检索结果-内蒙古大学图书馆

超高效液相色谱-串联质谱法测定尿液中血栓素A_(2)的3种代谢物和8-异前列腺素F_(2α)

色谱 2025年第2期43卷 148-154页

作者：刘思佳赵福荣张亚莲孙晓宇张萌萌侯琨曹云峰锦州医科大学药学院辽宁锦州121001 上海市生物医药技术研究院上海市疾病与健康基因组学重点实验室国家卫生健康委员会计划生育药具重点实验室上海200237 锦州医科大学辽宁省肿瘤临床代谢组学重点实验室辽宁锦州121001 大连博源医学科技有限公司辽宁大连116011

建立了同时测定人体尿液中血栓素A_(2)的3种代谢物(2,3-地诺血栓素B_(2)、11-脱氢-2,3-地诺血栓素B_(2)和11-脱氢血栓素B_(2))和8-异前列腺素F_(2α)的超高效液相色谱-串联质谱检测方法。尿液经盐酸酸化至pH 2.0~4.0,经C18固相萃取柱净... 详细信息

建立了同时测定人体尿液中血栓素A_(2)的3种代谢物(2,3-地诺血栓素B_(2)、11-脱氢-2,3-地诺血栓素B_(2)和11-脱氢血栓素B_(2))和8-异前列腺素F_(2α)的超高效液相色谱-串联质谱检测方法。尿液经盐酸酸化至pH 2.0~4.0,经C18固相萃取柱净化后测定。使用ACQUITY UPLC^(■) BEH Phenyl色谱柱(50 mm×2.1 mm,1.7μm),以含0.002%氨水的2 mmol/L乙酸铵水溶液和乙腈作为流动相进行梯度洗脱,流速为0.3 mL/min,柱温为40℃,采用电喷雾离子源,在负离子和多反应监测模式下分析4 min,内标法定量。4种目标化合物在各自范围内线性关系良好,相关系数(R^(2))大于0.99;方法检出限为2,3-地诺血栓素B_(2)0.02 ng/mL,其余目标化合物0.01 ng/mL;定量限为2,3-地诺血栓素B_(2)0.1 ng/mL,其余目标化合物0.05 ng/mL;实际尿液中,4种目标物在定量限水平下的加标回收率为91.48%~104.87%,低、中、高水平下的加标回收率为92.95%~104.90%,日内精密度为2.79%~13.01%,日间精密度为4.45%~13.67%。应用该方法测定健康人群和缺血性脑卒中患者血栓素A_(2)的3种代谢物和8-异前列腺素F_(2α)的含量,并用肌酐进行校正。对目标化合物进行二元Logistic回归分析并绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线)用于诊断,血栓素A_(2)(血栓素A_(2)的3种代谢物加和)的曲线下面积(AUC)为0.849,8-异前列腺素F_(2α)的AUC为0.775,具有较好的临床价值,有望辅助缺血性脑卒中的早期筛查诊断。

关键词：超高效液相色谱-串联质谱 2,3-地诺血栓素B_(2) 11-脱氢-2,3-地诺血栓素B_(2) 11-脱氢血栓素B_(2) 8-异前列腺素F_(2α) 尿液缺血性脑卒中

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肝癌表观遗传学研究进展

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 913-922页

作者：黄健国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

肝细胞癌是原发性肝癌的主要类型,也是恶性程度最高的肿瘤之一.目前人们对肝癌的发病机制并不十分清楚.研究表明,由遗传学和表观遗传学改变引起的原癌基因的活化和抑癌基因的灭活而引起细胞恶性改变是肿瘤发生的核心生物学过程.过去人... 详细信息

肝细胞癌是原发性肝癌的主要类型,也是恶性程度最高的肿瘤之一.目前人们对肝癌的发病机制并不十分清楚.研究表明,由遗传学和表观遗传学改变引起的原癌基因的活化和抑癌基因的灭活而引起细胞恶性改变是肿瘤发生的核心生物学过程.过去人们普遍认为遗传学上的基因突变是肿瘤发病机制中的关键事件,尤其是抑癌基因的体细胞突变与肿瘤的发生有着密切的关系.但是,近年来随着对肿瘤认识的深入,人们发现DNA序列以外的调控机制(即表观遗传学)异常在肿瘤的发生、发展过程中也起到非常重要的作用.表观遗传学机制包括:DNA甲基化修饰,组蛋白修饰,非编码RNAs(包括microRNA),染色质重塑等.其中,DNA甲基化和microRNA与肝癌发生的关系是得到最为深入研究的表观遗传学机制.本文将结合本课题组的研究重点,综述DNA甲基化和microRNA在肝癌研究中的进展.

