检索结果-内蒙古大学图书馆

合成生物学 2023年第4期4卷 738-755页

作者：林继聪邹根刘宏民魏勇军郑州大学药学院郑州大学药物研究院郑州大学合成生物学实验室药物关键制备技术教育部重点实验室河南郑州450001 上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海201403

丝状真菌能够合成抗生素、色素、酶制剂、激素等多种天然产物,广泛应用于医药、化工、农业和基础生物学研究等领域。丝状真菌遗传背景复杂,阻碍了对其的进一步开发利用。基因组编辑是基于核酸酶对基因组位点特异性序列进行靶向切割,产... 详细信息

丝状真菌能够合成抗生素、色素、酶制剂、激素等多种天然产物,广泛应用于医药、化工、农业和基础生物学研究等领域。丝状真菌遗传背景复杂,阻碍了对其的进一步开发利用。基因组编辑是基于核酸酶对基因组位点特异性序列进行靶向切割,产生双链断裂,从而通过非同源末端连接或同源重组进行修复的技术。其中,CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)系统是目前使用最普遍的基因组编辑技术,已在丝状真菌遗传育种、基因改造和多种天然产物合成等方面进行了大量应用。本文总结了丝状真菌CRISPR/Cas的技术原理、元件表达、递送方式及该系统在次级代谢产物等研究中的应用。对于脱靶效应以及转化率低的问题,本文讨论了可能的解决方法。在此基础上,展望了基于CRISPR/Cas的基因组编辑技术在真菌基因功能表征、天然产物合成代谢途径解析与重构、高效丝状真菌底盘细胞构建、天然产物合成等方面的应用。

关键词：丝状真菌 CRISPR/Cas系统次级代谢产物基因敲除异源表达

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高产孢灵芝新种质的创制及影响产孢基因的挖掘

高产孢灵芝新种质的创制及影响产孢基因的挖掘

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中国菌物学会2024年学术年会

作者：余香霖张赫男谭贻孟晶蒋家森张劲松唐传红上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室

本研究以主栽品种‘沪农灵芝1号’为出发菌株,利用ARTP诱变创制新菌株并结合出芝试验,筛选获得孢子粉产量较‘沪农灵芝1号’高出25%的HS34和低产孢子粉的LS170。对产孢性状存在显著差异的突变株进行基因组重测序分析。对上述两个产孢性... 详细信息

本研究以主栽品种‘沪农灵芝1号’为出发菌株,利用ARTP诱变创制新菌株并结合出芝试验,筛选获得孢子粉产量较‘沪农灵芝1号’高出25%的HS34和低产孢子粉的LS170。对产孢性状存在显著差异的突变株进行基因组重测序分析。对上述两个产孢性状表现差异大的两个新菌株和出发菌株的重测序发现,HS34 vs H1共检测出18003个SNP分别位于2305个基因上,LS170 vs H1之间共检测出52624个SNP分别位于2793个基因上。对检测出的位于编码区的非同义突变SNP基因进行GO注释和KEGG通路富集分析。HS34 vs H1共富集到523个GO术语。主要涉及膜的整体成分和固有成分的组成,影响有机环、杂环化合物、金属离子以及核酸的结合的分子功能,参与DNA整合及各种代谢过程,KEGG注释在半乳糖代谢途径通路上显著富集;LS170 vs H1共富集到869个GO术语,主要涉及Ctf18 RFC样复合物、细胞核和染色体的组成及影响各种环状化合物及金属离子的结合,参与DNA整合及各种代谢过程,KEGG注释在半乳糖代谢途径、嘌呤代谢途径、谷胱甘肽代谢途径、淀粉和蔗糖代谢途径及甘油磷脂代谢途径上显著富集。HS34的CDS区特有的InDel位点共160个,LS170的CDS区特有的InDel位点共634个。对上述三个菌株从幼嫩子实体到大量产孢成熟子实体的不同发育阶段的转录组分析发现,与幼嫩子实体相比,在成熟子实体H1、HS34、LS170中分别有433、1899、1576个差异表达基因。其中HS34上调基因数比LS170高1.68倍,下调基因无显著差异;在170个共有差异表达基因中有141个趋势一致的差异表达基因,其中包含108个上调基因,33个下调基因。对共有差异基因进行GO、KEGG富集分析与表达趋势分析确定了糖异生(戊糖葡萄糖醛酸酯相互转化)和乙醛酸盐二羧酸代谢为产孢发育供能,NADH为产孢过程中的重要能量来源;鞘糖脂的合成及糖胺聚糖的降解为产孢提供结构物质;Hop1、Wis1、Mek1、SPO5和MSH4等基因的差异表达可能影响了孢子产量。

