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中国生物化学与分子生物学会第十二届会员代表大会暨2018年全国学术会议

作者：程金科上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室

蛋白质SUMO修饰通过改变靶蛋白的位置与活性,以及与其它蛋白质及生物大分子的相互作用而成为了蛋白质调控的一种新的机制.它参与了对许多生理与病理过程的调控.蛋白质SUMO修饰是一个动态的、可逆的过程.对蛋白质的SUMO修饰起重要决定作...

蛋白质SUMO修饰通过改变靶蛋白的位置与活性,以及与其它蛋白质及生物大分子的相互作用而成为了蛋白质调控的一种新的机制.它参与了对许多生理与病理过程的调控.蛋白质SUMO修饰是一个动态的、可逆的过程.对蛋白质的SUMO修饰起重要决定作用的是由特异性去SUMO化蛋白酶(SUMO-specific protease,SENP)所介导的去SUMO化过程.在细胞代谢应激作用下,SENP1能够调控线粒体蛋白质的 SUMO修饰和调控线粒体的代谢活性.SENP1对线粒体的调控作用能够影响机体的一些生理与病理过程.

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器官芯片联合物联网医学在药物疗效预测中的应用

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国际检验医学杂志 2023年第20期44卷 2536-2542页

作者：谢林杉李泽宁孙梦婷周建宋元林白春学(综述) 毛红菊杨达伟(审校) 复旦大学附属中山医院呼吸与危重症医学科上海200030 中国科学院上海微系统与信息技术研究所/传感技术联合国家重点实验室上海200050 上海市呼吸病研究所物联网医学研究室上海200030 上海市肺部炎症与损伤重点实验室上海200030 上海呼吸物联网医学工程技术研究中心上海200030 上海市重大传染病和生物安全研究院上海200030 复旦大学附属中山医院(厦门)呼吸与危重症医学科福建厦门361000

随着器官芯片技术的迅猛发展,器官芯片能更好地反映人体或细胞外环境的复杂作用,也可以弥补动物模型与人类在生物学上的差异而导致的结果误差,具有极好的应用前景。“物联网医学”概念的提出,有助于解决先进医疗模式与人力不足和设备资... 详细信息

随着器官芯片技术的迅猛发展,器官芯片能更好地反映人体或细胞外环境的复杂作用,也可以弥补动物模型与人类在生物学上的差异而导致的结果误差,具有极好的应用前景。“物联网医学”概念的提出,有助于解决先进医疗模式与人力不足和设备资源陈旧之间的矛盾,最终消除“三低、四差、两难”的问题。将物联网医学的概念应用于疾病的诊断和治疗时,在设备和技术方面有一定的要求。文章提出将器官芯片与“物联网医学”相结合应用于医学检验学中,利用器官芯片建立疾病模型,利用物联网医学的云端共享功能,实现多中心的数据共享和实时数据监测,有助于推动疾病诊疗的进展,实现患者个体化精准诊疗的需求。

关键词：微流体器官芯片物联网医学呼吸道疾病医学检验学

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DGCR8多位点类泛素化修饰及其多样化功能的分子机制

DGCR8多位点类泛素化修饰及其多样化功能的分子机制

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中国细胞生物学学会2015年全国学术大会

作者：朱长红陈程余健秀上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系、上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室上海200025

DGCR8(迪-乔治综合症关键基因8)蛋白作为Drosha的主要结合蛋白,可以通过其C末端的两个双链RNA结合区域与pri-miRNAs结合,协助Drosha对Pri-miRNAs剪切加工,因此,DGCR8在miRNA的生物合成中有着重要的作用。虽然DGCR8在miRNA生物合成中的...