关键词：肿瘤肝癌表观遗传学 DNA甲基化 microRNA

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基因组分型技术的发展和应用

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 900-906页

作者：施锦绣王莹黄薇国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

伴随着人类基因组计划、人类单倍型图谱和人类拷贝数变异图谱的完成,基因分型技术获得了长足的发展,同时促进了对复杂性状疾病的研究.本文结合国家人类基因组南方研究中心的发展和研究项目,介绍了目前国际上广泛应用的几种基因分型技术... 详细信息

伴随着人类基因组计划、人类单倍型图谱和人类拷贝数变异图谱的完成,基因分型技术获得了长足的发展,同时促进了对复杂性状疾病的研究.本文结合国家人类基因组南方研究中心的发展和研究项目,介绍了目前国际上广泛应用的几种基因分型技术,及国内外复杂性状疾病遗传研究的突破和进展.

关键词：单核苷酸多态性拷贝数变异复杂性状疾病

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肝癌基因组学研究进展

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 907-912页

作者：韩泽广国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

在肝癌发生发展过程中,体细胞积累一些关键的遗传学变异.这些改变可以分为两类:第一类是与肝癌病因学密切相关的遗传学改变,包括乙型肝炎病毒(HBV)感染后的DNA插入整合,黄曲霉毒素B1暴露后引起的抑癌基因p53基因249位氨基酸突变等.第二... 详细信息

在肝癌发生发展过程中,体细胞积累一些关键的遗传学变异.这些改变可以分为两类:第一类是与肝癌病因学密切相关的遗传学改变,包括乙型肝炎病毒(HBV)感染后的DNA插入整合,黄曲霉毒素B1暴露后引起的抑癌基因p53基因249位氨基酸突变等.第二类遗传学改变属于继发性,如染色体的扩增与缺失,p53其他位点突变,Wnt/β-catenin信号途径因突变后活化等;携带这些遗传学变异的肿瘤细胞经进化选择后成为优势克隆.另外,肝癌易感基因鉴定是值得关注的重要方面.本文将就肝癌发生所涉及的基因组变异进行综述.

关键词：肝细胞癌染色体不稳定性基因突变癌基因抑癌基因

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围孕期叶酸补充对子代6岁智商影响及孕期坚果摄入和母乳喂养的效应修饰作用

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 29-35页

作者：苏慧佳谢珍珍孙松林陈瑶奚健雅梁红袁伟纪红蕾上海市生物医药技术研究院国家卫生健康委员会计划生育药具重点实验室上海市疾病与健康基因组学重点实验室上海200237

目的评估母亲围孕期叶酸补充与子代远期智力发育的关联,并检验孕期食用坚果和母乳喂养对该关联可能产生的效应修饰作用。方法2012年4—12月上海闵行出生队列建立时,通过结构式问卷收集母亲围孕期叶酸补充情况、坚果食用频率等信息;子代... 详细信息

目的评估母亲围孕期叶酸补充与子代远期智力发育的关联,并检验孕期食用坚果和母乳喂养对该关联可能产生的效应修饰作用。方法2012年4—12月上海闵行出生队列建立时,通过结构式问卷收集母亲围孕期叶酸补充情况、坚果食用频率等信息;子代出生后,通过随访收集纯母乳喂养时长等信息,并于子代6岁时,由经过专业培训的调查员利用第四版《韦氏儿童智力量表》中文版简版对其进行智力水平测试。最终纳入信息完整的530对母子,采用多因素线性回归模型分析母亲围孕期叶酸补充与子代6岁智商分数的关联,并探讨母亲孕期坚果食用频率及产后纯母乳喂养时长的潜在效应修饰作用。结果多因素分析结果显示,对于母亲围孕期叶酸补充的子代,其知觉推理分数提高4.57分(95%CI=0.13~9.02)。母亲孕前开始补充叶酸与孕后开始补充叶酸与子代知觉推理分数关联的效应值相近,分别为4.41(95%CI=-0.25~9.07)和4.71(95%CI=0.11~9.31)。另外,上述关联在母亲孕期坚果食用频率≤2 d/周、纯母乳喂养时长<6个月的研究对象中更强;前者,母亲围孕期补充叶酸的子代知觉推理分数提高5.80分(95%CI=0.52~11.08),后者母亲围孕期补充叶酸的子代知觉推理分数提高6.36分(95%CI=0.89~11.83)。结论母亲围孕期叶酸补充与子代6岁时知觉推理分数的提高有关,提示围孕期叶酸补充对子代远期智力发育的保护作用。该保护作用在母亲孕期坚果食用频率≤2 d/周或子代纯母乳喂养时长<6个月的研究人群中更强。

