学院生物统计学教研室上海200032

目的探讨儿童哮喘的主要危险因素,为哮喘的防治提供参考依据。方法建立多项膨胀泊松回归模型,获得数据授权,对美国城市合作哮喘研究(NCICAS)1993—1997年中8个主要城市的数据进行分析。结果共纳入1376名儿童进行分析。发现控制其他协变... 详细信息

目的探讨儿童哮喘的主要危险因素,为哮喘的防治提供参考依据。方法建立多项膨胀泊松回归模型,获得数据授权,对美国城市合作哮喘研究(NCICAS)1993—1997年中8个主要城市的数据进行分析。结果共纳入1376名儿童进行分析。发现控制其他协变量后,年龄每增长1岁,家长汇报患儿气喘的期望天数增加4%;服药次数每增加1次,汇报气喘的期望天数增加7%;与不关心治疗不良反应的家长相比,关心治疗不良反应的家长汇报气喘的期望天数增加12%;以上结果均有统计学意义(P<0.05)。对汇报气喘天数为0天的膨胀数据研究显示:服药次数越少、就医次数越多、儿童行为表现越差,对家长汇报其气喘天数为0具有正效应;儿童行为表现越好,对家长汇报患儿气喘天数为14天具有正效应。结论在调查哮喘症状的危险因素并设计预防和治疗策略时,有必要更加注意基础人群的异质性。对症状严重的儿童进行干预时,心理健康是重要的考虑因素。

关键词：哮喘多项膨胀泊松回归模型儿童

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研究生医学统计学课程思政教学设计与评价

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上海预防医学 2022年第7期34卷 719-723页

作者：吴骋秦婴逸武胜勇王睿海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433

【目的】开展医科院校研究生公共基础课程——医学统计学的课程思政教学设计,并进行实施和评价。【方法】通过专家咨询、文献查阅、调查研究等方法,从3个层面设计课程思政的教学要点,并通过调查问卷了解研究生对课程的认识和需求,评价... 详细信息

【目的】开展医科院校研究生公共基础课程——医学统计学的课程思政教学设计,并进行实施和评价。【方法】通过专家咨询、文献查阅、调查研究等方法,从3个层面设计课程思政的教学要点,并通过调查问卷了解研究生对课程的认识和需求,评价课程的思政效果。【结果】某高校2020级硕士研究生201人,有178人完成调查,占比为88.56%,回收有效问卷率100%。其中,84.27%的研究生认为有必要开展医学统计学课程思政教学,90.45%的研究生希望思政教学能结合案例进行。对比课前、课后的调查结果发现,研究生对待数据采集问题的正确认识有较大提升,从78.65%上升到100.00%;研究生的严谨治学精神从89.88%上升到97.75%。【结论】可结合案例开展研究生医学统计学课程思政教学;对于涉及知识技能实操方面的问题,思政教学效果更好。

关键词：研究生医学统计学课程思政设计实践评价

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磷酸化蛋白质组学联合蛋白质组学分析敲除维甲酸诱导蛋白16对人结肠癌细胞的影响

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肿瘤防治研究 2024年第10期51卷 820-830页

作者：陈奕孛苗根王文丁翠玲戚中田海军军医大学海军医学系生物医学防护教研室上海200433 海军军医大学海军医学系海军营养与食品卫生学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的分析人结肠癌HCT116细胞敲除维甲酸诱导蛋白16(RAI16)后细胞内总蛋白及磷酸化蛋白质表达的差异,探究RAI16影响HCT116细胞蛋白质功能的可能机制及相关信号通路。方法收集并提取HCT116 KO和WT细胞蛋白,SDS-PAGE检验蛋白提取效果。利... 详细信息

目的分析人结肠癌HCT116细胞敲除维甲酸诱导蛋白16(RAI16)后细胞内总蛋白及磷酸化蛋白质表达的差异,探究RAI16影响HCT116细胞蛋白质功能的可能机制及相关信号通路。方法收集并提取HCT116 KO和WT细胞蛋白,SDS-PAGE检验蛋白提取效果。利用胰蛋白酶酶解蛋白后,标记肽段并进行质谱分析。对鉴定到的差异蛋白及差异磷酸化蛋白质利用GO数据库、KEGG数据库和STRING数据库进行生物信息学分析。结果SDS-PAGE结果提示蛋白无明显降解,且实验组与对照组部分关键条带有明显差异;按Foldchange≥1.5或Foldchange≤1/1.5且P<0.05为条件进行差异蛋白的筛选,共筛选出147个上调差异蛋白和230个下调差异蛋白;并筛选到106个上调磷酸化位点和217个下调磷酸化位点。将去本底差异磷酸化位点功能GO富集分析,发现差异蛋白主要在核质、细胞核及细胞质组成,RNA、钙黏着蛋白及染色质结合,DNA修复、RNA剪接及DNA为模板转录的正调控等多个方面有显著富集趋势。KEGG富集结果显示,差异蛋白主要在核质转运、剪接体、细胞周期、细胞间紧密连接、病毒致癌作用和癌症中的微小RNA等通路具有显著富集趋势。蛋白互作网络主要以DDX17、NCL、EEF2、CDK1、SSRP1和SMARCC1为核心蛋白质。统计发现,SKP1、ORC1和BAD等两组学差异变化均上调,且磷酸化差异变化比蛋白差异变化更显著,RBL1、RB1、CDK1、CDC6、MCM4、TFDP1、CHD4和SNW1等两组学差异变化均下调,且磷酸化差异变化比蛋白差异变化更显著。结论RAI16可能通过SKP1、ORC1、RB1和CDK1等关键蛋白质在多方面生物功能和多条信号通路中发挥作用,影响细胞周期,进而影响癌症发生发展。