DGCR8(迪-乔治综合症关键基因8)蛋白作为Drosha的主要结合蛋白,可以通过其C末端的两个双链RNA结合区域与pri-miRNAs结合,协助Drosha对Pri-miRNAs剪切加工,因此,DGCR8在miRNA的生物合成中有着重要的作用。虽然DGCR8在miRNA生物合成中的作用机制已经研究得较为清楚,对其自身的调控机制仍尚不清晰。在我们的研究中,我们发现DGCR8可以在多个位点发生类泛素化(SUMOylation)修饰,从而增强DGCR8蛋白的稳定性。除此之外,不同位点的SUMOylation修饰还具有其它不同的生物学功能。

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线粒体蛋白SUMO修饰与代谢调控

线粒体蛋白SUMO修饰与代谢调控

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中国生物化学与分子生物学会第十二届全国会员代表大会暨2018年全国学术会议

作者：程金科上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室

蛋白质SUMO修饰通过改变靶蛋白的位置与活性,以及与其它蛋白质及生物大分子的相互作用而成为了蛋白质调控的一种新的机制。它参与了对许多生理与病理过程的调控。蛋白质SUMO修饰是一个动态的、可逆的过程。对蛋白质的SUMO修饰起重要决... 详细信息

蛋白质SUMO修饰通过改变靶蛋白的位置与活性,以及与其它蛋白质及生物大分子的相互作用而成为了蛋白质调控的一种新的机制。它参与了对许多生理与病理过程的调控。蛋白质SUMO修饰是一个动态的、可逆的过程。对蛋白质的SUMO修饰起重要决定作用的是由特异性去SUMO化蛋白酶(SUMO-specific protease, SENP)所介导的去SUMO化过程。在细胞代谢应激作用下,SENP1能够调控线粒体蛋白质的SUMO修饰和调控线粒体的代谢活性。SENP1对线粒体的调控作用能够影响机体的一些生理与病理过程。

关键词：蛋白质SUMO修饰线粒体代谢

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TARBP2类泛素化修饰调控小RNA诱导基因沉默的分子机制

TARBP2类泛素化修饰调控小RNA诱导基因沉默的分子机制

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中国细胞生物学学会2015年全国学术大会

作者：陈程朱长红余健秀上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系、上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室上海200025

小RNA(miRNA/siRNA)诱导基因沉默对于基因表达的转录后调控是非常关键的,但其精细调控分子机制仍未清楚。在本研究中,我们通过体内与体外实验证明了TARBP2能够在第52位赖氨酸(K52)发生类泛素化修饰(SUMO化修饰),并且这一修饰可以受到外...

小RNA(miRNA/siRNA)诱导基因沉默对于基因表达的转录后调控是非常关键的,但其精细调控分子机制仍未清楚。在本研究中,我们通过体内与体外实验证明了TARBP2能够在第52位赖氨酸(K52)发生类泛素化修饰(SUMO化修饰),并且这一修饰可以受到外部信号(如生长信号)的调控。我们通过实验证实,MAPK/ERK信号通路能激活TARBP2的磷酸化修饰,紧接着能进一步增强TARBP2的SUMO化修饰。

关键词：

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氧化应激在慢性阻塞性肺疾病发生中的作用及防治策略

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国际呼吸杂志 2016年第2期36卷 133-137页

作者：付玥川丁婕邓炯上海交通大学医学院 200025 上海交通大学医学院病理生理系细胞分化与凋亡教育部重点实验室 200025 上海交通大学医学院肿瘤微环境与炎症上海市重点实验室 200025 上海胸科医院转化医学中心 200030

COPD特征是慢性气道炎症、细小支气管重塑及肺实质破坏。研究表明，香烟烟雾等有害气体所引起的氧化应激在COPD发展过程起到了至关重要的作用。吸烟增强氧化应激，使氧化／抗氧化比例失衡，直接损伤肺组织，加重气道炎症反应，引起自身... 详细信息

COPD特征是慢性气道炎症、细小支气管重塑及肺实质破坏。研究表明，香烟烟雾等有害气体所引起的氧化应激在COPD发展过程起到了至关重要的作用。吸烟增强氧化应激，使氧化／抗氧化比例失衡，直接损伤肺组织，加重气道炎症反应，引起自身免疫反应，最终导致气流受限。因此，对抗氧化应激、提高宿主抗氧化能力，是COPD防治的最新着重点。

