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食用菌 2017年第3期39卷 3-4页

作者：李玉张振宇尚晓冬宋春艳李正鹏谭琦周峰上海市农业科学院食用菌研究所/农业部南方食用菌资源利用重点实验室/国家食用菌工程技术研究中心/国家食用菌加工技术研发分中心/农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室/上海市农业遗传育种重点开放实验室上海奉贤201403 山东七河生物科技股份有限公司山东淄博255100

近几年在国家政策的推动下,香菇产业转型升级,不少企业投资建设香菇菌棒工厂化生产车间。在扼要介绍香菇菌棒工厂化生产技术要点的基础上,分析其运作难点,建议香菇菌棒工厂化生产企业选址前要重点考虑当地气候条件,已经投资建设的企业... 详细信息

近几年在国家政策的推动下,香菇产业转型升级,不少企业投资建设香菇菌棒工厂化生产车间。在扼要介绍香菇菌棒工厂化生产技术要点的基础上,分析其运作难点,建议香菇菌棒工厂化生产企业选址前要重点考虑当地气候条件,已经投资建设的企业要配套其他品种或开拓出口市场提高设施设备利用率。

关键词：香菇菌棒生产工厂化

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灵芝醇提物通过抑制AR表达对LNCaP前列腺癌细胞凋亡的影响

灵芝醇提物通过抑制AR表达对LNCaP前列腺癌细胞凋亡的影响

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2013年灵芝产品研究与开发学术研讨会

作者：汪雯翰张劲松杨焱吴迪严梦秋章慧国家食用菌工程技术研究中心农业部应用真菌资源与利用重点开发实验室上海市农业遗传育种重点开发实验室上海市农业科学院食用菌研究所

以桑黄、桦褐孔菌、灵芝、蛹虫草、姬松茸、鸡腿菇、猴头、灰树花、香菇和杏鲍菇等十种食药用菌作为研究对象,利用LNCaP前列腺癌细胞模型比较了10种食药用菌醇提物抗肿瘤功效,并进一步探讨活性醇提物是否通过雄激素信号通路发挥抗前列... 详细信息

以桑黄、桦褐孔菌、灵芝、蛹虫草、姬松茸、鸡腿菇、猴头、灰树花、香菇和杏鲍菇等十种食药用菌作为研究对象,利用LNCaP前列腺癌细胞模型比较了10种食药用菌醇提物抗肿瘤功效,并进一步探讨活性醇提物是否通过雄激素信号通路发挥抗前列腺癌功效。研究结果表明,在十种食用菌中灵芝醇提物抑制LNCaP细胞增殖效果最好,而进一步的实验表明灵芝通激活CAS3和PAPR凋亡相关信号通路来促进肿瘤细胞凋亡,从而发挥其抑制细胞增殖作用,研究同时发现灵芝醇

关键词：醇提物前列腺癌 LNCaP 癌细胞凋亡

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香菇135菌株特异SCAR标记的分布和遗传特性

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食用菌学报 2008年第4期15卷 1-10页

作者：张美彦尚晓冬谭琦陈明杰潘迎捷中华人民共和国农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室上海市食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201106 上海海洋大学上海200090

用香菇(Lentinula edodes)135菌株的特异SCAR(Sequence Characterized Amplified Region)引物135F/R(扩增601bp的条带)对135菌株的58个原生质体单核体和97个孢子单核体的基因组DNA进行扩增.检验此特异标记在单核体中的分布和遗传规律。... 详细信息

用香菇(Lentinula edodes)135菌株的特异SCAR(Sequence Characterized Amplified Region)引物135F/R(扩增601bp的条带)对135菌株的58个原生质体单核体和97个孢子单核体的基因组DNA进行扩增.检验此特异标记在单核体中的分布和遗传规律。原生质体单核体分为两种交配型A1B1和A2B2,此标记仅存在于后一种核中;另外,此标记在四种交配型的孢子单核体后代中随机分布,显示这个SCAR标记可以稳定遗传到后代,而且与交配型A、B因子之间没有连锁关系。