关键词：结肠癌维甲酸诱导蛋白16 HCT116细胞磷酸化蛋白质组学

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多阅片者多病例设计影像诊断试验样本量估计方法介绍及软件实现

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中国循证医学杂志 2025年第5期 555-561页

作者：宛慧琴向蔓潘喆敏秦婴逸何倩贺佳同济大学医学院海军军医大学卫生统计学教研室

目的探讨多阅片者多病例设计影像诊断试验中的两种样本量估计方法并介绍其软件实现。方法采用Van Dyke数据集在R软件中进行程序演示，使用OR法和DBM法计算阅片者和病例的数量组合，以此作为多阅片者多病例研究的试点试验结果，为后续... 详细信息

目的探讨多阅片者多病例设计影像诊断试验中的两种样本量估计方法并介绍其软件实现。方法采用Van Dyke数据集在R软件中进行程序演示，使用OR法和DBM法计算阅片者和病例的数量组合，以此作为多阅片者多病例研究的试点试验结果，为后续的正式试验提供参数设置的参考。结果当效应量为0.044时，6名阅片者和247名病例时可以达到80%的检验效能；而当效应量大小为0.088时，阅片者为6名，病例仅需44例即可达到80.5%的检验效能。使用OR法和DBM法计算得到的样本量一致，也可以通过两种方法的转换得到相同的样本量计算结果。结论对于多阅片者多病例研究的样本量估计而言，R软件为影像诊断试验中采用多阅片者多病例设计的样本量估计提供了方便成熟的软件包，以此为影像诊断试验选择合适的样本量估计及统计分析方法提供了参考。

关键词：影像诊断试验多阅片者多病例 OR法 DBM法样本量估计

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上海市社区老年人电子衰弱指数的构建与实践

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同济大学学报（医学版） 2024年第1期45卷 51-56页

作者：赵欣欣茅丽玲盛飞唐碧菡陈琪同济大学医学院上海200331 同济大学医学院附属南翔镇社区卫生服务中心上海201802 海军军医大学卫勤教研室上海200433 海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433

目的构建电子衰弱指数(electronic frailty index,eFI)评估社区老年人衰弱状况,为全科医生提供方便快捷的筛查工具。方法选取同济大学医学院附属南翔镇社区卫生服务中心2019—2021年体检数据,构建电子衰弱指数。对2022年10月参加南翔... 详细信息

目的构建电子衰弱指数(electronic frailty index,eFI)评估社区老年人衰弱状况,为全科医生提供方便快捷的筛查工具。方法选取同济大学医学院附属南翔镇社区卫生服务中心2019—2021年体检数据,构建电子衰弱指数。对2022年10月参加南翔镇社区卫生服务中心卫生服务站健康体检的老年人,通过衰弱表型和电子衰弱指数评估衰弱状况,并评价两种评估方法的一致性。结果从南翔镇社区卫生服务中心2019—2021年连续参加老年人健康体检的5 316名研究对象的体检数据中提取41个健康缺陷作为变量构建eFI,研究对象平均年龄(67.7±5.2)岁,男性2 323例,占43.7%,女性2 993例,占56.3%。2019年研究对象衰弱指数的平均值为0.11±0.04,2020年衰弱指数平均值为0.13±0.05,2021年衰弱指数平均值为0.13±0.06。2022年10月社区卫生服务站点参加体检的222名研究对象平均年龄为(69.3±6.7)岁,男性95例,占42.8%,女性127例,占57.2%。以eFI评估的电子衰弱指数平均值为0.11±0.05,15.8%老年人为健壮,63.5%的老年人为衰弱前期,20.7%的老年人为衰弱期;按照衰弱表型评估的衰弱情况:27.5%老年人为健壮,57.2%的老年人为衰弱前期,15.3%的老年人为衰弱;eFI和FP的组内相关系数为0.742,95%CI:0.677~0.796,P<0.001,eFI与FP的一致性较好,eFI与FP评估的衰弱状态的Kappa值为0.503,即eFI与FP评价的衰弱状态具有中等的一致性(Kappa>0.5)。结论基于体检数据构建的电子衰弱指数比较稳健,可为全科医生评估社区老年人衰弱情况提供快捷有效的途径。全科医生可充分利用电子健康档案对社区老年人群进行衰弱评估和管理。