关键词：叶酸围孕期子代智商效应修饰队列研究

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基因组学在中国--从计划到实践的10年

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 879-881页

作者：陈竺赵国屏上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室国家人类基因组南方研究中心

在国家人类基因组南方研究中心成立10周年之际，我们集中发表一些与基因组研究相关的综述．抛砖引玉，为的是集思广益，探索基因组学今后在中国的发展方向和趋势．

关键词：基因组学中国人类基因组二倍体作物

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青春期早期青少年身体满意度与抑郁症状的关联

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中国儿童保健杂志 2024年第7期32卷 713-717,738页

作者：尤丽君左霞云余春艳廉启国房宇航涂晓雯楼超华复旦大学公共卫生学院上海市生物医药技术研究院上海市疾病与健康基因组学重点实验室国家卫生健康委生育调节药械重点实验室上海200237 上海市生物医药技术研究院上海市疾病与健康基因组学重点实验室国家卫生健康委生育调节药械重点实验室

目的探究上海市青春期早期青少年身体满意度与抑郁症状的关联,为青少年心理健康促进提供依据。方法采用分层整群抽样的方法,于2017年11~12月对上海市3所初中的6~8年级1704名学生进行调查,通过匿名电子问卷收集数据,采用身体满意度量表... 详细信息

目的探究上海市青春期早期青少年身体满意度与抑郁症状的关联,为青少年心理健康促进提供依据。方法采用分层整群抽样的方法,于2017年11~12月对上海市3所初中的6~8年级1704名学生进行调查,通过匿名电子问卷收集数据,采用身体满意度量表和抑郁症状量表收集研究对象的身体满意度和抑郁症状情况。结果青少年身体满意度平均分数为(23.03±4.68)分(得分范围7~35分),青少年身体满意度在不同性别、主要照看人不同教育水平和不同感知的学习成绩之间的差异具有统计学意义(P<0.05)。青少年抑郁症状平均得分为(15.94±5.05)分(得分范围6~30分),青少年抑郁症状在不同性别、不同年龄、是否独生子女、是否与父母分居、以及不同感知的学习成绩之间的差异具有统计学意义(P<0.05)。多元线性回归结果显示,身体满意度与抑郁症状得分存在负相关且关联具有统计学意义(β=-0.35,P<0.05)。不同性别青少年身体满意度与抑郁症状得分的关联存在差异(男生:β=-0.30,女生:β=-0.40),差异具有统计学意义(P<0.05)。结论青春期早期青少年身体满意度与抑郁症状存在负相关,提高身体满意度可能有利于减少青少年的抑郁情绪。

关键词：身体满意度抑郁症状精神卫生青少年

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miRNA在胚胎植入免疫调控中的研究进展

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中华生殖与避孕杂志 2023年第8期43卷 866-871页

作者：甘婕张璇上海市疾病与健康基因组学重点实验室国家卫生健康委员会计划生育药具重点实验室上海市生物医药技术研究院上海医学院复旦大学上海200237 上海市疾病与健康基因组学重点实验室国家卫生健康委员会计划生育药具重点实验室上海市生物医药技术研究院生殖健康研究所上海200237

胚胎植入是妊娠过程的起始阶段,囊胚必须黏附并入侵接受性母体子宫内膜,以获得氧气和营养的供应;但胎儿是一种半同种异体移植物,一旦进入子宫必然会遭到母体的免疫排斥,因此建立并维持母-胎免疫耐受对植入成功至关重要。微小RNAs(microR... 详细信息

胚胎植入是妊娠过程的起始阶段,囊胚必须黏附并入侵接受性母体子宫内膜,以获得氧气和营养的供应;但胎儿是一种半同种异体移植物,一旦进入子宫必然会遭到母体的免疫排斥,因此建立并维持母-胎免疫耐受对植入成功至关重要。微小RNAs(microRNAs,miRNAs)是一类内源性的非编码RNA,通过调控靶基因的转录后表达,从而参与人体内众多的生理和病理活动。目前已有大量的研究证实,miRNAs在胚胎植入中具有重要作用,同时也能调控母体免疫系统,当miRNAs表达失调时,通过调控免疫细胞和免疫分子参与妊娠并发症。此外,母-胎界面的免疫耐受性在着床中起着至关重要的作用。本文对miRNAs在胚胎植入免疫调控中的相关研究进展作一综述。