关键词：遗传规律香菇交配型特异SCAR标记

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香菇杂交新品种“申香16”的选育及示范推广

香菇杂交新品种“申香16”的选育及示范推广

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第九届全国食用菌学术研讨会

作者：宋春艳刘德云尚晓冬谭琦项寿南国家食用菌工程技术研究中心农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所浙江省丽水市农业科学研究院

以香菇939菌株、135菌株为亲本,利用原生质体单核化技术,采用对称杂交和非对称杂交方法进行杂交,通过数年栽培试验筛选获得一株高产、高抗、短柄的新菌株——S605,审定名为"申香16"。该品种改良了939菌柄偏长和135抗性差、产... 详细信息

以香菇939菌株、135菌株为亲本,利用原生质体单核化技术,采用对称杂交和非对称杂交方法进行杂交,通过数年栽培试验筛选获得一株高产、高抗、短柄的新菌株——S605,审定名为"申香16"。该品种改良了939菌柄偏长和135抗性差、产量不稳的不足,示范推广中表现出转潮快、产量高、易管理、优质菇比例高的突出特点,产生的经济效益显著,深得菇农喜爱,推广速度较快。

关键词：香菇原生质体杂交育种申香16(S605)

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层迭灵芝中三萜类化合物的分离和结构鉴定研究

层迭灵芝中三萜类化合物的分离和结构鉴定研究

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中国菌物学会2018年学术年会

作者：冯娜刘伟唐庆九张劲松上海市农业科学院食用菌研究所国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室华东理工大学药学院

层迭灵芝（Ganoderma lobatum）又名裂迭灵芝、裂叠灵芝、层迭树舌,是灵芝属树舌亚属的一种真菌,在民间有药用历史,但尚无对其化学成分和药理活性的科学研究。该种在我国主要分布于亚热带地区,目前在泰国有少量人工栽培。本研究首次对... 详细信息

层迭灵芝（Ganoderma lobatum）又名裂迭灵芝、裂叠灵芝、层迭树舌,是灵芝属树舌亚属的一种真菌,在民间有药用历史,但尚无对其化学成分和药理活性的科学研究。该种在我国主要分布于亚热带地区,目前在泰国有少量人工栽培。本研究首次对层迭灵芝中的三萜化合物进行了分离纯化和结构鉴定。将层迭灵芝子实体3.0 kg粉碎后,以1:20的料液比加入95%乙醇提取3次,合并浓缩。将浓缩获得的提取物用80%乙醇复溶制成混悬液,然后用石油醚等体积萃取3次,获得富含灵芝三萜的样品。采用C18反相色谱柱、乙腈:水梯度洗脱,通过中高压和高压制备液相,对层迭灵芝子实体中三萜类化合物进行分离纯化,并将得到的化合物通过紫外、质谱、核磁等分析方法检测,共鉴定得到7个三萜类化合物,分别为树舌环氧酸A,C,E,F,G、H和20-Hydroxy-3,12,15,23-tetraoxolanosta-7,9（11）,16-trien-26-oic acid。以上化合物均为首次从层迭灵芝中获得。以体外抑制肿瘤细胞L1210增殖实验模型来验证三萜化合物的活性。结果表明,树舌环氧酸E和树舌环氧酸G具有良好的抗肿瘤效果,其IC50值分别为135.9μg/mL和192.9μg/mL。

关键词：层迭灵芝三萜化合物结构鉴定增殖抑制

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在全基因组规模上对香菇单核体间单核苷酸多态性（SNP）的挖掘与分析

在全基因组规模上对香菇单核体间单核苷酸多态性（SNP）的挖掘与...