关键词：灵芝 ARTP诱变孢子粉产量产孢相关基因

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原生质体再生技术复壮金针菇退化菌株的研究

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上海农业学报 2023年第3期39卷 10-16页

作者：张丹朱秋瑾谭琦宋春艳于海龙王瑞娟尚晓冬刘建雨上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点开放实验室上海201403

利用原生质体再生技术对白色金针菇退化菌株进行复壮,研究复壮后菌株与正常菌株的菌丝生长性状及工厂化栽培的农艺性状,并对复壮前后的菌株进行了基于转录组的单核苷酸多态性检测和特异表达基因分析。结果表明:原生质体再生技术是白色... 详细信息

利用原生质体再生技术对白色金针菇退化菌株进行复壮,研究复壮后菌株与正常菌株的菌丝生长性状及工厂化栽培的农艺性状,并对复壮前后的菌株进行了基于转录组的单核苷酸多态性检测和特异表达基因分析。结果表明:原生质体再生技术是白色金针菇菌种复壮的有效手段,复壮菌株的菌丝生长速率、生育期、原基形成时间、菇盖直径、菌柄长度、单瓶子实体数量以及单瓶产量可恢复至正常菌株水平。复壮菌株较退化菌株的遗传背景发生了变化,其单核苷酸多态性位点数比退化菌株多,且大部分位于基因密码子区域。复壮菌株中与细胞吞噬、能量代谢、抗氧化、细胞骨架构建以及细胞DNA甲基化修饰等相关的基因特异表达。

关键词：金针菇菌种退化复壮原生质体再生单核苷酸多态性

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野生香菇菌株农艺性状分析及其子实体氨基酸营养评价

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上海农业学报 2023年第1期39卷 32-39页

作者：黄卫华陈洪雨鲍大鹏杨瑞恒陶祥生吴国锋黄建锋庆元县食用菌产业中心(庆元县食用菌科研中心) 丽水323800 上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点开放实验室上海201403

为发掘优质香菇种质资源,从50个野生香菇菌株中筛选优秀菌株,检测其子实体中氨基酸水平,通过主成分分析(PCA)方法分析样品间氨基酸差异,并基于氨基酸评分(AAS)、IOM模式评分(IOMS)和化学评分(CS)评估其营养价值。结果表明:有49个菌株可... 详细信息

为发掘优质香菇种质资源,从50个野生香菇菌株中筛选优秀菌株,检测其子实体中氨基酸水平,通过主成分分析(PCA)方法分析样品间氨基酸差异,并基于氨基酸评分(AAS)、IOM模式评分(IOMS)和化学评分(CS)评估其营养价值。结果表明:有49个菌株可以出菇,优选出11个菌株,最高产量达291.77 g∕袋。回归分析表明子实体产量和朵数呈正相关(R2=0.8406)。各优选菌株栽培香菇的干品中氨基酸总量达到13.24%-16.29%,其中必需氨基酸(IAA)占比为41.13%-42.39%。PCA抽取的两个主成分分别解释82.89%和9.15%的样品差异。19号、9号和20号菌株栽培的香菇在氨基酸水平上具有优势。AAS和IOMS显示各优选菌株栽培香菇蛋白质中的IAA达到WHO和IOM的推荐要求,但CS模型显示香菇蛋白质营养价值总体不如鸡蛋蛋白质,甲硫氨酸是香菇蛋白质中的优势氨基酸。

关键词：香菇菌株生物转化率氨基酸营养价值

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中国广义虫草种类及其驯化栽培研究进展

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食用菌学报 2023年第5期30卷 113-148页

作者：李传华杨双双邓旺秋林群英上海市农业科学院食用菌研究所国家食用菌工程技术研究中心农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室上海201403 广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东广州510070 中华全国供销合作总社南京野生植物综合利用研究所江苏南京210110

在中国发现的广义虫草据统计至少有299个,可形成子实体或棒束孢的种类至少有40个;虽然广义虫草物种在中国丰富多样,但只有4种可实现商业化栽培;系统总结可形成子实体或孢梗束的广义虫草的研究进展,并指出广义虫草在菌种、菌群复合群、... 详细信息

在中国发现的广义虫草据统计至少有299个,可形成子实体或棒束孢的种类至少有40个;虽然广义虫草物种在中国丰富多样,但只有4种可实现商业化栽培;系统总结可形成子实体或孢梗束的广义虫草的研究进展,并指出广义虫草在菌种、菌群复合群、驯化等方面存在的问题,提出未来研究重点的建议,以期为中国广义虫草的研究提供参考。