关键词：微小RNAs 胚胎植入杀伤细胞自然巨噬细胞 T淋巴细胞主要组织相容性复合物妊娠

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基于TCR组库分析流程的非小细胞肺癌特征分析

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上海交通大学学报（医学版） 2023年第12期43卷 1520-1528页

作者：赵卓明刘振浩鲁曼曼张钰许林锋谢鹭上海海洋大学食品学院食品科学与工程学科(系) 上海201306 上海市生物医药技术研究院基因组与生物信息研究所上海市疾病与健康基因组学重点实验室上海200237

目的·探究非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)免疫相关特征,发掘V-J基因中的肿瘤潜在标志物,为建立T细胞受体(T-cell receptor,TCR)-抗原识别预测模型提供基础。方法·收集704例NSCLC样本,用于构建一套系统的TCR... 详细信息

目的·探究非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)免疫相关特征,发掘V-J基因中的肿瘤潜在标志物,为建立T细胞受体(T-cell receptor,TCR)-抗原识别预测模型提供基础。方法·收集704例NSCLC样本,用于构建一套系统的TCR组库分析流程,涵盖从原始数据到质控、过滤、TCR序列的识别和提取等上游分析部分,以及组库克隆分布、克隆分型、V-J基因共享性、互补决定区3(CDR3)分布特征以及克隆追踪等下游分析流程。使用Shannon-Weiner指数、Chao1等指数分析样本克隆分布。根据克隆扩增数目进行克隆分型,以探索不同分型间的差异。选取2例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)样本进行去克隆扩增权重V-J基因共享分析,以探究低频克隆型对V-J基因共享性的影响。最后,通过分析V基因及高频克隆型CDR3分布特征和克隆追踪分析,监测肿瘤免疫前后克隆型频率的变化,寻找潜在的肿瘤标志物。结果·①NSCLC不同组织间克隆分布和克隆分型均存在显著差异,且在不同年龄与性别间存在显著差异。②在V-J基因共享性分析中发现了特定高共享V-J基因,同时在CDR3分布特征分析中存在非正态分布的高克隆V基因与氨基酸高频克隆型。③高频克隆型克隆追踪分析中,观察到NSCLC中高表达或新表达的高频克隆型,提示这些克隆型可作为潜在的肿瘤相关抗原或新抗原结合CDR3参考序列。④通过去克隆扩增权重V-J基因共享分析,发现原本低表达的TRBJ2-5基因表达频率显著增加,提示该基因可能为肿瘤免疫反应的潜在低频关键基因。结论·TRAV21和TRBV6.5基因在NSCLC中高克隆扩增,可作为潜在肿瘤标志物。

关键词： T细胞受体 TCR组库肿瘤免疫非小细胞肺癌

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1658例生殖健康门诊男性HPV感染情况及基因型分布特征分析

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复旦学报（医学版） 2024年第1期51卷 69-75页

作者：娜扎凯提·阿不都克里木李建辉张天成王鑫徐志明朱虔兮上海市生物医药技术研究院上海市疾病与健康基因组学重点实验室国家卫健委计划生育药具重点实验室上海200237 复旦大学公共卫生学院上海200032

目的了解生殖健康门诊男性的人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染情况和基因型分布特征,并比较各年龄组间是否存在差异。方法以2018—2022年在上海计生所医院门诊就诊的1658例男性为研究对象,采用PCR-反向点杂交法对23种HPV基... 详细信息

目的了解生殖健康门诊男性的人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染情况和基因型分布特征,并比较各年龄组间是否存在差异。方法以2018—2022年在上海计生所医院门诊就诊的1658例男性为研究对象,采用PCR-反向点杂交法对23种HPV基因型进行检测。结果研究对象的HPV总感染率为22.50%。主要感染类型为单一感染(66.76%)。各年龄组HPV感染率的差异具有统计学意义(P<0.001),18~30岁、31~40岁、41~50岁和51岁及以上组HPV感染率分别为16.83%、22.87%、34.63%和29.35%。感染率居前5位的高危型HPV为HPV52(3.56%)、HPV16(3.26%)、HPV39(2.41%)、HPV51(2.17%)和HPV58(2.17%)。感染率最高的低危型HPV为HPV81(2.90%)。本研究中感染者的全部基因型能被HPV二价、四价、九价疫苗覆盖的比例分别为7.77%、12.33%和26.27%。结论本地区生殖健康门诊男性研究对象HPV感染类型以单一感染为主。高危基因型感染以HPV52、16、39、51和58最常见,低危基因型感染以HPV81最常见。41~50岁男性受检者的HPV感染率较高。

关键词：人乳头瘤病毒基因型疫苗男性感染

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