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第九届全国食用菌学术研讨会

作者：陈祥区骏恒鲍大鹏关海山国家食用菌工程技术研究中心农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所香港中文大学生物系

香菇是我国食用菌产业一种主要的栽培品种。香菇栽培产业的发展促进了对香菇遗传学研究的深入。新一代高通量测序技术的迅猛发展为研究人员了解香菇的全基因组和单核苷酸多态性（SNP）提供了很好的研究手段。通过454 GS FLX高通量测序... 详细信息

香菇是我国食用菌产业一种主要的栽培品种。香菇栽培产业的发展促进了对香菇遗传学研究的深入。新一代高通量测序技术的迅猛发展为研究人员了解香菇的全基因组和单核苷酸多态性（SNP）提供了很好的研究手段。通过454 GS FLX高通量测序对香菇135菌株的两个原生质体单核体菌株（Le135A和Le135B）进行全基因组测序,分别得到了57万（200 M）和64万（230 M）条reads,通过去除冗余数据、重复序列和低质量的核苷酸等步骤后,得到了约65%的reads用于拼接,拼接结果分别得到了深度均约为6倍覆盖率的contig。将这些contig和灰盖鬼伞（Coprinopsis cinerea）的全基因组序列进行比对,结果显示约有20%的序列相互之间有高度的保守性。随后,在香菇的全基因组测序结果中进行了SNP数据挖掘,比对Le135A和Le135B的contig,共发现了124 591个SNPs位点,通过对这些SNPs位点的进一步分析,发现了众多在TheSingle Nucleotide Polymorphism Database（dbSNP）中并未报道的SNP位点,这些位点信息为食用真菌基因组和QTL mapping的研究提供了有价值的信息,并且本研究中所采用的分析方法也可为食用真菌单倍体的SNP相关研究提供借鉴。

关键词：香菇高通量测序 SNP

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猴头菌多糖合成关键基因A6180的克隆和异源表达

猴头菌多糖合成关键基因A6180的克隆和异源表达

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中国食品科学技术学会第十七届年会

作者：任鄄宝邹根张赫男吴迪张忠李文杨焱上海海洋大学食品学院上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点开放实验室

猴头菌（Hericium erinaceu）是我国著名的珍贵食药兼用菌,其主要的生物活性成分是猴头菌多糖,具有免疫调节、抗癌、降血脂和保护胃黏膜等多种功效。基于猴头菌三代全基因组测序和多糖的差异多组学分析结果,对一株高产多糖的猴头菇突变... 详细信息

猴头菌（Hericium erinaceu）是我国著名的珍贵食药兼用菌,其主要的生物活性成分是猴头菌多糖,具有免疫调节、抗癌、降血脂和保护胃黏膜等多种功效。基于猴头菌三代全基因组测序和多糖的差异多组学分析结果,对一株高产多糖的猴头菇突变株的关键基因进行挖掘,发现编码UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因A6180在突变株中显著上调,可能和猴头菇多糖高产有关。为了验证该基因在多糖合成过程中的关键功能,在对其编码序列进行密码子优化后,分别在大肠杆菌和酿酒酵母中进行异源过表达来验证其酶学性质及生物学功能,为在猴头菌中进行过表达获得高产多糖菌株奠定基础。在大肠杆菌中异源表达的重组蛋白经过纯化后进行对其酶学特性进行测定,可以高效地将UDP-葡萄糖转化成UDP-半乳糖,相关酶活达（1.107±0.07） U/mg,证实了此目的基因发挥着UDP-葡萄糖-4-差向异构酶活性。同时在酿酒酵母中的异源表达的结果也初步验证了该基因对猴头菇活性多糖结构和功能有着关键作用。本研究利用分子生物学技术进行高产多糖优势菌株关键基因进行功能表征,为猴头菇生物活性多糖合成途径的解析奠定基础。

关键词：猴头菌活性多糖异源表达 UDP-葡萄糖-4-差向异构酶

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斑玉蕈菌种质量评价方法的优化研究

斑玉蕈菌种质量评价方法的优化研究

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2012年中国菌物学会学术年会

作者：陈辉刘洋赵楚楚于海龙张津京冯志勇国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所南京农业大学生命科学学院