关键词：吸烟氧化应激慢性阻塞性肺疾病

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慢性阻塞性肺病与肺癌的相互关系

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国际肿瘤学杂志 2014年第6期41卷 439-443页

作者：王薇茜邓炯上海交通大学医学院09级临床医学八年制F097811 200025 上海交通大学医学院病理生理系上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室上海市胸科医院转化医学研中心

肺癌和慢性阻塞性肺病（COPD）是全球高死亡率的疾病。流行病学研究表明，COPD可增加患肺癌的风险。COPD和肺癌皆可由吸烟引起，且这两种疾病常常发生在同一患者身上。但两种疾病之间的联系不仅仅是吸烟，其病理机制联系还包括遗传易感... 详细信息

肺癌和慢性阻塞性肺病（COPD）是全球高死亡率的疾病。流行病学研究表明，COPD可增加患肺癌的风险。COPD和肺癌皆可由吸烟引起，且这两种疾病常常发生在同一患者身上。但两种疾病之间的联系不仅仅是吸烟，其病理机制联系还包括遗传易感性、炎症反应、细胞损伤、氧化与毒性应激、细胞外基质和蛋白酶的分泌等。其中的一些共性可能成为这两种疾病的化学预防或化学治疗的靶点。

关键词：肺疾病 ,慢性阻塞性肺肿瘤吸烟炎症

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口腔扁平苔藓中mRNA和miRNA表达谱的整合性分析

口腔扁平苔藓中mRNA和miRNA表达谱的整合性分析

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2018年中华口腔医学会第十次全国口腔黏膜病学术大会暨第八次全国口腔中西医结合学术大会

作者：陈俊俊杜观环王宇峰施林俊糜军唐国瑶上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔黏膜科国家口腔疾病临床医学研究中心上海市口腔医学重点实验室上海市口腔医学研究所上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室

目的:口腔扁平苔藓(OLP)通常被认为是一种病因不明的慢性炎性黏膜皮肤病,目前被认为是一种口腔潜在恶性病变。为了阐明OLP病变发生发展中病理变化,本实验采用二代测序方法进行初步研究。方法:采集口腔扁平苔藓患者和健康对照组的口腔颊... 详细信息

目的:口腔扁平苔藓(OLP)通常被认为是一种病因不明的慢性炎性黏膜皮肤病,目前被认为是一种口腔潜在恶性病变。为了阐明OLP病变发生发展中病理变化,本实验采用二代测序方法进行初步研究。方法:采集口腔扁平苔藓患者和健康对照组的口腔颊黏膜组织,通过DESeq和edgeR软件算法筛选差异表达miRNA和差异表达基因。通过构建和分析miRNA-mRNA网络筛选潜在的关键miRNA和基因。针对差异表达基因,使用Fisher精确检验和超几何分布进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)数据库分析。结果:与健康对照组相比,本研究检测到口腔扁平苔藓中94个差异表达miRNA和599个差异表达基因。将差异表达miRNA与其潜在靶标连接,然后与差异表达基因交集比较,我们发现数个潜在的miRNA-mRNA对,其中5个miRNA:has-miR-135a,has-miR-128,has-miR-218,has-miR-125a,has-let-7e可能是潜在的生物标志物。将差异表达基因进行功能富集分析,本研究发现口腔扁平苔藓的差异表达基因显着富集于"炎症"事件和免疫相关通路方面。结论:m RNA和miRNA表达谱的整合分析为阐明口腔扁平苔藓中异常基因表达提供了更多信息,为研究口腔扁平苔藓的病因和发病机制提供初步研究基础。

关键词：二代测序口腔扁平苔藓差异表达miRNAs 差异表达基因

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基于CT灌注成像的肺癌疗效评估方法初探

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肿瘤影像学 2018年第3期27卷 280-285页

作者：李素素肖建宇张坤刘竹君郭翌汪源源复旦大学电子工程系上海200433 上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室上海200032 天津医科大学肿瘤医院放射科国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实验室天津300060 天津医科大学肿瘤医院肺部肿瘤内科天津300060