关键词：社区卫生服务中心老年人衰弱全科医学评估

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基于循环神经网络模型的创伤重症患者临床结局的动态预测

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海军军医大学学报 2024年第10期45卷 1241-1249页

作者：齐戈尧徐进金志超海军军医大学(第二军医大学)卫生勤务学系军队卫生与统计学教研室上海200433 中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院兰州730030

目的探讨基于循环神经网络(RNN)算法构建的动态预测模型用于创伤重症患者临床结局动态预测的价值,并研究动态策略和实时预测模型可行的搭建方案及路径。方法本研究数据来源于美国重症监护医学信息数据库(MIMIC)-Ⅳ2.0。以创伤重症患... 详细信息

目的探讨基于循环神经网络(RNN)算法构建的动态预测模型用于创伤重症患者临床结局动态预测的价值,并研究动态策略和实时预测模型可行的搭建方案及路径。方法本研究数据来源于美国重症监护医学信息数据库(MIMIC)-Ⅳ2.0。以创伤重症患者院内结局为预测目标,使用长短时记忆(LSTM)和门控循环单元(GRU)2种RNN算法分别在4、6和8 h时间窗下训练动态预测模型。使用灵敏度、特异度、F1值和AUC值对模型性能进行评价,并分析不同RNN算法和时间窗对模型性能的影响。在8 h时间窗下分别训练隐马尔科夫模型(HMM)、随机森林(RF)模型和logistic模型作为对照,横向比较2种RNN算法模型与对照模型的性能指标,并分析各模型的时间趋势变化。结果在不同时间窗时,RNN动态模型在灵敏度、特异度、F1值和AUC值等4个性能指标上差异均有统计学意义(均P<0.001),在8 h时间窗时模型的各性能指标均高于6 h和4 h时;不同RNN算法(LSTM和GRU)间仅特异度差异有统计学意义(P=0.036)。横向比较结果显示,2种RNN算法模型和其他模型间各性能指标差异均有统计学意义(均P<0.001),2种RNN算法模型各指标均高于HMM、RF和logistic模型;各算法模型灵敏度、特异度和F1值的ICC均小于0.400(95% CI未包含0),而AUC值的ICC在统计学上证据不足(95% CI包含0)。结论基于RNN算法的动态模型对创伤重症患者临床结局的预测效果较其他常见模型具有一定优势,且时间窗对模型性能可能存在影响。

关键词：循环神经网络长短期记忆网络门控循环单元创伤动态模型临床结局预测模型

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运用信息成分方法分析伊布替尼的不良反应

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中国药物警戒 2022年第11期19卷 1228-1232页

作者：郑轶郭晓晶许金芳郭志坚迟立杰陈晨鑫梁际洲韦连慧陈枭叶小飞贺佳海军军医大学卫勤系军队卫生统计学教研室上海200433

目的全面系统地挖掘伊布替尼导致的药品不良反应(ADR),为临床医生安全用药提供参考。方法运用信息成分(IC)方法,基于美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)数据库对从建库至2021年6月1日中伊布替尼的ADR进行挖掘。结果FA... 详细信息

目的全面系统地挖掘伊布替尼导致的药品不良反应(ADR),为临床医生安全用药提供参考。方法运用信息成分(IC)方法,基于美国食品药品监督管理局(FDA)不良事件报告系统(FAERS)数据库对从建库至2021年6月1日中伊布替尼的ADR进行挖掘。结果FAERS数据库种共有伊布替尼ADR报告20120份,检测出阳性信号445个,包括Richter综合征[IC的95%置信区间下限(IC_(025))=5.67]和脑曲霉病(IC_(025)=5.05)2种IC_(025)>5的强信号ADR。房颤(n=982,IC_(025)=3.33,IC=3.44),疲乏(n=958,IC_(025)=0.36,IC=0.47),腹泻(n=931,IC_(025)=0.64,IC=0.75)是3种发生频数最高的ADR,其报告数均超过900份。结论伊布替尼在多个系统存在较为广泛的ADR,临床医生应充分关注其ADR,并及时采取相应措施保证患者的用药安全。

关键词：伊布替尼药品不良反应不成比例分析方法美国食品药品监督管理局不良事件报告系统数据库

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