在此前斑玉蕈菌种质量评价方法的基础上,通过考察液体培养终颜色、可见光谱分析,对碳源、氮源单因素及正交设计方法优化培养基成分,提升斑玉蕈质量优（SIEF4104）、劣（SIEF4078）菌株间的LBL评价方法的差异性和显著度,并确立优化液体... 详细信息

在此前斑玉蕈菌种质量评价方法的基础上,通过考察液体培养终颜色、可见光谱分析,对碳源、氮源单因素及正交设计方法优化培养基成分,提升斑玉蕈质量优（SIEF4104）、劣（SIEF4078）菌株间的LBL评价方法的差异性和显著度,并确立优化液体培养基组成（g/L）:200.0马铃薯,20.0乳糖,2.0麦芽提取物,1.0 MgSO4·7H20,3.0 KH2P04,0.06溴百里酚兰,pH 7.0,上述优劣菌株DR（脱色率）值的差值从优化前的72,提升到优化后的101,差异度提升了40.3%。本研究还发现,无机氮源相对于有机氮源该评价方法中对液体培养DR值普遍较低。上述结果将有益于技术人员开发相关试剂盒时,进一步提高该方法对优劣菌株的区分度。同时,通过不同碳源和有、无机氮源的比较及显色差异,启示我们该评价方法作用机理可能与代谢底物存在相关性。

关键词：斑玉蕈菌种质量评价液体培养溴百里酚兰优化

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草菇全基因组框架图的构建和序列分析

草菇全基因组框架图的构建和序列分析

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中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会

作者：鲍大鹏赵国屏谭琦王升跃陈明杰郑华军张劲松朱永强汪虹康慧陈祥林楠冯爱萍国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所国家人类基因组南方研究中心

草菇是一种重要的常规栽培种类,其栽培起源于我国,具有悠久的栽培历史,在国际上有"中国菇"之称。草菇味道鲜美,营养丰富,并具有一定的保健作用,在中国的华南地区及东南亚等地区一直很受欢迎。草菇是食用菌中主要的草腐菌,以... 详细信息