关键词：肉座菌目多样性菌种商业化问题

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香菇菌棒集约化生产技术规程

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上海农业学报 2023年第3期39卷 100-108页

作者：周峰董浩然章炉军李玉姜宁宋春艳尚晓冬谭琦于海龙上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点开放实验室上海201403

针对目前香菇菌棒集约化、设施化生产各环节缺乏操作规范的产业问题,通过多年、多点、多平台技术研发、参数优化及产业化应用,形成了香菇菌棒集约化生产技术规程。该技术规程在现有国家和行业标准的基础上,进一步规范和涵盖了菌棒集约... 详细信息

针对目前香菇菌棒集约化、设施化生产各环节缺乏操作规范的产业问题,通过多年、多点、多平台技术研发、参数优化及产业化应用,形成了香菇菌棒集约化生产技术规程。该技术规程在现有国家和行业标准的基础上,进一步规范和涵盖了菌棒集约化生产过程中的厂区选址及布局、设施设备、品种选择、栽培基质、料棒制作、灭菌、冷却、接种、菌棒培养、菌棒贮存等环节的作业技术要求及香菇菌棒集约化生产模式的核心技术,并针对菌棒制作过程出现的微孔、胀袋、灭菌不彻底、污染等问题提出了相应对策。该研究可为促进适合我国现阶段香菇生产模式的转型升级提供技术支撑。

关键词：香菇菌棒集约化设施化技术规程生产模式

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猴头菌UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因克隆表达及酶学性质

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菌物学报 2021年第9期40卷 2330-2340页

作者：任鄄宝邹根张忠陈万超吴迪张赫男龚明杨焱上海海洋大学食品学院上海201306 国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201403

通过实验室前期对诱变菌株猴头菌321的多组学分析结果,获得了一个多糖合成过程中起关键作用的UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因(UDP-glucose-4-epimerase,UGE),并在大肠杆菌E. coli BL21(DE3)中进行了异源表达。通过筛选最优的目的蛋白诱导... 详细信息

通过实验室前期对诱变菌株猴头菌321的多组学分析结果,获得了一个多糖合成过程中起关键作用的UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因(UDP-glucose-4-epimerase,UGE),并在大肠杆菌E. coli BL21(DE3)中进行了异源表达。通过筛选最优的目的蛋白诱导表达条件后,通过镍柱亲和层析纯化后获得高纯度目的蛋白,并对目的蛋白进行了酶学性质的研究,明确了其生物学性质和动力学参数,为其开发利用提供理论参考。

关键词：基因克隆诱导表达蛋白纯化酶学性质

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代料和段木栽培瓦尼桑黄子实体分级醇沉粗多糖理化性质及活性

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食用菌学报 2022年第5期29卷 81-89页

作者：楚文琪吴迪李正鹏陈万超张忠李文张劲松杨焱上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发中心上海201403 上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 上海菇林源菌业专业合作社上海201615

用20%、50%、70%乙醇分级醇沉栎树木屑代料栽培(DL)、桑树木屑代料栽培(DS)、柞树段木栽培二年生(D 2)和三年生(D 3)瓦尼桑黄(Sanghuangporus vaninii,以下简称桑黄)子实体粗多糖,并比较同一醇沉组分下,4种粗多糖的多糖含量、总酚含量... 详细信息

用20%、50%、70%乙醇分级醇沉栎树木屑代料栽培(DL)、桑树木屑代料栽培(DS)、柞树段木栽培二年生(D 2)和三年生(D 3)瓦尼桑黄(Sanghuangporus vaninii,以下简称桑黄)子实体粗多糖,并比较同一醇沉组分下,4种粗多糖的多糖含量、总酚含量、重均分子量分布、单糖组成、免疫活性和抗氧化活性。结果表明:就多糖含量而言,在3个醇沉组分中,50%醇沉组分的差异最显著,段木栽培D 2、D 3(54.56%、58.55%)高于代料栽培DL、DS(32.42%、33.56%)。就总酚含量而言,在20%醇沉组分中,DL、DS、D 2(10.65%、15.47%、15.70%)较高,而D 3在50%、70%醇沉组分中(9.98%、8.43%)均较高。就重均分子量而言,在3个醇沉组分中,与DL、D 2和D 3相比,DS的重均分子量均较小;在50%醇沉组分中,DL、D 2、D 3主要分布在1.359×10^(5)、7.439×10^(4)、6.823×10^(4);在70%醇沉组分中,DL、D2、D3主要分布在1.124×10^(5)、2.417×10^(4)、2.179×10^(4)。就单糖组成而言,在20%醇沉组分中,D 3仅由葡萄糖构成,在50%与70%醇沉组分中DL均由半乳糖、葡萄糖和甘露糖构成,而D2的单糖组成最复杂。就免疫活性而言,在3个醇沉组分中,50%醇沉组分的差异最显著,柞树段木栽培的D 2和D 3刺激巨噬细胞释放NO的量高于代料栽培的DL和DS。就抗氧化活性而言,在3个醇沉组分中,D 2对DPPH和ABTS自由基清除率均高于DL、DS和D 3。人工栽培瓦尼桑黄可根据需要的活性组分和栽培适应性选择合适的栽培料和栽培方式。