为了快速有效地评估肺癌治疗效果，提出肺部计算机断层扫描（computed tomography，CT）灌注图像的半自动分割方法，并采用计算机辅助诊断方法对怖癌血管靶向治疗疗效进行评估。首先读入怖部DICOM格式的CT灌注图像，然后采用改进的距离... 详细信息

为了快速有效地评估肺癌治疗效果，提出肺部计算机断层扫描（computed tomography，CT）灌注图像的半自动分割方法，并采用计算机辅助诊断方法对怖癌血管靶向治疗疗效进行评估。首先读入怖部DICOM格式的CT灌注图像，然后采用改进的距离规则化水平集分割方法对怖部肿瘤进行分割，将分割得到的区域逐层映射到其他CT灌注参数图像上，通过选取合适的阈值，分割出肿瘤的血管丰富区域，再分别计算肿瘤和内部血管丰富区域的体积。实验使用5例患者治疗前后的CT灌注参数图像，通过计算豪斯多夫距离，分析图像分割的效果；通过比较治疗前后肿瘤和血管丰富区域的体积，评估怖癌血管靶向治疗疗效。结果表明，本方法可以得到较好的图像分割结果，昕得的疗效评估结果也与临床病理数据相吻合。可见，该研究提出的方法有望对怖癌血管靶向治疗疗效做出有效评估，从而可为临床怖癌的治疗提供重要参考。

关键词： CT灌注成像肺癌疗效评估计算机辅助诊断图像分割

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下调的miRNA-27b-3p抑制口腔扁平苔藓角质细胞凋亡

下调的miRNA-27b-3p抑制口腔扁平苔藓角质细胞凋亡

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2018年中华口腔医学会第十次全国口腔黏膜病学术大会暨第八次全国口腔中西医结合学术大会

作者：陈俊俊王宇峰杜观环张文怡曹天翼施琳俊王燕妮糜军唐国瑶上海交通大学医学院附属第九人民医院.口腔医学院口腔黏膜科国家口腔疾病临床医学研究中心上海市口腔医学重点实验室上海市口腔医学研究所上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室

目的:口腔扁平苔藓(OLP)被认为是一种癌前病变,至今无法治愈。最近的研究报道,细胞凋亡的异常调节参与了OLP的发病机制。方法:采用下一代测序技术筛选OLP患者和健康黏膜活检组织中的候选microRNA和基因,将人口腔角质形成细胞转染miR-27b... 详细信息

目的:口腔扁平苔藓(OLP)被认为是一种癌前病变,至今无法治愈。最近的研究报道,细胞凋亡的异常调节参与了OLP的发病机制。方法:采用下一代测序技术筛选OLP患者和健康黏膜活检组织中的候选microRNA和基因,将人口腔角质形成细胞转染miR-27b-3p/cyclophilin D及其对照组的相关寡核苷酸;通过TdT介导的dUTP缺口末端标记和流式细胞术检测细胞凋亡。通过定量PCR,蛋白质印迹和酶联免疫吸附测定分别检测mRNA和蛋白质的水平。进行荧光素酶实验以检测miR-27b-3p和亲环蛋白D的荧光素酶活性。结果:本研究中,我们发现OLP临床样品中基底上皮细胞凋亡减少并且miR-27b-3p水平降低。我们还发现miR-27b-3p的下调通过上调亲环蛋白D的表达来抑制上皮角质形成细胞的凋亡。此外,亲环蛋白D通过直接结合Bcl2从而增加Bcl2的蛋白质稳定性,并且协同Bcl2抑制caspase9/3活化和细胞色素C释放。结论:总之,这些数据表明miR-27b-3p通过亲环蛋白D/Bcl2信号通路调节角质形成细胞凋亡,提示miR-27b-3p可能参与调节OLP的发病机制。

关键词： miR-27b-3p 口腔扁平苔藓亲环蛋白D 上皮细胞细胞凋亡

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