草菇是一种重要的常规栽培种类,其栽培起源于我国,具有悠久的栽培历史,在国际上有"中国菇"之称。草菇味道鲜美,营养丰富,并具有一定的保健作用,在中国的华南地区及东南亚等地区一直很受欢迎。草菇是食用菌中主要的草腐菌,以稻草、麦秆、废棉为生长基质。但是草菇的生物学转化率比较低,一般只有20%,远远低于其它食用菌100-150%的生物学转化率。草菇一个特有的生物学性状是在摄氏4度低温下发生自溶,这使得草菇成为唯一不能低温储运的食用菌。这也导致草菇的货架期很短,从而极大地限制了草菇栽培的普及。如何解决这些问题,多年来一直是食用菌遗传育种科研工作者努力研究的目标。由于对草菇的遗传学背景的了解比较薄弱,因而在分子水平上对草菇的分解木质纤维素和低温自溶的机理的研究一直没有重要的突破。近年来,新一代高通量测序技术的出现,显著地提高了基因组测序的速度,并大幅度地降低了测序成本,这为完成真菌类物种的全基因组序列提供了很好的机遇。通过完成草菇的全基因组测序计划,可以在全基因组水平上了解草菇降解木质纤维素的机制。并结合诱导变异型菌株基因组测序,开展其与野生型菌株的比较基因组学分析,有望了解草菇低温自溶分子机理,这些研究成果将为进一步运用基因修饰手段提高草菇分解基质的能力和耐低温的能力奠定坚实的基础。本研究采用Roche公司的454 GS FLX测序技术和Illumina公司的Solexa测序技术分别对草菇的单孢分离菌株进行了从头(de novo)全基因组序列测定,充分利用两种不同特点测序技术获得的结果,完成了草菇野生型全基因组框架图的构建,进行了初步的基因组结构和基因功能的生物信息学分析。用Roche 454 GS FLX测序技术,得到序列总长714,488,913 bp,测序覆盖率为20倍。通过Newbler软件拼装,得到LargeContigs(>2 kb)1,289个,Contig总长度为35.60Mb。采用Illumina solexa测序技术进行了DNA片段配对末端(paired-end)测序,测序长度为2*100bp,得到30,884,166对序列,基因组覆盖率为170倍。应用Velvet软件进行拼装,得到Large Contigs(>2 kb)4,022个,总计大小32.37Mb。运用独立开发的软件,将上述两组数据整合后得到Large Contigs(>2 kb)997个,Contig总长度为36.45Mb。平均Contig长度为40,218 bp,最长的Contig长度为1.04Mb,N50Contig长度为86,492 bp。再通过pair-end和Solexa 3K Matepair测序,插入片段平均大小为2-3k,对上述得到的Contig进行组装得到62个Scaffold。利用四款基因预测软件对62个Scaffold序列进行基因预测,并且以草菇EST序列的分布情况进行过滤,共得到了个基因。,共获得11,084个蛋白编码基因。平均编码序列(CDS)长度为1,532 bp,每个基因平均长度为1,948 bp,每个基因平均含有有6个外显子。通过与swiss-prot,KEGG的真核基因和蛋白数据库等进行比对,对预测基因进行了功能注释,其中有5,516个基因有明确的功能注释信息。通过KOG和GO分类,可以把4,821个基因分到25个功能类别中(KOG),1,462个基因可以进行GO分类。随后,通过KEGG代谢数据库,构建了草菇的代谢通路,发现了糖酵解、三羧酸循环等完整代谢通路。本研究在国际上首次完成了草菇的全基因组框架图,确定出草菇的基因组为36.45Mb,这远远大于通过脉冲电泳技术估算出的25Mb的基因组长度。本研究采用454 GS FLX和Solex GA两种新一代高通量测序技术相结合的方式,充分利用两种技术的不同优势,以较低的成本,高质量地完成草菇全基因组测序和框架图的构建。本研究所尝试的整合测序技术将会促进食用菌全基因组学和比较基因组学研究的广泛开展,从而能够提供全面和深入的食用菌遗传学知识,快速推动食用菌分子遗传学和分子育种学的进步。

关键词：草菇全基因组框架图

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几种提取草菇菌糠中总DNA方法的定量比较

几种提取草菇菌糠中总DNA方法的定量比较

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第九届全国食用菌学术研讨会

作者：侯立娟 BUSWELL John 陈明杰李玉谭琦国家食用菌工程技术研究中心农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所吉林农业大学菌物研究所

建立从草菇菌糠中DNA提取、纯化和定量分析方法。比较了化学裂解和酶裂解相结合方法、氯化苄方法、CTAB法、改良的CTAB法、土壤试剂盒和植物试剂盒6种DNA提取方法,各个方法的A260/A280比值有较大的差异。化学裂解法和酶裂解方法提取DNA... 详细信息

建立从草菇菌糠中DNA提取、纯化和定量分析方法。比较了化学裂解和酶裂解相结合方法、氯化苄方法、CTAB法、改良的CTAB法、土壤试剂盒和植物试剂盒6种DNA提取方法,各个方法的A260/A280比值有较大的差异。化学裂解法和酶裂解方法提取DNA的产量最高,用植物试剂盒提取培养料DNA的产量最低,分别为2 273.72±28.85μgDNA/g和87.67±20.41μgDNA/g。采用细菌、真菌及放线菌特异引物进行PCR扩增,氯化苄方法没有扩增出目的条带,其它方法获得的DNA均能扩增出目的条带,表明这些方法能从草菇培养料中同时有效地提取细菌、真菌和放线菌总基因DNA,说明5种方法均能扩增出微生物总基因组DNA。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从6种提取方法中筛选出提取草菇菌糠DNA质量最高的方法,该方法涉及样品预处理,SDS裂解,溶菌酶裂解,粗DNA3S柱纯化。

关键词：菌糠DNA DNA质量 PCR扩增

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