关键词：代料栽培段木栽培分级醇沉体外免疫活性抗氧化活性

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不同碳氮源对香菇液体菌种生长的影响

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上海农业学报 2024年第1期40卷 40-46页

作者：王宇星董浩然章炉军李玉李巧珍谭琦赵勇周峰上海海洋大学食品学院上海201306 上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室上海201403 山东御苑生物科技有限公司临沂276000

以香菇‘沪香F2’为试验材料,探究了9种碳源配方和10种氮源配方对菌丝在固体培养基上生长速度、在液体培养基中菌丝生物量和发酵固形物体积比以及发酵完成时接种后菌丝在木屑试管中生长速度的影响。结果表明:在固体培养基上,以糖蜜为碳... 详细信息

以香菇‘沪香F2’为试验材料,探究了9种碳源配方和10种氮源配方对菌丝在固体培养基上生长速度、在液体培养基中菌丝生物量和发酵固形物体积比以及发酵完成时接种后菌丝在木屑试管中生长速度的影响。结果表明:在固体培养基上,以糖蜜为碳源时,菌丝生长速度最快,达6.10 mm∕d,以木糖为碳源时,菌丝生长速度最慢,仅3.84 mm∕d;以麸皮为氮源时,菌丝生长速度为4.01 mm∕d,以尿素为氮源时,菌丝生长速度最慢,仅3.19 mm∕d。在液体培养基中,以糖蜜为主要碳源时,菌丝生物量达8.04 g∕L,发酵固形物体积比达98.69%;以麸皮为主要氮源时,菌丝生物量达7.90 g∕L,发酵固形物体积比达96.57%。相关性分析发现,在不同碳源的固体培养基上,菌丝生长速度与菌丝生物量呈显著正相关;在不同氮源的液体培养基中,菌丝生物量与发酵固形物体积比呈显著正相关;不同碳氮源的菌丝生物量与菌丝接种后在木屑试管中的生长速度呈显著正相关。综上,糖蜜和麸皮是香菇液体菌种最佳的碳氮源组合。该研究结果可为工厂化香菇液体菌种原材料的选择提供参考。

关键词：香菇液体菌种菌丝生长速度菌丝生物量发酵固形物体积比

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香菇菌渣多糖的高压复合酶提取及其抗炎活性研究

香菇菌渣多糖的高压复合酶提取及其抗炎活性研究

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中国食品科学技术学会第二十届年会

作者：张忠吴迪颜梦秋李文陈万超刘艳芳张劲松杨焱上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心

我国香菇产业的快速发展导致大量废弃菌渣的产生,给生态环境带来了巨大压力。因此,研究废弃菌渣的综合利用具有重要意义。本研究采用复合酶和高压预处理相结合的方法从香菇菌渣中提取多糖。利用单因素和响应面优化得到最佳提取条件为:... 详细信息

我国香菇产业的快速发展导致大量废弃菌渣的产生,给生态环境带来了巨大压力。因此,研究废弃菌渣的综合利用具有重要意义。本研究采用复合酶和高压预处理相结合的方法从香菇菌渣中提取多糖。利用单因素和响应面优化得到最佳提取条件为:复合酶（纤维素、木聚糖酶、β-葡聚糖酶）的比例为3:2:1;酶的总量为660 U·g;液料比,20 mL/g;温度,45℃;时间,6 h;粗提物再经过醇沉透析后所得香菇菌渣粗多糖（LE-UE）的产率为5.98%,含量为51.60%。LE-UE通过抑制NO的释放和炎性细胞因子的分泌,显著改善LPS诱导的巨噬细胞RAW264.7的炎症损伤。动物实验表明,LE-UE可通过调节氧化应激水平显著改善溃疡性结肠炎小鼠的组织病理学损伤和炎症,并通过下调mRNA表达和蛋白质水平减少炎性细胞因子的释放。因此,LE-UE具有显著的抗炎活性,可作为一种新型的抗炎药用于治疗。该研究为香菇废弃菌渣的高值化利用提供了科学依据,也为开发用于溃疡性结肠炎治疗的功能性食品和新型抗炎剂提供了理论依据。

关键词：香菇菌渣多糖抗炎活性高压复合酶

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